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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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2481 | 2024-08-07 |
DNA methylases for site-selective inhibition of type IIS restriction enzyme activity
2024-Jan-25, Applied microbiology and biotechnology
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s00253-024-13015-7
PMID:38270650
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研究论文 | 本文研究了通过重组DNA甲基化酶来抑制IIS型限制酶活性的方法 | 开发了可用于合成生物学和DNA组装技术的重组DNA甲基化酶 | NA | 生产能够体外抑制IIS型限制酶的重组DNA甲基化酶 | DNA甲基化酶及其在抑制IIS型限制酶活性中的应用 | 合成生物学 | NA | DNA甲基化 | NA | DNA | 十种甲基化酶 |
2482 | 2024-08-07 |
Protein and peptide engineering for chemical exchange saturation transfer imaging in the age of synthetic biology
2023-06, NMR in biomedicine
IF:2.7Q1
DOI:10.1002/nbm.4712
PMID:35150021
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综述 | 本文综述了化学交换饱和转移(CEST)成像中基于蛋白质的对比剂的发展历程,并讨论了合成生物学对其未来发展的影响 | 介绍了基于多肽的CEST对比剂的设计和工程化,以及酶-底物对作为CEST对比增强剂的合理化 | NA | 探讨如何提高多肽的选择性、特异性及CEST对比度,并讨论合成生物学对下一代基于蛋白质的CEST对比剂开发的影响 | 基于蛋白质的CEST对比剂及其在成像中的应用 | 生物技术 | NA | 化学交换饱和转移成像(CEST) | NA | NA | NA |
2483 | 2024-08-07 |
Computer-aided design of biological circuits using TinkerCell
2010 Jul-Aug, Bioengineered bugs
DOI:10.4161/bbug.1.4.12506
PMID:21327060
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研究论文 | 本文介绍了一种用于合成生物学中生物电路设计的计算机辅助设计工具TinkerCell | TinkerCell是一个灵活且可扩展的应用程序,能够适应合成生物学领域中的变化 | 由于合成生物学网络的建模和构建最佳实践尚未确立,TinkerCell的设计需要不断调整 | 开发一种有效的计算机辅助设计工具,用于合成生物学中的生物网络设计、分析和构建 | 合成生物学中的生物网络设计 | 合成生物学 | NA | 计算机辅助设计 (CAD) | NA | 生物网络 | NA |
2484 | 2024-08-07 |
Bioelectricity and CO2-to-butyrate production using photobioelectrochemical cells with bio-hydrogel
2024-Apr, Bioresource technology
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.biortech.2024.130530
PMID:38447619
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研究论文 | 本文介绍了一种利用光生物电化学电池(BPEC)通过生物水凝胶将太阳能转化为电能或化学物质的新技术 | 使用电活性细菌(Shewanella loihica PV-4)减少氧化石墨烯(rGO)纳米片并生产共装配的rGO/Shewanella生物水凝胶作为基本电极,结合合成生物学和纳米技术,提高了电子交换效率 | NA | 探索光生物电化学电池中高效生物电能和有价值化学物质的生产 | 光生物电化学电池中的生物水凝胶电极及其在CO2还原为丁酸中的应用 | 生物技术 | NA | 光生物电化学技术 | NA | 生物水凝胶 | 使用Shewanella loihica PV-4和基因编辑的Clostridium ljungdahlii进行共培养系统 |
2485 | 2024-08-07 |
Advancing the scale of synthetic biology via cross-species transfer of cellular functions enabled by iModulon engraftment
2024-Mar-15, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-46486-3
PMID:38490991
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研究论文 | 本研究通过机器学习分析大量转录组数据,识别出独立调节的基因集(iModulons),并展示了通过iModulon移植实现跨物种细胞功能的转移 | 首次通过iModulon移植实现了跨物种细胞功能的精确转移,包括生物转化和抗菌抵抗等复杂功能 | NA | 探索通过iModulon移植实现跨物种细胞功能转移的方法,并优化合成生物学中的菌株设计 | 细菌转录组数据和细胞功能转移 | 合成生物学 | NA | 机器学习 | NA | 转录组数据 | 涉及多种Pseudomonas物种和Escherichia coli |
2486 | 2024-08-07 |
Creating new-to-nature carbon fixation: A guide
2024-Mar, Metabolic engineering
IF:6.8Q1
DOI:10.1016/j.ymben.2023.12.012
PMID:38160747
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综述 | 本文提供了一种关于设计和实现新型自然碳固定途径的实用指南 | 介绍了合成CO固定途径,这些途径比自然途径(如CBB循环)更有效地捕获和转化CO | NA | 旨在设计新的生物功能并扩展自然解决方案空间 | 新型自然碳固定途径 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
2487 | 2024-08-07 |
Engineering mammalian cell growth dynamics for biomanufacturing
2024-Mar, Metabolic engineering
IF:6.8Q1
DOI:10.1016/j.ymben.2024.01.006
PMID:38325641
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研究论文 | 本文介绍了一种多层次的细胞工程策略,用于可调节的哺乳动物细胞生长阶段的控制 | 开发了一种结合“油门”和“刹车”系统的双可控系统,实现了哺乳动物细胞生长动态的动态和精确协调 | NA | 精确控制哺乳动物细胞生长动态,以提高生物制药制造 | 哺乳动物细胞 | 生物工程 | NA | CRISPR/Cas9 | NA | NA | NA |
2488 | 2024-08-07 |
Transitions in development - an interview with Nika Shakiba
2024-Mar-01, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.202748
PMID:38421607
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访谈 | 本文是对加拿大不列颠哥伦比亚大学Nika Shakiba的采访,她运用合成生物学技术研究干细胞竞争的基础 | NA | NA | 探讨Nika Shakiba的职业生涯及其如何将工程背景应用于干细胞研究 | 干细胞 | 合成生物学 | NA | 合成生物学技术 | NA | NA | NA |
2489 | 2024-08-07 |
'Seeing' the electromagnetic spectrum: spotlight on the cryptochrome photocycle
2024, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2024.1340304
PMID:38495372
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review | 本文综述了植物隐花色素如何获得光感应功能的机制 | 讨论了隐花色素光循环中产生的反应性氧物种(ROS)及其在生物应激反应中的作用,以及隐花色素对电磁场的响应和在光遗传学中的应用 | NA | 探讨植物隐花色素如何获得光感应功能及其在生物学和医学中的潜在应用 | 植物隐花色素及其光循环机制 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
2490 | 2024-08-07 |
Reprogramming Stars #8: A Synthetic Biology Approach to Cellular Reprogramming-An Interview with Dr. Katie Galloway
2022-08, Cellular reprogramming
IF:1.2Q4
DOI:10.1089/cell.2022.29068.kg
PMID:35900269
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
2491 | 2024-08-07 |
Chimeric Antigen Receptor- and TCR-Modified T Cells Enter Main Street and Wall Street
2015-Aug-01, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.4049/jimmunol.1500751
PMID:26188068
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研究论文 | 本文讨论了嵌合抗原受体(CAR)和T细胞受体(TCR)工程化T细胞在过继细胞转移(ACT)领域的应用及其临床免疫治疗的前景 | 利用合成生物学、免疫学和遗传工程的进展,生成具有所需特异性和增强功能的工程化T细胞 | NA | 探讨ACT领域面临的挑战和机遇 | 工程化T细胞在癌症、慢性感染和自身免疫疾病中的应用 | 免疫学 | 白血病,淋巴瘤 | 遗传工程 | NA | NA | 临床试验涉及成人和儿童 |
2492 | 2024-08-07 |
Chimeric antigen receptor therapy for cancer
2014, Annual review of medicine
IF:15.1Q1
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research paper | 本文探讨了嵌合抗原受体(CAR)疗法在癌症治疗中的应用及其发展前景 | 该疗法结合了单克隆抗体的精确靶向特异性和细胞毒性T细胞的强大细胞毒性及长期持久性 | 该领域仍处于起步阶段,需要进一步优化肿瘤靶点和调控细胞及宿主相关因素以支持基因工程细胞在体内的扩增和持久性 | 旨在开发具有可接受短期和长期毒性的新型靶向癌症疗法 | 研究对象包括神经母细胞瘤、慢性淋巴细胞白血病和B细胞淋巴瘤等多种成人和儿童恶性肿瘤 | 细胞免疫学 | 癌症 | 嵌合抗原受体(CAR)疗法 | NA | NA | NA |
2493 | 2024-08-07 |
Edible mycelium bioengineered for enhanced nutritional value and sensory appeal using a modular synthetic biology toolkit
2024-Mar-14, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-46314-8
PMID:38485948
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研究论文 | 开发了一种用于Aspergillus oryzae的可食用真菌的模块化合成生物学工具包,以提高其营养价值和感官吸引力 | 首次开发了用于可食用真菌Aspergillus oryzae的模块化合成生物学工具包,并成功提高了其内部营养素和风味分子的含量 | NA | 通过合成生物学技术增强真菌食品的营养价值和感官吸引力 | Aspergillus oryzae真菌 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas9基因编辑技术 | NA | NA | NA |
2494 | 2024-08-07 |
High-throughput prediction of enzyme promiscuity based on substrate-product pairs
2024-Jan-22, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae089
PMID:38487850
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研究论文 | 本文开发了一种基于底物-产物对的酶混杂性预测模型SPEPP,利用迁移学习和变换器架构进行预测 | SPEPP模型通过迁移学习和变换器架构,无需先验反应知识,允许用户自定义候选酶库,具有较强的外推能力 | NA | 解决现有基于底物和反应相似性的工具在代谢工程和合成生物学中应用的局限性 | 酶混杂性预测及其在代谢工程、从头途径设计和有害物质降解中的应用 | 代谢工程 | NA | 迁移学习 | 变换器架构 | 底物-产物对数据 | NA |
2495 | 2024-08-07 |
Deep generative design of RNA family sequences
2024-Mar, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-023-02148-8
PMID:38238559
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研究论文 | 提出了一种名为RfamGen的深度生成模型,用于高效地设计功能性RNA家族序列 | RfamGen通过整合对齐和共识二级结构信息,能够生成新颖且功能性的RNA家族序列 | NA | 开发一种自动化设计功能性RNA的平台 | RNA家族序列 | 机器学习 | NA | 深度生成模型 | 深度生成模型 | 序列数据 | 使用了多种RNA家族进行实验验证 |
2496 | 2024-08-07 |
Synthetic biological neural networks: From current implementations to future perspectives
2024-Mar, Bio Systems
DOI:10.1016/j.biosystems.2024.105164
PMID:38402944
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综述 | 本文综述了合成生物神经网络(SYNBIONNs)的当前实现和模型,并探讨了其未来的发展前景和挑战 | SYNBIONNs在医学、生物传感器、生物技术等领域的应用显示出巨大潜力 | 目前SYNBIONN的实现较为稀少,且主要依赖于在硅中预训练的神经网络和大量人工输入 | 探讨如何成功实现一个可扩展的、能够在线学习的体内生物神经网络 | 合成生物神经网络(SYNBIONNs)及其在不同领域的应用 | 生物技术 | NA | NA | 神经网络 | NA | NA |
2497 | 2024-08-07 |
Machine metaphors and ethics in synthetic biology
2018-Jun-04, Life sciences, society and policy
DOI:10.1186/s40504-018-0077-y
PMID:29862436
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研究论文 | 本文探讨了合成生物学中机器隐喻的使用及其伦理影响 | 分析了机器隐喻在合成生物学中的应用及其对伦理判断的影响 | 未提及 | 探讨机器隐喻在合成生物学中的应用及其伦理影响 | 合成生物学中的机器隐喻及其伦理含义 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
2498 | 2024-08-07 |
Yeast 2.0-connecting the dots in the construction of the world's first functional synthetic eukaryotic genome
2018-06-01, FEMS yeast research
IF:2.4Q3
DOI:10.1093/femsyr/foy032
PMID:29648592
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研究论文 | 本文介绍了构建世界上第一个功能性合成真核基因组的研究进展,特别是在合成酵母基因组项目中的应用。 | 文章展示了如何利用先进的生物设计概念和合成生物学工具,通过国际合作网络推动科学进步,并为人类未来和可持续环境提供积极框架。 | 文章强调了在探索合成生物学等前沿科学时,需要关注生物安全、生物伦理和监管方面的挑战。 | 构建一个安全的模型生物中的合成真核基因组,并探讨其对未来生物经济的影响。 | 研究对象包括合成酵母基因组项目中的酵母细胞和相关生物设计工具。 | 合成生物学 | NA | 合成生物学工具 | NA | 基因组数据 | 涉及16个人造染色体的酵母细胞 |
2499 | 2024-08-07 |
A living foundry for Synthetic Biological Materials: A synthetic biology roadmap to new advanced materials
2018-Jun, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2018.04.002
PMID:29900423
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研究论文 | 本文探讨了利用合成生物学发现和制造新型生物基材料的潜力和挑战 | 提出了一种新的合成生物学生物材料制造方法,涉及智能设计和预测、制造、评估和生产 | 文章未明确指出具体的限制 | 旨在识别和加速新一代合成生物材料的发展 | 新型合成生物材料及其制造方法 | 合成生物学 | NA | 合成生物学方法 | NA | NA | NA |
2500 | 2024-08-07 |
Spatially organizing biochemistry: choosing a strategy to translate synthetic biology to the factory
2018-05-29, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-018-26399-0
PMID:29844460
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研究论文 | 本文通过空间解析的动力学模型探讨了合成生物学中生物化学空间组织的基本设计选择 | 提出了灵活的设计空间分析方法,可适用于多种生物合成途径,并为合理选择生物合成组织策略奠定了基础 | NA | 探索生物合成途径的最佳组织策略 | 生物合成途径的空间组织策略 | 合成生物学 | NA | 空间解析的动力学模型 | NA | NA | NA |