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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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1981 | 2024-08-07 |
A pilot oral history of plant synthetic biology
2024-Apr-30, Plant physiology
IF:6.5Q1
DOI:10.1093/plphys/kiad585
PMID:38163646
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review | 本文通过采访8位植物合成生物学领域的创始人,记录并回顾了该领域的起源和发展 | 首次通过口述历史的方式,系统地记录了植物合成生物学的早期发展历程 | 由于植物合成生物学领域尚新,历史分析可能不够全面 | 捕捉植物合成生物学的起源和早期发展的本质 | 植物合成生物学的创始人和早期发展 | 合成生物学 | NA | NA | NA | 文本 | 8位领域的创始人 |
1982 | 2024-08-07 |
Probiotic-fermented edible herbs as functional foods: A review of current status, challenges, and strategies
2024-03, Comprehensive reviews in food science and food safety
IF:12.0Q1
DOI:10.1111/1541-4337.13305
PMID:38379388
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综述 | 本文综述了益生菌发酵食用草药作为功能性食品的当前研究状态、挑战和策略 | 强调了益生菌发酵食用草药中活性成分的生物转化及其健康益处 | NA | 探讨益生菌发酵食用草药在功能性食品中的应用及其健康益处 | 益生菌发酵食用草药及其功能性食品的应用 | NA | 慢性疾病 | NA | NA | NA | NA |
1983 | 2024-08-07 |
Tuning the ignition of CAR: optimizing the affinity of scFv to improve CAR-T therapy
2021-Dec-29, Cellular and molecular life sciences : CMLS
IF:6.2Q1
DOI:10.1007/s00018-021-04089-x
PMID:34966954
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综述 | 本文综述了单链可变片段(scFv)对嵌合抗原受体(CAR)功能的影响,并讨论了优化scFv亲和力的方法及其在CAR-T疗法中的应用 | 探讨了通过调整scFv亲和力来减轻CAR-T疗法中的靶点/非肿瘤毒性问题 | NA | 提供选择合适scFv用于CAR设计的初步指导 | scFv的亲和力优化及其对CAR功能的影响 | 生物技术 | NA | 合成生物学 | synNotch受体 | NA | NA |
1984 | 2024-08-07 |
Mechanisms supporting aminoadenine-based viral DNA genomes
2021-Dec-15, Cellular and molecular life sciences : CMLS
IF:6.2Q1
DOI:10.1007/s00018-021-04055-7
PMID:34910247
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研究论文 | 本文探讨了支持基于氨基腺嘌呤的病毒DNA基因组的机制 | 阐明了含有氨基腺嘌呤的DNA的生物合成途径以及腺嘌呤的排除机制 | NA | 研究病毒基因组中修饰核苷酸的生物合成途径及其在自然界中的分布 | 细菌噬菌体基因组中的2,6-二氨基嘌呤 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
1985 | 2024-08-07 |
An overview of signaling pathways regulating YAP/TAZ activity
2021-Jan, Cellular and molecular life sciences : CMLS
IF:6.2Q1
DOI:10.1007/s00018-020-03579-8
PMID:32748155
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综述 | 本文综述了调控YAP/TAZ活性的各种微环境信号和信号通路 | 提供了对YAP/TAZ信号调控机制的新认识,可能为生物材料、组织工程、再生医学和合成生物学等领域开辟新的治疗应用 | NA | 探讨YAP/TAZ的调控机制及其在生物学过程中的作用 | YAP/TAZ及其在细胞增殖、组织再生、细胞系命运决定、肿瘤发生和机械感应中的作用 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
1986 | 2024-08-07 |
Photosynthesis 2.0: Realizing New-to-Nature CO2-Fixation to Overcome the Limits of Natural Metabolism
