合成生物学相关文章
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当前共找到 3214 篇文献，本页显示第 201 - 220 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 201 | 2025-05-27 |
Regulatory helix plays a key role in genetic ON-OFF switching for the 2'-deoxyguanosine sensing mRNA element
2025-May-22, The Journal of biological chemistry
IF:4.0Q2
DOI:10.1016/j.jbc.2025.110282
PMID:40412519
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研究论文 | 本文研究了2'-脱氧鸟苷（2'-dG）感应mRNA元素的遗传开关机制，揭示了调控螺旋在转录调控中的关键作用 | 发现dGsw-int转录中间体在无配体时形成稳定的抗终止螺旋（ON状态），而在2'-dG存在时该螺旋解离（OFF状态），提出代谢物感应发生在两个转录中间体合成的短暂时间窗口 | 研究主要基于体外化学探测和荧光淬灭实验，未涉及体内复杂环境验证 | 阐明2'-dG感应核糖开关的精细调控机制及其在转录过程中的动态变化 | 2'-脱氧鸟苷感应核糖开关（dGsw）及其转录中间体（dGsw-fl和dGsw-int） | 分子生物学 | NA | 化学探测技术、荧光淬灭实验 | NA | 生物化学数据 | NA |
| 202 | 2025-05-27 |
Digital switching in a biosensor circuit via programmable timing of gene availability
2014-Dec, Nature chemical biology
IF:12.9Q1
DOI:10.1038/nchembio.1680
PMID:25306443
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研究论文 | 该研究展示了通过编程控制基因可用时间，利用位点特异性重组酶纠正多基因电路中的不良效应，显著提高了传感器的动态范围和特异性 | 通过编程控制基因可用时间，利用位点特异性重组酶纠正多基因电路中的不良效应，显著提高了传感器的动态范围和特异性 | NA | 提高合成生物学中基因电路的稳健性和性能 | 内源性microRNA (miRNA)的比例传感器 | 合成生物学 | NA | 位点特异性重组酶 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 203 | 2025-05-26 |
Development of Dipeptide-Based Liquid Droplets and Fibrils as Enzyme-Mimics
2025-May-24, Small (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/smll.202503916
PMID:40411841
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research paper | 开发了一种基于二肽的液滴和纤维作为酶模拟物 | 设计了一种简单的二肽，能够自凝聚成微米级液滴，并可作为微反应器用于疏水反应物，同时在不同pH值下形成纤维状组装体，作为高效的酯酶模拟催化剂 | NA | 探索最小化设计的超分子催化剂在酶学和合成生物学中的应用 | 二肽自凝聚形成的液滴和纤维 | synthetic biology | NA | liquid-liquid phase separation (LLPS) | NA | NA | NA |
| 204 | 2025-05-26 |
Transcription regulation by RNA-induced structural strain in duplex DNA
2025-May-22, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf429
PMID:40401557
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研究论文 | 本文描述了一种通过RNA-DNA三链体调节转录速率的机制，并在大肠杆菌启动子设计的架构中验证了其能力 | 揭示了RNA-DNA三链体通过扭曲双链DNA结构来增强或抑制转录的新机制 | 实验证据仍缺乏在更复杂生物（如哺乳动物）中的验证 | 探究非编码RNA通过形成三链体结构调控基因表达的分子机制 | 大肠杆菌启动子及其与RNA-DNA三链体的相互作用 | 分子生物学 | NA | 合成生物学方法、体外表征 | NA | NA | NA |
| 205 | 2025-05-26 |
Expanding the σ54-dependent transcription process with orthogonal designs
2025-May-22, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf442
PMID:40401558
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研究论文 | 本研究通过基于知识的筛选和重新设计σ54的RpoN盒及其配对启动子，开发了三组基于σ54-R456H、R456Y和R456L的正交表达系统 | 开发了三组具有不同启动子偏好和理想相互正交性的σ54正交表达系统，并证明其在三种非模式细菌中的特异性转录能力 | NA | 扩展合成生物学工具包，提供可靠且多样化的基因表达 | σ54依赖性转录过程 | 合成生物学 | NA | 知识筛选和重新设计 | NA | NA | 三种非模式细菌 |
| 206 | 2025-05-26 |
Assembly of ascovirus HvAV-3h long DNA fragment using the Transformation-Associated Recombination (TAR) approach in yeast cells
2025-May-22, BMC biotechnology
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12896-025-00964-8
PMID:40405135
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研究论文 | 本研究利用酵母细胞中的转化相关重组（TAR）方法，成功组装了来自昆虫病毒HvAV-3h的长DNA片段 | 首次将TAR方法应用于昆虫病毒长DNA片段的组装，为基因组工程研究提供了新思路 | 研究中发现了初始合成时存在的突变和缺失，可能影响组装片段的准确性 | 探索TAR方法在昆虫病毒基因组工程研究中的适用性 | Heliothesis virescens ascovirus 3h (HvAV-3h) dsDNA基因组 | 合成生物学 | NA | TAR, PCR, NGS | NA | DNA序列数据 | 15个约2.9-3.2 Kb的DNA片段组装成44.6 Kb长片段 |
| 207 | 2025-05-25 |
Mapping the Edges of Mass Spectral Prediction: Evaluation of Machine Learning EIMS Prediction for Xeno Amino Acids
2025-May-20, Analytical chemistry
IF:6.7Q1
DOI:10.1021/acs.analchem.5c00286
PMID:40329886
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research paper | 评估NEIMS质谱预测算法在单取代α-氨基酸上的准确性，以改进未知生物分子检测 | 首次评估NEIMS算法对超出训练数据的氨基酸的预测准确性，并指出其不足 | 预测光谱对于超出算法训练数据的氨基酸不准确，且无法通过物理化学差异或氨基酸衍生化状态解释这些不准确性 | 改进质谱预测算法，以扩展数据库覆盖范围，包括理论分子 | 单取代α-氨基酸 | machine learning | NA | mass spectrometry | NEIMS | mass spectral data | NA |
| 208 | 2025-05-25 |
Genetic encoding and expression of RNA origami cytoskeletons in synthetic cells
2025-May, Nature nanotechnology
IF:38.1Q1
DOI:10.1038/s41565-025-01879-3
PMID:40097648
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研究论文 | 本文介绍了RNA折纸细胞骨架模拟物作为合成细胞的核酸分子硬件，并展示了其在巨型单层脂质囊泡中的表达和应用 | 首次将RNA折纸技术应用于合成细胞的细胞骨架构建，实现了在等温条件下由DNA模板直接表达和自组装RNA折纸纳米管 | 研究仅局限于体外合成细胞系统，尚未在真实细胞环境中验证其功能 | 开发基于RNA的合成细胞分子硬件 | RNA折纸纳米管和合成细胞 | 合成生物学 | NA | RNA折纸技术、分子动力学模拟 | NA | 分子结构数据 | NA |
| 209 | 2025-05-25 |
Direct Quantification of Protein-Protein Interactions in Living Bacterial Cells
2025-May, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202414777
PMID:40125621
|
研究论文 | 该文章介绍了一种名为KD-FRET的方法，用于在活细菌细胞中定量测量蛋白质-蛋白质相互作用（PPIs）的解离常数（K） | 开发了KD-FRET方法，能够在活细菌细胞中直接定量测量PPIs，克服了体外测量中的假阳性信号问题，并能够测量在标准缓冲条件下不稳定的相互作用对 | 未明确提及方法的局限性，但可能包括荧光共振能量转移（FRET）技术本身的技术限制 | 开发一种在活细胞中直接定量测量蛋白质-蛋白质相互作用的方法，以促进合成生物学、蛋白质工程和药物发现 | 活细菌细胞（E. coli和S. cerevisiae）中的蛋白质-蛋白质相互作用 | 合成生物学 | NA | 荧光共振能量转移（FRET） | NA | 荧光信号数据 | 未明确提及具体样本数量，但涉及E. coli和S. cerevisiae中的蛋白质相互作用对 |
| 210 | 2025-05-25 |
ProteoSeeker: A Feature-Rich Metagenomic Analysis Tool for Accessible and Comprehensive Metagenomic Exploration
2025-May, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202414877
PMID:40130725
|
研究论文 | 介绍了一个名为ProteoSeeker的命令行工具，用于简化宏基因组蛋白质的识别和注释 | 开发了一个自动化工具ProteoSeeker，用于高效识别和注释宏基因组中的蛋白质，支持用户自定义蛋白质家族筛选和宿主生物分类学分析 | 未提及具体的性能对比或与其他工具的基准测试结果 | 加速生物技术、合成生物学和生物医学研究与创新 | 宏基因组中的蛋白质 | 生物信息学 | NA | 宏基因组分析 | NA | 宏基因组数据 | NA |
| 211 | 2025-05-24 |
Microbiome catalog and dynamics of the Chinese liquor fermentation process
2025-Sep, Bioresource technology
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.biortech.2025.132620
PMID:40334798
|
研究论文 | 该研究构建了中国白酒发酵过程中的微生物基因目录（MTFGC），揭示了发酵食品的独特性和高代谢潜力 | 建立了最大的发酵食品遗传资源库，发现了20%的新物种和基因，并验证了BGCs在合成香气相关脂肽中的作用 | 研究主要聚焦于中国白酒发酵过程，可能不适用于其他类型的发酵食品 | 揭示发酵食品中微生物的多样性和代谢潜力，推动传统发酵向精准合成生物学的转变 | 中国白酒发酵过程中的微生物群落 | 合成生物学 | NA | 宏基因组组装 | NA | 宏基因组数据 | 5,159个宏基因组组装基因组（MAGs） |
| 212 | 2025-05-24 |
Engineering Bacillus Spores to Display Nicotine Oxidase: In Situ Specific and Sensitive Nicotine Detection
2025-05-23, ACS sensors
IF:8.2Q1
DOI:10.1021/acssensors.5c00275
PMID:40329593
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research paper | 本研究开发了一种新型的活体电化学生物传感器，用于高灵敏度和实时检测尼古丁 | 通过合成生物学和材料工程的结合，开发了具有增强活性和热稳定性的基因工程NOX突变体，并将其展示在孢子表面，结合FeSe@MHCS复合电极，实现了超低检测限和出色的稳定性 | NA | 开发一种高灵敏度和实时检测尼古丁的方法 | 尼古丁 | 生物传感器 | NA | 电化学阻抗谱(EIS), 差分脉冲伏安法(DPV) | NA | 电化学数据 | 血液和尿液样本 |
| 213 | 2025-05-24 |
Characterization of a consensus-designed trans-cinnamic acid decarboxylase for styrene biosynthesis
2025-May-23, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mbio.00714-25
PMID:40407334
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研究论文 | 本文描述了一种通过共识设计获得的转肉桂酸脱羧酶PSC1，用于苯乙烯的生物合成 | 设计了一种新型的共识蛋白PSC1，能够在细菌中高效催化肉桂酸脱羧生成苯乙烯，解决了传统真菌脱羧酶在细菌系统中应用的难题 | NA | 开发一种高效、环保的苯乙烯生物合成方法 | 转肉桂酸脱羧酶PSC1及其在苯乙烯生物合成中的应用 | 合成生物学 | NA | 蛋白质工程、X射线晶体学 | NA | 蛋白质结构数据 | NA |
| 214 | 2025-05-24 |
Single-Cell Nanoencapsulation: Chemical Synthesis of Artificial Cell-in-Shell Spores
2025-May-22, Chemical reviews
IF:51.4Q1
DOI:10.1021/acs.chemrev.4c00984
PMID:40403226
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review | 本文综述了人工孢子中单细胞纳米封装（SCNE）技术的最新进展，重点讨论了纳米壳的细胞保护和多功能作用 | 受自然界隐生现象的启发，设计了具有纳米壳保护和功能能力的人工'细胞壳'结构，克服了生物原始细胞的固有局限 | NA | 通过SCNE技术实现细胞内和细胞周围化学调控的精细调节，设计和构建满足特定功能需求的人工孢子 | 人工'细胞壳'结构 | 合成生物学、生物化学、材料科学、生物医学工程 | NA | 单细胞纳米封装（SCNE） | NA | NA | NA |
| 215 | 2025-05-24 |
Removing redundancy of the NCN codons in vitro for maximal sense codon reassignment
2025-May-21, Chemical science
IF:7.6Q1
DOI:10.1039/d4sc06740a
PMID:40271033
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research paper | 该研究探讨了通过消除NCN密码子的冗余性，在体外实现最大程度的有义密码子重新分配，以扩展遗传密码的应用 | 提出了一种评估密码子重新分配潜力的通用流程，并将16个密码子分配给10种不同的氨基酸，显著提高了编码潜力 | 研究主要在体外进行，体内应用的可行性和效果尚待验证 | 扩展遗传密码，为合成生物学、蛋白质功能研究和多肽库的创建提供更多可能性 | NCN密码子及其对应的tRNA | 合成生物学 | NA | mRNA展示技术 | NA | NA | NA |
| 216 | 2025-05-24 |
Quantum-inspired logic for advanced Transcriptional Programming
2025-May-10, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf440
PMID:40396492
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研究论文 | 该研究提出了一种基于量子计算原理的新型合成生物学工具包，用于构建具有多输出基因控制的压缩遗传电路，以增强转录编程的生物计算能力 | 利用量子计算原理设计合成双向启动子和转录因子，构建了1输入2输出的生物量子比特和PAULI-X逻辑门，并进一步开发了更复杂的FEYNMAN和TOFFOLI门，以及2输入4输出的量子操作 | NA | 提高生物系统决策操作的复杂性，同时最小化对底盘细胞的代谢负担 | 合成遗传电路和量子启发的逻辑操作 | 合成生物学 | NA | 合成双向启动子工程、合成转录因子调控、重组酶记忆操作 | 量子启发的逻辑门（QUBIT、PAULI-X、FEYNMAN、TOFFOLI） | NA | NA |
| 217 | 2025-05-24 |
A meta-analysis of the gut microbiome in inflammatory bowel disease patients identifies disease-associated small molecules
2025-Feb-12, Cell host & microbe
IF:20.6Q1
DOI:10.1016/j.chom.2025.01.002
PMID:39947133
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meta-analysis | 通过对炎症性肠病(IBD)患者肠道微生物组中小分子生物合成基因簇(BGCs)的荟萃分析，发现与克罗恩病(CD)相关的两种梭菌衍生BGCs，并鉴定了六种脂肪酸酰胺作为其产物，这些分子可能影响肠道通透性并加剧疾病 | 首次通过合成生物学方法发现并解析了与克罗恩病相关的微生物组衍生小分子结构，并验证了这些分子在疾病模型中的作用 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本中的验证仍需进一步研究 | 探索肠道微生物组小分子在炎症性肠病发病机制中的作用 | 炎症性肠病患者的肠道微生物组及衍生小分子 | 微生物组学 | 炎症性肠病(克罗恩病) | 宏基因组测序，合成生物学 | NA | 宏基因组数据 | IBD患者和健康对照的肠道微生物组样本 |
| 218 | 2025-05-24 |
Evolution of interorganismal strigolactone biosynthesis in seed plants
2025-Jan-17, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.adp0779
PMID:39818909
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research paper | 该研究探讨了种子植物中跨生物体独脚金内酯（SLs）的生物合成进化 | 揭示了CYP722A在非经典SLs生物合成中的关键作用，并提出了16-OH-CLA作为经典SLs进化中的代谢中间体 | 未涉及所有种子植物种类，可能无法全面代表SLs的进化路径 | 研究独脚金内酯的生物合成进化及其功能分化 | 种子植物中的独脚金内酯及其生物合成酶 | 植物分子生物学 | NA | 合成生物学 | NA | 生化数据 | 多种开花植物的地上部分 |
| 219 | 2025-05-23 |
Advances in metabolic engineering for enhanced acetyl-CoA availability in yeast
2025-Jun, Critical reviews in biotechnology
IF:8.1Q1
DOI:10.1080/07388551.2024.2399542
PMID:39266266
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review | 本文总结了酵母中乙酰辅酶A及其衍生物生物合成途径和代谢工程方法的最新进展 | 强调了通过代谢工程策略调控乙酰辅酶A合成以创建更有效的微生物细胞工厂的新见解 | NA | 提高酵母中乙酰辅酶A的可用性以促进其衍生物的高效合成 | 酵母中的乙酰辅酶A及其衍生物 | 合成生物学 | NA | 代谢工程 | NA | NA | NA |
| 220 | 2025-05-23 |
Astaxanthin biosynthesis for functional food development and space missions
2025-Jun, Critical reviews in biotechnology
IF:8.1Q1
DOI:10.1080/07388551.2024.2410364
PMID:39428346
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review | 本文综述了虾青素（AXT）的生物合成及其在功能性食品开发和太空任务中的应用 | 探讨了合成生物学和细胞工厂策略在虾青素工业生产中的应用，并提出了其在太空探索中的潜在用途 | 未提及具体实验数据或案例研究来支持合成生物学策略的有效性 | 研究虾青素的生物合成及其在工业和太空任务中的应用 | 虾青素（AXT）及其在不同底盘生物中的表达 | 合成生物学 | 心血管疾病 | 合成生物学、基因工程 | NA | NA | NA |