合成生物学相关文章
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当前共找到 3069 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2025-05-03 |
Machine learning reveals novel compound for the improved production of chitooligosaccharides in Escherichia coli
2025-May-25, New biotechnology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.nbt.2025.01.005
PMID:39827984
|
研究论文 | 利用机器学习模型和特征重要性分析改进大肠杆菌中壳寡糖的生产 | 通过机器学习模型和特征重要性分析发现铁元素可以显著提高壳寡糖的生产效率 | 工程步骤可能无法带来足够的改进，且代谢反应中的瓶颈可能仍被隐藏 | 提高壳寡糖的生产效率和预测性 | 大肠杆菌中的壳寡糖生产途径 | 合成生物学 | NA | 机器学习 | NA | 代谢数据 | 大肠杆菌工程转录调节因子库 |
| 2 | 2025-05-03 |
Semantical and geometrical protein encoding toward enhanced bioactivity and thermostability
2025-May-02, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.98033
PMID:40314227
|
研究论文 | 本文提出了一种结合序列和几何编码器的新型预训练框架，用于蛋白质的一级和三级结构，以指导蛋白质工程中的突变方向并评估变异效应 | 整合了蛋白质序列和几何结构的编码器，模拟自然选择过程，提高了蛋白质功能预测的准确性和全面性 | 缺乏对预测蛋白质热稳定性的基本评估，尽管这是实践中经常研究的关键物理性质 | 提高蛋白质工程的效率和准确性，通过深度学习模型预测蛋白质变异效应 | 蛋白质序列和结构 | 合成生物学 | NA | 深度学习 | 预训练框架 | 蛋白质序列和结构数据 | 超过300个深度突变扫描实验的基准测试 |
| 3 | 2025-05-03 |
Biotechnological approaches for the production of neuroactive huperzine A
2025-Apr-29, Journal of biotechnology
IF:4.1Q2
DOI:10.1016/j.jbiotec.2025.04.020
PMID:40311807
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综述 | 本文综述了石杉碱甲（HupA）的神经保护特性及其在治疗神经退行性疾病中的潜力，并探讨了提高HupA产量的生物技术策略 | 强调了通过生物技术手段（如化学合成、微生物发酵、植物组织培养和合成生物学）提高HupA产量的创新方法，并讨论了关键生物合成中间体和酶的作用 | 目前对HupA生物合成的知识仍存在空白，需要进一步研究以开发经济高效、可持续的生产方法 | 探讨HupA在神经退行性疾病治疗中的潜力及其生物技术生产方法 | 石杉碱甲（HupA）及其在神经退行性疾病中的应用 | 生物技术 | 阿尔茨海默病、帕金森病、亨廷顿病、多发性硬化症、癫痫、重症肌无力 | 化学合成、微生物发酵、植物组织培养、合成生物学 | NA | NA | NA |
| 4 | 2025-05-03 |
Enhancing mixed-species microalgal biofilms for wastewater treatment: Design, construction, evaluation and optimisation
2025-Apr-28, Bioresource technology
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.biortech.2025.132600
PMID:40306338
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review | 本文详细总结了混合物种生物膜（包括藻类和细菌）的设计、构建、评估和优化（DCEO），并讨论了它们在工业和农业废水及新污染物处理中的应用 | 提出了使用DCEO方法来增强混合物种生物膜用于废水处理的新视角 | 讨论了混合物种微藻生物膜面临的问题及解决方案，但未具体说明实验验证的局限性 | 增强混合物种微藻生物膜在废水处理中的应用 | 混合物种生物膜（包括藻类和细菌） | 合成生物学 | NA | 三维生物打印 | NA | NA | NA |
| 5 | 2025-05-03 |
Microbially Derived P=S and P=Se Bond Formation
2025-Apr-28, JACS Au
IF:8.5Q1
DOI:10.1021/jacsau.5c00262
PMID:40313816
|
研究论文 | 本文报道了多种细菌通过中心硫代谢和非酶化学进行P=S键形成（PhP到PhPS），并首次在微生物细胞中进行了P=S键形成的生化和遗传研究 | 首次在微生物细胞中进行P=S键形成的生化和遗传研究，并首次利用微生物代谢物进行P=Se键形成的化学合成 | NA | 探索微生物代谢物在化学合成中的直接应用 | 细菌的P=S和P=Se键形成 | 合成生物学 | NA | 生化和遗传研究 | NA | NA | NA |
