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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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201 | 2025-04-03 |
[Advances in the regulation of microbial cell metabolism and environmental adaptation]
2025-Mar-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.240937
PMID:40170316
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review | 本文全面综述了细胞代谢和环境适应的调控机制及其在合成生物学中的应用 | 首次从跨膜蛋白和传感器蛋白、自然细胞的适应调控机制以及应用场景三个方面系统性地综述了细胞代谢和环境适应的调控 | 缺乏对具体实验数据和案例的深入分析 | 探讨细胞感知代谢和环境变化的机制及其在合成生物学中的应用 | 细胞的代谢和环境适应调控机制 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
202 | 2025-04-03 |
[Advances in reconstruction and optimization of cellular physiological metabolic network models]
2025-Mar-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.240966
PMID:40170315
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综述 | 本文系统介绍了细胞生理代谢网络模型重建与优化的最新研究进展 | 总结了人工智能在动力学模型和酶约束模型开发中的应用,为高精度构建细胞生理代谢网络模型提供了新机遇 | 未提及具体模型在实际应用中的性能局限或验证不足 | 为定量合成生物学和系统生物学研究提供计算生物学工具支持 | 细胞生理代谢网络模型(包括GEMs、动力学模型和ecGEMs) | 计算生物学 | NA | 基因组尺度代谢模型构建技术、人工智能技术 | GEMs、动力学模型、ecGEMs | 代谢网络数据 | NA |
203 | 2025-04-03 |
[Intelligent design of transcription factor-based biosensors]
2025-Mar-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.240603
PMID:40170310
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review | 本文综述了转录因子(TF)基生物传感器在计算模拟和人工智能辅助下的工程与优化最新进展 | 结合计算模拟和人工智能技术优化转录因子基生物传感器,相比传统工具更准确快速 | NA | 总结转录因子基生物传感器的工程与优化方法,促进新型生物传感器的发展 | 转录因子基生物传感器 | 合成生物学 | NA | 计算模拟、人工智能、蛋白质结构预测、配体结合模拟、机器学习 | 机器学习模型 | 突变数据 | NA |
204 | 2025-04-03 |
[Optimization of fermentation processes in intelligent biomanufacturing: on online monitoring, artificial intelligence, and digital twin technologies]
2025-Mar-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.250032
PMID:40170318
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综述 | 本文综述了智能生物制造中发酵过程的实时监测、人工智能优化策略和数字孪生技术的进展 | 整合了在线监测技术、人工智能驱动的动态优化和数字孪生技术,为发酵过程的精确优化和高效放大提供了新范式 | 未提及具体实验验证或案例研究的局限性 | 实现发酵过程的精确优化和高效放大,推动生物制造向更高效率、智能化和可持续发展方向发展 | 发酵过程的实时监测、智能控制和优化策略 | 智能生物制造 | NA | 在线监测技术、人工智能、数字孪生 | 人工神经网络、支持向量机、遗传算法 | 实时传感数据 | NA |
205 | 2025-04-03 |
[Preface for special issue on AI-driven biomanufacturing]
2025-Mar-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.250197
PMID:40170303
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评论 | 本期特刊探讨了人工智能驱动的生物制造的机遇、挑战和发展现状 | 综述了人工智能在生物制造领域的创新应用,包括智能设计、构建生物部件、电路和人工细胞,以及智能生物过程控制与优化 | NA | 把握人工智能驱动的生物制造的创新与发展 | 生物制造领域的技术创新和产业发展 | 生物制造 | NA | 人工智能 | NA | 生物大数据 | NA |
206 | 2025-04-03 |
Robust and highly efficient transformation method for a minimal mycoplasma cell
2025-Mar-20, Journal of bacteriology
IF:2.7Q3
DOI:10.1128/jb.00415-24
PMID:39903184
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研究论文 | 本文报道了一种针对最小细胞JCVI-syn3B的稳健且高效的转化方法 | 该方法在早期指数生长期观察到最高转化效率,转化效率高达每细胞每微克质粒DNA 4.4×10转化体,并开发了使用少量培养物和质粒DNA获得大量转化体的方法 | NA | 开发一种高效且稳健的最小细胞转化方法,以促进最小细胞的遗传工程和生物学研究 | 最小细胞JCVI-syn3B | 合成生物学 | NA | 转化方法 | NA | NA | 少于0.2 mL培养物,约1×10-10细胞和10 ng质粒DNA |
207 | 2025-04-03 |
Engineering Material Properties of Transcription Factor Condensates to Control Gene Expression in Mammalian Cells and Mice
2024-09, Small (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/smll.202311834
PMID:38573961
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research paper | 该研究通过调节转录因子凝聚物的材料特性,探索其对基因表达调控的影响 | 首次系统性地调节光遗传诱导的转录因子凝聚物的材料特性,并揭示其对基因表达激活的影响 | 研究主要关注转录因子凝聚物的物理性质对基因表达的影响,未深入探讨具体的分子机制 | 探索生物分子凝聚物材料特性对基因表达调控的影响 | 哺乳动物细胞和小鼠中的转录因子凝聚物 | 合成生物学 | NA | 光遗传学 | NA | 基因表达数据 | 哺乳动物细胞和小鼠模型,使用不同合成和天然转录因子 |
208 | 2025-04-03 |
Targeting solid tumor antigens with chimeric receptors: cancer biology meets synthetic immunology
2024-Apr, Trends in cancer
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.trecan.2024.01.003
PMID:38355356
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review | 本文回顾了针对实体瘤抗原的嵌合抗原受体(CAR)T细胞疗法的研究现状和临床应用 | 从癌症生物学和基因调控的角度探讨实体瘤靶抗原,并结合新兴临床数据讨论CAR-T细胞疗法 | 主要关注早期临床试验数据,尚未涉及大规模临床验证 | 探讨CAR-T细胞疗法在实体瘤治疗中的应用和发展 | 实体瘤靶抗原和CAR-T细胞疗法 | 合成免疫学 | 实体瘤 | CAR-T细胞疗法 | NA | 临床数据 | NA |
209 | 2025-04-02 |
Scaling Up Synthetic Cell Production Using Robotics and Machine Learning Toward Therapeutic Applications
2025-Mar-31, Advanced biology
IF:3.2Q3
DOI:10.1002/adbi.202400671
PMID:40162738
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research paper | 本研究开发了一种自动化方法,用于大规模生产具有治疗应用潜力的合成细胞(SCs),并通过机器学习和机器人技术优化了生产过程 | 结合机器人液体处理系统和自动化组织解离器,显著提高了合成细胞的生产效率和规模,同时利用AI图像分析实现了高质量、高通量的SC表征 | 研究主要聚焦于蛋白质表达的SCs,可能不适用于其他类型的合成细胞 | 开发自动化方法以提高合成细胞的生产效率和规模,用于治疗应用 | 合成细胞(SCs) | synthetic biology | NA | robotic liquid handling system, automated tissue dissociator, AI-based image analysis | AI-based image analysis | image | mice administered with large-scale luciferase-expressing SCs |
210 | 2025-04-02 |
Poplar transformation with variable explant sources to maximize transformation efficiency
2025-01-08, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-81235-y
PMID:39779752
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研究论文 | 本研究通过比较杨树不同外植体来源的再生和转化效率,探索了提高植物转化效率的新方法 | 发现根外植体具有显著的再生能力和转化适应性,并揭示了与高再生和转化效率相关的候选基因 | 研究仅针对杨树这一种生物能源作物,未涉及其他重要作物物种 | 提高植物转化效率,优化合成生物学中的设计-构建-测试-学习循环 | 杨树的不同外植体(叶、茎、叶柄和根) | 植物生物技术 | NA | 农杆菌介导的植物转化技术 | NA | 转录组数据 | 多种杨树外植体类型(叶、茎、叶柄和根) |
211 | 2025-04-01 |
Advances in synthesizing plant-derived isoflavones and their precursors with multiple pharmacological activities using engineered yeasts
2025-Mar-29, Microbial cell factories
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s12934-025-02692-2
PMID:40155940
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综述 | 本文总结了特定异黄酮的药理特性、其生物合成途径以及在工程酵母中生产异黄酮的技术策略 | 利用合成生物学和先进的生物技术策略,实现生物活性异黄酮的环保生产 | NA | 探讨异黄酮及其前体的生物合成及其在食品、制药和化妆品工业中的应用 | 植物源性异黄酮及其前体 | 合成生物学 | NA | 工程酵母生物合成 | NA | NA | NA |
212 | 2025-04-01 |
Scaling-up molecular logic to meso-systems via self-assembly
2025-Mar-28, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-58379-0
PMID:40148329
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research paper | 该研究展示了通过自组装系统实现分子逻辑计算向介观系统的扩展 | 首次展示了自组装系统(由环芳烃八羧酸酯和阳离子表面活性剂组成)能够执行逻辑操作,其中膜本身表现为一个Reset-Set Flip-Flop,并集成了7个以上的逻辑元件 | 人工分子基介观系统在逻辑操作方面的应用仍然非常罕见 | 探索分子逻辑计算在介观系统中的应用 | 自组装系统(环芳烃八羧酸酯和阳离子表面活性剂) | 合成生物学 | NA | 自组装技术 | NA | NA | NA |
213 | 2025-04-01 |
Protein-derived cofactors: chemical innovations expanding enzyme catalysis
2025-Mar-28, Chemical Society reviews
IF:40.4Q1
DOI:10.1039/d4cs00981a
PMID:40151987
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综述 | 本文综述了蛋白质衍生辅因子的化学创新及其在扩展酶催化功能方面的作用 | 揭示了蛋白质衍生辅因子的多样性和其生物合成途径,以及它们在酶催化中的新功能和应用 | 对辅因子生物合成和功能的机制理解仍显不足,传统诱变方法可能干扰辅因子组装 | 探讨蛋白质衍生辅因子的化学创新及其在酶催化、生物催化和生物技术中的应用 | 蛋白质衍生辅因子及其在酶催化中的作用 | 生物化学 | NA | 非经典氨基酸位点特异性掺入、结构生物学、质谱、生物物理光谱学 | NA | NA | NA |
214 | 2025-04-01 |
CAR-T therapy dilemma and innovative design strategies for next generation
2025-Mar-27, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-025-07454-x
PMID:40148310
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综述 | 本文综述了CAR-T细胞疗法在血液肿瘤治疗中的显著效果及其面临的挑战,并介绍了跨学科创新技术以克服当前CAR-T细胞疗法的主要障碍 | 提出了基于合成生物学的ON/OFF开关、生物指导支架、纳米材料、溶瘤病毒、CRISPR筛选、肠道微生物群及其代谢物等跨学科策略,以设计下一代CAR-T细胞 | 未提及具体的临床试验数据或样本量,可能缺乏实证支持 | 克服当前CAR-T细胞疗法在肿瘤免疫治疗中的主要障碍,设计下一代CAR-T细胞 | CAR-T细胞疗法及其在肿瘤免疫治疗中的应用 | 肿瘤免疫治疗 | 血液肿瘤 | 合成生物学、CRISPR筛选、纳米材料、溶瘤病毒等 | NA | NA | NA |
215 | 2025-04-01 |
The Transformation Experiment of Frederick Griffith I: Its Narrowing and Potential for the Creation of Novel Microorganisms
2025-Mar-20, Bioengineering (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/bioengineering12030324
PMID:40150788
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research paper | 本文探讨了弗雷德里克·格里菲斯的转化实验的局限性及其在创造新型微生物中的潜力 | 揭示了经典转化实验在创造新型微生物中的局限性,并探讨了其潜在应用 | 转化实验依赖于非常相近的微生物,限制了其创造潜力 | 研究转化实验在合成生物学中的应用及其局限性 | 微生物的基因组转移和转化实验 | 合成生物学 | NA | 基因组转移 | NA | NA | NA |
216 | 2025-04-01 |
Comparative transcriptome analyses of different orthosiphon aristatus tissues reveal differentially expressed genes associated with flavonoid biosynthesis
2025-01-07, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-85266-x
PMID:39775135
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研究论文 | 通过比较分析猫须草不同组织的转录组,揭示了与黄酮类生物合成相关的差异表达基因 | 首次全面比较猫须草各组织中黄酮类化合物的合成机制,并鉴定出与根部黄酮积累相关的212个差异表达基因 | 研究仅关注转录组水平,未涉及蛋白质或代谢物水平的验证 | 探究猫须草各组织中黄酮类化合物的生物合成机制 | 猫须草的不同组织(根、茎、叶) | 合成生物学 | 肾脏疾病 | HPLC分析、转录组分析、qRT-PCR | NA | 转录组数据 | 猫须草的根、茎、叶组织样本 |
217 | 2025-03-30 |
Exploration and mutagenesis of the germacrene A synthase from Solidago canadensis to enhance germacrene A production in E. coli
2025-Jun, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2025.02.015
PMID:40151792
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研究论文 | 本研究通过探索和诱变加拿大一枝黄花中的germacrene A合酶(GAS),以增强大肠杆菌中germacrene A的生产 | 结合分子对接和系统发育分析,对ScGAS进行关键残基诱变,显著提高了germacrene A的产量 | 研究依赖于大肠杆菌作为宿主,可能不适用于其他生产系统 | 提高germacrene A的产量,以满足β-榄香烯的临床需求 | 加拿大一枝黄花中的germacrene A合酶(ScGAS) | 合成生物学 | 癌症 | 分子对接、系统发育分析、诱变 | NA | NA | NA |
218 | 2025-03-30 |
Examining interactions of animal cells with chloroplasts and their light-induced responses in in vitro cell culture systems
2025-Apr-12, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2025.151622
PMID:40117974
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研究论文 | 本研究探讨了动物细胞与叶绿体的相互作用及其在体外细胞培养系统中的光诱导反应 | 揭示了人类宫颈癌HeLa细胞和小鼠巨噬细胞样J774.1细胞与叶绿体相互作用的三种不同模式,并强调了光诱导ROS生成在细胞毒性中的重要性 | 缺乏完善的体外实验系统来研究叶绿体-动物细胞相互作用 | 研究动物细胞与叶绿体的相互作用及其光诱导反应 | 人类宫颈癌HeLa细胞、小鼠巨噬细胞样J774.1细胞和Elysia marginata海蛞蝓的分离细胞 | 合成生物学 | 宫颈癌 | 体外细胞培养 | NA | 细胞反应数据 | HeLa细胞、J774.1细胞和Elysia marginata海蛞蝓的分离细胞 |
219 | 2025-03-30 |
A novel geminivirus-derived 3' flanking sequence of terminator mediates the gene expression enhancement
2025-Apr, Plant biotechnology journal
IF:10.1Q1
DOI:10.1111/pbi.14561
PMID:39723813
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研究论文 | 本研究探讨了一种来自甜薯卷叶病毒的SBG51 deltasatellite DNA序列,该序列在终止子下游时能显著增强基因表达 | 发现SBG51序列能显著增强基因表达,并鉴定出一个123 bp的AT富集序列及其中的'ATAAA'/'TTAAA'元件具有增强效应 | 未明确说明该技术在更广泛宿主中的适用性及长期稳定性 | 探索合成生物学中基因表达元件的新设计 | SBG51 deltasatellite DNA序列及其衍生的AT富集序列 | 合成生物学 | NA | 基因表达分析 | NA | 基因表达数据 | 本氏烟草叶片和转基因拟南芥植物 |
220 | 2025-03-30 |
Xenotopic synthetic biology: Prospective tools for delaying aging and age-related diseases
2025-Mar-28, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adu1710
PMID:40153513
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综述 | 本文探讨了利用来自低等生物的一组酶来逆转与年龄相关的代谢变化,以延缓衰老和年龄相关疾病 | 提出利用非哺乳动物酶作为延缓衰老和年龄相关疾病的未开发资源 | NA | 探讨通过异源合成生物学工具延缓衰老和年龄相关疾病的策略 | 来自低等生物的一组酶,包括氨基酸稳态调节剂、氧化还原电位调节剂等 | 合成生物学 | 老年病 | NA | NA | NA | NA |