合成生物学相关文章
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当前共找到 3211 篇文献，本页显示第 181 - 200 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 181 | 2025-05-29 |
Synthetic biology toolkit of Ralstonia eutropha (Cupriavidus necator)
2024-Aug-29, Applied microbiology and biotechnology
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s00253-024-13284-2
PMID:39207499
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review | 本文综述了目前可用于改造和增强Ralstonia eutropha生物生产的不同合成生物学技术 | 开发一个合成生物学工具包，赋予Ralstonia eutropha菌株新的能力，用于新颖应用 | NA | 增强Ralstonia eutropha的生物生产能力，用于生产新型生物产品 | Ralstonia eutropha（Cupriavidus necator） | 合成生物学 | NA | 合成生物学技术 | NA | NA | NA |
| 182 | 2025-05-29 |
Enhancing Escherichia coli abiotic stress resistance through ornithine lipid formation
2024-Apr-08, Applied microbiology and biotechnology
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s00253-024-13130-5
PMID:38587638
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研究论文 | 通过工程改造大肠杆菌使其产生鸟氨酸脂质，以增强其对非生物胁迫的抗性 | 首次将鸟氨酸脂质（OLs）的合成能力引入原本不具备此能力的大肠杆菌中，并证明其能增强胁迫抗性和生物量产量 | 研究仅针对特定胁迫条件（如pH变化和磷酸盐限制），未涵盖所有可能的非生物胁迫 | 通过改造大肠杆菌的膜脂组成，构建具有增强非生物胁迫抗性的宿主，用于生物技术和合成生物学应用 | 大肠杆菌（Escherichia coli）及其工程改造菌株 | 合成生物学 | NA | 基因工程（表达合成操纵子olsFC）、转录组分析 | NA | 基因表达数据、生长表型数据 | 多种工程改造的大肠杆菌菌株 |
| 183 | 2025-05-29 |
DNA methylases for site-selective inhibition of type IIS restriction enzyme activity
2024-Jan-25, Applied microbiology and biotechnology
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s00253-024-13015-7
PMID:38270650
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研究论文 | 本研究旨在生产能够体外抑制IIS型限制酶BsaI、BpiI或LguI活性的重组DNA甲基化酶 | 通过克隆和表达来自I型和II型R-M系统的甲基化酶，优化其表达条件，并验证其在体外选择性抑制IIS型限制酶活性的能力 | 研究仅限于体外实验，未涉及体内应用或更复杂的生物系统 | 开发新型分子和合成生物学工具，特别是用于DNA组装技术 | DNA甲基化酶及其对IIS型限制酶活性的抑制作用 | 合成生物学 | NA | 重组DNA技术、蛋白质表达与纯化、DNA甲基化分析 | NA | NA | 十种来自I型和II型R-M系统的甲基化酶 |
| 184 | 2025-05-28 |
Microfluidics-driven templating preparation of polymer vesicles with tailorable dimensions and rapid cellular internalization
2025-May-27, Biomaterials science
IF:5.8Q1
DOI:10.1039/d5bm00377f
PMID:40237355
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研究论文 | 本文提出了一种基于微流控技术的聚合物囊泡制备方法，实现了对囊泡尺寸的可控调节和快速细胞摄取 | 首次报道了微球模板策略，结合微流控精确控制和嵌段共聚物自组装，克服了传统方法的限制 | NA | 开发一种可控尺寸和快速细胞摄取的聚合物囊泡制备方法 | 聚合物囊泡 | 纳米技术 | NA | 微流控技术 | NA | NA | NA |
| 185 | 2025-05-28 |
Ponceau S as a Targeted Modulator for Protein Liquid-Liquid Phase Separation
2025-May-27, Analytical chemistry
IF:6.7Q1
DOI:10.1021/acs.analchem.4c06432
PMID:40353860
