合成生物学相关文章
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当前共找到 5211 篇文献，本页显示第 181 - 200 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 181 | 2026-06-14 |
Deep Learning-Guided Reverse Translation Enhances Soluble Expression of Recombinant Proteins in Escherichia coli
2026-Jun-05, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms27115131
PMID:42278656
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研究论文 | 开发了一个结合同义密码子生成模型和基因表达水平预测模型的深度学习框架，用于提高重组蛋白在大肠杆菌中的可溶性表达 | 提出了一种核心回避密码子优化策略，通过深度学习引导的反向翻译显著提升异源蛋白的可溶性表达 | NA | 设计DNA序列以保证高可溶性表达，并理解DNA序列与蛋白质表达之间的关系 | α-葡聚糖磷酸化酶和异淀粉酶两种工业酶 | 机器学习 | NA | 深度学习、基因表达预测 | SCG模型、GELP模型 | 基因组数据、基因表达数据 | 两种酶各进行多次实验（αGP 3次，IA 4次） | NA | 大肠杆菌 | NA | 工业生物技术 |
| 182 | 2026-06-14 |
The Promise of Synthetic Biology for Redesigning Plant Architecture
2026-May-28, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms27114876
PMID:42278408
|
综述 | 探讨利用合成生物学重新设计植物结构以实现作物改良的潜力 | 整合自然多样性、发育生物学和合成调控工程，提出理性重新设计植物结构的框架，强调合成生物学与育种及建模框架的整合 | NA | 探索通过合成生物学重塑植物结构以增强作物适应气候变化的能力 | 植物结构及相关发育过程 | 合成生物学 | NA | CRISPR-based regulatory systems, synthetic gene circuits, orthogonal signalling pathways, plant artificial chromosomes | NA | NA | NA | CRISPR, 人工染色体 | 植物（作物） | 可编程转录因子、合成基因电路、正交信号通路 | 农业 |
| 183 | 2026-06-13 |
Growth factor applications and clinical translation: advances and challenges
2026-12, Annals of medicine
IF:4.9Q1
DOI:10.1080/07853890.2026.2642893
PMID:41837883
|
综述 | 系统梳理生长因子在再生医学、肿瘤学及代谢调控领域的应用进展与临床转化挑战 | 综合分析了生长因子临床转化的多重瓶颈（药代动力学缺陷、脱靶效应、安全性问题），并系统总结了蛋白工程优化、智能响应递送系统（如细胞外囊泡平台）及多因子时序释放技术等解决方案 | 高通量大规模生产工艺成本高、体内微环境复杂性限制转化广度，未来需聚焦可扩展递送平台开发及合成生物学降本 | 为加速下一代生长因子疗法开发提供路线图和技术参考 | 生长因子在神经退行性疾病、骨再生、代谢紊乱中的临床应用案例 | 数字病理学 | 神经退行性疾病, 骨再生, 代谢紊乱 | 蛋白工程, 化学修饰, 智能响应递送系统, 细胞外囊泡平台, 多因子时序释放技术 | NA | 文献数据 | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 184 | 2026-06-13 |
Engineering of β-glucosidase for rare ginsenoside biosynthesis via distal conformational fine-tuning and sequential degradation control
2026-Oct, Bioresource technology
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.biortech.2026.134967
PMID:42184941
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研究论文 | 通过计算重设计β-葡萄糖苷酶实现稀有人参皂苷F的高水平生物制造 | 发现远端突变通过长程别构效应重塑活性位点，将底物结合转变为精确的“分子镊子”模式，并揭示顺序降解机制控制区域选择性 | 未提及临床或体内验证，且仅针对单一突变体组合进行详细分析 | 实现稀有人参皂苷F的高效生物合成并建立通用酶工程框架 | β-葡萄糖苷酶BglPp及其突变体 | 合成生物学 | NA | 计算重设计、定点突变、生物催化、发酵工程 | NA | 蛋白质序列、突变体活性和结构数据 | 5升生物反应器中的一个工程菌株 | NA | 大肠杆菌（推测） | 稀有人参皂苷F的生物合成途径（通过β-葡萄糖苷酶降解人参皂苷Rb1） | 工业生物技术、医药 |
