合成生物学相关文章
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当前共找到 3041 篇文献，本页显示第 2081 - 2100 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2081 | 2024-08-07 |
Synthetic biology-based bacterial extracellular vesicles displaying BMP-2 and CXCR4 to ameliorate osteoporosis
2024-Apr, Journal of extracellular vesicles
IF:15.5Q1
DOI:10.1002/jev2.12429
PMID:38576241
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研究论文 | 本文通过合成生物学方法构建了一种重组益生菌，该益生菌能够表达BMP-2和CXCR4并展示在细菌外泌体表面，用于改善骨质疏松症 | 首次利用合成生物学技术，将BMP-2和CXCR4展示在细菌外泌体表面，实现了一步法同时具有骨靶向和骨形成功能 | NA | 开发一种新型的骨质疏松症治疗方法 | 骨质疏松症及其治疗 | 合成生物学 | 骨质疏松症 | 合成生物学 | NA | NA | 使用了卵巢切除（OVX）小鼠模型进行实验 |
| 2082 | 2024-08-07 |
Characterization of CYP82 genes involved in the biosynthesis of structurally diverse benzylisoquinoline alkaloids in Corydalis yanhusuo
2024-Mar-07, Plant molecular biology
IF:3.9Q1
DOI:10.1007/s11103-023-01397-7
PMID:38453737
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研究论文 | 本研究探讨了CYP82基因在Corydalis yanhusuo中苯并异喹啉生物碱（BIAs）生物合成中的催化功能 | 首次鉴定并表征了Corydalis yanhusuo中的CyCYP82基因，这些基因在BIAs的合成生物学中具有重要作用 | NA | 研究CYP82基因在苯并异喹啉生物碱生物合成中的作用 | Corydalis yanhusuo中的CYP82基因及其在BIAs生物合成中的功能 | 生物化学 | NA | 基因克隆 | NA | 基因序列 | 20个CyCYP82编码基因 |
| 2083 | 2024-08-07 |
PCR amplification of DNA containing non-standard base pairs by variants of reverse transcriptase from Human Immunodeficiency Virus-1
2004, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkh241
PMID:14757837
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研究论文 | 研究使用人类免疫缺陷病毒1型逆转录酶的变体来合成包含非标准碱基对的双链DNA | 首次通过PCR扩增包含具有替代氢键模式的非标准碱基对的DNA | NA | 探索使用HIV逆转录酶变体合成包含非标准碱基对的双链DNA的能力 | HIV逆转录酶的变体及其合成非标准碱基对的能力 | 生物技术 | NA | PCR | NA | DNA | NA |
| 2084 | 2024-08-07 |
Engineering transcriptional regulation for cell-based therapies
2024-Apr, SLAS technology
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.slast.2024.100121
PMID:38340892
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综述 | 本文综述了利用合成生物学工具，特别是基于跨膜受体的转录调控平台，来开发细胞疗法的当前工程方法 | 探讨了将跨膜受体与转录激活平台结合的潜力，以及如何通过这些技术实现对基因调控的更精确控制 | 尚未完全实现跨膜受体与转录激活平台的全部潜力 | 探索和改进用于细胞疗法的转录调控技术，特别是在响应外部信号方面 | 哺乳动物细胞中的转录调控系统 | 合成生物学 | NA | 转录调控 | NA | NA | NA |
| 2085 | 2024-08-07 |
Experimental and biophysical modeling of transcription and translation dynamics in bacterial- and mammalian-based cell-free expression systems
2024-Apr, SLAS technology
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.slast.2022.02.001
PMID:35231628
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研究论文 | 本文开发了一个基于常微分方程（ODE）的生物物理模型，用于模拟细菌和哺乳动物细胞自由表达系统中的转录和翻译动力学 | 首次提出了一种适用于细菌和哺乳动物细胞自由表达系统的计算模型 | NA | 为基因回路定量研究提供一个标准的生物物理模型，以深入理解细胞自由表达系统的基本工作机制 | 细菌和哺乳动物细胞自由表达系统中的转录和翻译动力学 | 合成生物学 | NA | NA | ODE | 实验数据 | 四个基因回路在E. coli和HeLa细胞自由表达系统中的测试 |
