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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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2421 | 2024-08-07 |
Designer Micelles Accelerate Flux Through Engineered Metabolism in E. coli and Support Biocompatible Chemistry
2016-05-10, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.201600966
PMID:27061024
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研究论文 | 本文展示了维生素E衍生的设计微泡在合成化学中的应用,这些微泡在生物相容性环境下加速了通过大肠杆菌中苯乙烯生产途径的代谢通量 | 设计微泡能够非共价地与细菌外膜结合,增加膜的通透性,并能容纳异质性和有机可溶性过渡金属催化剂,加速生物相容性环丙烷化反应 | NA | 探索设计微泡在合成生物技术领域的应用,以及通过微生物发酵和生物相容性化学结合来扩大可从可再生资源中获得的分子类型 | 设计微泡在微生物代谢工程中的应用 | 合成生物技术 | NA | 微生物发酵 | NA | NA | NA |
2422 | 2024-08-07 |
A dual-core double emulsion platform for osmolarity-controlled microreactor triggered by coalescence of encapsulated droplets
2016-May, Biomicrofluidics
IF:2.6Q2
DOI:10.1063/1.4952572
PMID:27279935
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研究论文 | 本文报道了一种玻璃毛细管微流控方法,用于制造含有两个不同内滴/核心的渗透压响应性水-油-水(W/O/W)双乳液,并精确触发封装滴之间的聚结 | 该微流控方法能够生成高度单分散的双核心双乳液,并通过渗透压控制的膨胀行为提供新的刺激来触发封装滴之间的聚结 | NA | 开发一种新的双乳液平台,用于材料科学、合成生物学和化学工程中的微反应器 | 双核心双乳液及其在微反应器中的应用 | 材料科学 | NA | 微流控技术 | NA | 乳液 | NA |
2423 | 2024-08-07 |
Build to understand: synthetic approaches to biology
2016-Apr-18, Integrative biology : quantitative biosciences from nano to macro
IF:1.5Q4
DOI:10.1039/c5ib00252d
PMID:26686885
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综述 | 本文讨论了合成生物学如何促进研究自然生物系统中观察到的遗传电路的任务 | 通过实验合成基因电路来理解发育和疾病中的基本机制,并利用数学模型指导新基因电路的设计和探索电路拓扑结构 | NA | 探讨合成生物学在理解自然生物系统遗传电路中的应用 | 遗传电路、多稳态、随机基因表达、振荡和细胞间通信 | 合成生物学 | NA | NA | 数学模型 | NA | NA |
2424 | 2024-08-07 |
Streamlined Construction of the Cyanobacterial CO2-Fixing Organelle via Protein Domain Fusions for Use in Plant Synthetic Biology
2015-Sep, The Plant cell
DOI:10.1105/tpc.15.00329
PMID:26320224
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研究论文 | 本文通过构建融合蛋白简化了蓝细菌CO2固定器官的组装过程,并探讨了其在植物合成生物学中的应用 | 通过设计基于蛋白域相互作用的融合蛋白,简化了蓝细菌CO2固定器官的组装过程,减少了遗传负荷 | NA | 开发一种新的方法来简化蓝细菌CO2固定器官的组装,并探索其在植物合成生物学中的应用 | 蓝细菌CO2固定器官的组装过程及其在植物合成生物学中的应用 | 合成生物学 | NA | 蛋白域融合 | NA | NA | NA |
2425 | 2024-08-07 |
Ecological perspectives on synthetic biology: insights from microbial population biology
2015, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2015.00143
PMID:25767468
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综述 | 本文综述了合成生物学领域中微生物群落生物学的生态视角,特别关注了微生物群落的稳定性和持久性问题 | 强调了在微生物群落设计中结合生态和进化原则的重要性,以及空间结构和生态相互作用对微生物群落持久性的影响 | 目前的模型实践主要考虑固定化学反应回路的相互作用,忽略了生态背景和进化变化的可能性 | 探讨如何通过结合生态和进化原则来设计稳定的微生物群落,以实现进化稳定和可持续的系统 | 微生物群落的稳定性和持久性 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
2426 | 2024-08-07 |
Antibacterial Discovery and Development: From Gene to Product and Back
2015, BioMed research international
IF:2.6Q3
DOI:10.1155/2015/591349
PMID:26339625
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综述 | 本文综述了从基因到产品的抗菌发现与发展过程,并探讨了如何整合新旧方法以改进微生物产品的筛选、发酵和菌株改良 | 本文结合了微生物生态学、分析化学、基因组学、分子生物学和合成生物学等领域的进展,为微生物天然产物筛选和开发提供了新的视角 | NA | 探讨如何整合新旧方法以改进微生物产品的筛选、发酵和菌株改良 | Enterococcus faecium, Staphylococcus aureus, Klebsiella species, Clostridium difficile, Acinetobacter baumannii, Pseudomonas aeruginosa, Escherichia coli 等细菌 | NA | 感染性疾病 | 基因组学, 分子生物学, 合成生物学 | NA | NA | NA |
2427 | 2024-08-07 |
How to make a minimal genome for synthetic minimal cell
2010-May, Protein & cell
IF:13.6Q1
DOI:10.1007/s13238-010-0064-4
PMID:21203957
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综述 | 本文综述了合成最小细胞的关键步骤——构建功能性最小基因组的历史、现状及主要方法,并讨论了最小基因组对人工细胞代谢和调控的影响 | 实验表明,基因组简化带来了意想不到的有益特性,如高电穿孔效率和重组基因及质粒的准确传播 | NA | 构建一个合成最小细胞,提供一个合适的底盘,以整合功能性的合成部件、设备和系统 | 合成最小细胞及其最小基因组 | 合成生物学 | NA | 生物信息学和分子生物学方法 | NA | 基因组数据 | NA |
2428 | 2024-08-07 |
A Digitally Programmable Cytomorphic Chip for Simulation of Arbitrary Biochemical Reaction Networks
2018-04, IEEE transactions on biomedical circuits and systems
IF:3.8Q2
DOI:10.1109/TBCAS.2017.2781253
PMID:29570063
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研究论文 | 本文报道了一种数字可编程的0.35 μm BiCMOS模拟细胞形态芯片系统,能够精确模拟任意生化反应网络 | 提出了一种基于总变量和守恒定律的独特计算方法,解决了芯片制造过程中随机变化导致的偏差问题 | NA | 开发一种用于模拟任意大规模生物网络的设计、分析和仿真工具 | 数字可编程的细胞形态芯片及其在生化反应网络模拟中的应用 | 生物技术 | NA | BiCMOS | 细胞形态电路 | 电路模拟 | NA |
2429 | 2024-08-07 |
Emergent Properties of Giant Vesicles Formed by a Polymerization-Induced Self-Assembly (PISA) Reaction
2017-01-27, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/srep41534
PMID:28128307
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研究论文 | 本研究展示了通过控制自由基聚合反应,在温和条件下形成巨型聚合物囊泡的方法 | 首次通过聚合诱导自组装(PISA)反应,在温和条件下形成直径大于10微米的巨型聚合物囊泡 | NA | 探索巨型囊泡的形成及其在自然科学和工程领域的应用潜力 | 巨型聚合物囊泡及其自组装过程 | NA | NA | 聚合诱导自组装(PISA) | NA | 图像 | NA |
2430 | 2024-08-07 |
A Cas9-based toolkit to program gene expression in Saccharomyces cerevisiae
2017-Jan-09, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkw1023
PMID:27899650
