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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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181 | 2025-05-04 |
Towards microbial consortia in fermented foods for metabolic engineering and synthetic biology
2025-Feb, Food research international (Ottawa, Ont.)
DOI:10.1016/j.foodres.2025.115677
PMID:39849795
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综述 | 本文综述了发酵食品中微生物群落的相互作用机制及其功能,并探讨了利用新型发酵剂与本地微生物群落结合开发功能性发酵食品的未来发展方向 | 总结了发酵食品中微生物相互作用的当前机制(拮抗、竞争、共生和互惠),并探讨了将这些稳定的微生物群落应用于代谢工程和合成生物学的潜力 | 未提及具体实验数据或案例研究来支持微生物相互作用机制的具体应用 | 探讨发酵食品中微生物群落的相互作用机制及其在代谢工程和合成生物学中的应用 | 发酵食品中的微生物群落 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
182 | 2025-05-04 |
Engineering the future of medicine: Natural products, synthetic biology and artificial intelligence for next-generation therapeutics
2025-Feb, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.70146
PMID:39856487
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research paper | 探讨利用天然产物、合成生物学和人工智能开发下一代治疗方法 | 结合eXchange Unit between Thiolation domains方法和AI工具如Synthetic Intelligence,革新非核糖体肽合成酶和聚酮合酶工程,创造新型生物活性化合物 | 未提及具体实验数据或临床验证结果 | 应对抗生素耐药性和癌症等关键挑战,开发精确且可扩展的治疗方案 | 非核糖体肽合成酶和聚酮合酶工程 | 合成生物学与人工智能 | 抗生素耐药性和癌症 | eXchange Unit between Thiolation domains方法,AI工具 | Synthetic Intelligence | NA | NA |
183 | 2025-05-04 |
[Research progress in the design and application of whole-cell biosensors for antibiotics]
2025-Jan-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.240400
PMID:39855682
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综述 | 本文综述了抗生素全细胞生物传感器的设计和应用研究进展 | 总结了已报道的抗生素全细胞生物传感器,并将其分为特异性和通用性两类,详细阐述了两类抗生素生物传感器的设计原理和应用 | NA | 为其他抗生素全细胞生物传感器的构建和应用提供参考 | 抗生素全细胞生物传感器 | 合成生物学 | NA | 全细胞生物传感器 | NA | NA | NA |
184 | 2025-05-04 |
[Effects of exogenous additives on growth and high-value bioproducts accumulation of microalgae]
2025-Jan-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.240335
PMID:39855687
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review | 综述了外源添加剂对微藻生长及高价值生物产物积累的影响 | 对外源添加剂的类型、应用、目标菌株及分子机制进行了分类和总结 | 对外源添加剂的分类和总结不够全面 | 提高微藻高价值生物产物的生产效率 | 微藻 | 合成生物学 | NA | 外源添加剂调控 | NA | NA | NA |
185 | 2025-05-04 |
[Regulatory roles of DGAT and PDAT genes in plant oil synthesis]
2025-Jan-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.240376
PMID:39855689
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综述 | 本文全面综述了DGAT和PDAT基因在植物油脂合成中的生物学功能、分子机制及其在合成生物学背景下的应用 | 深入探讨DGAT和PDAT基因在植物油脂合成中的调控机制及其在合成生物学中的应用前景 | 未提及具体实验数据或案例研究 | 深入理解植物油脂合成的分子机制并提高油料作物的质量和产量 | DGAT和PDAT基因 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
186 | 2025-05-04 |
[Enzymatic MBH reaction catalyzed by an artificial enzyme designed with the introduction of an unnatural tertiary amine cofactor]
2025-Jan-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.240223
PMID:39855701
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研究论文 | 本文报道了一种通过引入非天然辅因子构建的人工酶,成功催化了不对称Morita-Baylis-Hillman (MBH)反应 | 通过引入4-二甲氨基吡啶(DMAP)辅因子作为催化中心,构建了一种新型人工酶,并成功催化了非天然的MBH反应 | 未提及具体的局限性 | 开发新型人工酶,为合成生物学提供丰富的工具箱 | 人工酶及其催化性能 | 合成生物学 | NA | 点击化学策略 | NA | NA | NA |
187 | 2025-05-04 |
[An efficient assembly method for a viral genome based on T7 endonuclease Ⅰ-mediated error correction]
2025-Jan-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.240302
PMID:39855702
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研究论文 | 本研究开发了一种基于T7内切酶Ⅰ介导的纠错方法,用于高效组装约10 kb的病毒基因组 | 通过合理设计寡核苷酸序列、两步PCR和高保真聚合酶合成3.0 kb DNA片段,并利用T7内切酶Ⅰ进行纠错,显著降低了错误率并简化了合成步骤 | NA | 优化基因合成过程,降低错误率并简化病毒基因组的合成与组装步骤 | 约10 kb的病毒基因组 | 合成生物学 | NA | T7内切酶Ⅰ介导的纠错、两步PCR、高保真聚合酶 | NA | DNA序列 | 约10 kb的病毒基因组 |
188 | 2025-05-04 |
Recent advances in engineering non-native microorganisms for poly(3-hydroxybutyrate) production
2025-Jan-24, World journal of microbiology & biotechnology
IF:4.0Q2
DOI:10.1007/s11274-025-04261-6
PMID:39849243
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综述 | 本文综述了非天然微生物在聚(3-羟基丁酸酯)(PHB)生产中的工程化进展 | 总结了代谢工程和合成生物学在非天然微生物中生产PHB的最新策略,包括CRISPR/Cas9基因编辑技术的应用 | 需要进一步的基因工程方法使非天然微生物更适合大规模PHB生产 | 探讨非天然微生物作为PHB生产宿主的潜力和优化策略 | 非天然微生物,特别是大肠杆菌 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、CRISPR/Cas9 | NA | NA | NA |
189 | 2025-05-04 |
Cell-free expression and SMA copolymer encapsulation of a functional receptor tyrosine kinase disease variant, FGFR3-TACC3
2025-Jan-23, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-86194-6
PMID:39848978
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研究论文 | 本研究通过无细胞蛋白表达系统成功表达了功能性的FGFR3-TACC3融合蛋白,并利用SMA共聚物进行重构 | 首次使用无细胞蛋白表达系统在48小时内成功表达功能性FGFR3-TACC3融合蛋白,并证明其具有显著的激酶结构域磷酸化活性 | 目前尚未获得任何全长RTK的高分辨率结构 | 解决跨膜蛋白特别是受体酪氨酸激酶融合蛋白的表达难题 | FGFR3-TACC3融合蛋白 | 合成生物学 | 癌症 | 无细胞蛋白表达(CFPE), SMA共聚物重构 | NA | 蛋白功能数据 | 表达产量为300 µg/mL裂解液 |
190 | 2025-05-04 |
Optimal network sizes for most robust Turing patterns
2025-Jan-23, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-86854-7
PMID:39849094
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research paper | 该研究通过随机矩阵理论分析大型网络的雅可比矩阵,揭示了图灵模式在生物系统中出现的可能性及其最优网络规模 | 使用随机矩阵理论分析大型网络的统计特性,发现图灵模式的出现概率高于预期,并确定了最优网络规模 | 研究主要基于理论分析,未涉及具体生物实验验证 | 探讨图灵不稳定性在生物模式形成中的作用及其网络规模的影响 | 基因调控网络中的图灵模式 | systems biology | NA | random matrix theory | NA | theoretical analysis | NA |
191 | 2025-05-04 |
BAC-browser: the tool for synthetic biology
2025-Jan-23, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-025-06049-9
PMID:39849360
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研究论文 | 介绍了一个名为BAC-browser v.2.1的图形界面程序,用于合成基因组学中的序列设计和DNA组装 | 开发了一个集成了多种工具的图形界面程序,使非生物信息学背景的研究者也能进行合成基因组学的任务 | 未提及程序的性能评估或与其他工具的对比 | 为合成基因组学领域提供易用的软件工具 | 合成基因组学中的序列设计和DNA组装 | 合成生物学 | NA | DNA序列设计和组装 | NA | 核苷酸序列 | NA |
192 | 2025-05-04 |
Physiology-informed use of Cupriavidus necator in biomanufacturing: a review of advances and challenges
2025-Jan-22, Microbial cell factories
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s12934-025-02643-x
PMID:39844200
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综述 | 本文综述了在生物制造中利用Cupriavidus necator的生理学进展与挑战 | 讨论了C. necator作为生物制造底盘的最新进展,特别是在利用二氧化碳和氢气或甲酸盐作为碳和能源来源方面的应用 | 现有工具和应用常因未充分考虑C. necator独特的生理和代谢特征而受限 | 探讨如何更好地理解和利用C. necator的生理机制以优化其在生物制造中的应用 | Cupriavidus necator细菌及其在生物制造中的应用 | 生物制造 | NA | 合成生物学工具和建模 | NA | NA | NA |
193 | 2025-05-04 |
Development of a Komagataella phaffii cell factory for sustainable production of ( +)-valencene
2025-Jan-21, Microbial cell factories
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s12934-025-02649-5
PMID:39838465
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研究论文 | 本研究开发了一种利用Komagataella phaffii细胞工厂可持续生产(+)-valencene的方法 | 首次在K. phaffii中通过CRISPR/Cas9系统引入(+)-valencene合成酶,并通过多种优化策略显著提高了产量 | 研究仅在摇瓶水平进行验证,尚未进行大规模发酵生产测试 | 开发可持续生产(+)-valencene的微生物细胞工厂 | Komagataella phaffii微生物细胞 | 合成生物学 | NA | CRISPR/Cas9基因编辑技术 | NA | NA | NA |
194 | 2025-05-04 |
Recent trends and advances in chloroplast engineering and transformation methods
2025, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2025.1526578
PMID:40313723
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综述 | 本文综述了叶绿体工程和转化方法的最新趋势和进展 | 讨论了合成生物学在叶绿体工程中的应用以及现代转化载体的构建要素 | 该技术目前主要局限于学术实验室的模式物种,尚未商业化 | 提高作物产量、营养品质、抗逆性以及工业酶和治疗蛋白的生产 | 叶绿体基因组和转基因植物 | 合成生物学 | NA | 叶绿体转化技术 | NA | NA | NA |
195 | 2025-05-04 |
Enhancing the physiological characteristics of chimeric antigen receptor natural killer cells by synthetic biology
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1592121
PMID:40313937
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review | 探讨合成生物学在增强嵌合抗原受体自然杀伤细胞(CAR-NK)生理特性方面的最新进展 | 通过合成生物学工具包与NK细胞的协同作用,为开发下一代CAR-NK疗法提供路线图 | 临床转化仍受限于在免疫抑制性肿瘤微环境中的持久性和功能耗竭问题 | 提升CAR-NK细胞的生理特性以应对实体瘤挑战 | 嵌合抗原受体自然杀伤细胞(CAR-NK) | 合成生物学 | 实体瘤 | 合成生物学工具包 | NA | NA | NA |
196 | 2025-05-03 |
Machine learning reveals novel compound for the improved production of chitooligosaccharides in Escherichia coli
2025-May-25, New biotechnology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.nbt.2025.01.005
PMID:39827984
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研究论文 | 利用机器学习模型和特征重要性分析改进大肠杆菌中壳寡糖的生产 | 通过机器学习模型和特征重要性分析发现铁元素可以显著提高壳寡糖的生产效率 | 工程步骤可能无法带来足够的改进,且代谢反应中的瓶颈可能仍被隐藏 | 提高壳寡糖的生产效率和预测性 | 大肠杆菌中的壳寡糖生产途径 | 合成生物学 | NA | 机器学习 | NA | 代谢数据 | 大肠杆菌工程转录调节因子库 |
197 | 2025-05-03 |
Addressing semantic ambiguity in biotechnology: Proposals from the European research infrastructure IBISBA
2025-Apr-24, New biotechnology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.nbt.2025.04.010
PMID:40280273
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讨论论文 | 本文探讨了生物技术领域的语义模糊问题,并提出了统一核心术语定义的建议 | 分析了生物技术领域术语定义的混乱现状,并提出了术语标准化的必要性 | 仅提出了问题而未提供具体的术语定义解决方案 | 促进生物技术领域术语定义的标准化,以支持有效的政策制定和科学传播 | 生物技术领域的核心术语(如biotechnology, biomanufacturing等) | 生物技术 | NA | NA | NA | 文本 | NA |
198 | 2025-05-03 |
Creating a Halotolerant Degrader for Efficient Mineralization of p-Nitrophenol-Substituted Organophosphorus Pesticides in High-Saline Wastewater
2025-Apr, Biotechnology and bioengineering
IF:3.5Q2
DOI:10.1002/bit.28923
PMID:39821562
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研究论文 | 本研究通过合成生物学方法创建了一种耐盐降解菌J9U-MP,用于高效矿化高盐废水中的对硝基酚取代有机磷农药 | 首次将包含七个基因的异源生物降解途径与耐盐底盘菌Halomonas cupida J9结合,创建了能在高盐和低氧环境下高效降解有机磷农药的工程菌J9U-MP | 研究仅针对特定类型的有机磷农药(对硝基酚取代的有机磷农药)进行测试,未涉及其他类型污染物 | 开发能在高盐废水中高效降解有机磷农药的生物修复技术 | 对硝基酚取代的有机磷农药(如甲基对硫磷)及其降解中间产物 | 合成生物学 | NA | 基因工程、RT-PCR、气相色谱分析、稳定同位素分析 | NA | 生物化学数据 | 工程菌J9U-MP在含60g/L NaCl的废水中对50mg/L甲基对硫磷及其降解产物的降解实验 |
199 | 2025-05-03 |
Next-generation metabolic models informed by biomolecular simulations
2025-Apr, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2025.103259
PMID:39827498
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research paper | 该文章探讨了如何将生物分子模拟与代谢模型相结合,以推动结构引导的合成生物学应用 | 提出了将生物分子模拟和机器学习预测整合到代谢模型中的新方法,以优化和理解代谢途径 | 尚未具体说明生物分子模拟与代谢模型整合的实际应用效果和具体案例 | 优化和理解代谢途径,以改善蛋白质和小分子产品的生物生产 | 从微生物到人类的细胞代谢 | 合成生物学 | NA | 生物分子模拟, 机器学习 | flux balance analysis, dynamic, kinetic delineations | 代谢网络数据 | NA |
200 | 2025-05-03 |
Advances in designed bionanomolecular assemblies for biotechnological and biomedical applications
2025-Apr, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2024.103256
PMID:39827499
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综述 | 本文综述了蛋白质工程在生物纳米分子组装设计方面的最新进展及其在生物技术和生物医学中的应用 | 结合AI工具(如AlphaFold、RFDiffusion和ProteinMPNN)显著提高了从头设计的可扩展性和成功率 | NA | 探讨蛋白质工程在设计和应用生物纳米分子组装方面的潜力 | 有限组装(如纳米笼和基于卷曲螺旋的结构)和扩展组装(如细丝和2D/3D晶格) | 合成生物学、材料科学、生物技术、生物医学 | NA | 蛋白质工程、AI工具(AlphaFold、RFDiffusion、ProteinMPNN) | NA | NA | NA |