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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 221 | 2026-05-01 |
LinkCraft: An interactive tool for the design of flexible linkers
2026-Apr-17, Journal of molecular biology
IF:4.7Q1
DOI:10.1016/j.jmb.2026.169814
PMID:42001978
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研究论文 | LinkCraft是一个用于设计多结构域蛋白质中柔性连接子的交互式计算工具 | 将连接子视为可调节的分子功能决定因素,支持基于理化性质的序列生成和系综建模评估 | 未明确讨论实验验证结果或与其他设计工具的性能比较 | 为多结构域蛋白质的柔性连接子提供理性设计工具 | 多结构域蛋白质中的固有结构无序连接子 | 合成生物学 | NA | 计算建模 | 系综模型 | 蛋白质序列 | NA | NA | NA | 多结构域蛋白质连接子设计 | 合成生物学, 生物技术 |
| 222 | 2026-05-01 |
PANoptosis as a drug discovery framework: integrating cell death architecture with clinical translation
2026-04, Genes and immunity
IF:5.0Q2
DOI:10.1038/s41435-026-00388-0
PMID:41776350
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综述 | 整合PANoptosis的分子架构与临床转化,提出以细胞死亡架构为基础的药物发现框架 | 首次提出PANoptosis作为药物发现框架,集成细胞死亡架构与临床试验转化,并引入临床极性与时序模型指导PANoptosis的诱导或抑制 | PANoptosis的分子机制尚未完全阐明,临床转换中组织特异性调控和长期安全性数据仍有限 | 综述PANoptosis的分子架构、调节机制及药物干预策略,推动其在感染、炎症、癌症和神经退行性疾病中的临床转化 | PANoptosis通路及其相关蛋白(ZBP1、AIM2、NLRP3、Pyrin、ASC、RIPK1、FADD、caspase-1/8、RIPK3-MLKL、gasdermins)和临床疾病模型 | 机器学 | 癌症,感染性疾病,炎症性疾病,神经退行性疾病 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医药 |
| 223 | 2026-05-01 |
Rewiring gene circuits to dissect oscillatory signaling dynamics
2026-01-05, Genes & development
IF:7.5Q1
DOI:10.1101/gad.353319.125
PMID:41162152
|
研究论文 | 利用合成生物学重构DELTA-NOTCH信号通路,研究分节时钟中细胞间振荡通讯的动态机制 | 首次通过合成生物学方法重建DELTA-NOTCH通路,并结合光遗传学验证配体呈现动态对细胞通讯的关键作用 | 结果主要基于小鼠PSM类器官模型,需进一步在体内验证 | 验证DELTA-NOTCH信号在分节时钟中耦合细胞间振荡的作用 | 小鼠前体节中胚层类器官中的DELTA缺陷细胞 | 合成生物学 | NA | 合成生物学构建、光遗传学激活 | NA | NA | NA | 合成DELTA-NOTCH通路 | 小鼠 | DELTA-NOTCH信号振荡回路 | 发育生物学 |
| 224 | 2026-05-01 |
Microbial response and resistance mechanisms against diverse anthropogenic pollutants
2026, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2026.1775529
PMID:42057789
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综述 | 本文综述了微生物对人类活动产生的多种污染物的响应和抗性机制 | 整合微生物天然抗性、实验室适应性进化及组学技术,揭示污染物特异性与生物特异性适应策略 | 群落水平多组学研究不足、真菌相关数据相对有限以及混合培养研究面临的挑战 | 增强对微生物响应与抵抗人为污染物机制的理解 | 细菌、微藻、真菌等微生物 | 机器学习 | NA | 基因组学、转录组学、蛋白质组学、代谢组学 | NA | NA | NA | NA | 细菌、微藻、真菌 | NA | 环境, 生物修复, 生物监测, 合成生物学 |
| 225 | 2026-05-01 |
Biosecurity in the age of synthetic nucleic acids: modernizing the law to manage emerging threats
2026 Jan-Jun, Journal of law and the biosciences
IF:2.5Q1
DOI:10.1093/jlb/lsag005
PMID:42058498
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综述 | 本文分析了合成核酸技术带来的生物安全挑战,并建议更新国际法以加强监管 | 提出结合具有约束力的国际义务与协调技术标准的跨国新治理方法来管理合成核酸风险 | 未提供实证研究或定量评估,主要基于法律和政策分析 | 评估当前生物安全框架对合成核酸的适用性并提出法律改革建议 | 合成核酸技术及相关的国际法律和监管框架 | NA | NA | 合成核酸技术 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 生物安全、法律 |
| 226 | 2026-05-01 |
Sticky enzymes: increased metabolic efficiency via substrate-dependent enzyme clustering
2024-Nov-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.11.05.622105
PMID:39574612
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研究论文 | 提出底物依赖性酶自聚集提高代谢效率的机制 | 揭示相分离酶可通过局部底物可用性调节‘粘性’实现近乎最优的聚类组织和间距,使代谢通量提升50-1000倍,毒性代谢物降低10-100倍 | 主要基于理论模型和数学模拟,缺乏体内实验验证 | 探索通过底物调控酶粘性实现代谢途径中酶的自组织优化策略 | 代谢途径中的相分离酶及底物系统 | 合成生物学, 代谢工程 | NA | NA | 数学模型 | NA | NA | NA | NA | 底物依赖性酶聚类系统 | 医学, 工业生物技术 |
| 227 | 2026-05-01 |
Decoding biology with massively parallel reporter assays and machine learning
2024-10-16, Genes & development
IF:7.5Q1
DOI:10.1101/gad.351800.124
PMID:39362779
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综述 | 本文综述了大规模并行报告基因检测与机器学习在解码生物学中的应用 | 结合大规模并行报告基因检测和机器学习,系统解析调控基因表达的顺式调控密码 | 未详细讨论方法的计算复杂度和实验验证挑战 | 通过MPRA和机器学习量化序列变异对基因表达的影响,并预测新序列功能 | 顺式调控元件、基因表达调控机制 | 机器学习 | NA | 大规模并行报告基因检测、高通量测序 | 机器学习模型 | 序列数据 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学、mRNA和基因治疗 |
| 228 | 2026-05-01 |
Artificial Diploid Escherichia coli by a CRISPR Chromosome-Doubling Technique
2023-03, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202205855
PMID:36642845
|
研究论文 | 利用CRISPR染色体加倍技术构建人工二倍体大肠杆菌细胞 | 首次通过CRISPR技术构建稳定的人工二倍体大肠杆菌单细胞,并验证其特性 | 二倍体大肠杆菌生长显著减慢,且仅限于细菌中应用 | 探索合成生物学中人工多倍体细胞构建方法及其基础生命科学问题 | 大肠杆菌 | 合成生物学 | NA | CRISPR、流式细胞术、定量PCR、荧光原位杂交、第三代基因组测序 | NA | 基因组序列、细胞图像 | 多个大肠杆菌菌株样本 | CRISPR-Cas9 | 大肠杆菌 | 染色体加倍电路 | 基础生命科学、工业生物技术 |
| 229 | 2026-04-30 |
A Combinatorial Strategy of Semirational Screening and Rational Design for Engineering an α-1,2-Fucosyltransferase toward Efficient 2'-Fucosyllactose Biosynthesis
2026-Apr-29, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.6c00566
PMID:41983305
|
研究论文 | 通过半理性筛选和理性设计组合策略工程化α-1,2-岩藻糖基转移酶,实现高效无副产物的2'-岩藻糖基乳糖生物合成 | 结合理性计算设计(结构、进化和稳定性预测)与半理性筛选(基于L-岩藻糖响应生物传感器),首次获得五重突变体M5,实现了124.25 g/L的2'-FL产量且无副产物DFL | 未明确讨论该策略对其他岩藻糖基转移酶或不同底物的普适性,也未评估长期工业生产的稳定性 | 开发无副产物的高效2'-FL微生物合成平台 | α-1,2-岩藻糖基转移酶BKHT及其突变体 | 合成生物学 | NA | 定点饱和突变、理性计算设计、生物传感器筛选 | NA | NA | NA | NA | 大肠杆菌 | L-岩藻糖响应生物传感器(FcsR-P) | 工业生物技术、食品 |
| 230 | 2026-04-30 |
Biological Detoxification of Gossypol: Enzymatic Mechanisms, System Engineering, and Prospects for Green Valorization
2026-Apr-29, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.5c17645
PMID:41989489
|
综述 | 本文综述了棉酚的生物解毒机制,包括酶学原理、系统工程策略以及绿色高值化利用的前景 | 将棉酚活性酶分为四个功能模块(官能团修饰、芳环裂解、增溶缀合和自由基介导环化),并提出产物解析验证方法以明确定义解毒终点 | 现有解毒方法主要依据总棉酚减少而非产物解析证据,缺乏解毒转化的明确验证 | 系统阐述棉酚的生物解毒机制,并提出绿色高值化利用的策略 | 棉酚及其解毒酶与微生物系统 | NA | NA | 酶工程, 多酶级联, 人工智能辅助酶/通路挖掘, 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 微生物 | 解毒代谢通路(包括棉酚活性酶的功能模块) | 农业, 食品, 工业生物技术 |
| 231 | 2026-04-30 |
Biosynthesized Silk-Amyloid-Mussel Proteins as Dissolution Recyclable Materials With Tunable Supercontraction
2026-Apr-29, Advanced materials (Deerfield Beach, Fla.)
DOI:10.1002/adma.73200
PMID:42051062
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研究论文 | 利用蛋白质工程和合成生物学设计丝绸-淀粉样蛋白-贻贝杂合蛋白,制备可溶解回收的高性能蛋白基材料 | 通过合理平衡非晶域与结晶域的相互作用,实现高强度、韧性、低超收缩及完全可回收性的蛋白基材料设计 | NA | 开发可溶解回收、高性能且可持续的蛋白基材料 | 丝绸-淀粉样蛋白-贻贝(SAM)杂合蛋白及其纤维和水凝胶 | 材料科学 | NA | 蛋白质工程、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 材料科学、可持续材料 |
| 232 | 2026-04-30 |
Chemical and synthetic biology tools to interrogate and control cell-cell interactions in vivo
2026-Apr-27, Current opinion in chemical biology
IF:6.9Q1
DOI:10.1016/j.cbpa.2026.102688
PMID:42048798
|
综述 | 本篇综述讨论了利用化学和合成生物学工具在体内探究和控制细胞-细胞相互作用的最新进展 | 专注于体内研究进展,强调在天然环境中保持细胞动态、组织结构和环境线索,从而揭示复杂生物系统中细胞相互作用的通用原理 | NA | 探讨用于研究和控制体内细胞间相互作用的化学与合成生物学工具的发展与应用 | 细胞-细胞相互作用、蛋白质介导的通讯 | 合成生物学 | NA | 化学工具、合成生物学工具 | NA | NA | NA | NA | 多细胞生物(体内) | NA | 基础生物学研究 |
| 233 | 2026-04-30 |
Tailored base editing toolkits for functional genomics and metabolic engineering in the halophile Salinivibrio
2026-Apr-22, Journal of biotechnology
IF:4.1Q2
DOI:10.1016/j.jbiotec.2026.04.012
PMID:42031218
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研究论文 | 在嗜盐菌Salinivibrio中开发了高效的碱基编辑平台,并应用于功能基因组学和代谢工程 | 首次在非模式嗜盐菌Salinivibrio中建立腺嘌呤和胞嘧啶碱基编辑器,并开发了新型融合蛋白PmCDA-TadA8e-nCas9-UGI实现双碱基同时编辑 | 未提及 | 开发高效的碱基编辑工具以推动嗜盐菌的合成生物学和工业应用 | 嗜盐菌Salinivibrio sp. TGB4 | 合成生物学 | NA | 碱基编辑 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | Salinivibrio sp. TGB4 | 碱基编辑器(ABE、CBE、双碱基编辑器)和代谢通路(乙酸代谢及聚3-羟基丁酸生物合成) | 工业生物技术 |
| 234 | 2026-04-30 |
Co-Immobilization of SpyTag-Cyclized Enzymes on a γPFD-SpyCatcher Hydrogel to Address Broad Specificity
2026-Apr-21, Gels (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/gels12040348
PMID:42042186
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研究论文 | 开发了一种基于自组装γPFD-SpyCatcher水凝胶的可编程蛋白质支架,用于体内共固定SpyTag环化级联酶,以解决酶广底物特异性导致的副反应和产量降低问题 | 通过SpyTag环化酶与γPFD-SpyCatcher水凝胶的共固定策略,实现级联酶的空间有序组织,显著提高产物产量 | 未明确提及,但可能包括体内支架稳定性或适用酶类型的限制 | 解决工程代谢途径中酶广底物特异性导致的副反应和产量降低问题 | SpyTag环化酶和γPFD-SpyCatcher水凝胶空间组织方法 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | SpyTag/SpyCatcher系统 | 工程微生物(未具体说明,可能是大肠杆菌或酵母) | 基于γPFD-SpyCatcher水凝胶的级联酶共固定支架 | 合成生物学, 工业生物技术 |
| 235 | 2026-04-30 |
Beyond tiny aquatic plants: how duckweeds serve the world as revolutionary crops for alleviating resource and energy crises
2026-Apr-21, Food chemistry
IF:8.5Q1
DOI:10.1016/j.foodchem.2026.149330
PMID:42048806
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综述 | 综述浮萍作为革命性作物在缓解资源和能源危机中的作用 | 系统阐述了浮萍在替代蛋白、可持续生物燃料、合成生物学底盘和太空生命支持系统等多领域的应用潜力,并通过生命周期和技术经济评估验证其环境与经济可行性 | 未明确讨论浮萍大规模商业化生产中的具体挑战或潜在风险 | 全面评估浮萍作为革命性作物在缓解资源和能源危机方面的潜力 | 浮萍(水生植物) | 合成生物学 | NA | 生命周期评估、技术经济评估 | NA | 文本 | NA | 合成生物学底盘 | 浮萍 | NA | 农业, 能源, 环境, 工业生物技术 |
| 236 | 2026-04-30 |
Metabolic Engineering of Rhodotorula toruloides for Biosynthesis of Retinal
2026-Apr-02, Journal of fungi (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/jof12040258
PMID:42042353
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研究论文 | 通过代谢工程改造圆红冬孢酵母NP11以生产视黄醛 | 首次在圆红冬孢酵母中引入并优化多种来源的β-胡萝卜素15,15'-双加氧酶基因,并结合多基因过表达和发酵条件优化,实现了视黄醛的高效生物合成 | 未进行详细的代谢流分析或基因调控网络优化,产量仍有提升空间 | 实现视黄醛的微生物合成,为萜类化合物的生物制造提供细胞工厂 | 圆红冬孢酵母NP11 | 合成生物学 | NA | 代谢工程, 发酵优化 | NA | 浓度数据 | 工程菌株Rt13及多种基因改造菌株 | NA | 圆红冬孢酵母 | 视黄醛合成途径:包含β-胡萝卜素15,15'-双加氧酶基因以及IDI1、BTS1、CARRP、CARB过表达 | 医药, 食品, 化妆品 |
| 237 | 2026-04-30 |
Functional Diversity of Probiotic Effector Molecules: Insights into Their Role in Improving Gut Health
2026-Apr, Annual review of food science and technology
IF:10.6Q1
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综述 | 本文综述了益生菌效应分子的功能多样性及其在改善肠道健康中的作用 | 系统总结了益生菌效应分子的主要类别和作用机制,并提出了高通量鉴定和合成生物学等新兴方法在解锁其治疗潜力方面的应用 | 益生菌效应分子的高通量鉴定和体内验证及有效剂量确定仍面临挑战 | 阐明益生菌效应分子的多样性及其功能,以促进靶向益生菌疗法和功能性食品的设计 | 益生菌效应分子,包括细菌多糖聚合物、表面蛋白、分泌肽和酶、细胞外囊泡及小分子代谢物 | 肠道微生物组与益生菌研究 | 肠道健康相关疾病 | 比较基因组学、合成生物学 | NA | NA | NA | 合成生物学 | 益生菌 | NA | 医学、食品 |
| 238 | 2026-04-30 |
Synthetic Biology Approaches in Reducing Mycotoxin Contamination and Enhancing Food System Sustainability
2026-Apr, Annual review of food science and technology
IF:10.6Q1
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综述 | 综述合成生物学在减少真菌毒素污染和增强食品系统可持续性方面的应用 | 整合人工智能与多组学技术开发识别元件、抗菌剂和降解酶,并强调CRISPR多重编辑和微生物细胞工厂等新兴技术 | NA | 探讨合成生物学在真菌毒素控制和食品副产物可持续利用中的解决方案 | 产毒真菌、真菌毒素、食品及加工副产物 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 微生物细胞 | 微生物细胞工厂、生物传感器 | 农业, 食品, 环境 |
| 239 | 2026-04-30 |
Radiation-Responsive Promoters: Molecular Mechanisms, Screening Strategies, and Translational Applications as Radiation Biomarkers
2026-Mar-26, Current issues in molecular biology
IF:2.8Q3
DOI:10.3390/cimb48040348
PMID:42042008
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综述 | 系统分析了辐射响应启动子的分子机制、筛选策略及其作为辐射生物标志物的转化应用 | 首次将辐射响应启动子分为五大类并系统比较其调控逻辑、剂量响应特征及临床部署证据,提出了区分生物标志物导向与工具导向的报告基因系统的双轨框架 | 缺乏临床级验证、标准化剂量响应曲线缺失、可重复性不足 | 系统梳理辐射响应启动子的分子机制与筛选策略,评估其在辐射生物标志物开发中的转化潜力 | 辐射响应启动子 | 数字病理学 | NA | 功能基因组学与转录组学、表观遗传修饰分析、合成生物学启动子工程 | NA | 文本 | NA | 合成生物学启动子工程 | NA | 辐射响应启动子回路 | 医学 |
| 240 | 2026-04-30 |
Minor groove tetrads: a potent and versatile capping interaction for i-motif structures
2026-Feb, Biophysical reviews
IF:4.9Q1
DOI:10.1007/s12551-026-01406-1
PMID:41909615
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review | 综述了小沟四联体(MGTs)作为i-motif结构封盖相互作用的强效多功能机制 | 揭示了MGT能稳定i-motif结构,使其在中性pH下折叠,并仅用两个C:C⁺对形成紧凑构型,同时可逆pH响应且不扭曲B-DNA几何结构 | 尚未提供体内应用的长期稳定性数据或在复杂生物环境中的直接验证 | 探索小沟四联体在i-motif工程中的稳定机制及其在纳米技术和合成生物学中的应用潜力 | 小沟四联体与i-motif DNA结构的相互作用 | 合成生物学 | NA | 荧光光谱、化学修饰(2'-氟取代、荧光胞苷类似物) | NA | NA | NA | NA | NA | i-motif纳米结构(含MGT封盖) | 生物传感, 纳米技术, 合成生物学 |