合成生物学相关文章
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当前共找到 5201 篇文献，本页显示第 201 - 220 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 201 | 2026-06-11 |
Design-driven optimization of low-cost reagent formulations for reproducible and high-yielding cell-free gene expression
2026-Mar-05, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-69605-8
PMID:41786720
|
研究论文 | 通过多维确定性筛选设计，优化低成本的细胞无细胞基因表达试剂配方，实现高产且可重复的蛋白质生产 | 首次采用多维确定性筛选设计从1231种配方中优选出仅含12种成分的简化试剂配方，大幅降低成本并提高产量，同时验证了配方在不同条件下的稳健性 | 未明确说明，但可能包括对特定蛋白质类型的适用性限制或大规模生产时的稳定性挑战 | 优化细胞无细胞基因表达系统的试剂配方，降低成本和复杂性，提高可重复性和产量 | 细胞无细胞基因表达系统中的试剂配方 | 合成生物学 | NA | 细胞无细胞基因表达 | NA | 配方组成数据及蛋白产量数据 | 1,231种不同试剂配方，以及超过20种不同蛋白质的合成测试 | NA | 大肠杆菌细胞裂解液 | 无细胞基因表达系统（用于蛋白质合成） | 生物技术，合成生物学，蛋白质生产 |
| 202 | 2026-06-11 |
Engineering yeast for sustainable bioproduction of tryptophan-derived aromatic compounds
2026-Jan-05, FEMS yeast research
IF:2.4Q3
DOI:10.1093/femsyr/foag012
PMID:41770028
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综述 | 该文章综述了通过工程化酵母可持续生产色氨酸衍生芳香族化合物的最新进展 | 系统总结了利用酵母细胞工厂生产色氨酸衍生物的最新策略与合成生物学工具 | 讨论了实现高效、可扩展和经济可行的酵母生物合成所面临的挑战 | 推动酵母在可持续生物生产中替代传统化学合成以应对气候变化和资源枯竭 | 酵母细胞工厂和色氨酸衍生芳香族化合物 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、合成生物学工具 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick | 酵母 | 色氨酸代谢通路 | 聚合物、食品、饲料、化妆品、制药工业 |
| 203 | 2026-06-11 |
Characterization of phage AbpL with a terminally redundant genome and its therapeutic potential against drug-resistant Acinetobacter baumannii infections
2026, Frontiers in cellular and infection microbiology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcimb.2026.1760018
PMID:41798749
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研究论文 | 表征具有末端冗余基因组的噬菌体AbpL及其对耐药鲍曼不动杆菌感染的治疗潜力 | 首次分离并全面表征了具有400 bp末端冗余的噬菌体AbpL，评估其对多重耐药鲍曼不动杆菌的体内外疗效，并作为合成生物学工程候选平台 | 主要依赖小鼠模型，未涉及人体临床试验或长期安全性评估 | 评估噬菌体AbpL作为替代抗生素治疗多重耐药鲍曼不动杆菌感染的潜力 | 多重耐药鲍曼不动杆菌（MDR-AB）和噬菌体AbpL | NA | 鲍曼不动杆菌感染 | NA | NA | 实验数据（形态、生长特性、基因组、治疗结果） | 52%的临床MDR-AB分离株和40只小鼠（脓毒症模型） | NA | NA | NA | 医学 |
| 204 | 2026-06-10 |
Closing the loop: AI-driven integration of multi-omics and phenomics for systematic resilient crop engineering
2026-Sep, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.108908
PMID:42035969
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综述 | 综述了人工智能驱动的多组学与表型组学整合闭环框架，用于系统性的抗逆作物工程 | 提出从边缘到云的闭环框架，融合多组学、实时表型组学和合成生物学，利用Transformer和图神经网络解码基因型-环境-管理互作的非线性动力学，并从被动预测转向主动设计，通过生成式AI加速设计-构建-测试-学习循环 | 未明确讨论具体实施中的计算资源需求、数据整合标准缺失以及实地验证的潜在挑战 | 系统性地将作物改良转变为可预测的工程学科，以应对气候变化下的粮食安全挑战 | 作物基因型、表型及环境互作系统 | 机器学习 | NA | NA | Transformer架构、图神经网络、生成式AI、基础模型 | 多组学数据、表型组学数据 | NA | 合成生物学、基因电路设计 | 作物 | 抗逆蛋白和基因电路 | 农业 |
| 205 | 2026-06-10 |
Macrophages: Redefining extracellular matrix architecture through phenotypic switches as therapeutic targets
2026-Jul, Biomaterials
IF:12.8Q1
|
综述 | 综述巨噬细胞通过表型转换重塑细胞外基质结构及其作为治疗靶点的潜力 | 系统整合了巨噬细胞发育起源、组织特异性表型异质性及其在细胞外基质重塑中的作用，并提出了基于合成生物学和AI辅助生物材料的智能治疗策略 | 在实现时空精确调控和平衡修复与纤维化结局方面仍存在挑战 | 探讨巨噬细胞通过表型转换在组织稳态维持中的作用机制及治疗潜力 | 巨噬细胞及其在组织稳态、细胞外基质重塑、免疫监视中的作用 | 机器学, 合成生物学 | 纤维化疾病, 慢性炎症性疾病 | NA | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, 合成生物学 | 巨噬细胞 | 智能治疗回路 | 医学 |
| 206 | 2026-06-10 |
Double-edged sword: Aspergillus flavus as a threat to food safety and a resource for biotechnology
2026 Jul-Aug, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.108848
PMID:41730464
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综述 | 系统综述了黄曲霉的次生代谢组多样性及其在食品安全威胁与生物技术资源中的双重角色 | 将黄曲霉重新定义为兼具生物安全风险与可开发化学多样性储库的双重用途生物，并整合基因组挖掘与合成生物学策略揭示其隐蔽代谢途径 | 未详细讨论黄曲霉毒素替代检测方法的发展现状 | 整合黄曲霉次生代谢物多样性与调控机制的知识，探索其在生物技术中的应用潜力 | 黄曲霉（Aspergillus flavus）及其次生代谢物（如黄曲霉毒素、环匹阿尼酸、曲酸、震颤素等） | 机器学习的其他应用 | 肝癌 | 基因组挖掘、CRISPR、异源表达 | NA | 文本 | NA | CRISPR-Cas9 | 黄曲霉 | 生物合成基因簇（BGCs）激活 | 医药, 农业, 工业生物技术 |
| 207 | 2026-06-10 |
Microalgae-Based Semiartificial Photosynthesis: Strategies, Applications, and Future Prospects
2026-Jun-09, Environmental science & technology
IF:10.8Q1
DOI:10.1021/acs.est.6c01166
PMID:42203637
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综述 | 综述微藻基半人工光合作用系统的策略、应用与未来前景 | 通过将活体藻细胞与工程化非生物组件结合，无需体外重建光合作用，系统性地优化光子利用、电子传递、二氧化碳浓度和环境鲁棒性 | 生物-非生物界面的能量耦合、缺乏标准化性能指标、长期稳定性不足以及纳米材料的可持续性问题 | 探讨微藻基半人工光合系统在太阳能燃料生产、生物制造、环境修复和生物混合微机器人等领域的应用及未来发展方向 | 微藻光合作用与半人工光合系统 | 数字生物学 | NA | 半人工光合作用 | NA | NA | NA | NA | 微藻 | NA | 能源, 环境, 工业生物技术 |
| 208 | 2026-06-10 |
The impact of fertilization on the health of paddy soil: pathways and prospects for fertility regulation based on microbial communities
2026-Jun-09, Crop health
DOI:10.1007/s44297-026-00078-3
PMID:42262665
|
综述 | 本文综述了施肥对水稻土健康的影响，并从微生物群落角度探讨了培育肥力的途径与前景 | 揭示了水稻土厌氧环境下有机质周转缓慢及土壤有机碳稳定的独特机制，并提出了基于合成生物学、材料工程和数据驱动智能决策系统的未来研究方向 | 缺乏对施肥阈值与微生物群落动态关系的定量分析，且未涵盖不同水稻种植系统的实证数据 | 探讨施肥对水稻土肥力和微生物群落的影响，以及通过微生物介导的碳固存机制实现智能绿色高产水稻种植的途径 | 水稻土中的微生物群落及土壤有机碳动态 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学， 材料工程， 智能决策系统 | 水稻 | NA | 农业， 环境 |
| 209 | 2026-06-10 |
Chassis Selection and Metabolic Fine-Tuning Enable Efficient in planta Betalain Production
2026-Jun-08, Plant physiology
IF:6.5Q1
DOI:10.1093/plphys/kiag337
PMID:42261105
|
研究论文 | 通过底盘选择和代谢微调，在三种植物中高效生产甜菜红碱色素 | 首次系统比较拟南芥、烟草和大豆三种植物底盘用于甜菜红碱生产，并设计推拉策略优化代谢平衡，发现大豆对工程化路径耐受性更强 | 强启动子驱动的推拉设计在拟南芥和烟草中导致矮化，影响植物生长 | 优化植物底盘选择和代谢调控，实现甜菜红碱高效生产而不损害植物生长 | 拟南芥、烟草和大豆三种植物底盘 | 合成生物学 | NA | NA | NA | 代谢数据 | 三种植物（拟南芥、烟草和大豆）的多个转基因株系 | NA | 拟南芥, 烟草, 大豆 | 推拉代谢路径（含DODA酶推和酪氨酸前体供应拉） | 食品工业, 农业 |
| 210 | 2026-06-10 |
Modular Assembly of Higher-Order DNA Nanotube Tile Nanostructures Using DNA Annular Scaffolds
2026-Jun-03, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.6c04434
PMID:42139459
|
研究论文 | 提出一种基于DNA环形支架的模块化组装策略，利用DNA纳米管砖块构建高阶纳米结构 | 首次将DNA环形支架与短DNA基序结合，实现具有高稳定性和可编程性的模块化组装，组装效率超过99%，并成功构建布尔逻辑门电路 | 高阶结构模块化潜力尚未完全实现，现有DNA组装策略的模块化能力有限 | 开发一种整合DNA砖块和DNA折纸优点的组装策略，克服高阶结构制造限制 | DNA纳米管砖块及其环形支架结构 | 纳米技术 | NA | DNA纳米管组装、DNA折纸 | NA | NA | NA | DNA环形支架、分支连接基序 | NA | 布尔逻辑门和逻辑电路 | 医药 |
| 211 | 2026-06-10 |
Enhancing CRISPR/Cas-Mediated Gene Knockout With Short Non-Homologous Oligonucleotides
2026-Jun, Plant biotechnology journal
IF:10.1Q1
DOI:10.1111/pbi.70548
PMID:41725298
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研究论文 | 该论文报道了通过共同递送CRISPR-Cas基因编辑试剂与短双链非同源寡脱氧核苷酸（dsNHO），在莱茵衣藻中提高基因敲除效率高达100倍的现象，并探讨其机制 | 首次发现非同源寡核苷酸增强（NOE）现象，能显著提升CRISPR/Cas介导的基因敲除效率，并揭示其通过KU70/80异二聚体介导、改变DNA修复途径从经典非同源末端连接向微同源介导末端连接转变的机制 | 研究主要局限于莱茵衣藻模型，dsNHO的长度、结构和化学修饰对增强效果有显著影响，其在不同物种中的普适性尚需进一步验证 | 提高CRISPR/Cas介导的基因敲除效率，以促进莱茵衣藻在合成生物学中的通路工程和功能基因组学研究 | 莱茵衣藻细胞及其CRISPR/Cas基因敲除过程 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas基因编辑, 寡脱氧核苷酸递送 | NA | 基因敲除效率数据, DNA修复通路分析数据 | 涉及莱茵衣藻多个基因位点和细胞株系的实验样本 | CRISPR-Cas9 | 莱茵衣藻 | NA | 工业生物技术, 农业 |
| 212 | 2026-06-10 |
Engineered Bacteria as living detectors of tumor DNA: A new diagnostic frontier
2026-Apr-15, Clinica chimica acta; international journal of clinical chemistry
DOI:10.1016/j.cca.2026.120914
PMID:41724454
|
综述 | 探讨工程改造细菌作为活体传感器直接检测肿瘤DNA的最新进展 | 利用自然感受态和水平基因转移结合CRISPR-Cas工具，使工程菌能区分肿瘤与野生型DNA并产生可观测的报道输出 | 存在生物安全性、定植效率和检测灵敏度限制等问题 | 开发用于临床癌症诊断的工程细菌生物传感器及其与治疗递送系统的整合 | 肿瘤DNA、KRAS突变、工程改造细菌（多种细菌物种）、结直肠癌和胃肠癌等实体肿瘤 | 合成生物学 | 癌症（结直肠癌、胃肠癌等） | CRISPR-Cas系统、同源重组、多重CRISPR系统、安全回路 | NA | DNA序列 | 包括体外检测、类器官模型、小鼠模型和非侵入性粪便样本 | CRISPR-Cas9, TALEN | 多种细菌物种（如大肠杆菌等） | 遗传回路、逻辑门、生物传感器、安全回路 | 医学 |
| 213 | 2026-06-10 |
Systems-level understanding of plant immune networks through single-cell and spatial omics
2026-Apr, Current opinion in plant biology
IF:8.3Q1
DOI:10.1016/j.pbi.2026.102870
PMID:41719893
|
综述 | 从系统层面对植物免疫网络进行整合性概述，涵盖受体激活、基因调控回路、蛋白互作中心和染色质动力学如何共同影响免疫结果 | 整合了单细胞和空间组学揭示的免疫激活异质性，并讨论了系统和合成生物学方法在作物持久广谱抗病工程中的应用前景 | 未提及具体的实验验证或技术局限性 | 综合理解植物免疫网络中的受体激活、基因调控、蛋白互作和染色质动力学如何影响免疫结果 | 植物免疫网络中的传感器NLR、帮助者NLR、PRIMER细胞、旁观者细胞等 | 机器学习 | 植物病害 | 单细胞组学、空间组学、蛋白质组学、互作组学 | NA | 单细胞转录组、空间转录组、蛋白质组、染色质数据 | NA | NA | 作物 | NA | 农业 |
| 214 | 2026-06-10 |
Super-enhancer-mediated transcriptional regulation of gene clusters in plants
2026-Apr, Current opinion in plant biology
IF:8.3Q1
DOI:10.1016/j.pbi.2026.102871
PMID:41719895
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综述 | 探讨超级增强子在植物基因簇转录调控中的核心作用 | 揭示了超级增强子通过拓扑关联域协调同源基因簇和生物合成基因簇中基因共表达的机制，并指出其可通过染色质可及性数据预测 | 主要基于拟南芥研究，对其他植物物种的普遍性仍需验证 | 阐明植物中超级增强子调控基因簇共表达的机制及其在合成生物学和作物改良中的应用潜力 | 植物同源基因簇和生物合成基因簇中的基因表达调控 | 分子生物学 | NA | CRISPR-Cas, T-DNA插入, 染色质可及性测序 | NA | 染色质可及性数据 | NA | CRISPR-Cas9, T-DNA插入 | 拟南芥 | 超级增强子调控的基因簇共表达回路 | 合成生物学, 代谢工程, 作物改良 |
| 215 | 2026-06-10 |
Engineered E. coli Nissle 1917 Depletes Branched-Chain Amino Acids to Suppress Colorectal Tumorigenesis
2026-Mar-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00804
PMID:41712535
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研究论文 | 工程化大肠杆菌Nissle 1917通过消耗支链氨基酸抑制结直肠肿瘤发生 | 利用合成生物学方法工程化益生菌，通过靶向支链氨基酸分解代谢来抑制结直肠癌进展，提供了一种新的癌症治疗策略 | 研究仅在AOM/DSS诱导的CRC小鼠模型和氨基酸饮食条件下进行，缺乏在人体中的验证 | 探究工程化益生菌通过消耗肠道支链氨基酸抑制结直肠癌的作用机制 | 工程化的大肠杆菌Nissle 1917菌株（ECN-Deg和ECN-Tra）以及AOM/DSS诱导的结直肠癌小鼠模型 | 合成生物学 | 结直肠癌 | NA | NA | NA | 使用AOM/DSS诱导的结直肠癌小鼠模型，具体样本数量未提及 | NA | 大肠杆菌 Nissle 1917 | 支链氨基酸分解代谢通路 | 医学 |
| 216 | 2026-06-10 |
Green Biosynthesis of Terpenoid-Derived Flavor and Fragrance Compounds: Advances and Strategic Perspectives
2026-Mar-04, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.5c08719
PMID:41718042
|
综述 | 系统总结了利用绿色生物合成方法生产萜类来源的香精香料化合物的最新进展与战略前景 | 聚焦低成本底物和微生物细胞工厂的宿主选择，并系统论述酶改造、动态途径调控、细胞区室化和提高萜类耐受性等关键工程策略 | NA | 为萜类化合物的可持续生产提供关键见解和指导方针 | 萜类及其衍生物 | 合成生物学 | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 微生物（多种宿主菌株） | 微生物细胞工厂中的萜类生物合成途径 | 食品,日化用品 |
| 217 | 2026-06-10 |
Synthetic gene circuits that selectively target RAS-driven cancers
2026-Feb-24, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.104320
PMID:41733988
|
研究论文 | 本文提出了一种合成基因电路设计方法，通过整合多个RAS传感器实现对RAS驱动癌症的选择性靶向治疗 | 首次将多个RAS传感器组合构建基因电路，实现了对突变RAS细胞前所未有的选择性输出蛋白表达，通过模块化设计和模型驱动优化提高了电路适应性和治疗潜力 | 当前电路仍局限于特定KRAS突变，且可能存在耐药性风险 | 开发针对RAS驱动癌症的新型合成基因电路治疗策略 | RAS突变癌细胞系 | 合成生物学 | RAS驱动癌症 | 合成基因电路设计 | 电路组件建模 | NA | 多种RAS驱动癌细胞系 | 合成基因电路 | 哺乳动物细胞 | RAS传感基因电路，整合多个RAS传感器实现选择性蛋白表达 | 医学 |
| 218 | 2026-06-10 |
Generative AI for synthetic biology: Designing biological parts, circuits, and genomes
2026-Feb-18, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2026.101533
PMID:41713401
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review | 探讨生成式人工智能与合成生物学的融合，重点介绍在生物元件、电路和基因组设计中的创新应用 | 系统性地总结了生成式AI在合成生物学中从分子工具到系统架构的转变，提出了数据驱动的新型生物设计范式 | 未涉及具体实验验证或定量性能比较 | 分析生成式AI在合成生物学中的机遇与挑战，并提出发展路线图 | 生物元件、遗传电路、基因组 | 机器学学习 | NA | NA | 生成式AI模型 | 生物序列数据 | NA | NA | NA | 遗传电路、基因组 | 合成生物学 |
| 219 | 2026-06-10 |
Live biotherapeutics: Emerging trends and future directions in microbial therapy
2026, Progress in molecular biology and translational science
DOI:10.1016/bs.pmbts.2025.12.001
PMID:41714074
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综述 | 综述了活体生物治疗产品在微生物疗法中的新兴趋势和未来方向 | 系统阐述了活体生物治疗产品从单一菌株到工程化微生物群落和天然配方的多样性发展，以及其在精准医学中的整合潜力 | 临床开发面临菌株筛选、复杂生产、活性问题及合并症患者安全性等关键挑战 | 概述当前活体生物治疗产品的种类、作用机制、临床应用及监管框架，并展望其未来方向 | 活体生物治疗产品 | NA | 代谢性疾病、神经系统疾病、免疫介导疾病 | 合成生物学、CRISPR基因组编辑、多组学 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | NA | 工程化微生物群落 | 医学 |
| 220 | 2026-06-10 |
Advancements in technology for developing recombinant live biotherapeutics
2026, Progress in molecular biology and translational science
DOI:10.1016/bs.pmbts.2026.01.006
PMID:41714076
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综述 | 综述重组活体生物治疗药物的最新技术进展及其在人类健康中的应用 | 综合了合成生物学、基因工程、多组学和人工智能/机器学习方法在重组活体生物治疗药物设计中的应用，强调了从基础研究到临床转化的创新策略 | 在可扩展性、安全性和临床应用方面仍存在重大挑战 | 总结重组活体生物治疗药物的开发进展，并指出其作为下一代治疗剂的机遇与障碍 | 基因和代谢工程改造的微生物物种 | 机器学习 | NA | 合成生物学, 基因工程, 多组学, 人工智能/机器学习 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |