合成生物学相关文章
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当前共找到 4965 篇文献，本页显示第 201 - 220 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 201 | 2026-05-03 |
Toward life with a 19-amino acid alphabet through generative artificial intelligence design
2026-Apr-30, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.aeb5171
PMID:42060756
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研究论文 | 通过计算设计与合成生物学探索构建仅由19种氨基酸组成的生命体 | 首次证明异亮氨酸在生命活动中可被替代，并利用蛋白质语言模型和结构模型成功设计出功能性无异亮氨酸蛋白质，构建出可存活的19氨基酸细胞 | 当前仅针对大肠杆菌进行验证，且替代过程依赖大量的计算重设计，可能需进一步优化以适用于其他生物体 | 探索简化氨基酸字母表（19种氨基酸）构建生命体的可行性 | 大肠杆菌中的核糖体及其382个异亮氨酸残基 | 蛋白质工程，合成生物学 | NA | 蛋白质语言模型，基于结构的模型，计算设计，合成生物学 | 蛋白质语言模型，基于结构的模型 | 蛋白质序列与结构数据 | 核糖体中的382个异亮氨酸残基，21个重新设计的亚基 | NA | 大肠杆菌 | 无异亮氨酸核糖体设计 | 合成生物学，基础生物学研究 |
| 202 | 2026-05-03 |
From known knowns to unknown unknowns: synthetic biology paths to antimicrobial discovery
2026-Apr-30, Current opinion in microbiology
IF:5.9Q1
DOI:10.1016/j.mib.2026.102759
PMID:42066660
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评论性文章 | 提出一个合成生物学中心框架，将抗菌天然产物按化学新颖性和工程可及性分为四个象限，以指导抗菌发现策略 | 从已知已知到未知未知的二维映射框架重新定义了合成生物学视角下的天然产物分类，并揭示了不同象限间的动态转化关系 | NA | 提出基于合成生物学的抗菌天然产物发现路径框架，应对当前抗生素耐药挑战 | 抗菌天然产物 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学, 工业生物技术 |
| 203 | 2026-05-03 |
From fundamental understanding to engineering carboxysomes for biotechnological applications
2026-Apr-30, Plant communications
IF:9.4Q1
DOI:10.1016/j.xplc.2026.101882
PMID:42068046
|
综述 | 综述了从基础理解到工程化改造羧基体用于生物技术应用的最新进展 | 系统总结了羧基体在合成生物学和生物工程中的设计原理，包括可编程结构、货物封装、半渗透性和模块化组装，并提出了将其改造为高效固碳引擎和多功能纳米材料的新策略 | 实现壳渗透性的精确控制和货物封装的高效性，以及将羧基体整合到异源宿主中仍面临挑战 | 探讨羧基体的分子机制及其在生物技术中的应用潜力 | 羧基体（一种自组装蛋白质微区室） | 合成生物学 | NA | NA | NA | 文本 | NA | NA | NA | 固碳通路、纳米材料 | 工业生物技术、环境 |
| 204 | 2026-05-03 |
From CRISPR functional genomics to synthetic interventions: engineering antiviral strategies
2026-04-21, Journal of virology
IF:4.0Q2
DOI:10.1128/jvi.00057-26
PMID:41910274
|
综述 | 本文综述了从CRISPR功能基因组学到合成生物学干预的进展，旨在工程化抗病毒策略 | 将CRISPR功能基因组学筛选与合成生物学设计相结合，提出可编程干预手段（如受体诱饵、基因电路和工程化免疫细胞） | 讨论从筛选机制转化为安全有效抗病毒策略时面临的约束条件 | 连接CRISPR功能基因组学与合成抗病毒设计，总结跨病毒家族通用原则 | 病毒与宿主相互作用中的宿主依赖性因子和限制因子 | 功能基因组学, 合成生物学 | 病毒相关疾病 | CRISPR扰动筛选, 单细胞测序, 成像技术, 空间表型分析, 类器官模型 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 人类细胞 | 受体诱饵及结合分子、条件性蛋白降解系统、感染感应基因电路、可调抗病毒功能免疫细胞 | 医学 |
