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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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1 | 2025-06-14 |
From reactants to products: computational methods for biosynthetic pathway design
2025-Sep, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2025.05.005
PMID:40510533
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综述 | 本文回顾了生物合成途径设计中的关键计算工具 | 整合了生物大数据、逆合成方法和酶工程三大关键组件,显著提高了生物合成途径设计的效率和准确性 | 未提及具体工具在实际应用中的性能比较或局限性 | 提高合成生物学中生物合成途径设计的效率和准确性 | 生物合成途径设计中的计算工具 | 合成生物学 | NA | 数据挖掘、逆合成方法、酶工程 | NA | 生物大数据(化合物、反应/途径、酶) | NA |
2 | 2025-06-14 |
Decoding the Minimal Translation System of the Plasmodium falciparum Apicoplast: Essential tRNA-modifying Enzymes and Their Roles in Organelle Maintenance
2025-Aug-15, Journal of molecular biology
IF:4.7Q1
DOI:10.1016/j.jmb.2025.169156
PMID:40335414
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研究论文 | 本研究通过比较基因组学和预测工具,鉴定了疟原虫顶质体中16种tRNA修饰酶,并验证了其中14种的定位,揭示了6种对寄生虫生存至关重要的酶 | 首次系统鉴定了疟原虫顶质体中tRNA修饰酶的最小集合,并确定了其中6种对寄生虫生存和顶质体功能至关重要的酶 | 有2个基因无法被敲除,其中一个具有双重定位,可能在其他细胞器中具有必需功能,另一个可能具有无法通过代谢旁路绕过的关键作用 | 研究疟原虫顶质体中最小翻译系统所需的tRNA修饰酶及其功能 | 疟原虫顶质体中的tRNA修饰酶 | 分子生物学 | 疟疾 | 比较基因组学、蛋白质定位预测、基因敲除 | NA | 基因组数据、蛋白质定位数据 | 16种预测的tRNA修饰酶,其中14种被实验验证 |
3 | 2025-06-14 |
Effect of glycosylation on protein folding: From biological roles to chemical protein synthesis
2025-Jun-20, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2025.112605
PMID:40502693
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review | 探讨糖基化在蛋白质折叠中的双重作用及其在化学蛋白质合成中的应用 | 提出临时糖基化支架策略,为化学蛋白质合成提供可逆的折叠引导方法 | 未提及具体实验数据或样本量,可能缺乏实证支持 | 研究糖基化对蛋白质折叠的影响及其在生物技术和合成生物学中的应用 | 蛋白质折叠及糖基化修饰 | 合成生物学 | NA | 化学蛋白质合成 | NA | NA | NA |
4 | 2025-06-14 |
Advances in engineered models of peri-gastrulation
2025-Jun-20, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2025.112659
PMID:40510116
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研究论文 | 本文探讨了工程化模型在研究人类发育中围原肠胚阶段的应用及其进展 | 整合干细胞技术和工程工具,提供了对早期谱系规范和形态发生事件的前所未有的见解 | NA | 研究人类发育的早期阶段,特别是围原肠胚阶段 | 人类发育的早期阶段,包括原肠胚前、原肠胚和原肠胚后模型 | 生物医学工程 | NA | 干细胞技术、微图案化基底、微流体系统、合成生物学工具 | NA | NA | NA |
5 | 2025-06-14 |
Establishing Halomonas as a chassis for industrial biotechnology: advances in synthetic biology tool development and metabolic engineering strategies
2025-Jun-12, Microbial cell factories
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s12934-025-02757-2
PMID:40506695
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综述 | 本文探讨了Halomonas作为工业生物技术底盘生物的潜力,重点介绍了合成生物学工具的开发及代谢工程策略的应用 | 强调了Halomonas在高盐条件下生长的独特优势及其在开放、非无菌条件下培养的潜力,以及其在生物塑料和高价值渗透剂生产中的天然能力 | 提到了转化困难等工具采用过程中面临的挑战 | 确立Halomonas作为工业生物技术的底盘生物 | Halomonas菌种 | 工业生物技术 | NA | 合成生物学工具开发、代谢工程 | NA | NA | NA |
6 | 2025-06-14 |
Characterization of a consensus-designed trans-cinnamic acid decarboxylase for styrene biosynthesis
2025-Jun-11, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mbio.00714-25
PMID:40407334
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research paper | 该研究描述了一种共识设计的反式肉桂酸脱羧酶PSC1,用于微生物生物合成苯乙烯 | 设计了一种新型的共识蛋白PSC1,能够在微生物中高效催化反式肉桂酸脱羧生成苯乙烯,并解析了其晶体结构 | NA | 开发更环保的苯乙烯生物合成方法以替代传统石化工艺 | 反式肉桂酸脱羧酶PSC1及其在苯乙烯生物合成中的应用 | 合成生物学 | NA | 蛋白质工程、X射线晶体学 | NA | 蛋白质结构数据 | NA |
7 | 2025-06-14 |
Fungal bioconversion of lignin-derived aromatics: Pathways, enzymes, and biotechnological potential
2025-Jun-10, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108624
PMID:40505753
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综述 | 本文综述了真菌对木质素衍生芳香化合物的生物转化途径、相关酶及其生物技术潜力 | 系统整合了芳香族分解代谢途径的最新进展,强调了真菌转运系统在芳香化合物摄取和排出中的关键作用 | 对真菌木质素降解系统的研究仍存在知识缺口,需要进一步整合合成生物学、计算建模和系统生物学方法 | 推动基于真菌的平台开发,实现可再生芳香族化合物的可持续生产 | 木质素衍生芳香化合物(如肉桂酸、没食子酸、阿魏酸和香草醛) | 生物技术 | NA | 合成生物学、计算建模、系统生物学 | NA | NA | NA |
8 | 2025-06-14 |
Expressing exogenous gene in Chlamydomonas reinhardtii chloroplast with viral replication elements
2025-Jun-07, Bioresource technology
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.biortech.2025.132784
PMID:40490158
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研究论文 | 本研究开发了一种基于病毒复制元件的表达平台,用于在莱茵衣藻叶绿体中高效表达外源基因 | 利用甜菜卷顶病毒的复制机制构建表达平台,相比传统同源重组方法提高了表达水平(2-4倍),并能稳定表达转基因长达12个月 | NA | 解决莱茵衣藻叶绿体作为合成生物学底盘时产物产量低的问题 | 莱茵衣藻叶绿体 | 合成生物学 | NA | 病毒复制元件表达平台 | NA | NA | NA |
9 | 2025-06-14 |
Rosmarinic Acid as Bioactive Compound: Molecular and Physiological Aspects of Biosynthesis with Future Perspectives
2025-Jun-05, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells14110850
PMID:40498026
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综述 | 本文综述了迷迭香酸(RA)的生物合成、分子机制、生理功能及其在生物技术中的应用 | 探讨了合成生物学和代谢工程技术在提高RA工业生产中的应用 | NA | 研究迷迭香酸的生物合成、功能及其生产方法 | 迷迭香酸及其在植物中的生物合成 | 植物生物技术 | NA | 植物细胞组织培养、合成生物学、代谢工程 | NA | NA | NA |
10 | 2025-06-14 |
Complexity Meets Risk-The Next Generation of Genome-Edited Plants Challenges Established Concepts for Environmental Risk Assessment in the EU
2025-Jun-05, Plants (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/plants14111723
PMID:40508397
