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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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2101 | 2024-08-07 |
Engineering Cyborg Bacteria Through Intracellular Hydrogelation
2023-03, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202204175
PMID:36628538
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research paper | 本文首次创建了名为Cyborg Cells的混合材料-细胞实体,通过在每个细菌内部组装合成聚合物网络,使其失去分裂能力,同时保留了细胞代谢、运动、蛋白质合成等基本功能,并获得了抵抗压力因素的新能力,还展示了其对癌细胞的侵入治疗潜力。 | 首次创建了Cyborg Cells,结合了细胞内人造聚合物与活细胞蛋白质网络的相互作用,为细胞生物工程建立了新的范式。 | NA | 探索细胞生物工程的新方法,通过创建Cyborg Cells来实现更可控的生物医学应用。 | Cyborg Cells及其在生物医学应用中的潜力。 | synthetic biology | NA | intracellular hydrogelation | NA | NA | NA |
2102 | 2024-08-07 |
Engineering CAR T cells for enhanced efficacy and safety
2022-Mar, APL bioengineering
IF:6.6Q1
DOI:10.1063/5.0073746
PMID:35071966
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综述 | 本文综述了通过合成生物学方法优化嵌合抗原受体(CAR)T细胞疗法的最新进展,旨在提高其对实体瘤的疗效和安全性 | 讨论了CAR和其他非CAR分子的改进策略,以及可由环境信号和/或外部刺激控制的诱导型CAR T细胞的开发 | NA | 提高CAR T细胞疗法的疗效和安全性,特别是针对实体瘤 | CAR T细胞疗法的优化策略 | 生物技术 | 血液恶性肿瘤 | 合成生物学 | NA | NA | NA |
2103 | 2024-08-07 |
Temporal signaling, population control, and information processing through chromatin-mediated gene regulation
2022-02-21, Journal of theoretical biology
IF:1.9Q3
DOI:10.1016/j.jtbi.2021.110977
PMID:34919934
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研究论文 | 本文构建了一个数学框架,用于分析含有染色质调节因子的遗传电路对哺乳动物细胞群体中时间信号的响应 | 展示了染色质介导的基因控制能够实现复杂的细胞群体对时间信号的响应,并且能够传输比先前测量在基因调节中更高的信息水平 | NA | 研究染色质调节在细胞对时间刺激响应中的作用,并探索其在合成生物学应用中的潜力 | 染色质调节因子在遗传电路中的作用及其对时间信号的响应 | 合成生物学 | NA | 数学建模 | NA | 时间序列数据 | 哺乳动物细胞群体 |
2104 | 2024-08-07 |
Lipid membranes modulate the activity of RNA through sequence-dependent interactions
2022-01-25, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2119235119
PMID:35042820
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研究论文 | 本文研究了脂质膜如何通过序列依赖性相互作用调节RNA的活性 | 首次展示了脂质膜作为RNA组织平台的机制,并介绍了RNA-脂质相互作用作为开发合成核糖开关和基于RNA的脂质生物传感器的新工具 | NA | 阐明RNA生物活性的控制机制,以及其在生理角色和合成生物学中的潜在应用 | RNA与脂质膜的相互作用及其对RNA活性的影响 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
2105 | 2024-08-07 |
Making Sense of "Nonsense" and More: Challenges and Opportunities in the Genetic Code Expansion, in the World of tRNA Modifications
2022-Jan-15, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms23020938
PMID:35055121
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综述 | 本文综述了遗传密码扩展(GCE)在增强蛋白质结构特性和功能方面的最新进展,并讨论了tRNA修饰和代谢在蛋白质设计中的新兴影响 | 遗传密码扩展通过引入非规范氨基酸(ncAAs),增强了蛋白质的功能性和结构特性,为生物化学、生物物理和细胞研究提供了广泛的应用潜力 | 不同的中介因素降低了非规范氨基酸在合成蛋白质中的掺入产量和效率 | 探讨遗传密码扩展在提高非规范氨基酸掺入效率中的相关性和系统生物学的作用 | 遗传密码扩展技术及其在蛋白质设计和合成蛋白治疗中的应用 | 合成生物学 | NA | 遗传密码扩展 | NA | NA | NA |
2106 | 2024-08-07 |
The Systems and Synthetic Biology of Auxin
2022-01-04, Cold Spring Harbor perspectives in biology
IF:6.9Q1
DOI:10.1101/cshperspect.a040071
PMID:34127446
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研究论文 | 本文综述了生长素生物学领域在解析植物生长网络结构、动态和控制方面的进展,强调了系统生物学和合成生物学方法的结合 | 通过结合系统生物学和合成生物学的互补方法,推动了对生长素控制植物生长、发育和生理的理解和工程化 | NA | 探讨生长素生物学领域的发展,并强调系统生物学和合成生物学方法的结合 | 生长素的生物学机制及其在植物生长和发育中的作用 | 系统生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
2107 | 2024-08-07 |
Advances in the design and development of SARS-CoV-2 vaccines
2021-12-16, Military Medical Research
IF:16.7Q1
DOI:10.1186/s40779-021-00360-1
PMID:34911569
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综述 | 本文综述了针对COVID-19的预防性和治疗性疫苗设计的最新进展 | 介绍了基于病毒载体、纳米科学和合成生物学的新型疫苗 | 临床试验中仍存在许多挑战 | 探讨SARS-CoV-2疫苗的设计与开发 | COVID-19疫苗 | NA | 冠状病毒病 | NA | NA | NA | NA |
2108 | 2024-08-07 |
Artificial nucleic acid backbones and their applications in therapeutics, synthetic biology and biotechnology
2021-11-12, Emerging topics in life sciences
IF:3.4Q1
DOI:10.1042/ETLS20210169
PMID:34297063
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研究论文 | 本文探讨了人工核酸骨架的改良技术及其在治疗药物、合成生物学和生物技术中的应用 | 提出了多种易于合成的人工核酸骨架及其引入寡核苷酸的稳健方法 | 目前人工核酸骨架的合成可及性有限,限制了其在更广泛领域的应用 | 开发新型人工核酸骨架,以充分利用其在治疗药物、合成生物学和生物技术中的潜力 | 人工核酸骨架及其在寡核苷酸中的应用 | 生物技术 | NA | 核酸骨架改良技术 | NA | NA | NA |
2109 | 2024-08-07 |
Synthetic biomarkers: a twenty-first century path to early cancer detection
2021-10, Nature reviews. Cancer
DOI:10.1038/s41568-021-00389-3
PMID:34489588
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综述 | 本文综述了合成生物标志物在早期癌症检测中的应用和发展 | 介绍了利用生物工程传感器在体内查询早期肿瘤并放大疾病信号的合成生物标志物 | 强调了合成生物标志物在临床前开发和临床转化中存在的挑战 | 探讨开发基于体液的合成生物标志物的合理性及其在早期癌症检测中的应用 | 合成生物标志物及其在早期癌症检测中的应用 | NA | 癌症 | 生物工程 | NA | 体液 | NA |
2110 | 2024-08-07 |
Bioinspired Networks of Communicating Synthetic Protocells
2021, Frontiers in molecular biosciences
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fmolb.2021.804717
PMID:35004855
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综述 | 本文讨论了从无生命分子和材料中自下而上合成类似细胞实体的挑战,并介绍了三种新出现的生物启发式通信合成原细胞网络 | 本文介绍了多原细胞系统的设计可能性,这些系统能够发送和接收化学信号,触发个体或集体的编程细胞样行为,或与活细胞和组织通信 | NA | 探讨自下而上合成生物学中新出现的领域,并介绍新型的生物启发式通信合成原细胞网络 | 合成原细胞及其在生物技术、组织工程和再生医学中的应用 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
2111 | 2024-08-07 |
The Future Potential of Biosensors to Investigate the Gut-Brain Axis
2021, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2021.826479
PMID:35096802
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综述 | 本文综述了利用生物传感器检测肠道代谢物以量化微生物组对抑郁症贡献的潜力,并探讨了合成生物学策略在检测肠道-大脑轴失调中的应用 | 提出利用生物传感器检测肠道代谢物,以量化微生物组对抑郁症的贡献,并探讨了合成生物学策略在检测肠道-大脑轴失调中的应用 | 强调了开发影响抑郁症的微生物组状况的活体诊断所面临的未来挑战 | 探讨生物传感器在研究肠道-大脑轴中的未来潜力 | 肠道微生物组及其与神经系统功能的相互作用 | NA | 抑郁症 | 生物传感器 | NA | 代谢物 | NA |
2112 | 2024-08-07 |
Gene editing technologies and applications for insects
2018-08, Current opinion in insect science
IF:5.8Q1
DOI:10.1016/j.cois.2018.05.006
PMID:30551769
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研究论文 | 本文探讨了基于CRISPR的基因编辑技术在昆虫中的应用和进展 | 介绍了基因编辑技术在昆虫中的多种应用,包括基因敲入、DNA碱基编辑、染色体易位和基因驱动等 | NA | 探索基因编辑技术在昆虫中的应用和进展 | 包括多种模型和非模型昆虫,如苍蝇、蜜蜂、甲虫、蝴蝶、飞蛾和蚱蜢等 | 基因编辑 | NA | CRISPR-based genome editing endonucleases | NA | 基因组数据 | 多种昆虫样本 |
2113 | 2024-08-07 |
Siraitia grosvenorii As a Homologue of Food and Medicine: A Review of Biological Activity, Mechanisms of Action, Synthetic Biology, and Applications in Future Food
2024-Apr-03, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.4c00018
PMID:38513114
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综述 | 本文综述了罗汉果(Siraitia grosvenorii)在食品和医药领域的历史角色、应用、植物化学成分及其生物活性,并探讨了其在合成生物学中的最新进展。 | 文章强调了合成生物学在提高罗汉果生物活性成分生产中的应用,为扩大其可用性提供了新机遇。 | NA | 旨在全面回顾罗汉果在食品和医药领域的历史、化学成分、生物功能、作用机制及合成生物学的应用。 | 罗汉果的植物化学成分、生物活性及其在食品和医药中的应用。 | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA |
2114 | 2024-08-07 |
Transcriptomics aids in uncovering the metabolic shifts and molecular machinery of Schizochytrium limacinum during biotransformation of hydrophobic substrates to docosahexaenoic acid
2024-Apr-01, Microbial cell factories
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s12934-024-02381-6
PMID:38561811
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研究论文 | 研究了Schizochytrium limacinum SR21在将疏水性底物转化为二十二碳六烯酸(DHA)过程中的代谢转变和分子机制 | 揭示了SR21在利用疏水性底物进行DHA生物合成时的代谢途径和分子机制,特别是脂酶的上调和脂肪酸完全降解为乙酰辅酶A的过程 | 研究主要集中在实验室条件下,未来研究可以利用合成生物学工具进一步优化疏水性底物的转化 | 探索Schizochytrium limacinum SR21在将废油转化为高价值营养品过程中的代谢和分子机制 | Schizochytrium limacinum SR21及其在不同脂肪酸组成的商业油和废烹饪油中的表现 | 代谢生物学 | NA | 转录组学 | NA | 转录组数据 | 使用SR21在72小时内处理不同脂肪酸组成的商业油和废烹饪油,产生约7.5 g/L的生物量 |
2115 | 2024-08-07 |
Biological factors in the synthetic construction of overlapping genes
2021-Dec-11, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-021-08181-1
PMID:34895142
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研究论文 | 研究探讨了重叠基因(OLGs)的生物学因素及其在不同生物中的分布和形成机制 | 发现病毒域在设计重叠基因方面不如细菌或真核生物域适合,与之前的研究结果相反 | 研究未考虑影响蛋白质折叠的基因内相互作用等重要因素 | 探索重叠基因的生物学基础及其在进化和生物技术中的应用 | 重叠基因及其在不同生物中的分布和形成机制 | 生物技术 | NA | 隐马尔可夫模型(HMM) | 隐马尔可夫模型 | 蛋白质序列 | 使用了Pfam域对进行分析 |
2116 | 2024-08-07 |
Rapid conversion of replicating and integrating Saccharomyces cerevisiae plasmid vectors via Cre recombinase
2021-12-08, G3 (Bethesda, Md.)
DOI:10.1093/g3journal/jkab336
PMID:34599813
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研究论文 | 本文介绍了一种通过Cre重组酶快速转换复制和整合的酿酒酵母质粒载体的方法 | 开发了一系列优化的酵母穿梭质粒,能够高效插入、移除和替换质粒酵母复制位点,生成一套完整的整合型、低拷贝和高拷贝质粒 | NA | 优化质粒载体,支持酵母作为遗传学研究和合成生物学的主要系统 | 酿酒酵母质粒载体 | 合成生物学 | NA | Cre重组酶 | NA | 质粒 | NA |
2117 | 2024-08-07 |
DeepCME: A deep learning framework for computing solution statistics of the chemical master equation
2021-12, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1009623
PMID:34879062
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研究论文 | 本文提出了一种基于深度学习的方法DeepCME,用于计算化学主方程(CME)解的统计量 | 利用深度神经网络(DNNs)的优越近似性质,通过重新构建使用Kolmogorov后向方程的随机动力学,可靠地估计CME解下用户定义状态向量函数的期望 | NA | 开发一种新的深度学习方法,用于计算高维CME解的统计量 | 化学主方程(CME)的解及其对反应网络参数(如速率常数)的敏感性 | 机器学习 | NA | 深度神经网络(DNNs) | DNN | NA | NA |
2118 | 2024-08-07 |
Independent control of mean and noise by convolution of gene expression distributions
2021-11-29, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-27070-5
PMID:34845228
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研究论文 | 本文通过理论证明和实验验证,展示了通过在同一细胞中从两个可诱导启动子表达两个基因拷贝,可以独立控制基因表达的均值和噪声 | 提出了一种新的方法,通过在同一细胞中使用两个可诱导启动子表达两个基因拷贝,实现对基因表达均值和噪声的独立控制 | NA | 研究基因表达噪声对细胞适应性和生物过程的影响 | 基因表达的均值和噪声控制 | 合成生物学 | NA | NA | NA | 基因表达数据 | 使用大肠杆菌进行实验验证 |
2119 | 2024-08-07 |
Bioremediation of Per- and Poly-Fluoroalkyl Substances (PFAS) by Synechocystis sp. PCC 6803: A Chassis for a Synthetic Biology Approach
2021-Nov-26, Life (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/life11121300
PMID:34947832
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研究论文 | 本文评估了Synechocystis sp. PCC 6803在PFAS污染水体中的生物修复潜力,并探讨了其在PFAS去除中的作用机制 | 首次报道了Synechocystis sp. PCC 6803在PFAS富集水体中的应用,并揭示了其在PFAS去除中的潜在机制 | 研究仅初步探讨了PFAS的去除机制,仍需进一步的代谢工程研究以优化其应用 | 评估Synechocystis sp. PCC 6803在PFAS污染水体中的生物修复潜力 | Synechocystis sp. PCC 6803在PFAS污染水体中的应用及其去除机制 | 生物技术 | NA | 呼吸测量法 | NA | 生物数据 | 未具体说明样本数量 |
2120 | 2024-08-07 |
Capsid Structure of Anabaena Cyanophage A-1(L)
2021-11-23, Journal of virology
IF:4.0Q2
DOI:10.1128/JVI.01356-21
PMID:34549983
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研究论文 | 本文报道了淡水蓝藻病毒A-1(L)的3.35 Å冷冻电镜结构,这是首个接近原子分辨率的T数为9的病毒衣壳结构 | A-1(L)病毒衣壳采用了一种独特的非共价链甲结构,通过两种榫卯式衣壳间相互作用稳定,这种结构使得A-1(L)具有仅由主要衣壳蛋白组成的刚性衣壳 | NA | 揭示蓝藻病毒A-1(L)衣壳的结构,以更好地理解其组装过程,并为未来的研究与应用提供结构平台 | 淡水蓝藻病毒A-1(L)的衣壳结构 | NA | NA | 冷冻电镜 | NA | 结构 | NA |