合成生物学相关文章
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当前共找到 3502 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2025-08-10 |
Therapeutic engineering of the gut microbiome using synthetic biology and metabolic tools: a comprehensive review with E. coli Nissle 1917 as a model case study
2025-Aug-06, Archives of microbiology
IF:2.3Q3
DOI:10.1007/s00203-025-04417-w
PMID:40767874
|
综述 | 本文综述了利用合成生物学和代谢工程工具对肠道微生物组进行工程化改造的最新进展，特别以大肠杆菌Nissle 1917为模型案例 | 探讨了从早期重组益生菌到先进合成生物学平台的发展，展示了工程化微生物在精准生物治疗中的潜力 | NA | 综述肠道微生物组工程化改造在治疗肠道相关疾病中的应用 | 肠道微生物组，特别是大肠杆菌Nissle 1917 | 合成生物学 | 炎症性肠病, 代谢功能障碍, 结直肠癌, 苯丙酮尿症(PKU) | 生物催化, 代谢工程, 合成生物学 | NA | NA | NA |
| 2 | 2025-08-10 |
CRISPR.BOT an autonomous platform for streamlined genetic engineering and molecular biology applications
2025-Aug-06, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-01655-2
PMID:40770192
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研究论文 | 介绍了一种名为CRISPR.BOT的自主遗传工程平台，旨在革新分子生物学实验流程 | 开发了首个自主遗传工程平台CRISPR.BOT，实现了高效、精确的基因编辑和单细胞亚克隆，且成本大幅降低 | 未提及该平台在复杂生物系统或大规模实验中的适用性验证 | 开发一种低成本、高效的自主遗传工程平台，以革新分子生物学实验流程 | 细菌宿主、人类细胞系、SARS CoV-2病毒等微生物 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas9基因编辑、慢病毒转导、质粒DNA转移 | 自主机器人平台（LEGO Mindstorms） | NA | 未明确提及具体样本数量，但涉及细菌、人类细胞系和病毒等多种研究对象 |
| 3 | 2025-08-10 |
Targeted metabolomics-guided rational refinement of cyanobacterial metabolism enables enhanced photosynthetic production of L-lysine
2025-Aug-05, Metabolic engineering
IF:6.8Q1
DOI:10.1016/j.ymben.2025.07.015
PMID:40754064
|
研究论文 | 本研究通过靶向代谢组学和合成生物学方法优化蓝藻代谢，显著提高了L-赖氨酸的光合生产效率 | 结合靶向代谢组学和合成生物学方法，系统识别并缓解蓝藻中赖氨酸生物合成的限速步骤，使赖氨酸生产率提高约77% | 研究仅在蓝藻Synechococcus sp. PCC 7002中进行，未在其他蓝藻菌株中验证 | 开发碳负的赖氨酸生产途径，替代当前依赖糖发酵的工业生产方法 | 蓝藻Synechococcus sp. PCC 7002 | 合成生物学 | NA | 靶向代谢组学，合成生物学 | NA | 代谢组数据 | 工程化蓝藻菌株 |
| 4 | 2025-08-10 |
Cancer stem cells: landscape, challenges and emerging therapeutic innovations
2025-Aug-05, Signal transduction and targeted therapy
IF:40.8Q1
DOI:10.1038/s41392-025-02360-2
PMID:40759634
|
综述 | 本文综述了癌症干细胞（CSCs）的特性、挑战及新兴治疗策略的最新进展 | 整合了单细胞测序、空间转录组学和多组学分析等最新技术，探讨了CSCs的代谢可塑性及其与肿瘤微环境的相互作用，并提出了针对CSCs的精准治疗新策略 | 缺乏普遍可靠的CSCs生物标志物，以及在不影响正常干细胞的前提下靶向CSCs的挑战 | 探讨癌症干细胞的生物学特性及其在肿瘤治疗中的挑战与创新策略 | 癌症干细胞（CSCs）及其与肿瘤微环境的相互作用 | 肿瘤生物学 | 癌症 | 单细胞测序、空间转录组学、多组学整合、CRISPR功能筛选、AI驱动的多组学分析 | 3D类器官模型 | NA | NA |
| 5 | 2025-08-10 |
Genome mining of tailoring enzymes from biosynthetic gene clusters for synthetic biology: A case study with fungal methyltransferases
2025-Aug-05, Metabolic engineering
IF:6.8Q1
DOI:10.1016/j.ymben.2025.08.001
PMID:40774411
|
研究论文 | 本文提出了一种高效的基因组挖掘方法，用于从真菌生物合成基因簇中挖掘修饰酶，特别是甲基转移酶，以增强天然产物的多样性和生产效率 | 利用机器学习方法优先筛选合适的甲基转移酶，成功实现了对选定化合物的修饰，为合成生物学优化天然产物生物合成提供了新工具 | 研究仅针对真菌甲基转移酶进行了测试，未涵盖其他类型的修饰酶 | 开发高效的基因组挖掘方法，以识别和利用真菌生物合成基因簇中的修饰酶 | 真菌生物合成基因簇中的甲基转移酶 | 合成生物学 | NA | 基因组挖掘、机器学习 | 机器学习 | 基因组数据 | 101,321个真菌生物合成基因簇中的16,748个推定甲基转移酶 |
| 6 | 2025-08-10 |
Framing synthetic biology as an innovation-driven market
2025-Aug, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2025.02.003
PMID:39984349
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research paper | 提出一个合成生物学市场的框架，以促进对其商业潜力的共同理解 | 提出了一个区分专业合成生物学市场与更广泛产品市场的框架 | NA | 探讨合成生物学市场的商业潜力 | 合成生物学市场 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 7 | 2025-08-10 |
Large language model for knowledge synthesis and AI-enhanced biomanufacturing
2025-Aug, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2025.02.008
PMID:40050157
|
review | 本文综述了大语言模型（LLMs）在合成生物学（SynBio）教育和研究中的进展及其在生物制造中的潜在影响 | 探讨LLMs在合成生物学信息提取、知识图谱构建及检索增强生成中的应用，并预测LLMs将革新代谢建模与工程中的设计-构建-测试-学习（DBTL）循环，推动未来生物制造中的自动驾驶实验室发展 | 需要建立LLMs的基准测试，促进可信知识合成，发展生物安全框架以防止滥用，并鼓励AI科学家、SynBio研究人员和生物过程工程师之间的合作 | 探讨LLMs在合成生物学和生物制造领域的应用及其潜在影响 | 大语言模型（LLMs）及其在合成生物学和生物制造中的应用 | 自然语言处理 | NA | NA | LLM | 非结构化数据 | NA |
| 8 | 2025-08-10 |
Pollutant degradation in saline wastewater using synthetic biology
2025-Aug, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2025.06.012
PMID:40544014
|
research paper | 该研究利用合成生物学技术开发了一种工程化的Vibrio natriegens菌株，用于高效降解高盐环境中的复杂有机污染物 | 开发了一种能在高盐环境中高效降解复杂有机污染物的工程菌株 | NA | 解决全球紧迫的环境挑战，如石化废水排放和海洋石油泄漏 | 高盐环境中的复杂有机污染物 | 合成生物学 | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA |
| 9 | 2025-08-10 |
Translation efficiency covariation identifies conserved coordination patterns across cell types
2025-Jul-25, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-025-02718-5
PMID:40715459
|
研究论文 | 本研究通过分析人类和小鼠的核糖体分析数据集，提出了翻译效率协变（TEC）的概念，揭示了跨细胞类型的协调翻译模式 | 引入翻译效率协变（TEC）概念，发现跨细胞类型的协调翻译模式，并揭示了基因功能在翻译层面的保守性 | 研究主要基于核糖体分析数据，可能未涵盖所有翻译调控机制 | 探索基因在翻译层面的协调表达模式及其生物学意义 | 人类和小鼠的117种组织和94种细胞系的3,819个核糖体分析数据集 | 生物信息学 | NA | 核糖体分析 | NA | RNA-seq数据 | 3,819个核糖体分析数据集，来自117种人类组织和94种小鼠细胞系 |
| 10 | 2025-08-10 |
Tracing the development of CAR-T cell design: from concept to next-generation platforms
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1615212
PMID:40771804
|
综述 | 本文回顾了CAR-T细胞疗法的发展历程，从早期概念到下一代平台的设计 | 探讨了CAR-T细胞疗法在受体工程、代谢重编程和免疫信号优化方面的最新进展，以及新兴基因编辑工具的应用 | CAR-T细胞疗法仍面临严重副作用、治疗反应不一致和生产成本高等挑战 | 总结CAR-T细胞疗法的发展现状和未来方向，以扩大其在多种癌症和其他疾病中的应用 | CAR-T细胞疗法及其在癌症治疗中的应用 | 癌症免疫治疗 | 血液系统恶性肿瘤 | CRISPR、碱基编辑、RNA编辑、表观基因组编辑 | NA | NA | NA |
| 11 | 2025-08-10 |
Dimensions, stability, and deformability of DOPC-cholesterol giant unilamellar vesicles formed by droplet transfer
2025, Open research Europe
DOI:10.12688/openreseurope.19149.2
PMID:40771874
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研究论文 | 研究了通过液滴转移法制备的DOPC-胆固醇巨型单层囊泡(GUVs)的尺寸、稳定性和可变形性 | 揭示了胆固醇对DOPC GUVs尺寸分布、时间稳定性和可变形性的影响，为人工细胞和微型机器人应用提供了定制GUV膜特性的方法 | 仅研究了DOPC-胆固醇系统，未考虑其他磷脂组合的影响 | 理解胆固醇对合成磷脂膜模型(如GUVs)特性的影响 | DOPC-胆固醇巨型单层囊泡(GUVs) | 合成生物学 | NA | 液滴转移法、相差显微镜、磁致变形技术 | NA | 图像数据 | 四种不同DOPC与胆固醇比例(100:0, 85:15, 71:29, 60:40)的GUVs样本 |
| 12 | 2025-08-10 |
Research Progress on the Assembly of Large DNA Fragments
2024-04-16, Chembiochem : a European journal of chemical biology
IF:2.6Q3
DOI:10.1002/cbic.202400054
PMID:38477700
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综述 | 本文综述了合成生物学中DNA组装技术的发展现状，特别是大片段DNA组装的最新进展 | 重点介绍了在大肠杆菌、枯草芽孢杆菌和酿酒酵母中组装大片段DNA的方法和挑战 | 未提及具体实验数据或样本量，可能缺乏实证支持 | 促进定制基因组的构建，修改细胞功能甚至创造人工生命 | 大肠杆菌、枯草芽孢杆菌和酿酒酵母中的大片段DNA组装 | 合成生物学 | NA | DNA组装技术 | NA | NA | NA |
| 13 | 2025-08-09 |
Engineering microbial carbon metabolism for sustainable resource utilization
2025-Oct, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108622
PMID:40467014
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综述 | 本文综述了通过代谢工程利用可再生碳源进行微生物生物合成化学品的研究进展 | 强调了利用多组学测序、机器学习和人工智能指导菌株工程以提高可持续碳源利用的前景 | NA | 开发绿色节能资源以替代化石燃料 | 微生物碳代谢 | 合成生物学 | NA | 多组学测序、机器学习、人工智能 | NA | NA | NA |
| 14 | 2025-08-09 |
Methanol metabolism in synthetic methylotrophic microorganisms
2025-Oct, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108623
PMID:40499848
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研究论文 | 本文详细探讨了甲醇代谢途径，并综述了合成甲基营养微生物在代谢工程中的最新进展 | 重点介绍了人工甲基营养中创新的C1同化途径 | NA | 增强对甲醇代谢的理解并释放合成甲基营养菌的工业潜力 | 合成甲基营养微生物 | 合成生物学 | NA | 代谢工程 | NA | NA | NA |
| 15 | 2025-08-09 |
Fungal bioconversion of lignin-derived aromatics: Pathways, enzymes, and biotechnological potential
2025-Oct, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108624
PMID:40505753
|
综述 | 本文综述了真菌对木质素衍生芳香化合物的生物转化途径、酶及其生物技术潜力 | 系统整合了木质素衍生芳香化合物的真菌代谢途径，强调了真菌转运系统在芳香化合物摄取和外排中的关键作用 | 对芳香化合物代谢途径的系统整合仍显碎片化 | 推动基于真菌的平台开发，用于可持续生产可再生芳香化合物，促进循环生物经济和绿色生物制造 | 木质素衍生芳香化合物（如肉桂酸、没食子酸、阿魏酸和香兰素） | 生物技术 | NA | 合成生物学、计算建模和系统生物学 | NA | NA | NA |
| 16 | 2025-08-09 |