2024-02-01, Cold Spring Harbor perspectives in biology
IF:6.9Q1
DOI:10.1101/cshperspect.a041669
PMID:37848245
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research paper | 本文探讨了通过合成生物学实现新型自然界未有的二氧化碳固定代谢途径,以克服自然光合作用的限制 | 提出了两种不同的策略:一是通过工程化植物实现碳中和或碳负性光呼吸代谢,如tatronyl-CoA途径,以提高二氧化碳吸收率;二是完全替代自然光合作用,引入如CETCH循环等替代性二氧化碳固定代谢途径,有望显著提高二氧化碳吸收率 | NA | 旨在通过合成生物学方法扩展植物代谢能力,以应对未来气候变化的挑战 | 工程化植物及其代谢途径 | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA |
1987 | 2024-08-07 |
Synthetic biology: ensuring the greatest global value
2013-Sep, Systems and synthetic biology
DOI:10.1007/s11693-013-9115-5
PMID:24432147
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研究论文 | 本文探讨了合成生物学(SynBio)的全球价值,并提出了基于健康影响基金(HIF)原则的解决方案 | 提出了基于健康影响基金(HIF)原则的解决方案,以确保合成生物学的利益和风险在全球范围内公平分配 | NA | 探讨合成生物学的全球价值及其在健康领域的应用 | 合成生物学的利益和风险分配 | NA | NA | 合成生物学(SynBio) | NA | NA | NA |
1988 | 2024-08-07 |
Effect of Quorum Sensing Molecules on the Quality of Bacterial Nanocellulose Materials
2024-May-07, ACS omega
IF:3.7Q2
DOI:10.1021/acsomega.3c10053
PMID:38737048
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研究论文 | 研究了群体感应分子对细菌纳米纤维素材料质量的影响 | 通过使用多种表面表征方法,揭示了特定群体感应信号分子对细菌纳米纤维素生物膜形态特性的影响 | 细菌纳米纤维素生物膜的生产和转化为实际形式存在挑战,主要受细胞密度异质性的影响 | 探讨群体感应分子如何影响细菌纳米纤维素生物膜的形态特性 | 细菌纳米纤维素生物膜及其在不同浓度群体感应信号分子下的形态特性 | 生物材料 | NA | 扫描电子显微镜, 能量散射光谱, 漫反射红外傅里叶变换光谱, 原子力显微镜 | NA | 生物膜 | 不同浓度的特定群体感应信号分子 |
1989 | 2024-08-07 |
Strategies, Achievements, and Potential Challenges of Plant and Microbial Chassis in the Biosynthesis of Plant Secondary Metabolites
2024-May-02, Molecules (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/molecules29092106
PMID:38731602
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综述 | 本文综述了植物和微生物底盘在植物次生代谢物生物合成中的策略、成就及潜在挑战 | 随着合成生物学的发展,更多研究聚焦于利用微生物进行异源合成 | 大规模种植宿主植物消耗土地资源且易受病虫害影响,化学合成的多步骤和高要求增加了生产成本,限制了其广泛应用 | 评估植物和微生物底盘在合成各种类型次生代谢物方面的表现,并探讨其面临的挑战及未来努力方向 | 植物次生代谢物 | NA | NA | 代谢工程 | NA | NA | NA |
1990 | 2024-08-07 |
Chalkophomycin Biosynthesis Revealing Unique Enzyme Architecture for a Hybrid Nonribosomal Peptide Synthetase and Polyketide Synthase
2024-Apr-25, Molecules (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/molecules29091982
PMID:38731473
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研究论文 | 本文研究了来自sp. CB00271的chalkophomycin的生物合成机制,揭示了其独特的非核糖体肽合成酶和聚酮合成酶的酶结构 | 首次揭示了chalkophomycin生物合成中独特的酶结构,涉及非核糖体肽合成酶和聚酮合成酶的混合体系 | NA | 阐明chalkophomycin的生物合成机制,并为通过合成生物学方法工程化chalkophomycin类似物奠定基础 | chalkophomycin的生物合成基因簇及其编码的酶 | 生物化学 | NA | 基因替换 | NA | DNA序列 | 涉及约31 kb的DNA区域,包含19个开放阅读框 |
