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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 201 | 2026-04-09 |
Causes and consequences of experimental variation in Nicotiana benthamiana transient expression
2026-Feb-14, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-69458-1
PMID:41690913
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研究论文 | 本研究系统分析了本氏烟草瞬时表达实验中的变异来源,并建立了变异模型以指导实验设计 | 首次对本氏烟草农杆菌浸润瞬时表达系统的实验变异进行全面建模分析,并基于三年纵向数据提出降低变异性的实用指南 | 研究主要针对本氏烟草系统,结论可能不完全适用于其他植物瞬时表达体系 | 探究本氏烟草瞬时表达实验中的变异来源及其影响,建立减少变异性的实验设计框架 | 本氏烟草(Nicotiana benthamiana)农杆菌浸润瞬时表达系统 | 合成生物学 | NA | 农杆菌浸润瞬时表达技术 | 变异统计模型 | 植物基因表达数据 | 1915株植物(三年纵向数据) | 农杆菌介导的基因递送 | 本氏烟草 | 瞬时基因表达系统 | 农业, 工业生物技术 |
| 202 | 2026-04-09 |
Engineered bacteria for cancer therapy: Advancements, challenges, and future directions
2025-Dec-20, Chinese medical journal
IF:7.5Q1
DOI:10.1097/CM9.0000000000003807
PMID:41243447
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综述 | 本文综述了工程化细菌在癌症治疗中的最新进展、挑战和未来方向,重点探讨了其作为新型治疗平台的潜力 | 利用工程化细菌选择性定植肿瘤微环境,作为局部递送治疗剂和激发抗肿瘤免疫反应的创新平台 | NA | 探讨工程化细菌在癌症治疗中的应用,以克服传统疗法的局限性 | 工程化细菌及其在癌症治疗中的设计和应用 | 合成生物学 | 癌症 | 基因工程和合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 细菌 | 可编程生产抗癌有效载荷的合成生物电路 | 医学 |
| 203 | 2026-04-09 |
Plasmid Stability Analysis with Open-Source Droplet Microfluidics
2024-12-27, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/67659
PMID:39803963
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研究论文 | 本研究介绍了一种基于开源硬件的微流控工作流程,用于分析质粒保留,通过培养单细胞于凝胶微滴中并使用荧光显微镜量化微菌落 | 采用开源硬件微流控技术,结合荧光蛋白表达和非特异性DNA染色,实现高通量质粒稳定性分析,相比传统平板计数具有更高统计能力 | 研究主要聚焦于大肠杆菌作为实验模型,方法虽具通用性但需进一步验证于其他生物体 | 开发一种开源微流控工作流程,用于分析质粒在无抗生素选择下的保留情况 | 质粒在单细胞中的表达和保留,以及微菌落的量化 | 合成生物学 | NA | 微流控技术、荧光显微镜、DNA染色 | NA | 图像数据 | NA | 开源硬件 | 大肠杆菌 | 质粒表达荧光蛋白,用于构建生物传感器或标记系统 | 工业生物技术、环境、医学 |
| 204 | 2026-04-09 |
Digital switching in a biosensor circuit via programmable timing of gene availability
2014-Dec, Nature chemical biology
IF:12.9Q1
DOI:10.1038/nchembio.1680
PMID:25306443
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研究论文 | 本文介绍了一种通过可编程基因可用性时序控制,利用位点特异性重组酶在合成生物传感器电路中实现数字切换的方法,显著降低了泄漏并提高了动态范围 | 利用位点特异性重组酶对多基因电路中的基因可用性进行可编程时序控制,以纠正瞬态传递中的非稳态过程,从而减少泄漏并增强电路性能 | NA | 开发一种通过时序控制基因可用性来改善合成生物传感器电路性能的方法 | 内源性microRNA(miRNA)的比例传感器和细胞类型分类 | 合成生物学 | NA | 位点特异性重组酶技术 | NA | 基因表达数据 | NA | 位点特异性重组酶 | NA | 比例传感器电路,涉及抑制器组件及其抑制目标的去同步化设计 | 医学 |
| 205 | 2026-04-08 |
Precision-engineered starch: Integrating metabolic engineering and cell-free synthetic biology for sustainable bioplastics and functional foods
2026-Jun-01, Carbohydrate polymers
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.carbpol.2026.125146
PMID:41943368
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综述 | 本文综述了通过代谢工程和无细胞合成生物学技术,从下游修饰转向精确生物合成设计,以开发可持续生物塑料和功能性食品用淀粉的最新进展 | 整合了植物代谢工程(特别是CRISPR-Cas基因组编辑)和无细胞合成生物学平台,将淀粉开发从传统下游修饰转向精确的生物合成工程,实现结构可控、高纯度、可重复生产的淀粉设计 | NA | 开发具有特定营养品质、技术功能和可持续性目标的下一代生物基材料——工程化淀粉 | 淀粉生物合成途径、淀粉颗粒结构(直链淀粉-支链淀粉比例、链长分布、磷酸酯化等)及其与理化性质、消化性、血糖反应和抗性淀粉形成的关系 | NA | NA | 代谢工程、CRISPR-Cas基因组编辑、无细胞合成生物学 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas | 植物(主要作物) | 淀粉生物合成途径(涉及颗粒结合淀粉合酶、可溶性淀粉合酶、淀粉分支酶和脱支酶的协调作用) | 农业, 食品, 材料, 工业生物技术 |
| 206 | 2026-04-08 |
Biosilicification across Biological Hierarchies
2026-Apr-07, ACS nano
IF:15.8Q1
DOI:10.1021/acsnano.5c22206
PMID:41888096
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综述 | 本文探讨了生物硅化作用在分子、细胞和组织层面的进展,强调了其在增强生物材料性能、保护生命系统以及整合合成与生物物质方面的潜力 | 挑战了硅在生物学中惰性的传统观点,并提供了工程化硅-生物界面的分子蓝图,利用合成生物学和材料科学实现超越进化时间尺度的可编程硅化调控 | NA | 研究生物硅化作用作为平台,以提升生物材料性能、保护生命系统并整合合成与生物物质 | 硅在生物系统中的化学形式、海洋生物(如硅藻)的硅化途径,以及硅在骨骼和结缔组织生物学中的作用 | 材料科学 | NA | 合成生物学、诱变、材料科学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学、材料、工业生物技术 |
| 207 | 2026-04-08 |
Crosslinking intermodular condensation in non-ribosomal peptide biosynthesis
2025-02, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-024-08306-y
PMID:39663458
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研究论文 | 本研究开发了位点选择性交联探针,用于解析非核糖体肽合成酶中载体蛋白与酶结构域之间的相互作用,并报告了高分辨率冷冻电镜结构 | 首次应用四嗪点击化学捕获载体蛋白在缩合结构域活性位点的交联,揭示了模块间识别事件和载体蛋白在催化步骤间的过程性移动机制 | 研究主要聚焦于酪氨酸素生物合成的前两个模块,可能未完全反映其他非核糖体肽合成酶系统的结构动态 | 阐明非核糖体肽合成酶中载体蛋白与酶结构域相互作用的分子机制 | 酪氨酸素生物合成途径中的载体蛋白和缩合结构域 | 结构生物学 | NA | 位点选择性交联、四嗪点击化学、冷冻电镜、X射线晶体学 | NA | 结构数据 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学 |
| 208 | 2026-04-08 |
Route to Measure Exact Parameters of Bio-Nanostructures Self-Assembly
2024-10-31, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom14111388
PMID:39595566
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研究论文 | 本文介绍了一种新方法,用于测量生物纳米结构自组装的关键参数,首次实现了对自催化与自抑制参数的精确计算 | 首次提出一种能够精确计算生物纳米结构自组装过程中自催化与自抑制参数的方法 | NA | 研究生物纳米结构自组装机制,以优化其在纳米技术和合成生物学中的应用 | 蛋白质基生物纳米涂层 | NA | NA | 数学模型 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 药物递送, 生物传感, 生物活性表面制造 |
| 209 | 2026-04-08 |
Mycoplasma pneumoniae Genome Editing Based on Oligo Recombineering and Cas9-Mediated Counterselection
2020-07-17, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.0c00022
PMID:32502342
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研究论文 | 本研究开发了一种基于寡核苷酸重组工程和CRISPR/Cas9反选择技术的支原体基因组编辑方法 | 首次在支原体中建立了基于GP35单链DNA重组酶的寡核苷酸重组工程系统,并结合CRISPR/Cas9反选择技术显著提高了编辑效率 | 基因删除效率随编辑片段增大而降低,对于超过1.8kb的染色体删除可能需要进一步优化 | 开发高效的支原体基因组编辑工具以推动其作为合成生物学底盘菌株的应用 | 肺炎支原体(Mycoplasma pneumoniae) | 合成生物学 | NA | 寡核苷酸重组工程、CRISPR/Cas9基因组编辑 | NA | 基因组序列数据 | NA | CRISPR-Cas9, GP35重组酶 | 肺炎支原体 | NA | 工业生物技术 |
| 210 | 2026-04-08 |
Situating anticipation in everyday life: Using sensory methods to explore public expectations of synthetic biology
2019-04, Public understanding of science (Bristol, England)
DOI:10.1177/0963662518808694
PMID:30355070
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研究论文 | 本文探讨了如何通过感官方法将公众对合成生物学的期望融入日常生活实践,以接地气地预测社会技术未来 | 采用感官方法论,将技术预期置于日常实践中,而非抽象化,并通过社会历史方法分析两个实践领域以展示生物合成未来如何改变人、物与观念的关系 | NA | 探索公众对合成生物学的期望,并研究如何通过感官方法将技术预测融入日常生活 | 公众的日常体验,特别是家庭护理与个人卫生护理两个实践领域 | 社会科学与合成生物学交叉 | NA | 感官方法论,社会历史分析 | NA | 定性数据(如感官体验描述) | NA | NA | NA | NA | 消费品(如香料与香水市场) |
| 211 | 2026-04-08 |
Informational laws of genome structures
2016-06-29, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/srep28840
PMID:27354155
|
研究论文 | 本研究探讨了在基因组分析中,基于k-mer和信息论概念选择最佳k值,以揭示基因组结构的内在规律,并提出了五个信息定律和一个基因组复杂性度量 | 确定了k = lg2(n)作为最佳k值,用于定义基因组信息指数,并提出了所有基因组都遵循的五个信息定律,以及一个基于广义逻辑映射的基因组复杂性度量 | 研究仅基于七十个基因组进行分析,可能未覆盖所有基因组类型,且应用部分仅简要概述 | 研究基因组结构的基本机制和设计原则,通过信息论概念表达基因组的内在方面 | 七十个基因组 | 计算生物学 | NA | k-mer分析,信息熵计算 | 广义逻辑映射 | 基因组序列数据 | 七十个基因组 | NA | NA | NA | 计算合成生物学 |
| 212 | 2026-04-07 |
Semi-rational engineering of terminal deoxynucleotidyl transferase for high-efficiency enzymatic de novo DNA synthesis
2026-Sep, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2026.03.009
PMID:41938127
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研究论文 | 本文通过半理性工程改造末端脱氧核苷酸转移酶,以实现高效酶法从头DNA合成 | 通过AlphaFold3预测结构指导,设计出对3'-ONH-dNTP掺入优化的五重突变体,其活性比三重突变体提高30倍,单步掺入效率超过98% | NA | 开发高效、环保的酶法DNA合成技术以克服传统化学方法的局限性 | 来自芽孢杆菌属的末端脱氧核苷酸转移酶及其工程变体 | 合成生物学 | NA | 酶法DNA合成、结构预测、蛋白质工程 | AlphaFold3 | 蛋白质序列、结构模型、酶活性数据 | NA | 蛋白质工程、结构引导的理性设计 | NA | NA | 工业生物技术 |
| 213 | 2026-04-07 |
Human Allele Frequency Distributions Contradict Current Narratives of Imminent Danger From Genetically Targeted Bioweapons
2026-Apr-05, Health security
IF:2.1Q3
DOI:10.1177/23265094261434692
PMID:41937340
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研究论文 | 本文通过分析人类等位基因频率分布,评估了基因靶向生物武器的可行性,并挑战了当前关于其紧迫威胁的叙事 | 首次从自然遗传变异角度系统评估基因靶向生物武器的可行性,揭示药物滥用而非病原体靶向是更紧迫的种族靶向风险 | 研究仅基于149个感染相关和136个药物反应相关变异,可能未涵盖所有潜在靶点;未考虑未来基因编辑技术进展的影响 | 验证基因靶向生物武器叙事的科学基础,评估其实际风险 | 人类等位基因频率分布,特别是感染相关和药物反应相关的遗传变异 | 遗传学 | NA | 等位基因频率分析 | NA | 遗传变异数据 | NA | NA | NA | NA | 生物安全 |
| 214 | 2026-04-07 |
Engineering aminoacyl-tRNA synthetase activity to enhance branched-chain amino acid biosynthesis
2026-Mar-31, Biochimie
IF:3.3Q2
DOI:10.1016/j.biochi.2026.03.014
PMID:41933685
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研究论文 | 本文探讨通过工程化支链氨基酸特异性氨酰-tRNA合成酶活性来增强微生物中支链氨基酸的生物合成 | 提出利用aaRS-tRNA对工程化创建生长偶联选择系统,并整合tRNA修饰、靶向aaRS诱变和合成生物学工具,以直接工程化BCAA aaRS,这是当前研究中较少探索的途径 | 直接工程化BCAA aaRS的研究仍较为罕见,相关应用潜力尚未充分开发 | 增强微生物细胞工厂中支链氨基酸的生物合成,以支持工业规模生产 | 支链氨基酸(缬氨酸、亮氨酸、异亮氨酸)及其特异性氨酰-tRNA合成酶 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、靶向诱变、tRNA修饰 | NA | NA | 涉及大肠杆菌和谷氨酸棒状杆菌的微生物细胞工厂 | 合成生物学工具 | 大肠杆菌, 谷氨酸棒状杆菌 | 生长偶联选择系统,基于aaRS-tRNA对的工程化设计 | 工业生物技术 |
| 215 | 2026-04-07 |
Machine learning-directed massively parallel programmable nucleic acid amplification
2026-Mar-27, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.aec9175
PMID:41880514
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研究论文 | 本文开发了一种基于热力学的可编程核酸扩增方法,通过机器学习模型优化预测精度,应用于DNA数据存储和临床诊断 | 提出了一种通过引物标签补偿策略解耦序列特异性和杂交能量调控的方法,实现了高分辨率(33%对比81%)的可编程扩增,并利用机器学习模型将预测精度从0.62提升至0.86 | 未明确提及具体局限性,但暗示该方法可扩展至单细胞测序和空间转录组学,表明当前应用范围可能有限 | 开发一种可动态调控扩增效率的方法,以提升分子诊断和DNA数据存储的性能 | 核酸扩增过程,包括DNA数据存储和临床RNA变异分析 | 机器学习 | 宫颈癌 | 核酸扩增技术,机器学习建模 | 机器学习模型 | 实验数据(2483个数据点) | 2483个实验数据点,用于构建机器学习模型 | NA | NA | NA | 医学,数据存储 |
| 216 | 2026-04-07 |
Engineering Trichoderma-mediated plant defense against bacterial phytopathogens: Micro-and nanobiotechnological strategies
2026, AIMS microbiology
IF:2.7Q3
DOI:10.3934/microbiol.2026002
PMID:41938783
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综述 | 本文综述了利用木霉属真菌通过微纳米生物技术策略工程化增强植物对细菌性植物病原体的防御能力 | 整合多组学、CRISPR基因组编辑、合成生物学与纳米技术,将木霉开发为可持续精准作物保护的下一代平台 | 仍面临田间转化、生物安全与监管方面的挑战 | 开发可持续且精准的作物保护策略以对抗细菌性植物病原体 | 木霉属真菌及其与植物和细菌病原体的相互作用 | 合成生物学与农业生物技术 | 植物细菌性病害 | 多组学分析、CRISPR基因组编辑、合成生物学、纳米技术 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, 合成生物学方法 | 木霉属真菌 | 通过基因编辑和合成生物学方法定制具有增强生物防治效率的菌株 | 农业 |
| 217 | 2026-04-07 |
Engineering the holobiont: Synthetic biology strategies for reversing bioenergetic collapse in radiation enteritis
2026, AIMS microbiology
IF:2.7Q3
DOI:10.3934/microbiol.2026003
PMID:41938784
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综述 | 本文综述了利用合成生物学策略逆转辐射性肠炎中生物能量崩溃的方法 | 提出从经验性益生菌补充转向微生物合成生物学,通过工程化共生菌作为活体氧汇、基因驯化及生物计算机设计来理性重编程肠道生态系统 | NA | 逆转辐射性肠炎中的生物能量崩溃,改善长期癌症生存率 | 肠道全息生物体(肠道微生物生态系统) | 合成生物学 | 辐射性肠炎 | 微生物合成生物学、基因工程、Gut-on-a-Chip验证 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, STALEMATE | 工程化共生菌 | 布尔逻辑门生物计算机、cGAS-STING轴调节、衣康酸分流代谢重编程 | 医学 |
| 218 | 2026-04-07 |
Transitions in development - an interview with Nika Shakiba
2024-03-01, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.202748
PMID:38421607
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访谈 | 本文是对加拿大英属哥伦比亚大学研究组长Nika Shakiba的访谈,探讨其如何运用合成生物学技术研究干细胞竞争的基础 | 通过工程学视角将干细胞视为可编程单元的研究方法,以及将合成生物学与干细胞生物学交叉融合的研究方向 | NA | 探索干细胞竞争的基础机制 | 干细胞 | 合成生物学 | NA | 合成生物学技术 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 219 | 2026-04-06 |
Advances in vehicles for in situ delivery: From classical vectors to biologically inspired structures
2026-Sep, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2026.02.013
PMID:41884229
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综述 | 本文系统总结了蛋白质和核酸递送系统的最新进展,包括病毒载体、非病毒载体及新型递送工具 | 全面评估了从经典载体到生物启发结构(如Arc、PNMA2、SEND、PVC和凝聚层系统)的递送工具发展,并对作用机制、应用进展和未来前景进行了系统分析 | NA | 为合成生物学和基因治疗领域的技术发展和理论研究提供参考 | 蛋白质和核酸的递送系统 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 220 | 2026-04-06 |
Focused Ultrasound-activated Extracellular Vesicles-nanoparticle Hybrids for Targeted Brain Drug Delivery: Engineering Strategies and Translational Outlook
2026-Apr-02, CNS & neurological disorders drug targets
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综述 | 本文全面探讨了聚焦超声激活的细胞外囊泡-纳米颗粒杂合体用于靶向脑部药物递送的工程策略、分子机制及转化前景 | 结合聚焦超声的可逆血脑屏障开放能力与细胞外囊泡-纳米颗粒杂合体的生物相容性及可控特性,实现高效、精准的脑部药物递送 | 大规模生产、标准化及长期安全性与可重复性仍面临挑战 | 开发一种非侵入性、靶向性的脑部药物递送系统,以克服血脑屏障的限制 | 聚焦超声激活的细胞外囊泡-纳米颗粒杂合体 | 生物医学工程 | 神经系统疾病 | 聚焦超声、声学空化、合成生物学、微流控、人工智能 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |