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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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2461 | 2024-08-07 |
Synthetic biology and metabolic engineering for marine carotenoids: new opportunities and future prospects
2014-Sep-17, Marine drugs
IF:4.9Q1
DOI:10.3390/md12094810
PMID:25233369
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综述 | 本文综述了海洋类胡萝卜素合成途径、酶以及多种海洋类胡萝卜素的修饰方法,并讨论了代谢工程和合成生物学在类胡萝卜素生产中的进展 | NA | NA | 促进海洋类胡萝卜素的应用探索 | 海洋类胡萝卜素及其合成途径和酶 | NA | NA | 代谢工程和合成生物学 | NA | NA | NA |
2462 | 2024-08-07 |
Engineering microorganisms based on molecular evolutionary analysis: a succinate production case study
2014-Sep, Evolutionary applications
IF:3.5Q1
DOI:10.1111/eva.12186
PMID:25469170
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研究论文 | 本文通过分子进化分析方法,研究了从不同物种中选择合适基因以优化代谢途径的能力,特别是针对琥珀酸生产的研究 | 本文首次探讨了通过分子进化分析来选择不同物种中的基因,以优化代谢工程和合成生物学中的代谢途径 | NA | 研究如何通过分子进化分析选择合适的基因,以优化代谢途径 | 研究对象包括来自糖酵解的九个基因以及参与琥珀酸前体供应的三种基因 | 合成生物学 | NA | 分子进化分析 | NA | 基因数据 | 研究涉及九个基因和三种基因类型 |
2463 | 2024-08-07 |
Protein localization analysis of essential genes in prokaryotes
2014-Aug-08, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/srep06001
PMID:25105358
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研究论文 | 本文对27种原核生物中的必需基因进行了全面的蛋白质定位分析 | 首次系统地从蛋白质定位的角度考察了必需基因 | NA | 深入理解必需基因的基本功能,并改进基因必需性预测 | 27种原核生物中的必需基因及其编码的蛋白质定位 | 生物信息学 | NA | 基因本体论(GO)分析 | NA | 基因组数据 | 27种原核生物,包括24种细菌、2种支原体和1种古菌 |
2464 | 2024-08-07 |
Computational approaches to metabolic engineering utilizing systems biology and synthetic biology
2014-Aug, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2014.08.005
PMID:25379141
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综述 | 本文综述了利用系统生物学和合成生物学工具进行代谢工程的计算方法 | 文章探讨了利用计算工具进行前瞻性预测设计以实现预期结果的方法,以及通过组合实验工具进行经验性探索和筛选所需特性的替代方法 | NA | 探讨代谢工程中系统生物学和合成生物学的计算工具应用 | 代谢工程中的细胞功能和生物化学应用 | 系统生物学 | NA | 计算工具 | NA | NA | NA |
2465 | 2024-08-07 |
Discovery of the lomaiviticin biosynthetic gene cluster in Salinispora pacifica
2014-Jul-08, Tetrahedron
IF:2.1Q2
DOI:10.1016/j.tet.2014.03.009
PMID:25045187
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研究论文 | 本文描述了在Salinispora pacifica菌株中鉴定出负责lomaiviticin生物合成的基因簇 | 通过分子方法和基因组测序鉴定了lomaiviticin生物合成的基因簇,并利用比较基因组学识别了几个不寻常的后修饰事件的候选酶 | NA | 阐明lomaiviticin的生物合成逻辑,并为生物催化合成生物学提供有用的分子工具 | lomaiviticin生物合成的基因簇及其相关酶 | 生物化学 | NA | 基因组测序 | NA | 基因组数据 | 涉及两个菌株DPJ-0016和DPJ-0019 |
2466 | 2024-08-07 |
Transient expressions of synthetic biology in plants
2014-Jun, Current opinion in plant biology
IF:8.3Q1
DOI:10.1016/j.pbi.2014.02.003
PMID:24631883
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研究论文 | 本文探讨了植物中合成生物学瞬时表达方法的最新进展及其在生产大分子复合物和代谢途径分析与调控中的应用 | 瞬时表达方法使得在几天内高效传递和表达多个基因成为可能,并且可以微调载体以实现不同基因的差异表达 | NA | 研究瞬时表达技术在植物合成生物学中的应用 | 植物细胞中的基因表达 | 合成生物学 | NA | 瞬时表达方法 | NA | 基因表达数据 | 多种植物细胞 |
2467 | 2024-08-07 |
Bacteriophage-based synthetic biology for the study of infectious diseases
2014-Jun, Current opinion in microbiology
IF:5.9Q1
DOI:10.1016/j.mib.2014.05.022
PMID:24997401
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研究论文 | 本文讨论了基于噬菌体的技术及其在研究传染病中的应用 | 提出了新的基因组工程策略,有望加速新型噬菌体疗法、诊断和工具的设计 | NA | 探讨噬菌体技术在传染病研究中的应用 | 噬菌体及其在分子生物学、遗传工程和合成生物学中的应用 | 分子生物学 | 传染病 | 合成生物学 | NA | NA | NA |
2468 | 2024-08-07 |
Yeast synthetic biology platform generates novel chemical structures as scaffolds for drug discovery
2014-May-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/sb400177x
PMID:24742115
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research paper | 本文首次报道了使用面包酵母通过组合遗传学方法生成74种新型化合物,这些化合物作为药物发现的支架结构 | 本文引入了一种新的合成生物学方法,通过与目标蛋白质的“共进化”生成新型化合物,这些化合物具有良好的生物活性,且结构复杂性高于合成片段 | NA | 开发一种新的合成生物学平台,用于生成新型化学结构作为药物发现的支架 | 74种新型化合物及其生物活性和结构特性 | 合成生物学 | NA | 组合遗传学方法 | NA | 化合物 | 74种新型化合物 |
2469 | 2024-08-07 |
Genetically engineered transvestites reveal novel mating genes in budding yeast
2013-Dec, Genetics
IF:3.3Q2
DOI:10.1534/genetics.113.155846
PMID:24121774
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研究论文 | 通过基因工程改造的“变装”酵母细胞揭示了新的交配基因 | 发现了新的MATα特异性蛋白Afb1,该蛋白干扰a因子(MATa细胞分泌的pheromone),并证明了强烈的pheromone分泌对有效交配至关重要 | 变装细胞的交配效率较低,且在所有潜在伙伴都分泌较少pheromone的情况下交配更弱 | 研究酵母交配过程中的效率控制因子 | 酵母细胞的交配类型特异性蛋白 | NA | NA | 基因工程 | NA | 转录组 | NA |
2470 | 2024-08-07 |
Design and analysis of a tunable synchronized oscillator
2013-Nov-18, Journal of biological engineering
IF:5.7Q1
DOI:10.1186/1754-1611-7-26
PMID:24245660
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研究论文 | 本文设计并分析了一种可调谐的同步振荡器遗传电路,用于研究同步转录反馈环路 | 通过引入化学诱导的抑制因子,扩大了振荡发生的条件范围,并允许调节振荡频率 | NA | 研究同步转录反馈环路在不同条件和实验设置下的行为 | 设计了两种遗传电路,能够在小规模的大肠杆菌细胞群体中展示同步振荡的绿色荧光蛋白表达 | 合成生物学 | NA | NA | NA | 图像 | 小规模的大肠杆菌细胞群体 |
2471 | 2024-08-07 |
Tuning response curves for synthetic biology
2013-Oct-18, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/sb4000564
PMID:23905721
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研究论文 | 本文探讨了合成生物学中系统响应曲线的调整问题 | 提出了一个数学公式来捕捉广泛的生物响应曲线,并定义了一系列调整变体 | NA | 研究如何通过实验改变系统的响应曲线形状 | 细胞系统的响应速率调整 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
2472 | 2024-08-07 |
A survey of enabling technologies in synthetic biology
2013-May-10, Journal of biological engineering
IF:5.7Q1
DOI:10.1186/1754-1611-7-13
PMID:23663447
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综述 | 本文综述了合成生物学领域的关键技术,并探讨了这些技术如何促进该领域的创新和发展 | 本文通过调查合成生物学实践者的意见和经验,总结了支持生物系统工程的关键技术,并强调了这些技术对合成生物学创新的重要性 | 文章主要基于调查结果,可能未涵盖所有合成生物学领域的关键技术,且对技术的未来发展趋势和挑战讨论有限 | 旨在探讨合成生物学中的关键技术及其对创新的影响,并提出相应的政策和管理建议 | 合成生物学领域的关键技术和实践者 | 合成生物学 | NA | DNA合成和测序技术,生物部件的公共和私有注册库,DNA构建体的物理组装标准方法,基因组数据库,DNA序列搜索、比对、分析和编辑的软件工具 | NA | 文本 | 自认参与合成生物学研究的实践者社区 |
2473 | 2024-08-07 |
Microbial synthetic biology for human therapeutics
2012-Jun, Systems and synthetic biology
DOI:10.1007/s11693-012-9092-0
PMID:23730360
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研究论文 | 本文讨论了通过微生物途径利用合成生物学开发新型人类治疗药物的潜力 | 本文提出了利用合成生物学工具在微生物系统中表达基于植物的药物化合物,并探讨了传统医学知识在微生物系统中开发新药物的价值 | NA | 探讨合成生物学在人类治疗学中的应用,特别是通过微生物途径 | 微生物合成细胞和现有微生物的再工程化,用于合成治疗产品 | 合成生物学 | NA | 合成生物学工具 | NA | NA | NA |
2474 | 2024-08-07 |
Landscape and global stability of nonadiabatic and adiabatic oscillations in a gene network
2012-Mar-07, Biophysical journal
IF:3.2Q2
DOI:10.1016/j.bpj.2012.02.002
PMID:22404922
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研究论文 | 本文通过量化潜在景观来确定生物振荡的全局稳定性和相干性,研究了两个相互抑制和激活对方的基因网络模体,发现了两种重要的波动类型,并探讨了绝热和非绝热两种振荡机制。 | 本文发现了两种新的振荡机制:绝热机制通过平均基因状态的有效相互作用产生稳定振荡,非绝热机制通过慢速绑定/解绑到启动子的时间延迟产生稳定振荡。 | NA | 研究生物振荡的全局稳定性和相干性 | 基因网络中的相互抑制和激活的基因 | 生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
2475 | 2024-08-07 |
Deterministic Function Computation with Chemical Reaction Networks
2012, Natural computing
IF:1.7Q2
DOI:10.1007/s11047-013-9393-6
PMID:25383068
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研究论文 | 本文介绍了化学反应网络(CRNs)在确定性函数计算中的应用,并展示了CRNs如何通过分子种类的计数来表示函数的输出。 | 本文首次提出了通过CRNs进行确定性函数计算的概念,并证明了函数图是半线性集时,CRN可以确定性地计算该函数。 | CRNs只能计算图是半线性集的函数,这限制了其计算能力的范围。 | 探讨化学反应网络在确定性函数计算中的应用及其计算能力。 | 化学反应网络(CRNs)及其在函数计算中的应用。 | NA | NA | 化学反应网络(CRNs) | NA | NA | NA |
2476 | 2024-08-07 |
Synthetic biology: ethical ramifications 2009
2009-Dec, Systems and synthetic biology
DOI:10.1007/s11693-009-9042-7
PMID:19816805
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研究论文 | 本文探讨了合成生物学从宣言阶段到研究项目的转变,并分析了其伦理影响 | 合成生物学从单一研究方向分化出多个不同的研究轨迹 | NA | 探讨合成生物学的伦理影响及其在可再生能源、廉价药物生产和环境修复等领域的应用 | 合成生物学的设计和构建新生物部件、设备和系统,以及重新设计自然生物系统 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
2477 | 2024-08-07 |
EcoGenoRisk: Developing a computational ecological risk assessment tool for synthetic biology
2024-Apr-01, Environmental pollution (Barking, Essex : 1987)
DOI:10.1016/j.envpol.2024.123647
PMID:38402941
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研究论文 | 本文介绍了EcoGenoRisk,一个用于合成生物学生物入侵风险评估的新型计算工具 | EcoGenoRisk通过筛选与合成生物微生物基因相似的微生物栖息地,预测合成生物微生物可能建立种群的位置 | NA | 开发一个计算工具,用于评估合成生物学中修改微生物对非预期环境的潜在风险 | 合成生物学中的修改微生物及其对环境的潜在影响 | 合成生物学 | NA | 生物信息学 | NA | 基因组数据 | 520个古菌和32,828个细菌的完整基因组 |
2478 | 2024-08-07 |
Automated high-throughput DNA synthesis and assembly
2024-Mar-30, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e26967
PMID:38500977
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综述 | 本文综述了DNA合成与组装技术的最新进展,重点介绍了自动化和高通量技术的发展及其在合成生物学中的应用 | 介绍了自动化液体处理工作站和集成实验设备的使用,提高了合成生物学领域的效率 | NA | 探讨DNA合成与组装技术的创新和改进 | DNA合成与组装技术 | 合成生物学 | NA | 自动化液体处理 | NA | DNA序列 | NA |
2479 | 2024-08-07 |
Engineered mRNA-ribosome fusions for facile biosynthesis of selenoproteins
2024-Mar-12, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2321700121
PMID:38442159
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研究论文 | 本研究通过将核糖体RNA(rRNA)与信使RNA(mRNA)进行功能性融合,开发了一种新型策略来改进核糖体工程,以促进硒蛋白的生物合成 | 本研究首次提出了一种基于mRNA-rRNA融合的新型核糖体工程策略,即RiboU,通过将16S rRNA与硒半胱氨酸插入序列(SECIS)共价结合,实现了硒半胱氨酸(Sec)在蛋白质中的特定位点插入 | NA | 开发一种新型核糖体工程策略,以促进硒蛋白的生物合成 | 核糖体RNA(rRNA)与信使RNA(mRNA)的功能性融合 | 合成生物学 | NA | mRNA-rRNA融合技术 | NA | RNA | 三种功能性目标硒蛋白 |
2480 | 2024-08-07 |
Design and optimization of ε-poly-l-lysine with specific functions for diverse applications
2024-Mar, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2024.129513
PMID:38262828
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综述 | 本文综述了ε-聚-L-赖氨酸(ε-PL)的生产及其分子结构修饰的最新进展,重点讨论了提高ε-PL生产效率和多样性的挑战与解决方案 | 强调了ε-PL在食品保鲜和生物医学领域的应用潜力,并展望了通过合成生物学定制ε-PL分子结构的可能性 | 目前微生物合成ε-PL的效率受限于遗传工程和分子结构修饰的低效性 | 探讨ε-PL的生产优化及其在多领域应用中的分子结构修饰 | ε-聚-L-赖氨酸及其衍生物 | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA |