合成生物学相关文章
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当前共找到 4980 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-05-20 |
One Yeast, Sixteen Synthetic Chromosomes, Infinite Possibilities
2026-May-19, Yeast (Chichester, England)
DOI:10.1002/yea.70026
PMID:42152749
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综述 | 庆祝《Yeast》期刊40周年，回顾合成酵母基因组计划（Sc2.0）在构建全部16条合成染色体中的技术与概念进展，并展望新型合成染色体的未来潜力 | 系统总结了Sc2.0项目在构建真核生物首个全合成基因组中的里程碑式成就，并引入新型模块化合成染色体（neochromosomes）作为正交于天然基因组的工程平台，拓展了酵母工程的通用性和可编程性 | 未详细讨论合成染色体在长期稳定性或生物安全性方面的潜在挑战 | 回顾Sc2.0项目进展并展望合成酵母的下一个发展方向，强调从模型生物到工程化底盘的转变 | 酿酒酵母及其16条合成的染色体 | 合成生物学 | NA | 设计-构建-测试-学习（DBTL）循环, 基因组规模工程 | NA | NA | NA | NA | 酿酒酵母（Saccharomyces cerevisiae） | 模块化合成染色体（neochromosomes） | 工业生物技术, 医学, 农业 |
| 2 | 2026-05-20 |
Substrates reconfigure picosecond electric field fluctuations in dihydrofolate reductase
2026-May-19, Journal of biomolecular structure & dynamics
IF:2.7Q2
DOI:10.1080/07391102.2026.2672099
PMID:42153902
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研究论文 | 本研究通过分子动力学模拟，探讨底物对二氢叶酸还原酶中皮秒电场波动的影响 | 揭示了底物结合显著改变催化剂中局部电场波动，影响能量势垒跨越事件的新机制 | NA | 理解酶催化中快速静电波动的作用，为酶抑制剂设计和工程酶开发提供基础 | 大肠杆菌二氢叶酸还原酶（DHFR）及其配体结合态和未结合态 | NA | NA | 分子动力学模拟（MD） | NA | 模拟数据 | NA | NA | 大肠杆菌 | NA | 合成生物学, 蛋白质工程 |
| 3 | 2026-05-20 |
Nanomedicine carrier-based combined antitumor strategy integrating phototherapy and immunotherapy
2026-May-19, Immunopharmacology and immunotoxicology
IF:2.9Q2
DOI:10.1080/08923973.2026.2671715
PMID:42153947
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综述 | 系统分析纳米载体介导的光疗与免疫疗法联合抗肿瘤策略的原理、机制及最新进展 | 聚焦近三年研究，分析纳米载体如何实现光疗和免疫药物的靶向共递送、刺激响应释放及增强肿瘤蓄积，并探讨多响应纳米平台、仿生设计和克服缺氧等新兴趋势 | 临床转化面临制造规模化、人类肿瘤异质性和最佳治疗顺序等挑战 | 阐明纳米载体介导的光疗-免疫联合疗法在实现持久抗肿瘤免疫中的应用潜力 | 纳米药物载体、光疗剂、免疫调节剂、CAR-T细胞等 | 数字病理学 | 肿瘤 | 纳米药物递送 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 4 | 2026-05-20 |
Recent advances in bioengineering and functional applications of microbial biocomposites: integrating bacterial cellulose, fungal mycelium and synthetic biology
2026-May-19, World journal of microbiology & biotechnology
IF:4.0Q2
DOI:10.1007/s11274-026-05021-w
PMID:42154349