| 185 | 2026-06-04 |
Heterologous expression of anaerobic reductive dehalogenases: host nanoarchitectonics and synthetic biology optimization
2026-Oct, Bioresource technology
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.biortech.2026.135019
PMID:42217801
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综述 | 综述了异源表达厌氧还原脱卤酶的研究进展，提出了宿主纳米结构与合成生物学优化策略 | 提出了宿主-酶-环境评估框架，强调辅因子供应、应激耐受性和环境适应性在异源表达中的关键作用 | 当前异源表达面临外源钴胺素依赖性和氧化折叠路径等挑战，且新宿主系统尚未充分开发 | 克服有机卤化物呼吸细菌在生物修复应用中的生长缓慢、氧敏感性和底物特异性限制 | 还原脱卤酶及其在异源宿主（如大肠杆菌和巨大芽孢杆菌）中的表达系统 | 合成生物学 | NA | 异源表达、钴胺素补救系统 | NA | NA | NA | NA | 大肠杆菌、巨大芽孢杆菌 | NA | 环境修复、工业生物技术 |
| 186 | 2026-06-13 |
Opportunities for artificial intelligence and synthetic biology in designing living drug delivery systems
2026-Aug, Advanced drug delivery reviews
IF:15.2Q1
DOI:10.1016/j.addr.2026.115883
PMID:42055250
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综述 | 本文综述了人工智能和合成生物学在工程化人类细胞和细菌作为活体药物递送系统中的应用 | 首次系统探讨AI和合成生物学协同设计下一代活体药物递送系统，重点揭示序列到功能和组成到功能的设计原理 | 未提供具体实验数据验证所讨论技术的有效性，可能缺乏对实际应用挑战的深入分析 | 探讨人工智能和合成生物学在工程化活体药物递送系统中的机遇 | 人类细胞和细菌作为活体药物递送载体 | 合成生物学，人工智能 | NA | 合成生物学，人工智能模型 | NA | NA | NA | 合成生物学工具 | 人类细胞，细菌 | 合成受体，信号处理网络，基因回路 | 医学 |
| 187 | 2026-06-13 |
Engineering microbial cell factories for succinic acid biomanufacturing: Challenges and perspectives
2026 Jul-Aug, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.108861
PMID:41791685
|
综述 | 系统评估微生物细胞工厂用于琥珀酸生物制造的挑战与前景 | 整合系统生物学、代谢建模和过程工程的多学科视角，提出提升碳通量优化、氧化还原平衡和工业规模的战略性框架 | 未提供具体实验数据，可能缺乏对某些新兴技术的深入讨论 | 为设计高效微生物细胞工厂和加速生物基琥珀酸商业化提供战略框架 | 微生物平台（包括细菌和酵母） | 合成生物学 | NA | 合成生物学、代谢建模 | NA | NA | NA | 合成生物学工具 | 细菌, 酵母 | 天然和异源生物合成途径 | 工业生物技术 |
| 188 | 2026-06-13 |
Bacterial compartments and biological condensates as nanoreactors for biocatalysis
2026-Jun-10, Advances in colloid and interface science
IF:15.9Q1
DOI:10.1016/j.cis.2026.103972
PMID:42276006
|
综述 | 本文综述了工程化细菌区室和生物凝聚体作为纳米反应器用于生物催化的研究进展 | 提出了利用自组装多酶系统（细菌区室和生物凝聚体）作为新一代生物催化剂，促进可持续有机合成与合成生物学的交叉融合 | 仅概述了现有研究，未提供实验数据或定量比较不同系统的性能 | 探索工程化细菌区室和生物凝聚体在多酶生物催化中的应用潜力 | 工程化细菌区室和生物凝聚体等自组装多酶系统 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 细菌 | 细菌区室和生物凝聚体作为纳米反应器 | 可持续化学, 有机合成 |
| 189 | 2026-06-13 |
