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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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2161 | 2024-08-07 |
Biosynthesis of Nature-Inspired Unnatural Cannabinoids
2021-May-14, Molecules (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/molecules26102914
PMID:34068935
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综述 | 本文综述了天然大麻素的生物合成途径及其在异源宿主中的合成生物学研究 | 通过合成生物学和代谢工程,可以在异源宿主中高效合成低产量的稀有大麻素,并探索新型衍生化合物的生物活性 | NA | 探讨大麻素的生物合成途径及其作为治疗剂的潜力 | 大麻素及其衍生物的生物合成和生物活性 | NA | NA | 合成生物学,代谢工程 | NA | NA | NA |
2162 | 2024-08-07 |
Novel synthetic biology approaches for developmental systems
2021-05-11, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2021.04.007
PMID:33979593
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研究论文 | 本文探讨了合成生物学工具在研究和发展系统中的应用,特别是在干细胞器官模型、胚胎模式形成和非发育系统的模式形成与形态发生中的应用。 | 介绍了合成生物学工具在三个特定领域的应用,包括干细胞器官模型、用户定义的扰动研究胚胎模式形成以及使用合成遗传电路的非发育系统模式形成与形态发生模型。 | NA | 研究和发展系统中的自组织能力及其控制。 | 干细胞器官模型、胚胎模式形成、非发育系统的模式形成与形态发生。 | 合成生物学 | NA | 合成生物学工具 | 合成遗传电路 | NA | NA |
2163 | 2024-08-07 |
Microbial methionine transporters and biotechnological applications
2021-May, Applied microbiology and biotechnology
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s00253-021-11307-w
PMID:33929594
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综述 | 本文综述了微生物甲硫氨酸转运蛋白的四个家族及其在生物技术应用中的研究进展 | 探讨了甲硫氨酸转运蛋白在发酵生产和合成生物学系统中的应用潜力 | NA | 总结甲硫氨酸转运蛋白的当前知识,并探讨其在生物技术和合成生物学中的应用 | 甲硫氨酸转运蛋白的四个家族及其功能、基因调控和生物技术应用 | 生物技术 | NA | 基因工程 | NA | NA | NA |
2164 | 2024-08-07 |
Developments in Nano-materials and Analysing its role in Fighting COVID-19
2021, Materials today. Proceedings
DOI:10.1016/j.matpr.2021.05.020
PMID:33996513
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研究论文 | 本文探讨了纳米材料在抗击新冠病毒中的应用及其发展,包括其在疫苗和抗病毒药物开发中的作用 | 介绍了纳米材料在制造特殊口罩、细菌捕捉技术和手消毒剂中的创新应用 | NA | 分析和讨论纳米材料在抗击和预防新冠病毒传播中的有效性 | 纳米材料,包括银、铁、陶瓷、石墨烯碳纳米管等 | NA | 新冠病毒 | 纳米材料 | NA | NA | NA |
2165 | 2024-08-07 |
Producing molecular biology reagents without purification
2021, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0252507
PMID:34061896
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研究论文 | 本文介绍了一种简化方法,用于制备细胞性试剂,即通过低温干燥过度表达目标蛋白的细菌,以替代商业纯酶在典型诊断和分子生物学反应中的应用 | 开发了一种简化的细胞性试剂制备方法,仅需要常见的细菌培养箱和廉价的化学干燥剂,使得该技术更易于广泛访问和本地生产 | NA | 旨在简化细胞性试剂的制备过程,使其更易于本地生产和广泛应用 | 细胞性试剂的制备方法及其在分子和合成生物学过程中的应用 | 分子生物学 | NA | PCR, qPCR, 反向转录, 等温扩增, Golden Gate DNA组装 | NA | NA | 在英国、喀麦隆和加纳等多个国家成功实施了该简化程序并制备了细胞性试剂 |
2166 | 2024-08-07 |
Further Biochemical Profiling of Hypholoma fasciculare Metabolome Reveals Its Chemogenetic Diversity
2021, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2021.567384
PMID:34109161
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研究论文 | 本研究进一步分析了Hypholoma fasciculare的代谢组,揭示了其化学遗传多样性 | 利用现代真菌分子和合成生物学工具,探索蘑菇真菌作为新型治疗药物的潜力 | NA | 研究九种担子菌的次级代谢产物,筛选其生物和化学特性,并调查与其生产相关的遗传途径 | 九种担子菌的次级代谢产物及其生物和化学特性 | NA | NA | 基因组比较和色谱研究 | NA | 基因组数据 | 九种担子菌 |
2167 | 2024-08-07 |
Altering Compositional Properties of Viral Genomes to Design Live-Attenuated Vaccines
2021, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2021.676582
PMID:34276608
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研究论文 | 本文讨论了通过修改病毒基因组的组成特性来设计新型减毒活疫苗的不同方法 | 利用合成生物学技术和对病毒基因组组成特性的深入理解,探索了通过理性遗传设计实现病毒减毒的新策略 | NA | 开发新型减毒活疫苗 | 病毒基因组的组成特性 | 合成生物学 | NA | 合成生物学技术 | NA | 基因组 | NA |
2168 | 2024-08-07 |
Recent Advances in Heterologous Synthesis Paving Way for Future Green-Modular Bioindustries: A Review With Special Reference to Isoflavonoids
2021, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2021.673270
PMID:34277582
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综述 | 本文综述了异源合成在促进未来绿色模块化生物工业中的最新进展,特别关注了异黄酮类化合物 | 随着代谢工程的进步和先进合成生物学工具的可用性,预计将很快设计出高度高效的异源宿主以满足不断增长的市场需求 | 目前的生产方法受限于缓慢的酶动力学和传统的繁琐遗传工程方法,需要进一步优化和发展以满足商业应用所需的滴定度、反应速率和产量 | 探讨异源合成在生物工业中的应用,特别是异黄酮类化合物的合成 | 异黄酮类化合物的生物合成途径及其在植物和动物中的应用 | NA | NA | 代谢工程 | NA | NA | 已鉴定出超过2,400种异黄酮类化合物,主要来自豆科植物 |
2169 | 2024-08-07 |
Bioelectronics communication: encoding yeast regulatory responses using nanostructured gallium nitride thin films
2018-Jun-21, Nanoscale
IF:5.8Q1
DOI:10.1039/c8nr03684e
PMID:29888776
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研究论文 | 研究展示了如何利用纳米结构的氮化镓薄膜编码酿酒酵母的生理反应 | 首次展示了氮化镓纳米结构薄膜在酵母细胞生理反应编码中的应用 | NA | 探索氮化镓纳米结构薄膜在酵母细胞生理反应编码中的应用 | 酿酒酵母的生理反应 | 生物电子学 | NA | 光电流测量、原子力显微镜和开尔文探针力显微镜 | NA | 纳米结构薄膜 | NA |
2170 | 2024-08-07 |
Convenient synthesis and delivery of a megabase-scale designer accessory chromosome empower biosynthetic capacity
2024-Apr, Cell research
IF:28.1Q1
DOI:10.1038/s41422-024-00934-3
PMID:38332200
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研究论文 | 本文开发了一种基于CRISPR/Cas9介导的单倍体化方法,用于在酵母中高效组装和传递大型DNA,从而增强宿主的生物合成能力 | 开发了一种名为HAnDy的新方法,无需复杂的体外操作即可实现大型DNA的高效组装和传递 | NA | 开发一种新方法,用于在酵母中高效组装和传递大型DNA,以扩展和解读复杂的生物功能 | 设计了一个1.024 Mb的合成辅助染色体(synAC),编码542个外源基因,并将其传递到六种不同系统发育的酵母中 | 合成生物学 | NA | CRISPR/Cas9 | NA | DNA | 六种不同系统发育的酵母 |
