合成生物学相关文章
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当前共找到 3183 篇文献，本页显示第 181 - 200 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 181 | 2025-05-17 |
Metabolic engineering for microbial production of sugar acids
2025-May-13, BMC biotechnology
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12896-025-00973-7
PMID:40361067
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review | 本文综述了微生物生产糖酸的不同方法、应用及其在微生物中的代谢 | 强调了代谢工程和合成生物学工具在优化微生物菌株高效生产糖酸中的关键作用 | 未具体讨论不同方法的成本效益分析或大规模生产的可行性 | 探讨微生物生产糖酸的方法及其在多个行业中的应用 | 糖酸及其微生物生产 | 微生物生物技术 | NA | 代谢工程、CRISPR-Cas、动态调控回路 | NA | NA | NA |
| 182 | 2025-05-17 |
Cryo-EM structure of cyanopodophage A4 reveals a pentameric pre-ejectosome in the double-stabilized capsid
2025-Apr-08, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2423403122
PMID:40163721
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研究论文 | 本文报道了蓝藻噬菌体A4的完整结构，揭示了其双稳定衣壳中的五聚体预喷射体结构 | 发现了由四种喷射蛋白组成的五聚体预喷射体结构，并提出了噬菌体的DNA包装和喷射机制 | NA | 研究蓝藻噬菌体A4的结构及其DNA包装和喷射机制 | 蓝藻噬菌体A4 | 结构生物学 | NA | 冷冻电镜(Cryo-EM) | NA | 结构数据 | NA |
| 183 | 2025-05-17 |
Development and application of an interbacterial DNA delivery system based on M13 bacteriophage
2025-Apr-05, Archives of microbiology
IF:2.3Q3
DOI:10.1007/s00203-025-04309-z
PMID:40186660
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研究论文 | 开发了一种基于M13噬菌体的细菌间DNA传递系统，用于研究细菌间的协作响应机制 | 利用M13噬菌体构建了动态噬菌粒补充系统，实现了在无抗生素选择压力环境下维持噬菌粒DNA的稳定性，为多细菌联合调控提供了新方法 | NA | 开发细菌间DNA传递系统，研究细菌协作响应机制 | 工程化细菌 | 合成生物学 | NA | 噬菌体介导的DNA传递 | NA | DNA | NA |
| 184 | 2025-05-17 |
Sustainable regeneration of 20 aminoacyl-tRNA synthetases in a reconstituted system toward self-synthesizing artificial systems
2025-Apr-04, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adt6269
PMID:40173221
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研究论文 | 本文开发了一种能够持续再生20种氨酰-tRNA合成酶（AARS）的重构系统，为自复制人工系统的实现提供了重要进展 | 通过五种改进方法实现了20种AARS的可持续再生，包括序列优化、翻译系统组成优化、使用不同细菌的AlaRS和SerRS、减少翻译抑制以及平衡DNA浓度 | NA | 实现自复制人工系统的体外构建 | 20种氨酰-tRNA合成酶（AARS） | 合成生物学 | NA | 体外重构系统 | NA | NA | NA |
| 185 | 2025-05-17 |
Introduction of human m6Am methyltransferase PCIF1 facilitates the biosynthesis of terpenoids in Saccharomyces cerevisiae
2025-Apr-02, Microbial cell factories
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s12934-025-02701-4
PMID:40176045
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研究论文 | 本研究通过将人类m6Am甲基转移酶PCIF1引入酿酒酵母，显著提高了萜类化合物的生物合成效率 | 首次发现PCIF1能显著促进酿酒酵母中角鲨烯和长叶烯的生物合成，并揭示了其通过上调糖酵解和乙酰辅酶A生物合成途径相关基因以及激活细胞壁完整性MAPK途径的机制 | 研究仅针对PCIF1在酿酒酵母中的作用，未在其他微生物系统中验证其普适性 | 开发更高效的代谢途径优化策略以提高微生物细胞工厂的生产潜力 | 酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae)和萜类化合物(角鲨烯和长叶烯) | 合成生物学 | NA | 代谢工程策略、转录组分析 | NA | 基因表达数据 | 工程化酵母菌株 |
