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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2001 | 2025-10-05 |
Yarrowia lipolytica as a promising cell factory for microbial production of value-added nutraceuticals
2025, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2025.1673169
PMID:40948964
|
综述 | 总结解脂耶氏酵母作为细胞工厂生产高附加值营养保健品的工程策略与进展 | 系统整合代谢工程与合成生物学工具,重点突出细胞器区室化工程和生物传感器驱动筛选等先进策略 | NA | 开发解脂耶氏酵母作为可持续生产营养保健品的微生物平台 | 解脂耶氏酵母细胞工厂 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、合成生物学、系统生物学、多组学分析 | NA | 多组学数据 | NA | CRISPR-Cas9, 生物传感器 | 解脂耶氏酵母 | 代谢通路工程、异源基因表达优化、前体供应增强、竞争途径重定向 | 食品, 工业生物技术 |
| 2002 | 2025-10-05 |
Reprogramming cancer immunity with next-generation combination therapies
2025, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2025.1652047
PMID:40950404
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综述 | 本文全面分析新一代癌症免疫联合疗法的机制基础与临床整合策略 | 系统整合多模态免疫治疗策略,结合纳米技术、免疫工程和人工智能建模等前沿技术 | 存在免疫相关不良事件和治疗反应异质性等挑战 | 探讨通过新一代联合疗法重编程癌症免疫应答 | 癌症免疫治疗策略及其临床应用 | 肿瘤免疫学 | 癌症 | 多组学分析、纳米技术、人工智能建模 | NA | NA | NA | 免疫工程 | NA | NA | 医学 |
| 2003 | 2025-10-05 |
Utilizing the SacB-mediated gene editing system in Komagataeibacter xylinus to explore the function of bacterial cellulose synthase
2025-Nov, Journal of biotechnology
IF:4.1Q2
DOI:10.1016/j.jbiotec.2025.08.003
PMID:40774389
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研究论文 | 本研究开发了基于SacB的基因编辑系统,用于木葡糖酸醋杆菌的标记自由基因编辑,并探索细菌纤维素合酶功能 | 开发了pK18mobsacB系统实现高达83.33%效率的标记自由基因编辑,首次系统研究bcs操纵子对细菌纤维素合成和结构的影响 | NA | 开发高效基因编辑工具并研究细菌纤维素合酶功能 | 木葡糖酸醋杆菌CGMCC 2955及其细菌纤维素合成机制 | 合成生物学 | NA | SacB介导的基因编辑系统 | NA | 基因编辑效率数据、纤维素结构表征数据 | 木葡糖酸醋杆菌CGMCC 2955菌株 | pK18mobsacB, SacB系统 | Komagataeibacter xylinus(木葡糖酸醋杆菌) | 基因删除、插入和替换操作 | 生物技术,食品,医药,工业生物技术 |
| 2004 | 2025-10-05 |
Synthetic Biology for Designing Allostery and Its Potential Biomedical Applications
2025-Oct-15, Journal of molecular biology
IF:4.7Q1
DOI:10.1016/j.jmb.2025.169225
PMID:40409706
|
综述 | 本文探讨利用合成生物学原理设计蛋白质变构调控及其在生物医学领域的应用潜力 | 整合人工智能生成式蛋白质设计方法开发新型变构调控系统,实现对外部信号响应的精准蛋白质功能调控 | NA | 通过合成生物学方法设计蛋白质变构调控机制,开发新型治疗策略 | 蛋白质变构调控系统 | 合成生物学 | NA | 结构域插入、从头蛋白质开关设计、工程化变构机制 | AI生成式蛋白质设计 | NA | NA | NA | NA | 变构蛋白质开关、变构调节剂、配体结合响应系统 | 医学 |
| 2005 | 2025-10-05 |
Development and Recent Advances in SLIPT-PM: A Chemogenetic Platform for Manipulating Signaling at the Plasma Membrane
2025-Sep-12, Chembiochem : a European journal of chemical biology
IF:2.6Q3
DOI:10.1002/cbic.202500327
PMID:40400158
|
综述 | 本文回顾了SLIPT-PM化学遗传平台的发展历程、主要特性及其在细胞信号操控中的应用 | 开发了基于自定位配体的蛋白质易位技术,能够可逆且重复地操控细胞内膜信号传导 | NA | 开发用于解析细胞信号网络和工程化细胞功能的化学遗传工具 | 细胞信号蛋白和脂质 | 合成生物学 | NA | SLIPT(自定位配体诱导蛋白易位) | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 哺乳动物细胞, 大肠杆菌 | 蛋白质易位系统,光诱导空间调控蛋白招募,多重信号操控 | 医学 |
