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当前共找到 5561 篇文献,本页显示第 181 - 200 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 工程工具 宿主生物 回路设计 应用领域
181 2026-08-10
Complete remediation of a mixture of 5 acetophenone derivatives by multi-modular engineered Escherichia coli: Avoiding intermediate toxicity from incomplete degradation
2026-Sep-01, Ecotoxicology and environmental safety IF:6.2Q1
研究论文 本文构建了多模块工程化大肠杆菌BL-all,通过整合14个结构优化的基因到4个分解代谢模块,实现了对5种苯乙酮衍生物的完全降解,避免了不完全降解产生的有毒中间体积累,并通过斑马鱼毒性测试和水样实验验证了其解毒能力和实际应用潜力。 首次采用多模块合成生物学方法构建工程菌株,完全降解5种苯乙酮衍生物混合物,解决不完全降解产生有毒中间体的问题,并通过同位素示踪和生态毒性测试全面验证其有效性和安全性。 具体局限性未在摘要中说明,可能包括对未测试底物的降解能力不确定,以及在实际复杂环境中的长期稳定性和效率需要进一步验证。 解决微生物不完全降解低毒化合物产生高毒中间体的问题,构建可完全降解苯乙酮衍生物混合物的工程菌,用于环境污染修复。 5种苯乙酮衍生物(苯乙酮、对羟基苯乙酮、对羟基苯丙酮、对羟基苯甲醛和邻羟基苯乙酮)及工程化大肠杆菌BL-all。 环境生物技术 NA 合成生物学、同位素示踪(C标记)、毒性测试(斑马鱼) NA 实验数据(降解效率、毒性测试结果) 5种苯乙酮衍生物,每种1 mM混合物,以及斑马鱼样品 合成生物学(多模块基因整合) 大肠杆菌 多模块分解代谢途径(4个模块,14个基因)用于完全降解苯乙酮衍生物 环境修复
182 2026-08-10
Engineering rhizobacterial communities for soil and plant health
2026-Aug, Microbiology (Reading, England)
综述 本文探讨了通过工程化根际细菌群落来改善土壤和植物健康的策略,重点介绍了合成生物学在微生物群落设计中的应用 提出了工程化微生物群落(EngComs)的概念,即通过合成基因回路增强的微生物联合体,扩展了传统的合成群落(SynComs)方法,实现可编程功能如细胞间通讯、劳动分工、生物传感和可控养分动员 根际细菌工程在真实土壤环境中的应用仍处于早期阶段,多数系统在简化或人工条件下表征,面临环境复杂性、遗传稳定性、生物防护和监管约束等挑战 整合合成生物学与根际生态学及生物物理学知识,开发可编程的植物-微生物系统,以提高作物生产力并减少环境影响 根际细菌群落、植物-微生物互作界面 合成生物学、微生物生态学 NA 合成基因回路、多输入遗传电路 NA NA NA 合成基因回路、多输入遗传电路 根际细菌 合成基因回路,包括细胞间通讯、劳动分工、生物传感和养分动员的调控电路 农业、环境
183 2026-08-10
Antimicrobial Peptides (AMPs) as Potential Antibiotics: Classification, Development and Future Prospects in Combating Multi-drug Resistant Pathogens
2026-Aug, Indian journal of microbiology IF:2.1Q3
综述 本文综述了抗菌肽作为潜在抗生素的分类、开发进展及其对抗多重耐药病原体的前景 强调抗菌肽独特的抗菌机制,使细菌难以产生耐药性,并探讨了合成与工程化肽在药物开发中的创新应用 抗菌肽的开发面临稳定性、毒性和生产成本等挑战,以及监管和经济障碍 促进抗菌肽作为下一代抗生素的临床转化,以应对抗菌素耐药性威胁 抗菌肽 药物开发 多重耐药菌感染 肽工程、合成生物学 NA 文本 NA 合成生物学 多种生物 NA 医学
184 2026-08-10
A hierarchy of metabolite exchanges in metabolic models of microbial species and communities
2024-09, PLoS computational biology IF:3.8Q1