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综述 | 本文综述了微生物生物复合材料的最新进展，重点关注细菌纤维素和真菌菌丝体与合成生物学的整合 | 系统总结了2020-2026年间细菌纤维素和真菌菌丝体生物复合材料与合成生物学、3D打印和矿物功能化等新兴方法的协同作用，并探讨了其在骨组织工程、自修复材料等前沿领域的应用 | 当前在工业规模化、功能稳定性和批次间标准化方面仍面临监管和技术挑战 | 为应用微生物学、材料科学和工业生物技术领域的研究人员提供关于微生物生物复合材料作为可持续性、功能创新和仿生设计交叉平台的综合视角 | 微生物生物复合材料，特别是细菌纤维素和真菌菌丝体 | 材料科学, 微生物学 | NA | 合成生物学, 3D打印, 矿物功能化 | NA | NA | NA | NA | Komagataeibacter spp., Ganoderma spp. | NA | 医药, 环境, 工业生物技术 |
| 5 | 2026-05-20 |
TALEs, TALENs, and TALE Base Editors: From Plant Pathology to Biotechnology
2026-May-18, Annual review of phytopathology
IF:9.1Q1
|
综述 | 探讨TALE蛋白从植物病理学到生物技术的应用，重点关注TALEN和TALE碱基编辑器的基因组编辑作用 | 系统总结TALE蛋白的模块化DNA结合域特性及其在合成生物学中的最新进展，包括叶绿体和线粒体基因组编辑工具的开发 | 未详细讨论TALEN技术与其他基因编辑工具（如CRISPR）的比较及潜在脱靶效应 | 综述TALE蛋白在自然发生、基因组编辑和合成生物学中的当前角色和最新进展 | TALE蛋白及其衍生的TALEN和TALE碱基编辑器 | 合成生物学, 基因组编辑 | NA | TALE, TALEN, TALE碱基编辑器 | NA | NA | NA | TALEN, TALE碱基编辑器 | 植物细胞 | NA | 农业, 生物技术 |
| 6 | 2026-05-20 |
Engineered Biocatalytic Strategies for Pesticide Degradation in Food Systems: From Catalytic Performance to Practical Applications
2026-May-14, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.6c01905
PMID:42133536
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综述 | 综述酶法降解农药在食品系统中的工程化策略，从催化性能到实际应用 | 系统总结了天然酶、纳米酶及多酶或混合级联系统的进展，并结合人工智能辅助设计和合成生物学的新方法 | 仍受限于催化效率有限、稳定性与可重复使用性不足、规模化困难及监管不确定性 | 探讨酶法降解农药的策略以提升性能与鲁棒性，并分析从实验室系统向真实食品基质转化的关键障碍 | 天然酶、纳米酶、多酶或混合级联系统、人工智能辅助设计、合成生物学方法 | NA | NA | 酶工程、人工智能辅助设计、合成生物学 | NA | NA | NA | 合成生物学 | NA | 多酶或混合级联系统 | 食品、农业 |
| 7 | 2026-05-20 |
Toward predictable and programmable genetic circuits in plants
2026-May-14, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.108924
PMID:42140530
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综述 | 探讨植物基因电路的可预测设计和编程化发展现状与挑战 | 提出量化工程框架，整合基因组和表观遗传背景、发育进程、空间组织和环境变异对电路行为的影响，推动从定性开关向定量感知和信息处理的转变 | 植物基因电路仍依赖经验优化，量化预测面临挑战，且从模式系统向作物和田间环境扩展时需考虑物种特性和环境波动 | 实现植物基因电路的可预测行为，建立量化表征、标准化测量、多尺度建模和迭代设计工作流程 | 植物基因电路 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 植物（模式系统和作物） | 基因电路（定量传感、信息处理、模型指导设计） | 农业 |
| 8 | 2026-05-20 |
Vesicle-Templated Self-Assembly of Programmable Freestanding Multi-μm DNA Shells
2026-May-13, Nano letters
IF:9.6Q1
DOI:10.1021/acs.nanolett.6c00402
PMID:42130031
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研究论文 | 该文介绍了一种利用囊泡模板自组装可编程的独立多微米DNA壳的方法 | 提出了简单且广泛适用的方法，通过表面活性剂介导的脂质体去除，从巨大单层囊泡上释放DNA壳，保留膜模板的几何形状，并展示了使用不同DNA构建模块（包括复杂桶形DNA折纸和简单11寡核苷酸纳米星基序）的成功构建 | 未明确提及限制 | 创建合成细胞模拟系统，开发独立、模拟膜的DNA壳结构 | DNA壳（桶形DNA折纸和纳米星基序） | 合成生物学 | NA | DNA折纸 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学 |
| 9 | 2026-05-20 |
Streptomyces Autoregulator Biosensors from Natural Product Cluster-Situated Regulators
2026-May-12, ACS chemical biology
IF:3.5Q2
DOI:10.1021/acschembio.6c00061
PMID:42117380
|
研究论文 | 本文开发了八种基于簇定位调控因子的自诱导物生物传感器及其合成路线 | 首次系统性地开发了基于链霉菌簇定位调控因子的自诱导物生物传感器，并研究了非同源调控因子与自诱导物之间的交叉反应性以及调控因子对替代操作子的调控能力 | NA | 开发自诱导物生物传感器以阐明链霉菌天然产物调控中涉及的小分子群体感应机制 | 链霉菌自诱导物生物传感器及其配体 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 8种生物传感器 | NA | 链霉菌 | 群体感应调控的遗传电路 | 工业生物技术 |
| 10 | 2026-05-20 |
A Linear Mixed Effects Model for Evaluating Synthetic Gene Circuits
2026-May-11, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.6c00171
PMID:42112575
|
研究论文 | 提出一种线性混合效应模型来评估合成基因电路的布尔逻辑门性能 | 首次将线性混合效应模型应用于合成基因电路性能的统计评估，并提出β̂作为网关行为的整体指标，支持前向设计 | NA | 标准化合成基因电路性能评估的统计方法 | 已发布的布尔逻辑门和模拟数据 | 合成生物学 | NA | 线性混合效应模型、k-means聚类、蒙特卡洛模拟 | 线性混合效应模型、k-means | 模拟数据 | 144个已发布的布尔逻辑门 | NA | NA | 布尔逻辑门、OR门、三输入门 | 计算、生物传感、人类健康 |
| 11 | 2026-05-20 |
Translation efficiency covariation identifies conserved coordination patterns across cell types
2026-May, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-025-02718-5
PMID:40715459
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研究论文 | 通过翻译效率协变分析跨细胞类型的协调翻译模式 | 首次定义翻译效率协变概念并发现哺乳动物跨细胞类型的保守翻译协调模式 | 未明确说明局限性 | 探究翻译效率在跨细胞类型中的协调模式及其保守性 | 人类和小鼠的翻译效率协变模式 | 机器学习 | NA | 核糖体足迹测序 | NA | 核糖体足迹数据 | 人类117种和小鼠94种组织及细胞系的3819个核糖体足迹数据集 | NA | 人类和小鼠 | NA | 合成生物学, 生物技术 |
| 12 | 2026-05-20 |
Incorporation of Cryptic Plasmid Energetics Improves Genome-Scale Metabolic Predictions in Probiotic E. coli Nissle 1917
2026-May, Microbial biotechnology
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/1751-7915.70361
PMID:42152457
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研究论文 | 本研究将隐蔽性质粒的能量成本纳入益生菌大肠杆菌Nissle 1917的基因组规模代谢模型，提高了代谢预测的准确性 | 首次在EcN代谢模型中考虑隐蔽性质粒的能耗，并提出可整合的质粒模块，提升了预测性能 | 未明确提及，但可能需要进一步验证模型在不同实验条件下的通用性 | 提高益生菌大肠杆菌Nissle 1917代谢模型的预测精度，并考虑其隐蔽性质粒的生理影响 | 大肠杆菌Nissle 1917及其隐蔽性质粒 | 合成生物学, 计算生物学 | NA | COBRA方法, 倾向性代谢流分析, 代谢组学分析 | 基因组规模代谢模型 | 代谢组学数据 | NA | NA | 大肠杆菌Nissle 1917 | 隐蔽性质粒模块 | 医学, 工业生物技术 |
| 13 | 2026-05-20 |
Toward life with a 19-amino acid alphabet through generative artificial intelligence design
2026-Apr-30, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.aeb5171
PMID:42060756
