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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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2441 | 2024-08-07 |
Conformational Study of an Artificial Metal-Dependent Regulation Site for Use in Designer Proteins
2013-Jul, Zeitschrift fur anorganische und allgemeine Chemie
IF:1.1Q4
DOI:10.1002/zaac.201300131
PMID:25995524
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
2442 | 2024-08-07 |
Cooperativity to increase Turing pattern space for synthetic biology
2015-Feb-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/sb500233u
PMID:25122550
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研究论文 | 本文通过建模反应扩散系统,探讨了如何在合成生物学中增加图灵模式的参数空间 | 研究预测了陡峭的剂量-反应函数(由协同作用产生)对于图灵模式是必要的,这种陡峭性增加了参数空间并减少了激活剂和抑制剂之间差异扩散的需求 | 本文主要探讨了线性场景在反应扩散系统中的局限性 | 旨在理解和工程化图灵模式网络,以应用于合成生物学 | 研究对象为反应扩散系统中的两种形态发生素 | 合成生物学 | NA | 反应扩散系统建模 | 反应扩散模型 | 参数空间分析 | NA |
2443 | 2024-08-07 |
Chassis organism from Corynebacterium glutamicum--a top-down approach to identify and delete irrelevant gene clusters
2015-Feb, Biotechnology journal
IF:3.2Q2
DOI:10.1002/biot.201400041
PMID:25139579
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研究论文 | 本研究采用自上而下的方法,从谷氨酸棒杆菌ATCC 13032中构建底盘生物,旨在识别并删除与在定义培养基上快速生长无关的基因簇 | 研究引入了相关基因的新概念,并展示了构建适用于生物技术应用底盘的一般策略 | NA | 通过删除无关基因簇,减少谷氨酸棒杆菌的基因组大小,以构建适用于生物技术应用的底盘生物 | 谷氨酸棒杆菌ATCC 13032的基因簇 | 合成生物学 | NA | 基因敲除 | NA | 基因组数据 | 41个基因簇,其中36个成功删除,10个基因组减少的菌株显示出生长速率受损 |
2444 | 2024-08-07 |
Engineering living functional materials
2015-Jan-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/sb500113b
PMID:25592034
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研究论文 | 本文提出并验证了通过合成生物学工具,将活细胞与无机组件结合,创造出具有新型功能的'活功能材料'和'活材料合成平台'的概念 | 本文首次展示了通过合成基因电路在E. coli生物膜中实现化学诱导响应的电开关,并动态组织生物-无机材料,模板化金纳米棒、金纳米线和金属/半导体异质结构,以及合成半导体纳米颗粒 | NA | 探索通过合成生物学工具创造新型活功能材料和活材料合成平台的可能性 | E. coli生物膜与无机材料的结合 | 合成生物学 | NA | 合成基因电路 | NA | 生物膜 | NA |
2445 | 2024-08-07 |
When plants produce not enough or at all: metabolic engineering of flavonoids in microbial hosts
2015, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2015.00007
PMID:25688249
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综述 | 本文综述了通过生物技术生产天然或非天然黄酮类化合物的合理方法,分析了异源生物中农业/医药化合物组合生物合成的意义 | 利用微生物细胞培养作为生物工厂,通过代谢工程方法强化自然代谢途径,发现新的天然和非天然植物黄酮类化合物的生产方式 | NA | 探讨通过代谢工程和合成生物学方法优化黄酮类化合物的生产 | 黄酮类化合物的代谢工程和合成生物学应用 | 化学生物工程 | NA | 代谢工程 | NA | 基因组数据 | NA |
2446 | 2024-08-07 |
Core concept: Synthetic biology-change, accelerated
2014-Dec-02, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.1419688111
PMID:25468948
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
2447 | 2024-08-07 |
Effective use of a horizontally-transferred pathway for dichloromethane catabolism requires post-transfer refinement
2014-Nov-24, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.04279
PMID:25418043
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研究论文 | 研究通过实验室进化模拟水平基因转移和精炼过程,展示了引入的二氯甲烷降解途径的有效使用需要细菌宿主发生特定的突变 | 构建了一个携带降解途径和氯离子出口蛋白的合成移动遗传元件,直接促进了在多种Methylobacterium环境分离株中有效降解二氯甲烷 | NA | 探讨水平基因转移后精炼过程的重要性及其在生物修复和合成生物学中的应用 | 水平基因转移后的基因和途径在微生物中的功能及进化精炼 | NA | NA | 实验室进化 | NA | 遗传元件 | 两种自然降解二氯甲烷的菌株及多种Methylobacterium环境分离株 |
2448 | 2024-08-07 |
Synthetic biology outside the cell: linking computational tools to cell-free systems
2014, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2014.00066
PMID:25538941
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综述 | 本文探讨了生物化学网络的体内外模型,特别关注可应用于无细胞表达系统构建的工具 | 本文强调了将数学模型与无细胞系统结合的新一代仿生系统的开发 | NA | 探索生物化学网络模型,并应用于无细胞表达系统的构建 | 生物化学网络的体内外模型及无细胞表达系统 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
2449 | 2024-08-07 |
Synthetic biology of phenotypic adaptation in vertebrates: the next frontier
2013-Jul, Molecular biology and evolution
IF:11.0Q1
DOI:10.1093/molbev/mst075
PMID:23603936
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研究论文 | 本文探讨了通过合成生物学方法研究脊椎动物表型适应性的新前沿 | 提出通过合成和操纵“适当”的祖先表型来建立基因型与表型之间的关系,并通过研究适应性突变的化学作用来学习其功能 | 目前大多数正选择氨基酸位点的统计结果尚未经过实验验证 | 通过实验测试正选择氨基酸位点的统计结果,并建立基因型与表型之间的关系 | 脊椎动物的表型适应性及其与环境行为变化的关系 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
2450 | 2024-08-07 |
A synthetic biology approach to understanding cellular information processing
2012-Sep-21, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/sb300044r
PMID:23411668
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综述 | 本文综述了合成生物学在理解细胞信息处理中的应用和发展 | 合成生物学方法揭示了网络基序的新动态,如简单基序组合产生的自主动态和转录翻译噪声对基序动态的影响 | NA | 增加对细胞信息处理的理解 | 细胞网络的动态特性和网络基序的行为 | 合成生物学 | NA | 合成基因电路构建与分析 | NA | NA | NA |
2451 | 2024-08-07 |
Targeting duplex DNA with chimeric α,β-triplex-forming oligonucleotides
2012-Sep, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gks410
PMID:22641847
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研究论文 | 研究设计了一系列短的嵌合α,β-三链形成寡核苷酸(TFOs),并研究了它们与荧光标记的二链发夹的相互作用 | 首次报道了嵌合TFOs能够识别双链DNA中的碱基对反转 | NA | 解决三链DNA识别严格受限于多嘌呤序列的问题 | 嵌合α,β-三链形成寡核苷酸(TFOs)与荧光标记的二链发夹的相互作用 | NA | NA | 原生凝胶电泳、阵列热变性和荧光淬灭实验 | NA | DNA | NA |
2452 | 2024-08-07 |
Microfluidic technologies for synthetic biology
2011, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms12063576
PMID:21747695
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综述 | 本文综述了微流控技术在合成生物学中的最新应用,强调其在基因表达/调控动态分析、代谢物的高灵敏度芯片内外检测以及全细胞分析中的潜力 | 微流控技术能够提供前所未有的手段,加速合成生物学的发展,特别是在高分辨率动态基因表达/调控分析和代谢物的高灵敏度检测方面 | NA | 探讨微流控技术如何加速合成生物学的发展,并提供新的生物部件和系统 | 微流控技术在合成生物学中的应用,包括基因表达/调控的动态分析、代谢物的检测和全细胞分析 | 合成生物学 | NA | 微流控技术 | NA | 生物和生化样本 | NA |
2453 | 2024-08-07 |
Synthetic biology of minimal living cells: primitive cell models and semi-synthetic cells
2010-Sep, Systems and synthetic biology
DOI:10.1007/s11693-010-9054-3
PMID:21886680
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研究论文 | 本文总结了2009年ESF合成生物学会议上关于生命最小需求和生物学研究中建设性(合成)方法的概念贡献 | 定义了半合成最小细胞,这些人工制造的基于囊泡的系统由最少数量的基因、蛋白质和生物大分子组成,并可被定义为活的 | NA | 探讨生命最小需求和生物学研究中的合成方法 | 最小生命细胞模型和半合成细胞 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
2454 | 2024-08-07 |
Professionalization as a governance strategy for synthetic biology
2009-Dec, Systems and synthetic biology
DOI:10.1007/s11693-009-9037-4
PMID:19816804
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研究论文 | 本文探讨了将专业化作为合成生物学治理策略的问题,并通过与科学家、科学期刊编辑、科学咨询委员会成员及非政府政策报告作者的访谈,分析了专业化的优缺点及其在合成生物学治理中的应用。 | 本文提出专业化作为一种治理策略,能够克服当前合成生物学治理辩论中的二分法,如“自上而下”与“自下而上”的治理模式以及科学事实与公众价值观的对立。 | 专业化作为一种治理选项,存在局限性,特别是在战争与和平问题上。 | 探讨专业化作为合成生物学治理策略的有效性及其潜在影响。 | 科学家、科学期刊编辑、科学咨询委员会成员及非政府政策报告作者的观点和经验。 | NA | NA | NA | NA | 访谈数据 | 涉及多位科学家、编辑、咨询委员会成员及政策报告作者 |
2455 | 2024-08-07 |
On the origin of systems. Systems biology, synthetic biology and the origin of life
2009-Aug, EMBO reports
IF:6.5Q1
DOI:10.1038/embor.2009.117
PMID:19636296
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
2456 | 2024-08-07 |
Mid-Long Chain Dicarboxylic Acid Production via Systems Metabolic Engineering: Progress and Prospects
2024-Mar-20, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.4c00002
PMID:38442481
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研究论文 | 本文探讨了通过系统代谢工程策略在不同底盘中合成中长链二羧酸的方法 | 利用系统生物学、合成生物学和进化工程的新工具,实现能源密集型生物燃料的可持续生产 | NA | 探索中长链二羧酸的可持续生产方法,并讨论该领域的未来挑战 | 中长链二羧酸的生产 | 合成生物学 | NA | 系统代谢工程 | NA | NA | NA |
2457 | 2024-08-07 |
Engineering living materials by synthetic biology
2023-Mar, Biophysics reviews
IF:2.9Q2
DOI:10.1063/5.0115645
PMID:38505813
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综述 | 本文综述了通过合成生物学工程化活体材料的研究进展,并讨论了面临的挑战和未来的机遇 | 受自然生物材料系统的启发,本文探讨了模仿其复杂精细制造过程和功能的新兴领域 | NA | 探讨合成生物学与材料科学交叉领域的活体材料工程 | 活体材料及其在环境刺激响应和与无机物质耦合中的应用 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
2458 | 2024-08-07 |
Interfacing Living and Synthetic Cells as an Emerging Frontier in Synthetic Biology
2021-Mar-08, Angewandte Chemie (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/ange.202006941
PMID:38505493
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研究论文 | 本文讨论了将生物细胞与人工细胞结合以创建混合系统的可能性,并介绍了该领域的现状及三种通用的混合模式 | 提出了一种新的细胞仿生学方法,通过结合自上而下和自下而上的合成生物学,模糊了生物与非生物之间的界限 | 目前人工细胞无法与生物细胞的强大功能和行为复杂性相匹配 | 探讨生物细胞与人工细胞结合的可能性,以利用两者的优势 | 生物细胞与人工细胞的混合系统 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
2459 | 2024-08-07 |
Model-guided metabolic rewiring to bypass pyruvate oxidation for pyruvate derivative synthesis by minimizing carbon loss
2024-Mar-19, mSystems
IF:5.0Q1
DOI:10.1128/msystems.00839-23
PMID:38315666
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研究论文 | 本文通过基因组规模的代谢模型和约束基流平衡分析、几何流平衡分析及流变量分析,设计了一种微生物宿主,通过引入双歧分流途径,绕过丙酮酸氧化,从而提高丙酮酸衍生物的合成效率。 | 本研究通过动态控制流分布和适应性实验室进化,建立了一种新的葡萄糖培养细菌的代谢模式,以在有氧条件下最小化碳损失,并为生产丙酮酸衍生物的细胞设计提供了有价值的见解。 | NA | 旨在通过代谢重编程,提高微生物宿主合成丙酮酸衍生物的效率,同时最小化碳损失。 | 微生物宿主的代谢途径和基因表达调控。 | 合成生物学 | NA | 基因组规模代谢模型、约束基流平衡分析、几何流平衡分析、流变量分析 | NA | 代谢数据 | 约3,000个基因编码库 |
2460 | 2024-08-07 |
Rule-based design of synthetic transcription factors in eukaryotes
2014-Oct-17, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/sb400134k
PMID:24933274
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研究论文 | 本文开发了一种用于设计真核细胞中合成转录因子(sTFs)的语法,并将其集成到GenoCAD软件中 | 提出了一个用于设计合成转录因子的语法,并将其应用于GenoCAD软件,以指导用户创建预期的设计转录因子 | NA | 开发一种语法来指导合成转录因子的设计,以实现更可靠、高效和自动化的合成细胞设计 | 合成转录因子(sTFs)的设计 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |