合成生物学相关文章
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当前共找到 4691 篇文献，本页显示第 201 - 220 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 201 | 2026-03-14 |
Biosynthesis of Two Types of Exogenous Antigenic Polysaccharides in a Single Escherichia coli Chassis Cell
2025-05-26, Life (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/life15060858
PMID:40566513
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研究论文 | 本研究在单个大肠杆菌底盘细胞中同时引入Wzy/Wzx依赖型和ABC转运蛋白依赖型两种抗原多糖生物合成途径，实现了两种结构不同多糖的共表达，为疫苗开发提供了一种简化且可扩展的策略 | 首次在单个宿主细胞中同时构建并表达两种不同生物合成途径的抗原多糖，并实现体内生物偶联生成糖蛋白，简化了多价结合疫苗的生产流程 | 共表达水平有所降低，诱导初期存在弱竞争相互作用，可能源于膜空间竞争或活化单糖前体的共享使用 | 开发一种合成生物学平台，用于在单个细菌宿主中共同表达多种多糖，以设计和生产针对耐药病原体的多价结合疫苗 | 大肠杆菌W3110细胞，两种抗原多糖（Wzy/Wzx依赖型和ABC转运蛋白依赖型） | 合成生物学 | 抗菌素耐药性感染 | Wzy/Wzx依赖型和ABC转运蛋白依赖型生物合成途径，体内生物偶联，全细胞蛋白质组学分析，MFUZZ聚类，基因本体分析 | NA | 蛋白质组学数据 | 工程化大肠杆菌菌株 | CRISPR-Cas9, Gibson Assembly | 大肠杆菌 | 双途径生物合成系统，用于同时生产两种抗原多糖，并偶联至载体蛋白形成糖蛋白 | 医学 |
| 202 | 2026-03-14 |
Discovery of bacterial terpenoids by genome mining
2025, Methods in enzymology
DOI:10.1016/bs.mie.2025.01.078
PMID:40651831
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综述 | 本文概述了利用基因组挖掘方法从细菌中发现新型萜类合酶和萜类天然产物的策略 | 强调基因组挖掘作为传统天然产物发现方法的补充，专注于细菌中未开发的萜类合酶基因资源 | 未提及具体实验验证或数据限制，主要侧重于方法概述 | 探索细菌中萜类天然产物的发现潜力，以应用于药物和工业领域 | 细菌中的萜类合酶基因和萜类天然产物 | 合成生物学 | NA | 下一代测序，基因组挖掘 | NA | 基因组数据 | NA | NA | 细菌 | NA | 药物，工业，商业 |
| 203 | 2026-03-14 |
Expanding the synthetic biology toolbox of Cupriavidus necator for establishing fatty acid production
2024-Jan-09, Journal of industrial microbiology & biotechnology
IF:3.2Q2
DOI:10.1093/jimb/kuae008
PMID:38366943
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研究论文 | 本研究扩展了Cupriavidus necator的合成生物学工具箱，通过验证启动子、设计RBS库和优化密码子，以促进脂肪酸生产 | 首次在C. necator中系统验证和表征诱导型和组成型启动子，设计并测试了RBS库实现50倍表达范围，并研究了密码子优化对基因表达的影响 | 文中提到仍需克服进一步障碍才能广泛用于生物合成过程，具体限制未详细说明 | 建立和优化Cupriavidus necator的合成生物学工具箱，以支持脂肪酸等化学品的高效生产 | Cupriavidus necator细菌及其基因表达元件（如启动子、RBS、密码子优化） | 合成生物学 | NA | 基因表达验证、RBS库设计、密码子优化、GFP和mCherry报告基因表达 | NA | 基因表达数据、荧光蛋白测量数据 | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | Cupriavidus necator | 生物传感器、代谢途径 | 工业生物技术 |
| 204 | 2026-03-13 |
Programmable AND-gate strategy to reduce false positives in rolling circle amplification
2026-Jun-15, Biosensors & bioelectronics
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.bios.2026.118515
PMID:41707426
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研究论文 | 本文提出了一种基于AND门布尔逻辑的多键滚环扩增策略，用于降低核酸检测生物传感器中的假阳性率 | 引入AND门布尔逻辑创建Multi-Key RCA，通过检测多个核酸序列作为扩增前提，显著减少假阳性，并实现高特异性单核苷酸多态性检测 | NA | 提高生物传感器的特异性，减少假阳性，特别针对即时诊断应用 | 滚环扩增技术及其在核酸检测生物传感器中的应用 | 合成生物学 | NA | 滚环扩增，等温扩增，侧向层析检测 | NA | 核酸序列 | NA | NA | NA | AND门逻辑电路，多输入生物传感器 | 医学 |
| 205 | 2026-03-13 |
Molecular Dialogue Across Kingdoms: The Role of Trans-Kingdom Peptides in Plant-Associated Interactions
2026-Apr, Plant, cell & environment
DOI:10.1111/pce.70378
PMID:41527218
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综述 | 本文提出并定义了跨界肽（TKPs）的概念，总结了其在植物与微生物相互作用中的功能，并探讨了其在农业和生物医学等领域的应用潜力 | 首次提出并系统定义跨界肽（TKPs）作为跨物种生物活性肽的新概念，整合了植物、微生物、病毒和昆虫来源的肽在多种生态互作中的作用 | NA | 探讨跨界肽在植物相关相互作用中的生物学功能和跨物种通讯机制 | 植物、微生物、病毒和昆虫来源的跨界肽及其在共生、寄生和免疫调控中的作用 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 农业, 生物医学, 合成生物学, 环境可持续性 |
| 206 | 2026-03-13 |
From sequence to structure: A comprehensive review of deep learning models for RNA structure prediction
2026-Apr, Current opinion in structural biology
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.sbi.2025.103216
PMID:41650708
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综述 | 本文全面回顾了从传统物理方法到当前深度学习模型在RNA二级和三级结构预测中的演变 | 系统梳理了三种深度学习范式：基于语言模型的方法、端到端结构预测器以及几何距离预测方法，并提出了针对数据稀缺和模型可解释性的未来研究方向 | RNA结构预测仍面临训练数据有限、复杂非规范相互作用和构象灵活性等独特挑战 | RNA结构预测，以理解基因调控、药物设计和合成生物学 | RNA的二级和三级结构 | 计算生物学 | NA | 深度学习 | 语言模型、端到端结构预测器、几何距离预测模型 | RNA序列和结构数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 207 | 2026-03-13 |
Adenosine Triphosphate-Producing Artificial Cells: Biomimetic Construction Strategies and Applications
2026-Mar-13, Chembiochem : a European journal of chemical biology
IF:2.6Q3
DOI:10.1002/cbic.202500934
PMID:41773731
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综述 | 本文综述了ATP生产人工细胞的仿生构建策略及其应用，重点关注模型膜、质子泵和ATP酶的协同整合 | 系统整合了三种构建策略的最新进展，包括绕过膜蛋白组装挑战的直接封装完整细胞器或构建非经典系统，为从基础研究转向实际应用提供指导 | NA | 探索ATP生产人工细胞的构建策略及其在合成生物学、靶向药物递送、再生疗法和生物混合能量转换设备等工程应用中的潜力 | 人工细胞，特别是基于脂质体、聚合物体、融合液滴、油包水胶束和金属有机框架等自下而上模型构建的ATP生产系统 | 合成生物学 | NA | 自下而上构建策略，包括封装完整线粒体、类囊体或构建非经典系统如精氨酸降解途径 | NA | NA | NA | NA | NA | 模拟氧化/光合磷酸化以维持ATP合成的仿生能量转换系统，包括质子泵和ATP酶的级联能量转换 | 医学, 农业, 环境, 能源, 材料, 工业生物技术 |
| 208 | 2026-03-13 |
Hybrid seed production: new paradigms and challenges in the twenty-first century
2026-Mar-11, Planta
IF:3.6Q1
DOI:10.1007/s00425-026-04959-3
PMID:41811507
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综述 | 本文综述了二十一世纪杂交种子生产的新范式与挑战，重点探讨了先进基因组学、人工智能育种与政策整合对可持续生产气候适应性杂交种子的影响 | 系统整合了CRISPR/Cas、基因组选择等现代基因组工具与人工智能/机器学习、表观遗传学等新兴技术，提出通过多领域协作解决杂交技术可扩展性与可及性瓶颈的创新框架 | 未提供具体作物的量化对比数据，对小型农户采纳障碍的解决方案探讨较为宏观，缺乏区域性政策差异的深度分析 | 探讨整合先进技术与政策以可持续生产气候适应性杂交种子的路径 | 杂交种子生产技术体系及其相关作物案例 | 农业生物技术 | NA | CRISPR/Cas, 标记辅助选择, 基因组选择, 人工智能/机器学习, 表观遗传学 | NA | 基因组数据, 表型数据 | NA | CRISPR-Cas9 | 作物植物 | NA | 农业 |
| 209 | 2026-03-13 |
Exploring the chemical diversity of Dictyostelium secondary metabolites and their biological implications
2026-Mar-10, Archives of microbiology
IF:2.3Q3
DOI:10.1007/s00203-026-04742-8
PMID:41805866
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综述 | 本文详细综述了盘基网柄菌次级代谢产物的化学多样性、生物合成途径、分离鉴定方法及其生物学功能与药理潜力 | 系统梳理了盘基网柄菌中罕见骨架的次级代谢产物（如聚酮、萜类、生物碱等），并展望了多组学技术与合成生物学结合在天然药物发现中的前沿应用 | NA | 探索盘基网柄菌次级代谢产物的化学多样性及其生物学与药理学意义 | 盘基网柄菌（Dictyostelium）产生的次级代谢产物 | NA | NA | 色谱分离技术、光谱学方法、化学合成、基因组挖掘、多组学技术 | NA | 化学结构数据、基因组数据、生物活性数据 | NA | 合成生物学 | 盘基网柄菌（Dictyostelium） | NA | 医药（天然药物发现） |
| 210 | 2026-03-13 |
Ornithine lipids and other acyloxyacyl amino lipids: the coming-of-age story of a group of non-canonical membrane lipids
2026-Mar-08, Applied microbiology and biotechnology
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s00253-026-13777-2
PMID:41794944
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综述 | 本文全面回顾了鸟氨酸脂及其他酰氧酰基氨基酸脂这类非典型膜脂的研究进展，包括其合成途径、调控条件、修饰方式及其在细菌应激抵抗和宿主互作中的作用 | 系统分析了鸟氨酸脂合成酶基因的分类分布，预测了具备合成能力的细菌，并探讨了其在合成生物学中的潜在应用 | NA | 综述鸟氨酸脂及其他酰氧酰基氨基酸脂的结构、合成、功能及其在合成生物学中的应用潜力 | 鸟氨酸脂及其他酰氧酰基氨基酸脂 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学 |
| 211 | 2026-03-13 |
Microbial computing: Review and Perspectives
2026 Mar-Apr, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108766
PMID:41317976
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综述 | 本文回顾了微生物计算领域的发展历程，概述了现有策略及其局限性，并提出了基于储层计算的新视角 | 引入了基于储层计算的自上而下新框架，利用生物系统固有的动态计算能力解决复杂任务 | 现有的自下而上策略仍不足以模拟细胞信号处理系统的计算复杂性 | 探讨微生物计算的发展策略与未来方向 | 微生物计算机（生物计算机） | 合成生物学 | NA | NA | 储层计算、模拟计算、神经形态架构 | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | 大肠杆菌（E. coli）、酿酒酵母（S. cerevisiae）、枯草芽孢杆菌（B. subtilis）、哺乳动物细胞、植物 | 数字逻辑门、切换开关、振荡器、生物传感器、代谢通路 | 生物生产、生物修复、生物医学 |
| 212 | 2026-03-13 |
Microbial electrochemical synergy: A mechanistic framework for enhanced bioelectrochemical remediation of halogenated organic pollutant in soil-water matrices
2026-Mar-01, Journal of hazardous materials
IF:12.2Q1
DOI:10.1016/j.jhazmat.2026.141415
PMID:41690271
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综述 | 本文提出了一个名为“微生物电化学协同作用”的概念框架，用于系统解析生物电化学系统在土壤-水基质中修复卤代有机污染物的性能，并探讨了通过整合机器学习、多组学和合成生物学工具来设计和调控下一代BES技术的潜力 | 提出了一个整合性的“微生物电化学协同作用”机制框架，该框架从电子流效率、功能微生物生态位分配和界面微环境特征三个维度系统解析BES性能，并首次倡导协同利用机器学习、多组学和合成生物学工具进行理性设计 | 本文是一篇综述，未提供具体的实验数据或案例验证所提框架的有效性 | 旨在通过提出一个整合性机制框架，提升基于生物电化学系统的卤代有机污染物修复策略的可扩展性和可持续性 | 生物电化学系统及其在土壤-水基质中修复卤代有机污染物的应用 | 环境生物技术 | NA | 机器学习， 多组学， 合成生物学工具 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 环境 |
| 213 | 2026-03-13 |
A Scaffoldomics Platform for Modular In Vivo Enzyme Colocalisation and Its Application to Naringenin Biosynthesis
2026-Mar, Microbial biotechnology
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/1751-7915.70328
PMID:41814496
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研究论文 | 本文开发了一个名为'支架组学'的平台，用于在体内模块化地共定位酶，并将其应用于柚皮素的生物合成 | 开发了一个通用的合成框架（支架组学平台），能够组合式地将生物合成途径的酶组装到蛋白质支架上，形成多样的多酶复合体，并通过整合染色体编码的生物传感器实现实时检测和途径评估 | NA | 提高微生物细胞工厂生产精细化学品的产量，通过酶共定位策略增强代谢效率 | 柚皮素（一种关键的类黄酮中间体）的生物合成途径 | 合成生物学 | NA | 体内酶共定位、组合式支架组装、染色体编码生物传感器 | NA | NA | NA | 合成支架、染色体编码生物传感器 | 大肠杆菌 | 多酶复合体组装系统（最多可将四种途径酶组装到蛋白质支架上），用于柚皮素生物合成的代谢途径 | 工业生物技术 |
| 214 | 2026-03-13 |
Arboviral Diseases in a Changing World: Evolutionary Dynamics, Host-Vector Interactions, and Novel Control Strategies
2026-Feb-19, Vector borne and zoonotic diseases (Larchmont, N.Y.)
DOI:10.1177/15303667251376450
PMID:40955762
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综述 | 本文系统综述了虫媒病毒病的进化机制、宿主-媒介相互作用及新兴控制策略，以应对其在全球变化背景下的公共卫生挑战 | 整合了基因组分析、元流行病学综合和预测建模，并重点评估了CRISPR基因驱动、沃尔巴克氏体干预和RNAi抗病毒药物等新型控制策略的潜力 | 纳入的研究数量有限（仅12篇），且涉及基因编辑和微生物干预的伦理、生态和监管问题仍需审慎考量 | 理解虫媒病毒的进化机制、传播动力学并评估新兴控制策略，以有效缓解疾病负担 | 登革热病毒、寨卡病毒、基孔肯雅病毒和西尼罗河病毒等虫媒病毒及其传播媒介（如蚊、蜱） | NA | 虫媒病毒病 | 基因组分析、元流行病学综合、预测建模 | NA | NA | NA | CRISPR | NA | NA | 医学 |
| 215 | 2026-03-13 |
Multichannel genomic recording of biological information with ENGRAM
2026-Feb-11, Nature protocols
IF:13.1Q1
DOI:10.1038/s41596-025-01322-w
PMID:41673323
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研究论文 | 本文提供了进行ENGRAM实验和分析数据的逐步协议，并讨论了该系统的设计考虑、优势、局限性和应用 | 利用prime editing介导的插入实现多路复用信号记录，并与DNA Typewriter兼容以捕获信号顺序 | 需要基本的分子生物学、哺乳动物细胞培养和DNA测序分析技能，实验周期为5-6周 | 开发用于测量生物学时间动态的分子记录系统 | 顺式调控元件（CREs）的活性记录 | 合成生物学 | NA | DNA测序，prime editing | NA | 基因组数据 | NA | CRISPR-Cas9（prime editing） | 哺乳动物细胞 | 增强子介导的基因组记录电路（ENGRAM），可将瞬时CRE活性转换为稳定的基因组记录 | 医学，工业生物技术 |
| 216 | 2026-03-13 |
Ultra-high-throughput mapping of genetic design space
2026-Feb, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-025-09933-9
PMID:41535463
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研究论文 | 本文介绍了一种名为CLASSIC的遗传筛选平台，结合长读和短读测序技术，用于高通量评估任意长度基因构建体的表达谱，以加速合成生物学设计 | CLASSIC平台首次结合长读和短读NGS技术，实现了对超过10^6个基因电路设计（长度5-20 kb）在单次实验中的定量评估，揭示了基因部件可组合性规则 | NA | 加速合成生物学，通过高通量筛选基因电路设计并学习“组合到功能”映射，以揭示基因部件可组合性规则 | 基因电路设计，包含多种基因部件组合的构建体 | 合成生物学 | NA | 长读和短读下一代测序（NGS） | 机器学习模型 | 测序数据 | 超过10^6个基因电路设计，长度从5到20 kb | NA | 人类细胞 | 基因电路，包括多种遗传部件组合 | 工业生物技术 |
| 217 | 2026-03-13 |
Copper biosorption by Serratia plymuthica: crucial role of tightly bound extracellular polymeric substances in planktonic and biofilm systems
2026-01-16, Biodegradation
IF:3.1Q2
DOI:10.1007/s10532-026-10245-6
PMID:41545695
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研究论文 | 本研究探讨了沙雷氏菌（Serratia plymuthica）菌株As3-5a(5)在浮游细胞和生物膜系统中对铜的生物吸附作用，重点关注紧密结合的胞外聚合物（EPS）的关键角色 | 揭示了紧密结合的胞外聚合物（尤其是蛋白质组分）在铜生物吸附中的关键作用，并展示了该菌株在极端酸性工业废水（pH 1.9）中仍能实现高效铜去除（97%）的强效潜力 | 研究未涉及合成生物学方法改进铜螯合能力，且系统在真实工业废水条件下的可扩展性及技术成熟度需进一步验证 | 开发高效的重金属生物去除系统，探索可持续的铜修复生物技术方法 | 沙雷氏菌（Serratia plymuthica）菌株As3-5a(5)及其胞外聚合物（EPS） | NA | NA | 生物吸附实验、电镀废水处理 | NA | 实验数据 | 使用烧结玻璃生物膜系统及浮游细胞系统进行测试 | NA | 沙雷氏菌（Serratia plymuthica） | NA | 环境修复、工业废水处理、循环经济中的金属回收 |
| 218 | 2026-03-13 |
Next-Generation Immune Checkpoints and Tumor Microenvironment Modulation in Cancer Immunotherapy
2026, Journal of immunology research
IF:3.5Q2
DOI:10.1155/jimr/7864229
PMID:41811823
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综述 | 本文全面回顾了下一代免疫检查点及肿瘤微环境调控在癌症免疫治疗中的最新进展 | 系统梳理了共抑制性和共刺激性两类下一代免疫检查点的分子机制与临床证据，并探讨了整合代谢通路、先天免疫感知、细胞因子信号及微生物组等多元化TME重塑策略 | NA | 探索扩展癌症免疫治疗临床获益的新靶点与组合策略 | 免疫检查点通路、肿瘤微环境组分及免疫调节机制 | NA | 癌症 | 多组学分析、系统生物学、人工智能 | NA | 临床数据、分子机制数据 | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 219 | 2026-03-13 |
Advanced microbial engineering approaches for biodegradation of pharmaceutical pollutants
2025-12-18, Biodegradation
IF:3.1Q2
DOI:10.1007/s10532-025-10238-x
PMID:41410736
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综述 | 本文综述了利用微生物工程策略高效降解药物污染物的最新进展 | 整合了CRISPR系统、适应性实验室进化、代谢工程、生物强化和生物反应器设计等多种先进技术，并探讨了合成生物学和宏基因组学在应对新兴污染物中的应用 | NA | 开发更有效和可持续的药物污染物生物修复策略 | 药物污染物（如抗癫痫药、抗生素、镇痛药、非甾体抗炎药、激素和防腐剂） | 环境生物技术 | NA | CRISPR系统、适应性实验室进化、代谢工程、生物强化、生物反应器设计、合成生物学、宏基因组学 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 微生物 | NA | 环境 |
| 220 | 2026-03-13 |
Bioremediation of polycyclic aromatic hydrocarbons contaminated soils/water for environmental remediation
2025-12-01, Biodegradation
IF:3.1Q2
DOI:10.1007/s10532-025-10229-y
PMID:41324725
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综述 | 本文综述了利用微生物进行多环芳烃（PAHs）污染土壤/水体的生物修复方法 | 系统总结了利用特定细菌（如假单胞菌、分枝杆菌等）及其酶系统降解PAHs的机制，并探讨了生物表面活性剂、生物膜、微生物群落以及基因工程、合成生物学和纳米技术等新兴工具在提升修复效率中的作用 | NA | 探讨可持续、环保的多环芳烃污染修复方法 | 多环芳烃（如萘、菲、蒽、芘）污染的土壤和水体 | NA | NA | 微生物降解、基因工程、合成生物学、纳米技术 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 环境 |