合成生物学相关文章
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当前共找到 3070 篇文献，本页显示第 2161 - 2180 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2161 | 2024-08-07 |
What is the role of microbial biotechnology and genetic engineering in medicine?
2024-Apr, MicrobiologyOpen
IF:3.9Q2
DOI:10.1002/mbo3.1406
PMID:38556942
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综述 | 本文综述了微生物生物技术和遗传工程在医学领域的应用，重点介绍了基于基因的技术在开发治疗剂中的作用 | 本文介绍了遗传工程技术、功能基因组学和合成生物学在揭示先前未知的天然产物中的应用 | NA | 探讨微生物生物技术和遗传工程在医学中的作用 | 微生物产品及其在治疗剂开发中的应用 | NA | NA | 遗传工程技术、功能基因组学、合成生物学 | NA | NA | NA |
| 2162 | 2024-08-07 |
A general model for predicting enzyme functions based on enzymatic reactions
2024-Mar-31, Journal of cheminformatics
IF:7.1Q1
DOI:10.1186/s13321-024-00827-y
PMID:38556873
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研究论文 | 本文介绍了一种基于BERT的多分类模型BEC-Pred，用于预测与反应相关的酶委员会（EC）编号 | BEC-Pred模型利用迁移学习，通过分析底物和产物的SMILES序列，实现了对广泛酶委员会（EC）编号的精确预测 | NA | 开发一种高效准确的模型来预测酶的功能 | 酶的功能预测 | 机器学习 | NA | BERT | BERT | 文本 | NA |
| 2163 | 2024-08-07 |
Novel processing strategies to enhance the bioaccessibility and bioavailability of functional components in wheat bran
2024, Critical reviews in food science and nutrition
IF:7.3Q1
DOI:10.1080/10408398.2022.2129582
PMID:36190261
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综述 | 本文综述了小麦麸皮中的功能性成分，分析了改性方法，并重点介绍了新型固态发酵（SSF）策略在释放功能性成分中的应用 | 利用传统发酵食品中的高效微生物资源，探索细胞群落间的物质交换规律，构建稳定的自调节共培养系统，以及结合新兴的物理场预处理技术 | NA | 探讨如何通过新型处理策略提高小麦麸皮中功能性成分的生物可及性和生物利用度 | 小麦麸皮中的功能性成分，如膳食纤维、多糖和酚类 | NA | NA | 固态发酵（SSF）、合成生物学、基因编辑 | NA | NA | NA |
| 2164 | 2024-08-07 |
Using EuGeneCiD and EuGeneCiM computational tools for synthetic biology
2021-12-17, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2021.100820
PMID:34585158
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研究论文 | 本文介绍了一种使用EuGeneCiD和EuGeneCiM计算工具进行合成生物学设计和建模的优化方法 | 提出了一种基于优化工具的合成生物学设计和建模方法，有助于提高遗传电路设计的成功率 | NA | 探索合成生物学中遗传电路设计的计算方法 | 遗传电路的设计和筛选 | 合成生物学 | NA | 计算优化工具 | NA | 遗传电路设计数据 | NA |
| 2165 | 2024-08-07 |
Directed Signaling Cascades in Monodisperse Artificial Eukaryotic Cells
2021-10-26, ACS nano
IF:15.8Q1
DOI:10.1021/acsnano.1c04219
PMID:34570489
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研究论文 | 本研究通过微流控平台生产单分散多泡囊泡（MVVs）作为合成真核细胞，并展示其在不同隔室间进行定向化学通信的能力 | 开发了一种微流控平台，能够高效生产具有三个独立内隔室的脂质基MVVs，并展示其在隔室间进行定向化学通信的能力 | NA | 解决多隔室人工细胞能够沿着特定空间路径定向生物化学反应的工程挑战 | 单分散多泡囊泡（MVVs）作为合成真核细胞 | 合成生物学 | NA | 微流控技术 | NA | 囊泡 | NA |
| 2166 | 2024-08-07 |
Plastic-Degrading Potential across the Global Microbiome Correlates with Recent Pollution Trends
2021-10-26, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mBio.02155-21
PMID:34700384
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研究论文 | 本研究利用全球环境DNA采样项目，构建隐马尔可夫模型并挖掘海洋和土壤宏基因组，评估微生物降解塑料的全球潜力 | 本研究首次编译了超过30,000种非冗余酶同源物目录，这些酶具有降解10种不同塑料类型的潜力，并发现海洋酶丰度随深度增加与塑料污染趋势相关 | 尽管研究揭示了微生物降解塑料的潜力，但自然降解过程仍然非常缓慢，且微生物群落中仍存在未探索的多样性 | 探讨全球微生物降解塑料的潜力及其与塑料污染趋势的相关性 | 全球微生物群落及其降解塑料的能力 | 环境科学 | NA | 隐马尔可夫模型 | 隐马尔可夫模型 | 宏基因组数据 | 超过30,000种非冗余酶同源物 |
| 2167 | 2024-08-07 |
Cell-free riboswitches
2021-Oct-07, RSC chemical biology
IF:4.2Q2
DOI:10.1039/d1cb00138h
PMID:34704047
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综述 | 本文综述了在原核和真核细胞无细胞系统中起作用的合成无细胞核糖开关，以提供当前无细胞核糖开关技术及其局限性的现状 | 无细胞核糖开关能够检测化学信号并通过调控无细胞蛋白质合成系统中的蛋白质合成来响应 | 文章提到无细胞核糖开关技术存在局限性，但未具体说明 | 探讨无细胞合成生物学中构建复杂生物化学和遗传系统的可能性 | 无细胞核糖开关及其在无细胞系统中的应用 | 合成生物学 | NA | RNA-配体相互作用 | NA | NA | NA |
| 2168 | 2024-08-07 |
Understanding and mathematical modelling of cellular resource allocation in microorganisms: a comparative synthesis
2021-Sep-28, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-021-04382-3
PMID:34583645
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综述 | 本文综述了微生物细胞资源分配的原则、假设和数学模型，旨在总结该领域的重要成就并探讨其潜在的生理根源 | 本文重新审视了资源分配现象的竞争性假设，特别是溢出代谢现象的生理根源，并分析了蛋白质组分与核糖体机器分配之间的可能联系 | 文章指出，关于溢出代谢的生理根源和‘蛋白质成本’的正确解释等几个重要问题仍然悬而未决 | 旨在更清晰地理解资源分配在解决细菌生长策略中的作用 | 微生物细胞资源分配现象及其生理根源 | NA | NA | NA | 数学模型 | NA | NA |
| 2169 | 2024-08-07 |
Rapid prototyping and design of cybergenetic single-cell controllers
2021-09-24, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-25754-6
PMID:34561433
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研究论文 | 本文介绍了一种名为Cyberloop的测试框架，用于加速生物分子控制器的设计和实现过程 | 提出了Cyberloop框架，通过实时细胞荧光测量和计算机模拟，实现了对生物分子控制器的快速设计和测试 | NA | 旨在解决合成生物学中合成电路设计的不确定性和耗时问题 | 研究了不同生物分子控制器在酵母细胞中的应用及其性能 | 合成生物学 | NA | optogenetic tools | NA | 细胞荧光测量 | NA |
| 2170 | 2024-08-07 |
A toolbox for digitally enhanced teaching in synthetic biology
2021-09-14, FEMS microbiology letters
IF:2.2Q3
DOI:10.1093/femsle/fnab115
PMID:34472608
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综述 | 本文综述了在合成生物学领域中，利用数字工具进行远程教育的方法和资源 | 介绍了多种远程教育工具和方法，以应对疫情期间的教育挑战 | 主要关注合成生物学领域的远程教育，可能不适用于其他学科 | 探讨如何在合成生物学教育中有效利用数字工具进行远程教学 | 合成生物学领域的教育者和学生 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2171 | 2024-08-07 |
In situ activation of therapeutics through bioorthogonal catalysis
2021-09, Advanced drug delivery reviews
IF:15.2Q1
DOI:10.1016/j.addr.2021.113893
PMID:34333074
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综述 | 本文综述了生物正交纳米催化剂的最新进展及其在治疗和诊断中的应用 | 开发了基于合成金属催化剂的生物正交反应，扩展了生物正交化学在药物化学和合成生物学中的应用 | 直接应用裸露的过渡金属催化剂在复杂生物介质中存在水溶性差、毒性和催化剂失活等问题 | 探讨生物正交纳米催化剂的制备及其在生物医学领域的应用 | 生物正交纳米催化剂及其在治疗和诊断中的应用 | NA | NA | 生物正交化学 | NA | NA | NA |
| 2172 | 2024-08-07 |
TALENs-an indispensable tool in the era of CRISPR: a mini review
2021-Aug-21, Journal, genetic engineering & biotechnology
DOI:10.1186/s43141-021-00225-z
PMID:34420096
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综述 | 本文综述了TALENs和CRISPR/Cas9基因编辑系统的结构和功能角色，以及TALENs的独特特性和CRISPR的局限性 | TALENs在治疗领域提供了新的机会，具有高度的特异性和对DNA修饰的敏感性 | CRISPR在临床应用中通常不被首选，且gRNA难以导入线粒体DNA | 探讨TALENs在合成生物学领域的不可或缺性，并为通过基因编辑进行性状改良的研究者提供指导 | TALENs和CRISPR/Cas9基因编辑工具 | 基因编辑 | NA | 基因编辑技术 | NA | NA | NA |
| 2173 | 2024-08-07 |
Modular dynamic biomolecular modelling with bond graphs: the unification of stoichiometry, thermodynamics, kinetics and data
2021-08, Journal of the Royal Society, Interface
DOI:10.1098/rsif.2021.0478
PMID:34428949
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研究论文 | 本文提出了一种基于能量基础的键图方法，用于整合化学计量模型与热力学原理和动力学建模，以开发全细胞模型 | 键图方法能够内在地执行热力学约束，提供模块化建模方法，并为生物分子系统的动态模型提供参数估计的基础 | NA | 开发新的建模方法以适应基因组规模的细胞代谢模型，特别是超越稳态的动态模拟 | 生物分子系统的动态模拟模型 | 生物技术 | NA | 键图方法 | 键图模型 | 实验数据 | NA |
| 2174 | 2024-08-07 |
Metabolic Engineering of Microbial Cell Factories for Biosynthesis of Flavonoids: A Review
2021-Jul-27, Molecules (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/molecules26154522
PMID:34361675
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综述 | 本文综述了黄酮类化合物的生物合成途径以及微生物表达系统在黄酮类化合物生产中的发展 | 强调了共培养系统在黄酮类化合物生物合成中的应用 | NA | 为黄酮类化合物的合成代谢工程进一步研究提供有用的参考 | 黄酮类化合物的生物合成途径和微生物表达系统 | 合成生物学 | NA | 合成代谢工程 | NA | NA | NA |
| 2175 | 2024-08-07 |
Recent Advances in the Synthetic Biology of Natural Drugs
2021, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2021.691152
PMID:34395399
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综述 | 本文综述了天然药物合成生物学的最新进展，特别关注了通过优化合成系统可能大规模生产的药物研究 | 提出了通过重建和优化生物合成途径来大规模制备一些稀有天然植物代谢物和高度生物活性微生物化合物的新策略 | 一些提出的合成方法仍处于初步探索阶段 | 探讨利用合成生物学生产天然药物的方法及其应用潜力 | 九种药物，包括七种来自植物和两种来自微生物的药物 | 合成生物学 | NA | 合成生物学 | NA | NA | 九种药物 |
| 2176 | 2024-08-07 |
Designed Artificial Protein Heterodimers With Coupled Functions Constructed Using Bio-Orthogonal Chemistry