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research paper | 通过计算设计和合成生物学探索构建基于19种氨基酸的细胞，验证异亮氨酸的可替代性并生成稳定细胞 | 首次通过蛋白质语言模型和结构模型协同设计，系统性替换核糖体中所有382个异亮氨酸残基，创建了首个19种氨基酸的活细胞 | 未详细说明模型在非必需蛋白或复杂多细胞生物中的适用性，且细胞稳定性仅基于短期进化实验 | 探索生命在简化氨基酸字母表下的可行性，构建19种氨基酸的细胞 | 大肠杆菌中的必需蛋白质和核糖体 | machine learning、computational biology | NA | 计算机辅助设计、合成生物学 | 蛋白质语言模型、结构模型 | 蛋白质序列和结构数据 | 核糖体中382个异亮氨酸残基改造，涉及21个重新设计的亚基 | 合成生物学 | 大肠杆菌 | NA | 生物技术、基础生物学 |
| 14 | 2026-05-20 |
MOSAIC: A Highly Efficient, One-Step Recombineering Approach to Plasmid Editing and Diversification
2025-10-17, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00657
PMID:40471122
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研究论文 | 建立一种高效的一步重组工程方法MOSAIC，用于质粒编辑和多样化 | 利用单链DNA退火蛋白CspRecT高效整合DNA寡核苷酸，实现高达90%的单靶点编辑效率，并在单次转化中生成覆盖四个靶区域的组合质粒文库，同时集成基于Nanopore测序的用户友好验证流程 | 未明确说明具体局限性，可能包括对寡核苷酸设计的依赖或某些质粒类型的适用性限制 | 开发一种简单、快速且资源高效的质粒编辑和文库构建方法 | 质粒的定向编辑和组合文库生成 | 合成生物学 | NA | 重组工程，Nanopore测序 | NA | 序列数据 | NA | CspRecT蛋白，重组工程 | 细菌（具体未指定） | 质粒编辑和组合文库构建系统 | 分子生物学，合成生物学 |
| 15 | 2026-05-20 |
Engineered Bacteria Convert a 3-Bit Binary Code to a 3-Bit Gray Code by Multicellular Artificial-Neural-Network-Type Architecture
2025-09-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00145
PMID:40333022
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研究论文 | 利用基因工程细菌构建单层人工神经网络，实现3位二进制码到3位格雷码的转换 | 首次使用基因工程细胞构建人工神经网络实现二进制码到格雷码的转换，扩展了神经形态计算在合成生物学中的应用能力 | 目前处于概念验证阶段，实际应用场景和规模尚需进一步探索 | 开发基于基因工程细胞的生物计算机技术与合成生物电路设计 | 基因工程改造的细菌种群（大肠杆菌） | 合成生物学 | NA | NA | 人工神经网络（ANN） | NA | 5个工程细菌种群 | NA | 大肠杆菌 | 单层人工神经网络（3位二进制到格雷码转换器） | 工业生物技术、计算机科学 |
| 16 | 2026-05-20 |
Streptomyces Autoregulator Biosensors from Natural Product Cluster-Situated Regulators
2025-Sep-05, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.09.05.673737
PMID:40950212
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研究论文 | 开发基于簇定位调节因子的链霉菌自诱导物生物传感器并研究其合成路线 | 首次开发了八个基于簇定位调节因子的自诱导物生物传感器，并研究了非同源配对间的串扰及替代操纵子调控能力 | 未明确说明，但可能涉及传感器动态范围有限或体内应用验证不足 | 开发链霉菌自诱导物生物传感器以解析群体感应回路并用于合成生物学 | 链霉菌自诱导物生物传感器及其配体 | 合成生物学 | NA | 生物传感器构建 | NA | NA | 八个自诱导物生物传感器 | NA | 链霉菌 | 群体感应回路、正交信号系统、多输入遗传电路 | 工业生物技术, 农业 |
| 17 | 2026-05-20 |
The Dawn of High-Throughput and Genome-Scale Kinetic Modeling: Recent Advances and Future Directions
2025-08-15, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00868
PMID:40262025