| 6 | 2025-05-03 |
Engineering strategies for producing medium-long chain dicarboxylic acids in oleaginous yeasts
2025-Apr-26, Bioresource technology
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.biortech.2025.132593
PMID:40294756
|
review | 本文综述了在产油酵母中生产中等长度链二羧酸（DCAs）的工程策略 | 系统总结了提高DCAs产量的多种工程策略，包括启动子、酶、途径、细胞、发酵和下游工程 | 讨论了当前DCAs生物合成领域的挑战和发展趋势，但未提出具体解决方案 | 探索利用产油酵母生物合成高附加值DCAs的工程策略 | 中等长度链二羧酸（DCAs, C ≥ 6） | 合成生物学 | NA | 生物合成 | NA | NA | NA |
| 7 | 2025-05-03 |
Addressing semantic ambiguity in biotechnology: Proposals from the European research infrastructure IBISBA
2025-Apr-24, New biotechnology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.nbt.2025.04.010
PMID:40280273
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讨论论文 | 本文探讨了生物技术领域的语义模糊问题，并提出了统一核心术语定义的建议 | 分析了生物技术领域术语定义的混乱现状，并提出了术语标准化的必要性 | 仅提出了问题而未提供具体的术语定义解决方案 | 促进生物技术领域术语定义的标准化，以支持有效的政策制定和科学传播 | 生物技术领域的核心术语（如biotechnology, biomanufacturing等） | 生物技术 | NA | NA | NA | 文本 | NA |
| 8 | 2025-05-03 |
Paving the way for bacteria-based drug delivery: biohybrid microrobots emerging from microrobotics and synthetic biology
2025-Apr-16, Advanced drug delivery reviews
IF:15.2Q1
DOI:10.1016/j.addr.2025.115577
PMID:40250568
|
综述 | 本文探讨了微机器人学和合成生物学的融合如何促进生物混合细菌微机器人的发展，用于药物递送 | 结合微机器人学和合成生物学的优势，开发出具有外部控制模式的生物混合细菌微机器人，提高了靶向治疗的精确性和有效性 | 需要解决生物与合成组件之间的兼容性、规模化制造过程以及针对活体治疗剂的监管路径等关键挑战 | 探索微机器人学和合成生物学在药物递送领域的创新解决方案 | 细菌作为治疗系统的工程化应用 | 合成生物学 | NA | 光、超声波和磁场等外部控制模式 | NA | NA | NA |
| 9 | 2025-05-03 |
Elucidation and de novo reconstitution of glyceollin biosynthesis
2025-Apr-10, Molecular plant
IF:17.1Q1
DOI:10.1016/j.molp.2025.04.003
PMID:40211535
|
研究论文 | 本研究揭示了glyceollins的完整生物合成途径，并通过合成生物学和代谢工程实现了在面包酵母中从简单碳源生产glyceollins | 发现了glyceollins生物合成途径中未表征的基因，特别是编码还原酶和五个P450酶的基因，实现了在微生物宿主中的可持续生产 | 未提及具体产量或生产效率，可能在实际应用中存在优化空间 | 阐明glyceollins的生物合成途径并实现其可持续生产 | glyceollins及其生物合成途径 | 合成生物学 | NA | 瞬时表达、体外酶表征、酵母喂养研究 | NA | NA | NA |
| 10 | 2025-05-03 |
Creating a Halotolerant Degrader for Efficient Mineralization of p-Nitrophenol-Substituted Organophosphorus Pesticides in High-Saline Wastewater
2025-Apr, Biotechnology and bioengineering
IF:3.5Q2
DOI:10.1002/bit.28923
PMID:39821562
|
研究论文 | 本研究通过合成生物学方法创建了一种耐盐降解菌J9U-MP，用于高效矿化高盐废水中的对硝基酚取代有机磷农药 | 首次将包含七个基因的异源生物降解途径与耐盐底盘菌Halomonas cupida J9结合，创建了能在高盐和低氧环境下高效降解有机磷农药的工程菌J9U-MP | 研究仅针对特定类型的有机磷农药（对硝基酚取代的有机磷农药）进行测试，未涉及其他类型污染物 | 开发能在高盐废水中高效降解有机磷农药的生物修复技术 | 对硝基酚取代的有机磷农药（如甲基对硫磷）及其降解中间产物 | 合成生物学 | NA | 基因工程、RT-PCR、气相色谱分析、稳定同位素分析 | NA | 生物化学数据 | 工程菌J9U-MP在含60g/L NaCl的废水中对50mg/L甲基对硫磷及其降解产物的降解实验 |
