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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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2061 | 2024-08-07 |
Rainbow screening: Chromoproteins enable visualized molecular cloning
2024-Apr, Biotechnology journal
IF:3.2Q2
DOI:10.1002/biot.202400114
PMID:38622790
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研究论文 | 本文介绍了一种名为Rainbow Screening的新方法,通过结合Gibson Assembly和chromoproteins,实现无需额外遗传操作或成本的分子克隆可视化筛选 | Rainbow Screening方法简化了分子克隆的可视化过程,无需额外遗传操作或成本,通过肉眼即可区分大肠杆菌菌落 | NA | 开发一种简化的分子克隆可视化筛选方法 | 大肠杆菌菌落和插入片段(E. coli 16s rRNA和sfGFP表达模块) | 生物技术 | NA | Gibson Assembly | NA | 菌落 | NA |
2062 | 2024-08-07 |
A toolbox for manipulating the genome of the major goat pathogen, Mycoplasma capricolum subsp. capripneumoniae
2024-01, Microbiology (Reading, England)
DOI:10.1099/mic.0.001423
PMID:38193814
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研究论文 | 本文介绍了一种用于操作主要山羊病原体Mycoplasma capricolum subsp. capripneumoniae基因组的工具箱 | 首次将合成生物学技术应用于Mycoplasma capricolum subsp. capripneumoniae,实现了基因的同时克隆和工程化,以及基因敲除和Cre-lox重组系统的应用 | NA | 开发改进的疫苗以控制传染性山羊胸膜肺炎(CCPP) | Mycoplasma capricolum subsp. capripneumoniae的基因组 | 合成生物学 | 传染性山羊胸膜肺炎 | CReasPy-Cloning, Cre-lox重组系统 | NA | 基因组序列 | NA |
2063 | 2024-08-07 |
Synthetic Biology Approaches to Posttranslational Regulation in Plants
2024-Jan, Biochemistry. Biokhimiia
DOI:10.1134/S0006297924140165
PMID:38621756
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综述 | 本文综述了植物合成生物学在翻译后水平调控植物代谢的最新进展及其未来方向 | 重点介绍了在翻译后水平控制植物遗传机制的方法,减少了对植物基因组的非靶向干扰效应 | NA | 探讨植物合成生物学在翻译后水平调控植物代谢的进展 | 植物合成生物学方法及其在功能基因组学和农业作物产量增加中的应用 | 合成生物学 | NA | 合成生物学方法 | NA | NA | NA |
2064 | 2024-08-07 |
Application of synthetic lipid droplets in metabolic diseases
2023-11, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.1441
PMID:37997538
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综述 | 本文综述了内源性脂滴的组装和功能,以及合成脂滴模型在生物学中的最新进展和应用挑战 | 开发了体外合成脂滴的方法,并在蛋白质结合、脂质功能、膜动力学和酶反应方面取得了显著进展 | 细胞生物学方法的局限性导致脂滴功能的分子机制尚未完全理解 | 全面概述脂滴的组装和功能,并探讨合成脂滴模型在未来的实际应用中的作用和挑战 | 脂滴及其在代谢疾病中的作用 | 合成生物学 | 代谢疾病 | NA | NA | NA | NA |
2065 | 2024-08-07 |
Engineering microbial systems to explore ecological and evolutionary dynamics
2012-Oct, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2012.01.006
PMID:22310174
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研究论文 | 本文探讨了利用合成生物学方法构建微生物系统以研究生态和进化动力学的新进展 | 通过构建简单的基因电路,合成生态系统为研究自然环境中难以观察的生态和进化现象提供了独特的平台 | NA | 旨在通过合成生物学方法提供对多样生物过程的机制性理解 | 微生物系统及其在生态和进化生物学中的应用 | 合成生物学 | NA | 基因电路构建 | NA | NA | NA |
2066 | 2024-08-07 |
An internal reaction chamber in dimethylglycine oxidase provides efficient protection from exposure to toxic formaldehyde
2009-Jun-26, The Journal of biological chemistry
IF:4.0Q2
DOI:10.1074/jbc.M109.006262
PMID:19369258
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研究论文 | 本文通过合成生物学方法展示了二甲基甘氨酸氧化酶中不寻常的底物通道机制 | 首次发现二甲基甘氨酸氧化酶通过一个中心“反应室”进行底物通道,保护细胞免受有毒甲醛的影响 | NA | 研究二甲基甘氨酸氧化酶的酶机制及其在细胞内的保护作用 | 二甲基甘氨酸氧化酶及其在细胞内的底物通道机制 | 生物化学 | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA |
2067 | 2024-08-07 |
Two neglected but valuable genetic tools for Escherichia coli and other bacteria: In vivo cosmid packaging and inducible plasmid replication
2023-12, Molecular microbiology
IF:2.6Q3
DOI:10.1111/mmi.15171
PMID:37770255
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研究论文 | 本文介绍了两种被忽视但有价值的遗传工具:大肠杆菌和其他细菌中的体内cosmid包装和可诱导质粒复制 | 通过操纵包装噬菌体和宿主,解决了体内cosmid包装效率低和污染问题,实现了仅包含cosmid DNA的颗粒 | 质粒难以从细胞中去除,但可诱导复制质粒提供了一种“治愈”质粒的方法 | 探索在生理学和合成生物学中,如何高效且无损地将基因引入细菌宿主 | 大肠杆菌和其他细菌 | 合成生物学 | NA | 体内cosmid包装,可诱导质粒复制 | NA | DNA | NA |
2068 | 2024-08-07 |
Synthetic biology: understanding biological design from synthetic circuits
2009-Dec, Nature reviews. Genetics
DOI:10.1038/nrg2697
PMID:19898500
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研究论文 | 本文通过合成生物学中的基因和蛋白质电路设计,探讨了自然生物系统设计原则的理解 | 通过合成生物器件,直观地理解简单生物电路的行为范围,并控制自然过程 | NA | 揭示自然生物系统的设计原则 | 合成启动子、细胞间相互作用的控制等生物系统工程过程 | 合成生物学 | NA | 合成生物学技术 | NA | NA | NA |
2069 | 2024-08-07 |
Environment and synthetic biology
2024-Sep, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2024.03.016
PMID:38616974
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
2070 | 2024-08-07 |
Optogenetic and chemogenetic approaches for modeling neurological disorders in vivo
2024-Apr, Progress in neurobiology
IF:6.7Q1
DOI:10.1016/j.pneurobio.2024.102600
PMID:38548126
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综述 | 本文综述了基于光遗传学和化学遗传学的动物模型在人类神经退行性疾病研究中的应用 | 光遗传学和化学遗传学技术为研究人类神经退行性疾病提供了新的机会,能够在细胞水平上模拟多种病理状态 | NA | 探讨光遗传学和化学遗传学在模拟人类神经退行性疾病中的应用及未来发展方向 | 人类神经退行性疾病,包括与年龄相关的痴呆、阿尔茨海默病、帕金森病、肌萎缩侧索硬化症、癫痫和共济失调等 | NA | 神经退行性疾病 | 光遗传学和化学遗传学 | NA | NA | NA |
2071 | 2024-08-07 |
Phaeodactylum tricornutum: An established model species for diatom molecular research and an emerging chassis for algal synthetic biology
2023-12, Journal of phycology
IF:2.8Q2
DOI:10.1111/jpy.13400
PMID:37975560
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研究论文 | 本文综述了Phaeodactylum tricornutum作为硅藻分子研究和藻类合成生物学新兴底盘的贡献 | Phaeodactylum tricornutum作为一种非典型硅藻,因其易于实验室培养和基因表达操作工具的增加,已成为硅藻分子研究的重要模型,并逐渐成为藻类过程工程和合成生物学的新工具 | NA | 探讨Phaeodactylum tricornutum在硅藻生物学研究和藻类合成生物学中的应用 | Phaeodactylum tricornutum | 分子生物学 | NA | 基因表达操作 | NA | 基因组信息 | NA |
2072 | 2024-08-07 |
Spontaneous Emergence of Multicellular Heritability
2023-08-17, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes14081635
PMID:37628687
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研究论文 | 本文通过分析模型、合成生物学和生物学模拟探索了多细胞性进化过程中性状遗传性的自发出现 | 本文证实了在多细胞群体形成时,集体层面的遗传性不仅存在,而且通常比基础的细胞层面性状更具遗传性 | NA | 探索多细胞性进化过程中性状遗传性的出现 | 多细胞生物的性状遗传性 | NA | NA | 分析模型、合成生物学、生物学模拟 | NA | NA | NA |
2073 | 2024-08-07 |
Rapid screening of engineered microbial therapies in a 3D multicellular model
2019-04-30, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.1820824116
PMID:30996123
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研究论文 | 本文介绍了一种细菌-球状体共培养(BSCC)平台,用于在多细胞球状体中同时测试宿主物种、治疗有效载荷和工程细菌的合成基因回路,并在几周的时间尺度上进行长期监测。 | 该平台能够高吞吐量地筛选工程微生物疗法,并动态分析多种微生物物种及其在不同宿主细胞类型中的作用。 | NA | 加速合成生物学在临床应用中的发展,并深入理解疾病部位的宿主-微生物相互作用。 | 工程细菌的宿主物种、治疗有效载荷和合成基因回路。 | 合成生物学 | 炎症、感染、代谢紊乱、癌症 | NA | NA | 多细胞球状体 | 多种微生物物种和宿主细胞类型 |
2074 | 2024-08-07 |
Synthetic biology for the directed evolution of protein biocatalysts: navigating sequence space intelligently
2015-Mar-07, Chemical Society reviews
IF:40.4Q1
DOI:10.1039/c4cs00351a
PMID:25503938
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综述 | 本文综述了利用合成生物学方法进行蛋白质生物催化剂定向进化的策略,重点探讨了如何智能地探索蛋白质序列空间以发现理想的活性和其他特性。 | 结合设计策略和经典定向进化方法,利用合成生物学技术,通过智能地探索蛋白质序列空间,开发新型高效且稳定的生物催化剂。 | 蛋白质的可能序列数量巨大,难以逐一测试,需要有效的方法来高效可靠地导航搜索空间。 | 探讨和开发利用定向进化改善酶特性的方法,特别是在快速时间尺度上超越自然进化的蛋白质改进机会。 | 蛋白质生物催化剂的序列、结构和功能。 | 合成生物学 | NA | 合成生物学技术 | NA | 蛋白质序列 | NA |
2075 | 2024-08-07 |
XPORT ENTRAP: A droplet microfluidic platform for enhanced DNA transfer between microbial species
2024-Jul-25, New biotechnology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.nbt.2024.02.003
PMID:38408724
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研究论文 | 本文介绍了一种基于液滴微流控平台的DNA增强转移系统(DNA ENTRAP),用于提高微生物间DNA转移的效率 | 利用液滴微流控技术,通过细胞封装的水-油乳液滴作为皮升体积的生物反应器,实现了XPORT介导的遗传转移效率的提升 | NA | 解决合成生物学中DNA高效引入微生物的挑战 | 微生物间的DNA转移效率 | 生物技术 | NA | 液滴微流控技术 | NA | 微生物细胞 | 使用了两种不同的枯草芽孢杆菌(供体和受体) |
2076 | 2024-08-07 |
Multiomics unravels potential molecular switches in the C3 to CAM transition of Mesembryanthemum crystallinum
2024-May-15, Journal of proteomics
IF:2.8Q2
DOI:10.1016/j.jprot.2024.105145
PMID:38431086
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研究论文 | 本研究利用转录组学、蛋白质组学和靶向代谢组学分析了Mesembryanthemum crystallinum从C到CAM光合作用的分子变化 | 发现了新的发现,如转录本的昼夜节律调控比蛋白质更强,氧化磷酸化和肌醇甲基化可能在转变中起重要作用,V型H-ATP酶在质子泵送中的作用,以及蛋白磷酸酶2C在ABA信号通路中的潜在触发作用 | NA | 揭示Mesembryanthemum crystallinum从C到CAM光合作用转变中的潜在分子开关 | Mesembryanthemum crystallinum的分子变化 | NA | NA | 转录组学、蛋白质组学、靶向代谢组学 | NA | 转录组、蛋白质组、代谢组 | NA |
2077 | 2024-08-07 |
Exploring the frontier of rapid prototyping technologies for plant synthetic biology and what could lie beyond
2024-May, The New phytologist
DOI:10.1111/nph.19650
PMID:38426415
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综述 | 本文综述了近期研究中展示的各种快速原型技术,这些技术克服了植物合成生物学中的一些瓶颈,加速了进展 | 探讨了将不同快速原型技术结合的可能性,以实现植物合成生物学的快速和可扩展部署 | 每种技术都有其局限性,限制了它们的广泛应用 | 实现植物合成生物学的全部潜力,阐明基因型与表型之间的关系,并应用这些见解来工程化性状 | 植物合成生物学中的快速原型技术 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
2078 | 2024-08-07 |
Exploiting synthetic biology platforms for enhanced biosynthesis of natural products in Yarrowia lipolytica
2024-May, Bioresource technology
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.biortech.2024.130614
PMID:38513925
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综述 | 本文主要回顾了合成生物学技术在Yarrowia lipolytica中的发展,并总结了近期在Y. lipolytica中合成天然产品的研究进展 | 利用合成生物学平台设计、修改甚至从头合成微生物,赋予微生物非自然功能,促进功能产品的开发 | NA | 解决天然产品供应不足的关键问题,如低产量、长生产周期和繁琐的程序 | Yarrowia lipolytica中的合成生物学技术和天然产品合成 | 合成生物学 | NA | 合成生物学技术 | NA | NA | NA |
2079 | 2024-08-07 |
Two Cytochrome P450 Enzymes Form the Tricyclic Nested Skeleton of Meroterpenoids by Sequential Oxidative Reactions
2024-Apr-11, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.4c01943
PMID:38602511
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研究论文 | 本文研究了两种细胞色素P450酶在形成三环嵌套骨架过程中的氧化反应作用 | 首次发现并证明了ClaR和ClaT两种酶在clavilactone生物合成中的关键作用,特别是ClaR作为大环酶催化非萜类部分的氧化环化 | NA | 探索并阐明在clavilactone生物合成中形成10/5/3三环嵌套骨架的自然酶机制 | clavilactone的生物合成机制及其在真菌中的基因簇 | NA | NA | 细胞色素P450单加氧酶 | NA | 基因簇 | NA |
2080 | 2024-08-07 |
Enhancing Escherichia coli abiotic stress resistance through ornithine lipid formation
2024-Apr-08, Applied microbiology and biotechnology
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s00253-024-13130-5
PMID:38587638
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研究论文 | 本研究通过表达合成操纵子olsFC,使不同的大肠杆菌菌株产生未修饰和羟基化的鸟氨酸脂,以增强其对非生物胁迫的抵抗力 | 通过工程化大肠杆菌膜成分,增强其对非生物胁迫的抵抗力,为生物技术和合成生物学应用构建更健壮的主机 | NA | 研究通过鸟氨酸脂的形成增强大肠杆菌对非生物胁迫的抵抗力 | 大肠杆菌菌株 | 生物技术 | NA | NA | NA | 转录组数据 | 不同的大肠杆菌菌株 |