合成生物学相关文章
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当前共找到 3041 篇文献，本页显示第 2021 - 2040 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2021 | 2024-08-07 |
The biosynthetic logic and enzymatic machinery of approved fungi-derived pharmaceuticals and agricultural biopesticides
2024-Apr-24, Natural product reports
IF:10.2Q1
DOI:10.1039/d3np00040k
PMID:37990930
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研究论文 | 本文探讨了真菌来源的药物和农业生物农药的生物合成逻辑和酶机制 | 介绍了通过合成生物学对现有药物进行合理设计和系统生产新化学结构的方法 | 开发新药物的时间和成本仍然很高 | 最大化现有药物的利用率，通过合成生物学设计新的化学结构 | 真菌来源的天然产物及其生物合成基因簇 | NA | NA | 代谢工程，途径重编程，细胞工厂开发 | NA | 基因组数据 | NA |
| 2022 | 2024-08-07 |
Multiplex genetic manipulations in Clostridium butyricum and Clostridium sporogenes to secrete recombinant antigen proteins for oral-spore vaccination
2024-Apr-24, Microbial cell factories
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s12934-024-02389-y
PMID:38659027
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研究论文 | 本文通过基因工程手段改造梭状芽孢杆菌，使其能够分泌重组抗原蛋白，用于口服疫苗的研发 | 利用非典型翻译起始密码子AUU，成功克服了在E. coli中克隆困难蛋白的挑战，并实现了在梭状芽孢杆菌中的重组蛋白分泌 | NA | 探索利用梭状芽孢杆菌作为口服疫苗载体的可能性 | 梭状芽孢杆菌C. butyricum和C. sporogenes | 生物技术 | 癌症, 病毒性疾病 | 基因工程 | NA | 蛋白质 | 涉及多种梭状芽孢杆菌菌株和重组抗原蛋白 |
| 2023 | 2024-08-07 |
A model-driven approach to upcycling recalcitrant feedstocks in Pseudomonas putida by decoupling PHA production from nutrient limitation
2024-Apr-23, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2024.113979
PMID:38517887
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研究论文 | 本研究通过模型驱动的方法，利用合成生物学技术重新引导碳流并解除调控限制，实现了在营养非限制条件下提高Pseudomonas putida中PHA产量 | 成功在生长阶段实现PHA生产，达到高达46%的PHA/细胞干重，并验证了使用酶解聚乙烯对苯二甲酸酯作为原料的上循环场景 | NA | 克服传统PHA生产生物过程的复杂性，推动PHA生产技术的发展 | Pseudomonas putida菌株及PHA生产 | 合成生物学 | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA |
| 2024 | 2024-08-07 |
Chromosome-level Alstonia scholaris genome unveils evolutionary insights into biosynthesis of monoterpenoid indole alkaloids
2024-May-17, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.109599
PMID:38646178
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研究论文 | 本研究通过使用纳米孔和Hi-C数据组装了高质量的染色体水平Alstonia scholaris基因组，旨在深入了解单萜吲哚生物碱（MIAs）的生物合成 | 首次组装了Alstonia scholaris的高质量染色体水平基因组，并发现了与MIAs生物合成途径相关的基因簇 | NA | 探索Alstonia scholaris中单萜吲哚生物碱的生物合成及其进化起源 | Alstonia scholaris植物及其基因组 | 数字病理学 | 癌症 | 纳米孔测序，Hi-C | NA | 基因组数据 | 一个Alstonia scholaris样本 |
| 2025 | 2024-08-07 |
Metal-Organic Framework-Mediated Delivery of Nucleic Acid across Intact Plant Cells
2024-Apr-17, ACS applied materials & interfaces
IF:8.3Q1
DOI:10.1021/acsami.3c19571