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研究论文 | 本文探讨了新一代基因组编辑植物对欧盟环境风险评估(ERA)现有概念的挑战 | 提出了针对复杂转基因植物应用的假设驱动评估方法,补充现有比较评估方法的不足 | 研究主要基于案例分析,可能缺乏大规模实证数据支持 | 评估欧盟现行转基因植物环境风险评估方法的适用性 | 复杂代谢途径修饰的转基因植物 | 生物技术 | NA | 基因组编辑技术 | NA | 案例分析数据 | 未明确说明具体样本数量 |
11 | 2025-06-14 |
Synthetic Biology in Natural Product Biosynthesis
2025-Apr-09, Chemical reviews
IF:51.4Q1
DOI:10.1021/acs.chemrev.4c00567
PMID:40116601
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综述 | 本文综述了合成生物学在天然产物生物合成中的最新进展 | 总结了合成生物学在天然产物发现和工程中的多学科工具整合与应用 | NA | 探讨合成生物学在天然产物生物合成中的作用 | 天然产物及其生物合成基因簇 | 合成生物学 | NA | 生物信息学、异源表达、组合生物合成 | NA | NA | NA |
12 | 2025-06-14 |
Cell-free expression and SMA copolymer encapsulation of a functional receptor tyrosine kinase disease variant, FGFR3-TACC3
2025-01-23, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-86194-6
PMID:39848978
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研究论文 | 该研究通过无细胞蛋白表达系统成功表达了功能性的FGFR3-TACC3融合蛋白,并利用SMA共聚物进行重构 | 首次使用无细胞蛋白表达系统在48小时内成功表达功能性FGFR3-TACC3融合蛋白,并实现高产量重构 | 尚未获得全长受体酪氨酸激酶的高分辨率结构 | 解决跨膜蛋白特别是受体酪氨酸激酶融合蛋白表达困难的问题 | FGFR3-TACC3融合蛋白 | 合成生物学 | 癌症 | 无细胞蛋白表达(CFPE), SMA共聚物重构 | NA | 蛋白功能数据 | NA |
13 | 2025-06-14 |
Optimal network sizes for most robust Turing patterns
2025-01-23, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-86854-7
PMID:39849094
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research paper | 该研究通过随机矩阵理论分析较大网络的Jacobian矩阵,探讨了图灵模式在生物系统中的形成机制及其最优网络大小 | 揭示了图灵模式比以往认为的更可能偶然发生,并发现最稳健的图灵网络具有一个最优大小,仅由少数分子物种组成,从而显著提高了其在生物系统中的可识别性 | 研究主要基于理论分析,需要进一步的实验验证以确认在真实生物系统中的适用性 | 探讨图灵模式在复杂生物基因调控网络中的形成机制及其稳健性 | 基因调控网络及其Jacobian矩阵 | systems biology | NA | random matrix theory | NA | theoretical analysis | NA |
14 | 2025-06-14 |
Optimizing phage therapy with artificial intelligence: a perspective
2025, Frontiers in cellular and infection microbiology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcimb.2025.1611857
PMID:40496019
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综述 | 本文综述了人工智能在优化噬菌体疗法中的最新进展及其潜在应用 | 探讨了AI如何促进噬菌体-宿主相互作用的研究,以设计更有效的噬菌体治疗剂 | 未提及具体的AI模型或技术在实际应用中的效果验证 | 探索人工智能在优化噬菌体疗法中的应用 | 噬菌体与细菌的相互作用 | 人工智能 | 抗菌耐药性 | NA | NA | NA | NA |
15 | 2025-06-14 |
Unlocking the potential of flavonoid biosynthesis through integrated metabolic engineering
2025, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2025.1597007
PMID:40510168
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综述 | 本文全面综述了黄酮类化合物的生物合成、调控、转运及产量提升策略,并探讨了如何通过合成生物学和数字工具实现可持续、高产量的黄酮类化合物生产 | 结合植物细胞工厂、基因组编辑、环境优化和人工智能驱动的代谢工程,提出了一种新颖的可持续高产黄酮类化合物的路线图 | NA | 探索黄酮类化合物的生物合成途径及提升其产量的策略 | 黄酮类化合物的生物合成、调控、转运及产量提升 | 合成生物学 | NA | 基因组编辑、人工智能驱动的代谢工程 | NA | NA | NA |