2021, Frontiers in chemistry
IF:3.8Q2
DOI:10.3389/fchem.2021.733550
PMID:34422774
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研究论文 | 本文展示了如何将两种不同的蛋白质——血红素结合螺旋束蛋白细胞色素和β桶绿色荧光蛋白通过非天然的三唑连接形成异二聚体 | 通过计算对接方法预测两种蛋白质的兼容界面，并使用遗传密码扩展技术将两种蛋白质通过三唑共价键连接，形成具有新功能特性的异二聚体 | NA | 设计并构建能够结合结构和功能上不同的蛋白质形成具有新功能特性的异二聚体 | 血红素结合螺旋束蛋白细胞色素和β桶绿色荧光蛋白 | 生物技术 | NA | 遗传密码扩展技术 | 计算对接方法 | 蛋白质结构 | 两种蛋白质 |
| 2177 | 2024-08-07 |
Design and assembly of DNA molecules using multi-objective optimization
2021, Synthetic biology (Oxford, England)
DOI:10.1093/synbio/ysab026
PMID:34676304
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研究论文 | 本文开发了一种新的开源算法，用于DNA工程的多目标优化设计与组装 | 提出了一种新的多目标优化算法，用于DNA设计和组装，能够平衡设计要求和制造约束 | NA | 解决生物系统工程中制造约束与设计过程整合不足的问题 | DNA分子从基因到基因组的设计与组装 | 合成生物学 | NA | 多目标优化算法 | NA | NA | NA |
| 2178 | 2024-08-07 |
paraSBOLv: a foundation for standard-compliant genetic design visualization tools
2021, Synthetic biology (Oxford, England)
DOI:10.1093/synbio/ysab022
PMID:34712845
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研究论文 | 本文介绍了一个名为paraSBOLv的Python包，该包通过使用机器可读的参数化符号定义，使SBOLv符号的完整套件可访问，从而简化了图形的渲染过程并允许对生成的图形进行广泛的自定义 | paraSBOLv通过使用机器可读的参数化符号定义，简化了符号渲染过程，并支持高度专业化的生物设计可视化工具的开发 | NA | 加速高度专业化的生物设计可视化工具的开发，并为更复杂的软件提供基础 | 开发支持SBOLv标准的遗传设计可视化工具 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2179 | 2024-08-07 |
A short review on cell-based biosensing: challenges and breakthroughs in biomedical analysis
2020-Dec-25, Journal of biomedical research
IF:2.2Q3
DOI:10.7555/JBR.34.20200128
PMID:33888671
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综述 | 本文综述了基于细胞的生物传感器的最新进展，重点介绍了其在生物医学分析中的挑战和突破 | 介绍了基于细胞的生物传感器在生物医学分析中的新概念和合成生物学工具箱的应用，以及如何开发具有定制性能的生物传感平台 | NA | 旨在激发对基于细胞的生物传感器的兴趣，并提高其接受度和应用 | 基于细胞的生物传感器及其在生物医学分析中的应用 | 生物医学工程 | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA |
| 2180 | 2024-08-07 |
Engineered dCas9 with reduced toxicity in bacteria: implications for genetic circuit design
2018-11-16, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gky884
PMID:30289463
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研究论文 | 本文通过消除dCas9的PAM结合位点并恢复其DNA结合能力，构建了一种在细菌中低毒性的dCas9变体，用于遗传电路设计。 | 引入了一种非毒性的dCas9变体dCas9*_PhlF，通过R1335K突变消除PAM结合，并与PhlF抑制因子融合，从而在Escherichia coli中显著降低毒性。 | 同时使用多个sgRNA会导致抑制效果单调下降，当同时表达15个sgRNA时，动态范围小于10倍。 | 开发一种在细菌中低毒性的dCas9变体，以促进其在代谢工程和合成生物学中的应用。 | dCas9的毒性及其在遗传电路设计中的应用。 | 合成生物学 | NA | 基因编辑技术 | dCas9*_PhlF | 基因表达数据 | 30个正交sgRNA-启动子对 |