合成生物学相关文章
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当前共找到 3069 篇文献，本页显示第 2401 - 2420 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2401 | 2024-08-07 |
Development and Application of a Synthetically-Derived Lead Biosensor Construct for Use in Gram-Negative Bacteria
2016-Dec-18, Sensors (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/s16122174
PMID:27999352
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研究论文 | 本研究利用合成生物学原理开发了一种基于质粒的全细胞细菌生物传感器，用于检测铅污染 | 开发了一种新型的合成来源的铅生物传感器构造，用于检测铅污染 | NA | 开发和应用一种合成来源的铅生物传感器，用于检测环境中的铅污染 | 铅生物传感器及其在检测铅污染中的应用 | 合成生物学 | NA | 合成生物学 | NA | NA | 包括多种实验室和环境分离株 |
| 2402 | 2024-08-07 |
Modular modelling with Physiome standards
2016-12-01, The Journal of physiology
DOI:10.1113/JP272633
PMID:27353233
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research paper | 本文提出了一套基于Physiome标准建模协议CellML的复杂模型设计原则，并通过实例展示了这些原则在构建可扩展和可重用的模型中的应用 | 本文首次提出了一套设计原则，用于指导复杂模型的构建，这些原则使得模型不仅可扩展，而且适合在更大规模的模型中重用 | NA | 旨在为复杂模型的构建提供设计原则，以支持模型的可扩展性和重用性 | 复杂计算模型的设计原则及其在CellML中的应用 | NA | NA | CellML | NA | NA | NA |
| 2403 | 2024-08-07 |
Bacterial genome engineering and synthetic biology: combating pathogens
2016-11-04, BMC microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.1186/s12866-016-0876-3
PMID:27814687
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综述 | 本文综述了细菌基因组工程和合成生物学工具在对抗多药耐药病原菌中的应用 | 介绍了重组工程、CRISPR和细菌细胞间信号传导机制等特定基因组工程和合成生物学方法在病原体靶向中的应用 | NA | 探讨如何利用新兴的细菌基因组工程和合成生物学工具来监测和治疗广泛存在的顽固性细菌感染 | 多药耐药病原菌及其耐药机制 | 合成生物学 | NA | 重组工程、CRISPR | NA | NA | NA |
| 2404 | 2024-08-07 |
Design of nanoscale enzyme complexes based on various scaffolding materials for biomass conversion and immobilization
2016-Nov, Biotechnology journal
IF:3.2Q2
DOI:10.1002/biot.201600039
PMID:27783468
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综述 | 本文综述了基于蛋白质、微生物和纳米材料的不同支架技术在酶固定化中的应用，以及这些技术对木质纤维素材料生物精炼的影响 | 介绍了智能应用各种支架与纳米尺度工程工具和代谢工程技术结合，可能为研究带来特定优势 | NA | 探讨支架技术在酶固定化和生物精炼领域的应用 | 酶固定化技术及其在生物精炼中的应用 | 生物技术 | NA | 酶固定化技术 | NA | NA | NA |
| 2405 | 2024-08-07 |
Synthetic Biology of Natural Products
2016-Oct-03, Cold Spring Harbor perspectives in biology
IF:6.9Q1
DOI:10.1101/cshperspect.a023994
PMID:27503995
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研究论文 | 本文讨论了天然产物生物合成途径的多样性和自然模块性，以及它们作为合成生物学方法的吸引力和挑战 | 文章介绍了基于合成生物学工具的化合物和途径检测与表征方法的发展，以及通过理性多样化方法访问化学空间的新技术 | 文章提到了当前领域的进展和剩余瓶颈，但未具体说明局限性 | 探讨天然产物合成生物学的现状，强调最新进展和存在的瓶颈 | 天然产物的生物合成途径及其在合成生物学中的应用 | 合成生物学 | NA | 合成生物学工具 | NA | 基因组信息 | 涉及微生物多样性的大部分 |
| 2406 | 2024-08-07 |
Engineering of synthetic, stress-responsive yeast promoters
2016-09-30, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkw553
PMID:27325743
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研究论文 | 本研究开发了一组在酸性条件下可诱导的合成酵母启动子，并验证了其增强乳酸生产的应用 | 本研究通过修改转录因子结合位点，提高了合成启动子在低pH条件下的性能，并成功将其应用于不相关的启动子中 | NA | 设计和工程化可响应特定内源或环境条件的合成酵母启动子 | 酵母菌Saccharomyces cerevisiae的合成启动子 | 合成生物学 | NA | NA | NA | 表达数据和转录因子结合数据 | 一组合成启动子变体 |
| 2407 | 2024-08-07 |
Improving protein content and quality by over-expressing artificially synthetic fusion proteins with high lysine and threonine constituent in rice plants
2016-Sep-28, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/srep34427
PMID:27677708
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研究论文 | 通过在稻米植物中超表达人工合成的融合蛋白，提高稻米中赖氨酸和苏氨酸的含量，从而改善蛋白质的质量和数量 | 人工合成了两个新的基因，通过融合内源性稻米基因与赖氨酸/苏氨酸模体编码序列，显著提高了转基因稻米种子中赖氨酸、苏氨酸、总氨基酸和粗蛋白的含量 | 转基因种子中携带这两个新基因的串联阵列时，蛋白质质量和数量的改进有限 | 提高稻米中赖氨酸和苏氨酸的含量，从而改善蛋白质的质量和数量 | 稻米植物及其种子中的蛋白质含量和质量 | 合成生物学 | NA | 基因工程 | NA | 基因序列 | 转基因稻米种子与野生型对照 |
| 2408 | 2024-08-07 |
A linear-encoding model explains the variability of the target morphology in regeneration
2014-Mar-06, Journal of the Royal Society, Interface
DOI:10.1098/rsif.2013.0918
PMID:24402915
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研究论文 | 本文探讨了再生过程中目标形态变异性的线性编码模型 | 提出了线性编码目标形态的概念，简化了再生过程中的逆问题 | NA | 研究再生机制及其在生物医学和合成生物工程中的应用 | 鹿角、涡虫、招潮蟹等生物的再生机制 | NA | NA | NA | 线性编码模型 | NA | NA |
| 2409 | 2024-08-07 |
A single mutation in the core domain of the lac repressor reduces leakiness
2013-Jul-08, Microbial cell factories
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/1475-2859-12-67
PMID:23834731
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研究论文 | 本文研究了乳糖操纵子抑制蛋白（LacI）核心域中单个突变对泄漏性的影响 | 通过将色氨酸220突变为苯丙氨酸，成功减少了LacI的泄漏性，从而降低了异源蛋白生产中的能量负担和潜在毒性 | NA | 研究LacI抑制蛋白的泄漏性及其对异源蛋白生产的影响 | 乳糖操纵子抑制蛋白（LacI）及其突变体LacIWF | 分子生物学 | NA | 饱和突变 | NA | 蛋白质 | NA |
| 2410 | 2024-08-07 |
Designing and encoding models for synthetic biology
2009-Aug-06, Journal of the Royal Society, Interface
DOI:10.1098/rsif.2009.0035.focus
PMID:19364720
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研究论文 | 本文概述了合成生物学中模型创建和分析的过程以及常用的软件工具，并描述了使用标记语言对模型及其相关注释进行编码的方法。 | 本文介绍了模型组件的挖掘、其在关系模型中的集成、公式化和参数化，以及模拟结果的评估和模型的验证。 | NA | 探讨合成生物学中定量模型的设计和编码方法。 | 合成生物学中的基因调控和反应网络的动态建模。 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2411 | 2024-08-07 |
Towards the engineering of in vitro systems
2009-Aug-06, Journal of the Royal Society, Interface
DOI:10.1098/rsif.2009.0110.focus
PMID:19474076
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研究论文 | 本文探讨了体外系统工程设计的可能性及其面临的挑战 | 提出体外系统作为克服生物系统复杂性的一种手段，可作为工程化活体系统的过渡 | 仍面临酶动力学和关键设计参数知识不足的问题 | 探索体外系统在合成生物学中的应用，以简化生物系统的设计 | 体外系统，特别是中等规模的酶促反应网络如糖酵解 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2412 | 2024-08-07 |
Consistent design schematics for biological systems: standardization of representation in biological engineering
2009-Aug-06, Journal of the Royal Society, Interface
DOI:10.1098/rsif.2009.0046.focus
PMID:19493898
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综述 | 本文综述了合成生物学中用于生物系统设计和表示的标准化努力，特别是图形可视化和模拟/注释方案的标准 | 提出了一个统一的框架，用于模型可视化、模拟和跨工具共享，以促进对分子机制的深入理解和新型生物系统的设计 | NA | 探讨生物工程中生物系统表示的标准化方法 | 生物系统的设计和表示标准 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2413 | 2024-08-07 |
Mathematical modeling and synthetic biology
2008, Drug discovery today. Disease models
DOI:10.1016/j.ddmod.2009.07.002
PMID:27840651
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研究论文 | 本文探讨了合成生物学中数学建模与实验技术的结合，以及它们在设计生物电路和分析预期行为中的应用 | 本文强调了建模与实验方法结合在合成生物学中的重要性，并展示了这一结合如何推动工程微生物作为技术平台的应用 | NA | 研究目的是探索合成生物学中数学建模与实验技术的结合及其在生物电路设计中的应用 | 研究对象是合成生物学中的生物电路设计及其预期行为分析 | 合成生物学 | NA | 数学建模 | NA | NA | NA |
| 2414 | 2024-08-07 |
Engineering bacterial motility towards hydrogen-peroxide
2018, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0196999
PMID:29750783
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研究论文 | 本文开发了一种遗传结构，用于控制和引导细菌向过氧化氢移动，利用oxyRS调节系统实现对非天然趋化剂过氧化氢的识别和移动。 | 首次成功利用遗传工程使细菌能够识别并朝向过氧化氢移动，为信号引导治疗提供了新的可能性。 | 研究主要集中在实验室条件下，尚未在实际疾病治疗环境中进行验证。 | 旨在创建能够自主治疗疾病的细胞，这些疾病通过过氧化氢的释放来信号化。 | 细菌的趋化性和对过氧化氢的响应。 | 合成生物学 | NA | 遗传工程 | NA | 细胞追踪数据 | 涉及不同浓度的过氧化氢（0-200 μM）和不同诱导时间的细菌样本。 |
| 2415 | 2024-08-07 |
Preparation of Giant Vesicles Encapsulating Microspheres by Centrifugation of a Water-in-oil Emulsion
2017-01-24, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/55282
PMID:28190062
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研究论文 | 本文描述了一种通过水油乳液离心法制备封装微球的大囊泡（GVs）的方法 | 提出了一种简单的水油乳液离心法制备封装微球的大囊泡的方法 | NA | 研究人工细胞的构建方法 | 大囊泡（GVs）封装微球 | 合成生物学 | NA | 水油乳液离心法 | NA | 囊泡 | NA |
| 2416 | 2024-08-07 |
Functional photosystem I maintains proper energy balance during nitrogen depletion in Chlamydomonas reinhardtii, promoting triacylglycerol accumulation
2017, Biotechnology for biofuels
IF:6.1Q2
DOI:10.1186/s13068-017-0774-4
PMID:28413444
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研究论文 | 本文研究了在氮缺乏条件下，Chlamydomonas reinhardtii中功能性光系统I（PSI）如何维持能量平衡并促进三酰甘油（TAG）积累 | 揭示了PSI在调控细胞代谢和脂质/淀粉分配中的核心作用，以及其在氮缺乏条件下维持细胞氧化还原状态的机制 | 研究主要集中在tab2突变体和野生型在氮缺乏条件下的比较，未涉及其他可能的调控因素 | 探讨PSI在氮缺乏条件下对细胞代谢和能量平衡的影响 | Chlamydomonas reinhardtii中的tab2突变体和野生型 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2417 | 2024-08-07 |
Synthetic biology routes to bio-artificial intelligence
2016-11-30, Essays in biochemistry
IF:5.6Q1
DOI:10.1042/EBC20160014
PMID:27903825
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研究论文 | 本文讨论了合成基因网络（SGNs）在生物学上实现感知器算法和巴甫洛夫联想学习的可能性，并探讨了SGNs在复杂输入数据处理中的进化潜力 | 首次探讨了合成基因网络在生物学上实现感知器算法和巴甫洛夫联想学习的可能性，并提出了SGNs在复杂输入数据处理中的进化策略 | NA | 探索合成基因网络在生物学上实现人工智能算法的可能性 | 合成基因网络及其在生物学上实现感知器算法和巴甫洛夫联想学习的能力 | 生物技术 | NA | 合成基因网络（SGNs） | 感知器算法 | 输入数据 | NA |
| 2418 | 2024-08-07 |
A Combinatorial Algorithm for Microbial Consortia Synthetic Design
2016-07-04, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/srep29182
PMID:27373593
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研究论文 | 本文介绍了一种组合算法，用于设计微生物共生体的合成 | 提出了一种新的模型和方法，用于合成生产化合物的外源或内源微生物共生体 | 成功建立最佳共生体以生产特定化合物或其组合仍然是一个挑战 | 解决如何选择最佳共生体以合成生产特定化合物的问题 | 微生物共生体及其在化合物生产中的应用 | 合成生物学 | NA | 组合算法 | 初始模型 | NA | NA |
| 2419 | 2024-08-07 |
Symbiotic Nitrogen Fixation and the Challenges to Its Extension to Nonlegumes
2016-07-01, Applied and environmental microbiology
IF:3.9Q2
DOI:10.1128/AEM.01055-16
PMID:27084023
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综述 | 本文综述了生物固氮的原理及其在非豆科作物中扩展的挑战和前景 | 提出了利用合成生物学方法扩展生物固氮至更多作物种类的蓝图 | 生物固氮过程目前仅限于细菌和古菌，不适用于真核生物 | 探讨如何通过合成生物学方法将共生固氮扩展到非豆科作物，以减少对氮肥的依赖 | 生物固氮过程及其在农业中的应用 | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA |
| 2420 | 2024-08-07 |
RNAiFold2T: Constraint Programming design of thermo-IRES switches
2016-06-15, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btw265
PMID:27307638
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研究论文 | 本文介绍了RNAiFold2T算法，用于解决RNA热传感器（RNATs）的逆折叠问题，并成功设计了两种热传感器内部核糖体进入位点（thermo-IRES）元素。 | RNAiFold2T是首个使用约束编程（CP）和大型邻域搜索（LNS）算法解决2温度逆折叠问题的软件，能够生成比现有程序多两个数量级的解决方案。 | 设计的thermo-IRES元素的翻译效率低于野生型IRES元素，后者对温度变化完全不敏感。 | 开发一种新的算法来解决RNA热传感器的逆折叠问题，并设计功能性RNA热开关。 | RNA热传感器（RNATs）和热传感器内部核糖体进入位点（thermo-IRES）元素。 | 生物信息学 | NA | 约束编程（CP）和大型邻域搜索（LNS） | NA | RNA结构 | 两种设计的thermo-IRES元素在42°C时的翻译效率比30°C时高约50%。 |