PMID:38564422
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research paper | 本研究探讨了利用金属有机框架（MOFs）通过渗透方式将核酸递送至完整植物细胞的方法 | 本研究采用了小尺寸的ZIF-8纳米颗粒（小于20 nm），有效实现了DNA/RNA向叶片和根部的递送，并展示了其在保护RNA免受RNase降解和通过递送siRNA沉默内源基因方面的应用 | NA | 解决植物细胞壁和完整细胞膜对基因递送的挑战 | 植物细胞和核酸递送 | NA | NA | 金属有机框架（MOFs） | NA | DNA/RNA | 叶片和根部 |
| 2026 | 2024-08-07 |
Strategies for the efficient biosynthesis of β-carotene through microbial fermentation
2024-Apr-12, World journal of microbiology & biotechnology
IF:4.0Q2
DOI:10.1007/s11274-024-03955-7
PMID:38607448
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综述 | 本文综述了通过微生物发酵高效合成β-胡萝卜素的研究进展和策略 | 介绍了利用廉价碳源合成β-胡萝卜素以及提出进一步提高β-胡萝卜素产量的新策略 | NA | 总结天然类胡萝卜素产生菌和代谢工程策略在工程微生物异源合成β-胡萝卜素中的应用 | β-胡萝卜素的微生物发酵合成 | NA | 心血管疾病 | 微生物发酵 | NA | NA | NA |
| 2027 | 2024-08-07 |
Machine learning-aided design and screening of an emergent protein function in synthetic cells
2024-Mar-05, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-46203-0
PMID:38443351
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研究论文 | 本文探讨了利用机器学习辅助设计和筛选合成细胞中新兴蛋白质功能的方法 | 本文首次描述了如何通过计算和体外实验筛选机器学习生成的蛋白质变体，这些变体能够在细胞内形成时空模式 | 本文仅展示了原理验证，尚未广泛应用于实际工业和生物医学应用 | 研究如何利用机器学习设计合成蛋白质，以工程化细胞功能 | 新兴蛋白质功能，如细胞内时空自组织能力 | 机器学习 | NA | 机器学习 | 条件生成模型 | 蛋白质结构数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 2028 | 2024-08-07 |
A synthetic biology approach for the treatment of pollutants with microalgae
2024, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2024.1379301
PMID:38646010
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综述 | 本文综述了利用合成生物学方法通过微藻处理污染物的最新进展 | 合成生物学有望通过扩大处理目标范围和提高污染物去除率来增强基于微藻的技术 | 需要扩展工具，包括开发通用克隆工具包和适应更广泛的微藻物种的遗传工程工具 | 探讨合成生物学在微藻污染物去除中的应用 | 微藻及其在污染物去除中的作用 | NA | NA | CRISPR/Cas9, TALENs | NA | NA | NA |
| 2029 | 2024-08-07 |
Emulating nonribosomal peptides with ribosomal biosynthetic strategies
2023-Jan-04, RSC chemical biology
IF:4.2Q2
DOI:10.1039/d2cb00169a
PMID:36685251
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综述 | 本文综述了利用核糖体生物合成策略模拟非核糖体肽的最新进展 | 探讨了非核糖体肽和核糖体合成及翻译后修饰肽的共同结构特征，并强调了通过核糖体途径工程模拟非核糖体肽的合成生物学策略 | NA | 旨在概述这一新兴研究领域的最新进展 | 非核糖体肽和核糖体合成及翻译后修饰肽 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2030 | 2024-08-07 |
Interfacing non-enzymatic catalysis with living microorganisms
2021-Aug-05, RSC chemical biology
IF:4.2Q2
DOI:10.1039/d1cb00072a
PMID:34458824
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综述 | 本文综述了非酶催化与细胞代谢界面的新兴方法，用于生产高价值小分子和聚合物 | 该领域结合了合成化学和合成生物学，为可持续化学工业提供了广阔潜力 | NA | 探讨非酶催化与微生物代谢的界面，以及其在高价值分子生产中的应用 | 非酶催化与细胞代谢的界面，以及其在生物聚合物和分子生产中的应用 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2031 | 2024-08-07 |