| 205 | 2026-05-03 |
A standardized workflow for kinetic metabolic model curation and dissemination
2026-Apr, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1014227
PMID:42008579
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research paper | 提出一个标准化工作流程，用于动力学代谢模型的构建、注释、可视化和共享 | 整合社区标准和开源工具，确保模型的可重复性、互操作性和用户可访问性 | NA | 提高动力学代谢模型的可重复性和实用性 | 动力学代谢模型 | NA | NA | NA | 动力学代谢模型 | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学, 代谢工程, 系统生物学 |
| 206 | 2026-05-03 |
Emerging ultrafast technologies in biotechnology
2025-May, 3 Biotech
IF:2.6Q3
DOI:10.1007/s13205-025-04309-2
PMID:40292246
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综述 | 重点介绍超快技术在生物技术中的应用，包括实时可视化和精确操纵生物分子过程 | 整合了飞秒激光、超快光谱、泵浦-探针显微镜、CARS及阿秒光谱等多种超快技术，并探讨了其与人工智能和纳米技术的结合，推动诊断、个性化医疗和合成生物学发展 | 面临光损伤、与复杂生物系统整合困难以及伦理考量等挑战 | 综述超快技术在生物技术中的变革性应用及潜力 | 涉及蛋白质折叠路径、酶活性、能量转移机制、CRISPR基因编辑实时监测、细胞动力学、神经活动等生物分子过程和动态 | 机器学习, 数字病理学 | NA | 飞秒激光, 超快光谱, 泵浦-探针显微镜, 相干反斯托克斯拉曼散射, 阿秒光谱 | NA | 图像, 文本 | NA | CRISPR-Cas9 | NA | NA | 医学, 农业, 环境, 能源, 材料, 食品, 工业生物技术 |
| 207 | 2026-05-03 |
Prevention of ribozyme catalysis through cDNA synthesis enables accurate RT-qPCR measurements of context-dependent ribozyme activity
2025-04-16, RNA (New York, N.Y.)
DOI:10.1261/rna.080243.124
PMID:40050070
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研究论文 | 开发并验证了一种通过cDNA合成抑制核酶催化活性以实现准确RT-qPCR测量上下文依赖性核酶活性的方法 | 在样本制备工作流程中引入寡核苷酸以抑制核酶活性，恢复RT-qPCR测量的准确性，首次解决了RNA提取和逆转录条件诱发核酶裂解导致测量不准确的问题 | 研究仅在体外已知上下文依赖性核酶裂解的RNA组上验证，未涉及体内复杂环境或多种核酶类型，潜在限制于实际应用场景的泛化能力 | 准确测量不同遗传和环境上下文中的核酶活性，以验证新核酶序列及基于核酶的生物技术 | 自裂解核酶及其上下文依赖性活性 | 分子生物学 | NA | RT-qPCR, RNA提取, cDNA合成 | NA | RNA定量数据 | 一组已知体外上下文依赖性裂解的RNA样本 | NA | NA | 自裂解核酶（自切割RNA） | 合成生物学, 生物制造, 核酸治疗 |
| 208 | 2026-05-03 |
Active learning of enhancers and silencers in the developing neural retina
2025-Jan-15, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2024.12.004
PMID:39778579
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研究论文 | 开发了一种主动学习方法，用于训练区分增强子和沉默子的模型，并在发育中的神经视网膜中应用 | 将主动学习与合成生物学及不确定性采样相结合，迭代训练模型以区分功能相反的转录因子结合位点 | 未明确说明局限性 | 训练能够区分增强子和沉默子的模型，解释相同转录因子在不同上下文中激活或抑制转录的机制 | 发育中的神经视网膜中的增强子和沉默子 | 机器学习 | NA | 大规模并行报告分析 | 深度学习模型 | 基因组序列 | 几乎全部CRX结合位点及多轮合成生物学数据 | NA | NA | NA | 医学 |