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综述 | 本文综述了高通量和全基因组规模动力学建模的最新进展与未来方向 | 整合机器学习与机械代谢模型、开发新型动力学参数数据库以及定制化参数化策略，推动了动力学建模领域的变革 | 未提及具体局限性，但历史上对详细参数化和大量计算资源的需求仍是挑战 | 促进系统生物学、合成生物学、代谢工程和医学研究在无前例规模和速度下取得进展 | 代谢过程的动力学模型及其在细胞过程表征中的应用 | 机器学习和系统生物学 | NA | 动力学建模、机器学习 | 机械代谢模型 | NA | NA | NA | NA | NA | 系统生物学、合成生物学、代谢工程、医学研究 |
| 18 | 2026-05-20 |
Development of CRISPRi Orthogonal Repression Systems in Plant Cells Using Synthetic Variants of the Figwort Mosaic Virus 34S Promoter with Two Identical sgRNA Binding Sites
2025-08-15, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00356
PMID:40643567
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研究论文 | 本研究利用合成的苜蓿花叶病毒34S启动子变体结合两个相同的sgRNA结合位点，在植物细胞中开发了CRISPRi正交抑制系统 | 首次系统评估不同启动子的CRISPRi抑制效率，并发现两个相同sgRNA结合位点的启动子比异质位点更易被抑制；同时结合Cre/loxP RNA支架正交系统设计了基因开关 | 研究仅在烟草叶片中进行瞬时表达评估，缺乏稳定转化和更广泛植物物种的验证 | 开发用于植物细胞基因表达精确调控的CRISPRi正交抑制系统和遗传开关 | 植物细胞中的不同启动子（尤其是34S启动子变体） | 合成生物学 | NA | CRISPRi, 瞬时基因表达, 农杆菌浸润 | NA | 表达数据 | 33个34S启动子变体 | CRISPR-Cas9, Cre/loxP | 烟草 | CRISPRi抑制系统, Cre/loxP RNA支架正交系统, 基因开关 | 农业, 合成生物学 |
| 19 | 2026-05-20 |
Investigating the Potential of Division of Labor in Synthetic Bacterial Communities for the Production of Violacein
2025-07-18, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00120
PMID:40525226
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研究论文 | 研究合成细菌群落中劳动分工生产紫色杆菌素的潜力 | 通过将紫色杆菌素生物合成途径拆分到两个亚群中，实现了2.5倍的产量提升，并揭示了亚群生长速率和比例对生产效率的影响 | 仅使用大肠杆菌为基础，未探索其他宿主或更复杂的群落结构 | 评估劳动分工策略在合成微生物群落中提高紫色杆菌素生产效率的可行性 | 基于大肠杆菌的合成细菌群落和紫色杆菌素生物合成途径 | 合成生物学 | NA | 代谢工程 | NA | 产量数据 | 多个共培养和单培养实验条件 | NA | 大肠杆菌 | 代谢途径拆分（VioABE和VioDC亚群） | 工业生物技术 |
| 20 | 2026-05-20 |
A Tn5 Transposase-Based System for High-Efficiency Genome-Wide Gene Activation in Escherichia coli
2025-07-18, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00170
PMID:40527878
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research paper | 开发了一种基于Tn5转座酶的高效全基因组基因激活系统，用于大肠杆菌的功能基因组学研究 | 基于Tn5转座酶构建高效全基因组基因激活突变文库，实现条件性基因激活和高通量筛选 | 未明确说明局限性，但可能涉及插入位点偏好性或激活效率的进一步优化需求 | 开发一种高效的全基因组基因激活工具，用于基因功能解析和菌株优化 | 大肠杆菌（Escherichia coli） | synthetic biology, functional genomics | NA | Tn5 transposase-based system | NA | DNA sequence data | NA | Tn5 transposase | E. coli | inducible gene activation system with tetracycline-inducible promoter Ptet and kanamycin resistance gene | synthetic biology, industrial biotechnology |