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研究论文 | 本研究介绍了Ponceau S作为一种选择性调节剂，用于诱导和监测蛋白质的液-液相分离（LLPS） | 首次提出Ponceau S作为小分子调节剂，能够精确调控蛋白质的液-液相分离，并通过其荧光特性监测相分离过程 | 研究仅针对牛血清白蛋白和溶菌酶两种蛋白质，未验证其在更广泛蛋白质体系中的适用性 | 探索小分子对蛋白质液-液相分离的精确调控方法 | 牛血清白蛋白和溶菌酶 | 生物分子工程 | NA | 荧光监测技术 | NA | 实验数据 | 两种蛋白质（牛血清白蛋白和溶菌酶） |
| 186 | 2025-05-28 |
Mitigating Uricase Immunogenicity through Zwitterionic Peptide Fusion for Enhanced Gout Therapy
2025-May-27, Langmuir : the ACS journal of surfaces and colloids
IF:3.7Q2
DOI:10.1021/acs.langmuir.5c00829
PMID:40374583
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研究论文 | 通过合成生物学方法将两性离子肽与尿酸氧化酶融合，降低其免疫原性，从而增强痛风治疗效果 | 利用不同长度的两性离子肽（重复VPKEG序列）融合尿酸氧化酶，显著降低其免疫原性，并提高酶活性、底物亲和力及血液循环时间 | 研究仅在大鼠痛风模型中进行验证，尚未进行人体临床试验 | 开发低免疫原性的尿酸氧化酶以增强痛风治疗效果 | 尿酸氧化酶及两性离子肽融合蛋白 | 合成生物学 | 痛风 | 合成生物学 | NA | NA | 大鼠痛风模型 |
| 187 | 2025-05-28 |
Engineering a Biosynthetic Pathway for the Production of (+)-Brevianamides A and B in Escherichia coli
2024-Dec-12, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.12.10.627567
PMID:39713314
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研究论文 | 该研究设计了一种在大肠杆菌中生产(+)-brevianamides A和B的生物合成途径 | 结合合成生物学、生物催化和合成化学方法，设计了一个五步工程生物合成途径，用于生产复杂的吲哚生物碱 | NA | 简化对含有BDO核心的二酮哌嗪天然产物的获取途径 | 大肠杆菌 | 合成生物学 | NA | 生物合成途径工程 | NA | NA | NA |
| 188 | 2025-05-27 |
Research progress and development prospects of microbial synthesis of ergothioneine
2025-May-26, World journal of microbiology & biotechnology
IF:4.0Q2
DOI:10.1007/s11274-025-04415-6
PMID:40415044
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综述 | 本文综述了麦角硫因的微生物合成研究进展与发展前景 | 系统梳理了麦角硫因的应用、代谢途径、微生物合成策略及发酵优化方法，并展望了未来研究方向与技术挑战 | 未涉及具体实验数据或案例分析 | 提高麦角硫因的生物合成效率以满足市场需求 | 麦角硫因及其微生物合成 | 合成生物学 | NA | 基因工程与发酵工艺优化 | NA | 文献资料 | NA |
| 189 | 2025-05-27 |
Regulatory helix plays a key role in genetic ON-OFF switching for the 2'-deoxyguanosine sensing mRNA element
2025-May-22, The Journal of biological chemistry
IF:4.0Q2
DOI:10.1016/j.jbc.2025.110282
PMID:40412519
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研究论文 | 本文研究了2'-脱氧鸟苷（2'-dG）感应mRNA元素的遗传开关机制，揭示了调控螺旋在转录调控中的关键作用 | 发现dGsw-int转录中间体在无配体时形成稳定的抗终止螺旋（ON状态），而在2'-dG存在时该螺旋解离（OFF状态），提出代谢物感应发生在两个转录中间体合成的短暂时间窗口 | 研究主要基于体外化学探测和荧光淬灭实验，未涉及体内复杂环境验证 | 阐明2'-dG感应核糖开关的精细调控机制及其在转录过程中的动态变化 | 2'-脱氧鸟苷感应核糖开关（dGsw）及其转录中间体（dGsw-fl和dGsw-int） | 分子生物学 | NA | 化学探测技术、荧光淬灭实验 | NA | 生物化学数据 | NA |
| 190 | 2025-05-27 |
Digital switching in a biosensor circuit via programmable timing of gene availability
2014-Dec, Nature chemical biology
IF:12.9Q1
DOI:10.1038/nchembio.1680
PMID:25306443
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研究论文 | 该研究展示了通过编程控制基因可用时间，利用位点特异性重组酶纠正多基因电路中的不良效应，显著提高了传感器的动态范围和特异性 | 通过编程控制基因可用时间，利用位点特异性重组酶纠正多基因电路中的不良效应，显著提高了传感器的动态范围和特异性 | NA | 提高合成生物学中基因电路的稳健性和性能 | 内源性microRNA (miRNA)的比例传感器 | 合成生物学 | NA | 位点特异性重组酶 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 191 | 2025-05-26 |
