合成生物学相关文章
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当前共找到 3514 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2025-08-12 |
Synthetic biology approaches for restoring gut microbial balance and engineering disease-specific microbiome therapeutics
2025-Oct, Microbial pathogenesis
IF:3.3Q2
DOI:10.1016/j.micpath.2025.107931
PMID:40716471
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综述 | 探讨合成生物学方法在恢复肠道微生物平衡及设计疾病特异性微生物组疗法中的应用 | 提出了一种结合区域微生物组生态型、饮食响应模块化设计和自适应代谢模型的生态精准工程框架，以确保跨人群兼容性和稳定性 | NA | 开发可重复、适应性强且包容性广的微生物组干预措施，作为精准医学的一部分 | 人类肠道微生物组 | 合成生物学 | 炎症性肠病(IBD)、肥胖、糖尿病、神经退行性疾病 | CRISPR基因组编辑、代谢工程、多组学整合 | 人工微生物群落(AMCs) | NA | NA |
| 2 | 2025-08-12 |
Deciphering and Predicting Thermal and pH Stabilities of Triplex DNA Under Multifactorial Conditions
2025-Aug-11, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202507190
PMID:40498537
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研究论文 | 本文通过开发高通量5DFRETMA方法，研究了环境与序列因素如何调控三链DNA的稳定性 | 开发了高通量5DFRETMA方法，首次预测了pH稳定性，并揭示了离子强度对三链DNA稳定性的双重影响 | NA | 揭示环境与序列因素如何调控三链DNA的稳定性，并为基因靶向治疗和合成生物学应用提供工具 | 三链DNA | 生物化学 | NA | 5D荧光共振能量转移熔解退火(5DFRETMA) | 预测模型 | 荧光数据 | 至少414组缓冲条件 |
| 3 | 2025-08-12 |
Exploring lipid diversity and minimalism to define membrane requirements for synthetic cells
2025-Aug-11, FEBS letters
IF:3.0Q3
DOI:10.1002/1873-3468.70131
PMID:40787853
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综述 | 本文探讨了合成细胞中脂质多样性与最小化，以定义膜的需求 | 对比了自下而上和自上而下的合成细胞构建方法，强调了膜蛋白与其周围脂质环境的关键相互作用 | 天然脂质膜的复杂性是构建最小系统的主要挑战 | 理解生命的基本原理并构建可应用于多个领域的合成细胞 | 合成细胞的脂质膜 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 4 | 2025-08-12 |
The growth benefits and toxicity of quinone biosynthesis are balanced by a dual regulatory mechanism and substrate limitations
2025-Aug-11, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mbio.00887-25
PMID:40788026
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研究论文 | 本文研究了乳酸菌中醌类前体DHNA的生物合成调控机制，揭示了遗传、酶和代谢共同作用的双重调控模式 | 首次阐明MenF和MenD酶在DHNA调控中的协同作用，建立包含可逆通量和变构反馈抑制的两阶段数学模型 | 研究仅限于乳酸菌模型，未在其他微生物体系中验证调控机制的普适性 | 解析微生物调控醌类水平的分子机制，为代谢工程改造提供理论基础 | 乳酸菌中甲萘醌前体DHNA的生物合成途径 | 合成生物学 | NA | 合成生物学方法、数学建模 | 两阶段调控数学模型 | 酶活性数据、代谢物浓度数据 | NA |
| 5 | 2025-08-12 |
Enhancing the β-Oxidation-Like Pathway for the Optimal Production of the Immunosuppressant Mycophenolic Acid
2025-Aug-11, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202508826
PMID:40788096
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research paper | 该研究首次在真菌中重构了负责组装免疫抑制剂霉酚酸（MPA）的β-氧化样酶级联反应，并通过优化途径提高了MPA的产量 | 首次在真菌天然产物生物合成中建立了完整的β-氧化样酶级联反应，为利用分解代谢模块驱动合成创新提供了范例 | NA | 优化β-氧化样途径以高效生产免疫抑制剂霉酚酸（MPA） | 真菌β-氧化酶级联反应及其在霉酚酸生物合成中的作用 | 合成生物学 | NA | 体外酶测定、基因过表达 | NA | NA | NA |
| 6 | 2025-08-12 |
Intelligent Design of Microbial Carbohydrate Factories: Integrated Chassis-Tools-Strategies Frameworks
2025-Aug-11, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.5c05803
PMID:40788265
|
review | 本文综述了合成生物学在微生物碳水化合物工厂智能设计中的集成方法 | 提出了一个多维理论框架，整合了底盘生物特性、计算与实验工具以及代谢工程策略，用于智能设计碳水化合物生物合成系统 | NA | 探索微生物生产碳水化合物的合成生物学方法 | 工业底盘生物及其碳水化合物合成途径 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、计算建模 | NA | NA | NA |
| 7 | 2025-08-12 |
Recent advances of muconic acid production using microbial synthetic biology
2025-Aug-11, Archives of microbiology
IF:2.3Q3
DOI:10.1007/s00203-025-04419-8
PMID:40788366
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review | 本文综述了利用微生物合成生物学生产黏康酸的最新进展 | 讨论了提高黏康酸产量的策略，包括辅因子工程、模块化共培养和人工智能辅助酶优化 | 未提及具体实验数据或样本量，可能缺乏实证支持 | 探讨微生物合成生物学在黏康酸生产中的应用及其经济和技术可行性 | 黏康酸的生产方法和优化策略 | 合成生物学 | NA | 辅因子工程、模块化共培养、人工智能辅助酶优化 | NA | NA | NA |
| 8 | 2025-08-12 |
SpyRing-Mediated Cyclization of TEV Protease, Guided by AlphaFold, Improves Thermostability
2025-Aug-05, ACS omega
IF:3.7Q2
DOI:10.1021/acsomega.5c05386
PMID:40787351
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研究论文 | 通过SpyRing系统和AlphaFold指导的环化策略，提高烟草蚀纹病毒蛋白酶（TEVp）的热稳定性 | 利用SpyRing系统实现蛋白质共价环化，结合AlphaFold结构预测优化连接子长度和结构域位置，显著提高了TEVp的热稳定性 | 研究仅针对特定TEVp变体（L56V, S135G, S219V, Δ238-242），未在其他蛋白质上验证该策略的普适性 | 开发一种提高蛋白质热稳定性的通用策略，用于合成生物学和工业生物技术应用 | 烟草蚀纹病毒蛋白酶（TEVp） | 蛋白质工程 | NA | SpyTag/SpyCatcher介导的异肽键形成，AlphaFold结构预测 | NA | 蛋白质结构数据 | NA |
| 9 | 2025-08-12 |
Unveiling the Frontiers of Synthetic Biology in Brazil: Pioneering the National Synthetic Biology Network
2025-Aug-05, ACS omega
IF:3.7Q2
DOI:10.1021/acsomega.5c03077
PMID:40787363
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综述 | 本文探讨了合成生物学在巴西的发展现状及巴西合成生物学网络的建立 | 介绍了巴西合成生物学网络的建立及其在推动国家生物技术能力方面的作用 | 巴西的科学和监管环境对国际社会了解不足，限制了其技术发展 | 推动巴西合成生物学的发展及其在全球经济可持续发展中的作用 | 巴西的合成生物学研究群体及巴西合成生物学网络 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 10 | 2025-08-12 |
KDBI-RP: Kinetic Data of RNA-Protein Interactions Database
2025-Jul-25, Journal of molecular biology
IF:4.7Q1
DOI:10.1016/j.jmb.2025.169357
PMID:40716733
|
research paper | 介绍KDBI-RP，一个专注于RNA-蛋白质相互作用动力学的数据库 | KDBI-RP是首个系统整合RNA-蛋白质相互作用动力学数据的专用数据库，填补了该领域定量数据库的空白 | NA | 为RNA生物学和RNA医学研究提供定量动力学数据资源 | RNA-蛋白质相互作用动力学数据 | 生物信息学 | NA | NA | NA | 定量动力学数据 | 3657个结合速率常数条目，3761个解离速率常数条目，175,932个平衡解离常数条目 |
| 11 | 2025-08-11 |
Molecular logic gates based on programmable self-assembly of DNA origami triangles for the detection of nucleic acid molecules
2025-Aug-09, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-15119-0
PMID:40783588
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研究论文 | 本研究开发了一种基于DNA折纸纳米结构和分子逻辑门的可编程核酸检测平台，用于动态分子计算 | 通过将DNA折纸纳米结构与分子逻辑门结合，实现了目标驱动的层次自组装，模拟布尔逻辑运算（YES、AND和OR门） | NA | 开发可编程核酸检测平台，推动动态分子计算领域的发展 | DNA折纸纳米结构和分子逻辑门 | 分子纳米技术 | 肺癌 | DNA折纸技术、原子力显微镜（AFM）、链置换技术 | NA | 核酸分子 | NA |
| 12 | 2025-08-11 |
Protocol for fabricating a reusable plate-well insert with a 3D-printed mounter and hydrogel scaffolds for 3D cell culture and functional assays
2025-Aug-07, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2025.104014
PMID:40782348
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研究论文 | 本文提出了一种用于标准24孔板的可重复使用插入件的制造协议，包括3D打印支架和水凝胶支架，用于3D细胞培养研究 | 通过3D打印支架和水凝胶支架的结合，简化了水凝胶制备和安装过程，减少了批次间差异，降低了成本，并支持合成生物学研究 | NA | 开发一种用于3D细胞培养和功能测定的可重复使用插入件的制造协议 | 标准24孔板的可重复使用插入件 | 生物医学工程 | NA | 3D打印，水凝胶支架合成，冻干，灭菌，亲水化处理 | NA | NA | NA |
| 13 | 2025-08-11 |
A Strictly Inducible and Orthogonal Dre-rox System for Precise and Markerless Genome Editing in Bacillus subtilis
2025-Jul-25, Journal of microbiology and biotechnology
IF:2.5Q3
DOI:10.4014/jmb.2505.05006
PMID:40730489
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研究论文 | 本文介绍了一种在枯草芽孢杆菌中实现精确和无标记基因组编辑的严格诱导和正交Dre-rox系统 | 开发了一种与Cre功能正交且性能相当的Dre-rox系统，通过茶碱诱导的核糖开关严格控制Dre表达，提高了重组特异性 | NA | 扩展基因组工程工具包，支持合成生物学中的分层途径工程、突变体库生成和模块化底盘开发 | 枯草芽孢杆菌 | 合成生物学 | NA | 基因组编辑 | Dre-rox系统 | 基因组数据 | NA |
| 14 | 2025-08-10 |
Therapeutic engineering of the gut microbiome using synthetic biology and metabolic tools: a comprehensive review with E. coli Nissle 1917 as a model case study
2025-Aug-06, Archives of microbiology
IF:2.3Q3
DOI:10.1007/s00203-025-04417-w
PMID:40767874
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综述 | 本文综述了利用合成生物学和代谢工程工具对肠道微生物组进行工程化改造的最新进展，特别以大肠杆菌Nissle 1917为模型案例 | 探讨了从早期重组益生菌到先进合成生物学平台的发展，展示了工程化微生物在精准生物治疗中的潜力 | NA | 综述肠道微生物组工程化改造在治疗肠道相关疾病中的应用 | 肠道微生物组，特别是大肠杆菌Nissle 1917 | 合成生物学 | 炎症性肠病, 代谢功能障碍, 结直肠癌, 苯丙酮尿症(PKU) | 生物催化, 代谢工程, 合成生物学 | NA | NA | NA |
| 15 | 2025-08-10 |
CRISPR.BOT an autonomous platform for streamlined genetic engineering and molecular biology applications
2025-Aug-06, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-01655-2
PMID:40770192
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研究论文 | 介绍了一种名为CRISPR.BOT的自主遗传工程平台，旨在革新分子生物学实验流程 | 开发了首个自主遗传工程平台CRISPR.BOT，实现了高效、精确的基因编辑和单细胞亚克隆，且成本大幅降低 | 未提及该平台在复杂生物系统或大规模实验中的适用性验证 | 开发一种低成本、高效的自主遗传工程平台，以革新分子生物学实验流程 | 细菌宿主、人类细胞系、SARS CoV-2病毒等微生物 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas9基因编辑、慢病毒转导、质粒DNA转移 | 自主机器人平台（LEGO Mindstorms） | NA | 未明确提及具体样本数量，但涉及细菌、人类细胞系和病毒等多种研究对象 |
| 16 | 2025-08-10 |
Targeted metabolomics-guided rational refinement of cyanobacterial metabolism enables enhanced photosynthetic production of L-lysine
2025-Aug-05, Metabolic engineering
IF:6.8Q1
DOI:10.1016/j.ymben.2025.07.015
PMID:40754064
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研究论文 | 本研究通过靶向代谢组学和合成生物学方法优化蓝藻代谢，显著提高了L-赖氨酸的光合生产效率 | 结合靶向代谢组学和合成生物学方法，系统识别并缓解蓝藻中赖氨酸生物合成的限速步骤，使赖氨酸生产率提高约77% | 研究仅在蓝藻Synechococcus sp. PCC 7002中进行，未在其他蓝藻菌株中验证 | 开发碳负的赖氨酸生产途径，替代当前依赖糖发酵的工业生产方法 | 蓝藻Synechococcus sp. PCC 7002 | 合成生物学 | NA | 靶向代谢组学，合成生物学 | NA | 代谢组数据 | 工程化蓝藻菌株 |
| 17 | 2025-08-10 |
Cancer stem cells: landscape, challenges and emerging therapeutic innovations
2025-Aug-05, Signal transduction and targeted therapy
IF:40.8Q1
DOI:10.1038/s41392-025-02360-2
PMID:40759634
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综述 | 本文综述了癌症干细胞（CSCs）的特性、挑战及新兴治疗策略的最新进展 | 整合了单细胞测序、空间转录组学和多组学分析等最新技术，探讨了CSCs的代谢可塑性及其与肿瘤微环境的相互作用，并提出了针对CSCs的精准治疗新策略 | 缺乏普遍可靠的CSCs生物标志物，以及在不影响正常干细胞的前提下靶向CSCs的挑战 | 探讨癌症干细胞的生物学特性及其在肿瘤治疗中的挑战与创新策略 | 癌症干细胞（CSCs）及其与肿瘤微环境的相互作用 | 肿瘤生物学 | 癌症 | 单细胞测序、空间转录组学、多组学整合、CRISPR功能筛选、AI驱动的多组学分析 | 3D类器官模型 | NA | NA |
| 18 | 2025-08-10 |
Genome mining of tailoring enzymes from biosynthetic gene clusters for synthetic biology: A case study with fungal methyltransferases
2025-Aug-05, Metabolic engineering
IF:6.8Q1
DOI:10.1016/j.ymben.2025.08.001
PMID:40774411
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研究论文 | 本文提出了一种高效的基因组挖掘方法，用于从真菌生物合成基因簇中挖掘修饰酶，特别是甲基转移酶，以增强天然产物的多样性和生产效率 | 利用机器学习方法优先筛选合适的甲基转移酶，成功实现了对选定化合物的修饰，为合成生物学优化天然产物生物合成提供了新工具 | 研究仅针对真菌甲基转移酶进行了测试，未涵盖其他类型的修饰酶 | 开发高效的基因组挖掘方法，以识别和利用真菌生物合成基因簇中的修饰酶 | 真菌生物合成基因簇中的甲基转移酶 | 合成生物学 | NA | 基因组挖掘、机器学习 | 机器学习 | 基因组数据 | 101,321个真菌生物合成基因簇中的16,748个推定甲基转移酶 |
| 19 | 2025-08-10 |
Framing synthetic biology as an innovation-driven market
2025-Aug, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2025.02.003
PMID:39984349
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research paper | 提出一个合成生物学市场的框架，以促进对其商业潜力的共同理解 | 提出了一个区分专业合成生物学市场与更广泛产品市场的框架 | NA | 探讨合成生物学市场的商业潜力 | 合成生物学市场 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 20 | 2025-08-10 |
Large language model for knowledge synthesis and AI-enhanced biomanufacturing
2025-Aug, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2025.02.008
PMID:40050157
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review | 本文综述了大语言模型（LLMs）在合成生物学（SynBio）教育和研究中的进展及其在生物制造中的潜在影响 | 探讨LLMs在合成生物学信息提取、知识图谱构建及检索增强生成中的应用，并预测LLMs将革新代谢建模与工程中的设计-构建-测试-学习（DBTL）循环，推动未来生物制造中的自动驾驶实验室发展 | 需要建立LLMs的基准测试，促进可信知识合成，发展生物安全框架以防止滥用，并鼓励AI科学家、SynBio研究人员和生物过程工程师之间的合作 | 探讨LLMs在合成生物学和生物制造领域的应用及其潜在影响 | 大语言模型（LLMs）及其在合成生物学和生物制造中的应用 | 自然语言处理 | NA | NA | LLM | 非结构化数据 | NA |