合成生物学相关文章
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当前共找到 3264 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2025-06-18 |
Investigating the Potential of Division of Labor in Synthetic Bacterial Communities for the Production of Violacein
2025-Jun-17, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00120
PMID:40525226
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研究论文 | 本研究探讨了在合成细菌群落中分工对紫胶素生产的潜在益处 | 通过将紫胶素生物合成途径分配到两个亚群中，实现了2.5倍的产量提升 | 研究仅基于E. coli的合成群落，未探索其他微生物系统 | 探索分工策略对复杂代谢产物生产效率的提升 | 合成细菌群落和紫胶素生产途径 | 合成生物学 | NA | 代谢工程 | NA | NA | 使用基于E. coli的合成群落进行实验 |
| 2 | 2025-06-18 |
'Intelligent' proteins
2025-Jun-14, Cellular and molecular life sciences : CMLS
IF:6.2Q1
DOI:10.1007/s00018-025-05770-1
PMID:40515853
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research paper | 本文提出了一种挑战传统蛋白质分子观点的新理念，认为蛋白质表现出一种基本的‘智能’形式 | 结合整合信息理论(IIT)、网络理论和变构效应，重新定义蛋白质智能，并探讨其信息处理、环境适应和记忆行为 | 将智能概念应用于分子系统存在挑战，且如何设计适应性‘智能’蛋白质仍需解决 | 探索蛋白质的动态和适应性本质，为蛋白质工程、药物设计和合成生物学提供新视角 | 蛋白质分子 | 生物化学 | NA | 整合信息理论(IIT)、网络理论、变构效应分析 | NA | 理论分析 | NA |
| 3 | 2025-06-18 |
Deciphering and Predicting Thermal and pH Stabilities of Triplex DNA Under Multifactorial Conditions
2025-Jun-11, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202507190
PMID:40498537
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研究论文 | 本文开发了一种高通量5D荧光共振能量转移熔解退火(5DFRETMA)方法，用于研究环境及序列因素如何调控三链DNA的稳定性 | 开发了5DFRETMA方法，首次预测了可变温度和离子环境下的pH稳定性，并揭示了离子强度对三链DNA稳定性的双重影响 | NA | 揭示环境和序列因素如何调控三链DNA的稳定性，并开发预测模型 | 三链DNA | 生物物理学 | NA | 5D荧光共振能量转移熔解退火(5DFRETMA) | 预测模型 | 荧光数据 | 至少414组缓冲条件 |
| 4 | 2025-06-18 |
Real-Time Fluorescence-Based Method for Dynamic Quantification of Droplet Network Assembly
2025-Jun-10, ACS omega
IF:3.7Q2
DOI:10.1021/acsomega.5c02156
PMID:40521463
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research paper | 该研究介绍了一种基于荧光的分子信标方法，用于实时监测液滴组装，提高了合成生物学和中尺度材料应用的精确度 | 与传统成像技术（如显微镜图像的皮尔逊相关性）不同，这种直接方法能够以高灵敏度连续量化动态液滴相互作用 | NA | 提高合成生物学和中尺度材料应用中液滴组装的精确度 | 液滴网络组装 | 合成生物学 | NA | 荧光基分子信标方法 | NA | 荧光信号 | NA |
| 5 | 2025-06-18 |
Optimizing Plant Alkaloid Biosynthesis under Drought Stress: Regulatory Mechanisms and Biotechnological Strategies
2025-Jun-10, Journal of plant physiology
IF:4.0Q1
DOI:10.1016/j.jplph.2025.154545
PMID:40523330
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综述 | 本文综述了干旱胁迫下植物生物碱生物合成的调控机制及生物技术优化策略 | 探讨了ABA信号传导和ROS响应等关键通路对生物碱合成的调控作用，并提出了结合遗传工程、合成生物学和AI的优化策略 | 需要平衡植物生长与代谢产物生产的关系，并解决实验室策略在田间应用的可行性问题 | 提高干旱条件下植物生物碱的产量，促进药用植物产业的可持续发展 | 植物生物碱及其生物合成途径 | 植物生物技术 | NA | 遗传工程、合成生物学、AI | NA | NA | NA |