研究论文 本文通过路径枚举和通量采样方法,分析微生物物种和群落代谢模型中的代谢物交换,揭示不同路径定义之间的层级关系,并评估其对生物解释的鲁棒性 首次系统比较不同途径定义(如基本转换模式、基本通量模式和最小途径)在代谢物交换分析中的关系,提出它们之间存在层次结构,并展示该层次关系普遍适用于代谢网络和子网络 无偏方法(如路径枚举和通量采样)因组合爆炸在大规模网络可扩展性受限,且研究主要基于模型分析,未涉及实验验证 通过聚焦代谢子网络(如代谢物交换)提高无偏代谢网络分析方法(如途径分析)的可扩展性,并确保生物解释的稳健性 微生物物种和微生物群落的代谢模型,包括从中心碳代谢到全基因组规模的模型 计算生物学 不适用 约束型代谢模型、途径枚举、通量采样 约束型代谢模型(如FBA、通量采样) 代谢模型数据(如基因组规模代谢模型) 涉及多个微生物物种和微生物群落的代谢模型,但具体数量未在摘要中提及 不适用 不适用 不适用 代谢工程、合成生物学
185 2026-08-09
Engineered diazotrophs with host-inducible nitrogen supply systems: Transforming rice farming through innovative nitrogen biofertilizers
2026-Aug, Journal of integrative plant biology IF:9.3Q1
综述 本文综述了通过合成生物学改造固氮菌,使其具备宿主诱导的氮供应系统,以作为水稻创新氮生物肥料的潜力,并探讨了减少工业氮肥依赖、推动可持续农业的路径 强调结合野生稻中丰富的固氮菌群与现代合成生物学手段,开发可输出氮的工程化固氮菌及合成微生物群落,并针对水稻品种的响应性进行定制化研究 未提及具体实验数据或技术限制,主要基于文献综述和展望 旨在通过工程化固氮菌提供可持续的氮肥替代方案,补充水稻氮营养,促进可持续农业 固氮菌、水稻品种、合成微生物群落 合成生物学 NA 合成生物学、宏基因组学 NA 文献数据、微生物组数据 未明确,涉及野生稻和栽培稻的微生物组研究 CRISPR-Cas9、TALEN、ZFN 固氮菌(如共生固氮菌) 氮输出生物传感器或代谢通路 农业、环境
186 2026-08-09
Design and optimization of a kinase-controlled allosteric switch
2026-Aug, Nature methods IF:36.1Q1
研究论文 本文设计并优化了一种由激酶控制的变构开关,利用工程化变构技术构建磷酸化控制的蛋白质开关,并展示了其在哺乳动物类器官中揭示空间ERK信号模式的能力。 首次将变构控制技术应用于设计磷酸化控制蛋白质开关,优化出具有20倍磷酸化依赖性转录输出变化的ERK控制转录因子,并证明该开关架构可推广至其他输入激酶和变构控制目标。 未明确指出局限性,可能包括对特定激酶的特异性或体内应用的稳定性等问题。 开发一种通用的基于磷酸化的合成电路设计平台,用于生物传感和合成生物学应用。 磷酸化控制的蛋白质开关(phospho-switches),以Gal4转录因子为支架,ERK控制转录因子。 合成生物学 NA 蛋白质工程,变构设计,FRET生物传感器 NA 实验数据,成像数据 哺乳动物发育类器官(具体数量未指明) 蛋白质工程,变构设计 哺乳动物细胞 磷酸化控制的变构开关,基于FRET生物传感器架构设计ERK响应转录因子 医学,生物技术
187 2026-08-09
Bacterial surface layer - Properties, role, applications and challenges - A review of the next-generation nanotechnological tool
2026-Aug-01, Journal of microbiological methods IF:1.7Q4
综述 本文综述了细菌表面层蛋白的结构特性、自组装功能及其在纳米生物技术、疫苗开发、生物传感、药物递送和超滤等领域的应用,并探讨了商业化挑战与解决方案 该综述独特地整合了S层蛋白的机制生物学、面向制造的工程化设计、蛋白质设计流程和商业化路线图,提供了先前综述未涵盖的可操作方案和基准 S层蛋白向商业规模应用转化面临挑战,包括高纯度蛋白生产的可扩展性、重组表达的成本效益、工业条件下的稳定性以及生物衍生纳米材料的监管途径不明确 总结S层蛋白在纳米技术中的应用潜力,并分析从理论到功能原型的转化瓶颈及解决策略 细菌和古菌的表面层蛋白 纳米生物技术 NA 重组表达、蛋白质工程、计算建模 计算结构-功能预测模型 文本文献资料 NA NA 细菌和古菌 NA 医疗、工业、环境
188 2026-08-09
Extrachromosomally co-encoded toxin-immunity pairs in yeast and their application potential
