合成生物学相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
2181	2024-08-07	A synthetic biology-based device prevents liver injury in mice 2016-07, Journal of hepatology IF:26.8Q1 DOI:10.1016/j.jhep.2016.03.020 PMID:27067456	研究论文	本文介绍了一种基于合成生物学的装置，该装置通过检测血清胆酸水平并产生治疗性肝细胞生长因子，保护小鼠免受药物诱导的急性肝衰竭	本文创新性地设计了一个闭环合成信号网络，通过激活外源表达的TGR5与人工启动子控制的肝细胞生长因子转录相连接，实现了对肝损伤相关血清胆酸水平的自我调节和剂量依赖性响应	NA	开发一种新的预防、急性及慢性医疗保健的方法	小鼠的肝脏损伤	合成生物学	肝病	基因工程	合成基因电路	NA	小鼠
2182	2024-08-07	Functional characterization of four mono-terpene synthases (TPSs) provided insight into the biosynthesis of volatile monoterpenes in the medicinal herb Blumea balsamifera 2023-Apr, Physiology and molecular biology of plants : an international journal of functional plant biology IF:3.4Q1 DOI:10.1007/s12298-023-01306-8 PMID:37187774	研究论文	本研究通过转录组测序结合代谢组学分析，筛选并克隆了Blumea balsamifera中的四种单萜合酶基因，并通过异源表达和体外酶活性测定验证了其功能	首次鉴定并功能验证了Blumea balsamifera中的四种单萜合酶，揭示了其挥发性单萜的生物合成途径	NA	旨在通过生物工程手段缓解Blumea balsamifera资源短缺问题，并提高其活性成分的产量	Blumea balsamifera中的单萜合酶基因及其编码的酶	生物工程	NA	转录组测序，代谢组学分析，异源表达，体外酶活性测定	NA	基因序列，代谢物	根、茎、叶中的基因和代谢物
2183	2024-08-07	Optimized cDICE for Efficient Reconstitution of Biological Systems in Giant Unilamellar Vesicles 2021-07-16, ACS synthetic biology IF:3.7Q1 DOI:10.1021/acssynbio.1c00068 PMID:34185516	研究论文	本文展示了通过优化连续液滴界面交叉封装（cDICE）方法，生成含有复杂生物化学系统的无缺陷巨型单层囊泡（GUVs）	通过严格控制环境条件和调整脂质-油分散体，显著提高了高质量GUV形成的可重复性和封装效率	NA	提高巨型单层囊泡中生物系统的封装效率和质量	巨型单层囊泡及其在生物系统中的应用	生物物理学	NA	连续液滴界面交叉封装（cDICE）	NA	囊泡	多种生物系统，包括最小肌动蛋白细胞骨架、膜锚定DNA纳米结构和功能性PURE系统
2184	2024-08-07	Integrating Systems and Synthetic Biology to Understand and Engineer Microbiomes 2021-07-13, Annual review of biomedical engineering IF:12.8Q1 DOI:10.1146/annurev-bioeng-082120-022836 PMID:33781078	综述	本文综述了利用系统生物学和合成生物学理解及工程化微生物组的方法	讨论了多组学和建模方法的集成，以解决微生物组工程中的关键知识和技术的空白	NA	探讨如何利用系统生物学和合成生物学工具理解微生物组并设计工程化微生物组	微生物组的组成和功能及其在农业、医学和生物技术中的应用	合成生物学	NA	多组学技术	计算模型	微生物组数据	NA
2185	2024-08-07	Present and future prospects for wheat improvement through genome editing and advanced technologies 2021-07-12, Plant communications IF:9.4Q1 DOI:10.1016/j.xplc.2021.100211 PMID:34327324	综述	本文综述了通过基因编辑和其他先进技术改善小麦的研究现状和未来前景	介绍了基因编辑技术在小麦功能基因组学和遗传改良中的应用，并讨论了其他技术如GWAS、高通量基因型和表型分析、快速育种和合成生物学在小麦研究中的应用	小麦的六倍体基因组和基因冗余复杂化了遗传研究和精确基因修饰的进展	探讨如何通过尖端技术提高小麦生产的韧性，同时减少环境污染，确保全球粮食和生态系统安全	小麦	NA	NA	基因编辑技术	NA	NA	NA
2186	2024-08-07	Realities and hopes in the application of microbial tools in agriculture 2021-07, Microbial biotechnology IF:4.8Q1 DOI:10.1111/1751-7915.13866 PMID:34156754	研究论文	本文探讨了微生物工具在农业中的应用现状与前景	提出了通过现场微生物群落操作方法，如使用含有合成微生物群落和新型益生元的产品，来克服当前限制的潜力	微生物工具在田间条件下的低效力和性能不一致是需要解决的主要限制	探讨微生物工具在可持续提高农业生产中的应用及其对其他可持续发展目标的贡献	微生物工具在农业中的应用及其市场发展	NA	NA	合成生物学和纳米生物技术	NA	NA	NA
2187	2024-08-07	Increasing MinD's Membrane Affinity Yields Standing Wave Oscillations and Functional Gradients on Flat Membranes 2021-05-21, ACS synthetic biology IF:3.7Q1 DOI:10.1021/acssynbio.0c00604 PMID:33881306	研究论文	本文通过调节MinD蛋白的膜亲和性，实现了在平坦脂质膜上的驻波振荡和功能梯度的形成	通过理性引导的突变延长MinD的膜定位序列，实现了不同于常见的行波或静态模式的驻波振荡	NA	探索通过分子自组织形成大规模模式的基本原理，并应用于合成生物学中的蛋白质模式和梯度的工程化	细菌MinDE蛋白系统中的MinD和MinE蛋白在脂质膜上的自组织行为	合成生物学	NA	理性引导的突变	NA	蛋白质模式	NA
2188	2024-08-07	Synthetic living machines: A new window on life 2021-May-21, iScience IF:4.6Q1 DOI:10.1016/j.isci.2021.102505 PMID:34041452	综述	本文综述了合成形态发生领域的最新进展，重点介绍了通过生物工程创造新型多细胞生物体的研究	该研究通过创建新型合成生物形式，扩展了现有的模型系统，超越了进化的植物和动物谱系	NA	旨在通过工程方法解决我们对形态发生中尺度规则理解上的空白，并推动合成生物学的发展	合成生物学中的新型多细胞生物体及其在医学和生物学基础问题理解上的应用	合成生物学	NA	NA	NA	NA	NA
2189	2024-08-07	Biosynthesis of Nature-Inspired Unnatural Cannabinoids 2021-May-14, Molecules (Basel, Switzerland) DOI:10.3390/molecules26102914 PMID:34068935	综述	本文综述了天然大麻素的生物合成途径及其在异源宿主中的合成生物学研究	通过合成生物学和代谢工程，可以在异源宿主中高效合成低产量的稀有大麻素，并探索新型衍生化合物的生物活性	NA	探讨大麻素的生物合成途径及其作为治疗剂的潜力	大麻素及其衍生物的生物合成和生物活性	NA	NA	合成生物学，代谢工程	NA	NA	NA
2190	2024-08-07	Novel synthetic biology approaches for developmental systems 2021-05-11, Stem cell reports IF:5.9Q2 DOI:10.1016/j.stemcr.2021.04.007 PMID:33979593	研究论文	本文探讨了合成生物学工具在研究和发展系统中的应用，特别是在干细胞器官模型、胚胎模式形成和非发育系统的模式形成与形态发生中的应用。	介绍了合成生物学工具在三个特定领域的应用，包括干细胞器官模型、用户定义的扰动研究胚胎模式形成以及使用合成遗传电路的非发育系统模式形成与形态发生模型。	NA	研究和发展系统中的自组织能力及其控制。	干细胞器官模型、胚胎模式形成、非发育系统的模式形成与形态发生。	合成生物学	NA	合成生物学工具	合成遗传电路	NA	NA
2191	2024-08-07	Microbial methionine transporters and biotechnological applications 2021-May, Applied microbiology and biotechnology IF:3.9Q2 DOI:10.1007/s00253-021-11307-w PMID:33929594	综述	本文综述了微生物甲硫氨酸转运蛋白的四个家族及其在生物技术应用中的研究进展	探讨了甲硫氨酸转运蛋白在发酵生产和合成生物学系统中的应用潜力	NA	总结甲硫氨酸转运蛋白的当前知识，并探讨其在生物技术和合成生物学中的应用	甲硫氨酸转运蛋白的四个家族及其功能、基因调控和生物技术应用	生物技术	NA	基因工程	NA	NA	NA
2192	2024-08-07	Developments in Nano-materials and Analysing its role in Fighting COVID-19 2021, Materials today. Proceedings DOI:10.1016/j.matpr.2021.05.020 PMID:33996513	研究论文	本文探讨了纳米材料在抗击新冠病毒中的应用及其发展，包括其在疫苗和抗病毒药物开发中的作用	介绍了纳米材料在制造特殊口罩、细菌捕捉技术和手消毒剂中的创新应用	NA	分析和讨论纳米材料在抗击和预防新冠病毒传播中的有效性	纳米材料，包括银、铁、陶瓷、石墨烯碳纳米管等	NA	新冠病毒	纳米材料	NA	NA	NA
2193	2024-08-07	Producing molecular biology reagents without purification 2021, PloS one IF:2.9Q1 DOI:10.1371/journal.pone.0252507 PMID:34061896	研究论文	本文介绍了一种简化方法，用于制备细胞性试剂，即通过低温干燥过度表达目标蛋白的细菌，以替代商业纯酶在典型诊断和分子生物学反应中的应用	开发了一种简化的细胞性试剂制备方法，仅需要常见的细菌培养箱和廉价的化学干燥剂，使得该技术更易于广泛访问和本地生产	NA	旨在简化细胞性试剂的制备过程，使其更易于本地生产和广泛应用	细胞性试剂的制备方法及其在分子和合成生物学过程中的应用	分子生物学	NA	PCR, qPCR, 反向转录, 等温扩增, Golden Gate DNA组装	NA	NA	在英国、喀麦隆和加纳等多个国家成功实施了该简化程序并制备了细胞性试剂
2194	2024-08-07	Further Biochemical Profiling of Hypholoma fasciculare Metabolome Reveals Its Chemogenetic Diversity 2021, Frontiers in bioengineering and biotechnology IF:4.3Q2 DOI:10.3389/fbioe.2021.567384 PMID:34109161	研究论文	本研究进一步分析了Hypholoma fasciculare的代谢组，揭示了其化学遗传多样性	利用现代真菌分子和合成生物学工具，探索蘑菇真菌作为新型治疗药物的潜力	NA	研究九种担子菌的次级代谢产物，筛选其生物和化学特性，并调查与其生产相关的遗传途径	九种担子菌的次级代谢产物及其生物和化学特性	NA	NA	基因组比较和色谱研究	NA	基因组数据	九种担子菌
2195	2024-08-07	Altering Compositional Properties of Viral Genomes to Design Live-Attenuated Vaccines 2021, Frontiers in microbiology IF:4.0Q2 DOI:10.3389/fmicb.2021.676582 PMID:34276608	研究论文	本文讨论了通过修改病毒基因组的组成特性来设计新型减毒活疫苗的不同方法	利用合成生物学技术和对病毒基因组组成特性的深入理解，探索了通过理性遗传设计实现病毒减毒的新策略	NA	开发新型减毒活疫苗	病毒基因组的组成特性	合成生物学	NA	合成生物学技术	NA	基因组	NA
2196	2024-08-07	Recent Advances in Heterologous Synthesis Paving Way for Future Green-Modular Bioindustries: A Review With Special Reference to Isoflavonoids 2021, Frontiers in bioengineering and biotechnology IF:4.3Q2 DOI:10.3389/fbioe.2021.673270 PMID:34277582	综述	本文综述了异源合成在促进未来绿色模块化生物工业中的最新进展，特别关注了异黄酮类化合物	随着代谢工程的进步和先进合成生物学工具的可用性，预计将很快设计出高度高效的异源宿主以满足不断增长的市场需求	目前的生产方法受限于缓慢的酶动力学和传统的繁琐遗传工程方法，需要进一步优化和发展以满足商业应用所需的滴定度、反应速率和产量	探讨异源合成在生物工业中的应用，特别是异黄酮类化合物的合成	异黄酮类化合物的生物合成途径及其在植物和动物中的应用	NA	NA	代谢工程	NA	NA	已鉴定出超过2,400种异黄酮类化合物，主要来自豆科植物
2197	2024-08-07	Bioelectronics communication: encoding yeast regulatory responses using nanostructured gallium nitride thin films 2018-Jun-21, Nanoscale IF:5.8Q1 DOI:10.1039/c8nr03684e PMID:29888776	研究论文	研究展示了如何利用纳米结构的氮化镓薄膜编码酿酒酵母的生理反应	首次展示了氮化镓纳米结构薄膜在酵母细胞生理反应编码中的应用	NA	探索氮化镓纳米结构薄膜在酵母细胞生理反应编码中的应用	酿酒酵母的生理反应	生物电子学	NA	光电流测量、原子力显微镜和开尔文探针力显微镜	NA	纳米结构薄膜	NA
2198	2024-08-07	Convenient synthesis and delivery of a megabase-scale designer accessory chromosome empower biosynthetic capacity 2024-Apr, Cell research IF:28.1Q1 DOI:10.1038/s41422-024-00934-3 PMID:38332200	研究论文	本文开发了一种基于CRISPR/Cas9介导的单倍体化方法，用于在酵母中高效组装和传递大型DNA，从而增强宿主的生物合成能力	开发了一种名为HAnDy的新方法，无需复杂的体外操作即可实现大型DNA的高效组装和传递	NA	开发一种新方法，用于在酵母中高效组装和传递大型DNA，以扩展和解读复杂的生物功能	设计了一个1.024 Mb的合成辅助染色体（synAC），编码542个外源基因，并将其传递到六种不同系统发育的酵母中	合成生物学	NA	CRISPR/Cas9	NA	DNA	六种不同系统发育的酵母
2199	2024-08-07	Design and assembly of the 117-kb Phaeodactylum tricornutum chloroplast genome 2024-Mar-29, Plant physiology IF:6.5Q1 DOI:10.1093/plphys/kiad670 PMID:38114089	研究论文	本文展示了两种高效克隆117 kb的Phaeodactylum tricornutum叶绿体基因组的方法	开发了两种新的叶绿体基因组克隆方法，效率高达90%至100%，并可稳定维持和传播于大肠杆菌中	方法可能仅适用于具有相似叶绿体基因组大小和结构的物种	开发新的叶绿体基因组克隆技术，以扩展合成生物学底盘的选择	Phaeodactylum tricornutum叶绿体基因组	合成生物学	NA	PCR扩增、酵母重组	NA	DNA	至少10个酵母菌落
2200	2024-08-07	GraphKM: machine and deep learning for KM prediction of wildtype and mutant enzymes 2024-Mar-28, BMC bioinformatics IF:2.9Q1 DOI:10.1186/s12859-024-05746-1 PMID:38549073	研究论文	本文提出了一种基于深度学习框架PaddlePaddle的机器和深度学习方法GraphKM，用于预测野生型和突变酶的Michaelis常数K	GraphKM结合了图神经网络（GNN）、全连接层和梯度提升框架，通过分子图和预训练的基于transformer的语言模型来表示底物和酶，以构建模型输入	现有的机器和深度学习模型仅限于特定酶，如少数酶或野生型酶	提高酶动力学研究的步伐，通过预测K值来替代耗时且困难的实验测量	野生型和突变酶的Michaelis常数K	机器学习	NA	深度学习	图神经网络（GNN）、全连接层、梯度提升框架	分子图、文本	独立K数据集HXKm