合成生物学相关文章
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当前共找到 3041 篇文献，本页显示第 2381 - 2400 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2381 | 2024-08-07 |
A single mutation in the core domain of the lac repressor reduces leakiness
2013-Jul-08, Microbial cell factories
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/1475-2859-12-67
PMID:23834731
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研究论文 | 本文研究了乳糖操纵子抑制蛋白（LacI）核心域中单个突变对泄漏性的影响 | 通过将色氨酸220突变为苯丙氨酸，成功减少了LacI的泄漏性，从而降低了异源蛋白生产中的能量负担和潜在毒性 | NA | 研究LacI抑制蛋白的泄漏性及其对异源蛋白生产的影响 | 乳糖操纵子抑制蛋白（LacI）及其突变体LacIWF | 分子生物学 | NA | 饱和突变 | NA | 蛋白质 | NA |
| 2382 | 2024-08-07 |
Designing and encoding models for synthetic biology
2009-Aug-06, Journal of the Royal Society, Interface
DOI:10.1098/rsif.2009.0035.focus
PMID:19364720
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研究论文 | 本文概述了合成生物学中模型创建和分析的过程以及常用的软件工具，并描述了使用标记语言对模型及其相关注释进行编码的方法。 | 本文介绍了模型组件的挖掘、其在关系模型中的集成、公式化和参数化，以及模拟结果的评估和模型的验证。 | NA | 探讨合成生物学中定量模型的设计和编码方法。 | 合成生物学中的基因调控和反应网络的动态建模。 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2383 | 2024-08-07 |
Towards the engineering of in vitro systems
2009-Aug-06, Journal of the Royal Society, Interface
DOI:10.1098/rsif.2009.0110.focus
PMID:19474076
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研究论文 | 本文探讨了体外系统工程设计的可能性及其面临的挑战 | 提出体外系统作为克服生物系统复杂性的一种手段，可作为工程化活体系统的过渡 | 仍面临酶动力学和关键设计参数知识不足的问题 | 探索体外系统在合成生物学中的应用，以简化生物系统的设计 | 体外系统，特别是中等规模的酶促反应网络如糖酵解 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2384 | 2024-08-07 |
Consistent design schematics for biological systems: standardization of representation in biological engineering
2009-Aug-06, Journal of the Royal Society, Interface
DOI:10.1098/rsif.2009.0046.focus
PMID:19493898
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综述 | 本文综述了合成生物学中用于生物系统设计和表示的标准化努力，特别是图形可视化和模拟/注释方案的标准 | 提出了一个统一的框架，用于模型可视化、模拟和跨工具共享，以促进对分子机制的深入理解和新型生物系统的设计 | NA | 探讨生物工程中生物系统表示的标准化方法 | 生物系统的设计和表示标准 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2385 | 2024-08-07 |
Mathematical modeling and synthetic biology
2008, Drug discovery today. Disease models
DOI:10.1016/j.ddmod.2009.07.002
PMID:27840651
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研究论文 | 本文探讨了合成生物学中数学建模与实验技术的结合，以及它们在设计生物电路和分析预期行为中的应用 | 本文强调了建模与实验方法结合在合成生物学中的重要性，并展示了这一结合如何推动工程微生物作为技术平台的应用 | NA | 研究目的是探索合成生物学中数学建模与实验技术的结合及其在生物电路设计中的应用 | 研究对象是合成生物学中的生物电路设计及其预期行为分析 | 合成生物学 | NA | 数学建模 | NA | NA | NA |
| 2386 | 2024-08-07 |
Engineering bacterial motility towards hydrogen-peroxide
2018, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0196999
PMID:29750783
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研究论文 | 本文开发了一种遗传结构，用于控制和引导细菌向过氧化氢移动，利用oxyRS调节系统实现对非天然趋化剂过氧化氢的识别和移动。 | 首次成功利用遗传工程使细菌能够识别并朝向过氧化氢移动，为信号引导治疗提供了新的可能性。 | 研究主要集中在实验室条件下，尚未在实际疾病治疗环境中进行验证。 | 旨在创建能够自主治疗疾病的细胞，这些疾病通过过氧化氢的释放来信号化。 | 细菌的趋化性和对过氧化氢的响应。 | 合成生物学 | NA | 遗传工程 | NA | 细胞追踪数据 | 涉及不同浓度的过氧化氢（0-200 μM）和不同诱导时间的细菌样本。 |
| 2387 | 2024-08-07 |
Preparation of Giant Vesicles Encapsulating Microspheres by Centrifugation of a Water-in-oil Emulsion
2017-01-24, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/55282
PMID:28190062
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研究论文 | 本文描述了一种通过水油乳液离心法制备封装微球的大囊泡（GVs）的方法 | 提出了一种简单的水油乳液离心法制备封装微球的大囊泡的方法 | NA | 研究人工细胞的构建方法 | 大囊泡（GVs）封装微球 | 合成生物学 | NA | 水油乳液离心法 | NA | 囊泡 | NA |
| 2388 | 2024-08-07 |
Functional photosystem I maintains proper energy balance during nitrogen depletion in Chlamydomonas reinhardtii, promoting triacylglycerol accumulation
2017, Biotechnology for biofuels
IF:6.1Q2
DOI:10.1186/s13068-017-0774-4
PMID:28413444
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研究论文 | 本文研究了在氮缺乏条件下，Chlamydomonas reinhardtii中功能性光系统I（PSI）如何维持能量平衡并促进三酰甘油（TAG）积累 | 揭示了PSI在调控细胞代谢和脂质/淀粉分配中的核心作用，以及其在氮缺乏条件下维持细胞氧化还原状态的机制 | 研究主要集中在tab2突变体和野生型在氮缺乏条件下的比较，未涉及其他可能的调控因素 | 探讨PSI在氮缺乏条件下对细胞代谢和能量平衡的影响 | Chlamydomonas reinhardtii中的tab2突变体和野生型 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2389 | 2024-08-07 |
Synthetic biology routes to bio-artificial intelligence
2016-11-30, Essays in biochemistry
IF:5.6Q1
DOI:10.1042/EBC20160014
PMID:27903825
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研究论文 | 本文讨论了合成基因网络（SGNs）在生物学上实现感知器算法和巴甫洛夫联想学习的可能性，并探讨了SGNs在复杂输入数据处理中的进化潜力 | 首次探讨了合成基因网络在生物学上实现感知器算法和巴甫洛夫联想学习的可能性，并提出了SGNs在复杂输入数据处理中的进化策略 | NA | 探索合成基因网络在生物学上实现人工智能算法的可能性 | 合成基因网络及其在生物学上实现感知器算法和巴甫洛夫联想学习的能力 | 生物技术 | NA | 合成基因网络（SGNs） | 感知器算法 | 输入数据 | NA |
| 2390 | 2024-08-07 |
A Combinatorial Algorithm for Microbial Consortia Synthetic Design
2016-07-04, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/srep29182
PMID:27373593
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研究论文 | 本文介绍了一种组合算法，用于设计微生物共生体的合成 | 提出了一种新的模型和方法，用于合成生产化合物的外源或内源微生物共生体 | 成功建立最佳共生体以生产特定化合物或其组合仍然是一个挑战 | 解决如何选择最佳共生体以合成生产特定化合物的问题 | 微生物共生体及其在化合物生产中的应用 | 合成生物学 | NA | 组合算法 | 初始模型 | NA | NA |
| 2391 | 2024-08-07 |
Symbiotic Nitrogen Fixation and the Challenges to Its Extension to Nonlegumes
2016-07-01, Applied and environmental microbiology
IF:3.9Q2
DOI:10.1128/AEM.01055-16
PMID:27084023
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综述 | 本文综述了生物固氮的原理及其在非豆科作物中扩展的挑战和前景 | 提出了利用合成生物学方法扩展生物固氮至更多作物种类的蓝图 | 生物固氮过程目前仅限于细菌和古菌，不适用于真核生物 | 探讨如何通过合成生物学方法将共生固氮扩展到非豆科作物，以减少对氮肥的依赖 | 生物固氮过程及其在农业中的应用 | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA |
| 2392 | 2024-08-07 |
RNAiFold2T: Constraint Programming design of thermo-IRES switches
2016-06-15, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btw265
PMID:27307638
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研究论文 | 本文介绍了RNAiFold2T算法，用于解决RNA热传感器（RNATs）的逆折叠问题，并成功设计了两种热传感器内部核糖体进入位点（thermo-IRES）元素。 | RNAiFold2T是首个使用约束编程（CP）和大型邻域搜索（LNS）算法解决2温度逆折叠问题的软件，能够生成比现有程序多两个数量级的解决方案。 | 设计的thermo-IRES元素的翻译效率低于野生型IRES元素，后者对温度变化完全不敏感。 | 开发一种新的算法来解决RNA热传感器的逆折叠问题，并设计功能性RNA热开关。 | RNA热传感器（RNATs）和热传感器内部核糖体进入位点（thermo-IRES）元素。 | 生物信息学 | NA | 约束编程（CP）和大型邻域搜索（LNS） | NA | RNA结构 | 两种设计的thermo-IRES元素在42°C时的翻译效率比30°C时高约50%。 |
| 2393 | 2024-08-07 |
Designer Micelles Accelerate Flux Through Engineered Metabolism in E. coli and Support Biocompatible Chemistry
2016-05-10, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.201600966
PMID:27061024
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研究论文 | 本文展示了维生素E衍生的设计微泡在合成化学中的应用，这些微泡在生物相容性环境下加速了通过大肠杆菌中苯乙烯生产途径的代谢通量 | 设计微泡能够非共价地与细菌外膜结合，增加膜的通透性，并能容纳异质性和有机可溶性过渡金属催化剂，加速生物相容性环丙烷化反应 | NA | 探索设计微泡在合成生物技术领域的应用，以及通过微生物发酵和生物相容性化学结合来扩大可从可再生资源中获得的分子类型 | 设计微泡在微生物代谢工程中的应用 | 合成生物技术 | NA | 微生物发酵 | NA | NA | NA |
| 2394 | 2024-08-07 |
A dual-core double emulsion platform for osmolarity-controlled microreactor triggered by coalescence of encapsulated droplets
2016-May, Biomicrofluidics
IF:2.6Q2
DOI:10.1063/1.4952572
PMID:27279935
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研究论文 | 本文报道了一种玻璃毛细管微流控方法，用于制造含有两个不同内滴/核心的渗透压响应性水-油-水（W/O/W）双乳液，并精确触发封装滴之间的聚结 | 该微流控方法能够生成高度单分散的双核心双乳液，并通过渗透压控制的膨胀行为提供新的刺激来触发封装滴之间的聚结 | NA | 开发一种新的双乳液平台，用于材料科学、合成生物学和化学工程中的微反应器 | 双核心双乳液及其在微反应器中的应用 | 材料科学 | NA | 微流控技术 | NA | 乳液 | NA |
| 2395 | 2024-08-07 |
Build to understand: synthetic approaches to biology
2016-Apr-18, Integrative biology : quantitative biosciences from nano to macro
IF:1.5Q4
DOI:10.1039/c5ib00252d
PMID:26686885
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综述 | 本文讨论了合成生物学如何促进研究自然生物系统中观察到的遗传电路的任务 | 通过实验合成基因电路来理解发育和疾病中的基本机制，并利用数学模型指导新基因电路的设计和探索电路拓扑结构 | NA | 探讨合成生物学在理解自然生物系统遗传电路中的应用 | 遗传电路、多稳态、随机基因表达、振荡和细胞间通信 | 合成生物学 | NA | NA | 数学模型 | NA | NA |
| 2396 | 2024-08-07 |
Streamlined Construction of the Cyanobacterial CO2-Fixing Organelle via Protein Domain Fusions for Use in Plant Synthetic Biology
2015-Sep, The Plant cell
DOI:10.1105/tpc.15.00329
PMID:26320224
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研究论文 | 本文通过构建融合蛋白简化了蓝细菌CO2固定器官的组装过程，并探讨了其在植物合成生物学中的应用 | 通过设计基于蛋白域相互作用的融合蛋白，简化了蓝细菌CO2固定器官的组装过程，减少了遗传负荷 | NA | 开发一种新的方法来简化蓝细菌CO2固定器官的组装，并探索其在植物合成生物学中的应用 | 蓝细菌CO2固定器官的组装过程及其在植物合成生物学中的应用 | 合成生物学 | NA | 蛋白域融合 | NA | NA | NA |
| 2397 | 2024-08-07 |
Ecological perspectives on synthetic biology: insights from microbial population biology
2015, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2015.00143
PMID:25767468
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综述 | 本文综述了合成生物学领域中微生物群落生物学的生态视角，特别关注了微生物群落的稳定性和持久性问题 | 强调了在微生物群落设计中结合生态和进化原则的重要性，以及空间结构和生态相互作用对微生物群落持久性的影响 | 目前的模型实践主要考虑固定化学反应回路的相互作用，忽略了生态背景和进化变化的可能性 | 探讨如何通过结合生态和进化原则来设计稳定的微生物群落，以实现进化稳定和可持续的系统 | 微生物群落的稳定性和持久性 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2398 | 2024-08-07 |
Antibacterial Discovery and Development: From Gene to Product and Back
2015, BioMed research international
IF:2.6Q3
DOI:10.1155/2015/591349
PMID:26339625
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综述 | 本文综述了从基因到产品的抗菌发现与发展过程，并探讨了如何整合新旧方法以改进微生物产品的筛选、发酵和菌株改良 | 本文结合了微生物生态学、分析化学、基因组学、分子生物学和合成生物学等领域的进展，为微生物天然产物筛选和开发提供了新的视角 | NA | 探讨如何整合新旧方法以改进微生物产品的筛选、发酵和菌株改良 | Enterococcus faecium, Staphylococcus aureus, Klebsiella species, Clostridium difficile, Acinetobacter baumannii, Pseudomonas aeruginosa, Escherichia coli 等细菌 | NA | 感染性疾病 | 基因组学, 分子生物学, 合成生物学 | NA | NA | NA |
| 2399 | 2024-08-07 |
How to make a minimal genome for synthetic minimal cell
2010-May, Protein & cell
IF:13.6Q1
DOI:10.1007/s13238-010-0064-4
PMID:21203957
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综述 | 本文综述了合成最小细胞的关键步骤——构建功能性最小基因组的历史、现状及主要方法，并讨论了最小基因组对人工细胞代谢和调控的影响 | 实验表明，基因组简化带来了意想不到的有益特性，如高电穿孔效率和重组基因及质粒的准确传播 | NA | 构建一个合成最小细胞，提供一个合适的底盘，以整合功能性的合成部件、设备和系统 | 合成最小细胞及其最小基因组 | 合成生物学 | NA | 生物信息学和分子生物学方法 | NA | 基因组数据 | NA |
| 2400 | 2024-08-07 |
A Digitally Programmable Cytomorphic Chip for Simulation of Arbitrary Biochemical Reaction Networks
2018-04, IEEE transactions on biomedical circuits and systems
IF:3.8Q2
DOI:10.1109/TBCAS.2017.2781253
PMID:29570063
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研究论文 | 本文报道了一种数字可编程的0.35 μm BiCMOS模拟细胞形态芯片系统，能够精确模拟任意生化反应网络 | 提出了一种基于总变量和守恒定律的独特计算方法，解决了芯片制造过程中随机变化导致的偏差问题 | NA | 开发一种用于模拟任意大规模生物网络的设计、分析和仿真工具 | 数字可编程的细胞形态芯片及其在生化反应网络模拟中的应用 | 生物技术 | NA | BiCMOS | 细胞形态电路 | 电路模拟 | NA |