2171 | 2024-08-07 |
Design and assembly of the 117-kb Phaeodactylum tricornutum chloroplast genome
2024-Mar-29, Plant physiology
IF:6.5Q1
DOI:10.1093/plphys/kiad670
PMID:38114089
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研究论文 | 本文展示了两种高效克隆117 kb的Phaeodactylum tricornutum叶绿体基因组的方法 | 开发了两种新的叶绿体基因组克隆方法,效率高达90%至100%,并可稳定维持和传播于大肠杆菌中 | 方法可能仅适用于具有相似叶绿体基因组大小和结构的物种 | 开发新的叶绿体基因组克隆技术,以扩展合成生物学底盘的选择 | Phaeodactylum tricornutum叶绿体基因组 | 合成生物学 | NA | PCR扩增、酵母重组 | NA | DNA | 至少10个酵母菌落 |
2172 | 2024-08-07 |
GraphKM: machine and deep learning for KM prediction of wildtype and mutant enzymes
2024-Mar-28, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-024-05746-1
PMID:38549073
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研究论文 | 本文提出了一种基于深度学习框架PaddlePaddle的机器和深度学习方法GraphKM,用于预测野生型和突变酶的Michaelis常数K | GraphKM结合了图神经网络(GNN)、全连接层和梯度提升框架,通过分子图和预训练的基于transformer的语言模型来表示底物和酶,以构建模型输入 | 现有的机器和深度学习模型仅限于特定酶,如少数酶或野生型酶 | 提高酶动力学研究的步伐,通过预测K值来替代耗时且困难的实验测量 | 野生型和突变酶的Michaelis常数K | 机器学习 | NA | 深度学习 | 图神经网络(GNN)、全连接层、梯度提升框架 | 分子图、文本 | 独立K数据集HXKm |
2173 | 2024-08-07 |
Virus Eradication and Synthetic Biology: Changes with SARS-CoV-2?
2021-03-28, Viruses
DOI:10.3390/v13040569
PMID:33800626
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研究论文 | 本文探讨了合成生物学在病毒消除中的作用,特别是针对SARS-CoV-2的影响 | 强调了合成生物学在快速响应和疫苗开发中的潜力 | NA | 研究合成生物学在病毒消除中的长期可持续性和对公共健康的影响 | SARS-CoV-2病毒及其疫苗开发 | 生物技术 | 传染病 | 合成生物学 | NA | NA | NA |
2174 | 2024-08-07 |
Stability and Robustness of Unbalanced Genetic Toggle Switches in the Presence of Scarce Resources
2021-Mar-24, Life (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/life11040271
PMID:33805212
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研究论文 | 本文研究了在资源稀缺条件下,不平衡遗传触发开关的稳定性和鲁棒性 | 揭示了资源竞争对触发开关动态特性的不利影响,并提出了通过优化资源竞争来减轻这些影响的方法 | 文章未明确提及研究的具体限制 | 探讨资源稀缺对遗传触发开关性能的影响,并提供优化设计指南 | 遗传触发开关在资源稀缺条件下的动态行为 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
2175 | 2024-08-07 |
Mechanisms of Scaffold-Mediated Microcompartment Assembly and Size Control
2021-03-23, ACS nano
IF:15.8Q1
DOI:10.1021/acsnano.0c05715
PMID:33683101
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研究论文 | 本文通过理论和计算研究,探讨了蛋白质壳在多种货物分子和长而灵活的支架分子组成的复合体周围的动态组装过程 | 研究预测了壳体大小、封装货物量及组装路径对支架特性(如长度和支架-货物相互作用的价数)的敏感依赖性,并揭示了蛋白质壳的自组装能力与其自发曲率半径和弹性长度尺度的关系 | NA | 研究细菌微隔间的组装及其大小控制的机制 | 蛋白质壳、货物分子、支架分子 | NA | NA | 理论和计算模拟 | NA | NA | NA |
2176 | 2024-08-07 |
Engineering aminoacyl-tRNA synthetases for use in synthetic biology
2020, The Enzymes