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research paper | 本文利用CRISPR/Cas9技术构建了一个无需克隆的工具包,用于解决代谢工程中常见的障碍,如染色体整合位点选择、启动子选择以及蛋白质定位和溶解性问题 | 该工具包包括23个Cas9-sgRNA质粒、37个不同强度和时间表达特性的启动子以及10种蛋白质定位、降解和溶解性标签,并通过一个基于网络的工具自动化生成用于整合的DNA片段 | NA | 开发一个高效的基因表达编程工具包,用于酵母菌株工程 | 酵母菌株工程中的基因编辑和代谢工程 | synthetic biology | NA | CRISPR/Cas9 | NA | DNA | 23个Cas9-sgRNA质粒、37个启动子、10种蛋白质标签 |
2431 | 2024-08-07 |
Development of SyneBrick Vectors As a Synthetic Biology Platform for Gene Expression in Synechococcus elongatus PCC 7942
2017, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2017.00293
PMID:28303150
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研究论文 | 本文开发了SyneBrick载体作为合成生物学平台,用于Synechococcus elongatus PCC 7942中的基因表达。 | SyneBrick载体提供了三种可诱导的表达系统和三个中性位点用于染色体整合,能够有效控制基因表达并加速代谢工程。 | 基因表达在光照下48小时后因aTc降解而减少。 | 开发合成生物学平台,用于蓝细菌中的基因表达和代谢途径重构。 | Synechococcus elongatus PCC 7942作为模型蓝细菌。 | 合成生物学 | NA | 基因表达调控技术 | NA | 基因表达数据 | NA |
2432 | 2024-08-07 |
Model-guided combinatorial optimization of complex synthetic gene networks
2016-Dec-28, Molecular systems biology
IF:8.5Q1
DOI:10.15252/msb.20167265
PMID:28031353
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研究论文 | 本文展示了一种利用预测模型优化复杂三基因电路的策略,该电路是一种新型的比例miRNA生物传感器 | 通过模型引导生成遗传多样性,随后进行筛选和模型验证,成功优化了复杂基因网络的性能,无需广泛的前期知识 | NA | 构建满足定量性能标准的基因电路 | 复杂的三基因电路及miRNA生物传感器 | 合成生物学 | NA | 预测建模 | NA | 遗传数据 | 小数量的传感器 |
2433 | 2024-08-07 |
Production and Characterization of Synthetic Carboxysome Shells with Incorporated Luminal Proteins
2016-Mar, Plant physiology
IF:6.5Q1
DOI:10.1104/pp.15.01822
PMID:26792123
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研究论文 | 本文描述了在大肠杆菌中表达合成操纵子以生产含有内腔蛋白的合成羧基体壳,并研究了其结构决定因素和渗透性 | 本研究不仅加深了对控制羧基体组装的蛋白质-蛋白质相互作用的理解,还建立了一个平台来研究壳的渗透性和完整BMC壳的结构基础 | NA | 理解羧基体和其他细菌微区室(BMCs)的货物包装和壳渗透性的结构决定因素,以应用于植物合成生物学和代谢工程 | 合成羧基体壳及其内腔蛋白的表达和特性 | 生物工程 | NA | NA | NA | 蛋白质 | NA |
2434 | 2024-08-07 |
Compartmentalization and Transport in Synthetic Vesicles
2016, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2016.00019
PMID:26973834
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综述 | 本文综述了合成囊泡在合成生物学中的应用,特别是简单和嵌套人工囊泡在多隔室生物反应器中的使用 | 本文探讨了将膜转运蛋白整合到简单和嵌套人工囊泡中,以实现子隔间之间特定物质交换的潜力 | 目前大多数隔室化生物反应器依赖于非特异性底物和产物的交换,这限制了其进一步的应用 | 探讨合成囊泡在合成生物学中的应用,特别是如何通过技术进步实现膜蛋白的重构 | 简单和嵌套人工囊泡,以及多隔室生物反应器 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
2435 | 2024-08-07 |
Genome-Editing Technologies for Enhancing Plant Disease Resistance
2016, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2016.01813
PMID:27990151
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研究论文 | 本文探讨了利用基因编辑技术提高植物病害抗性的策略和目标 | 提出了通过重写效应子-目标序列和修改效应子-目标启动子来增强目标基因表达的策略,以及通过基因编辑技术获得合成基因的方法 | NA | 提高植物病害抗性,促进可持续农业发展 | 植物基因编辑技术和植物免疫系统 | 生物技术 | NA | 基因编辑技术 | NA | 基因序列 | NA |
2436 | 2024-08-07 |
Rationally designed, heterologous S. cerevisiae transcripts expose novel expression determinants
2015, RNA biology
IF:3.6Q2
DOI:10.1080/15476286.2015.1071762
PMID:26176266
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研究论文 | 本文通过合成生物学方法,系统地研究了不同转录区域对基因表达的影响,特别是在酵母中对病毒HRSVgp04基因ORF的383个基因变体的理性设计和分析。 | 发现了转录本中先前未探索区域的新因果效应,以及翻译调控与ORF不同部分折叠强度选择之间的关系。 | 研究主要集中在5'UTR和ORF下游120个核苷酸内的区域,对更远区域的探索有限。 | 揭示RNA转录特征与蛋白质表达谱之间的通用因果关系。 | 病毒HRSVgp04基因ORF的383个基因变体在酵母中的表达。 | 合成生物学 | NA | 合成生物学方法 | NA | 转录本 | 383个基因变体 |
2437 | 2024-08-07 |
Salinity tolerance in plants. Quantitative approach to ion transport starting from halophytes and stepping to genetic and protein engineering for manipulating ion fluxes
2015, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2015.00873
PMID:26579140
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综述 | 本文从盐生植物和盐敏感植物之间的离子运输差异出发,重点讨论了通过遗传和蛋白质工程操纵离子通量以提高植物耐盐性的方法 | 本文介绍了通过过表达或敲除离子转运蛋白来改变耐盐性的成功尝试,并探讨了通过单点突变修改离子通道和转运蛋白以及合成生物学方法创建新的调控网络以提高耐盐性的潜在方向 | NA | 提高植物的耐盐性 | 植物的离子运输机制和相关蛋白质 | NA | NA | 遗传和蛋白质工程 | NA | 离子通量数据 | NA |
2438 | 2024-08-07 |
Synthetic Peptides as Protein Mimics
2015, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2015.00211
PMID:26835447
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综述 | 本文综述了使用合成肽作为蛋白质模拟物以调节蛋白质功能和为合成生物学提供构建块的最新进展 | 合成肽可以精确复制蛋白质片段,并通过多种化学修饰(包括非蛋白质氨基酸的引入和肽骨架的修饰)来扩展其化学和结构多样性,从而提高其蛋白酶稳定性 | NA | 探索和调节蛋白质功能,通过控制分子间相互作用的干扰 | 合成肽作为蛋白质模拟物 | NA | NA | 合成肽技术 | NA | NA | NA |
2439 | 2024-08-07 |
Construction of synthetic nucleoli and what it tells us about propagation of sub-nuclear domains through cell division
2014, Cell cycle (Georgetown, Tex.)
DOI:10.4161/15384101.2014.949124
PMID:25486191
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研究论文 | 本文通过合成生物学原理构建人工核仁,探讨亚核域在细胞分裂中的传播机制 | 利用合成生物学方法成功构建人工核仁,揭示了核仁在细胞周期传播中的关键机制 | NA | 深入理解核体在细胞周期中的继承机制 | 细胞核中的核体及其在细胞分裂中的传播 | 细胞生物学 | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA |
2440 | 2024-08-07 |
An RNA origami robot that traps and releases a fluorescent aptamer
2024-Mar-22, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adk1250
PMID:38507482
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研究论文 | 本文使用RNA折纸技术开发了一种名为“Traptamer”的RNA机器人设备,该设备能够机械地捕获并释放荧光适配体iSpinach | 首次展示了RNA机器人设备能够作为布尔AND门,并通过可逆控制荧光适配体的荧光来实现对分子过程的增强控制 | NA | 开发先进的RNA机器人设备,用于在医学和合成生物学中的应用 | RNA折纸机器人设备Traptamer及其对荧光适配体iSpinach的捕获和释放机制 | 合成生物学 | NA | RNA折纸技术 | NA | RNA | NA |