| 2006 | 2025-10-05 |
Engineering Proteinosomes with Cellular-Like Functionalities
2025-Sep-12, Chembiochem : a European journal of chemical biology
IF:2.6Q3
DOI:10.1002/cbic.202500448
PMID:40810682
|
综述 | 本文综述了蛋白质体作为仿生结构在模拟细胞功能方面的研究进展,包括构建方法、功能化策略及其在人工细胞模型和生物医学应用中的潜力 | 详细阐述了通过界面自组装、聚合物膜模板和混合脂质-聚合物系统构建具有可调渗透性、机械稳定性和刺激响应行为的蛋白质体,并强调了其在构建原型组织方面的创新 | NA | 探索蛋白质体作为人工细胞模型的构建方法和功能化策略 | 蛋白质体及其仿生结构 | 合成生物学 | 癌症 | 界面自组装、聚合物膜模板、混合脂质-聚合物系统 | NA | NA | NA | NA | NA | 刺激响应材料、多室结构、原型组织构建 | 医学 |
| 2007 | 2025-10-05 |
Pepper RNA variants reveal decoupling of HBC530 binding thermodynamics and fluorescence activation
2025-Jun-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.06.24.660466
PMID:40667133
|
研究论文 | 通过分析Pepper RNA变体揭示了HBC530结合热力学与荧光激活之间的解耦关系 | 发现配体识别与荧光强度之间存在解耦现象,并证明远端结构元件对结合热力学和荧光强度的重要影响 | 仅研究了53种变体,可能未覆盖所有关键序列变异 | 理解RNA适配体配体识别和荧光激活的序列-结构-功能关系,为理性设计荧光RNA适配体提供框架 | Pepper RNA适配体及其53种变体 | 合成生物学 | NA | RNA变体库构建、结合亲和力测定、荧光强度测量 | NA | 生物化学数据、荧光数据 | 53种Pepper变体 | NA | NA | 荧光RNA适配体 | 医学, 合成生物学 |
| 2008 | 2025-10-05 |
Mining unique cysteine synthetases and computational study on thoroughly eliminating feedback inhibition through tunnel engineering
2024-Oct, Protein science : a publication of the Protein Society
IF:4.5Q1
DOI:10.1002/pro.5160
PMID:39275998
|
研究论文 | 通过数据库挖掘获得高催化活性OPSS酶并利用隧道工程策略彻底消除其产物反馈抑制 | 采用半理性设计与隧道分析相结合的策略,成功构建了完全消除产物抑制且不牺牲催化效率的AsOPSS变体 | NA | 开发高效的L-半胱氨酸生物合成途径 | 来自Acetobacterium sp.的O-磷酸丝氨酸硫化氢酶(AsOPSS) | 合成生物学 | NA | 数据库挖掘、分子对接、分子动力学模拟、随机加速分子动力学模拟、伞形采样模拟 | NA | 酶活性数据、分子模拟数据 | NA | 隧道工程 | Acetobacterium sp. | 代谢途径工程 | 医药, 农业 |
| 2009 | 2025-10-05 |
Introduction to "Biomolecular Technologies"
2025-Aug-27, RSC chemical biology
IF:4.2Q2
DOI:10.1039/d5cb90031j
PMID:40843437
|
综述 | 介绍生物分子技术领域的最新进展及其在基础科学和实际应用中的机会 | 汇集了基于工程生物分子的多种技术,涵盖小分子、核酸和蛋白质,展示生物分子设计的模块化和可调性 | NA | 概述生物分子技术在生物催化、生物传感和合成生物学等领域的应用 | 工程生物分子(小分子、核酸、蛋白质) | 合成生物学 | NA | 生物分子工程 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 生物催化, 生物传感, 合成生物学 |
| 2010 | 2025-10-05 |
Gene duplication and clustering underlie the conservation and diversification of benzylisoquinoline alkaloid biosynthesis in plants
2025-Aug-18, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-63175-x
PMID:40826018
|
研究论文 | 本研究揭示了植物中苄基异喹啉生物碱(BIA)生物合成途径的保守性与多样化机制,重点关注基因复制和基因簇形成的作用 | 首次在木兰类植物中发现CYP80G介导的酚偶联反应,揭示了BIA骨架形成基因在木兰类和毛茛目之间的保守性,并发现CYP80B与4'OMT、6-OMT基因的动态簇聚现象 | 研究主要集中于蕺菜(Houttuynia cordata),对其他木兰类植物的BIA生物合成研究仍较少 | 探究植物中苄基异喹啉生物碱生物合成的进化机制和基因组织方式 | 蕺菜(Houttuynia cordata)及其他被子植物中的BIA生物合成基因 | 植物分子生物学 | NA | 功能分析、全基因组分析、酶学表征 | NA | 基因组数据、酶活性数据 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学 |
| 2011 | 2025-10-05 |
Protein structure prediction and design for high-throughput computing
2025-Jul-22, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.07.18.665594
PMID:40777508
|
研究论文 | 开发用于蛋白质结构预测和设计工具的容器化解决方案,以解决高计算需求和部署难题 | 开发了针对多种计算架构优化的容器化解决方案,并创建了OmniFold包装平台实现多工具并行运行和自动质量报告生成 | 未提及具体性能提升的量化数据或与其他部署方法的直接比较 | 解决蛋白质结构预测和设计工具的高计算需求和部署困难问题 | AlphaFold3、Chai-1、Boltz-2和RFdiffusion等蛋白质结构预测和设计工具 | 计算生物学 | NA | 容器化技术、GPU优化计算 | 深度学习模型 | 蛋白质结构数据 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学、疾病治疗 |
| 2012 | 2025-10-05 |
Application and research progress of MultiBac: A review
2024-Sep-06, Medicine
IF:1.3Q2
DOI:10.1097/MD.0000000000039333
PMID:39252306
|
综述 | 本文回顾了MultiBac技术的发展历程、特点及其在生物技术和制药领域的应用 | 引入相对较新的MultiBac技术,整合合成生物学方法增强多功能性 | 存在某些缺陷,研究人员需根据具体需求考虑其局限性 | 为基础研究人员提供新的蛋白表达方法 | MultiBac技术及其在重组蛋白生产和复杂蛋白复合物研究中的应用 | 生物技术 | NA | MultiBac技术 | NA | NA | NA | MultiBac | 昆虫细胞 | NA | 制药, 生物技术 |
| 2013 | 2025-10-05 |
Peptide Coacervates Can Protect Sequestered Oligonucleotides from Nucleases and Release Them for Transcription and Translation
2025-Sep-08, Biomacromolecules
IF:5.5Q1
DOI:10.1021/acs.biomac.5c00600
PMID:40802871
|
研究论文 | 本文证明肽凝聚层可通过液-液相分离形成无膜细胞器,有效隔离并保护短DNA报告基因和功能性荧光素酶基因免受多种核酸酶降解 | 发现基于聚组氨酸肽与ATP静电相互作用的关联性凝聚层能高效保护寡核苷酸,并可通过离子强度或温度变化实现可控释放 | 基于黏附-间隔模型肽的简单凝聚层保护效果有限 | 开发能够保护和可控释放功能性遗传物质的生物相容性递送系统 | 短DNA报告基因和功能性荧光素酶基因 | 合成生物学 | NA | 无细胞转录翻译系统 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学, 合成生物学 |
| 2014 | 2025-10-05 |
Expanding Immunotherapy Beyond CAR T Cells: Engineering Diverse Immune Cells to Target Solid Tumors
2025-Sep-05, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers17172917
PMID:40941014
|
综述 | 本文综述了除CAR-T细胞外多种工程化免疫细胞在实体瘤治疗中的最新进展 | 探讨γδ T细胞、iNKT细胞、病毒特异性T细胞、NK细胞及髓系效应细胞等作为CAR平台替代方案的独特优势 | NA | 扩展细胞免疫疗法在实体瘤治疗中的应用范围 | 工程化免疫细胞(γδ T细胞、iNKT细胞、NK细胞、巨噬细胞、树突状细胞等) | 合成生物学 | 实体瘤 | 合成生物学、人工智能 | NA | NA | NA | CAR工程技术 | 人类免疫细胞 | 嵌合抗原受体(CAR)设计 | 医学 |
| 2015 | 2025-10-05 |
One-pot cloning and protein expression platform for genetic engineering
2025-Aug-29, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.08.28.672974
PMID:40909620
|
研究论文 | 开发了一种集成突变、质粒组装和功能蛋白测试的一锅法克隆与蛋白表达平台 | 将Golden Gate克隆与无细胞转录翻译系统结合,实现无需中间纯化或细菌扩增的遗传变异高效生成与筛选 | NA | 建立高通量克隆和蛋白质工程的通用自动化方法 | 荧光蛋白、荧光素酶、抗生素转化酶和紫色杆菌素生物合成途径 | 合成生物学 | NA | Golden Gate克隆、无细胞转录翻译 | NA | NA | NA | Golden Gate Assembly | 无细胞系统 | 生物传感器、代谢途径 | 工业生物技术 |
| 2016 | 2025-10-05 |
Molecular Mechanisms of Herbicide Resistance in Rapeseed: Current Status and Future Prospects for Resistant Germplasm Development
2025-Aug-26, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26178292
PMID:40943213
|
综述 | 系统总结油菜除草剂抗性分子机制及抗性种质开发策略 | 首次系统整合非靶标抗性机制、多组学与AI技术在抗除草剂油菜育种中的应用潜力 | NA | 为抗除草剂油菜的可持续发展提供安全有效的创新方法指导 | 油菜及其除草剂抗性机制 | 农业生物技术 | NA | 基因编辑、合成生物学、定向蛋白进化、多组学分析 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 油菜 | NA | 农业 |
| 2017 | 2025-10-05 |
Unlocking Casein Bioactivity: Lactic Acid Bacteria and Molecular Strategies for Peptide Release
2025-Aug-22, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26178119
PMID:40943047
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综述 | 本文综述了利用乳酸菌和分子生物学策略释放牛β-酪蛋白中生物活性肽的方法 | 系统整合合成生物学、分子生物技术和系统生物学方法增强β-酪蛋白源生物活性肽的靶向发现与生产 | NA | 提高β-酪蛋白源生物活性肽的靶向发现和生产效率 | 牛β-酪蛋白中的生物活性肽 | 合成生物学 | NA | CRISPR/Cas系统、多组学方法(基因组学、转录组学、蛋白质组学、代谢组学) | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 乳酸菌 | 诱导型表达平台、无细胞系统 | 食品, 医药 |
| 2018 | 2025-10-05 |
Microbial Biosensor for Sensing and Treatment of Intestinal Inflammation
2025-Jul, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202504364
PMID:40323169
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研究论文 | 开发了一种能够检测和治疗肠道炎症的微生物生物传感器 | 首次开发了针对临床验证生物标志物钙卫蛋白的合成生物传感器,兼具诊断记录和治疗功能 | NA | 开发用于肠道疾病诊断和治疗的合成生物系统 | 肠道炎症生物标志物钙卫蛋白 | 合成生物学 | 肠道炎症疾病 | 合成生物学技术 | NA | 生物分子数据 | 两种独立的小鼠结肠炎模型 | CRISPR-Cas9 | 微生物 | 锌摄取调节因子(Zur)控制启动子与记忆电路耦合的生物传感器,结合抗炎细胞因子IL10产生系统 | 医学 |
| 2019 | 2025-10-05 |
A quantitative analysis of biosafety and biosecurity using attack trees in low-to-moderate risk scenarios: Evidence from iGEM
2025-06, Risk analysis : an official publication of the Society for Risk Analysis
IF:3.0Q1
DOI:10.1111/risa.17678
PMID:39552172
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研究论文 | 本研究通过攻击树方法对iGEM竞赛中的生物安全和生物安保风险进行定量分析 | 将传统定性风险分析扩展为定量评估,构建了针对iGEM项目的攻击树模型 | 主要针对中低风险场景,且参与者经验相对不足可能影响评估准确性 | 评估合成生物学项目中的生物安全和生物安保风险 | 2022年iGEM竞赛项目 | 合成生物学 | NA | 攻击树分析 | 攻击树模型 | 项目风险评估数据 | 2022年iGEM项目 | iGEM | NA | NA | 生物安全 |
| 2020 | 2025-10-05 |
The growth benefits and toxicity of quinone biosynthesis are balanced by a dual regulatory mechanism and substrate limitations
2025-Sep-10, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mbio.00887-25
PMID:40788026
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研究论文 | 本研究揭示了乳酸菌中醌类前体DHNA生物合成的双相调控机制及其与底物限制的协同作用 | 发现MenF和MenD酶通过可逆通量和变构反馈抑制形成双相调控模式,并首次阐明底物可用性对DHNA过量生产的限制作用 | 研究聚焦于乳酸菌中的DHNA调控机制,在其他微生物中的普适性仍需验证 | 阐明微生物调控醌类水平的分子机制,为代谢工程改造微生物生产醌类提供理论基础 | 乳酸菌中醌类前体1,4-二羟基-2-萘甲酸(DHNA)的生物合成调控机制 | 合成生物学 | NA | 合成生物学方法、数学模型 | 数学模型 | 酶活性数据、代谢通量数据 | NA | 合成生物学方法 | 乳酸菌 | 醌类生物合成途径调控网络 | 工业生物技术 |