| 2086 | 2024-08-07 |
Recent advances of droplet-based microfluidics for engineering artificial cells
2024-Apr, SLAS technology
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.slast.2023.05.002
PMID:37245659
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综述 | 本文总结了基于液滴的微流控技术在人工细胞合成方面的最新进展 | 介绍了多种基于液滴的微流控设备类型及其在多隔室囊泡和人工细胞形成中的应用 | 讨论了当前基于液滴的微流控方法在工程人工细胞方面的挑战和未来展望 | 构建具有最少部件和复杂性的活细胞 | 人工细胞的合成及其在基因表达、细胞间通信和机械生物学中的应用 | 微流控技术 | NA | 基于液滴的微流控技术 | NA | NA | NA |
| 2087 | 2024-08-07 |
TidyTron: Reducing lab waste using validated wash-and-reuse protocols for common plasticware in Opentrons OT-2 lab robots
2024-Apr, SLAS technology
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.slast.2023.08.007
PMID:37696493
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研究论文 | 本文介绍并验证了TidyTron，一个用于清洁受DNA、E. coli和S. cerevisiae污染的微量移液管尖和微孔板的协议库，旨在通过自动化液体处理机器人实现单次使用塑料的清洁，以提高可持续性和降低生物研究的成本。 | 开发了开源、经过验证的协议，使用低成本实验室机器人进行塑料器皿的有效清洁，促进安全再利用。 | NA | 通过自动化单次使用塑料清洁，提高生物实验室的可持续性和降低成本。 | 微量移液管尖和微孔板，受DNA、E. coli和S. cerevisiae污染。 | 生物技术 | NA | 液体处理机器人 | NA | NA | NA |
| 2088 | 2024-08-07 |
Employing synthetic biology to expand antibiotic discovery
2024-Apr, SLAS technology
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.slast.2024.100120
PMID:38340893
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综述 | 本文综述了利用合成生物学在抗生素发现领域的最新进展 | 合成生物学被用作预测和诱导新型天然抗生素的关键策略，通过克隆和突变技术来识别和修改抗生素生物合成基因簇（BGCs），以产生更有效的抗生素 | NA | 探索和改进抗生素的生物合成途径，以对抗抗药性细菌 | 抗生素生物合成基因簇（BGCs）及其相关的非核糖体肽合成酶（NRPS）和聚酮合成酶（PKS）途径 | 合成生物学 | 抗药性细菌感染 | 克隆和突变技术 | NA | 基因序列 | NA |
| 2089 | 2024-08-07 |
Adhesion of Active Cytoskeletal Vesicles
2018-12-18, Biophysical journal
IF:3.2Q2
DOI:10.1016/j.bpj.2018.10.013
PMID:30455042
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研究论文 | 研究通过合成生物学方法设计了一个最小实验模型，用于理解形状重塑在粘附过程中的作用，特别是通过调整细胞骨架囊泡的大小、体积和细胞骨架收缩性来实现强粘附。 | 首次展示了细胞骨架囊泡在主动重塑肌动蛋白皮质的情况下能够维持与固体基质的强粘附，并揭示了变形性和粘附强度之间的平衡是实现粘附的关键。 | NA | 理解形状重塑在粘附过程中的作用 | 细胞骨架囊泡的粘附机制 | 细胞生物学 | NA | 合成生物学 | NA | 囊泡 | 有限数量的构建块 |
| 2090 | 2024-08-07 |
Biosafety and biosecurity: treading China's synbio tightrope
2024-Apr, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2023.10.014
PMID:37957090
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research paper | 本文分析了中国在合成生物学领域如何在促进创新与实施严格监管之间进行复杂平衡 | NA | NA | 探讨如何在中国合成生物学领域增强生物安全和生物安保，以及提升公众信任 | 中国合成生物学领域的创新与监管平衡 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2091 | 2024-08-07 |
Design of a Biohybrid Materials Circuit with Binary Decoder Functionality
2024-Apr, Advanced materials (Deerfield Beach, Fla.)
DOI:10.1002/adma.202308092
PMID:38118057
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研究论文 | 本文设计了一种基于蛋白酶的生物混合材料电路，具有二进制解码功能 | 开发了一组可通过诱导或抑制其生物活性来调控的蛋白酶基生物混合模块，并将其应用于材料中进行信息处理 | NA | 将合成生物学中的计算功能转移到材料系统中，实现高级信息处理电路的实现 | 蛋白酶基生物混合模块及其在材料中的应用 | 生物技术 | NA | 生物工程 | NA | 生物分子 | 2输入/4输出二进制解码器 |
| 2092 | 2024-08-07 |
Multiplex Functional Characterization of Protein Variant Libraries in Mammalian Cells with Single-Copy Genomic Integration and High-Throughput DNA Sequencing
2024, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-3718-0_10
PMID:38441763
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研究论文 | 本文开发了一种利用Bxb1噬菌体DNA重组酶在细胞基因组中预设的“着陆垫”位点插入单个无启动子质粒的哺乳动物合成生物学平台，以实现大规模并行遗传分析 | 该平台通过基因组整合的启动子确保每个细胞只表达一个转基因，保持严格的基因型-表型联系，并能对选定的细胞进行测序以赋予每个变体表型评分 | NA | 开发一种新的方法来同时表征编码数千种独特蛋白质变体的库的基因型-表型关系 | 蛋白质变体库在哺乳动物细胞中的功能表征 | 合成生物学 | NA | 高通量DNA测序 | NA | DNA序列 | 数千种独特蛋白质变体 |
| 2093 | 2024-08-07 |
A Unifying Mathematical Framework for Genetic Robustness, Environmental Robustness, Network Robustness and their Trade-offs on Phenotype Robustness in Biological Networks. Part III: Synthetic Gene Networks in Synthetic Biology
2013, Evolutionary bioinformatics online
DOI:10.4137/EBO.S10686
PMID:23515190
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研究论文 | 本文提出了一种统一的数学框架，用于研究合成生物学中合成基因网络的鲁棒稳定性和环境干扰抑制原理 | 提出了一个统一的数学框架，用于分析合成基因网络中的鲁棒性和环境干扰抑制，并定义了表型鲁棒性的标准 | NA | 研究生物网络中的鲁棒稳定性和环境干扰抑制，并探讨其在合成生物学中的应用 | 合成生物学中的合成基因网络 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2094 | 2024-08-07 |
Neural network-derived Potts models for structure-based protein design using backbone atomic coordinates and tertiary motifs
2023-02, Protein science : a publication of the Protein Society
IF:4.5Q1
DOI:10.1002/pro.4554
PMID:36564857
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研究论文 | 本文结合基于骨干坐标和三级模体（TERMs）的神经网络模型，提出了一种新的蛋白质设计方法，通过生成Potts模型来优化蛋白质序列设计。 | 本文创新地将基于骨干坐标的特征与TERMs数据结合，提出两种神经网络架构（TERMinator和COORDinator），用于生成序列空间的Potts模型，并展示了TERMs在提高神经模型原生序列恢复性能方面的应用。 | NA | 设计新型蛋白质以执行特定功能，如结合或催化。 | 蛋白质设计方法及其在合成生物学中的应用。 | 机器学习 | NA | 神经网络模型 | Potts模型 | 骨干坐标和三级模体数据 | NA |
| 2095 | 2024-08-07 |
The genome sequence of Propionibacterium acidipropionici provides insights into its biotechnological and industrial potential
2012-Oct-19, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/1471-2164-13-562
PMID:23083487
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研究论文 | 本文分析了产丙酸菌Propionibacterium acidipropionici的基因组，探讨其在生物技术和工业应用中的潜力 | 发现了P. acidipropionici基因组中编码蛋白基因数量增加，涉及基因组完整性维护的基因增多，以及存在与碳代谢调控相关的基因 | 未发现磷酸烯醇式丙酮酸羧化酶编码基因，但确认了丙酮酸羧化酶基因及其酶的存在 | 研究P. acidipropionici的基因组特征，评估其在化学品生产中的应用潜力 | Propionibacterium acidipropionici的基因组及其生物学功能 | NA | NA | 基因组测序 | NA | 基因组数据 | 单个微生物样本Propionibacterium acidipropionici (ATCC 4875) |
| 2096 | 2024-08-07 |
CRISPRi-induced transcriptional regulation of IAH1 gene and its influence on volatile compounds profile in Kluyveromyces marxianus DU3
2024-Mar-05, World journal of microbiology & biotechnology
IF:4.0Q2
DOI:10.1007/s11274-023-03811-0
PMID:38441729
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研究论文 | 本研究利用CRISPR干扰技术下调Kluyveromyces marxianus DU3菌株中的IAH1基因表达，并分析其对挥发性化合物代谢谱的影响 | 首次在Kluyveromyces marxianus中应用CRISPRi技术进行基因表达的靶向调控，为代谢工程和合成生物学策略提供了新途径 | NA | 研究IAH1基因下调对Kluyveromyces marxianus中挥发性化合物代谢谱的影响 | Kluyveromyces marxianus DU3菌株中的IAH1基因及其编码的酯酶 | 代谢工程 | NA | CRISPR干扰技术 | NA | 基因表达数据 | Kluyveromyces marxianus DU3菌株 |
| 2097 | 2024-08-07 |
Fast-growing cyanobacterial chassis for synthetic biology application
2024-May, Critical reviews in biotechnology
IF:8.1Q1
DOI:10.1080/07388551.2023.2166455
PMID:36842999
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综述 | 本文综述了快速生长的蓝细菌作为合成生物学应用底盘的研究进展 | 介绍了近年来快速生长的蓝细菌新品种及其在将二氧化碳转化为化学品中的应用，以及为这些新蓝细菌底盘开发的遗传工具箱 | 当前蓝细菌底盘的生长速度慢和生物量积累低，导致大多数产品的生产率仍低于大规模商业应用所需的阈值 | 探讨开发具有快速生长和/或更高生物量积累能力的高效蓝细菌底盘 | 快速生长的蓝细菌底盘 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2098 | 2024-08-07 |
The emerging tumor microbe microenvironment: From delineation to multidisciplinary approach-based interventions
2024-Apr, Acta pharmaceutica Sinica. B
DOI:10.1016/j.apsb.2023.11.018
PMID:38572104
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综述 | 本文综述了肿瘤微环境中的微生物群落，探讨了其在肿瘤发生、转移、免疫监视和预后中的作用，以及多学科方法在肿瘤微生物组干预中的应用。 | 强调了肿瘤微环境中微生物群落的新角色及其对传统肿瘤微环境的多样化影响。 | NA | 深入理解癌症-免疫-微生物的相互作用，并促进基于微生物的肿瘤特异性治疗的发展。 | 肿瘤微环境中的微生物群落及其在不同类型肿瘤中的异质性。 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2099 | 2024-08-07 |
BioNexusSentinel: a visual tool for bioregulatory network and cytohistological RNA-seq genetic expression profiling within the context of multicellular simulation research using ChatGPT-augmented software engineering
2024, Bioinformatics advances
IF:2.4Q2
DOI:10.1093/bioadv/vbae046
PMID:38571784
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研究论文 | 本文介绍了一个集成视觉平台BioNexusSentinel，用于高效探索细胞组织学RNA-seq和生物调节网络 | BioNexusSentinel是一个全新的系统，独特地结合了细胞组织学RNA-seq和生物调节网络探索功能，并利用ChatGPT增强的软件工程技术开发 | NA | 旨在参数化多细胞模拟研究，并开发一个集成视觉平台以提高研究效率 | 多细胞模拟研究中的细胞组织学RNA-seq和生物调节网络 | 计算生物学 | NA | RNA-seq | NA | 数据 | 基于人类蛋白质图谱数据 |
| 2100 | 2024-08-07 |
Safely balancing a double-edged blade: identifying and mitigating emerging biosecurity risks in precision medicine
2024, Frontiers in medicine
IF:3.1Q1
DOI:10.3389/fmed.2024.1364703
PMID:38572161
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研究论文 | 本文探讨了精准医学中新兴生物安全风险的识别与缓解措施 | 提出了一个新兴学科——网络生物安全，旨在保护人类隐私、自主权和安全，与生物医学的科学和技术进步保持同步 | NA | 探讨精准医学中的双重用途风险，并提出相应的生物数据安全措施 | 精准医学中的工具和方法，以及相关的生物数据安全问题 | 精准医学 | NA | 机器学习、人工智能 | NA | 生物数据 | NA |