1991 | 2024-08-07 |
Efficient biosynthesis of transglutaminase in Streptomyces mobaraensis via systematic engineering strategies
2024, Current research in food science
IF:6.2Q1
DOI:10.1016/j.crfs.2024.100756
PMID:38736907
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研究论文 | 本研究通过系统工程策略在重组的smL2020菌株中高效合成转谷氨酰胺酶(TGase) | 通过多重工程策略,包括启动子工程、优化信号肽和重组位点以及增加表达盒的拷贝数,实现了TGase活性的显著提升,达到了迄今为止报道的最高水平 | NA | 提高转谷氨酰胺酶在食品工业中的应用范围 | 转谷氨酰胺酶的合成与应用 | 生物技术 | NA | 系统工程策略 | NA | 酶活性数据 | 1000升发酵罐 |
1992 | 2024-08-07 |
Programming microbial population dynamics by engineered cell-cell communication
2011-Jul, Biotechnology journal
IF:3.2Q2
DOI:10.1002/biot.201100132
PMID:21681967
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review | 本文综述了通过工程化细胞间通信来编程微生物种群动态的最新进展 | 探讨了从单一物种到多物种、从单向到双向通信的工程化微生物生态系统中的细胞间通信 | NA | 旨在通过工程化基因电路编程细胞行为,特别是种群层面的细胞行为 | 工程化细胞间通信在微生物种群动态中的应用 | synthetic biology | NA | NA | NA | NA | NA |
1993 | 2024-08-07 |
Tailored UPRE2 variants for dynamic gene regulation in yeast
2024-May-07, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2315729121
PMID:38687789
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研究论文 | 本文通过创建UPRE2突变体库,筛选出具有增强响应性和更宽动态范围的元素,并研究了其与转录因子Hac1的相互作用,以提高酵母中重组蛋白和天然产物合成的效率 | 开发了新的UPRE2突变体,增强了与Hac1的结合亲和力,提高了基因表达的动态调控能力 | NA | 研究如何通过合成生物学方法优化酵母中的基因调控,以提高化学品和重组蛋白的生产效率 | UPRE2突变体及其在酵母细胞中的基因调控作用 | 合成生物学 | NA | 分子建模,定点突变 | NA | 基因序列 | 多个UPRE2突变体元素 |
1994 | 2024-08-07 |
OpenCell: A Low-cost, Open-Source, 3-in-1 device for DNA Extraction
2024-Feb-01, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.09.18.558349
PMID:37808818
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研究论文 | 介绍了一种低成本、开源的3合1实验室设备OpenCell,用于DNA提取 | OpenCell集成了珠磨机、微量离心机和涡旋混合器的功能,采用模块化附件和中央旋转无刷电机,设计紧凑且具有多种安全特性 | NA | 降低预算有限的实验室进行DNA提取的成本 | OpenCell设备的开发及其在DNA提取中的应用 | 合成生物学 | NA | 3D打印 | NA | NA | 使用OpenCell成功从菠菜中提取DNA,平均产量为2.3 μg |
1995 | 2024-08-07 |
OpenCell: A low-cost, open-source, 3-in-1 device for DNA extraction
2024, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0298857
PMID:38696375
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研究论文 | 介绍了一种低成本、开源的3合1实验室设备OpenCell,用于DNA提取 | OpenCell集成了珠磨机、微量离心机和涡旋混合器的功能,采用模块化附件和磁性连接,以及冗余安全特性 | NA | 解决预算有限的实验室进行高成本DNA提取的问题 | OpenCell设备及其在DNA提取中的应用 | 生物技术 | NA | DNA提取 | NA | DNA | 从Spinacia oleracea(菠菜)中成功分离DNA,平均产量为2.3 μg |
1996 | 2024-08-07 |
Mining the Utricularia gibba genome for insulator-like elements for genetic engineering
2023, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2023.1279231
PMID:38023853
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研究论文 | 本文通过分析Utricularia gibba(驼峰狸藻)的基因组,寻找潜在的绝缘子样序列,用于遗传工程 | 本文发现了两个与已发表元素(EXOB)性能相当且尺寸显著较小的绝缘子样元素 | 本文未能识别出选定间隔区与现有植物绝缘子样元素之间的保守基序 | 寻找新的绝缘子样序列,以精确控制多基因遗传工程和合成生物学中的转录 | Utricularia gibba的基因组中的绝缘子样序列 | 遗传工程 | NA | 基因组分析 | NA | 基因组数据 | 4,656个间隔区,10个选定的间隔区 |
1997 | 2024-08-07 |
Design and implementation of a biomolecular concentration tracker
2015-Feb-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/sb500024b
PMID:24847683
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研究论文 | 本文设计并实现了一种生物分子浓度跟踪器,利用合成蛋白质支架作为模块化和可调的负反馈机制,实现动态蛋白质浓度跟踪。 | 本文创新性地使用合成蛋白质支架作为模块化和可调的机制,通过负反馈实现生物分子浓度的动态跟踪。 | NA | 研究目的是开发一种动态和自适应的方法,以确保在活细胞中人工系统的恒定相对活性,不受内在和外在噪声的影响。 | 研究对象是合成蛋白质支架和其在生物分子浓度跟踪中的应用。 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 研究在Escherichia coli中进行,具体样本数量未提及。 |
1998 | 2024-08-07 |
Bacterial quorum sensing and metabolic incentives to cooperate
2012-Oct-12, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.1227289
PMID:23066081
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研究论文 | 研究了机会性病原体铜绿假单胞菌如何利用群体感应系统控制公共产品的生产,并探讨了这种系统如何通过代谢约束防止社会欺骗行为 | 展示了群体感应控制的私人产品表达如何对社会欺骗行为施加代谢约束,防止公共资源的悲剧 | NA | 探讨群体感应系统在控制公共产品生产和防止社会欺骗行为中的作用 | 铜绿假单胞菌的群体感应系统和其控制的细胞酶 | NA | NA | 群体感应 | NA | NA | NA |
1999 | 2024-08-07 |
Reversing the directionality of reactions between non-oxidative pentose phosphate pathway and glycolytic pathway boosts mycosporine-like amino acid production in Saccharomyces cerevisiae
2024-May-09, Microbial cell factories
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s12934-024-02365-6
PMID:38725068
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研究论文 | 研究通过改变非氧化戊糖磷酸途径与糖酵解途径之间的反应方向性,提高酵母中类海藻氨基酸的生产 | 提出了一种新的代谢工程策略,通过逆转糖酵解与非氧化戊糖磷酸途径之间的通量方向,增强类海藻氨基酸的生产 | NA | 探索调控类海藻氨基酸生产的细胞因子 | 类海藻氨基酸在酵母中的生产 | 合成生物学 | NA | 代谢工程 | NA | NA | NA |
2000 | 2024-08-07 |
Sender-receiver systems and applying information theory for quantitative synthetic biology
2015-Feb, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2014.08.005
PMID:25282688
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研究论文 | 本文探讨了发送-接收(S-R)系统在生物学中的应用,并利用信息论进行定量分析,特别是在合成生物学领域。 | 结合信息论和合成生物学,提供了对人工S-R系统的定量控制,并探讨了如何最大化信号传递的鲁棒性。 | 需要进一步发展更复杂的电路设计,以解释生物学意义。 | 研究如何通过信息论和合成生物学的结合,推动合成生物学的发展。 | 自然遗传、酶促和神经网络中的S-R系统。 | 合成生物学 | NA | 信息论 | NA | NA | NA |