Revolutionizing lignin valorization: Key advances in demethylation, methylation, and methyl metabolism
2025-Oct, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108634
PMID:40588043
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综述 | 本文系统综述了木质素生物增值中的去甲基化、甲基化和甲基代谢过程 | 总结了微生物木质素增值的有前景的甲基循环路线，并强调了机器学习辅助酶工程、合成生物学和代谢工程等新型先进策略 | NA | 促进木质素的可持续增值，推动木质素基生物经济的发展 | 木质素及其衍生物 | 生物工程 | NA | 机器学习辅助酶工程、合成生物学、代谢工程 | NA | NA | NA |
| 17 | 2025-08-09 |
Beyond nature's clock: Accelerating genomic diversity through hypermutation
2025-Oct, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108638
PMID:40614910
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综述 | 本文系统回顾了旨在克服自然突变率不足的高突变技术进展及其在多个领域的应用 | 比较了定向、多靶点和全基因组高突变工具，并提出了未来发展方向如高通量筛选方法和AI驱动的突变结果预测模型 | 未提及具体实验数据验证这些高突变技术的实际效果 | 弥合自然突变限制与生物技术需求之间的差距 | 高突变技术 | 合成生物学 | NA | 定向突变、多靶点突变、全基因组突变 | AI-driven预测模型 | NA | NA |
| 18 | 2025-08-09 |
Yeast as C1 cell factory: Transforming methanol and Formate into high-value compounds
2025-Oct, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108641
PMID:40645511
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综述 | 本文综述了利用酵母作为C1细胞工厂，将甲醇和甲酸转化为高价值化合物的研究进展、挑战及未来展望 | 探讨了合成甲基营养在非甲基营养底盘中的发展，以及通过非理性基因组工程和菌株进化结合理性设计揭示隐藏的C1途径和底物耐受机制 | C1气体为基础的生物工艺在工业上的应用仍存在许多未解决的技术限制，且甲酸为基础的酵母生长和生物合成研究尚处于早期阶段 | 研究目的是通过酵母将温室气体如二氧化碳和甲烷转化为有价值的生化物质，以实现可持续的去碳化制造工业 | 工业酵母及其对甲醇和甲酸的耐受和同化能力 | 合成生物学 | NA | 合成甲基营养、非理性基因组工程、菌株进化、理性设计、模块化共培养工程、过氧化物酶体耦合 | NA | NA | NA |
| 19 | 2025-08-09 |
Advances in production and application technologies of minicells: A review
2025-Oct, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108648
PMID:40669734
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review | 本文综述了微型细胞的生产和应用技术进展，重点介绍了其形成机制、分离方法、最新应用以及未来挑战 | 强调了微型细胞在非传统药物递送领域的创新应用，包括解毒与耐受、富集与微反应器、分子封装与递送以及原生结构表征四大功能 | 讨论了微型细胞在生物技术应用中面临的挑战，但未具体说明当前技术的具体限制 | 探讨微型细胞在合成生物学、农业和医学领域的应用潜力 | 微型细胞（minicells） | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 20 | 2025-08-09 |
Unlocking the algae toolbox: Cutting-edge tools for environmental and biotechnological solutions
2025-Oct, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108652
PMID:40695391
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review | 本文综述了藻类研究中的最新工具和方法，强调了它们在推动藻类生物技术和全球可持续发展中的作用 | 整合了CRISPR-Cas9基因工程、高通量组学、机器学习驱动的建模和基于遥感技术的生态系统监测等前沿技术 | 大规模生产仍面临经济可行性和环境可持续性的挑战 | 探讨藻类在生物技术、环境管理和可持续产业中的应用 | 藻类 | 生物技术 | NA | CRISPR-Cas9, 高通量组学, 机器学习, 遥感技术, 光学传感器, 流式细胞术, 生物传感器, 环境DNA | NA | NA | NA |