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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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181 | 2025-07-29 |
Advancements in understanding tumor-resident bacteria and their application in cancer therapy
2025-Jul-25, Military Medical Research
IF:16.7Q1
DOI:10.1186/s40779-025-00623-1
PMID:40713785
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综述 | 本文综述了肿瘤内微生物群,特别是细胞内细菌在肿瘤演变中的独特作用及其在癌症治疗中的应用 | 探讨了细胞内细菌的来源、侵入癌细胞的机制及潜在生存策略,并讨论了靶向这些细菌的新方法,如工程化药物递送系统和合成生物学 | 综述性文章,未涉及具体实验数据或样本分析 | 探索肿瘤内微生物群在癌症发展和治疗中的作用 | 肿瘤内微生物群,特别是细胞内细菌 | 肿瘤学 | 癌症 | 下一代测序(NGS)和生物信息学 | NA | NA | NA |
182 | 2025-07-29 |
Engineered implementations of spatial computation in biological systems
2025-Jul-24, Seminars in cell & developmental biology
IF:6.2Q1
DOI:10.1016/j.semcdb.2025.103631
PMID:40712326
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review | 本文综述了工程化生物系统中空间计算的应用及其潜力 | 探讨了超越传统单细胞逻辑系统的空间分布式和区室化框架,模拟自然现象如形态发生素梯度和细胞区室化,以实现可扩展性、鲁棒性和适应性 | NA | 探索合成生物学中空间计算的应用,以解决传统计算架构无法应对的复杂计算挑战 | 工程化生物系统中的空间计算框架 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
183 | 2025-07-29 |
Protein-glycan engineering in vaccine design: merging immune mechanisms with biotechnological innovation
2025-Jul-24, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2025.06.022
PMID:40713219
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review | 本文综述了蛋白质-糖基工程在疫苗设计中的应用,探讨了如何通过精确控制糖基结构来增强抗原呈递和免疫激活 | 整合了CRISPR糖基编辑、合成生物学和糖基修饰纳米颗粒等前沿生物技术,重新定义了疫苗效力 | 糖基异质性和免疫逃逸等挑战仍然存在 | 探讨蛋白质-糖基工程在疫苗设计中的应用,以提高疫苗效力 | 糖基在免疫识别中的调控作用及其在疫苗设计中的应用 | 生物技术 | NA | CRISPR糖基编辑、合成生物学、糖基修饰纳米颗粒 | NA | NA | NA |
184 | 2025-07-29 |
A Review of DNA Restriction-Free Overlapping Sequence Cloning Techniques for Synthetic Biology
2025-Jul, Biotechnology journal
IF:3.2Q2
DOI:10.1002/biot.70084
PMID:40713804
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综述 | 本文系统总结了合成生物学中当前使用的主要无限制重叠序列克隆(RFOSC)技术,并探讨了它们的发展、效率、实用性和具体应用 | 全面评估了多种RFOSC技术,包括体外和体内方法,并提出了未来技术发展的趋势 | 未明确指出每种技术的具体限制条件或适用范围 | 总结和评估合成生物学中的DNA克隆技术 | DNA克隆技术,特别是无限制重叠序列克隆技术 | 合成生物学 | NA | Gibson Assembly, CPEC, PIPE, OEC, UDG-Cloning, In-Fusion, LIC, SLIC, TEDA, YHR, IVA, TAR, PEDA | NA | NA | NA |
185 | 2025-07-29 |
Exploring pigment-producing Streptomyces as an alternative source to synthetic pigments: diversity, biosynthesis, and biotechnological applications. A review
2025-Jun-25, World journal of microbiology & biotechnology
IF:4.0Q2
DOI:10.1007/s11274-025-04379-7
PMID:40555885
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综述 | 探讨产色素链霉菌作为合成色素替代来源的多样性、生物合成及生物技术应用 | 综述了CRISPR/Cas基因编辑技术在激活沉默生物合成基因簇以提高色素产量方面的最新进展 | 毒性评估、工业条件下色素稳定性、未探索链霉菌菌株的高通量筛选以及AI预测工具在途径优化中的整合等方面存在研究空白 | 寻找天然、环保的色素替代品以解决合成色素带来的健康和环保问题 | 产色素的链霉菌 | 生物技术 | NA | CRISPR/Cas基因编辑 | NA | NA | NA |
186 | 2025-07-29 |
Development and Recent Advances in SLIPT-PM: A Chemogenetic Platform for Manipulating Signaling at the Plasma Membrane
2025-May-21, Chembiochem : a European journal of chemical biology
IF:2.6Q3
DOI:10.1002/cbic.202500327
PMID:40400158
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综述 | 本文综述了SLIPT-PM化学遗传学平台的开发、主要特点、当前应用及未来挑战,该平台用于在活细胞中操控质膜信号传导 | 开发了一种新型的化学遗传学平台SLIPT-PM,能够快速将目标蛋白从细胞质招募到质膜,并具有可控的可逆性和重复性 | 未明确提及具体限制,但提到未来挑战,可能涉及技术的进一步优化和应用扩展 | 开发并优化一种用于操控细胞信号传导网络的化学遗传学工具 | 哺乳动物细胞中的信号蛋白和脂质 | 化学生物学与合成生物学 | NA | SLIPT(自定位配体诱导蛋白转位)技术 | NA | NA | NA |
187 | 2025-07-29 |
Leveraging a synthetic biology approach to enhance BCG-mediated expansion of Vγ9Vδ2 T cells
2025-May-09, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.05.651767
PMID:40654943
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research paper | 本研究利用合成生物学方法改造BCG疫苗,以增强其激活和扩增Vγ9Vδ2 T细胞的能力,从而提高抗结核疫苗的效果 | 首次尝试通过改造BCG中的MEP途径来积累HMBPP,利用宿主对HMBPP的自我-非我识别机制增强疫苗效果 | 虽然GcpE过表达成功诱导了Vγ9Vδ2 T细胞扩增,但MEP途径多个基因的异位表达可能导致反馈抑制,仍需进一步研究以开发更有效的疫苗 | 开发更有效的抗结核疫苗 | BCG疫苗和Vγ9Vδ2 T细胞 | 合成生物学 | 结核病 | 合成生物学方法,基因工程 | NA | 基因组数据,细胞实验数据 | 356个调查基因组和人类Vγ9Vδ2 T细胞刺激实验 |
188 | 2025-07-29 |
Active learning of enhancers and silencers in the developing neural retina
2025-Jan-15, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2024.12.004
PMID:39778579
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研究论文 | 本文提出了一种主动学习方法来训练模型,以区分由光感受器转录因子CRX结合位点组成的增强子和沉默子 | 采用主动学习策略结合合成生物学和不确定性采样,迭代训练模型以区分功能相反的CRX结合位点 | 模型可能仍无法完全解释转录因子在不同背景下激活或抑制转录的具体机制 | 开发能够区分增强子和沉默子的深度学习模型 | 光感受器转录因子CRX的结合位点 | 机器学习 | NA | 主动学习、合成生物学、大规模并行报告基因检测 | 深度学习模型 | 基因组序列 | 几乎所有基因组中结合的CRX位点 |
189 | 2025-07-29 |
LIM-domain-only 4 (LMO4) enhances CD8+ T-cell stemness and tumor rejection by boosting IL-21-STAT3 signaling
2024-08-09, Signal transduction and targeted therapy
IF:40.8Q1
DOI:10.1038/s41392-024-01915-z
PMID:39117617
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研究论文 | 研究发现LMO4通过增强IL-21-STAT3信号通路,提高CD8+ T细胞的干细胞样特性及抗肿瘤能力 | 首次揭示LMO4通过结合JAK1增强STAT3信号传导,促进CD8+ T细胞的干细胞样特性和抗肿瘤功能 | 研究主要基于体外和小鼠模型,尚未在人体临床试验中验证 | 探索增强CD8+ T细胞干细胞样特性以提升T细胞疗法效果的分子机制 | CD8+ T细胞 | 免疫治疗 | 肿瘤 | CRISPR激活筛选、合成生物学方法、CRISPR/Cas9基因编辑 | NA | 基因表达数据、细胞功能实验数据 | NA |
190 | 2025-07-29 |
Reconstitution of the Bacterial Glutamate Receptor Channel by Encapsulation of a Cell-Free Expression System
2024-Mar-08, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/66595
PMID:38526087
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研究论文 | 本文展示了一种在合成细胞中重构细菌谷氨酸受体通道的方法 | 提出了一种基于封装和无细胞表达反应的方法,成功在合成细胞中重构膜蛋白 | 方法仅针对细菌谷氨酸受体进行了验证,未广泛测试其他膜蛋白 | 开发一种在合成细胞中重构膜蛋白的稳健方法 | 细菌谷氨酸受体(GluR0)和蛋白视紫红质信号肽 | 合成生物学 | NA | 无细胞表达系统(CFE) | NA | NA | NA |
191 | 2025-07-29 |
Activation domains can decouple the mean and noise of gene expression
2022-07-19, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2022.111118
PMID:35858548
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research paper | 研究探讨了激活结构域(ADs)如何影响基因表达的平均水平和噪声 | 揭示了激活结构域的强度和核浓度如何独立调控基因表达噪声,而不依赖于ADs类别的差异 | 未涉及具体疾病模型或临床应用验证 | 探索基因表达噪声的调控机制及其潜在应用 | 基因表达的随机波动(噪声) | 合成生物学 | NA | NA | NA | 理论分析 | NA |
192 | 2025-07-26 |
Isoprenoids in eukaryotic phytoplankton: metabolic diversity, eco-physiology and biotechnological opportunities
2025-Jul-25, Plant physiology
IF:6.5Q1
DOI:10.1093/plphys/kiaf314
PMID:40707021
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综述 | 本文全面评估了不同微藻类群中异戊二烯类化合物的生物合成与调控,并探讨了其生理生态意义和生物技术潜力 | 系统比较了叶绿体定位的MEP途径和胞质MVA途径的差异,揭示了藻类特有的酶适应和谱系特异性类胡萝卜素生物合成酶 | 对异戊二烯类生态功能的认识仍存在未解决的问题 | 阐明微藻中内源性异戊二烯类生物合成及其调控网络 | 真核浮游植物(微藻)中的异戊二烯类代谢 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
193 | 2025-07-26 |
Crucial roles of intracellular cyclic di-GMP in impacting the genes important for extracellular electron transfer by Geobacter metallireducens
2025-Jul-23, Applied and environmental microbiology
IF:3.9Q2
DOI:10.1128/aem.00727-25
PMID:40464557
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研究论文 | 研究细胞内c-di-GMP在Geobacter metallireducens细菌胞外电子传递(EET)中的作用 | 揭示了c-di-GMP通过调控多血红素细胞色素和菌毛蛋白PilA-N的基因表达,影响整个胞外电子传递过程 | c-di-GMP如何影响这些基因表达的具体机制尚不清楚 | 探究c-di-GMP在细菌胞外电子传递中的调控作用 | Geobacter metallireducens细菌 | 微生物学 | NA | 合成生物学方法 | NA | 基因表达数据 | 三种不同c-di-GMP水平的菌株(Gme-H, Gme-C, Gme-L) |
194 | 2025-07-26 |
Genetic "expiry-date" circuits control lifespan of synthetic scavenger bacteria for safe bioremediation
2025-Jul-19, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf703
PMID:40705927
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研究论文 | 本文设计了一种遗传'过期日期'电路,用于控制合成细菌的寿命,以实现安全的生物修复 | 通过前馈激活网络设计可调节寿命的遗传电路,结合合成小调控RNA和基于asd的辅助营养系统优化电路,降低基因表达泄漏 | NA | 开发一种生物控制策略,安全部署合成细菌于实际应用中 | 合成酚清除大肠杆菌 | 合成生物学 | NA | 遗传电路设计,合成小调控RNA | NA | NA | NA |
195 | 2025-07-26 |
Extracellular Peptide-Ligand Dimerization Actuator Receptor Design for Reversible and Spatially Dosed 3D Cell-Material Communication
2025-Jul-18, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00482
PMID:39705005
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研究论文 | 该研究设计了一种名为EPDA的合成受体平台,用于实现可逆和空间剂量控制的3D细胞-材料通信 | 开发了EPDA受体平台,通过肽配体二聚化实现可逆的细胞响应,并利用新型计算算法PETEI筛选最优单抗体 | 研究中仅测试了30种基于预测结合亲和力的单抗体,可能未涵盖所有潜在有效受体 | 桥接合成生物学和生物材料领域,开发能够感知和响应生物材料结合配体的跨膜受体 | 哺乳动物细胞和3D生物材料 | 合成生物学 | NA | 硫醇-降冰片烯化学,PETEI计算算法 | EPDA受体平台 | 荧光信号(GFP) | 超过2000种候选单抗体,最终测试了30种 |
196 | 2025-07-26 |
Integrating metagenomics and high-throughput screening for bioprospecting marine producers of Polyhydroxyalkanoates
2025-Jul-17, Letters in applied microbiology
IF:2.0Q4
DOI:10.1093/lambio/ovaf096
PMID:40674061
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研究论文 | 本研究通过宏基因组分析和高通量筛选技术,探索海洋环境中生产聚羟基脂肪酸酯(PHA)的微生物资源 | 结合宏基因组预测和荧光定量技术,有效解决了荧光筛选中的假阳性问题,并成功分离出高效PHA生产菌株 | 研究仅针对海洋环境,未涉及其他生态系统的PHA生产者 | 开发可持续生产生物降解材料PHA的微生物资源和技术平台 | 海洋环境中的微生物群落及其PHA合成潜力 | 生物技术 | NA | 宏基因组分析、气相色谱(GC)、高通量筛选 | NA | 宏基因组数据、荧光定量数据 | 从不同海洋生境中分离出102株PHA生产菌株 |
197 | 2025-07-26 |
Bacterial Therapeutics: Addressing the Affordability Gap in Cancer Therapy
2025-Jul-15, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-25-0870
PMID:40660814
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research paper | 探讨细菌疗法作为低成本替代方案在癌症治疗中的应用及其潜力 | 提出利用合成生物学和人工智能开发下一代细菌疗法,显著降低成本并提高安全性 | 未提及细菌疗法在临床试验中的具体效果和潜在副作用 | 解决癌症治疗中高昂费用的问题,探索低成本替代方案 | 细菌疗法在癌症治疗中的应用 | 合成生物学 | 癌症 | 合成生物学, 人工智能 | NA | NA | NA |
198 | 2025-07-26 |
Enhancing ELISA Sensitivity: From Surface Engineering to Synthetic Biology
2025-Jul-06, Biosensors
DOI:10.3390/bios15070434
PMID:40710084
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综述 | 本文综述了提高ELISA敏感性的策略,包括表面修饰、混合与洗涤效率提升、信号生成与放大技术的最新进展,以及合成生物学在其中的新兴作用 | 强调了无细胞合成生物学在提升ELISA敏感性中的新兴作用,介绍了如表达免疫分析、CRISPR联免分析(CLISA)和T7 RNA聚合酶联免传感分析(TLISA)等新技术 | NA | 提高ELISA的敏感性,以改善体外诊断(IVD)的准确性 | ELISA技术及其敏感性提升策略 | 生物技术 | NA | ELISA, 合成生物学, CRISPR, T7 RNA聚合酶 | NA | NA | NA |
199 | 2025-07-26 |
Three cytochrome P450 88A subfamily enzymes, CYP88A108, CYP88A164, and CYP88A222, act as β-amyrin 11-oxidases involved in triterpenoid biosynthesis in Melia azedarach L
2025-Jul, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.145362
PMID:40541870
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研究论文 | 本研究鉴定了Melia azedarach L.中三个CYP88A亚家族细胞色素P450基因作为β-香树脂醇11-氧化酶,参与三萜类化合物的生物合成 | 揭示了CYP88A亚家族酶在五环三萜和柠檬苦素类化合物生物合成中的双重功能,支持了结构保守驱动的功能趋同范式 | NA | 阐明Melia azedarach L.中五环三萜类化合物生物合成的酶学机制 | Melia azedarach L.中的CYP88A亚家族细胞色素P450基因 | 植物分子生物学 | NA | 转录组挖掘、烟草瞬时表达系统、酵母微粒体功能表征 | NA | 基因序列、酶活性数据 | 三个CYP88A亚家族基因(MaCYP88A108, MaCYP88A164, MaCYP88A222)和一个氧化角鲨烯环化酶(MaβAS1) |
200 | 2025-07-26 |
Core biological principles and tools stemming from basic Arabidopsis research
2025-Jul-01, The Plant cell
DOI:10.1093/plcell/koaf141
PMID:40479512
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综述 | 本文探讨了拟南芥在植物生物学研究中的核心作用及其对基础生物学过程的贡献 | 展示了拟南芥研究在免疫机制、基因组变异性、合成生物学和生物生产等领域的突破性进展 | 主要聚焦于拟南芥的研究,可能未涵盖其他模型生物的最新进展 | 探讨拟南芥在基础生物学研究中的贡献及其对更广泛生物领域的启示 | 拟南芥及其在免疫机制、基因组学、合成生物学等领域的应用 | 植物生物学 | 弗里德赖希共济失调 | 泛基因组学、重复扩增研究、合成生物学、生长素诱导降解技术 | NA | NA | NA |