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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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181 | 2025-05-04 |
[An efficient assembly method for a viral genome based on T7 endonuclease Ⅰ-mediated error correction]
2025-Jan-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.240302
PMID:39855702
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研究论文 | 本研究开发了一种基于T7内切酶Ⅰ介导的纠错方法,用于高效组装约10 kb的病毒基因组 | 通过合理设计寡核苷酸序列、两步PCR和高保真聚合酶合成3.0 kb DNA片段,并利用T7内切酶Ⅰ进行纠错,显著降低了错误率并简化了合成步骤 | NA | 优化基因合成过程,降低错误率并简化病毒基因组的合成与组装步骤 | 约10 kb的病毒基因组 | 合成生物学 | NA | T7内切酶Ⅰ介导的纠错、两步PCR、高保真聚合酶 | NA | DNA序列 | 约10 kb的病毒基因组 |
182 | 2025-05-04 |
Recent advances in engineering non-native microorganisms for poly(3-hydroxybutyrate) production
2025-Jan-24, World journal of microbiology & biotechnology
IF:4.0Q2
DOI:10.1007/s11274-025-04261-6
PMID:39849243
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综述 | 本文综述了非天然微生物在聚(3-羟基丁酸酯)(PHB)生产中的工程化进展 | 总结了代谢工程和合成生物学在非天然微生物中生产PHB的最新策略,包括CRISPR/Cas9基因编辑技术的应用 | 需要进一步的基因工程方法使非天然微生物更适合大规模PHB生产 | 探讨非天然微生物作为PHB生产宿主的潜力和优化策略 | 非天然微生物,特别是大肠杆菌 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、CRISPR/Cas9 | NA | NA | NA |
183 | 2025-05-04 |
Cell-free expression and SMA copolymer encapsulation of a functional receptor tyrosine kinase disease variant, FGFR3-TACC3
2025-Jan-23, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-86194-6
PMID:39848978
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研究论文 | 本研究通过无细胞蛋白表达系统成功表达了功能性的FGFR3-TACC3融合蛋白,并利用SMA共聚物进行重构 | 首次使用无细胞蛋白表达系统在48小时内成功表达功能性FGFR3-TACC3融合蛋白,并证明其具有显著的激酶结构域磷酸化活性 | 目前尚未获得任何全长RTK的高分辨率结构 | 解决跨膜蛋白特别是受体酪氨酸激酶融合蛋白的表达难题 | FGFR3-TACC3融合蛋白 | 合成生物学 | 癌症 | 无细胞蛋白表达(CFPE), SMA共聚物重构 | NA | 蛋白功能数据 | 表达产量为300 µg/mL裂解液 |
184 | 2025-05-04 |
Optimal network sizes for most robust Turing patterns
2025-Jan-23, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-86854-7
PMID:39849094
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research paper | 该研究通过随机矩阵理论分析大型网络的雅可比矩阵,揭示了图灵模式在生物系统中出现的可能性及其最优网络规模 | 使用随机矩阵理论分析大型网络的统计特性,发现图灵模式的出现概率高于预期,并确定了最优网络规模 | 研究主要基于理论分析,未涉及具体生物实验验证 | 探讨图灵不稳定性在生物模式形成中的作用及其网络规模的影响 | 基因调控网络中的图灵模式 | systems biology | NA | random matrix theory | NA | theoretical analysis | NA |
185 | 2025-05-04 |
BAC-browser: the tool for synthetic biology
2025-Jan-23, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-025-06049-9
PMID:39849360
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研究论文 | 介绍了一个名为BAC-browser v.2.1的图形界面程序,用于合成基因组学中的序列设计和DNA组装 | 开发了一个集成了多种工具的图形界面程序,使非生物信息学背景的研究者也能进行合成基因组学的任务 | 未提及程序的性能评估或与其他工具的对比 | 为合成基因组学领域提供易用的软件工具 | 合成基因组学中的序列设计和DNA组装 | 合成生物学 | NA | DNA序列设计和组装 | NA | 核苷酸序列 | NA |