Recent developments in intein-mediated protein splicing and their applications in bioengineering
2026-Jun-09, Current protein & peptide science
IF:1.9Q4
|
综述 | 综述内含子介导的蛋白质剪接最新进展及其在生物工程中的应用 | 系统总结了内含子在结构多样性、催化机制和可控性方面的工程化改进，以及条件型内含子在合成生物学中的新兴应用，并指出了计算设计、高通量筛选和人工智能整合的未来方向 | 仍存在剪接不完全、外显子兼容性问题以及上下文依赖效率等限制其广泛应用的挑战 | 全面概述内含子生物学、分类和机制，并讨论其在生物技术和生物医学中的应用进展、挑战与未来机遇 | 内含子及其工程化变体 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 内含子工程改造 | NA | 条件型内含子、蛋白质剪接系统 | 生物技术、生物医学 |
| 190 | 2026-06-13 |
Engineering peroxisomal cofactor systems in Saccharomyces cerevisiae for enhanced biosynthesis of α-humulene
2026-Jun-08, World journal of microbiology & biotechnology
IF:4.0Q2
DOI:10.1007/s11274-026-05060-3
PMID:42257761
|
研究论文 | 通过工程化改造酿酒酵母的过氧化物酶体辅因子系统，实现α-葎草烯的高效生物合成 | 首次系统性地工程化过氧化物酶体的辅因子平衡，结合细胞质-过氧化物酶体双区室工程策略，显著提高α-葎草烯产量 | 未提及在大规模发酵或工业环境下的稳定性和成本效益 | 在酿酒酵母中实现α-葎草烯的高效生物合成 | 酿酒酵母BY4741及其工程菌株 | 合成生物学 | NA | 代谢工程 | NA | 产量数据 | 多个工程化酵母菌株（LM07, LM27等） | NA | 酿酒酵母 | 甲羟戊酸途径靶向过氧化物酶体，过氧化物酶体辅因子系统（乙酰辅酶A供应、NADH可用性、CoA代谢循环），细胞质-过氧化物酶体双区室工程 | 工业生物技术 |
| 191 | 2026-06-13 |
Small but Mighty: The Surprising Metabolic Range of a Bacterial Microcompartment
2026-Jun-07, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.06.05.730297
PMID:42282558
|
研究论文 | 通过在大肠杆菌中异源表达丙二醇利用操纵子，研究细菌微区室的代谢多功能性，并展示其在底物利用和生物技术中的应用潜力 | 首次证实异源表达的Pdu细菌微区室具有底物杂泛性，可处理C2至C5的二醇和三醇，并通过酶工程将底物范围扩展至1,2-戊二醇，为塑料回收和高价值化合物合成提供新途径 | 氧气抑制1,2-丙二醇利用，虽在微氧条件下缓解，但可能限制某些需氧应用；目前主要在模式菌株大肠杆菌中验证，其他宿主适用性未评估 | 研究细菌微区室的代谢多功能性及其在合成生物学中的调控潜力 | 大肠杆菌中异源表达的Pdu细菌微区室 | 合成生物学，代谢工程 | NA | 分子动力学模拟，染色体整合，同源重组，诱变 | NA | 代谢数据，分子动力学模拟数据 | 单个大肠杆菌工程菌株及多种底物测试 | CRISPR-Cas9，同源重组 | 大肠杆菌 | Pdu细菌微区室代谢模块 | 工业生物技术，塑料回收 |
| 192 | 2026-06-13 |
Development of Bacillus subtilis cell factories for nutraceuticals production
2026-Jun-06, World journal of microbiology & biotechnology
IF:4.0Q2
DOI:10.1007/s11274-026-05068-9
PMID:42250015
|
综述 | 系统总结了利用枯草芽孢杆菌细胞工厂生产保健品的合成生物学工具和代谢工程策略 | 全面比较了不同工程策略的局限性并强调其在保健品生物合成中的应用 | 当前挑战包括生产效率和经济性仍需提升 | 开发枯草芽孢杆菌作为高效生产保健品的底盘细胞 | 枯草芽孢杆菌细胞工厂 | 合成生物学 | NA | 合成生物学工具、代谢工程 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly | 枯草芽孢杆菌 | 代谢途径 | 工业生物技术 |
| 193 | 2026-06-13 |
Rational assembly of synthetic marine biofilm community with chitinase production
2026-Jun-04, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-9419003/v1
PMID:42282017
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研究论文 | 利用自上而下的方法理性组装具有几丁质酶活性的合成海洋生物膜群落 | 首次采用自上而下的组装策略，利用天然海洋细菌设计多功能生物膜群落，实现目标功能几丁质酶的产生，并展示了多物种生物膜在入侵挑战中的集体韧性 | 研究局限于实验室条件下的短期观察（7天），未探讨更长时间尺度下的群落稳定性；仅评估了一种目标功能（几丁质酶），其他潜在功能未涉及 | 设计具有几丁质酶生产功能的多物种生物膜，利用天然海洋细菌实现目标功能工程化 | 17种初始分离的海洋细菌及其组装形成的多物种生物膜 | 合成生物学，微生物组工程 | NA | 自上而下的群落组装，几丁质酶活性检测 | NA | 生物膜组成数据，酶活性数据 | 17种初始海洋细菌分离株，14种成员组成的最终群落 | NA | 天然海洋细菌 | 几丁质酶生产功能电路 | 海洋微生物组工程，生物技术 |
| 194 | 2026-06-13 |
Coupled intracellular redox and extracellular respiration sensing for quantitative oxidative stress profiling
2026-Jun-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.05.30.727573
PMID:42282784
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研究论文 | 提出一种结合基因编码的氧化还原生物传感器和光学氧传感器的双荧光传感平台，用于工业酵母系统中细胞内活性氧和耗氧率的并行、非侵入性定量测定 | 首次将细胞内氧化还原生物传感器与胞外氧气传感集成，实现对酵母氧化应激的动态监测，并识别出不同酵母的独特氧化还原-呼吸表型 | NA | 开发一种定量评估细胞氧化应激的方法，通过同时测量细胞内氧化还原状态和胞外呼吸活性 | 两种工业酵母菌株（Crabtree阳性酵母和专性呼吸酵母） | 合成生物学 | NA | 双荧光传感、基因编码生物传感器、光学氧传感 | NA | 荧光强度、氧气消耗率 | 两种酵母菌株（具体数目未提及） | NA | 酿酒酵母（Crabtree阳性酵母）、专性呼吸酵母 | NA | 生物制造、合成生物学 |
| 195 | 2026-06-13 |
Combining model-based and data-driven models: An application to synthetic biology resource competition
2026-Jun, Mathematical biosciences
IF:1.9Q3
DOI:10.1016/j.mbs.2026.109649
PMID:41791590
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研究论文 | 探索机器学习与机理模型在合成生物学资源竞争问题中的融合，提出部分不确定模型结构和嵌入式物理信息神经网络方法 | 提出部分不确定模型结构概念以防机器学习忽略机理约束，引入嵌入式物理信息神经网络方法，无缝融合机器学习和机理模型组件 | 机理模型构建劳动密集且依赖简化假设，机器学习可能忽视机理信息导致过拟合或可解释性降低 | 通过融合机器学习和机理模型实现更鲁棒的预测、增强系统洞察并改进对稀疏或噪声数据的处理 | 合成生物学中因资源共享导致基因电路意外行为的基因网络模型 | 机器学习 | NA | NA | 物理信息神经网络 | NA | NA | NA | NA | 基因电路 | 合成生物学 |
| 196 | 2026-06-13 |
Cytochrome P450-mediated structural diversification of diketopiperazine alkaloids
2026-Jun, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2026.103476
PMID:41793977
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综述 | 综述细胞色素P450酶催化二酮哌嗪生物碱结构多样化的研究进展 | 强调P450酶除羟基化外的催化多样性，包括二聚化、核苷碱基偶联和分子内环化，并探讨工程化P450变体在可持续生物合成中的应用 | 未提及具体实验验证或定量比较不同P450变体的催化效率 | 总结P450酶在二酮哌嗪结构多样化中的作用，并探索合成生物学驱动的创新策略 | 细胞色素P450酶及其催化的二酮哌嗪生物碱 | 合成生物学 | NA | P450酶催化、工程化P450变体 | NA | NA | NA | 工程化P450变体 | NA | 二酮哌嗪生物合成途径 | 药物发现 |
| 197 | 2026-06-13 |
Nitrogenase regulation in Vibrio natriegens differs from other γ-proteobacteria
2026-Jun-01, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.05.30.728972
PMID:42282805
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研究论文 | 研究了费氏弧菌中固氮酶的调控机制，并发现其与γ-变形菌的其他物种存在差异 | 首次揭示了费氏弧菌中固氮酶调控的独特层次，特别是NifA能独立激活固氮酶表达而NtrBC并非必需，以及GlnB和GlnK对NtrBC的冗余抑制类似非固氮菌 | 研究主要基于实验室条件，未在自然环境或复杂生态系统中验证这些调控机制 | 阐明费氏弧菌中固氮酶在铵离子与氮气条件下的调控机制 | 费氏弧菌（Vibrio natriegens）及其固氮酶调控蛋白 | 合成生物学 | NA | 功能基因组学、定点突变、报告基因分析 | NA | 基因表达数据 | 未具体说明样本数量 | CRISPR-Cas9 | 费氏弧菌 | 固氮酶调控回路（包括NtrBC、PII蛋白GlnB/GlnK及NifA的层级调控） | 农业, 工业生物技术 |
| 198 | 2026-06-13 |
Combinatorial and Inducible CRISPRa/i Enables Canalized hiPSC Forward Programming and Iterative Refinement via Single-Cell Genomics
2026-Jun-01, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.05.31.729073
PMID:42282825
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研究论文 | 开发了一种名为CIRI的可组合、诱导型CRISPRa/i平台，用于人类诱导多能干细胞（hiPSCs）的前向编程和迭代优化，并结合单细胞基因组学进行调控 | 首次在hiPSCs中建立可组合、诱导型CRISPRa/i平台，利用单一dCas9实现正交的CRISPR激活和干扰，并整合单细胞RNA测序筛选进行通路优化 | 未提及具体限制，可能包括体内应用验证不足或长期稳定性问题 | 开发一种可编程的合成生物学框架，用于人类干细胞模型中的基因调控和前向编程 | 人类诱导多能干细胞（hiPSCs）及其衍生的心肌类器官和骨骼肌细胞 | 合成生物学 | NA | CRISPRa/i, 单细胞RNA测序, 四环素诱导系统 | NA | 单细胞转录组数据 | 涉及hiPSCs、hiPSC衍生的心肌类器官和骨骼肌细胞，具体样本数量未提及 | CRISPR-Cas9 | 人类诱导多能干细胞（hiPSCs） | 可组合、诱导型CRISPRa/i基因调控回路，包括四环素响应性sgRNA和模块化RNA适配体 | 医学, 生物技术 |
| 199 | 2026-06-13 |
Sugarcane Biorefinery from Component Separation to High-Value Outputs: Technical Progress and Future Perspectives
2026-May-26, Foods (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/foods15111877
PMID:42279664
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综述 | 系统总结了甘蔗汁、蔗渣和滤泥的高值化利用途径，并提出甘蔗加工全组分高值化利用框架 | 构建'甘蔗加工树'全组分高值化框架，定量揭示功能糖高利润、蔗渣预处理成本占比40-50%以及滤泥粗蜡回收率仅5-8%等关键瓶颈，并提出耦合生物炼制、合成生物学和标准化框架的未来方向 | 当前瓶颈包括预处理效率低、菌株性能不佳和分离成本高 | 解决甘蔗加工单一产品依赖和副产品利用率低的问题，推动低碳循环转型 | 甘蔗汁、蔗渣、滤泥 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 工业生物技术、农业 |
| 200 | 2026-06-13 |
Molecular recruitment and release using DNA host condensates
2026-May-12, Nanoscale horizons
IF:8.0Q1
DOI:10.1039/d5nh00586h
PMID:41774821
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研究论文 | 使用DNA宿主凝聚体实现分子招募与释放 | 在DNA纳米星中整合适配体以构建具有招募和释放目标生物分子能力的凝聚体，并研究适配体位置对凝聚和招募效率的影响 | 仅研究了链霉亲和素（SA）一种模型蛋白，且适配体定位对凝聚和招募无显著影响可能限制了设计灵活性 | 探索DNA纳米星凝聚体作为可调控分子招募与释放平台的潜力 | DNA纳米星凝聚体及其招募的链霉亲和素（SA）分子 | 合成生物学 | NA | DNA纳米自组装、适配体技术 | NA | 实验数据 | 未明确说明 | DNA纳米星 | 无细胞系统 | 适配体修饰的DNA纳米星凝聚体 | 合成生物学 |