| 186 | 2025-05-17 |
[Databases, knowledge bases, and large models for biomanufacturing]
2025-Mar-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.240653
PMID:40170304
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综述 | 本文综述了生物制造领域数据库、知识库和大语言模型的最新研究进展 | 探讨了生物制造领域的发展方向、挑战及新兴技术方法 | 未提及具体的技术实现细节或实验验证 | 为相关领域的科学研究提供指导和启发 | 生物制造领域的信息技术整合 | 生物信息学 | NA | 人工智能、大模型、高性能计算 | 大语言模型 | 生物信息学数据 | NA |
| 187 | 2025-05-17 |
[Intelligent design of nucleic acid elements in biomanufacturing]
2025-Mar-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.240599
PMID:40170308
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综述 | 本文总结了生物制造中使用的各种核酸元件、基于AI算法开发的预测和设计这些元件的工具，以及AI在生物制造中的应用案例 | 通过整合AI与合成生物学及高通量技术，展望开发更高效的核酸元件设计工具，加速AI在生物制造中的应用 | 由于生物系统的复杂性和缺乏高度量化的训练数据，AI在生物制造中的应用仍有限 | 探讨AI在生物制造中核酸元件设计与优化中的应用 | 核酸元件（如启动子、核糖体结合位点、终止子等） | 合成生物学 | NA | 高通量技术 | AI算法 | 序列数据 | NA |
| 188 | 2025-05-17 |
[Artificial intelligence-assisted design, mining, and modification of CRISPR-Cas systems]
2025-Mar-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.240865
PMID:40170307
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review | 本文综述了人工智能技术在CRISPR-Cas系统设计、挖掘和修饰中的应用进展 | 利用AI技术（特别是机器学习）分析高通量测序数据，优化sgRNA设计，提高编辑效率并准确预测脱靶效应 | NA | 探讨人工智能在CRISPR-Cas系统设计、挖掘和修饰中的应用及其对基因编辑效率和精度的提升 | CRISPR-Cas系统及其相关蛋白 | synthetic biology | NA | high-throughput sequencing | machine learning | sequencing data | NA |
| 189 | 2025-05-17 |
[Machine learning-aided design of synthetic biological parts and circuits]
2025-Mar-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.240605
PMID:40170311
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综述 | 本文回顾了机器学习在合成生物学部件和遗传电路设计中的常用算法及其典型应用，并讨论了主要挑战和潜在解决方案 | 探讨了机器学习如何从经验驱动的试错模式转向标准化、智能化的工程方法，以支持合成生物学部件和遗传电路的智能设计 | 未具体说明机器学习算法在复杂遗传电路设计中的实际效果和局限性 | 推动合成生物学从传统试错方法向智能化工程设计转变 | 合成生物学部件（如合成启动子、RNA调控元件和转录因子）和简单遗传电路 | 合成生物学 | NA | 机器学习 | NA | 生物数据 | NA |
| 190 | 2025-05-17 |
[Advances in the regulation of microbial cell metabolism and environmental adaptation]
2025-Mar-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.240937
PMID:40170316
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综述 | 本文从三个角度全面综述了细胞代谢和环境适应的调控机制及其在合成生物学中的应用 | 提供了细胞感知代谢和环境变化机制的全面视角，并为合成生物学领域的进一步创新奠定了理论基础 | 目前缺乏对细胞代谢和环境适应调控的系统性综述 | 探讨细胞感知代谢和环境变化的机制及其在合成生物学中的应用 | 细胞的代谢和环境适应调控机制 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 191 | 2025-05-17 |
[Advances in reconstruction and optimization of cellular physiological metabolic network models]
2025-Mar-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.240966
PMID:40170315
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review | 本文系统介绍了细胞生理代谢网络模型的最新研究进展，包括基因组尺度代谢模型（GEMs）、动力学模型和酶约束基因组尺度代谢模型（ecGEMs） | 总结了人工智能在动力学模型和酶约束模型开发中的应用，为细胞生理代谢网络模型的高精度构建提供了新机遇 | NA | 系统阐明基因型与生长表型之间的关系，为精确表征细胞生理代谢活动和绿色生物制造提供计算生物学工具 | 细胞生理代谢网络模型 | 计算生物学 | NA | 基因组尺度代谢模型（GEMs）、动力学模型、酶约束基因组尺度代谢模型（ecGEMs） | NA | NA | NA |
| 192 | 2025-05-17 |
[Intelligent design of transcription factor-based biosensors]
2025-Mar-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.240603
PMID:40170310
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综述 | 本文全面总结了在计算模拟和人工智能辅助下，基于转录因子的生物传感器的工程和优化最新进展 | 利用计算模拟和人工智能技术，提高了生物传感器设计的准确性和速度 | NA | 优化基于转录因子的生物传感器性能 | 转录因子（TF） | 合成生物学 | NA | 计算模拟、人工智能、蛋白质结构预测、配体结合模拟、机器学习 | 机器学习模型 | 突变数据 | NA |
| 193 | 2025-05-17 |
[Optimization of fermentation processes in intelligent biomanufacturing: on online monitoring, artificial intelligence, and digital twin technologies]
2025-Mar-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.250032
PMID:40170318
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综述 | 本文综述了智能生物制造中发酵过程的优化，重点探讨了在线监测技术、人工智能优化策略和数字孪生应用的最新进展 | 整合了在线监测技术、AI驱动的动态优化和数字孪生技术，为发酵过程的实时优化和规模化提供了新范式 | 未提及具体实施案例或实验验证结果 | 实现发酵过程的精确优化和高效规模化 | 发酵过程的实时传感与智能控制 | 智能生物制造 | NA | 在线监测技术、机器学习（如人工神经网络和支持向量机）、遗传算法 | 数字孪生、多尺度模型（如细胞代谢动力学和反应器流体力学） | 实时传感数据 | NA |
| 194 | 2025-05-17 |
DNA/RNA hybrids avoid channel gating that leads to the continued packaging of numerous hybrids into the phi29 protein shell
2025-Mar-20, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf242
PMID:40193705
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research paper | 该研究探讨了phi29 DNA包装马达在包装双链DNA和RNA/DNA杂交体时的效率差异及其机制 | 发现RNA/DNA杂交体由于缺乏通道门控机制而比双链DNA更高效地被包装 | 通道门控的具体机制仍不明确 | 研究phi29 DNA包装马达对不同核酸结构的包装效率及其机制 | phi29 DNA包装马达及其包装的双链DNA和RNA/DNA杂交体 | 分子生物学 | NA | 单通道电生理学和蔗糖梯度超速离心 | NA | NA | NA |
| 195 | 2025-05-17 |
Self-organized spatial targeting of contractile actomyosin rings for synthetic cell division
2024-11-29, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-54807-9
PMID:39614082
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研究论文 | 该研究通过结合肌动蛋白环和细菌MinDE蛋白系统在GUVs中的重构，展示了自组织空间靶向收缩肌动蛋白环以实现合成细胞分裂的潜力 | 结合肌动蛋白环和细菌MinDE蛋白系统，实现了自组织空间靶向收缩肌动蛋白环，诱导囊泡中段变形和囊泡出芽 | NA | 开发合成细胞自分裂的最小模块 | 巨型单层囊泡(GUVs)和肌动蛋白环 | 合成生物学 | NA | 肌动蛋白环重构和MinDE蛋白系统 | NA | NA | NA |
| 196 | 2025-05-17 |
Biosynthesis of plant hemostatic dencichine in Escherichia coli
2022-09-19, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-33255-3
PMID:36123371
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研究论文 | 该研究通过合成生物学方法在大肠杆菌中实现了植物止血成分dencichine的从头生物合成 | 通过逆向生物合成方法设计人工途径，优化关键酶翻译速率，并系统改造代谢网络以提高产量 | NA | 建立dencichine的可持续生产途径 | 植物源天然产物dencichine | 合成生物学 | NA | 逆向生物合成、代谢工程 | NA | NA | NA |
| 197 | 2025-05-16 |
Microfluidic Fluorescence-Activated Cell Sorting of Convolutional Neural Network-Designed Synthetic Yeast Promoter
2025-May-14, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00025
PMID:40368332
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研究论文 | 本文开发了一种分支卷积神经网络（B-CNN）结合遗传算法，用于设计和筛选合成酵母启动子，并通过微流控荧光激活细胞分选（μFACS）系统进行高通量筛选 | 结合B-CNN和遗传算法设计合成启动子，开发了μFACS系统进行高通量筛选，提高了启动子强度和产物产量 | 未提及实验的具体样本量或筛选范围的具体限制 | 提高合成酵母启动子的设计和筛选效率，以增强基因表达和代谢物生物合成 | 酵母启动子，特别是酒精氧化酶1启动子（P） | 合成生物学 | NA | 微流控荧光激活细胞分选（μFACS），遗传算法 | 分支卷积神经网络（B-CNN） | 序列数据，荧光信号 | 未明确提及具体样本量，但提到细胞通量达到7000细胞/秒 |
| 198 | 2025-05-16 |
Machine learning-led semi-automated medium optimization reveals salt as key for flaviolin production in Pseudomonas putida
2025-Apr-18, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-025-08039-2
PMID:40251395
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研究论文 | 本文介绍了一种基于机器学习的半自动化培养基优化方法，显著提高了恶臭假单胞菌中黄酮醇的产量 | 提出了一种分子和宿主无关的主动学习流程，通过半自动化管道快速优化培养基，并发现盐浓度是影响黄酮醇生产的关键因素 | 未明确说明该方法在其他宿主或分子生产中的普适性 | 优化培养基以提高恶臭假单胞菌中黄酮醇的产量 | 恶臭假单胞菌KT2440和黄酮醇生产 | 合成生物学 | NA | 机器学习，主动学习，半自动化管道 | NA | 实验数据 | 三个不同的黄酮醇生产实验 |
| 199 | 2025-05-16 |
Long-Term Yeast Cultivation Coupled with In Situ Extraction for High Triterpenoid Production
2025-Apr-02, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.5c00273
PMID:40129278
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research paper | 该研究通过结合长期酵母培养与原位提取技术，提高了工程酵母细胞内人参皂苷的生产和输出效率 | 结合长期酵母培养与原位提取技术，显著提高人参皂苷产量，并实现酵母的重复利用 | 研究未提及该方法在大规模工业化生产中的可行性和成本效益 | 提高人参皂苷的生产效率，支持其工业化生产 | 工程酵母 | 合成生物学 | NA | 酵母培养与原位提取技术 | NA | NA | NA |
| 200 | 2025-05-16 |
Advances in synthesizing plant-derived isoflavones and their precursors with multiple pharmacological activities using engineered yeasts
2025-Mar-29, Microbial cell factories
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s12934-025-02692-2
PMID:40155940
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综述 | 本文综述了利用工程酵母合成植物源性异黄酮及其前体的进展，包括其药理活性、生物合成途径及生产技术策略 | 总结了合成生物学和先进生物技术策略在环境友好型生物活性异黄酮生产中的应用 | 未提及具体实验数据或样本量，可能缺乏对当前技术局限性的深入讨论 | 探讨利用工程酵母可持续高效生产异黄酮的方法 | 植物源性异黄酮及其前体，如大豆苷元和染料木素 | 合成生物学 | NA | 工程酵母生物合成 | NA | NA | NA |