合成生物学相关文章
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当前共找到 3058 篇文献，本页显示第 2361 - 2380 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2361 | 2024-08-07 |
Functionalization of Bacterial Microcompartment Shell Proteins With Covalently Attached Heme
2019, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2019.00432
PMID:31993414
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研究论文 | 本研究利用细胞色素成熟系统I开发了一种简单方法，能够在目标蛋白质的主链中掺入血红素，特别是针对自组装的细菌微区室壳蛋白，并在蛋白质主链的多处位置插入功能性血红素 | 本研究报告了一种通用策略，用于从结构定义的蛋白质中生成电子传导细胞色素，并提供了关于血红素掺入如何与工程化蛋白质的天然组装特性相互作用的设计考虑 | 血红素结合的壳蛋白在形成更高阶壳体组装时，其大分子复合物的结构特征有时会改变 | 探索血红素在合成生物学和生物电子应用中的潜力，特别是通过在定义位置附着血红素以促进位置敏感过程如电子转移 | 细菌微区室壳蛋白及其血红素功能化 | 合成生物学 | NA | 细胞色素成熟系统I | NA | 蛋白质 | 多个位置的壳蛋白 |
| 2362 | 2024-08-07 |
Synthetic biology in the German press: how implications of metaphors shape representations of morality and responsibility
2018-Jun-24, Life sciences, society and policy
DOI:10.1186/s40504-018-0079-9
PMID:29936670
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研究论文 | 本文通过分析德国两家主要媒体在2000年至2010年间对合成生物学的隐喻表达，探讨了这些表达如何影响道德和责任的呈现 | 采用隐喻和共现分析的新颖组合，系统地考察了新闻报道中语言形象所固有的隐含道德意义 | NA | 旨在为合成生物学新闻报道的实证伦理分析做出贡献，并提供一种方法论，为科学和技术研究以及新技术伦理分析中关于负责任语言使用的文献增添内容 | 合成生物学在德国媒体的隐喻表达及其道德影响 | 生物技术 | NA | NA | NA | 文本 | 两家德国媒体（Die Frankfurter Allgemeine Zeitung 和 Der Spiegel）在2000年至2010年间的报道 |
| 2363 | 2024-08-07 |
Genome scale analysis of Escherichia coli with a comprehensive prokaryotic sequence-based biophysical model of translation initiation and elongation
2018-Apr-01, DNA research : an international journal for rapid publication of reports on genes and genomes
IF:3.9Q1
DOI:10.1093/dnares/dsx049
PMID:29161365
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研究论文 | 本研究首次提供了一个计算模拟的生物物理模型，该模型涵盖了翻译起始和延伸的所有方面，并专注于大肠杆菌基因 | 本研究首次提出了一个全面的生物物理模型，能够基于转录序列预测mRNA翻译动力学，并考虑了翻译的所有基本方面 | NA | 开发一个全面的生物物理模型，用于预测和量化翻译过程中的各种动态变化 | 大肠杆菌的基因翻译过程 | 分子生物学 | NA | 计算模拟 | 生物物理模型 | 序列数据 | NA |
| 2364 | 2024-08-07 |
RNA Thermometers for the PURExpress System
2018-01-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.7b00294
PMID:29271642
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研究论文 | 本文描述了在PURExpress体外蛋白合成系统中实现温度依赖性翻译的合成RNA温度计 | 设计了位于Shine-Dalgarno序列和感兴趣基因内互补序列之间的发夹结构，使得温度计在体外系统中保留其功能 | NA | 开发新的工具，利用温度作为体外基因调控的快速外部触发器 | 合成RNA温度计及其在PURExpress系统中的应用 | 合成生物学 | NA | NA | NA | RNA | NA |
| 2365 | 2024-08-07 |
Optimization-based synthesis of stochastic biocircuits with statistical specifications
2018-01, Journal of the Royal Society, Interface
DOI:10.1098/rsif.2017.0709
PMID:29321266
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研究论文 | 本文提出了一种计算框架，用于系统地指定内在噪声水平，并基于统计规范设计高度异质性的生物电路 | 使用描述性统计作为随机生物电路的直观规范语言，并开发了一种基于优化的计算工具，探索满足设计要求的参数配置 | NA | 增强随机生物电路的设计过程 | 随机生物电路的设计和优化 | 合成生物学 | NA | 优化方法 | 凸优化程序 | 统计数据 | NA |
| 2366 | 2024-08-07 |
Synthetic enhancer design by in silico compensatory evolution reveals flexibility and constraint in cis-regulation
2017-Nov-29, BMC systems biology
DOI:10.1186/s12918-017-0485-2
PMID:29187214
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研究论文 | 本文通过计算机模拟补偿进化设计合成增强子，揭示了顺式调控中的灵活性和约束 | 利用功能模型和计算机模拟补偿进化生成与自然增强子相似度不同的合成even-skipped stripe 2增强子，展示了增强子功能的多样性和复杂性 | 文章指出，尽管基因调控模型解释了大部分stripe 2增强子的功能，但表达偏离预测的情况表明可能存在未描述的因子调节表达 | 测试已知转录因子和它们之间的相互作用在多大程度上解释了果蝇even-skipped stripe 2增强子的活性 | 果蝇even-skipped stripe 2增强子的合成设计及其功能 | 合成生物学 | NA | 计算机模拟补偿进化 | 功能模型 | 序列数据 | 40个序列 |
| 2367 | 2024-08-07 |
Parallel DNA Synthesis on Poly(ethylene terephthalate)
2017-10-05, Chembiochem : a European journal of chemical biology
IF:2.6Q3
DOI:10.1002/cbic.201700321
PMID:28763573
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研究论文 | 本文描述了在氨基化处理的聚对苯二甲酸乙二醇酯（PET）薄片上直接制造DNA阵列的方法 | 使用氨基处理暴露PET薄片上的羟基，这些羟基可用于耦合磷酰胺和启动阵列合成，无需进一步的功能化步骤 | NA | 开发一种灵活且坚固的基质，以提高寡核苷酸合成的通量 | 在PET薄片上直接制造DNA阵列 | 合成生物学 | NA | DNA合成 | NA | NA | NA |
| 2368 | 2024-08-07 |
Identification of Novel Growth Regulators in Plant Populations Expressing Random Peptides
2017-Oct, Plant physiology
IF:6.5Q1
DOI:10.1104/pp.17.00577
PMID:28807931
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研究论文 | 本文描述了一种结合化学基因组学和合成生物学的方法，通过在大量植物群体中表达随机合成的小肽，筛选出影响植物生长、发育和代谢的新型生长调节因子 | 该研究首次在大量植物群体中合成并筛选出影响植物生物学多个方面的随机小肽，为农业领域引入新一代生长调节剂、除草剂或防御化合物提供了新工具 | 目前研究主要集中在筛选和描述新型小肽对植物生物学的影响，尚未深入探讨这些小肽如何整合到生物化学过程中 | 旨在通过化学基因组学方法识别影响植物生长、发育和代谢的新型小分子 | 在大量植物群体中表达的随机合成小肽 | 合成生物学 | NA | 化学基因组学 | NA | 肽序列 | 超过2000株植物 |
| 2369 | 2024-08-07 |
Block V RTX Domain of Adenylate Cyclase from Bordetella pertussis: A Conformationally Dynamic Scaffold for Protein Engineering Applications
2017-09-17, Toxins
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/toxins9090289
PMID:28926974
|
综述 | 本文综述了来自百日咳博德特菌的腺苷酸环化酶的Block V RTX肽域在钙结合时可逆折叠成β-卷曲二级结构，并探讨了其构象动态性质在蛋白质工程中的应用 | RTX肽域的构象动态性质被用作切换机制，以介导不同的蛋白质功能和蛋白质-蛋白质相互作用 | NA | 探讨RTX肽域的构象动态性质在蛋白质工程中的应用 | RTX肽域的构象动态性质及其在蛋白质工程中的应用 | 生物工程 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2370 | 2024-08-07 |
Bacterial cell-free expression technology to in vitro systems engineering and optimization
2017-Jun, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2017.07.004
PMID:29062966
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研究论文 | 本文介绍了细菌无细胞表达技术在体外系统工程和优化中的应用 | 本文提出了机器学习实验来优化无细胞蛋白合成系统的蛋白产量，并介绍了使用脂质体作为动态容器合成最小细胞的实验 | NA | 探索无细胞表达系统在生物工程项目中的应用，如无细胞代谢工程、实验的进化设计及合成最小细胞构建 | 无细胞蛋白合成系统及其在合成生物学中的应用 | 合成生物学 | NA | 无细胞蛋白合成系统 | 机器学习 | 蛋白 | NA |
| 2371 | 2024-08-07 |
Enzymatic N- and C-Protection in Cyanobactin RiPP Natural Products
2017-03-01, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.6b12872
PMID:28195477
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研究论文 | 本文利用一种新型双功能酶AgeMTPT保护线性肽的自由N端和C端，通过结合其他模块化生物合成酶，实现了天然产物aeruginosamide B的完全合成和线性蓝细菌肽天然产物的生物合成 | 使用新型双功能酶AgeMTPT保护线性肽的N端和C端，并结合其他生物合成酶进行天然产物的合成 | NA | 探索和定义肽天然产物生物合成的酶机制 | 蓝细菌肽天然产物及其生物合成机制 | 生物化学 | NA | 生物合成酶 | NA | 肽 | NA |
| 2372 | 2024-08-07 |
Availability: A Metric for Nucleic Acid Strand Displacement Systems
2017-01-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5b00231
PMID:26875531
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研究论文 | 本文介绍了一种用于量化核酸链置换系统中泄漏影响的指标——可用性和相互可用性 | 提出了可用性和相互可用性的概念，用于分析网络并减少泄漏 | 需要进一步验证这些概念在实际合成生物学应用中的效果 | 量化核酸链置换系统中二级结构对泄漏的影响 | 核酸链置换系统中的泄漏问题 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2373 | 2024-08-07 |
Enzyme engineering: A synthetic biology approach for more effective library generation and automated high-throughput screening
2017, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0171741
PMID:28178357
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研究论文 | 本文通过合成生物学方法，利用Golden Gate策略进行酶工程改造，生成更有效的生物催化剂库并进行自动化高通量筛选 | 本文展示了Golden Gate策略在酶工程中的优势应用，通过定向进化快速生成多样化的生物催化剂库 | NA | 开发一种有效的合成生物学方法，用于生成和筛选生物催化剂库 | Candida antarctica lipase A (Cal-A) 的酶工程改造 | 合成生物学 | NA | Golden Gate策略 | NA | DNA片段 | 三个不同的Candida antarctica lipase A基因片段 |
| 2374 | 2024-08-07 |
Challenges and Advances for Genetic Engineering of Non-model Bacteria and Uses in Consolidated Bioprocessing
2017, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2017.02060
PMID:29123506
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综述 | 本文综述了非模式细菌遗传工程的挑战与进展，以及在整合生物加工中的应用 | 近年来，合成生物学、分子遗传工具开发、组学数据技术应用和计算工具的发展为非模式宿主的系统开发提供了前所未有的进展 | 非模式微生物的遗传操作仍然具有挑战性，因为生物体特定的细微差别阻碍了通用的分子遗传工具和可翻译的细胞内生化途径及调控机制的知识 | 探讨非模式微生物遗传工程的挑战与进展，以及在整合生物加工中的应用 | 非模式微生物的遗传工程及其在生物加工中的应用 | 合成生物学 | NA | CRISPR, 基因组规模代谢模型 | NA | 基因组数据 | NA |
| 2375 | 2024-08-07 |
Novel directions in molecular systems design: The case of light-transducing synthetic cells
2017, Communicative & integrative biology
DOI:10.1080/19420889.2017.1365993
PMID:29260799
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comments | 本文评论了在构建光自养合成细胞方面的首个里程碑，展示了其合成生物学背景、未来步骤及可能实现该成就的实验方法 | 文章介绍了光自养合成细胞的研究进展，特别是光合反应中心在巨型脂质囊泡中的重建 | NA | 研究旨在构建能够从可用能源中产生自身生化能量的光自养合成细胞 | 光自养合成细胞及其在脂质囊泡中的光合反应中心重建 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2376 | 2024-08-07 |
Introduction to provocative questions in left-right asymmetry
2016-12-19, Philosophical transactions of the Royal Society of London. Series B, Biological sciences
DOI:10.1098/rstb.2015.0399
PMID:27821529
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研究论文 | 本文探讨了左右不对称现象的多个重要方面，涵盖细胞层面、生理学、遗传学、解剖学和进化生物学等多个领域 | 揭示了先前未被发现的多样性不对称机制，包括可能构成更普遍不对称发展基础的古老手性元素 | NA | 探讨左右不对称现象的机制及其在生物医学、发育、进化和合成生物学中的深远影响 | 从单细胞到无脊椎动物再到人类发育障碍的多种模型系统 | 发育生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2377 | 2024-08-07 |
Recent development on synthetic biological devices treating bladder cancer
2016-Dec, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2016.08.001
PMID:29062946
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综述 | 本文综述了合成生物学在膀胱癌治疗领域的最新进展 | 利用合成生物学工具，包括DNA、RNA和蛋白质生物部件，探索癌症研究中的多种问题，如机制阐明、诊断工具创新和治疗新方法的发明 | NA | 推动肿瘤合成生物学的基础研究成果向临床应用转化 | 合成生物学在膀胱癌治疗中的应用 | 生物技术 | 膀胱癌 | 合成生物学 | NA | NA | NA |
| 2378 | 2024-08-07 |
Synthetic biology in China, UK and US
2016-Dec, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2016.10.002
PMID:29062945
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2379 | 2024-08-07 |
The Saccharomyces cerevisiae pheromone-response is a metabolically active stationary phase for bio-production
2016-Dec, Metabolic engineering communications
IF:3.7Q2
DOI:10.1016/j.meteno.2016.05.001
PMID:29468120
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研究论文 | 研究了酵母菌的交配素反应作为生物生产代谢活跃静止期的潜力 | 首次探讨了交配素反应作为生物生产阶段的适宜性，并展示了其独特的代谢活性 | NA | 探索酵母菌交配素反应作为生物生产阶段的适宜性 | 酵母菌的交配素反应及其代谢特性 | 合成生物学 | NA | 转录组数据分析 | NA | 代谢物通量数据 | NA |
| 2380 | 2024-08-07 |
The cellular Ising model: a framework for phase transitions in multicellular environments
2016-06, Journal of the Royal Society, Interface
DOI:10.1098/rsif.2015.1092
PMID:27307510
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research paper | 本文基于Ising模型引入了一种基因调控网络，该网络能在多细胞环境中诱导相变，从而协调细胞群体的行为 | 设计了由所谓的切换开关与两个群体感应模块Las和Lux接口组成的构建块，展示了信号分子跨细胞膜运输速率变化时，细胞群体从个体切换表型到全局集体表型组织的自发对称性破缺 | NA | 探索多细胞系统中的相变现象及其在合成生物学领域的应用 | 基因调控网络在多细胞环境中的相变行为 | synthetic biology | NA | NA | Ising model | NA | NA |