合成生物学相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
1	2025-06-22	Integrase enables synthetic intercellular logic via bacterial conjugation 2025-Jun-18, Cell systems IF:9.0Q1 DOI:10.1016/j.cels.2025.101268 PMID:40300599	研究论文	本文介绍了一种通过细菌接合设计、构建和测试基于整合酶的细胞间DNA信息传递的通用策略	提出了基于整合酶的细胞间DNA信息传递及其通过水平基因转移调控的新方法	NA	推进细胞间DNA信息传递、分层信号处理以及整合酶在系统和合成生物学中的应用	细菌接合过程中的整合酶和DNA信息传递	合成生物学	NA	细菌接合	NA	DNA	NA
2	2025-06-22	A systems view of cellular heterogeneity: Unlocking the "wheel of fate" 2025-Jun-18, Cell systems IF:9.0Q1 DOI:10.1016/j.cels.2025.101300 PMID:40472847	综述	本文通过系统生物学的视角，探讨细胞异质性的概念及其在干细胞研究和再生医学中的应用	提出一个从细胞角度概念化异质性的框架，并总结了用于捕捉异质性的系统和合成生物学工具	未提及具体的技术或数据限制	探讨细胞异质性的生物学意义及其在干细胞研究和再生医学中的应用	人类多能干细胞(hPSC)培养和β细胞分化	系统生物学	NA	单细胞技术	NA	NA	NA
3	2025-06-22	Three cytochrome P450 88A subfamily enzymes, CYP88A108, CYP88A164, and CYP88A222, act as β-amyrin 11-oxidases involved in triterpenoid biosynthesis in Melia azedarach L 2025-Jun-18, International journal of biological macromolecules IF:7.7Q1 DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.145362 PMID:40541870	research paper	该研究鉴定了Melia azedarach L.中三个CYP88A亚家族细胞色素P450基因作为β-香树脂醇11-氧化酶，参与三萜类生物合成	揭示了CYP88A亚家族酶在五环三萜和柠檬苦素类生物合成中的双重功能，支持了结构保守驱动的功能趋同新范式	NA	阐明Melia azedarach中五环三萜类化合物的生物合成机制	Melia azedarach L.中的CYP88A亚家族细胞色素P450基因	植物分子生物学	NA	转录组挖掘、烟草瞬时表达系统、酵母微粒体功能表征	NA	基因序列、酶活性数据	三个CYP88A亚家族基因(MaCYP88A108, MaCYP88A164, MaCYP88A222)和一个氧化角鲨烯环化酶(MaβAS1)
4	2025-06-22	Metabolic engineering for microbial production of sugar acids 2025-May-13, BMC biotechnology IF:3.5Q2 DOI:10.1186/s12896-025-00973-7 PMID:40361067	综述	本文综述了微生物生产糖酸的代谢工程方法及其应用	强调了代谢工程和合成生物学工具在优化微生物菌株生产糖酸中的关键作用	未提及具体实验数据或生产效能的定量分析	探讨微生物生产糖酸的方法及其工业应用	糖酸（包括醛糖酸、糖醛酸和糖二酸）	生物技术	NA	代谢工程、CRISPR-Cas、动态调控回路	NA	NA	NA
5	2025-06-22	BTG13-related metalloenzymes: Atypical non-heme iron-dependent dioxygenases with unusual coordination patterns and catalytic mechanisms 2025-Mar, Engineering microbiology DOI:10.1016/j.engmic.2024.100188 PMID:40538716	research paper	本文介绍了一种新型非血红素铁依赖性双加氧酶BTG13，其具有独特的配位中心和催化机制	发现了一种新型非血红素铁依赖性双加氧酶BTG13，具有由四个组氨酸和一个羧化赖氨酸(Kcx)组成的独特配位中心，并通过分子动力学模拟和量子化学计算揭示了其催化蒽醌C-C键断裂的非传统步骤	NA	研究非血红素铁依赖性双加氧酶的多样性和催化机制	BTG13相关金属酶及其催化机制	生物化学	NA	分子动力学模拟, 量子化学计算, 系统发育分析	NA	生化数据	NA
6	2025-06-22	Parsing patterns: Emerging roles of tissue self-organization in health and disease 2024-Jun-20, Cell IF:45.5Q1 DOI:10.1016/j.cell.2024.05.016 PMID:38906093	review	探讨生物组织中自组织模式在健康和疾病中的作用	综述了胚胎和成体组织中自组织模式的原理和机制，并探讨其在稳态、修复和病理状态中的作用	NA	理解自组织模式在生物组织中的普遍性和应用	胚胎和成体组织	生物学	炎症性皮肤病、肿瘤	NA	NA	NA	NA
7	2025-06-21	Construction of a synthetic biology toolkit for the genetic manipulation in the cellulose-producing strain Kosakonia oryzendophytica 2025-Sep, Synthetic and systems biotechnology IF:4.4Q1 DOI:10.1016/j.synbio.2025.05.012 PMID:40529626	research paper	开发了一个合成生物学工具包，用于在纤维素生产菌株Kosakonia oryzendophytica中进行遗传操作	构建了一个可调表达模块和精确基因组编辑能力的综合工具包，用于重编程菌株以生产具有定制特性的下一代纤维素基功能材料	NA	开发合成生物学平台以工程化高产细菌纤维素合成菌株	Kosakonia oryzendophytica菌株	合成生物学	NA	CRISPR/Cas9介导的无疤痕基因组编辑系统	NA	NA	NA
8	2025-06-21	Biomolecular Condensate-Based Artificial Organelle for Driving Compartmentalized Flux Control 2025-Jun-20, ACS synthetic biology IF:3.7Q1 DOI:10.1021/acssynbio.4c00871 PMID:40339164	研究论文	该研究开发了一种基于生物分子凝聚物的人工细胞器平台，用于实现模块化通路区室化以精确控制代谢通量	利用工程化生物分子凝聚物创建可编程人工细胞器，通过空间组织关键酶来克服代谢中间体扩散分散问题	目前仅在2'-岩藻糖基乳糖生物合成通路中验证了该平台的有效性	开发合成生物学平台以优化区室化生物合成通路的效率	工程化大肠杆菌中的2'-岩藻糖基乳糖生物合成通路	合成生物学	NA	蛋白质工程、代谢通路设计	NA	生物分子相互作用数据、代谢物浓度数据	工程化大肠杆菌菌株
9	2025-06-21	Microfluidic Fluorescence-Activated Cell Sorting of Convolutional Neural Network-Designed Synthetic Yeast Promoter 2025-Jun-20, ACS synthetic biology IF:3.7Q1 DOI:10.1021/acssynbio.5c00025 PMID:40368332	研究论文	本文开发了一种分支卷积神经网络（B-CNN）结合遗传算法设计合成酵母启动子，并通过微流控荧光激活细胞分选（μFACS）系统进行高通量筛选	结合B-CNN和遗传算法设计合成酵母启动子，并开发了μFACS系统进行高通量筛选	NA	提高酵母启动子的设计和筛选效率，增强基因表达和代谢物生物合成	合成酵母启动子	合成生物学	NA	微流控荧光激活细胞分选（μFACS）	分支卷积神经网络（B-CNN）	序列数据	NA
10	2025-06-21	De Novo Synthesis of Friedelin in Saccharomyces cerevisiae via Combination of Metabolic and Lipid Droplet Engineering 2025-Jun-20, ACS synthetic biology IF:3.7Q1 DOI:10.1021/acssynbio.5c00047 PMID:40373267	研究论文	本研究通过代谢和脂滴工程的结合，在酿酒酵母中实现了friedelin的从头合成	首次在酿酒酵母中构建了friedelin的从头合成途径，并通过多种优化策略将产量提高了30倍	研究仅在摇瓶发酵规模进行，尚未进行大规模发酵验证	开发更高效和可持续的friedelin生产方法	酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae)	合成生物学	NA	代谢工程、脂滴工程、发酵优化	NA	NA	Z28菌株在250 mL摇瓶发酵
11	2025-06-21	Bioproduction of a Large-Scale Library of Tryptamine Derivatives for Neuropsychiatric Drug Screening 2025-Jun-20, ACS chemical biology IF:3.5Q2 DOI:10.1021/acschembio.4c00857 PMID:40375477	研究论文	本研究通过微生物代谢工程和发酵技术，构建了一个大规模色胺衍生物库，用于神经精神药物的筛选	利用生物合成策略构建大规模化合物库，克服了传统合成化学在通量、规模和多样性上的限制，并实现了目标产物的纯化	部分目标化合物未被检测到，且生物发酵的产量相对较低	开发一种基于生物发酵的大规模药物筛选方法，用于神经精神疾病的治疗	色胺衍生物	合成生物学	神经精神疾病	微生物代谢工程、发酵技术	NA	化学化合物	344种可能的生物转化，产生279种产物，其中17种新型乙酰化衍生物进行了放大培养和纯化
12	2025-06-21	Genetic Toggle Switch in Plants 2025-Jun-20, ACS synthetic biology IF:3.7Q1 DOI:10.1021/acssynbio.4c00777 PMID:40387045	研究论文	该研究开发了一种植物基因开关，通过定量表征的转移函数和计算机模型指导组装，实现了在稳定工程植物中的预测功能	首次在植物中开发了可编程的基因开关，并通过计算机模型指导组件选择和电路优化	研究主要关注基因开关的功能验证，未全面评估植物特有属性（如环境敏感性、发育可塑性）对电路预测性的影响	开发可预测和可编程的植物基因设备，以利用植物独特能力于可持续人类和环境系统	植物基因元件和基因开关电路	合成生物学	NA	定量转移函数表征、计算机建模	基因调控网络模型	基因表达数据	稳定工程植物（具体数量未提及）
13	2025-06-21	Synthetic Phosphorylation Networks with Fluorescence and Luminescence Expansion 2025-Jun-20, ACS synthetic biology IF:3.7Q1 DOI:10.1021/acssynbio.4c00814 PMID:40476587	research paper	介绍了一种名为SPN-FLUX的全翻译后平台，该平台整合了合成磷酸化网络与分裂荧光或发光蛋白，用于快速可调地报告细胞过程	SPN-FLUX平台不依赖转录介导的报告过程，能够在1小时内响应细胞外刺激，提供了一种快速实时的细胞信号事件报告方法	NA	开发一种新型合成受体平台，用于快速实时监测细胞信号事件	哺乳动物细胞	synthetic biology	NA	synthetic phosphorylation networks, split fluorescent or luminescent proteins	NA	fluorescence and luminescence data	NA
14	2025-06-21	Standardized Quorum Sensing Tools for Gram-Negative Bacteria 2025-Jun-20, ACS synthetic biology IF:3.7Q1 DOI:10.1021/acssynbio.5c00036 PMID:40476774	研究论文	开发了一套标准化的群体感应（QS）工具，用于革兰氏阴性细菌之间的通信	利用SEVA质粒集合构建了三套QS系统，提高了系统的通用性和可交换性，并提供了数学模型和速率参数以支持设计	目前QS工具箱在非模型细菌中的应用仍有待验证	开发标准化的群体感应工具以促进合成菌群的分布式功能	革兰氏阴性细菌	合成生物学	NA	群体感应（QS）系统	数学模型	NA	NA
15	2025-06-21	Robust Synthetic Biology Toolkit to Advance Carboxysome Study and Redesign 2025-Jun-20, ACS synthetic biology IF:3.7Q1 DOI:10.1021/acssynbio.5c00144 PMID:40488673	研究论文	本研究设计和验证了一个名为pXpressome的质粒工具包，用于稳健表达和纯化功能性α-羧基体，并探索了通过基因突变调控羧基体形态和性能的方法	开发了pXpressome工具包，实现了羧基体的稳健表达和纯化，并通过基因编辑调控其形态，提高了表达均匀性和细胞健康状态	NA	推进羧基体研究和重新设计，为增强碳固定或其他纳米封装目标提供平台	α-羧基体及其相关基因	合成生物学	NA	基因编辑、荧光标记	NA	NA	NA
16	2025-06-21	The Japan-UK Synthetic Biology Conference, Spring 2025: Strengthening Global Links to Engineer Biology 2025-Jun-20, ACS synthetic biology IF:3.7Q1 DOI:10.1021/acssynbio.5c00232 PMID:40538270	评论	本文总结了2025年春季日本-英国合成生物学会议的核心科学议题、新兴趋势及面临的挑战	强调了国际合作在推动合成生物学发展中的重要性，并提出了通过共享专业知识、国家基础设施和资金支持来应对挑战的方法	文章仅基于会议内容进行总结，未涉及具体研究数据或实验验证	促进合成生物学领域的国际合作与研究进展	合成生物学领域的科研人员与政策制定者	合成生物学	NA	NA	NA	NA	NA
17	2025-06-21	Switchable RNA motifs for dynamic transcriptional control of RNA condensates 2025-Jun-20, Nucleic acids research IF:16.6Q1 DOI:10.1093/nar/gkaf497 PMID:40539511	research paper	该研究展示了如何通过设计包含额外线性或分支环域的RNA纳米星结构，动态控制RNA凝聚体的形成和解离	利用RNA入侵者和抗入侵者链实现RNA凝聚体的可逆调控，为合成生物学提供了响应性自组织生物分子材料的新工具	研究仅在体外一锅反应中验证，尚未在体内环境中测试	开发可调控的RNA凝聚体工程方法	RNA纳米星结构及其形成的生物分子凝聚体	合成生物学	NA	体外转录	NA	NA	NA
18	2025-06-21	From Code to Life: The AI-Driven Revolution in Genome Editing 2025-Jun-19, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany) DOI:10.1002/advs.202417029 PMID:40538131	review	本文探讨了人工智能（AI）在基因组编辑领域的革命性作用及其应用	AI驱动的模型提高了sgRNA设计的准确性，发现了新的Cas蛋白，并增强了基因调控网络分析	AI驱动的基因组编辑存在数据偏见、算法透明度和意外基因修改等伦理问题	研究AI如何提升基因组编辑的精确性和效率	基因组编辑技术及其应用	machine learning	genetic disease	CRISPR-associated systems, deep learning-based predictors, protein language models	deep learning	genomic data	NA
19	2025-06-21	Progress and prospects in metabolic engineering approaches for isoprenoid biosynthesis in microalgae 2025-Jun-18, Biotechnology for biofuels and bioproducts IF:3.3Q3 DOI:10.1186/s13068-025-02665-y PMID:40533766	综述	本文综述了微藻中类异戊二烯生物合成的代谢工程方法进展与前景	详细讨论了代谢工程和合成生物学策略在优化微藻类异戊二烯生物合成途径中的应用	未提及具体实验数据或样本量，可能缺乏实证支持	探讨微藻中类异戊二烯生物合成的代谢工程方法及其应用前景	微藻及其代谢途径	合成生物学	NA	代谢工程、合成生物学	NA	NA	NA
20	2025-06-21	Addressing challenges in microbial manufacturing: Systematic microbial biotechnology 2025-Jun-02, Innovation (Cambridge (Mass.)) DOI:10.1016/j.xinn.2025.100871 PMID:40528882	研究论文	提出了一种系统微生物生物技术框架，用于解决微生物制造中的挑战，以实现经济和环境效益的最优化	采用系统性和整体性的方法，结合多学科技术，定制化解决微生物制造过程中的瓶颈问题	未提及具体的技术实施细节或实验验证结果	解决微生物制造在工业应用中的挑战，推动可持续循环生物经济的发展	微生物制造过程及其相关技术	合成生物学	NA	酶学、合成生物学、代谢工程、发酵、分离工程、AI技术	NA	NA	NA