Arabinose-Induced Catabolite Repression as a Mechanism for Pentose Hierarchy Control in Clostridium acetobutylicum ATCC 824
2018 Sep-Oct, mSystems
IF:5.0Q1
DOI:10.1128/mSystems.00064-18
PMID:30374459
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研究论文 | 本研究探讨了Clostridium acetobutylicum ATCC 824中阿拉伯糖诱导的分解代谢物阻遏作为戊糖利用层次控制机制的特性 | 揭示了通过预测的Crh进行转录调控的新机制，该机制控制碳水化合物利用的层次，对指导化学品生产的稳健遗传工程策略至关重要 | NA | 研究Clostridium acetobutylicum中戊糖利用层次的转录调控机制 | Clostridium acetobutylicum ATCC 824中的戊糖利用层次 | 生物工程 | NA | 转录组测序（RNA-Seq） | NA | 转录组数据 | NA |
| 2032 | 2024-08-07 |
Integration of transcriptional inputs at promoters of the arabinose catabolic pathway
2010-Jun-02, BMC systems biology
DOI:10.1186/1752-0509-4-75
PMID:20525212
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研究论文 | 本文通过合成生物学方法开发了一种能够在活体内实时测量转录因子活性的报告系统，并利用该系统研究了阿拉伯糖分解代谢途径中四个启动子的转录输入整合规则 | 本文采用合成生物学方法，开发了一种新的报告系统来测量活体内的转录因子活性，避免了传统方法中对细胞内浓度、结合亲和力和反应速率的测量需求 | NA | 研究转录因子在活体内的活性以及不同启动子如何整合共同的转录输入 | 阿拉伯糖分解代谢途径中的四个启动子 | 合成生物学 | NA | 合成生物学方法 | 简单模型 | 转录因子活性数据 | NA |
| 2033 | 2024-08-07 |
[Development the agricultural synthesis biology course for postgraduates]
2024-Apr-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.230539
PMID:38658161
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research paper | 本文介绍了为研究生开设的农业合成生物学课程的开发 | 该课程强调跨学科合作、创新和新技术实际应用，旨在培养学生解决生物育种领域关键科技问题的能力 | NA | 旨在培养研究生在生物育种领域的科技创新能力 | 研究生 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2034 | 2024-08-07 |
Metabolic engineering strategies for de novo biosynthesis of sterols and steroids in yeast
2021-Nov-05, Bioresources and bioprocessing
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s40643-021-00460-9
PMID:38650187
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综述 | 本文综述了基于调控机制的代谢工程策略，用于提高酵母中甾醇和甾体化合物的从头生物合成 | 介绍了酵母中一些典型甾醇和甾体化合物的最新从头合成进展 | 讨论了当前面临的挑战和未来展望 | 提高酵母中甾醇和甾体化合物的从头生物合成效率 | 甾醇和甾体化合物 | 代谢工程 | NA | 代谢工程 | NA | NA | NA |
| 2035 | 2024-08-07 |
Engineering a synthetic gene circuit for high-performance inducible expression in mammalian systems
2024-Apr-17, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-47592-y
PMID:38632224
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研究论文 | 本文介绍了一种用于哺乳动物系统中高表现诱导表达的合成基因电路CASwitch的设计与应用 | CASwitch结合了Coherent Feed-Forward Loop和Mutual Inhibition两种网络结构，以及CRISPR-Cas内切酶CasRx和Tet-On3G诱导基因系统，实现了在不修改转录因子或启动子的情况下，减少泄漏表达同时保持高表达 | NA | 设计并验证一种新的合成基因电路，用于在哺乳动物系统中实现高效诱导基因表达 | 合成基因电路CASwitch及其在不同生物技术应用中的性能 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas | 合成基因电路 | 基因表达数据 | NA |
| 2036 | 2024-08-07 |
CRISPR-COPIES: an in silico platform for discovery of neutral integration sites for CRISPR/Cas-facilitated gene integration
2024-Apr-12, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkae062
PMID:38346683
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研究论文 | 开发了一个名为CRISPR-COPIES的计算平台，用于发现CRISPR/Cas系统辅助基因整合的中性整合位点 | 利用ScaNN模型进行基于嵌入的最近邻搜索，快速准确地识别细菌和真菌基因组中的基因间位点 | NA | 解决CRISPR/Cas系统在基因整合中寻找最佳染色体位点的难题 | CRISPR/Cas系统的中性整合位点 | 合成生物学 | NA | CRISPR/Cas系统 | ScaNN | 基因组数据 | 涉及三种不同物种：酿酒酵母、Cupriavidus necator和HEK293T细胞 |
| 2037 | 2024-08-07 |
Peptide nucleic acid-assisted generation of targeted double-stranded DNA breaks with T7 endonuclease I
2024-Apr-12, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkae148
PMID:38421613
|
研究论文 | 本文利用γ-修饰的肽核酸（γPNAs）促进靶向特异性DNA入侵，并使用T7核酸内切酶I（T7EI）识别并切割γPNA入侵的DNA，实现双链DNA断裂（DSBs）的引入。 | 开发了一种新的PNA引导的T7EI（PG-T7EI）技术，该技术能够作为可编程核酸酶，在体外广泛条件下生成单个或多个特定的DSBs，并具有在大型基因组操作中应用的潜力。 | NA | 探索和扩展DNA操作技术，包括体外和体内的克隆、大片段DNA组装和基因编辑。 | γ-修饰的肽核酸（γPNAs）和T7核酸内切酶I（T7EI）在DNA操作中的应用。 | 生物技术 | NA | 肽核酸（PNA）和T7核酸内切酶I（T7EI） | NA | DNA | NA |
| 2038 | 2024-08-07 |
Revealing the grammar of small RNA secretion using interpretable machine learning
2024-Apr-10, Cell genomics
IF:11.1Q1
DOI:10.1016/j.xgen.2024.100522
PMID:38460515
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研究论文 | 本文介绍了ExoGRU机器学习模型，用于预测小RNA从初级RNA序列中的分泌概率，并通过实验验证了其性能 | 开发了ExoGRU模型和exoCLIP技术，揭示了小RNA分泌的cis和trans因子，包括已知和新发现的RNA结合蛋白 | NA | 揭示小RNA分泌的生物学机制，并探索其在治疗和合成生物学中的应用 | 小RNA的分泌机制及其相关的RNA结合蛋白 | 机器学习 | NA | 机器学习 | ExoGRU | RNA序列 | NA |
| 2039 | 2024-08-07 |
Self-assembly of stabilized droplets from liquid-liquid phase separation for higher-order structures and functions
2024-Apr-09, Communications chemistry
IF:5.9Q1
DOI:10.1038/s42004-024-01168-5
PMID:38594355
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综述 | 本文综述了通过液-液相分离产生的动态微尺度液滴的稳定化策略及其在合成生物学和生物医学材料中的应用 | 探讨了如何通过自组装使稳定化的液滴形成更高阶结构，展示协同功能，以充分发挥其在自下而上合成生物学和生物医学应用中的潜力 | NA | 探讨液滴稳定化及其在合成生物学和生物医学材料中的应用 | 液-液相分离产生的动态微尺度液滴 | NA | NA | 液-液相分离 (LLPS) | NA | NA | NA |
| 2040 | 2024-08-07 |
Light Color-Controlled pH-Adjustment of Aqueous Solutions Using Engineered Proteoliposomes
2024-Apr, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202307524
PMID:38342618
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研究论文 | 本文介绍了一种利用工程化蛋白脂质体通过不同颜色的光控制微升尺度水溶液pH值的系统 | 该系统利用两种光驱动质子泵——细菌视紫红质和蓝光吸收蛋白视紫红质Med12，在脂质膜中方向相反地排列，将不同颜色的光转化为特定的pH变化 | NA | 开发一种在微升尺度上控制pH值的方法，适用于研究、医学和工业应用 | 工程化蛋白脂质体和光驱动质子泵 | 合成生物学 | NA | 光驱动质子泵 | NA | 溶液pH值 | NA |