16 | 2025-06-14 |
Digital switching in a biosensor circuit via programmable timing of gene availability
2014-Dec, Nature chemical biology
IF:12.9Q1
DOI:10.1038/nchembio.1680
PMID:25306443
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research paper | 该研究展示了通过编程控制基因可用性时间,利用位点特异性重组酶纠正多基因电路中的不良效应,显著提高了生物传感器的性能 | 提出通过编程控制基因可用性时间来优化基因电路设计,显著提高了传感器的动态范围和特异性 | NA | 优化基因电路设计,提高生物传感器的性能和特异性 | 内源性microRNA (miRNA) 和细胞类型 | synthetic biology | NA | site-specific recombinases | NA | gene expression data | NA |
17 | 2025-06-13 |
Revolutionizing immunotherapy: The next frontier in CAR T-cell engineering
2025-Jul, Critical reviews in oncology/hematology
DOI:10.1016/j.critrevonc.2025.104751
PMID:40306469
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review | 本文综述了嵌合抗原受体(CAR)T细胞疗法的发展历程及其在癌症治疗中的革命性潜力 | 探讨了从第一代到第五代CAR T细胞的设计进展,包括共刺激结构域的引入、双信号通路和细胞因子释放机制的整合 | 在实体瘤治疗中仍面临免疫抑制性肿瘤微环境和抗原异质性的挑战 | 探索CAR T细胞疗法在癌症治疗中的最新进展和未来方向 | CAR T细胞疗法及其在血液系统恶性肿瘤和实体瘤中的应用 | 免疫治疗 | 癌症 | 合成生物学 | NA | NA | NA |
18 | 2025-06-13 |
Opto-p53: A Light-Controllable Activation of p53 Signaling Pathway
2025-Jun-12, Cell structure and function
IF:2.0Q4
DOI:10.1247/csf.25017
PMID:40500178
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研究论文 | 本研究开发了一种光遗传学工具Opto-p53,通过光控制p53信号通路的激活 | 开发了Opto-p53工具,利用光诱导二聚化系统选择性激活p53信号通路 | NA | 开发一种实验系统,用于在细胞和组织中选择性激活p53信号通路 | p53蛋白及其信号通路 | 合成生物学 | 肿瘤 | 光遗传学 | NA | NA | NA |
19 | 2025-06-13 |
In Vivo Multicellular Feedback Control in Synthetic Microbial Consortia
2025-Jun-11, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00862
PMID:40499137
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research paper | 提出了一种能够在合成微生物群落中实现稳定和精确基因表达调控的生物分子控制架构 | 通过分布式多细胞反馈回路在两个菌株之间实现分工,克服了传统单细胞生物分子控制策略的复杂性和适应性限制 | NA | 开发一种能够在合成微生物群落中实现稳定和精确基因表达调控的生物分子控制架构 | 合成微生物群落中的基因表达调控 | synthetic biology | NA | biomolecular control architecture | NA | NA | NA |
20 | 2025-06-13 |
Detection of TuMV by a toehold switch sensor coupled with NASBA amplification in Pseudostellaria heterophylla
2025-Jun-09, Plant methods
IF:4.7Q1
DOI:10.1186/s13007-025-01394-5
PMID:40490766
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研究论文 | 开发了一种基于核酸序列扩增(NASBA)和toehold开关传感器的无细胞表达系统,用于检测太子参中的芜菁花叶病毒(TuMV) | 结合NASBA扩增和toehold开关传感器,开发了一种快速、灵敏、特异性强且适用于田间应用的TuMV检测方法 | 未提及该方法在其他病毒检测中的适用性或长期稳定性 | 开发高效诊断系统以控制和减轻太子参中的TuMV感染 | 太子参(Pseudostellaria heterophylla)及其感染的芜菁花叶病毒(TuMV) | 合成生物学 | 植物病毒感染 | NASBA, toehold开关传感器 | NA | RNA片段 | 田间样品(具体数量未提及) |