186 | 2025-05-04 |
Physiology-informed use of Cupriavidus necator in biomanufacturing: a review of advances and challenges
2025-Jan-22, Microbial cell factories
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s12934-025-02643-x
PMID:39844200
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综述 | 本文综述了在生物制造中利用Cupriavidus necator的生理学进展与挑战 | 讨论了C. necator作为生物制造底盘的最新进展,特别是在利用二氧化碳和氢气或甲酸盐作为碳和能源来源方面的应用 | 现有工具和应用常因未充分考虑C. necator独特的生理和代谢特征而受限 | 探讨如何更好地理解和利用C. necator的生理机制以优化其在生物制造中的应用 | Cupriavidus necator细菌及其在生物制造中的应用 | 生物制造 | NA | 合成生物学工具和建模 | NA | NA | NA |
187 | 2025-05-04 |
Development of a Komagataella phaffii cell factory for sustainable production of ( +)-valencene
2025-Jan-21, Microbial cell factories
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s12934-025-02649-5
PMID:39838465
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研究论文 | 本研究开发了一种利用Komagataella phaffii细胞工厂可持续生产(+)-valencene的方法 | 首次在K. phaffii中通过CRISPR/Cas9系统引入(+)-valencene合成酶,并通过多种优化策略显著提高了产量 | 研究仅在摇瓶水平进行验证,尚未进行大规模发酵生产测试 | 开发可持续生产(+)-valencene的微生物细胞工厂 | Komagataella phaffii微生物细胞 | 合成生物学 | NA | CRISPR/Cas9基因编辑技术 | NA | NA | NA |
188 | 2025-05-04 |
Recent trends and advances in chloroplast engineering and transformation methods
2025, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2025.1526578
PMID:40313723
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综述 | 本文综述了叶绿体工程和转化方法的最新趋势和进展 | 讨论了合成生物学在叶绿体工程中的应用以及现代转化载体的构建要素 | 该技术目前主要局限于学术实验室的模式物种,尚未商业化 | 提高作物产量、营养品质、抗逆性以及工业酶和治疗蛋白的生产 | 叶绿体基因组和转基因植物 | 合成生物学 | NA | 叶绿体转化技术 | NA | NA | NA |
189 | 2025-05-04 |
Enhancing the physiological characteristics of chimeric antigen receptor natural killer cells by synthetic biology
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1592121
PMID:40313937
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review | 探讨合成生物学在增强嵌合抗原受体自然杀伤细胞(CAR-NK)生理特性方面的最新进展 | 通过合成生物学工具包与NK细胞的协同作用,为开发下一代CAR-NK疗法提供路线图 | 临床转化仍受限于在免疫抑制性肿瘤微环境中的持久性和功能耗竭问题 | 提升CAR-NK细胞的生理特性以应对实体瘤挑战 | 嵌合抗原受体自然杀伤细胞(CAR-NK) | 合成生物学 | 实体瘤 | 合成生物学工具包 | NA | NA | NA |
190 | 2025-05-03 |
Machine learning reveals novel compound for the improved production of chitooligosaccharides in Escherichia coli
2025-May-25, New biotechnology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.nbt.2025.01.005
PMID:39827984
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研究论文 | 利用机器学习模型和特征重要性分析改进大肠杆菌中壳寡糖的生产 | 通过机器学习模型和特征重要性分析发现铁元素可以显著提高壳寡糖的生产效率 | 工程步骤可能无法带来足够的改进,且代谢反应中的瓶颈可能仍被隐藏 | 提高壳寡糖的生产效率和预测性 | 大肠杆菌中的壳寡糖生产途径 | 合成生物学 | NA | 机器学习 | NA | 代谢数据 | 大肠杆菌工程转录调节因子库 |
191 | 2025-05-03 |
Addressing semantic ambiguity in biotechnology: Proposals from the European research infrastructure IBISBA
2025-Apr-24, New biotechnology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.nbt.2025.04.010
PMID:40280273
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讨论论文 | 本文探讨了生物技术领域的语义模糊问题,并提出了统一核心术语定义的建议 | 分析了生物技术领域术语定义的混乱现状,并提出了术语标准化的必要性 | 仅提出了问题而未提供具体的术语定义解决方案 | 促进生物技术领域术语定义的标准化,以支持有效的政策制定和科学传播 | 生物技术领域的核心术语(如biotechnology, biomanufacturing等) | 生物技术 | NA | NA | NA | 文本 | NA |
192 | 2025-05-03 |
Creating a Halotolerant Degrader for Efficient Mineralization of p-Nitrophenol-Substituted Organophosphorus Pesticides in High-Saline Wastewater
2025-Apr, Biotechnology and bioengineering
IF:3.5Q2
DOI:10.1002/bit.28923
PMID:39821562
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研究论文 | 本研究通过合成生物学方法创建了一种耐盐降解菌J9U-MP,用于高效矿化高盐废水中的对硝基酚取代有机磷农药 | 首次将包含七个基因的异源生物降解途径与耐盐底盘菌Halomonas cupida J9结合,创建了能在高盐和低氧环境下高效降解有机磷农药的工程菌J9U-MP | 研究仅针对特定类型的有机磷农药(对硝基酚取代的有机磷农药)进行测试,未涉及其他类型污染物 | 开发能在高盐废水中高效降解有机磷农药的生物修复技术 | 对硝基酚取代的有机磷农药(如甲基对硫磷)及其降解中间产物 | 合成生物学 | NA | 基因工程、RT-PCR、气相色谱分析、稳定同位素分析 | NA | 生物化学数据 | 工程菌J9U-MP在含60g/L NaCl的废水中对50mg/L甲基对硫磷及其降解产物的降解实验 |
193 | 2025-05-03 |
Next-generation metabolic models informed by biomolecular simulations
2025-Apr, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2025.103259
PMID:39827498
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research paper | 该文章探讨了如何将生物分子模拟与代谢模型相结合,以推动结构引导的合成生物学应用 | 提出了将生物分子模拟和机器学习预测整合到代谢模型中的新方法,以优化和理解代谢途径 | 尚未具体说明生物分子模拟与代谢模型整合的实际应用效果和具体案例 | 优化和理解代谢途径,以改善蛋白质和小分子产品的生物生产 | 从微生物到人类的细胞代谢 | 合成生物学 | NA | 生物分子模拟, 机器学习 | flux balance analysis, dynamic, kinetic delineations | 代谢网络数据 | NA |
194 | 2025-05-03 |
Advances in designed bionanomolecular assemblies for biotechnological and biomedical applications
2025-Apr, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2024.103256
PMID:39827499
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综述 | 本文综述了蛋白质工程在生物纳米分子组装设计方面的最新进展及其在生物技术和生物医学中的应用 | 结合AI工具(如AlphaFold、RFDiffusion和ProteinMPNN)显著提高了从头设计的可扩展性和成功率 | NA | 探讨蛋白质工程在设计和应用生物纳米分子组装方面的潜力 | 有限组装(如纳米笼和基于卷曲螺旋的结构)和扩展组装(如细丝和2D/3D晶格) | 合成生物学、材料科学、生物技术、生物医学 | NA | 蛋白质工程、AI工具(AlphaFold、RFDiffusion、ProteinMPNN) | NA | NA | NA |
195 | 2025-05-03 |
Using synthetic biology to express nitrogenase biosynthesis pathway in rice and to overcome barriers of nitrogenase instability in plant cytosol
2025-Apr, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2024.12.002
PMID:39818476
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research paper | 该研究通过合成生物学方法将固氮酶生物合成途径引入水稻,以克服植物细胞质中固氮酶不稳定的障碍 | 成功将包含13个基因的固氮酶生物合成途径引入水稻,并发现NifH-S18是导致蛋白降解的关键残基,获得了具有Fe蛋白活性且抵抗植物内切蛋白酶切割的NifH变体 | NifH在水稻细胞质中仍不稳定,需要进一步优化以提高其稳定性 | 通过工程化方法实现谷物中的固氮作用,减少化学氮肥的使用 | 水稻 | 合成生物学 | NA | 多基因载体转化、性杂交、基因组测序分析 | NA | 基因组数据、蛋白质数据 | 转基因水稻品系L12-13和L8-17 |
196 | 2025-05-03 |
Designing with Printed Responsive Biomaterials: A Review
2025-Apr, 3D printing and additive manufacturing
IF:2.3Q3
DOI:10.1089/3dp.2024.0004
PMID:40308656
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review | 本文综述了跨学科领域中用于设计响应性生物材料的增材制造策略,并展望了如何将印刷响应性生物材料(PRBs)融入日常物品和建筑中以增强环境和人类健康 | 探讨了增材制造在生物材料科学、生物材料制造、合成生物学、生物医学工程、生物设计和活体建筑中的最新进展,展示了多感官互动的日常产品和建筑环境的新时代 | NA | 探索如何利用增材制造技术设计和集成响应性生物材料,以提升环境和人类健康 | 响应性生物材料及其在日常生活和建筑中的应用 | 生物材料科学 | NA | 增材制造(AM) | NA | NA | NA |
197 | 2025-05-03 |
Artificial intelligence driven innovations in biochemistry: A review of emerging research frontiers
2025-Mar-07, Biomolecules & biomedicine
DOI:10.17305/bb.2024.11537
PMID:39819459
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综述 | 本文综述了人工智能在生物化学领域的应用及其对研究能力的提升 | 探讨了人工智能在生物化学中的当前及潜在应用,特别是在数据分析、分子建模、酶工程和代谢途径研究方面 | 面临数据质量、模型可解释性和伦理问题等挑战 | 评估人工智能在生物化学领域的应用及其未来潜力 | 生物化学研究中的复杂数据集、分子相互作用、药物发现等 | 生物化学 | NA | 机器学习算法、自然语言处理、基于AI的分子建模 | AlphaFold | 复杂数据集 | NA |
198 | 2025-05-03 |
Mechanisms and applications of bacterial luciferase and its auxiliary enzymes
2025-Mar, Archives of biochemistry and biophysics
IF:3.8Q1
DOI:10.1016/j.abb.2025.110307
PMID:39824239
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review | 本文综述了细菌荧光素酶(LuxAB)及其辅助酶的机制和应用 | 最近的研究阐明了C4a-氢过氧黄素形成的机制,并确定了关键催化残基如His44,这些发现有助于理解光生成过程中重要的黄素中间体的产生 | 仍存在一些挑战性问题,如实现红移发射、优化信号强度以及确定与发光物种生成相关的机制 | 深入了解LuxAB反应的机制,并探索其在生物技术和生物医学领域的应用 | 细菌荧光素酶(LuxAB)及其辅助酶 | 合成生物学 | NA | 蛋白工程、合成生物学 | NA | NA | NA |
199 | 2025-05-03 |
Microbial Production of Ectoine: A Review
2025-Feb-21, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00490
PMID:39834017
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综述 | 本文综述了微生物生产四氢嘧啶(ectoine)的策略,包括野生菌株筛选、突变育种和模型菌株的代谢工程 | 探讨了利用合成生物学和代谢工程技术,通过非嗜盐工程菌株高效生产四氢嘧啶的创新方法 | 未提及具体实验数据或生产规模限制 | 探索更经济高效的四氢嘧啶生产方法以满足市场需求 | 四氢嘧啶及其微生物生产 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、合成生物学 | NA | NA | NA |
200 | 2025-05-03 |
Maize2035: A decadal vision for intelligent maize breeding
2025-Feb-03, Molecular plant
IF:17.1Q1
DOI:10.1016/j.molp.2025.01.012
PMID:39827366
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Perspective paper | 本文概述了玉米育种的历史成功,并探讨了实现可持续农业的全面性状改良方法 | 讨论了前沿解决方案,包括从单细胞分析到全息生物的多组学方法、智能育种与先进技术和算法,以及合成生物学方法的变革潜力 | 未提及具体的技术实施细节或数据支持 | 探讨玉米育种在可持续农业中的未来发展方向 | 玉米 | 农业生物技术 | NA | 多组学方法、智能育种、合成生物学 | NA | NA | NA |