Development of Dipeptide-Based Liquid Droplets and Fibrils as Enzyme-Mimics
2025-May-24, Small (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/smll.202503916
PMID:40411841
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research paper | 开发了一种基于二肽的液滴和纤维作为酶模拟物 | 设计了一种简单的二肽，能够自凝聚成微米级液滴，并可作为微反应器用于疏水反应物，同时在不同pH值下形成纤维状组装体，作为高效的酯酶模拟催化剂 | NA | 探索最小化设计的超分子催化剂在酶学和合成生物学中的应用 | 二肽自凝聚形成的液滴和纤维 | synthetic biology | NA | liquid-liquid phase separation (LLPS) | NA | NA | NA |
| 192 | 2025-05-26 |
Transcription regulation by RNA-induced structural strain in duplex DNA
2025-May-22, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf429
PMID:40401557
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研究论文 | 本文描述了一种通过RNA-DNA三链体调节转录速率的机制，并在大肠杆菌启动子设计的架构中验证了其能力 | 揭示了RNA-DNA三链体通过扭曲双链DNA结构来增强或抑制转录的新机制 | 实验证据仍缺乏在更复杂生物（如哺乳动物）中的验证 | 探究非编码RNA通过形成三链体结构调控基因表达的分子机制 | 大肠杆菌启动子及其与RNA-DNA三链体的相互作用 | 分子生物学 | NA | 合成生物学方法、体外表征 | NA | NA | NA |
| 193 | 2025-05-26 |
Expanding the σ54-dependent transcription process with orthogonal designs
2025-May-22, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf442
PMID:40401558
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研究论文 | 本研究通过基于知识的筛选和重新设计σ54的RpoN盒及其配对启动子，开发了三组基于σ54-R456H、R456Y和R456L的正交表达系统 | 开发了三组具有不同启动子偏好和理想相互正交性的σ54正交表达系统，并证明其在三种非模式细菌中的特异性转录能力 | NA | 扩展合成生物学工具包，提供可靠且多样化的基因表达 | σ54依赖性转录过程 | 合成生物学 | NA | 知识筛选和重新设计 | NA | NA | 三种非模式细菌 |
| 194 | 2025-05-26 |
Assembly of ascovirus HvAV-3h long DNA fragment using the Transformation-Associated Recombination (TAR) approach in yeast cells
2025-May-22, BMC biotechnology
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12896-025-00964-8
PMID:40405135
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研究论文 | 本研究利用酵母细胞中的转化相关重组（TAR）方法，成功组装了来自昆虫病毒HvAV-3h的长DNA片段 | 首次将TAR方法应用于昆虫病毒长DNA片段的组装，为基因组工程研究提供了新思路 | 研究中发现了初始合成时存在的突变和缺失，可能影响组装片段的准确性 | 探索TAR方法在昆虫病毒基因组工程研究中的适用性 | Heliothesis virescens ascovirus 3h (HvAV-3h) dsDNA基因组 | 合成生物学 | NA | TAR, PCR, NGS | NA | DNA序列数据 | 15个约2.9-3.2 Kb的DNA片段组装成44.6 Kb长片段 |
| 195 | 2025-05-25 |
Mapping the Edges of Mass Spectral Prediction: Evaluation of Machine Learning EIMS Prediction for Xeno Amino Acids
2025-May-20, Analytical chemistry
IF:6.7Q1
DOI:10.1021/acs.analchem.5c00286
PMID:40329886
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research paper | 评估NEIMS质谱预测算法在单取代α-氨基酸上的准确性，以改进未知生物分子检测 | 首次评估NEIMS算法对超出训练数据的氨基酸的预测准确性，并指出其不足 | 预测光谱对于超出算法训练数据的氨基酸不准确，且无法通过物理化学差异或氨基酸衍生化状态解释这些不准确性 | 改进质谱预测算法，以扩展数据库覆盖范围，包括理论分子 | 单取代α-氨基酸 | machine learning | NA | mass spectrometry | NEIMS | mass spectral data | NA |