| 6 | 2025-06-18 |
Robust Synthetic Biology Toolkit to Advance Carboxysome Study and Redesign
2025-Jun-09, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00144
PMID:40488673
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研究论文 | 本研究设计并验证了一个名为pXpressome的质粒工具包，用于稳健表达和纯化功能完整的α-羧基体，以促进其研究和重新设计 | 开发了pXpressome工具包，能够稳健表达并纯化功能完整的α-羧基体，通过突变影响其结构和性能，并观察到比以往系统更均匀的表达和更好的细胞健康 | NA | 促进羧基体的研究和重新设计，以增强碳固定或作为其他纳米封装目标的平台 | α-羧基体 | 合成生物学 | NA | 质粒设计、突变分析、荧光标记 | NA | NA | NA |
| 7 | 2025-06-18 |
Engineering Nicotinamide Adenine Dinucleotide Oxidase for Regeneration of Oxidized Non-natural Cofactor
2025-May-22, Chembiochem : a European journal of chemical biology
IF:2.6Q3
DOI:10.1002/cbic.202500254
PMID:40400447
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research paper | 该研究通过改造来自粪肠球菌的NADH氧化酶（EfNOX），使其偏好氧化非天然辅因子NCDH，从而为氧化反应提供NCD | 首次成功改造NADH氧化酶以高效氧化非天然辅因子NCDH，并展示了其在合成生物学中的应用潜力 | 研究仅针对特定酶进行改造，可能不适用于其他酶或系统 | 开发能够氧化非天然辅因子NCDH的工具，以扩展其在氧化代谢反应中的应用 | NADH氧化酶（EfNOX）及其突变体 | 合成生物学 | NA | 酶工程、分子对接分析 | NA | 生化数据 | NA |
| 8 | 2025-06-18 |
A synthetic platform for developing recombinant adeno-associated virus type 8 producer cell lines
2025 May-Jun, Biotechnology progress
IF:2.5Q3
DOI:10.1002/btpr.70009
PMID:39968660
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研究论文 | 本研究建立了一个基于合成生物学的平台，用于构建稳定的重组腺相关病毒8型（rAAV8）生产细胞系 | 将rAAV2生产细胞系的构建流程扩展到rAAV8，并优化了包装模块以提高产量 | 初始产量低于传统的三质粒转染方法，Cap蛋白生产和衣壳形成是潜在的限制因素 | 开发适用于不同AAV血清型的稳定生产细胞系平台 | 重组腺相关病毒8型（rAAV8）生产细胞系 | 合成生物学 | NA | 合成生物学技术、基因工程 | NA | NA | 四种rAAV8生产细胞系（VH1-4） |
| 9 | 2025-06-18 |
Efficient expression of recombinant proteins in Bacillus subtilis using a rewired gene circuit of quorum sensing
2025 May-Jun, Biotechnology progress
IF:2.5Q3
DOI:10.1002/btpr.70007
PMID:39968680
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研究论文 | 本研究通过重构LuxRI群体感应系统，在枯草芽孢杆菌中实现了细胞密度依赖的重组蛋白高效表达 | 利用来自Aliivibrio fischeri的LuxRI群体感应系统，实现了重组蛋白表达与细胞生长的协调，并通过启动子工程和强终止子的引入显著提高了表达水平 | NA | 开发一种在枯草芽孢杆菌中高效表达重组蛋白的新方法 | 枯草芽孢杆菌和重组蛋白表达系统 | 合成生物学 | NA | 群体感应系统、启动子工程 | NA | NA | 四种突变启动子(P22, P47, P56, P58) |
| 10 | 2025-06-18 |
A tunable affinity fusion tag for protein self-assembly
2025-Jan-15, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.01.14.633037
PMID:39868245
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research paper | 该研究介绍了一种基于可调淀粉样蛋白的基因编码工具，用于精确控制细胞内蛋白质浓度阈值 | 通过系统筛选二肽重复序列，发现聚苏氨酸丙氨酸（poly-TA）因其在任意选定浓度阈值下形成淀粉样蛋白样组装体的独特能力而被选为理想候选物 | 未提及具体局限性 | 研究蛋白质浓度与活性之间的关系，并开发工具以操纵蛋白质溶解度 | 蛋白质浓度阈值及其对细胞功能的影响 | 合成生物学 | NA | 基因编码工具、系统筛选二肽重复序列 | NA | NA | NA |
| 11 | 2025-06-18 |
Multi-strategy ugt mining, modification and glycosyl donor synthesis facilitate the production of triterpenoid saponins
2025, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2025.1586295
PMID:40519597
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综述 | 本文综述了三萜皂苷糖基化的研究进展，重点介绍了多组学方法在UGT挖掘中的应用以及UGT修饰和糖基供体合成的最新研究 | 结合多组学方法（基因组学、转录组学和代谢组学）进行UGT筛选，提高了UGT鉴定的效率和准确性；应用合成生物学平台进行UGT的高通量筛选和功能验证；讨论了UGT修饰的最新研究进展，包括定向进化和合理设计 | NA | 促进三萜皂苷的生产和应用，提升其工业潜力 | 三萜皂苷及其糖基化过程中的关键酶UGT | 合成生物学 | NA | 多组学方法（基因组学、转录组学、代谢组学）、合成生物学平台 | NA | NA | NA |
| 12 | 2025-06-18 |
Microbial electrosynthesis meets synthetic biology: Bioproduction from waste feedstocks
2025, Biotechnology notes (Amsterdam, Netherlands)
DOI:10.1016/j.biotno.2025.05.001
PMID:40519649
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综述 | 本文综述了合成生物学在微生物电合成（MES）中的最新进展，重点介绍了利用废物原料和碳捕获进行电力介导的生物生产 | 结合电化学和生物学，通过合成生物学改进微生物细胞外电子传递和代谢途径效率，优化氧化还原平衡，扩展底物多样性和增强生物生产 | 关键挑战限制了MES的可扩展性，需要未来研究以实现工业规模部署 | 可持续化学生产和脱碳 | 微生物电合成（MES）和合成生物学 | 生物技术 | NA | 微生物电合成（MES） | NA | NA | NA |
| 13 | 2025-06-18 |
Viral vector-based transient expression systems for plant biotechnology research at PUIs
2025, Frontiers in education
IF:1.9Q2
DOI:10.3389/feduc.2025.1598673
PMID:40520985
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mini-review | 该文章探讨了病毒载体为基础的瞬时表达系统在本科院校植物生物技术研究中的应用 | 提出了一种成本低、时间短且设备要求简单的替代方法，适用于本科院校的教学与研究 | 未提及该方法在长期稳定性和大规模应用中的表现 | 推广病毒载体瞬时表达系统在本科院校植物生物技术研究和教学中的应用 | 本科院校的植物生物技术研究 | 植物生物技术 | NA | 病毒载体瞬时表达系统（如TMV或Geminivirus） | NA | NA | NA |
| 14 | 2025-06-18 |
A robust synthetic biology toolkit to advance carboxysome study and redesign
2024-Oct-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.10.08.617227
PMID:39416180
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研究论文 | 本研究设计并验证了一个名为pXpressome的工具包，用于稳健表达和纯化功能完整的α-羧基体，以促进其研究和重新设计 | 开发了pXpressome工具包，能够更均匀地表达羧基体并改善细胞健康状况，相比以往的系统具有更好的表现型一致性 | NA | 促进羧基体的研究和重新设计，以增强碳固定或作为其他纳米封装目标的平台 | α-羧基体 | 合成生物学 | NA | 质粒设计、荧光标记 | NA | NA | NA |
| 15 | 2025-06-18 |
Distinct phases of cellular signaling revealed by time-resolved protein synthesis
2024-Oct, Nature chemical biology
IF:12.9Q1
DOI:10.1038/s41589-024-01677-3
PMID:38977789
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research paper | 该研究利用邻近触发的蛋白质反式剪接技术，实现了目标蛋白质的时间分辨合成，并应用于多种蛋白质的动态调控 | 开发了一种模块化的蛋白质反式剪接技术，能够时间分辨地合成目标蛋白质，并调控其细胞定位和活性状态 | NA | 开发合成生物学工具，用于调控蛋白质功能并研究细胞信号传导 | 多种蛋白质，包括激酶融合蛋白BCR-ABL和DNAJ-PKAc | 合成生物学 | 癌症 | 邻近触发的蛋白质反式剪接技术 | NA | 蛋白质合成与调控数据 | 多种蛋白质样本，包括BCR-ABL和DNAJ-PKAc |
