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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 181 | 2026-03-16 |
Biosynthesis of benzylisoquinoline alkaloids and its evolution in plants
2026-Mar-09, Plant communications
IF:9.4Q1
DOI:10.1016/j.xplc.2026.101786
PMID:41776991
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综述 | 本文系统综述了植物中苄基异喹啉生物碱(BIAs)的生物合成途径、关键酶及其进化机制,并展望了未来研究方向 | 整合了BIAs生物合成途径的系统知识,并提出了通过多组学数据与合成生物学结合来可持续生产高价值BIAs的新策略 | 仍存在途径空白、酶的多功能性以及调控网络尚未完全阐明等挑战 | 阐明苄基异喹啉生物碱(BIAs)的生物合成途径及其在植物中的进化机制 | 苄基异喹啉生物碱(BIAs)及其生物合成途径与关键酶 | NA | NA | 多组学数据整合、蛋白质工程、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医药、农业 |
| 182 | 2026-03-16 |
Pelecyphora chihuahuensis (Britton & Rose) D. Aquino & Dan. Sánchez: A Review on Its Taxonomy, Ecology and Conservation of an Endemic Mexican Cactus Species with Biotechnological Perspectives
2026-Mar-03, Biology
DOI:10.3390/biology15050413
PMID:41823840
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综述 | 本文综述了墨西哥特有仙人掌物种Pelecyphora chihuahuensis的分类学、生态学、保护现状及其生物技术应用前景 | 首次系统整合传统分类学与现代生物技术工具(如分子标记、NGS、CRISPR-Cas和合成生物学)来解决该特有仙人掌物种的保护问题 | 作为综述文章,未提供原始实验数据,且对CRISPR-Cas和合成生物学在仙人掌保护中的具体应用仍处于讨论阶段 | 通过整合生物技术、生态学和分类学知识,促进该特有仙人掌物种及其相关濒危仙人掌的可持续管理和保护 | 墨西哥特有仙人掌物种Pelecyphora chihuahuensis | NA | NA | 分子标记、下一代测序(NGS)、基于GIS的物种分布模型、组织培养、低温保存 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas | NA | NA | 环境, 农业 |
| 183 | 2026-03-16 |
Double-edged sword: Aspergillus flavus as a threat to food safety and a resource for biotechnology
2026-Feb-21, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.108848
PMID:41730464
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综述 | 本文综述了黄曲霉作为食品安全威胁与生物技术资源双重角色的最新研究进展 | 将黄曲霉重新定义为具有双重用途的生物体,既关注其生物安全风险,又挖掘其作为可利用化学多样性资源的潜力 | NA | 系统梳理黄曲霉次级代谢产物的多样性、调控机制及其在生态、致病和生物技术中的应用 | 黄曲霉及其次级代谢产物 | NA | NA | 真菌基因组学、代谢组学、基因组挖掘、CRISPR技术、异源表达 | NA | NA | NA | CRISPR, 合成生物学平台 | NA | NA | 医药, 农业 |
| 184 | 2026-03-16 |
Exploring the computing power of microbes that shapes the environment
2026-Feb, Current opinion in microbiology
IF:5.9Q1
DOI:10.1016/j.mib.2025.102700
PMID:41494508
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综述 | 本文探讨了微生物通过遗传和代谢机制处理信息并影响环境的计算能力,并回顾了合成生物学在构建遗传电路以模拟这种计算方面的进展 | 通过比较自然微生物计算与合成遗传电路的复杂性,提出理解微生物计算形式化方法以缩小两者间的差距 | 主要聚焦于细菌,可能未全面涵盖其他微生物群体的计算特性 | 探索微生物的计算能力及其对环境的影响,并研究如何通过合成生物学工具提升人工遗传电路的计算效能 | 自然微生物和合成遗传电路 | 合成生物学 | NA | 遗传电路设计 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | 细菌 | 布尔门电路、组合输入处理电路、顺序逻辑、基于记忆的系统、模拟电路和细胞联合体中的分布式计算 | 环境, 工业生物技术 |
| 185 | 2026-03-16 |
On-Demand Nanoliter Delivering Platform via Electrical-Activated Microdroplet Assembling
2025-09-24, Nano letters
IF:9.6Q1
DOI:10.1021/acs.nanolett.5c02928
PMID:40929287
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研究论文 | 本文介绍了一种按需纳升输送平台,通过电激活微滴组装实现实时控制和选择性内容融合 | 该平台创新性地整合了电传感、触发式液滴合并和被动分选于单一连续流中,利用基于阻抗的内容检测选择性识别目标液滴并启动电聚结融合 | NA | 开发一种高精度、可编程的纳升输送平台,用于提高生化检测的吞吐量和特异性 | 微滴液滴及其内容物,应用于细菌筛选等场景 | NA | NA | 阻抗检测、电聚结融合、流体动力学偏转 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 药物发现、合成生物学、单细胞分析 |
| 186 | 2026-03-15 |
Recoding multiple rare codons enables the simultaneous incorporation of up to five distinct noncanonical amino acids
2026-Mar-13, Nature chemistry
IF:19.2Q1
DOI:10.1038/s41557-026-02084-y
PMID:41826677
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研究论文 | 本文提出了一种多类型稀有密码子重编码策略,实现了在哺乳动物细胞中高效、多位点同时引入多种非经典氨基酸 | 通过系统评估和重新利用稀有密码子,并结合工程化的正交氨酰-tRNA合成酶/tRNA对,首次实现了在哺乳动物细胞中单个蛋白内同时引入多达五种不同非经典氨基酸 | NA | 扩展遗传密码,实现哺乳动物细胞中多位点、多类型非经典氨基酸的高效同时引入 | 非经典氨基酸、哺乳动物细胞、蛋白质 | 合成生物学 | NA | 稀有密码子重编码、正交氨酰-tRNA合成酶/tRNA对工程 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 哺乳动物细胞 | 多类型非经典氨基酸同时引入的翻译系统 | 生物医学, 合成生物学 |
| 187 | 2026-03-15 |
KSHV and cancer: understanding the oncogenic machinery for next-generation diagnostic tools and therapies
2026-Jan-21, Archives of microbiology
IF:2.3Q3
DOI:10.1007/s00203-025-04706-4
PMID:41563473
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综述 | 本文综述了卡波西肉瘤相关疱疹病毒(KSHV)的致癌机制,并探讨了下一代诊断工具和疗法的前景 | 整合新兴诊断生物标志物(如病毒microRNAs)与下一代治疗策略(包括基因编辑和合成生物学方法),强调精准医学在改善疾病检测、治疗特异性和患者预后方面的机遇 | 当前KS诊断主要依赖组织病理学和LANA免疫染色,这些方法在早期或不典型病变以及区分潜伏与裂解感染方面存在重要限制,且KSHV相关恶性肿瘤缺乏病毒特异性靶向治疗,临床结果仍不理想 | 理解KSHV驱动的致癌机制,并为未来诊断和治疗创新提供关键方向 | 卡波西肉瘤相关疱疹病毒(KSHV)及其相关的癌症,如卡波西肉瘤(KS)、原发性渗出性淋巴瘤(PEL)和多中心性Castleman病(MCD) | NA | 卡波西肉瘤 | 组织病理学、LANA染色、先进成像、分子生物标志物检测、CRISPR-Cas9、治疗性适配体 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | NA | NA | 医学 |
| 188 | 2026-03-15 |
NNTox: Gene Ontology-Based Protein Toxicity Prediction Using Neural Network
2019-11-29, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-019-54405-6
PMID:31784686
|
研究论文 | 本文提出了一种基于基因本体(GO)的神经网络模型NNTox,用于预测蛋白质毒性,并分析了GO术语与蛋白质毒性之间的关系 | 将通用的蛋白质功能预测方法扩展应用于毒性预测,开发了基于神经网络的模型NNTox,能够预测蛋白质的毒性可能性及具体毒性类型 | 现有方法过于特定,限制了其应用范围;模型依赖于预测的GO术语,可能受预测准确性影响 | 预测蛋白质毒性,以减少合成生物学中潜在危害风险 | 蛋白质序列及其毒性 | 生物信息学 | NA | 神经网络 | 神经网络 | 蛋白质序列和GO术语 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学 |
| 189 | 2026-03-15 |
The rise of bottom-up synthetic biology and cell-free biology
2019-05-07, Physical biology
IF:2.0Q3
DOI:10.1088/1478-3975/ab1bed
PMID:31018188
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 190 | 2026-03-15 |
Towards control of cellular decision-making networks in the epithelial-to-mesenchymal transition
2019-03-07, Physical biology
IF:2.0Q3
DOI:10.1088/1478-3975/aaffa1
PMID:30654341
|
综述 | 本文从实验/技术和理论两个角度探讨上皮-间质转化(EMT),综述其在胚胎发育、伤口愈合和转移等生理背景下的调控网络,并介绍相关数学模型和新兴合成生物学技术 | 结合实验与理论视角,强调网络基序(如耦合反馈环)在生成上皮与间质状态间中间杂交态中的作用,并提出通过驱动网络动态向期望吸引子(如上皮细胞状态)来控制表型结果的新兴方法 | NA | 理解EMT调控网络,以开发控制细胞表型结果的方法,特别是在癌症治疗策略中 | 上皮-间质转化(EMT)的调控网络及其在胚胎发育、伤口愈合和转移中的生理背景 | 合成生物学 | 癌症 | NA | 数学模型 | NA | NA | 合成生物学技术 | 细胞 | 网络基序如耦合反馈环 | 医学 |
| 191 | 2026-03-14 |
Plant-derived bioactive compounds modulate the gut microbiota in Alzheimer's disease: Metabolite signaling, neuroimmune circuits, and systems-level regulation
2026-Apr, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology
IF:6.7Q1
DOI:10.1016/j.phymed.2026.157919
PMID:41678917
|
综述 | 本文综述了植物来源的生物活性化合物如何通过调节肠道菌群及其代谢物,影响阿尔茨海默病的病理生理过程 | 提出了一个系统层面的框架,将植物干预与肠道菌群重塑和代谢物信号联系起来,并强调了肠道菌群作为植物源治疗活性的核心介质作用 | NA | 阐明植物来源的生物活性化合物如何通过微生物群依赖的代谢和神经免疫机制调节阿尔茨海默病的病理生理学 | 植物来源的生物活性化合物(如植物化学物质、多糖、复方草药)、肠道菌群及其代谢物 | NA | 阿尔茨海默病 | 文献综述、多组学整合分析 | NA | 文献数据 | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 192 | 2026-03-14 |
Systems-level understanding of plant immune networks through single-cell and spatial omics
2026-Apr, Current opinion in plant biology
IF:8.3Q1
DOI:10.1016/j.pbi.2026.102870
PMID:41719893
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综述 | 本文综述了通过单细胞和空间组学技术系统理解植物免疫网络的进展,包括受体激活、基因调控回路、蛋白质互作中心和染色质动态如何共同影响免疫结果 | 整合单细胞和空间组学揭示植物免疫异质性,识别了专门的“PRIMER”细胞和“旁观者”细胞,并探讨了系统与合成生物学方法在作物抗病工程中的应用 | NA | 系统理解植物免疫网络,以指导作物更持久和广谱的抗病性工程 | 植物免疫系统,包括PTI、ETI、SAR层,以及NLR受体、PRIMER细胞和旁观者细胞 | NA | NA | 单细胞组学、空间组学、结构分析、蛋白质组学、互作组学 | NA | 组学数据 | NA | NA | 植物 | NA | 农业 |
| 193 | 2026-03-14 |
Super-enhancer-mediated transcriptional regulation of gene clusters in plants
2026-Apr, Current opinion in plant biology
IF:8.3Q1
DOI:10.1016/j.pbi.2026.102871
PMID:41719895
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研究论文 | 本文探讨了植物基因组中超级增强子如何调控基因簇(特别是生物合成基因簇)的转录,以协调基因的共表达,从而影响特化代谢物的产生 | 揭示了超级增强子在植物生物合成基因簇共表达中的核心作用,并展示了通过CRISPR/Cas技术破坏超级增强子可以改变整个基因簇的表达 | NA | 研究超级增强子介导的基因簇转录调控机制,以促进合成生物学、代谢工程和作物改良 | 植物基因组中的基因簇,包括同源基因簇和生物合成基因簇,特别以拟南芥为例 | 合成生物学 | NA | T-DNA插入、CRISPR/Cas诱导删除、组织特异性染色质可及性数据集分析 | NA | 基因组数据、染色质可及性数据 | NA | CRISPR-Cas9 | 拟南芥 | NA | 农业, 工业生物技术 |
| 194 | 2026-03-14 |
Chromosome-Level Genome Assembly of the Allotetraploid Gynostemma pentaphyllum Provides Novel Insights Into the Biosynthesis of Ginsenoside and Gypenoside LVI
2026-Mar-13, Plant biotechnology journal
IF:10.1Q1
DOI:10.1111/pbi.70598
PMID:41821502
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研究论文 | 本研究通过组装绞股蓝染色体级别基因组,揭示了其皂苷类成分生物合成差异的机制,并鉴定了一个关键的双功能P450酶 | 首次组装了绞股蓝的染色体级别基因组,揭示了其异源四倍体起源,并鉴定了一个在绞股蓝和五加科植物中独立进化、具有双功能(C-12和C-2羟基化)的关键P450酶GpCYP88AB3 | NA | 阐明绞股蓝不同地理种群间达玛烷型人参皂苷和绞股蓝皂苷LVI积累差异的分子机制 | 绞股蓝(Gynostemma pentaphyllum),特别是来自遂宁(SN)和南宁(NN)的种群 | 基因组学与合成生物学 | NA | 染色体级别基因组组装、多组学分析(基因组、转录组、代谢组)、系统发育分析、染色体进化分析、体内外酶功能验证 | NA | 基因组序列数据、多组学数据 | NA | NA | NA | NA | 医药、合成生物学 |
| 195 | 2026-03-14 |
The disputed identity of Pseudomonas putida KT2440: when taxonomists rename your favorite microbe
2026-Mar-11, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mbio.03390-25
PMID:41589905
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评论 | 本文讨论了假单胞菌KT2440菌株的分类学重命名问题,强调社区实践和历史连贯性应优先于不断变化的分类学正统 | 提出在微生物命名中,对于标志性菌株如KT2440,应基于社区共识和实际效用而非单纯系统发育分析来决定名称 | NA | 探讨微生物分类学重命名对科学社区和实践的负面影响,并倡导社区参与命名决策 | 假单胞菌KT2440菌株及其分类学身份 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 假单胞菌KT2440 | NA | 环境微生物学, 生物技术, 合成生物学 |
| 196 | 2026-03-14 |
Synthetic overlapping genes stabilize genetic systems
2026-Mar-11, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mbio.02725-25
PMID:41649272
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研究论文 | 本文提出了一种名为OAFI的新方法,用于创建合成重叠基因,以稳定基因系统并限制抗生素抗性基因的水平转移 | 开发了OAFI(重叠、交替框架插入)方法,通过将编码在交替框架中的“内部”基因插入“外部”基因的灵活区域,创建合成重叠基因对 | 未明确说明该方法在不同宿主或复杂基因系统中的普适性,也未讨论长期进化稳定性 | 开发一种创建合成重叠基因的方法,以稳定工程基因并限制抗生素抗性基因的水平转移 | 基因报告因子、细菌毒素和抗生素抗性基因 | 合成生物学 | NA | OAFI(重叠、交替框架插入)方法 | NA | NA | NA | OAFI | 细菌(未指定具体种类) | 合成重叠基因对,其中内部基因(如毒素)编码在抗生素抗性基因的交替阅读框架中 | 工业生物技术, 环境 |
| 197 | 2026-03-14 |
Overcoming hydrophobicity-driven aggregation: An integrated expression strategy enables high-yield soluble production of recalcitrant starch synthases in Escherichia coli
2026-Mar-10, Protein expression and purification
IF:1.4Q4
DOI:10.1016/j.pep.2026.106917
PMID:41819303
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研究论文 | 本研究开发了一种整合表达策略,用于提高疏水性淀粉合成酶在大肠杆菌中的可溶性表达产量 | 结合结构分析、MBP融合标签、优化诱导条件和密码子优化,系统性解决了疏水性酶的可溶性表达难题,并验证了该策略对多种不同来源淀粉合成酶的普适性 | 研究主要针对原核表达系统,未在真核宿主中验证;酶活性提升的具体分子机制有待进一步阐明 | 提高疏水性淀粉合成酶在大肠杆菌中的可溶性表达产量,以支持无细胞化学酶法淀粉合成 | 嗜热绿菌门细菌的淀粉合成酶(CtSS)及其他四种植物来源的淀粉生物合成酶 | 合成生物学 | NA | 蛋白质异源表达、结构分析、MBP融合标签技术、密码子优化 | NA | 蛋白质序列与结构数据、酶活性数据 | 5种淀粉合成酶(CtSS、GmPGM、ZmAGP、OsSS、MeSS) | MBP融合表达系统 | 大肠杆菌 | 淀粉生物合成途径的异源表达优化 | 工业生物技术 |
| 198 | 2026-03-14 |
Post-translational modifications of silk proteins
2026-Mar-05, RSC chemical biology
IF:4.2Q2
DOI:10.1039/d6cb00012f
PMID:41822872
|
综述 | 本文综述了丝蛋白的翻译后修饰(PTMs)如何赋予其化学多样性,影响高级组装、水合和共价连接,并探讨了这些修饰对蛋白质结构稳定性和机械性能的贡献 | 整合了蛋白质组学、合成生物学和生物正交化学的最新进展,揭示了低丰度PTMs,并实现了可编程修饰以调控物理化学性质,为下一代蛋白质基材料的预测性设计提供了基础 | NA | 探讨丝蛋白的翻译后修饰及其在化学生物学和材料科学交叉界面中的应用,以设计新型蛋白质基材料 | 丝蛋白及其翻译后修饰,包括羟基化、糖基化、磷酸化和共价交联 | 材料科学 | NA | 蛋白质组学、合成生物学、生物正交化学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 材料 |
| 199 | 2026-03-14 |
Protein-inducible ribosomal frameshifting enables programmable translational control for genetic circuit design in Escherichia coli
2026-Feb-07, Journal of biological engineering
IF:5.7Q1
DOI:10.1186/s13036-026-00629-w
PMID:41654819
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研究论文 | 本文介绍了一种名为PIRF的合成翻译调控平台,通过整合适配体-蛋白质相互作用与-1移码基序,实现了在大肠杆菌中可调控的翻译 | 开发了蛋白质诱导的核糖体移码平台,将适配体-蛋白质相互作用与-1移码基序结合,实现了可编程的翻译调控,突破了传统移码设计的严格序列和结构限制 | 观察到可测量的基础移码水平,未来可能需要额外策略进行进一步优化 | 开发可编程的翻译调控工具,用于遗传电路设计和合成生物学应用 | 大肠杆菌中的翻译调控机制和遗传电路 | 合成生物学 | NA | 蛋白质诱导的核糖体移码 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | 大肠杆菌 | 逻辑门操作、多层调控、融合蛋白表达控制、蛋白质聚集和膜周定位 | 生物传感、生物治疗 |
| 200 | 2026-03-14 |
"Microbial metabolites in cardioprotection: an immune-engineered framework for heart failure and post-ischemic remodeling: a narrative review"
2026-Feb, Annals of medicine and surgery (2012)
DOI:10.1097/MS9.0000000000004529
PMID:41675890
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综述 | 本文是一篇叙述性综述,探讨了肠道微生物代谢物通过免疫工程化框架在心力衰竭和缺血后心脏重塑中的心脏保护潜力 | 提出了一个整合微生物代谢物、分子通路和合成生物学工具的“免疫工程化框架”,用于靶向调控肠道-心脏轴,并强调了后生元制剂和新型递送系统等创新干预策略 | 存在显著的转化障碍,包括药代动力学差异、微生物群异质性以及临床验证和监管标准化不足 | 客观评估肠道微生物代谢物的心脏保护潜力,探讨其分子通路、治疗选择及转化障碍 | 肠道微生物代谢物(如短链脂肪酸、尿石素、吲哚、氧化三甲胺、硫化氢)及其对心脏保护、炎症、纤维化和免疫代谢的影响 | NA | 心血管疾病 | 系统文献检索(PubMed, Scopus, Web of Science),叙述性综合分析 | NA | 文本(文献数据) | NA | 合成生物学 | NA | NA | 医学 |