| 196 | 2025-05-25 |
Genetic encoding and expression of RNA origami cytoskeletons in synthetic cells
2025-May, Nature nanotechnology
IF:38.1Q1
DOI:10.1038/s41565-025-01879-3
PMID:40097648
|
研究论文 | 本文介绍了RNA折纸细胞骨架模拟物作为合成细胞的核酸分子硬件，并展示了其在巨型单层脂质囊泡中的表达和应用 | 首次将RNA折纸技术应用于合成细胞的细胞骨架构建，实现了在等温条件下由DNA模板直接表达和自组装RNA折纸纳米管 | 研究仅局限于体外合成细胞系统，尚未在真实细胞环境中验证其功能 | 开发基于RNA的合成细胞分子硬件 | RNA折纸纳米管和合成细胞 | 合成生物学 | NA | RNA折纸技术、分子动力学模拟 | NA | 分子结构数据 | NA |
| 197 | 2025-05-25 |
Direct Quantification of Protein-Protein Interactions in Living Bacterial Cells
2025-May, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202414777
PMID:40125621
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研究论文 | 该文章介绍了一种名为KD-FRET的方法，用于在活细菌细胞中定量测量蛋白质-蛋白质相互作用（PPIs）的解离常数（K） | 开发了KD-FRET方法，能够在活细菌细胞中直接定量测量PPIs，克服了体外测量中的假阳性信号问题，并能够测量在标准缓冲条件下不稳定的相互作用对 | 未明确提及方法的局限性，但可能包括荧光共振能量转移（FRET）技术本身的技术限制 | 开发一种在活细胞中直接定量测量蛋白质-蛋白质相互作用的方法，以促进合成生物学、蛋白质工程和药物发现 | 活细菌细胞（E. coli和S. cerevisiae）中的蛋白质-蛋白质相互作用 | 合成生物学 | NA | 荧光共振能量转移（FRET） | NA | 荧光信号数据 | 未明确提及具体样本数量，但涉及E. coli和S. cerevisiae中的蛋白质相互作用对 |
| 198 | 2025-05-25 |
ProteoSeeker: A Feature-Rich Metagenomic Analysis Tool for Accessible and Comprehensive Metagenomic Exploration
2025-May, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202414877
PMID:40130725
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研究论文 | 介绍了一个名为ProteoSeeker的命令行工具，用于简化宏基因组蛋白质的识别和注释 | 开发了一个自动化工具ProteoSeeker，用于高效识别和注释宏基因组中的蛋白质，支持用户自定义蛋白质家族筛选和宿主生物分类学分析 | 未提及具体的性能对比或与其他工具的基准测试结果 | 加速生物技术、合成生物学和生物医学研究与创新 | 宏基因组中的蛋白质 | 生物信息学 | NA | 宏基因组分析 | NA | 宏基因组数据 | NA |
| 199 | 2025-05-24 |
Microbiome catalog and dynamics of the Chinese liquor fermentation process
2025-Sep, Bioresource technology
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.biortech.2025.132620
PMID:40334798
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研究论文 | 该研究构建了中国白酒发酵过程中的微生物基因目录（MTFGC），揭示了发酵食品的独特性和高代谢潜力 | 建立了最大的发酵食品遗传资源库，发现了20%的新物种和基因，并验证了BGCs在合成香气相关脂肽中的作用 | 研究主要聚焦于中国白酒发酵过程，可能不适用于其他类型的发酵食品 | 揭示发酵食品中微生物的多样性和代谢潜力，推动传统发酵向精准合成生物学的转变 | 中国白酒发酵过程中的微生物群落 | 合成生物学 | NA | 宏基因组组装 | NA | 宏基因组数据 | 5,159个宏基因组组装基因组（MAGs） |
| 200 | 2025-05-24 |
Engineering Bacillus Spores to Display Nicotine Oxidase: In Situ Specific and Sensitive Nicotine Detection
2025-05-23, ACS sensors
IF:8.2Q1
DOI:10.1021/acssensors.5c00275
PMID:40329593
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research paper | 本研究开发了一种新型的活体电化学生物传感器，用于高灵敏度和实时检测尼古丁 | 通过合成生物学和材料工程的结合，开发了具有增强活性和热稳定性的基因工程NOX突变体，并将其展示在孢子表面，结合FeSe@MHCS复合电极，实现了超低检测限和出色的稳定性 | NA | 开发一种高灵敏度和实时检测尼古丁的方法 | 尼古丁 | 生物传感器 | NA | 电化学阻抗谱(EIS), 差分脉冲伏安法(DPV) | NA | 电化学数据 | 血液和尿液样本 |