| 209 | 2026-05-02 |
Engineering Plant-Derived P450 Enables the Efficient Production of Berberine through a Concise and Modular Enzymatic Cascade in E. coli
2026-Apr-27, JACS Au
IF:8.5Q1
DOI:10.1021/jacsau.6c00169
PMID:42063854
|
研究论文 | 通过工程化植物来源的P450酶，设计模块化酶促级联反应在大肠杆菌中高效生产小檗碱 | 优化设计了绕过多个天然步骤的简明模块化途径，并结合表达优化、结构指导设计、共识突变和机器学习综合工程化CYP719A1，获得活性提高8.9倍且热稳定性改善的变体 | NA | 解决植物膜结合细胞色素P450酶催化瓶颈，实现植物天然产物小檗碱的可持续高效生产 | 植物来源的CYP719A1酶及其工程化变体 | 合成生物学、代谢工程 | NA | 蛋白质工程、机器学习、酶级联反应 | 机器学习模型 | 序列和结构数据 | NA | CRISPR-Cas9 | 大肠杆菌 | 模块化酶促级联途径（包含P450依赖步骤） | 医药、工业生物技术 |
| 210 | 2026-05-02 |
Engineered commensal Bacteroides thetaiotaomicron enables targeted drug delivery to colorectal tumors
2026-Apr-24, Journal of controlled release : official journal of the Controlled Release Society
IF:10.5Q1
DOI:10.1016/j.jconrel.2026.114945
PMID:42036032
|
研究论文 | 工程化肠道共生菌多形拟杆菌实现结直肠肿瘤靶向药物递送 | 基于天然肠道共生菌多形拟杆菌构建新型细菌递送系统，通过筛选表面锚定蛋白实现肿瘤靶向蛋白展示，并整合治疗模块实现双重抗肿瘤效果 | 尚需进一步评估临床安全性和长期免疫反应 | 开发基于肠道共生菌的靶向肿瘤治疗新策略 | 多形拟杆菌 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 微生物工程 | NA | NA | AOM/DSS诱导的结直肠癌小鼠模型 | NA | 多形拟杆菌 | 肿瘤靶向蛋白展示系统及溶血素E治疗模块 | 医学 |
| 211 | 2026-05-02 |
Ornithine lipids and other acyloxyacyl amino lipids: the coming-of-age story of a group of non-canonical membrane lipids
2026-Mar-08, Applied microbiology and biotechnology
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s00253-026-13777-2
PMID:41794944
|
综述 | 本文综述了鸟氨酸脂及其他酰氧基酰基氨基脂的研究进展，包括其合成途径、功能及其在合成生物学中的潜在应用 | 首次系统分析了编码鸟氨酸脂合酶的基因在细菌分类中的分布，并讨论了鸟氨酸脂修饰对膜性质的生物物理影响及其与Toll样受体4的相互作用 | 未提供实验数据验证预测，且综述范围限于已发表研究，可能遗漏未报道的数据 | 总结鸟氨酸脂的生物合成、修饰、功能及应用进展，促进其在合成生物学中的利用 | 细菌中的鸟氨酸脂及类似脂类 | 合成生物学 | NA | NA | NA | 基因序列数据 | NA | NA | 大肠杆菌（E. coli） | 代谢通路：鸟氨酸脂生物合成与修饰 | 合成生物学 |
| 212 | 2026-05-02 |
Mass spectrometry integrates protein design into structural biology method development
2026, QRB discovery
DOI:10.1017/qrd.2025.10018
PMID:42063620
|
综述 | 概述了质谱如何通过验证多种设计目标来补充蛋白质设计，并探讨了工程蛋白作为方法开发测试平台的价值 | 提出将机器学习与原生质谱整合形成反馈循环的新观点，即新设计挑战分析技术，改进的方法提供更丰富数据以指导未来预测 | 未提及具体实验数据或量化分析，缺乏对整合方法实际效能的评估 | 阐述质谱在蛋白质设计验证中的作用及其与机器学习的协同关系 | 人工设计蛋白质及其结构特征（寡聚化、折叠、配体结合、动态构象变化） | 机器学习 | NA | 质谱 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学, 人工原细胞开发 |
| 213 | 2026-05-02 |
PSMA-directed CAR-T cell therapy for metastatic castration-resistant prostate cancer: a next-generation engineering perspective on stem cell-derived immune effectors
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1819701
PMID:42064077
|
综述 | 这篇综述回顾了针对转移性去势抵抗性前列腺癌（mCRPC）的PSMA导向CAR-T细胞疗法的临床翻译现状，并提出了一种三重协同框架来克服TME免疫抑制、抗原异质性和T细胞适应性等核心挑战 | 提出了三重协同框架系统解构实体瘤障碍，并聚焦于干细胞衍生免疫效应器（如iPSC衍生CAR-T、CAR-NK、CAR-巨噬细胞）作为新一代细胞产品范式，同时纳入基于证据的等级评估提升学术严谨性 | NA | 为PSMA-CAR-T疗法提供战略蓝图，以将其推进至mCRPC的治愈性治疗，并广泛适用于新一代干细胞衍生免疫疗法 | PSMA导向CAR-T细胞疗法及其在mCRPC中的临床应用 | 数字病理学 | 前列腺癌 | CAR-T细胞疗法 | NA | NA | NA | NA | 人 | 嵌合抗原受体 | 医学 |
| 214 | 2026-05-01 |
Combining model-based and data-driven models: An application to synthetic biology resource competition
2026-Jun, Mathematical biosciences
IF:1.9Q3
DOI:10.1016/j.mbs.2026.109649
PMID:41791590
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研究论文 | 该研究探索了机器学习和机理模型的整合方法，并应用于合成生物学资源竞争问题 | 提出了部分不确定模型结构（PUMS）概念和嵌入式物理信息神经网络（ePINNs），通过两个共享损失函数神经网络无缝融合ML和MM组件，并防止ML忽视机理约束 | 机理模型构建耗时且依赖简化假设，可能无法完全捕捉现实复杂性 | 结合机器学习和机理模型以实现更鲁棒的预测和增强的系统洞察 | 机器学习模型与机理模型的整合方法 | 机器学习 | NA | NA | 嵌入式物理信息神经网络（ePINNs） | NA | NA | NA | 活细胞 | 基因网络模型 | 合成生物学 |
| 215 | 2026-05-01 |
Engineered live bacteria for liver diseases and gut-liver axis disorders: from genetic modification to advanced delivery systems
2026-Apr-29, Journal of nanobiotechnology
IF:10.6Q1
DOI:10.1186/s12951-026-04483-2
PMID:42057131
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综述 | 本文综述了工程化活菌在肝脏疾病及肠肝轴疾病中的应用，从基因修饰到先进递送系统的进展 | 系统总结了工程化活菌在肝脏疾病治疗中的内部基因修饰与外部共价连接策略，并讨论了多种递送系统（胶囊、微囊、纳米制剂）和给药方式 | 面临挑战包括工程化活菌的临床转化难度、安全性及稳定性问题 | 探讨工程化活菌在肝脏疾病治疗中的潜力，推动其临床应用并减轻肝脏疾病的全球负担 | 双歧杆菌、大肠杆菌Nissle 1917、枯草芽孢杆菌、布拉酵母菌、罗伊氏乳杆菌等工程化活菌 | 数字病理学 | 肝细胞癌、非酒精性脂肪性肝病、酒精性肝病 | 基因工程 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick | 大肠杆菌, 枯草芽孢杆菌, 酿酒酵母 | 生物传感器, 代谢通路 | 医学 |
| 216 | 2026-05-01 |
Bacillus methanolicus as an emerging platform for energy-efficient biomanufacturing from one-carbon and marine resources
2026-Apr-28, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2026.103500
PMID:42056785
|
综述 | 本文强调枯草芽孢杆菌甲醇利用菌作为新兴生物制造平台，能够高效利用甲醇和甘露醇 | 首次系统阐述该菌在利用一碳和海洋资源方面的能量高效特性及合成生物学工具进展 | 讨论甲醇和甘露醇生物制造面临的挑战，需进一步优化菌株 | 建立枯草芽孢杆菌甲醇利用菌作为联接一碳和海洋衍生底物与可持续化学合成的多功能平台 | 枯草芽孢杆菌甲醇利用菌的甲醇和甘露醇代谢途径 | 合成生物学 | NA | 合成生物学工具 | NA | NA | NA | NA | 枯草芽孢杆菌甲醇利用菌 | NA | 工业生物技术 |
| 217 | 2026-04-28 |
Ultra-rapid and high-titer biomanufacturing of trehalose 6-phosphate by an in vitro synthetic biology platform
2026-Apr-27, Bioresources and bioprocessing
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s40643-026-01057-w
PMID:42043645
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 218 | 2026-05-01 |
A genetic manipulation tool based on the GP35 recombinase for targeted gene editing in mycoplasmas of ruminants
2026-Apr-27, The Journal of biological chemistry
IF:4.0Q2
DOI:10.1016/j.jbc.2026.113096
PMID:42055338
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研究论文 | 基于GP35重组酶的遗传操作工具，用于反刍动物支原体的靶向基因编辑 | 首次利用来自噬菌体SPP1的GP35重组酶在牛支原体中实现精准基因插入和缺失，避免随机脱氨风险，编辑效率高达77.78%-100% | 该工具当前仅针对牛支原体验证，对其他反刍动物病原体的适用性需进一步验证，且未探讨长期稳定性和潜在脱靶效应 | 开发一种有效的遗传工具以推进反刍动物支原体致病机制研究和疫苗开发 | 反刍动物支原体病原体，特别是牛支原体 | 合成生物学， | 反刍动物传染病， | GP35重组酶介导的长单链DNA重组工程 | NA | DNA序列， | 涉及牛支原体突变体，具体样本数未提及 | GP35重组酶， | 牛支原体 | 基于GP35重组酶的精准基因编辑系统 | 畜牧业，兽药 |
| 219 | 2026-05-01 |
From modular engineering to practical applications: Advances in GPCR-based yeast biosensors
2026-Apr-24, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.108909
PMID:42035967
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综述 | 系统剖析基于GPCR的酵母生物传感器的工程化进展及其模块化框架 | 通过模块化框架梳理传感、转导和输出三个核心模块的工程策略，并强调人工智能与合成生物学整合实现下一代生物传感器的预测性和可编程设计 | 未提及具体实验数据或定量性能比较，依赖已发表文献的综述性总结 | 综述GPCR酵母生物传感器的工程化进展及其在多种配体检测中的应用扩展 | GPCR、酵母信号网络、报告蛋白 | 合成生物学 | NA | GPCR工程、酵母信号通路改造 | NA | NA | NA | NA | 酿酒酵母 | 生物传感器（GPCR信号转导与报告基因输出） | 医学、农业、环境、工业生物技术 |
| 220 | 2026-05-01 |
Closing the loop: AI-driven integration of multi-omics and phenomics for systematic resilient crop engineering
2026-Apr-24, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.108908
PMID:42035969
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综述 | 本文综合阐述了边缘到云的闭环框架，该框架统一了多组学、实时表型组学和合成生物学，并由人工智能驱动，以实现系统性抗逆作物工程 | 提出从被动预测转向主动设计的范式转变，利用生成式人工智能和基础模型加速设计-构建-测试-学习循环，并提出了弥合计算机模拟与田间实际差距的路线图 | 未具体说明局限性，可能涉及当前框架在田间部署的挑战、数据可获取性或计算资源限制 | 将作物改良转化为能够为未来气候培育抗逆品种的预测性工程学科 | 作物及其与基因型-环境-管理相互作用的复杂系统 | 机器学习 | NA | 多组学、实时表型组学、合成生物学、深度学习、生成式人工智能 | Transformer架构、图神经网络、多模态融合算法、生成式人工智能、基础模型 | 多组学数据、表型数据 | NA | 合成生物学工具 | NA | 抗逆蛋白和基因回路 | 农业 |