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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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2041 | 2024-08-07 |
To be or not to be a cytochrome: electrical characterizations are inconsistent with Geobacter cytochrome 'nanowires'
2024, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2024.1397124
PMID:38633696
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研究论文 | 本文通过电学特性分析,对Geobacter细胞色素'纳米线'的身份进行了探讨 | 结合先前的结构计算和动力学分析,提出了至少需要约7条细胞色素'纳米线'来承载细胞的呼吸通量 | 文章指出先前的电学和光谱结构表征可能因实验伪影和样品杂质而不适用于已知的细胞色素纤维 | 阐明生理金属-微生物相互作用的机制,并推进合成生物学努力以优化这些相互作用 | Geobacter细胞色素的'纳米线' | 生物学 | NA | 低温电子显微镜 | NA | 电学和光谱数据 | NA |
2042 | 2024-08-07 |
Heterologous synthesis of the complex homometallic cores of nitrogenase P- and M-clusters in Escherichia coli
2023-Oct-31, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2314788120
PMID:37871225
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研究论文 | 本文报道了在非固氮宿主大肠杆菌中异源合成氮酶P-和M-簇核心的成功 | 首次通过生化和光谱分析证明了在非固氮宿主中成功合成P-和L-簇 | NA | 研究氮酶的异源表达及其生物合成机制 | 氮酶的P-和M-簇核心 | 生物化学 | NA | 电子顺磁共振(EPR)、X射线吸收光谱(XAS)/扩展X射线吸收精细结构(EXAFS) | NA | 生化数据 | NA |
2043 | 2024-08-07 |
Research progress of multi-enzyme complexes based on the design of scaffold protein
2023-Oct-23, Bioresources and bioprocessing
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s40643-023-00695-8
PMID:38647916
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综述 | 本文综述了基于支架蛋白设计的多酶复合体在分子酶工程中的设计策略和应用进展 | NA | NA | 探讨多酶复合体的设计策略及其在合成生物学中的应用 | 多酶复合体及其在酶级联反应中的应用 | 分子酶工程 | NA | NA | NA | NA | NA |
2044 | 2024-08-07 |
De novo synthesis of nervonic acid and optimization of metabolic regulation by Yarrowia lipolytica
2023-Oct-06, Bioresources and bioprocessing
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s40643-023-00689-6
PMID:38647797
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研究论文 | 本研究通过合成生物学方法在Yarrowia lipolytica中构建了nervonic酸的从头合成途径,并通过代谢工程和发酵优化进一步提高了nervonic酸的产量 | 成功表达和评估了来自不同生物的异源延长酶和脱饱和酶,用于在Y. lipolytica中生产nervonic酸,并分析了添加菜籽油作为辅助碳源对nervonic酸生产的潜力 | NA | 开发一种高效的生产nervonic酸的方法,以替代传统的天然提取或化学合成方法 | nervonic酸的合成及其在Yarrowia lipolytica中的代谢调控 | 合成生物学 | 脑神经系统疾病 | 代谢工程 | NA | NA | 最高浓度达到185.0 mg/L |
2045 | 2024-08-07 |
Structural basis for topological regulation of Tn3 resolvase
2023-02-22, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkac733
PMID:36100255
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研究论文 | 本文通过新的结构和生化数据,提出了一种新的Tn3解离酶复合体(synaptosome)的详细模型,并讨论了其如何利用DNA拓扑结构来调节重组酶的酶活性 | 本文提出了一个新的、详细的Tn3解离酶复合体模型,该模型基于新的结构和生化数据,解决了之前模型与实验数据不一致的问题 | NA | 研究Tn3解离酶如何通过DNA拓扑结构来调节其酶活性 | Tn3解离酶及其复合体(synaptosome) | NA | NA | NA | NA | 结构和生化数据 | NA |
2046 | 2024-08-07 |
Construction of the genetic switches in response to mannitol based on artificial MtlR box
2023-Jan-30, Bioresources and bioprocessing
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s40643-023-00634-7
PMID:38647829
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研究论文 | 本文介绍了一种可靠的工作流程,用于设计两种类型的遗传元件:基于MtlR盒的开关元件和基于catabolite control protein A (CcpA)盒的转录调控元件,这些元件能够响应甘露醇进行ON/OFF状态的选择。 | 本研究通过理性设计MtlR盒和CcpA盒,实现了对遗传开关的灵活调控,显著提高了开关对诱导物的敏感性,并大幅降低了OFF状态的值。 | 由于对特定转录因子与其目标基因相互作用的分子机制理解不足,遗传开关的理性设计进展有限。 | 设计新型的遗传开关,以在合成生物学中实现代谢途径的精确控制。 | 基于MtlR盒和CcpA盒的遗传开关元件。 | 合成生物学 | NA | 遗传工程 | NA | 遗传元件 | NA |
2047 | 2024-08-07 |
Minimization and optimization of α-amylase terminator for heterologous protein production in Bacillus licheniformis
2022-Oct-10, Bioresources and bioprocessing
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s40643-022-00597-1
PMID:38647575
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研究论文 | 本研究对芽孢杆菌中的α-淀粉酶终止子T1进行了特性分析和优化,以提高其在异源蛋白生产中的终止效率 | 通过多方面优化策略,成功提高了终止子T1的终止效率,并验证了其在蛋白表达中的通用性 | NA | 解决芽孢杆菌中缺乏可用和通用终止子的问题,扩展合成生物学工具箱 | 芽孢杆菌中的α-淀粉酶终止子T1及其优化 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
2048 | 2024-08-07 |
Towards green biomanufacturing of high-value recombinant proteins using promising cell factory: Chlamydomonas reinhardtii chloroplast
2022-Aug-13, Bioresources and bioprocessing
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s40643-022-00568-6
PMID:38647750
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综述 | 本文综述了利用Chlamydomonas reinhardtii叶绿体作为绿色工厂生产重组蛋白的最新技术进展及其影响因素 | 探讨了Chlamydomonas reinhardtii叶绿体作为合成生物学平台的巨大潜力,并介绍了新的遗传工具和策略 | 需要开发更多针对叶绿体的技术和工具包以实现高效的标记无编辑,并探索影响蛋白表达的新遗传元素和选择标记 | 探讨如何利用Chlamydomonas reinhardtii叶绿体高效生产重组蛋白 | Chlamydomonas reinhardtii叶绿体及其在重组蛋白生产中的应用 | NA | NA | 遗传工程 | NA | NA | NA |
2049 | 2024-08-07 |
Improved succinic acid production through the reconstruction of methanol dissimilation in Escherichia coli
2022-May-31, Bioresources and bioprocessing
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s40643-022-00547-x
PMID:38647636
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研究论文 | 本研究通过在E. coli Suc260中引入一碳代谢途径,提高了从甲醇和甲酸等一碳原料生产琥珀酸的能力 | 通过合理构建甲醇代谢途径和固定化技术,提高了琥珀酸的产量和细胞对不良环境的抵抗力 | NA | 验证通过赋予生产者甲醇代谢途径来增强还原代谢物生产的可能性 | E. coli Suc260中的甲醇代谢途径和琥珀酸生产 | 合成生物学 | NA | 固定化技术 | NA | 代谢途径 | NA |
2050 | 2024-08-07 |
Biotechnological advances for improving natural pigment production: a state-of-the-art review
2022-Jan-28, Bioresources and bioprocessing
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s40643-022-00497-4
PMID:38647847
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综述 | 本文综述了利用生物技术提高天然色素生产的创新方法和策略 | 介绍了通过体外植物细胞/组织培养系统和微生物培养方法优化,以及合成生物学在异源生物合成色素方面的应用 | 讨论了当前生产高价值天然色素面临的挑战和未来展望 | 总结优化和工程化天然色素原生和异源生产者的创新方法和策略 | 天然色素,如类胡萝卜素、黄酮类和姜黄素类 | 生物技术 | NA | 体外植物细胞/组织培养系统,微生物培养方法,合成生物学 | NA | NA | NA |
2051 | 2024-08-07 |
Large DNA fragment knock-in and sequential gene editing in Plasmodium falciparum: a preliminary study using suicide-rescue-based CRISPR/Cas9 system
2024-Jan, Molecular and cellular biochemistry
IF:3.5Q3
DOI:10.1007/s11010-023-04711-5
PMID:37004637
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研究论文 | 本文通过改进自杀-救援型CRISPR/Cas9系统,在恶性疟原虫中实现了大DNA片段的敲入和连续基因编辑 | 本文首次成功利用改进的自杀-救援型CRISPR/Cas9系统在恶性疟原虫中实现大DNA片段的敲入和连续基因编辑 | 连续基因插入的可行性需要进一步确认 | 提高恶性疟原虫基因编辑效率,深入理解基因功能,并促进基于活疟原虫的合成生物学策略和疫苗开发 | 恶性疟原虫 | 基因编辑 | 疟疾 | CRISPR/Cas9 | NA | DNA | NA |
2052 | 2024-08-07 |
Engineered bacteria in tumor immunotherapy
2024-May-01, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2024.216817
PMID:38492769
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综述 | 本文综述了工程化细菌在肿瘤免疫治疗中的应用及其与免疫系统的复杂相互作用 | 利用遗传和合成生物学技术,工程化细菌作为肿瘤靶向载体和原位制药工厂,为免疫治疗提供了新的策略 | NA | 探讨工程化细菌在肿瘤免疫治疗中的应用及其优化策略 | 工程化细菌及其在免疫治疗中的作用 | 生物技术 | 肿瘤 | 遗传和合成生物学技术 | NA | NA | NA |
2053 | 2024-08-07 |
Development of a Split Esterase for Protein-Protein Interaction-Dependent Small-Molecule Activation
2019-Nov-27, ACS central science
IF:12.7Q1
DOI:10.1021/acscentsci.9b00567
PMID:31807678
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研究论文 | 本文开发了一种基于蛋白质相互作用依赖的小分子激活的分离酯酶系统 | 首次提出了一种基于蛋白质相互作用依赖的小分子激活的分离酯酶系统,该系统能够选择性地在相互作用依赖的方式下解除酯保护的小分子 | NA | 开发一种新的生物传感系统,用于在生物系统中基于测量输入信号生成目标小分子 | 分离酯酶系统及其在蛋白质相互作用检测和细胞杀伤中的应用 | 合成生物学 | NA | 分离酯酶系统 | NA | NA | NA |
2054 | 2024-08-07 |
Engineered Living Materials: Prospects and Challenges for Using Biological Systems to Direct the Assembly of Smart Materials
2018-May, Advanced materials (Deerfield Beach, Fla.)
DOI:10.1002/adma.201704847
PMID:29430725
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综述 | 本文综述了工程化活体材料(ELMs)的发展前景和挑战,重点介绍了利用生物系统指导智能材料组装的早期努力 | 探讨了利用合成生物学和自组装材料交叉领域的技术,通过生物纳米材料的力量生长复杂结构和物体 | NA | 开发具有自主性、适应性和自愈特性的先进材料,并具有设计的多尺度物理化学或机械性能 | 工程化活体材料(ELMs),特别是工程化细菌系统和活体复合材料 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
2055 | 2024-08-07 |
Modular assembly of an artificially concise biocatalytic cascade for the manufacture of phenethylisoquinoline alkaloids
2024-01-02, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-44420-7
PMID:38167860
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研究论文 | 本文建立了一个人工简化的四酶生物催化级联系统,用于合成苯乙基异喹啉生物碱(PEIAs),避免了植物来源的P450修饰 | 通过酶发现和酶工程,实现了从易得底物高效合成多样化的天然和非天然PEIAs,并通过插拔策略替代了限速步骤的O-甲基化,实现了高产量的秋水仙碱前体(S)-秋水仙碱的规模化制备 | NA | 解决生物碱合成挑战,通过合成生物学构建更多人工生物催化级联系统,用于多样化生物碱的制造 | 苯乙基异喹啉生物碱(PEIAs)的合成 | 生物技术 | NA | 生物催化级联 | NA | NA | NA |
2056 | 2024-08-07 |
Dipeptide coacervates as artificial membraneless organelles for bioorthogonal catalysis
2024-01-02, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-44278-9
PMID:38169470
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研究论文 | 本文报道了二肽凝聚物作为人工无膜细胞器用于生物正交催化的设计 | 设计了具有增强稳定性、生物相容性和疏水微环境的二肽凝聚物,促进了疏水物种的包封,提高了其在水环境中的催化效率 | 二肽凝聚物作为人工细胞器的应用受限于其复杂的分子结构、对内部微环境属性的有限控制和固有的胶体不稳定性 | 开发具有疏水微环境的凝聚物,为仿生材料领域在催化与合成生物学中的应用开辟新途径 | 二肽凝聚物及其在细胞内作为活性人工细胞器的应用 | 仿生材料 | NA | NA | NA | NA | NA |
2057 | 2024-08-07 |
Noise-reducing optogenetic negative-feedback gene circuits in human cells
2019-08-22, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkz556
PMID:31269201
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研究论文 | 本文通过在哺乳动物细胞中构建光遗传学基因回路,实现了通过遗传和体外负反馈来精确控制基因表达的噪声降低 | 开发了一种新的光遗传学工具集,称为噪声降低的光诱导调节器(LITer),通过融合TetR抑制子和Tet抑制肽(TIP)或降解标签,实现了高达5倍的噪声降低 | NA | 研究基因表达噪声降低及其在生物医学领域的应用 | 哺乳动物细胞中的基因表达控制 | 合成生物学 | NA | 光遗传学 | NA | 基因表达数据 | NA |
2058 | 2024-08-07 |
Insights into the Impact of Trans-Zeatin Overproduction-Engineered Sinorhizobium meliloti on Alfalfa (Medicago sativa L.) Tolerance to Drought Stress
2024-Apr-17, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.4c00115
PMID:38564678
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研究论文 | 研究通过合成生物学方法改造根瘤菌,使其过量生产反式玉米素,以提高苜蓿对干旱胁迫的耐受性 | 首次通过基因工程改造植物促生长根瘤菌,增加细胞分裂素的产量,以增强苜蓿的干旱耐受性 | 在非干旱条件下,改造后的根瘤菌对苜蓿生物量和根瘤形成没有显著影响 | 研究如何通过基因工程提高苜蓿对干旱胁迫的耐受性 | 反式玉米素过量生产的根瘤菌和苜蓿 | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | 两株改造后的根瘤菌 |
2059 | 2024-08-07 |
Research Progress on the Assembly of Large DNA Fragments
2024-Apr-16, Chembiochem : a European journal of chemical biology
IF:2.6Q3
DOI:10.1002/cbic.202400054
PMID:38477700
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research paper | 本文综述了DNA组装技术的发展现状,特别是大肠杆菌、枯草芽孢杆菌和酿酒酵母中大型DNA片段组装的最新进展 | 文章强调了在不同宿主中组装大型DNA片段的方法和挑战,这些进展有助于构建定制基因组,修改细胞功能甚至创造人工生命 | 大型DNA片段由于其高分子量和易断裂性,其组装仍是一个挑战 | 探讨合成生物学中DNA组装技术的发展,特别是大型DNA片段的组装 | DNA组装技术,特别是大肠杆菌、枯草芽孢杆菌和酿酒酵母中大型DNA片段的组装 | 合成生物学 | NA | DNA组装技术 | NA | NA | NA |
2060 | 2024-08-07 |
Rational construction of synthetic consortia: Key considerations and model-based methods for guiding the development of a novel biosynthesis platform
2024 May-Jun, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2024.108348
PMID:38531490
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综述 | 本文综述了合成生物学中合成群落的构建及其在生物合成平台中的应用 | 合成群落作为一种新兴且高效的生物合成平台,能够减轻代谢负担并提高产品产量 | 合成群落的研究仍处于初级阶段,设计和构建稳定的合成群落面临诸多挑战 | 探讨合成群落的工程化关键考虑因素及模拟计算工具,以推动其发展 | 合成群落的设计与构建 | 合成生物学 | NA | 人工智慧和机器学习 | NA | NA | NA |