| 11 | 2025-05-03 |
Next-generation metabolic models informed by biomolecular simulations
2025-Apr, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2025.103259
PMID:39827498
|
research paper | 该文章探讨了如何将生物分子模拟与代谢模型相结合，以推动结构引导的合成生物学应用 | 提出了将生物分子模拟和机器学习预测整合到代谢模型中的新方法，以优化和理解代谢途径 | 尚未具体说明生物分子模拟与代谢模型整合的实际应用效果和具体案例 | 优化和理解代谢途径，以改善蛋白质和小分子产品的生物生产 | 从微生物到人类的细胞代谢 | 合成生物学 | NA | 生物分子模拟, 机器学习 | flux balance analysis, dynamic, kinetic delineations | 代谢网络数据 | NA |
| 12 | 2025-05-03 |
Advances in designed bionanomolecular assemblies for biotechnological and biomedical applications
2025-Apr, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2024.103256
PMID:39827499
|
综述 | 本文综述了蛋白质工程在生物纳米分子组装设计方面的最新进展及其在生物技术和生物医学中的应用 | 结合AI工具（如AlphaFold、RFDiffusion和ProteinMPNN）显著提高了从头设计的可扩展性和成功率 | NA | 探讨蛋白质工程在设计和应用生物纳米分子组装方面的潜力 | 有限组装（如纳米笼和基于卷曲螺旋的结构）和扩展组装（如细丝和2D/3D晶格） | 合成生物学、材料科学、生物技术、生物医学 | NA | 蛋白质工程、AI工具（AlphaFold、RFDiffusion、ProteinMPNN） | NA | NA | NA |
| 13 | 2025-05-03 |
Using synthetic biology to express nitrogenase biosynthesis pathway in rice and to overcome barriers of nitrogenase instability in plant cytosol
2025-Apr, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2024.12.002
PMID:39818476
|
research paper | 该研究通过合成生物学方法将固氮酶生物合成途径引入水稻，以克服植物细胞质中固氮酶不稳定的障碍 | 成功将包含13个基因的固氮酶生物合成途径引入水稻，并发现NifH-S18是导致蛋白降解的关键残基，获得了具有Fe蛋白活性且抵抗植物内切蛋白酶切割的NifH变体 | NifH在水稻细胞质中仍不稳定，需要进一步优化以提高其稳定性 | 通过工程化方法实现谷物中的固氮作用，减少化学氮肥的使用 | 水稻 | 合成生物学 | NA | 多基因载体转化、性杂交、基因组测序分析 | NA | 基因组数据、蛋白质数据 | 转基因水稻品系L12-13和L8-17 |
| 14 | 2025-05-03 |
Designing with Printed Responsive Biomaterials: A Review
2025-Apr, 3D printing and additive manufacturing
IF:2.3Q3
DOI:10.1089/3dp.2024.0004
PMID:40308656
|
review | 本文综述了跨学科领域中用于设计响应性生物材料的增材制造策略，并展望了如何将印刷响应性生物材料（PRBs）融入日常物品和建筑中以增强环境和人类健康 | 探讨了增材制造在生物材料科学、生物材料制造、合成生物学、生物医学工程、生物设计和活体建筑中的最新进展，展示了多感官互动的日常产品和建筑环境的新时代 | NA | 探索如何利用增材制造技术设计和集成响应性生物材料，以提升环境和人类健康 | 响应性生物材料及其在日常生活和建筑中的应用 | 生物材料科学 | NA | 增材制造（AM） | NA | NA | NA |
| 15 | 2025-05-03 |
Artificial intelligence driven innovations in biochemistry: A review of emerging research frontiers
2025-Mar-07, Biomolecules & biomedicine
DOI:10.17305/bb.2024.11537
PMID:39819459
|
综述 | 本文综述了人工智能在生物化学领域的应用及其对研究能力的提升 | 探讨了人工智能在生物化学中的当前及潜在应用，特别是在数据分析、分子建模、酶工程和代谢途径研究方面 | 面临数据质量、模型可解释性和伦理问题等挑战 | 评估人工智能在生物化学领域的应用及其未来潜力 | 生物化学研究中的复杂数据集、分子相互作用、药物发现等 | 生物化学 | NA | 机器学习算法、自然语言处理、基于AI的分子建模 | AlphaFold | 复杂数据集 | NA |
| 16 | 2025-05-03 |
Mechanisms and applications of bacterial luciferase and its auxiliary enzymes
2025-Mar, Archives of biochemistry and biophysics
IF:3.8Q1
DOI:10.1016/j.abb.2025.110307
PMID:39824239
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review | 本文综述了细菌荧光素酶(LuxAB)及其辅助酶的机制和应用 | 最近的研究阐明了C4a-氢过氧黄素形成的机制，并确定了关键催化残基如His44，这些发现有助于理解光生成过程中重要的黄素中间体的产生 | 仍存在一些挑战性问题，如实现红移发射、优化信号强度以及确定与发光物种生成相关的机制 | 深入了解LuxAB反应的机制，并探索其在生物技术和生物医学领域的应用 | 细菌荧光素酶(LuxAB)及其辅助酶 | 合成生物学 | NA | 蛋白工程、合成生物学 | NA | NA | NA |
| 17 | 2025-05-03 |
Microbial Production of Ectoine: A Review
2025-Feb-21, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00490
PMID:39834017
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综述 | 本文综述了微生物生产四氢嘧啶（ectoine）的策略，包括野生菌株筛选、突变育种和模型菌株的代谢工程 | 探讨了利用合成生物学和代谢工程技术，通过非嗜盐工程菌株高效生产四氢嘧啶的创新方法 | 未提及具体实验数据或生产规模限制 | 探索更经济高效的四氢嘧啶生产方法以满足市场需求 | 四氢嘧啶及其微生物生产 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、合成生物学 | NA | NA | NA |
| 18 | 2025-05-03 |
Maize2035: A decadal vision for intelligent maize breeding
2025-Feb-03, Molecular plant
IF:17.1Q1
DOI:10.1016/j.molp.2025.01.012
PMID:39827366
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Perspective paper | 本文概述了玉米育种的历史成功，并探讨了实现可持续农业的全面性状改良方法 | 讨论了前沿解决方案，包括从单细胞分析到全息生物的多组学方法、智能育种与先进技术和算法，以及合成生物学方法的变革潜力 | 未提及具体的技术实施细节或数据支持 | 探讨玉米育种在可持续农业中的未来发展方向 | 玉米 | 农业生物技术 | NA | 多组学方法、智能育种、合成生物学 | NA | NA | NA |
| 19 | 2025-05-03 |
Bacillus methanolicus: an emerging chassis for low-carbon biomanufacturing
2025-Feb, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2024.06.013
PMID:39033040
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研究论文 | 本文探讨了利用合成生物学方法改造Bacillus methanolicus以提高其在低碳生物制造中的效率 | 提出利用代谢建模和基因组编辑等合成生物学方法优化Bacillus methanolicus，以提升其在低碳生物制造中的应用潜力 | 当前Bacillus methanolicus的效率尚未达到工业化要求 | 提高Bacillus methanolicus在低碳生物制造中的效率 | Bacillus methanolicus | 合成生物学 | NA | 代谢建模, 基因组编辑 | NA | NA | NA |
| 20 | 2025-05-03 |
Bridging the gap: pathway programs for inclusion and persistence in microbiology
2025-Feb, Trends in microbiology
IF:14.0Q1
DOI:10.1016/j.tim.2024.12.007
PMID:39814665
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研究论文 | 本文概述了一个旨在为微生物学领域提供公平的高影响力研究经验和课程指导的途径计划 | 提出了一个促进微生物学领域多样化的途径计划，重点包括噬菌体发现、合成生物学和数据科学/AI等新兴领域 | NA | 促进微生物学领域的多样化劳动力发展 | 微生物学领域的学生和研究人员 | 微生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |