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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 181 | 2025-11-29 |
Biosynthesis of high-value chorismate derivatives in Escherichia coli: Recent advances and perspectives
2025-Nov-20, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108762
PMID:41274425
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综述 | 本文综述了在大肠杆菌中生物合成高价值分支酸衍生物的最新进展与前景 | 系统总结代谢工程和合成生物学策略在大肠杆菌平台中优化分支酸衍生物生物合成的最新方法 | 未涉及具体实验数据验证,主要基于文献综述 | 探讨通过工程化大肠杆菌实现分支酸衍生物绿色高效合成的途径 | 分支酸衍生物及其在大肠杆菌中的生物合成途径 | 合成生物学 | NA | 系统代谢工程、合成生物学 | NA | 文献数据 | NA | 代谢工程、基因重设计 | 大肠杆菌 | 分支酸衍生物生物合成途径 | 医药、化妆品、特种化学品 |
| 182 | 2025-11-29 |
Structure and encapsulation of carbonic anhydrase within the α-carboxysome
2025-Nov-18, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2523723122
PMID:41223214
|
研究论文 | 本研究解析了α-羧酶体中碳酸酐酶的结构及其封装机制 | 首次揭示了CsoSCA采用二聚体三聚体的寡聚结构且中心不含锌离子,并证明其与外壳蛋白的直接相互作用机制 | 研究主要基于合成微型外壳系统,可能无法完全反映天然羧酶体的复杂环境 | 探究α-羧酶体中碳酸酐酶的结构特征和封装机制 | 化学自养细菌Halothiobacillus neapolitanus的α-羧酶体碳酸酐酶(CsoSCA) | 结构生物学 | NA | 结构解析、合成微型外壳构建、蛋白质相互作用分析 | NA | 结构数据、生化实验数据 | NA | 合成生物学工具 | Halothiobacillus neapolitanus | 羧酶体封装系统,包含Rubisco和碳酸酐酶的代谢模块 | 合成生物学、生物技术 |
| 183 | 2025-11-29 |
Silk Fibroin-Derived Smart Living Hydrogels for Regenerative Medicine and Organoid Engineering: Bioactive, Adaptive, and Clinically Translatable Platforms
2025-Nov-13, Gels (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/gels11110908
PMID:41294593
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综述 | 本文综述丝素蛋白智能活性水凝胶在再生医学和类器官工程中的应用与进展 | 将传统丝素蛋白材料升级为具有感知微环境信号、指导细胞命运和递送治疗信号的智能活性水凝胶系统 | 长期细胞活性维持、临床规模化生产和监管标准符合方面仍存在挑战 | 探索丝素蛋白智能水凝胶在连接基础研究与临床应用之间的桥梁作用 | 丝素蛋白水凝胶及其在组织再生和类器官培养中的应用 | 再生医学 | NA | 水凝胶工程、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 184 | 2025-11-29 |
Advances and Future Perspectives of Synechocystis sp. as a Microbial Cell Factory for Biomanufacturing
2025-Nov, Biotechnology journal
IF:3.2Q2
DOI:10.1002/biot.70162
PMID:41311002
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综述 | 本文综述了集胞藻作为微生物细胞工厂在生物制造中的最新进展与未来前景 | 整合了生物信息学概述与合成生物学应用的最新进展,提出了组学策略整合等未来研究方向 | NA | 推动蓝藻在工业生物技术中的应用,促进可持续、低碳、高效生物生产系统的发展 | 集胞藻(Synechocystis sp.) | 工业生物技术 | NA | 合成生物学、组学策略 | NA | NA | NA | 合成生物学工具 | 集胞藻(Synechocystis sp.) | 细胞工厂设计、高价值生化产物生物合成途径 | 工业生物技术,能源,环境 |
| 185 | 2025-11-29 |
Harnessing plant agriculture to mitigate climate change: A framework to evaluate synthetic biology (and other) interventions
2025-Oct-31, Plant physiology
IF:6.5Q1
DOI:10.1093/plphys/kiaf410
PMID:41004568
|
研究论文 | 本文提出一个评估合成生物学干预措施在植物农业中减缓气候变化潜力的框架 | 首次使用费米估计量化多种合成生物学策略的碳减排潜力,并与非工程化方法进行基准比较 | 基于100年时间跨度的预测存在不确定性,需要定期重新评估策略有效性 | 识别和优先考虑通过植物农业减缓气候变化的合成生物学策略 | 植物农业系统中的碳减排和碳封存技术 | 合成生物学 | NA | 费米估计、生命周期评估 | NA | 定量分析数据 | NA | 合成生物学 | 植物 | 改进的CO2固定、根系沉积生物聚合物、工程化固氮、甲烷减排 | 农业,环境 |
| 186 | 2025-11-28 |
Overcoming antimicrobial resistance: Phage therapy as a promising solution to combat ESKAPE pathogens
2025-Dec, International journal of antimicrobial agents
IF:4.9Q1
|
综述 | 本文系统评估噬菌体疗法对抗多重耐药ESKAPE病原体的治疗潜力 | 重点探讨噬菌体裂解-溶原性转换的分子调控机制,并整合纳米技术递送系统和CRISPR-Cas等前沿工程技术 | 存在监管、耐药性和可扩展性等挑战,尚未实现从实验性到主流治疗的完全转变 | 评估噬菌体疗法作为对抗抗菌素耐药性的替代治疗策略 | 多重耐药的ESKAPE病原体(医院获得性感染主要致病菌) | 微生物学与传染病学 | 细菌感染性疾病 | 噬菌体疗法、CRISPR-Cas技术、合成生物学方法 | NA | 文献资料与临床证据 | NA | CRISPR-Cas, 合成生物学方法 | 噬菌体 | NA | 医学 |
| 187 | 2025-11-28 |
Recent advances in nucleic acid nanotechnology-driven artificial transcriptional components
2025-Nov-27, Nanoscale
IF:5.8Q1
DOI:10.1039/d5nr03210e
PMID:41221719
|
综述 | 概述核酸纳米技术在人工转录组件构建与转录调控中的应用及其优势 | 系统阐述核酸纳米技术通过模块化设计、动态响应和逻辑信息处理实现精准转录调控的独特优势 | NA | 探讨核酸纳米技术在人工转录组件设计与转录调控中的应用前景 | 核酸纳米技术驱动的人工转录组件 | 合成生物学 | NA | 核酸纳米技术 | NA | NA | NA | NA | NA | 人工转录组件 | 生物计算、智能生物制造、生物传感 |
| 188 | 2025-11-28 |
Biomimetic nanovaccines with self-adjuvant effects induced broad-spectrum neutralizing antibodies against SARS-CoV-2 infection in rodents
2025-Nov-25, Journal of virology
IF:4.0Q2
DOI:10.1128/jvi.00315-25
PMID:41070969
|
研究论文 | 本研究利用合成生物学技术开发具有自佐剂效应的仿生纳米疫苗,可诱导广谱中和抗体对抗SARS-CoV-2感染 | 首次将SARS-CoV-2 RBD蛋白负载于树枝状介孔有机硅纳米颗粒制备仿生纳米疫苗,具有自佐剂效应和广谱中和能力 | 目前仅在啮齿类动物模型中进行验证,尚未开展人体临床试验 | 开发能够对抗SARS-CoV-2变异株的下一代广谱疫苗平台 | SARS-CoV-2病毒及其变异株 | 合成生物学 | COVID-19 | 合成生物学技术、纳米颗粒制备技术 | NA | 免疫学数据 | 啮齿类动物模型 | NA | NA | NA | 医学 |
| 189 | 2025-11-28 |
Challenges and opportunities beyond antibody-drug conjugates: Toward a new era of programmable therapeutic proteins
2025-Nov-19, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2025.153018
PMID:41297517
|
综述 | 本文综述了超越抗体-药物偶联物的新型可编程治疗蛋白的发展前景与挑战 | 提出基于完全基因编码的双功能嵌合蛋白,整合靶向结构域与抗癌肽细胞毒性模块,突破传统ADC药物的局限性 | 未提供具体临床实验数据验证新型蛋白治疗效果 | 开发下一代标准化、可定制的蛋白质治疗药物 | 抗体-药物偶联物及其替代性治疗蛋白 | 合成生物学 | 肿瘤 | 合成生物学、展示系统、机器学习 | 机器学习 | NA | NA | NA | 细菌 | 双功能嵌合蛋白设计(靶向结构域+细胞毒性模块) | 医学 |
| 190 | 2025-11-28 |
Recent advances of engineered bacteria for therapeutic applications
2025-Nov-12, Molecular therapy : the journal of the American Society of Gene Therapy
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.ymthe.2025.11.013
PMID:41234015
|
综述 | 系统回顾工程化细菌在疾病治疗应用中的最新进展,重点关注组织特异性治疗策略 | 基于组织特异性系统分析不同器官中工程化细菌的治疗应用,强调系统级优化对临床疗效的提升 | NA | 总结工程化细菌在疾病治疗中的开发与应用进展 | 工程化细菌系统 | 合成生物学 | 肿瘤、代谢紊乱 | 合成生物学、基因工程、计算建模、模块化基因电路设计 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN | 细菌 | 模块化基因电路、生物传感器 | 医学 |
| 191 | 2025-11-27 |
Microbial Production of Crocins: Enzymes, Pathways, and Engineering Strategies
2025-Nov-26, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.5c06555
PMID:41220064
|
综述 | 本文全面综述了通过合成生物学和代谢工程在异源宿主中生物合成藏花素的研究进展 | 重点聚焦酶表征和途径工程,提出开发高效藏花素微生物细胞工厂的潜在策略 | 藏花素生物合成途径复杂且途径酶效率低,微生物高效生产仍面临挑战 | 实现藏花素的大规模微生物生产 | 藏花素生物合成途径及相关酶 | 合成生物学 | NA | 代谢工程,合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 异源微生物宿主 | 藏花素生物合成途径 | 食品工业 |
| 192 | 2025-11-27 |
Expanding frontiers: harnessing plant biology for space exploration and planetary sustainability
2025-Nov-26, The New phytologist
DOI:10.1111/nph.70662
PMID:41295882
|
观点文章 | 本文提出利用植物生物学支持太空探索和地球可持续发展的集体愿景和优先事项 | 引入新的作物生物再生生命支持系统准备水平框架,扩展现有作物准备水平概念 | NA | 推动植物科学支持人类太空探索和地球可持续发展 | 植物在太空环境中的响应机制和生物再生生命支持系统 | 太空生物学 | NA | 预测建模、合成生物学、地球模拟系统、空间生物监测仪器 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 太空探索, 环境 |
| 193 | 2025-11-27 |
Engineering Artificial Mitochondria with Self-Amplifying Proton Generation for Autonomous Energy Supply and Metabolic Coupling in Artificial Cells
2025-Nov-24, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202514980
PMID:41030094
|
研究论文 | 本研究开发了一种模拟线粒体功能的人工ATP纳米发电机,通过酶促级联反应实现自主能量供应 | 设计了具有自增强质子生成功能的人工线粒体,实现了跨膜质子梯度的稳定维持和高效ATP合成 | NA | 为人工细胞构建持续自主的能量供应系统 | 人工线粒体、人工细胞模型 | 合成生物学 | NA | 酶共区室化、纳米胶囊封装、脂质体构建 | NA | NA | NA | Gibson Assembly | NA | 自增强酶促级联回路:葡萄糖氧化酶-过氧化氢酶协同作用放大质子生成 | 合成生物学、生物能源 |
| 194 | 2025-11-27 |
A Chromosomally Integrated T7 RNA Polymerase Enables T7-Derived Expression in Salmonella enterica without Compromising Virulence
2025-11-18, Journal of microbiology and biotechnology
IF:2.5Q3
DOI:10.4014/jmb.2509.09023
PMID:41260602
|
研究论文 | 本研究通过染色体整合T7 RNA聚合酶,成功开发了可在鼠伤寒沙门氏菌中实现T7表达系统功能且不影响其毒力的工程菌株 | 首次在鼠伤寒沙门氏菌中实现染色体整合的T7 RNA聚合酶系统,解决了该病原菌无法使用T7表达工具的难题 | 研究仅针对鼠伤寒沙门氏菌特定菌株14028s,未验证在其他沙门氏菌株中的适用性 | 开发适用于沙门氏菌的T7兼容表达系统,用于病原菌研究和生物技术应用 | 鼠伤寒沙门氏菌(Salmonella enterica serovar Typhimurium)菌株14028s | 合成生物学 | 细菌感染性疾病 | pGRG36转座子系统,染色体整合技术 | NA | 细菌生长数据,毒力实验数据 | 工程菌株与野生型菌株的比较研究 | pGRG36 transposon system | Salmonella enterica | lac启动子控制的T7 RNA聚合酶表达系统,IPTG诱导型异源蛋白表达 | 医学, 合成生物学 |
| 195 | 2025-11-27 |
A membrane-driven biochemical oscillator tunable by the volume to surface area ratio
2025-Nov-16, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.11.14.688573
PMID:41292784
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研究论文 | 提出并建模了一种基于膜磷脂浓度动态变化的质量守恒生化振荡器 | 利用膜反应维度缩减效应实现几何可调的生化振荡,无需转录翻译机制 | 计算模拟为主,需要实验验证;低V/A比时酶动力学设计规则较为严格 | 开发几何可编程的合成生物学定时模块 | 膜驱动的生化振荡系统 | 合成生物学 | NA | 质量作用反应动力学、反应扩散模拟 | 确定性振荡器模型、随机模拟 | 计算模拟数据 | NA | NA | 无细胞系统 | 膜定位振荡器、自组装三聚体耦合系统 | 合成生物学、生物工程 |
| 196 | 2025-11-27 |
Innovative insights into gut microbiota modulation in colorectal cancer: From microbial dysbiosis to therapeutic strategies
2025-Nov-15, World journal of gastrointestinal oncology
IF:2.5Q3
DOI:10.4251/wjgo.v17.i11.108747
PMID:41281485
|
综述 | 探讨肠道微生物群失调在结直肠癌发病机制和进展中的作用及相应治疗策略 | 系统阐述微生物代谢产物与宿主尿素循环等通路在肿瘤发生中的相互作用,并提出基于合成生物学的工程益生菌等创新疗法 | 未具体说明研究中涉及的样本规模和临床验证数据 | 解析肠道微生物群在结直肠癌中的作用机制并开发新型治疗策略 | 结直肠癌相关的肠道微生物群落及其代谢产物 | NA | 结直肠癌 | 微生物组分析、代谢组学 | NA | 微生物组数据、代谢物数据 | NA | 合成生物学 | 工程益生菌 | 微生物调控回路 | 医学 |
| 197 | 2025-11-27 |
NMR-guided rational exploration of co-factors in boosting the Pfu DNA polymerase
2025-Nov, Magnetic resonance letters
DOI:10.1016/j.mrl.2025.200218
PMID:41278258
|
研究论文 | 本研究利用NMR技术指导探索能够增强Pfu DNA聚合酶性能的辅助因子 | 开发了一种不依赖结构数据或生物信息学的NMR引导方法,利用酶活性位点作为探针筛选辅助因子 | 方法验证仅使用了Tween-20作为模型系统,需要进一步在不同酶系统中验证普适性 | 优化DNA聚合酶的热稳定性和持续性,提升其性能 | Pfu DNA聚合酶及其辅助因子 | 合成生物学 | NA | 核磁共振(NMR)光谱技术 | NA | 蛋白质结构数据 | NA | NA | NA | NA | 工业生物技术 |
| 198 | 2025-11-27 |
A pipeline for screening small molecule-enhanced protein stability in a bacterial orphan receptor
2025-Nov, Protein science : a publication of the Protein Society
IF:4.5Q1
DOI:10.1002/pro.70330
PMID:41074865
|
研究论文 | 本研究开发了一种筛选小分子增强细菌孤儿受体蛋白稳定性的流程,并以CU228转录因子为模型系统进行验证 | 建立了结合生物信息学分析、差示扫描荧光法、微流控调制光谱和饱和转移差示NMR的多技术联用流程,成功识别出三种能显著提高孤儿PAS蛋白稳定性的小分子配体 | 研究仅使用了约760种化合物的片段库,可能未覆盖所有潜在配体;配体亲和力处于微摩尔级别,属于片段水平结合 | 开发筛选小分子配体的方法,用于表征和工程化孤儿PAS蛋白 | 来自Candidatus Solibacter usitatus的CU228转录因子(PAS-HTH型) | 合成生物学 | NA | 差示扫描荧光法, 微流控调制光谱, 饱和转移差示NMR, 生物信息学分析 | NA | 蛋白质结构数据, 热稳定性数据, 光谱数据 | 约760种化合物片段库,鉴定出3种有效配体 | NA | NA | NA | 生物技术, 合成生物学 |
| 199 | 2025-11-27 |
Yohimban acetylation in Rauvolfia is mediated by a leaf-specific acetyltransferase in reserpine biosynthetic gene cluster
2025-Oct-30, Plant physiology and biochemistry : PPB
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.plaphy.2025.110714
PMID:41289712
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研究论文 | 本研究鉴定并表征了萝芙木中负责育亨宾乙酰化的叶片特异性乙酰转移酶YAT | 首次发现位于利血平生物合成基因簇中的叶片特异性乙酰转移酶YAT,揭示了育亨宾生物代谢中先前未知的分支点 | NA | 阐明萝芙木中单萜吲哚生物碱生物合成的酶学基础和进化动态 | 萝芙木中的育亨宾O-乙酰转移酶(YAT)及其在育亨宾生物碱代谢中的作用 | 合成生物学 | NA | 同源建模、底物对接实验 | NA | 基因表达数据、酶活性数据 | NA | NA | 萝芙木 | 利血平生物合成基因簇 | 医药 |
| 200 | 2025-11-27 |
Phenylpropanoid methyl esterase unlocks catabolism of aromatic biological nitrification inhibitors
2025-Jan-02, The ISME journal
DOI:10.1093/ismejo/wraf251
PMID:41230824
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研究论文 | 本研究发现了微生物降解芳香族硝化抑制剂苯丙烷类甲酯的新途径 | 鉴定了一种先前未知的苯丙烷类甲酯降解微生物途径,并发现两种新型酶包括新鉴定的苯丙烷甲酯酶 | 仅初步揭示了微生物降解途径,对土壤中抑制剂降解的整体理解仍需进一步研究 | 研究微生物对芳香族硝化抑制剂的降解机制 | 苯丙烷类甲酯(一类芳香族硝化抑制剂)及其降解微生物 | 合成生物学 | NA | 转录组学、高通量功能基因组学、遗传分析、生化分析 | NA | 基因组数据、转录组数据、生化数据 | NA | 基因转移 | 细菌 | 苯丙烷类甲酯降解途径 | 农业、环境 |