| 16 | 2025-06-18 |
Accurately predicting enzyme functions through geometric graph learning on ESMFold-predicted structures
2024-09-18, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-52533-w
PMID:39294165
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研究论文 | 提出了一种基于几何图学习的酶功能预测方法GraphEC，利用ESMFold预测的结构和预训练的蛋白质语言模型来预测酶的活性位点、EC编号和最适pH | 首次将几何图学习应用于酶功能预测，结合活性位点预测和同源信息扩散算法，显著提高了预测性能 | NA | 开发更准确的酶功能预测方法 | 酶蛋白 | 生物信息学 | NA | 几何图学习、蛋白质语言模型 | GraphEC | 蛋白质结构数据 | NA |
| 17 | 2025-06-18 |
Tunable cell differentiation via reprogrammed mating-type switching
2024-09-17, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-52282-w
PMID:39289346
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研究论文 | 本研究介绍了一种合成生物学方法，通过重编程酵母交配型转换机制实现可调谐的细胞分化，促进合成微生物群落的形成和协作 | 将酵母交配型转换机制工程化为遗传逻辑门，可在单倍体酵母群体中诱导不对称性分化，形成具有交配型异质性和可调谐群体组成的群落 | NA | 开发合成生物学方法以促进微生物群落的协作和生物技术应用 | 酵母细胞 | 合成生物学 | NA | 遗传工程 | 遗传逻辑门 | NA | NA |
| 18 | 2025-06-18 |
Bioenergetic stress potentiates antimicrobial resistance and persistence
2024-Jul-13, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.07.12.603336
PMID:39026737
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research paper | 该研究探讨了生物能量应激如何通过增加ATP利用影响抗生素治疗效果，并揭示了其通过增强ROS产生、突变断裂修复和转录偶联修复促进抗菌素耐药性（AMR）进化的机制 | 首次利用合成生物学方法构建了组成性水解ATP或NADH的遗传系统，直接研究生物能量应激对抗生素效果的影响，并提出了统一的模型解释抗生素诱导的抗菌素耐药性和持久性 | 研究仅在大肠杆菌中进行，未在其他细菌中验证 | 理解生物能量应激对抗生素治疗效果的影响机制 | 大肠杆菌 | 合成生物学 | 细菌感染 | 合成生物学方法 | 遗传工程系统 | NA | NA |
| 19 | 2025-06-18 |
An RNA origami robot that traps and releases a fluorescent aptamer
2024-03-22, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adk1250
PMID:38507482
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研究论文 | 本文介绍了一种名为'Traptamer'的RNA折纸机器人，能够机械捕获和释放荧光适配体iSpinach | 利用RNA折纸方法开发了一种能够感知、计算和驱动的RNA机器人设备，实现了对RNA功能的精确控制 | 研究仍处于原型阶段，尚未在真实细胞环境中验证其功能 | 开发先进的RNA纳米机器人设备以增强对分子过程的控制 | RNA折纸机器人Traptamer及其与荧光适配体iSpinach的相互作用 | RNA纳米技术 | NA | RNA折纸方法、冷冻电子显微镜 | 布尔AND门 | 分子结构数据、荧光信号 | NA |
| 20 | 2025-06-18 |
Cytokine signaling in chimeric antigen receptor T-cell therapy
2024-02-14, International immunology
IF:4.8Q2
DOI:10.1093/intimm/dxad033
PMID:37591521
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综述 | 本文综述了细胞因子信号在嵌合抗原受体T细胞（CAR-T）疗法中的作用及其调控策略 | 探讨了通过基因工程调控细胞因子信号以增强CAR-T细胞功能的新策略，并提出了减轻相关毒性的治疗方法 | 未涉及具体临床试验数据，主要基于理论和小规模实验研究 | 提高CAR-T细胞疗法的疗效并减少其副作用 | 嵌合抗原受体T细胞（CAR-T）及其细胞因子信号通路 | 免疫治疗 | 血液系统恶性肿瘤 | 基因工程、合成生物学方法 | NA | NA | NA |