DOI:10.1016/bs.enz.2020.06.004
PMID:33837709
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研究论文 | 本文讨论了在合成生物学领域中,通过遗传密码扩展技术利用工程化的氨酰-tRNA合成酶(aaRSs)来扩展蛋白质氨基酸集合的方法 | 本文介绍了如何通过实验室技术创建设计型的aaRSs和tRNAs,并强调了正交性在遗传密码扩展中的重要性 | NA | 探索和优化遗传密码扩展技术,以在治疗学、生物修复和生物催化等领域中应用 | 工程化的氨酰-tRNA合成酶及其在蛋白质合成中的应用 | 合成生物学 | NA | 遗传密码扩展技术 | NA | NA | NA |
2177 | 2024-08-07 |
A Modular, Dynamic, DNA-Based Platform for Regulating Cargo Distribution and Transport between Lipid Domains
2021-04-14, Nano letters
IF:9.6Q1
DOI:10.1021/acs.nanolett.0c04867
PMID:33733783
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research paper | 本文介绍了一种模块化方法,用于在共存的脂质域中编程两亲性DNA纳米结构的分配 | 利用不同疏水“锚”在不同相中富集的倾向,通过合理组合疏水物质以及改变纳米结构的大小和拓扑结构来调节设备的横向分布 | NA | 复制人工细胞系统中的生命功能,如信号传导和运输 | 两亲性DNA纳米结构在脂质域中的分配和运输 | synthetic biology | NA | DNA nanostructure | NA | lipid domains | NA |
2178 | 2024-08-07 |
Creating enzymes and self-sufficient cells for biosynthesis of the non-natural cofactor nicotinamide cytosine dinucleotide
2021-04-09, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-22357-z
PMID:33837188
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研究论文 | 本文通过重新编程烟酸单核苷酸腺苷酰转移酶的底物结合口袋,创造了一种名为NCD合成酶(NcdS)的酶,促进了细胞内非天然辅因子尼克酰胺胞嘧啶二核苷酸(NCD)的合成 | 开发了一种新的酶NCD合成酶(NcdS),并通过其过表达在模型宿主大肠杆菌中实现了NCD的内源性生产 | NA | 研究非天然辅因子NCD的生物合成及其在细胞内的自给自足 | NCD合成酶(NcdS)及其在细胞内的应用 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 在大肠杆菌模型宿主中进行了实验,NCD水平可达5.0 mM |
2179 | 2024-08-07 |
Guanidine Biosensors Enable Comparison of Cellular Turn-on Kinetics of Riboswitch-Based Biosensor and Reporter
2021-03-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.0c00583
PMID:33646758
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研究论文 | 本研究开发了基于RNA的荧光(RBF)生物传感器,用于检测常见的 chaotropic 试剂胍,并比较了基于核糖开关的生物传感器与报告基因的激活动力学。 | 首次系统地比较了同一配体下基于核糖开关的生物传感器与报告基因的性能,并展示了RBF生物传感器在监测细胞生物学、生物技术和合成生物学中动态过程的优势。 | NA | 开发和优化基于RNA的荧光生物传感器,用于监测胍的细胞内激活动力学。 | 基于RNA的荧光生物传感器和报告基因。 | 生物技术 | NA | RNA-based fluorescent (RBF) biosensors | NA | 荧光信号 | NA |
2180 | 2024-08-07 |
A computational workflow for the expansion of heterologous biosynthetic pathways to natural product derivatives
2021-03-19, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-22022-5
PMID:33741955
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研究论文 | 本文介绍了一种计算工作流程,用于系统筛选生物合成途径的生物化学邻近区域,以发现可通过衍生化途径中间体生产的药物化合物 | 该工作流程能够识别新的生物合成途径和酶候选物,用于生产已知的药物和新的衍生化合物 | NA | 探索和生产新的植物天然产物(PNP)衍生药物 | 植物天然产物及其衍生药物的生物合成途径 | 合成生物学 | NA | 计算筛选 | NA | 生物合成途径 | NA |