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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 221 | 2025-11-23 |
Site-Specific OaAEP1 Mediated Functional Proteins Immobilization on Magnetic Nanoparticles and the Recyclings
2025-Nov-21, Chemistry (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/chem.202502540
PMID:41273006
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研究论文 | 开发基于OaAEP1肽连接酶的位点特异性蛋白质固定策略,实现功能蛋白在磁性纳米颗粒上的可控定向固定与循环利用 | 利用OaAEP1酶催化N端GL与C端NGL基序的特异性连接,实现蛋白质在纳米颗粒表面的定向固定和高效率固定 | NA | 开发精确稳定的蛋白质固定方法以推动生物催化、生物传感和合成生物学应用 | 荧光蛋白和催化活性酶(TEV蛋白酶和Taq聚合酶)在FeO和FeO@SiO磁性纳米颗粒上的固定 | 合成生物学 | NA | OaAEP1介导的肽连接技术 | NA | NA | NA | OaAEP1 | NA | 蛋白质-纳米颗粒功能界面构建 | 生物催化,生物传感,纳米生物技术,蛋白质工程 |
| 222 | 2025-11-23 |
Potential biosafety risks of synthetic biology microorganism leakage in industry settings to drinking water: A review
2025-Nov-05, Journal of hazardous materials
IF:12.2Q1
DOI:10.1016/j.jhazmat.2025.140169
PMID:41110321
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综述 | 综述工业环境中合成生物学微生物泄漏对饮用水生物安全的潜在风险 | 首次系统分析工业用合成生物学微生物通过废水排放进入自然水体后,其增强的消毒剂抗性及在饮用水系统中利用有限碳源生产生物产物的双重风险 | 未提出具体的监管框架或量化风险评估模型 | 探讨合成生物学微生物在工业应用中的生物安全风险及其对饮用水安全的影响 | 合成生物学微生物(SynBioMs)及其在工业环境中的泄漏途径 | 合成生物学 | NA | 膜工程、应激反应工程、转录因子工程 | NA | 文献资料 | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | 大肠杆菌, 酿酒酵母, 枯草芽孢杆菌 | 营养缺陷型设计、遗传回路 | 工业生物技术, 环境 |
| 223 | 2025-11-23 |
Next-generation perspectives on microbially synthesized siderophores: molecular engineering, multi-omics insights, and applications for smart climate-resilient crops
2025-Oct-16, World journal of microbiology & biotechnology
IF:4.0Q2
DOI:10.1007/s11274-025-04575-5
PMID:41099996
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综述 | 本文综述微生物合成铁载体的生物合成、调控机制及其在智能气候韧性作物中的应用前景 | 整合合成生物学与多组学技术揭示铁载体合成调控网络,开发纳米制剂和智能递送系统增强田间应用效果 | NA | 探讨微生物铁载体在可持续农业中的分子机制与应用策略 | 微生物铁载体及其合成基因簇,植物根际促生菌(PGPR) | 合成生物学 | NA | 多组学(基因组学、转录组学、蛋白质组学、代谢组学),CRISPR/Cas基因组编辑 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 植物根际促生菌(PGPR) | 铁载体生物合成基因簇 | 农业 |
| 224 | 2025-11-23 |
Application progress and biosafety challenges of gene editing and synthetic biotechnology in diagnosis, treatment and prevention of infectious diseases
2025-Oct, Biosafety and health
IF:3.5Q1
DOI:10.1016/j.bsheal.2025.09.002
PMID:41262458
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综述 | 本文系统综述了基因编辑和合成生物技术在传染病防治中的应用进展与生物安全挑战 | 系统分析了2015-2025年间CRISPR诊断技术、合成疫苗和工程益生菌在传染病防治中的最新应用,并首次全面评估其生物安全风险 | 基于文献综述,缺乏原始实验数据验证;主要关注技术层面,社会接受度和经济可行性分析不足 | 评估合成生物技术在传染病诊断、治疗和预防中的应用进展及相关的生物安全挑战 | CRISPR诊断系统、合成疫苗平台和工程益生菌等合成生物技术产品 | 合成生物学 | 传染病 | CRISPR/Cas系统(DETECTR、SHERLOCK)、mRNA疫苗技术、病毒载体疫苗技术、工程益生菌技术 | NA | 文献数据 | NA | CRISPR-Cas9, Cas12a, Cas13a | 工程益生菌 | 病原体检测生物传感器、免疫调节回路 | 医学 |
| 225 | 2025-11-23 |
Beyond evolution: De novo designed protein toolkit rewriting the rules of synthetic biology
2025-Oct, Biosafety and health
IF:3.5Q1
DOI:10.1016/j.bsheal.2025.09.004
PMID:41262455
|
综述 | 本文探讨人工智能驱动的蛋白质设计如何通过超越进化约束的全新蛋白质工具包革新合成生物学 | 提出超越已知结构模板和进化约束的全新蛋白质设计范式,建立从蛋白质设计到系统级实施的层次化框架 | 新型蛋白质在细胞系统中表达存在功能不可预测性,需要更完善的风险评估体系 | 系统分析AI驱动蛋白质设计的计算框架及其在合成生物学中的应用前景 | 从头设计的蛋白质工具包及其在合成生物学系统中的应用 | 合成生物学 | NA | 人工智能蛋白质设计、多组学分析 | NA | NA | NA | NA | NA | 结构导向的理性基因电路设计 | 工业生物技术 |
| 226 | 2025-11-22 |
Virus-like particles as versatile scaffolds for nanobiosensors and nanoreactors: Design, applications, and future perspectives
2026-Feb-01, Biosensors & bioelectronics
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.bios.2025.118156
PMID:41172906
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综述 | 系统探讨病毒样颗粒作为纳米支架在纳米生物传感器和纳米反应器中的设计、应用及未来发展方向 | 提出将人工智能、先进材料和刺激响应设计整合以开发下一代智能纳米器件 | 在可扩展性、功能精确性和体内兼容性方面仍存在挑战 | 研究病毒样颗粒在纳米生物传感器和纳米反应器中的应用潜力 | 病毒样颗粒的结构与理化特性 | NA | NA | 光学传感(荧光、化学发光、表面等离子共振)、电化学传感(伏安法、电位法、阻抗法)、场效应系统 | NA | NA | NA | NA | NA | 多酶途径空间组织、级联反应 | 医学诊断、治疗、可持续催化、生物催化、合成生物学 |
| 227 | 2025-11-22 |
Dissecting native plasmid functions in Lactococcus lactis: Synergistic regulation of metabolism and industrially relevant traits
2025-Dec, Journal of dairy science
IF:3.7Q2
DOI:10.3168/jds.2025-27053
PMID:41130394
|
研究论文 | 本研究解析了乳酸乳球菌C20中3个天然质粒的功能及其对代谢和工业性状的协同调控作用 | 首次系统揭示了乳酸乳球菌C20中天然质粒的协同调控网络及其对工业性状的关键影响 | 研究仅针对C20菌株的3个质粒,未在其他乳酸乳球菌菌株中验证普适性 | 阐明乳酸乳球菌天然质粒的生物学功能及其在工业应用中的潜力 | 乳酸乳球菌C20菌株及其3个天然质粒(pLL1, pLL2, pLL3) | 合成生物学 | NA | 基因组分析、组合消除、功能表征 | NA | 基因组数据、代谢数据 | 乳酸乳球菌C20菌株及其质粒变异株 | 基因编辑、合成生物学 | 乳酸乳球菌 | 天然质粒调控网络 | 食品,制药,工业生物技术 |
| 228 | 2025-11-22 |
CTRL Enables Gene-Specific RNA Regulation Using CRISPR-Cas7-11
2025-Nov-21, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00658
PMID:41202215
|
