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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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201 | 2025-07-17 |
Yeast as C1 cell factory: Transforming methanol and Formate into high-value compounds
2025-Jul-09, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108641
PMID:40645511
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综述 | 本文综述了酵母作为C1细胞工厂,将甲醇和甲酸盐转化为高价值化合物的研究进展、挑战及未来展望 | 探讨了合成甲基营养在非甲基营养酵母中的应用,以及通过非理性基因组工程和理性设计揭示C1途径和底物耐受机制 | C1气体生物转化技术尚未解决的技术限制仍阻碍其工业应用 | 研究如何利用酵母将温室气体转化为高价值生化产品,以实现可持续的工业脱碳 | 工业酵母及其对甲醇和甲酸盐的耐受和同化能力 | 合成生物学 | NA | 合成甲基营养、非理性基因组工程、理性设计、模块化共培养工程、过氧化物酶体耦合 | NA | NA | NA |
202 | 2025-07-17 |
The XNA alphabet
2025-Jul-08, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf635
PMID:40650979
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综述 | 本文综述了50年来化学家设计和合成的糖修饰核酸(XNA)系统,探讨了其在生物技术和合成生物学中的应用 | 系统总结了XNA的构象行为及其与天然核酸的正交性,为XNA复制和进化提供了更理性的方法 | 未提及具体实验数据或样本量,主要为基础性综述 | 探讨糖修饰核酸(XNA)的构象特性及其在合成生物学等领域的应用潜力 | 糖修饰核酸(XNA)系统 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
203 | 2025-07-17 |
Expanding genetic engineering capabilities in Vibrio natriegens with the Vnat Collection
2025-Jul-08, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf580
PMID:40650977
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研究论文 | 本文介绍了Vnat Collection,一个专为Vibrio natriegens设计的模块化工具包,旨在克服其遗传工程工具的不足 | 通过优化的Golden Gate克隆策略和改进的连接序列,实现了组装效率的300倍提升,并引入了新型操作子连接器和精确的基因调控系统 | NA | 扩展Vibrio natriegens的遗传工程能力,以充分发挥其在合成生物学中的潜力 | Vibrio natriegens | 合成生物学 | NA | Golden Gate克隆策略、NT-CRISPR方法 | NA | NA | 超过220个经过严格验证的模块化组件 |
204 | 2025-07-17 |
Analysis of Poly-3-Hydroxybutyrate Production with Different Microorganisms Using the Dynamic Simulations for Evaluation of Economic Potential Approach
2025-Jul-08, ACS omega
IF:3.7Q2
DOI:10.1021/acsomega.4c11178
PMID:40657095
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研究论文 | 本文提出了一种名为DySEEP的方法,用于评估工业生物产品的生产潜力,并以PHB生产为例进行了分析 | 提出了一种结合动态通量平衡分析和经济指标的DySEEP方法,用于评估生物产品的生产潜力,并提出了提高PHB产量的基因改造目标 | 由于DFBA模拟的性质,无法预测某些关键聚合物特性 | 优化生物塑料PHB的生产过程,降低生产成本 | 重组微生物的PHB生产潜力 | 生物工程 | NA | 动态通量平衡分析(DFBA) | NA | 模拟数据 | NA |
205 | 2025-07-17 |
Deciphering plasmid replication dynamics: a computational approach to predict ColE1-like plasmid copy number
2025-Jul, Journal of the Royal Society, Interface
DOI:10.1098/rsif.2024.0783
PMID:40664234
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research paper | 开发了一种新型软件工具,通过计算模型预测ColE1样质粒的拷贝数,旨在简化质粒拷贝数设计 | 首次提出了一个能够从复制起点(ORI)序列计算预测质粒拷贝数的机器学习模型,强调了启动子强度和RNA折叠动力学的重要性 | NA | 开发计算工具预测质粒拷贝数,优化合成生物学中的质粒工程工作流程 | ColE1样质粒的复制起点(ORI)序列 | synthetic biology | NA | machine learning | machine learning model | sequence data | NA |
206 | 2025-07-17 |
Pattern recognition in living cells through the lens of machine learning
2025-Jul, Open biology
IF:4.5Q1
DOI:10.1098/rsob.240377
PMID:40664239
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research paper | 本文探讨了机器学习概念在生物框架中的应用,以探索人工神经网络、信号通路和基因调控网络之间的结构和功能相似性(及差异) | 将机器学习概念应用于生物系统,探索人工神经网络与生物信号通路、基因调控网络的相似性,并提出适合生物分类任务的神经网络架构 | 研究尚处于初步阶段,未涉及具体实验验证 | 探索生物系统中信号通路和基因调控网络的固有计算能力 | 细胞内的信号通路和基因调控网络 | machine learning | NA | NA | artificial neural networks | NA | NA |
207 | 2025-07-17 |
Light-orchestrated multi-step solid-phase picodroplet reactors
2025-Jun-27, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.06.23.660884
PMID:40666841
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研究论文 | 介绍了一种光控固相皮升液滴反应器,用于实现复杂的多步生化反应 | 利用光电子镊子操控单个皮升液滴和微珠,实现了八步点击化学为基础的DNA连接合成循环,并实时原位荧光检测反应产物 | 当前皮升液滴微流控技术缺乏试剂交换和洗涤能力,无法执行多步过程 | 开发一种能够执行复杂多步生化反应的皮升液滴反应器平台 | 皮升液滴反应器和微珠 | 合成生物学 | NA | 光电子镊子、荧光检测 | NA | 荧光信号 | NA |
208 | 2025-07-17 |
Pepper RNA variants reveal decoupling of HBC530 binding thermodynamics and fluorescence activation
2025-Jun-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.06.24.660466
PMID:40667133
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研究论文 | 本文通过生成Pepper RNA变体库,定量评估了单个核苷酸对HBC530结合亲和力、镁结合亲和力和荧光强度的贡献,揭示了配体识别与荧光强度之间的解耦现象 | 发现了HBC530结合亲和力与荧光强度之间的相关性较弱,并识别出多个结合亲和力与野生型Pepper相似但荧光强度显著降低的变体 | 研究仅针对Pepper RNA变体,未扩展到其他荧光RNA适体 | 探究荧光RNA适体的配体识别和荧光激活机制,为下一代荧光RNA适体的理性设计提供框架 | Pepper RNA变体及其与HBC530和镁离子的相互作用 | 合成生物学 | NA | RNA变体库生成与定量评估 | NA | RNA序列与荧光强度数据 | 53个Pepper变体 |
209 | 2025-07-17 |
Temporal gene regulation enables controlled expression of gas vesicles and preserves bacterial viability
2025-Jun-20, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.06.20.660610
PMID:40667317
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研究论文 | 本文报道了一种双诱导转录调控系统,用于控制气体囊泡(GVs)的时序表达,以保持细菌的活力 | 开发了一种双诱导转录调控系统,通过时序控制GV组装因子和外壳蛋白的表达,解决了GV异源表达导致的细胞生长受损问题 | 研究仅针对特定细菌宿主,未验证在其他宿主中的适用性 | 优化气体囊泡(GVs)在非原生宿主中的表达,以促进其在生物医学工程和合成生物学中的应用 | 气体囊泡(GVs)及其在细菌中的表达 | 合成生物学 | NA | 双诱导转录调控系统 | NA | NA | NA |
210 | 2025-07-17 |
Attaining the Promise of Geminivirus-Based Vectors in Plant Genome Editing
2025-04-27, Viruses
DOI:10.3390/v17050631
PMID:40431643
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综述 | 本文综述了基于双生病毒载体在植物基因组编辑中的应用及其潜力 | 讨论了双生病毒载体如何克服传统转基因技术的限制,并加速基因组编辑过程 | 虽然双生病毒载体具有潜力,但其应用仍面临一些技术障碍 | 探讨双生病毒载体在植物基因组编辑中的应用及其优势 | 植物基因组编辑技术及双生病毒载体 | 合成生物学 | NA | 病毒载体介导的基因组编辑 | NA | NA | NA |
211 | 2025-07-17 |
Microfluidic Production of Spatially Structured Biomimetic Microgels as Compartmentalized Artificial Cells
2025-Apr, Small science
IF:11.1Q1
DOI:10.1002/smsc.202400320
PMID:40657197
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research paper | 该研究开发了一种微流控策略,用于生产具有空间结构的仿生微凝胶,作为区室化人工细胞 | 通过微流控技术实现了微米级两室和三室仿生微凝胶的可控制备,并能在不同区室中引入多种合成细胞器,模拟生物细胞的区室化特征 | NA | 开发能模拟生物细胞区室化特征的人工细胞平台 | 仿生微凝胶人工细胞 | 合成生物学 | NA | 微流控技术 | NA | NA | NA |
212 | 2025-07-17 |
Integrated platform for structural and functional analysis of terpene synthases of Cannabis sativa
2025, PeerJ
IF:2.3Q2
DOI:10.7717/peerj.19723
PMID:40656959
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研究论文 | 开发了一个集成平台,用于系统表达、纯化、酶学表征和大麻萜烯合成酶(TPS)的结晶 | 结合动力学、热稳定性和结构分析,开发了一个数据挖掘指导的结晶筛选方法,成功生产出衍射质量晶体 | 仅对大麻中的十种TPS酶进行了功能表征,样本量有限 | 优化萜烯生产,用于制药、害虫管理和合成生物学应用 | 大麻萜烯合成酶(TPS) | 合成生物学 | NA | 结晶筛选、数据挖掘、酶学表征 | NA | 酶学数据、晶体结构数据 | 十种大麻TPS酶 |
213 | 2025-07-16 |
Programmable DNA Hairpin Locker: Dual-Layer Encrypted Carrier Communication
2025-Jul-15, ACS nano
IF:15.8Q1
DOI:10.1021/acsnano.5c01802
PMID:40614219
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研究论文 | 本文介绍了一种基于DNA的双层加密载体通信系统,利用DNA的可编程性和分子信标架构实现精确的信号识别与处理 | 开发了DNA发夹锁(DHL)架构,具有Exo λ抗性,支持动态响应DNA信号并保持稳定运行,同时设计了三种变体支持九种不同的输入/输出配置 | 未提及具体实验规模或实际应用中的性能限制 | 开发一种安全可靠的分子通信系统,用于生物传感和合成生物学应用 | DNA分子及其在通信系统中的应用 | 合成生物学 | NA | 分子编程、lambda核酸外切酶(Exo λ) | NA | 分子信号 | NA |
214 | 2025-07-16 |
Advances in nanorobotics for gastrointestinal surgery: a new frontier in precision medicine and minimally invasive therapeutics
2025-Jul-14, Journal of robotic surgery
IF:2.2Q2
DOI:10.1007/s11701-025-02550-8
PMID:40660043
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综述 | 本文综述了纳米机器人技术在胃肠外科手术中的最新进展,探讨了其在精准医学和微创治疗中的潜在应用 | 纳米机器人技术通过结合纳米级工程、合成生物学和智能计算,开创了精准医学的新领域,从静态构造发展到能够动态导航胃肠环境的智能代理 | 讨论了自主性、脱靶控制和伦理法律框架等重大挑战 | 推动纳米机器人技术在胃肠外科手术中的临床转化和应用 | 胃肠外科手术中的纳米机器人技术 | 精准医学 | 胃肠疾病 | 纳米机器人技术、合成生物学、人工智能 | NA | NA | NA |
215 | 2025-07-16 |
Robust soybean leaf agroinfiltration
2024-Jun-05, Plant cell reports
IF:5.3Q1
DOI:10.1007/s00299-024-03245-4
PMID:38837057
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research paper | 开发了一种稳健的大豆叶片农杆菌浸润介导的瞬时基因表达方法 | 创新了一种针对大豆叶片的农杆菌浸润方法,确定了影响成功的关键因素,包括基因型、表面活性剂、发育阶段和农杆菌菌株及培养基 | 研究仅针对两种大豆品系进行了验证,可能不适用于所有大豆品种或其他作物 | 开发一种稳健的农杆菌浸润介导的瞬时基因表达方法,用于大豆叶片 | 大豆(Glycine max)叶片 | 植物生物技术 | NA | 农杆菌浸润 | NA | NA | 两种大豆品系(V17-0799DT和TN16-5004) |
216 | 2025-07-15 |
Insight into the eminent biotechnological applications of xylanolytic enzymes for sustainable bioprocessing
2025-Aug, 3 Biotech
IF:2.6Q3
DOI:10.1007/s13205-025-04415-1
PMID:40657403
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综述 | 本文全面综述了木聚糖的结构、木聚糖降解酶的作用及其在造纸、食品、纺织和制药等工业中的应用 | 讨论了利用纳米生物技术、基因工程(特别是CRISPR/CAS技术)提高木聚糖酶的热稳定性,并探讨了木聚糖酶研究的新趋势,如从宏基因组中生物勘探新型耐热木聚糖酶、蛋白质工程、合成生物学和生物精炼的整合 | NA | 探讨木聚糖酶在生物技术和工业生物加工中的多方面作用,并概述该领域未来的研究和创新方向 | 木聚糖及其降解酶 | 生物技术 | NA | 纳米生物技术、基因工程(CRISPR/CAS技术)、蛋白质工程、合成生物学 | NA | NA | NA |
217 | 2025-07-15 |
Antioxidant and Anti-Inflammatory Effects of Traditional Medicinal Plants for Urolithiasis: A Scoping Review
2025-Jul-02, Plants (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/plants14132032
PMID:40648041
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综述 | 本文总结了传统药用植物在尿路结石管理中的抗氧化和抗炎作用及其分子机制 | 聚焦于传统药用植物的抗氧化和抗炎作用,填补了尿路结石研究中此类生物标志物的研究空白 | 仅纳入6项研究,样本量较小且地域分布有限 | 探索传统药用植物在尿路结石管理中的潜在应用价值 | 传统药用植物及其生物活性成分 | 生物医学 | 尿路结石 | 文献综述方法 | NA | 文献数据 | 6项研究(来自中国2项、印度3项、韩国1项) |
218 | 2025-07-15 |
Revisiting Traditional Medicinal Plants: Integrating Multiomics, In Vitro Culture, and Elicitation to Unlock Bioactive Potential
2025-Jul-02, Plants (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/plants14132029
PMID:40648038
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综述 | 本文回顾了传统药用植物的研究,整合了多组学技术、体外培养和诱导策略以探索其生物活性潜力 | 结合多组学技术、体外培养和诱导策略,全面探索药用植物的生物活性化合物 | 未提及具体实验数据或样本量,可能缺乏实证支持 | 探索和优化药用植物中生物活性化合物的生产 | 传统药用植物及其生物活性化合物 | 生物技术 | NA | 多组学技术(代谢组学、蛋白质组学、转录组学)、体外培养系统、诱导策略 | NA | 多组学数据 | NA |
219 | 2025-07-15 |
Reprogramming Hairy Root Cultures: A Synthetic Biology Framework for Precision Metabolite Biosynthesis
2025-Jun-23, Plants (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/plants14131928
PMID:40647937
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综述 | 本文综述了毛状根培养在可持续生产植物源化合物中的应用及其在遗传和代谢工程中的潜力 | 整合了毛状根系统与转录组学和CRISPR技术等先进基因组工具,以加速途径特异性代谢工程 | 大规模生产优化、生物反应器效率提升以及不同植物物种间代谢物合成增强仍面临挑战 | 探讨毛状根培养在可持续生产高价值植物源化合物中的应用及其潜力 | 毛状根培养及其在遗传和代谢工程中的应用 | 合成生物学 | NA | 转录组学, CRISPR技术 | NA | NA | NA |
220 | 2025-07-15 |
Reviving the Dire Wolf? A Case Study in Welfare Ethics, Legal Gaps, and Ontological Ambiguity
2025-Jun-21, Animals : an open access journal from MDPI
IF:2.7Q1
DOI:10.3390/ani15131839
PMID:40646738
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research paper | 本文探讨了通过基因编辑和克隆技术复活已灭绝的恐狼所带来的伦理、法律和本体论问题 | 首次将五领域模型应用于评估基因工程动物的福利风险,并从多种伦理角度分析功能灭绝复活的道德合理性 | 研究主要基于理论分析,缺乏实际动物行为数据和长期观察结果 | 评估基因复活灭绝物种项目的伦理、法律和动物福利影响 | 基因编辑创造的恐狼样犬科动物、代孕母狼及可能受影响的生态系统 | 合成生物学 | NA | 基因组编辑和克隆技术 | 五领域模型 | 理论分析 | 3只基因改造动物 |