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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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1 | 2025-06-21 |
Construction of a synthetic biology toolkit for the genetic manipulation in the cellulose-producing strain Kosakonia oryzendophytica
2025-Sep, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2025.05.012
PMID:40529626
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research paper | 开发了一个合成生物学工具包,用于在纤维素生产菌株Kosakonia oryzendophytica中进行遗传操作 | 构建了一个可调表达模块和精确基因组编辑能力的综合工具包,用于重编程菌株以生产具有定制特性的下一代纤维素基功能材料 | NA | 开发合成生物学平台以工程化高产细菌纤维素合成菌株 | Kosakonia oryzendophytica菌株 | 合成生物学 | NA | CRISPR/Cas9介导的无疤痕基因组编辑系统 | NA | NA | NA |
2 | 2025-06-21 |
Biomolecular Condensate-Based Artificial Organelle for Driving Compartmentalized Flux Control
2025-Jun-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00871
PMID:40339164
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研究论文 | 该研究开发了一种基于生物分子凝聚物的人工细胞器平台,用于实现模块化通路区室化以精确控制代谢通量 | 利用工程化生物分子凝聚物创建可编程人工细胞器,通过空间组织关键酶来克服代谢中间体扩散分散问题 | 目前仅在2'-岩藻糖基乳糖生物合成通路中验证了该平台的有效性 | 开发合成生物学平台以优化区室化生物合成通路的效率 | 工程化大肠杆菌中的2'-岩藻糖基乳糖生物合成通路 | 合成生物学 | NA | 蛋白质工程、代谢通路设计 | NA | 生物分子相互作用数据、代谢物浓度数据 | 工程化大肠杆菌菌株 |
3 | 2025-06-21 |
Microfluidic Fluorescence-Activated Cell Sorting of Convolutional Neural Network-Designed Synthetic Yeast Promoter
2025-Jun-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00025
PMID:40368332
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研究论文 | 本文开发了一种分支卷积神经网络(B-CNN)结合遗传算法设计合成酵母启动子,并通过微流控荧光激活细胞分选(μFACS)系统进行高通量筛选 | 结合B-CNN和遗传算法设计合成酵母启动子,并开发了μFACS系统进行高通量筛选 | NA | 提高酵母启动子的设计和筛选效率,增强基因表达和代谢物生物合成 | 合成酵母启动子 | 合成生物学 | NA | 微流控荧光激活细胞分选(μFACS) | 分支卷积神经网络(B-CNN) | 序列数据 | NA |
4 | 2025-06-21 |
De Novo Synthesis of Friedelin in Saccharomyces cerevisiae via Combination of Metabolic and Lipid Droplet Engineering
2025-Jun-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00047
PMID:40373267
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研究论文 | 本研究通过代谢和脂滴工程的结合,在酿酒酵母中实现了friedelin的从头合成 | 首次在酿酒酵母中构建了friedelin的从头合成途径,并通过多种优化策略将产量提高了30倍 | 研究仅在摇瓶发酵规模进行,尚未进行大规模发酵验证 | 开发更高效和可持续的friedelin生产方法 | 酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae) | 合成生物学 | NA | 代谢工程、脂滴工程、发酵优化 | NA | NA | Z28菌株在250 mL摇瓶发酵 |
5 | 2025-06-21 |
Bioproduction of a Large-Scale Library of Tryptamine Derivatives for Neuropsychiatric Drug Screening
2025-Jun-20, ACS chemical biology
IF:3.5Q2
DOI:10.1021/acschembio.4c00857
PMID:40375477
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研究论文 | 本研究通过微生物代谢工程和发酵技术,构建了一个大规模色胺衍生物库,用于神经精神药物的筛选 | 利用生物合成策略构建大规模化合物库,克服了传统合成化学在通量、规模和多样性上的限制,并实现了目标产物的纯化 | 部分目标化合物未被检测到,且生物发酵的产量相对较低 | 开发一种基于生物发酵的大规模药物筛选方法,用于神经精神疾病的治疗 | 色胺衍生物 | 合成生物学 | 神经精神疾病 | 微生物代谢工程、发酵技术 | NA | 化学化合物 | 344种可能的生物转化,产生279种产物,其中17种新型乙酰化衍生物进行了放大培养和纯化 |
6 | 2025-06-21 |
Genetic Toggle Switch in Plants
2025-Jun-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00777
PMID:40387045
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研究论文 | 该研究开发了一种植物基因开关,通过定量表征的转移函数和计算机模型指导组装,实现了在稳定工程植物中的预测功能 | 首次在植物中开发了可编程的基因开关,并通过计算机模型指导组件选择和电路优化 | 研究主要关注基因开关的功能验证,未全面评估植物特有属性(如环境敏感性、发育可塑性)对电路预测性的影响 | 开发可预测和可编程的植物基因设备,以利用植物独特能力于可持续人类和环境系统 | 植物基因元件和基因开关电路 | 合成生物学 | NA | 定量转移函数表征、计算机建模 | 基因调控网络模型 | 基因表达数据 | 稳定工程植物(具体数量未提及) |
7 | 2025-06-21 |
Synthetic Phosphorylation Networks with Fluorescence and Luminescence Expansion
2025-Jun-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00814
PMID:40476587
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research paper | 介绍了一种名为SPN-FLUX的全翻译后平台,该平台整合了合成磷酸化网络与分裂荧光或发光蛋白,用于快速可调地报告细胞过程 | SPN-FLUX平台不依赖转录介导的报告过程,能够在1小时内响应细胞外刺激,提供了一种快速实时的细胞信号事件报告方法 | NA | 开发一种新型合成受体平台,用于快速实时监测细胞信号事件 | 哺乳动物细胞 | synthetic biology | NA | synthetic phosphorylation networks, split fluorescent or luminescent proteins | NA | fluorescence and luminescence data | NA |
8 | 2025-06-21 |
Standardized Quorum Sensing Tools for Gram-Negative Bacteria
2025-Jun-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00036
PMID:40476774
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研究论文 | 开发了一套标准化的群体感应(QS)工具,用于革兰氏阴性细菌之间的通信 | 利用SEVA质粒集合构建了三套QS系统,提高了系统的通用性和可交换性,并提供了数学模型和速率参数以支持设计 | 目前QS工具箱在非模型细菌中的应用仍有待验证 | 开发标准化的群体感应工具以促进合成菌群的分布式功能 | 革兰氏阴性细菌 | 合成生物学 | NA | 群体感应(QS)系统 | 数学模型 | NA | NA |
9 | 2025-06-21 |
Robust Synthetic Biology Toolkit to Advance Carboxysome Study and Redesign
2025-Jun-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00144
PMID:40488673
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研究论文 | 本研究设计和验证了一个名为pXpressome的质粒工具包,用于稳健表达和纯化功能性α-羧基体,并探索了通过基因突变调控羧基体形态和性能的方法 | 开发了pXpressome工具包,实现了羧基体的稳健表达和纯化,并通过基因编辑调控其形态,提高了表达均匀性和细胞健康状态 | NA | 推进羧基体研究和重新设计,为增强碳固定或其他纳米封装目标提供平台 | α-羧基体及其相关基因 | 合成生物学 | NA | 基因编辑、荧光标记 | NA | NA | NA |
10 | 2025-06-21 |
The Japan-UK Synthetic Biology Conference, Spring 2025: Strengthening Global Links to Engineer Biology
2025-Jun-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00232
PMID:40538270
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评论 | 本文总结了2025年春季日本-英国合成生物学会议的核心科学议题、新兴趋势及面临的挑战 | 强调了国际合作在推动合成生物学发展中的重要性,并提出了通过共享专业知识、国家基础设施和资金支持来应对挑战的方法 | 文章仅基于会议内容进行总结,未涉及具体研究数据或实验验证 | 促进合成生物学领域的国际合作与研究进展 | 合成生物学领域的科研人员与政策制定者 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
11 | 2025-06-21 |
Switchable RNA motifs for dynamic transcriptional control of RNA condensates
2025-Jun-20, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf497
PMID:40539511
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research paper | 该研究展示了如何通过设计包含额外线性或分支环域的RNA纳米星结构,动态控制RNA凝聚体的形成和解离 | 利用RNA入侵者和抗入侵者链实现RNA凝聚体的可逆调控,为合成生物学提供了响应性自组织生物分子材料的新工具 | 研究仅在体外一锅反应中验证,尚未在体内环境中测试 | 开发可调控的RNA凝聚体工程方法 | RNA纳米星结构及其形成的生物分子凝聚体 | 合成生物学 | NA | 体外转录 | NA | NA | NA |
12 | 2025-06-21 |
From Code to Life: The AI-Driven Revolution in Genome Editing
2025-Jun-19, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202417029
PMID:40538131
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review | 本文探讨了人工智能(AI)在基因组编辑领域的革命性作用及其应用 | AI驱动的模型提高了sgRNA设计的准确性,发现了新的Cas蛋白,并增强了基因调控网络分析 | AI驱动的基因组编辑存在数据偏见、算法透明度和意外基因修改等伦理问题 | 研究AI如何提升基因组编辑的精确性和效率 | 基因组编辑技术及其应用 | machine learning | genetic disease | CRISPR-associated systems, deep learning-based predictors, protein language models | deep learning | genomic data | NA |
13 | 2025-06-21 |
Progress and prospects in metabolic engineering approaches for isoprenoid biosynthesis in microalgae
2025-Jun-18, Biotechnology for biofuels and bioproducts
IF:3.3Q3
DOI:10.1186/s13068-025-02665-y
PMID:40533766
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综述 | 本文综述了微藻中类异戊二烯生物合成的代谢工程方法进展与前景 | 详细讨论了代谢工程和合成生物学策略在优化微藻类异戊二烯生物合成途径中的应用 | 未提及具体实验数据或样本量,可能缺乏实证支持 | 探讨微藻中类异戊二烯生物合成的代谢工程方法及其应用前景 | 微藻及其代谢途径 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、合成生物学 | NA | NA | NA |
14 | 2025-06-21 |
Addressing challenges in microbial manufacturing: Systematic microbial biotechnology
2025-Jun-02, Innovation (Cambridge (Mass.))
DOI:10.1016/j.xinn.2025.100871
PMID:40528882
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研究论文 | 提出了一种系统微生物生物技术框架,用于解决微生物制造中的挑战,以实现经济和环境效益的最优化 | 采用系统性和整体性的方法,结合多学科技术,定制化解决微生物制造过程中的瓶颈问题 | 未提及具体的技术实施细节或实验验证结果 | 解决微生物制造在工业应用中的挑战,推动可持续循环生物经济的发展 | 微生物制造过程及其相关技术 | 合成生物学 | NA | 酶学、合成生物学、代谢工程、发酵、分离工程、AI技术 | NA | NA | NA |
15 | 2025-06-21 |
Polymeric Giant Unilamellar Vesicles Support Longevity of Native Nuclei in Protocells
2025-Jun, Small science
IF:11.1Q1
DOI:10.1002/smsc.202400622
PMID:40529862
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research paper | 该研究通过将天然细胞核整合到聚合物巨型单层囊泡(pGUVs)中,创建了一种能够长期保持细胞核功能和完整性的原生细胞模型 | 利用双乳液微流控技术将天然细胞核整合到合成囊泡中,并证明细胞核的输入机制在原生细胞内仍保持功能,显著提高了核定位信号肽基多室胶束(NLS-MCMs)的递送效率 | NA | 开发一种简化的生物模拟系统,用于研究核过程及细胞器行为 | 天然细胞核和聚合物巨型单层囊泡(pGUVs) | 合成生物学 | NA | 双乳液微流控技术 | NA | NA | NA |
16 | 2025-06-21 |
BTG13-related metalloenzymes: Atypical non-heme iron-dependent dioxygenases with unusual coordination patterns and catalytic mechanisms
2025-Mar, Engineering microbiology
DOI:10.1016/j.engmic.2024.100188
PMID:40538716
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research paper | 本文介绍了一种新型非血红素铁依赖性双加氧酶BTG13,其具有独特的配位中心和催化机制 | 发现了一种新型非血红素铁依赖性双加氧酶BTG13,其配位中心由四个组氨酸和一个羧化赖氨酸(Kcx)组成,并通过分子动力学模拟和量子化学计算揭示了Kcx在催化过程中的关键作用 | NA | 研究非血红素铁依赖性双加氧酶的多样性和新型催化机制 | BTG13相关金属酶及其催化机制 | 生物化学 | NA | 分子动力学模拟, 量子化学计算, 系统发育分析 | NA | NA | NA |
17 | 2025-06-21 |
Viral vector-based transient expression systems for plant biotechnology research at PUIs
2025, Frontiers in education
IF:1.9Q2
DOI:10.3389/feduc.2025.1598673
PMID:40520985
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mini-review | 该文探讨了病毒载体瞬时表达系统在本科院校植物生物技术研究中的应用及其优势 | 提出病毒载体瞬时表达系统作为传统稳定遗传转化的高效替代方案,特别适合本科院校的教学与研究 | 未提及该系统的具体技术限制或潜在问题 | 推广病毒载体瞬时表达系统在本科院校植物生物技术研究和教学中的应用 | 本科院校的植物生物技术研究与教学 | 植物生物技术 | NA | 病毒载体瞬时表达系统(如TMV或Geminivirus) | NA | NA | NA |
18 | 2025-06-21 |
"Open science" meets commercial realities: a qualitative study of factors influencing sharing in synthetic biology research in Australia
2025, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2025.1604509
PMID:40529177
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研究论文 | 本文研究了合成生物学研究中数据和材料的共享行为,以及知识产权法规和商业化需求对其的影响 | 通过社会法律视角分析合成生物学领域的共享驱动因素和障碍,探讨学术与商业双重需求下的研究者行为模式 | 研究仅基于澳大利亚的案例,可能无法完全反映其他地区的实际情况 | 探讨合成生物学研究中数据/材料共享的影响因素及其与知识产权保护、商业化需求的关系 | 大学和商业环境中的合成生物学家以及商业化专业人士 | 合成生物学 | NA | 定性研究方法 | NA | 访谈数据 | 未明确说明具体样本量(涉及大学/商业机构的研究者及商业化专业人士) |
19 | 2025-06-21 |
Emerging technologies transforming the future of global biosecurity
2025, Frontiers in digital health
IF:3.2Q2
DOI:10.3389/fdgth.2025.1622123
PMID:40534823
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research paper | 探讨人工智能与合成生物学的融合如何改变全球生物安全 | 综合分析AI在生物安全中的应用及合成生物学在疫苗开发中的创新,同时探讨相关伦理和安全挑战 | 未提及具体技术实施的详细案例或数据支持 | 批判性地评估AI和合成生物学在提升全球生物安全方面的进展与风险 | 全球生物安全、公共健康准备系统 | machine learning | NA | AI、合成生物学 | NA | NA | NA |
20 | 2025-06-21 |
A robust synthetic biology toolkit to advance carboxysome study and redesign
2024-Oct-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.10.08.617227
PMID:39416180
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研究论文 | 本文设计并验证了一个名为pXpressome的质粒工具包,用于稳健表达和纯化功能性α-羧酶体,并探索了通过基因突变调控羧酶体结构和性能的方法 | 开发了pXpressome工具包,实现了羧酶体的稳健表达和纯化,并通过基因突变调控其形态,提高了表达均匀性和细胞健康状态 | NA | 推进羧酶体的研究和重新设计,以增强碳固定能力或作为其他纳米封装目标的平台 | α-羧酶体 | 合成生物学 | NA | 质粒构建、基因突变、荧光标记 | NA | NA | NA |