2026-May-26, Applied microbiology and biotechnology IF:3.9Q2
综述 本文综述了酵母中由染色体外元件共编码的毒素-免疫因子对,并探讨了其在合成生物学和生物技术中的应用潜力 系统整合了毒素-免疫因子对的分子知识及其克隆、研究和工程化方法,并类比细菌毒素-抗毒素系统,提出其在合成生物学中的应用前景 对免疫因子的保护机制研究相对较少,应用潜力仍需进一步探索 推动对酵母毒素-免疫因子对的基础理解,并促进其在合成生物学和生物技术中的应用 酵母中的毒素-免疫因子对,包括dsRNA真菌病毒卫星和dsDNA病毒样元件 合成生物学 NA NA NA 文本信息 NA NA 酵母 毒素-免疫因子对系统 食品,医药,生物技术
189 2026-08-09
Structures of pentatricopeptide repeat proteins
2026-Apr-01, Acta crystallographica. Section F, Structural biology communications
综述 本文全面调查了所有已解析的五肽重复序列(PPR)蛋白晶体结构,分析其晶体学性质、结构特征及其对理解PPR功能的贡献。 系统性地编目所有PPR晶体结构,包括核糖体PPR结构,并总结RNA识别编码机制及构象变化等关键见解。 未提及具体局限性。 为晶体学家和植物生物学家提供PPR蛋白结构综合资源,以理解其结构和功能。 五肽重复序列(PPR)蛋白及核糖体PPR蛋白的结构。 结构生物学 NA X射线晶体学、冷冻电镜 NA 结构数据 30个PPR和83个核糖体PPR晶体或冷冻电镜结构 NA NA NA 合成生物学
190 2026-08-09
The people behind the papers - Sarah Soliman and Zara Weinberg
2025-06-01, Development (Cambridge, England)
访谈 本文是一篇关于Sarah Soliman和Zara Weinberg研究工作的访谈,介绍了他们开发的用于控制小鼠胚胎干细胞基因表达和分化的小分子及细胞接触诱导系统 开发了一套小分子和细胞接触诱导系统,能够在时间和空间上精确控制小鼠胚胎干细胞中的基因表达和分化 NA 利用合成生物学工具重现发育过程,研究发育生物学原理 小鼠胚胎干细胞 合成生物学 NA NA NA NA NA NA 小鼠 小分子和细胞接触诱导的基因表达和分化调控系统 医学
191 2026-08-09
Nudix hydrolase WvNUDX24 is involved in borneol biosynthesis in Wurfbainia villosa
2024-05, The Plant journal : for cell and molecular biology
研究论文 本研究通过体内外功能鉴定,发现Wurfbainia villosa中的Nudix水解酶WvNUDX24能够特异性地催化焦磷酸龙脑酯水解生成磷酸龙脑酯,进而转化为龙脑,阐明了龙脑生物合成途径中的关键酶。 首次鉴定出负责将焦磷酸龙脑酯水解为龙脑的Nudix水解酶WvNUDX24,并确定了四个关键氨基酸残基(R84、S96、P98和G99)对其水解活性至关重要。 研究仅关注了WvNUDX24在龙脑合成中的作用,未深入探讨其在植物体内的调控机制及与其他代谢途径的相互作用。 揭示龙脑生物合成途径中BPP水解为龙脑的关键酶及其机制,为植物代谢工程和合成生物学生产相关萜类化合物提供遗传元件。 研究对象为Wurfbainia villosa植物中的Nudix水解酶WvNUDX24及相关磷酸酶(如WvPAP5和WvPAP10)。 植物代谢工程 NA 体外酶活分析、体内功能鉴定、亚细胞定位实验、定点突变 NA 体外实验数据、体内功能数据 未明确说明,涉及多种酶蛋白及突变体,具体样本数量未提及。 定点突变 NA 龙脑生物合成途径,包括WvNUDX24催化的BPP水解为BP,及磷酸酶进一步水解为龙脑。 医药、食品、工业生物技术
192 2026-08-09
Regulation of cancer epigenomes with a histone-binding synthetic transcription factor
2017, NPJ genomic medicine IF:4.7Q1
研究论文 本文描述了一种基于组蛋白结合的合成转录因子(PcTF)在癌症细胞系中全基因组范围内的行为,揭示其通过读取H3K27me3标记调控基因表达的机制 首次报道了基于多梳蛋白结构域的合成转录因子(PcTF)在全基因组水平上的行为,该因子通过蛋白-蛋白相互作用读取组蛋白修饰(H3K27me3)而非直接结合DNA,从而将表观遗传沉默标记转化为基因激活 研究中仅在三种癌症来源的人类细胞系中进行验证,且未涉及体内或临床前模型,可能限制其直接应用性 研究PcTF合成转录因子在癌症细胞中的全基因组调控机制,并评估其作为癌症研究和治疗工具的潜力 三种癌症来源的人类细胞系及其中的目标基因(包括发育调控因子和肿瘤抑制基因) 合成生物学 癌症 转录组分析、染色质分析 NA 转录组数据、染色质数据 三种人类癌细胞系 NA 人类细胞 基于融合蛋白的合成转录因子(PcTF) 医学
193 2026-08-09
Recent advances in DNA assembly technologies
2015-02, FEMS yeast research IF:2.4Q3
综述 本文综述了DNA组装技术的最新进展,包括关键方法及其应用,并强调了组装方案的创新和自动化挑战。 总结了多种DNA组装方法的最新进展,突出了组装方案的创新,并探讨了自动化组装方法的挑战。 未详细提及具体方法的局限性和性能对比数据。 综述DNA组装技术在合成生物学和代谢工程中的进展,强调创新和挑战。 DNA组装方法及其应用。 合成生物学 NA DNA组装技术(包括限制性酶切连接、Gibson组装等) NA 文献资料 NA 限制性酶切连接, Gibson组装 NA DNA组装方案 合成生物学, 代谢工程
194 2026-08-08
S-layer (Glyco)protein lattices: Biophysical principles of antifouling at prokaryotic interfaces
2026-Aug-07, Quarterly reviews of biophysics IF:7.2Q1
综述 该综述整合历史超微结构观察与现代原子分辨率结构数据和生物物理原理,论证抗污性是所有细菌和古菌S层的基本和普遍功能,并探讨其在生物技术和材料科学中的仿生应用。 首次将S层抗污性置于低雷诺数物理框架下,强调晶格动力学、晶体纳米形貌、静电马赛克、碎片化疏水性、结构化水合壳和聚糖介导的空间排斥的协同作用。 主要基于理论综合,缺乏直接实验验证抗污性机制在不同环境下的定量比较。 阐明S层(糖)蛋白晶格在低雷诺数环境中的抗污生物物理机制,并突出其作为可调界面的潜力。 细菌和古菌的表面层(S层)蛋白和糖蛋白晶格。 生物物理学 NA NA NA 文献数据 NA NA 细菌和古菌 NA 生物技术、合成生物学、材料科学
195 2026-08-08
Microbial lipases: advances in metagenomics and artificial intelligence for enzyme discovery and engineering
2026-Aug-07, Archives of microbiology IF:2.3Q3
综述 本文综述了宏基因组学和人工智能技术在微生物脂肪酶发现与工程中的最新进展,并简要概述了脂肪酶的来源、结构特征、理化性质及工业应用 强调了宏基因组学与人工智能技术的协同作用,用于酶的识别和理性设计,整合大规模序列数据库与预测性计算建模工具,并展望了蛋白质语言模型、生成式人工智能、合成生物学和多组学整合的未来发展 存在异源表达水平低、缺乏高质量信息以及工业规模验证有限等挑战 探讨宏基因组学和人工智能技术在微生物脂肪酶发现与工程中的应用,以推动高效经济的酶开发和可持续生物技术应用 微生物脂肪酶 宏基因组学、人工智能 NA 宏基因组学、人工智能 蛋白质语言模型、生成式人工智能 序列数据 NA NA NA NA 工业生物技术
196 2026-08-08
Regulation of Escherichia coli fermentation processes: from molecular mechanisms to smart industrial practice
2026-Aug-07, Archives of microbiology IF:2.3Q3
综述 本文系统综述了大肠杆菌发酵调控从分子机制到智能工业实践的范式转变,涵盖跨尺度关联、先进缓解策略、多尺度建模与数字孪生等前沿方向 提出从经验性过程调整向跨尺度、深度耦合的智能控制框架转变,整合模型预测控制与动态合成生物学电路,并强调数字孪生作为工业发酵透明化的工具 未提及具体实验数据或案例验证,主要基于文献综述,缺乏实际工业应用的量化评估 阐明大肠杆菌发酵调控的现代范式,从分子机制到智能工业实践,推动绿色生物制造 大肠杆菌发酵过程 工业生物技术 NA 多尺度建模、计算流体动力学、基因组规模代谢模型、数字孪生、合成生物学电路 模型预测控制、数字孪生、基因组规模代谢模型 文献数据 NA 合成生物学电路 大肠杆菌 基于群体感应的生长-生产解耦、代谢物响应反馈回路、光遗传开关 工业生物技术、绿色生物制造
197 2026-08-08
Integrative framework for selecting gene delivery technologies in microalgae for synthetic biology
2026-Aug-07, Molecular biology reports IF:2.6Q3
研究论文 本研究对微藻合成生物学中使用的基因递送技术进行了比较分析,并提出了一个实用的方法选择框架 提出了一个基于工程目标和物种特异性细胞特征来组织基因递送方法的选择框架,该框架强调了递送平台需兼容多样化货物、受体物种和工程应用 新兴技术如细胞穿透肽和金属有机框架的实用性需要更广泛的物种级验证 为微藻合成生物学中的基因递送技术选择提供指导框架 微藻基因递送技术,包括常规技术和新兴技术 合成生物学 NA 基因递送技术(包括 agitation、微粒轰击、电穿孔、农杆菌介导转化、细胞穿透肽、金属有机框架) NA 文献数据 NA NA 微藻 NA 工业生物技术
198 2026-08-08
Integrated multi-omics analysis reveals a pH-driven metabolic and translational switch in Ureaplasma parvum
2026-Aug-04, Microbiology spectrum IF:3.7Q2
研究论文 该研究通过整合蛋白质组学、代谢组学和RNA修饰分析,构建了微小病原体微小脲原体在不同pH条件下的适应性系统模型 首次揭示了在缺乏典型转录调控系统的基因组最小细菌中,通过pH驱动的代谢和翻译开关实现适应性可塑性的机制,并强调了表观转录组在其中的关键作用 未明确指出,但可能受限于体外培养条件与体内微环境差异,以及多组学数据整合的复杂性 构建微小脲原体pH适应的系统级模型,理解基因组最小生物如何通过转录后和代谢调控实现适应性 微小脲原体(Ureaplasma parvum) 系统生物学 泌尿生殖道感染 蛋白质组学、代谢组学、RNA修饰分析 系统级模型 蛋白质、代谢物、RNA修饰数据 NA NA NA NA 医学、合成生物学
199 2026-08-08
Phage as a prospective arsenal against superbugs
2026-Aug-04, Molecular biology reports IF:2.6Q3
综述 本文全面评述了噬菌体疗法作为抗超级细菌武器库的现状,涵盖其现代分类、治疗优势、生物技术应用、临床转化流程及面临的挑战 系统整合了基于基因组的噬菌体分类、基因工程改造、噬菌体衍生蛋白及噬菌体-抗生素协同作用等前沿应用,并展望了合成生物学和人工智能在克服科学、监管和商业障碍中的潜力 尽管有同情使用和临床试验的有力证据,仍存在显著的科学、监管和商业障碍,且论文未提供具体临床效果数据 探讨噬菌体疗法作为抗生素替代品的潜力,并分析其从实验室到临床应用的转化路径及未来发展方向 噬菌体及其衍生蛋白在抗菌治疗中的应用 微生物学 抗菌素耐药性相关感染 基因组测序、基因工程 NA 文献资料 NA 基因工程(未指定具体工具) 细菌(未指定具体菌种) NA 医学
200 2026-08-08
Engineering Naematelia aurantialba as a Robust Synthetic Biology Chassis: Stable Episomal Vector Construction and Metabolic Optimization for Enhanced Polysaccharide Synthesis
2026-Aug-04, Bioresource technology IF:9.7Q1
研究论文 本研究为金耳(Naematelia aurantialba)构建了稳定的遗传平台,包括优化原生质体再生、鉴定微型着丝粒元件以实现稳定的附加体复制,并通过表达透明颤菌血红蛋白增强细胞呼吸,最终使金耳多糖产量提高44.8% 首次在金耳中鉴定出475-bp微型着丝粒核心元件,并利用其构建稳定的自主复制附加体载体,解决了转化子遗传嵌合和荧光异质性问题,为金耳代谢工程提供了高效工具 摘要未提及研究的局限性,可能包括对非模式真菌的适用性有限、微型着丝粒元件的普适性待验证等 建立金耳作为稳健合成生物学底盘,通过遗传工具开发和代谢优化提高金耳多糖产量 金耳(Naematelia aurantialba)菌株NX-20,及其工程改造菌株 合成生物学 NA 原生质体再生、基因组分析、密码子偏好分析、异源表达 NA 基因组序列、生化数据、发酵数据 金耳菌株NX-20,具体样本数量未明确 NA 金耳(Naematelia aurantialba) 携带微型着丝粒元件的附加体表达载体,整合透明颤菌血红蛋白(VHb)基因 工业生物技术
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