研究论文 | 开发了一种基于CRISPR-Cas7-11的新型基因调控工具CTRL,用于实现基因特异性RNA调控 | 利用新发现的CRISPR-Cas7-11效应子的直接重复序列处理活性,首次开发出能够位点特异性靶向合成mRNA分子的基因调控工具 | NA | 开发精确的基因表达调控技术,用于生物和生化网络的全面研究 | 合成mRNA分子和基因表达调控 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas7-11基因编辑技术 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas7-11 | NA | 基因表达调控系统 | 医学,工业生物技术 |
| 229 | 2025-11-22 |
Harnessing Fungal Secretion Systems for Precision Fermentation of Food Proteins
2025-Nov-21, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00521
PMID:41220338
|
观点文章 | 探讨利用真菌分泌系统提高精密发酵生产食品蛋白质效率的策略 | 提出通过数据驱动的分泌途径工程化改造来提高蛋白质分泌效率的创新方法 | NA | 提高精密发酵生产食品蛋白质的商业可行性和规模化生产能力 | 真菌分泌系统和食品蛋白质生产 | 合成生物学 | NA | 蛋白质分泌技术 | NA | NA | NA | 合成生物学, 蛋白质工程 | 酵母, 丝状真菌 | 蛋白质分泌途径 | 食品, 工业生物技术 |
| 230 | 2025-11-22 |
Advanced Large DNA Manipulation Technologies for Constructing Microbial Cell Factories
2025-Nov-21, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00539
PMID:41105858
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综述 | 系统总结大片段DNA操作技术的核心原理与最新进展及其在构建微生物细胞工厂中的应用 | 首次系统归纳四类大片段DNA操作技术,并阐述其在获取复杂生物合成基因簇、构建多基因生物合成途径等领域的创新应用 | NA | 推动大片段DNA操作技术发展并扩展其在构建高性能微生物细胞工厂中的应用 | 大片段DNA操作技术及其在微生物细胞工厂构建中的应用 | 合成生物学 | NA | 大片段DNA克隆、组装、递送和重排技术 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick | 微生物细胞 | 多基因生物合成途径、复杂遗传模块、代谢网络结构重连与模块化重建 | 工业生物技术 |
| 231 | 2025-11-22 |
Application of Rational and Irrational Strategies in the Construction of Prokaryotic Cell Factories for the Bioproduction of Aromatic Amino Acid-Derived Chemicals
2025-Nov-21, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00711
PMID:41137187
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综述 | 总结原核细胞工厂生产芳香族氨基酸衍生化学品的挑战、构建策略及最新技术 | 重点关注理性与非理性策略在原核细胞工厂构建中的应用,并探讨未来发展方向 | NA | 改进芳香族氨基酸衍生化学品的发酵生产工艺 | 原核细胞工厂 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、合成生物学 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, 代谢工程工具 | 原核生物 | 芳香族氨基酸生物合成途径 | 工业生物技术, 医药 |
| 232 | 2025-11-22 |
An efficient system for plastid transformation in an edible medicinal herb
2025-Nov-20, Transgenic research
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s11248-025-00469-2
PMID:41266676
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研究论文 | 本文开发了一种针对药用植物龙葵的高效质体转化系统 | 首次为茄科重要药用植物龙葵建立了稳定可靠的质体转化体系,突破了质体转化技术主要局限于烟草等少数植物的限制 | NA | 开发适用于龙葵的质体转化技术,拓展质体工程在药用植物研究中的应用 | 龙葵(Solanum nigrum)植物叶片外植体 | 合成生物学 | NA | 质体转化、基因枪轰击、PCR、Southern印迹、共聚焦激光扫描显微镜 | NA | 分子生物学数据、荧光成像数据 | NA | 基因枪 | 龙葵 | 质体转化载体,包含壮观霉素抗性基因(aadA)和绿色荧光蛋白报告基因(gfp),整合于trnfM和trnG基因之间 | 医药、农业 |
| 233 | 2025-11-22 |
Enhancing Escherichia coli production of material proteins using circular mRNAs
2025-Nov-19, Applied and environmental microbiology
IF:3.9Q2
DOI:10.1128/aem.01579-25
PMID:41055377
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研究论文 | 本研究开发了一种环状mRNA表达系统,用于提高大肠杆菌中材料蛋白的产量 | 利用自切割核酶构建环状mRNA结构,结合绝缘RNA环提高蛋白翻译效率,显著增强重复序列蛋白的表达稳定性 | NA | 解决高分子量重复序列蛋白在微生物宿主中表达不稳定和产量低的问题 | 材料蛋白(包括蛛丝蛋白、肌联蛋白重复序列、贻贝足蛋白寡聚体和丝蛋白-淀粉样重复序列) | 合成生物学 | NA | 环状mRNA技术,逆转录DNA扩增测序 | NA | 蛋白质表达数据,质粒稳定性数据 | 多种材料蛋白(包括96-mer重复的牵引丝蛋白等) | 自切割核酶,绝缘RNA环 | 大肠杆菌 | 环状mRNA表达系统 | 工业生物技术,材料 |
| 234 | 2025-11-22 |
Illuminating the dark majority: photobiology of nonphotosynthetic bacteria
2025-Nov, Photochemical & photobiological sciences : Official journal of the European Photochemistry Association and the European Society for Photobiology
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s43630-025-00789-6
PMID:41114917
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综述 | 综述非光合细菌的光生物学研究,揭示其通过光感受器介导的膜电位调节、应激反应和趋光性等生理过程 | 首次系统阐述非光合细菌利用光作为环境信号的分子机制,打破传统认为光仅与光合作用相关的认知局限 | 主要基于现有研究综述,缺乏原始实验数据支持 | 阐明非光合细菌的光感应机制及其生物学意义 | 非光合细菌及其光感受器系统 | 微生物学 | NA | NA | NA | 文献数据 | NA | NA | NA | NA | 抗菌治疗, 合成生物学, 环境生物技术 |
| 235 | 2025-11-22 |
A modular high-throughput approach for advancing synthetic biology in the chloroplast of Chlamydomonas
2025-Nov, Nature plants
IF:15.8Q1
DOI:10.1038/s41477-025-02126-2
PMID:41184475
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研究论文 | 本研究建立了莱茵衣藻作为叶绿体合成生物学的原型平台,开发了高通量自动化工作流程和标准化遗传元件 | 建立了首个叶绿体合成生物学高通量原型平台,开发了自动化工作流程可并行处理数千个转基因株系,并扩展了选择标记和调控元件的工具箱 | 研究主要基于模式生物莱茵衣藻,在高等植物中的直接应用仍需进一步验证 | 推进叶绿体合成生物学发展,克服叶绿体工程中遗传工具稀缺和通量低的限制 | 莱茵衣藻叶绿体 | 合成生物学 | NA | 分子克隆、自动化工作流程、转基因技术 | NA | 生物分子数据、表型数据 | 数千个转基因株系,140多个调控元件 | Gibson Assembly, 分子克隆标准 | Chlamydomonas reinhardtii(莱茵衣藻) | 合成光呼吸途径、启动子设计库、调控元件 | 农业, 能源, 环境 |
| 236 | 2025-11-22 |
SpatialPPIv2: Enhancing protein-protein interaction prediction through graph neural networks with protein language models
2025, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2025.01.022
PMID:41255828
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研究论文 | 提出了一种基于图神经网络和蛋白质语言模型的蛋白质-蛋白质相互作用预测方法SpatialPPIv2 | 不再依赖蛋白质结构预测算法,能够独立预测蛋白质相互作用,结合大型语言模型和图注意力网络 | NA | 提高蛋白质-蛋白质相互作用预测的特异性和鲁棒性 | 蛋白质-蛋白质相互作用 | 生物信息学 | NA | 图神经网络,蛋白质语言模型 | 图注意力网络 | 蛋白质序列和结构数据 | PINDER数据集(包含RCSB PDB和AlphaFold数据库的相互作用数据) | NA | NA | NA | 药物发现,合成生物学 |
| 237 | 2025-11-21 |
Engineering heterologous core promoters to optimize the SES expression system for Pichia pastoris
2026-Mar, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2025.10.005
PMID:41245009
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研究论文 | 通过工程化异源核心启动子优化毕赤酵母SES表达系统 | 首次从解脂耶氏酵母中筛选214个候选启动子,成功构建41个性能提升达5.4倍的SES系统,并结合CRISPR/Cas9多拷贝整合策略 | 未在更广泛的工业应用场景中验证系统稳定性 | 优化毕赤酵母合成表达系统(SES)的转录调控能力 | 毕赤酵母表达系统及其异源核心启动子 | 合成生物学 | NA | RNA-seq, CRISPR/Cas9, 荧光筛选 | NA | 基因表达数据, 荧光强度数据 | 214个合成启动子,54个功能验证,41个性能提升系统 | CRISPR-Cas9, Gibson Assembly | 毕赤酵母 | 合成表达系统(SES), 核心启动子工程 | 工业生物技术, 医药 |
| 238 | 2025-11-21 |
Gene expression and protein abundance: Just how associated are these molecular traits?
2026 Jan-Feb, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108720
PMID:41038299
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综述 | 本文综述了基因表达与蛋白质丰度之间关系的研究进展,重点关注不同实验环境和细胞背景下两者的关联性 | 系统分类和比较了基于不同相关性度量方法的研究,并整合了单细胞分析等最新技术进展 | 主要依赖相关性分析,对因果关系的解释有限 | 探讨基因表达与蛋白质丰度之间的关联程度及其在生物技术中的应用潜力 | 基因表达与蛋白质丰度的关系研究 | 合成生物学 | NA | 转录组学、蛋白质组学、单细胞分析 | 统计模型、机制模型、机器学习、深度学习 | 组学数据 | NA | NA | NA | NA | 生物技术、代谢工程、合成生物学 |
| 239 | 2025-11-21 |
Precise control of transcriptional stoichiometry in bacteria: From mechanisms to synthetic biology applications
2026 Jan-Feb, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108748
PMID:41187847
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综述 | 探讨细菌通过RNA水平机制精确控制蛋白质亚基化学计量比及其在合成生物学中的应用 | 超越经典转录调控,聚焦转录后精细调控机制,并展示如何将这些天然策略转化为可编程的合成基因电路设计 | NA | 解析细菌控制转录化学计量比的机制并开发合成生物学应用工具 | 细菌转录调控机制和合成基因电路 | 合成生物学 | NA | RNA水平调控分析、合成基因电路设计 | NA | NA | NA | 启动子文库、工程化终止子、RNase处理模块 | 细菌 | 合成基因电路、代谢途径工程、蛋白质组装系统 | 生物技术、生物医学 |
| 240 | 2025-11-21 |
Synthetic biology for scalable production of medical polyhydroxyalkanoates: Advances and applications
2026 Jan-Feb, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108722
PMID:41046988
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综述 | 本文综述了合成生物学在医用聚羟基脂肪酸酯规模化生产中的进展与应用 | 系统整合了CRISPR/Cas基因组编辑、启动子工程、核糖体结合位点优化等合成生物学技术,并引入嗜盐菌下一代工业生物技术提升生产经济性 | 未提供具体实验数据验证技术改进效果,主要基于现有研究进展的总结分析 | 探讨合成生物学技术促进医用聚羟基脂肪酸酯规模化生产的进展与前景 | 聚羟基脂肪酸酯及其生产工艺 | 合成生物学 | NA | CRISPR/Cas基因组编辑, 启动子工程, 核糖体结合位点优化, 代谢通路优化, 形态工程 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 嗜盐菌 | 代谢通路优化 | 医药, 工业生物技术 |