合成生物学相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
2561	2024-08-07	Microfluidic PicoArray synthesis of oligodeoxynucleotides and simultaneous assembling of multiple DNA sequences 2004, Nucleic acids research IF:16.6Q1 DOI:10.1093/nar/gkh879 PMID:15477391	研究论文	本文介绍了一种基于微流控PicoArray方法，用于同时合成和纯化设计用于多重基因合成的寡核苷酸，并展示了其在蛋白质表达中的应用	开发了一种微流控PicoArray方法，实现了寡核苷酸的并行合成和纯化，提高了基因合成的效率和纯度	NA	探索微流控技术在现代合成生物学中的应用，特别是基因合成和蛋白质表达	寡核苷酸的合成与纯化，以及通过连接和融合PCR策略实现的大规模DNA构建	合成生物学	NA	微流控PicoArray	NA	DNA序列	数百个碱基对的DNA构建物，以及高达10 kb的DNA构建物
2562	2024-08-07	Applications of designer phage encoding recombinant gene payloads 2024-03, Trends in biotechnology IF:14.3Q1 DOI:10.1016/j.tibtech.2023.09.008 PMID:37833198	研究论文	本文讨论了通过基因工程将重组基因有效载荷编码到噬菌体基因组中，以在细菌宿主中表达，从而影响噬菌体与细菌相互作用的潜在结果	本文探讨了在噬菌体疗法中使用合成生物学和DNA测序技术的新应用，特别是在多药耐药感染的治疗方面	文中指出，异源基因有效载荷的识别及其在转化相关应用中对细菌或人类细胞的影响仍未得到充分探索	研究目的是探索和分类重组基因有效载荷在噬菌体基因工程中的潜在应用	研究对象包括噬菌体、细菌以及通过基因工程引入的重组基因有效载荷	合成生物学	NA	DNA测序	NA	基因组数据	NA
2563	2024-08-07	Intellectual property and funding: fueling Chinese synbio 2024-03, Trends in biotechnology IF:14.3Q1 DOI:10.1016/j.tibtech.2023.10.012 PMID:37980185	研究论文	本文探讨了中国合成生物学领域中知识产权与资金支持的相互作用及其对创新和商业化的推动作用	强调知识产权与资金支持在中国合成生物学发展中的关键作用	NA	分析中国合成生物学领域的知识产权与资金支持的现状及其政策影响	中国合成生物学领域的知识产权与资金支持	合成生物学	NA	NA	NA	NA	NA
2564	2024-08-07	Developing Ganoderma lucidum as a next-generation cell factory for food and nutraceuticals 2024-02, Trends in biotechnology IF:14.3Q1 DOI:10.1016/j.tibtech.2023.07.008 PMID:37659953	综述	本文探讨了利用现代合成生物学工具，通过分子策略解决Ganoderma lucidum中基因调控网络和同源重组频率低的瓶颈问题，以促进其作为食品和营养补充品的高效细胞工厂的开发	利用现代合成生物学技术，加速精确的多基因靶向和编辑，解开G. lucidum的生物合成机制	Ganoderma lucidum中强大的调控网络和低频率的同源重组限制了分子工具和精确遗传标记的发展	将Ganoderma lucidum转化为高效的细胞工厂，用于食品和营养补充品的生产	Ganoderma lucidum的生物合成机制和分子调控策略	NA	NA	合成生物学	NA	NA	NA
2565	2024-08-07	Plant Engineering to Enable Platforms for Sustainable Bioproduction of Terpenoids 2024, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.) DOI:10.1007/978-1-0716-3658-9_1 PMID:38468079	综述	本文综述了利用植物工程技术开发可持续生产萜类化合物的平台，并强调了优化已知途径、细胞内途径的区室化以及为复杂生物合成途径工程开发的遗传工具等策略。	本文介绍了利用植物作为可持续生产平台，通过代谢工程和合成生物学技术，提高萜类化合物的产量和生产效率。	NA	开发可持续的解决方案，通过工程化宿主生物中的生物合成途径来生产萜类化合物。	萜类化合物及其在工业中的应用，如绿色溶剂、香料和香精、营养补充品、着色剂和治疗药物。	合成生物学	NA	代谢工程	NA	NA	NA
2566	2024-08-07	Construction of Xylose-Utilizing Cyanobacterial Chassis for Bioproduction Under Photomixotrophic Conditions 2024, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.) DOI:10.1007/978-1-0716-3658-9_4 PMID:38468082	研究论文	本文通过合成生物学方法，以快速生长的蓝细菌Synechococcus elongatus UTEX 2973为例，构建了一种新的能够利用木糖的蓝细菌底盘，以增加乙酰辅酶A用于生物生产	本文首次开发了一种合成生物学方法，用于构建能够利用木糖的蓝细菌底盘	NA	开发一种新的合成生物学方法，用于构建能够利用木糖的蓝细菌底盘	蓝细菌Synechococcus elongatus UTEX 2973	合成生物学	NA	合成生物学	NA	NA	NA
2567	2024-08-07	Multiplex Marker-Less Genome Integration in Pichia pastoris Using CRISPR/Cas9 2024, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.) DOI:10.1007/978-1-0716-3658-9_10 PMID:38468088	研究论文	本文利用CRISPR/Cas9系统在Pichia pastoris中实现多基因无标记整合，构建细胞工厂	首次在Pichia pastoris中应用CRISPR/Cas9系统进行多基因整合，为C1生物转化提供平台	NA	开发Pichia pastoris中的合成生物学工具，特别是多基因路径的操作	Pichia pastoris细胞工厂的构建	合成生物学	NA	CRISPR/Cas9	NA	NA	NA
2568	2024-08-07	Genome Editing, Transcriptional Regulation, and Forward Genetic Screening Using CRISPR-Cas12a Systems in Yarrowia lipolytica 2024, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.) DOI:10.1007/978-1-0716-3658-9_11 PMID:38468089	研究论文	本文介绍了在工业相关的油质酵母Yarrowia lipolytica中使用CRISPR-Cas12a系统进行基因编辑、转录调控和功能基因组筛选的方法	开发了一套CRISPR-Cas12a载体，用于简单多重基因敲除、抑制和激活，并构建了一个全基因组范围的引导库，用于功能基因组筛选	NA	扩展CRISPR-Cas12a系统在工业重要宿主中的合成生物学工具	Yarrowia lipolytica中的基因编辑、转录调控和功能基因组筛选	合成生物学	NA	CRISPR-Cas12a	机器学习算法	基因组数据	全基因组范围的引导库，每个基因有八倍覆盖
2569	2024-08-07	A Machine Learning Approach for Predicting Essentiality of Metabolic Genes 2024, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.) DOI:10.1007/978-1-0716-3658-9_20 PMID:38468098	研究论文	本文描述了一种使用二元分类算法预测代谢基因必需性的策略	该方法结合了基因组规模代谢模型、有向图和机器学习，形成了一个可以在小规模敲除数据上训练的预测模型	NA	识别必需基因，特别是在将原料转化为有价值产品的代谢途径工程中	代谢基因的必需性	机器学习	NA	二元分类算法	NA	基因组规模代谢模型数据	小规模敲除数据
2570	2024-08-07	Programming Juxtacrine-Based Synthetic Signaling Networks in a Cellular Potts Framework 2024, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.) DOI:10.1007/978-1-0716-3658-9_17 PMID:38468095	research paper	本文开发了一种计算框架，使用模拟细胞系（ISCL）来设计和测试合成信号网络，以促进组织形成和形态发生	提出了一个包含基本可修改特征（如粘附、运动、生长和分裂）的模拟细胞系（ISCL），并能在其中快速工程化定制遗传电路以测试和改进不同的信号网络设计	NA	旨在重新编程高等真核细胞以促进组织形成和形态发生	合成生物学领域的合成发展	synthetic biology	NA	cellular Potts modeling	NA	NA	NA
2571	2024-08-07	Genetic Network Design Automation with LOICA 2024, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.) DOI:10.1007/978-1-0716-3658-9_22 PMID:38468100	研究论文	介绍了一种名为LOICA的Python包，用于设计、建模和表征遗传网络，使用简单的面向对象设计抽象	LOICA通过将不同的生物学和实验组件表示为类，并利用Flapjack实验数据管理平台进行参数化，实现了遗传网络的高效设计和模拟	NA	开发和应用遗传设计自动化工具，以实现更复杂的合成遗传网络的高通量设计	遗传网络的设计和模拟	生物工程	NA	遗传设计自动化	面向对象设计抽象	实验数据	NA
2572	2024-08-07	Multimodal Control of Bacterial Gene Expression by Red and Blue Light 2024, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.) DOI:10.1007/978-1-0716-3658-9_26 PMID:38468104	研究论文	本文详细介绍了使用pREDusk、pREDawn、pCrepusculo和pAurora光遗传电路通过红光和蓝光控制细菌基因表达的方法	利用光遗传技术实现对细胞事件和状态的光依赖性控制，具有可逆性、非侵入性和精细的时空精度	NA	探索光遗传技术在细胞生物学、合成生物学和生物技术中的创新应用	细菌基因表达的控制	合成生物学	NA	光遗传技术	NA	NA	NA
2573	2024-08-07	In Silico Design, In Vitro Construction, and In Vivo Application of Synthetic Small Regulatory RNAs in Bacteria 2024, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.) DOI:10.1007/978-1-0716-3658-9_27 PMID:38468105	研究论文	本文介绍了一种计算预测和合成生物学方法，用于设计、构建和验证细菌中合成小调控RNA（sRNA）的功能	使用计算工具SEEDling匹配最佳种子区域与用户选择的sRNA骨架，以抑制目标mRNA，并通过Golden Gate克隆组装合成sRNA	仅以acrA mRNA在Escherichia coli中的抑制为例，未涵盖所有可能的应用场景	开发一种用于设计、构建和验证细菌中合成sRNA功能的方法	小调控RNA（sRNA）在细菌中的功能	合成生物学	NA	Golden Gate克隆	NA	RNA	以acrA mRNA在Escherichia coli中的抑制为例
2574	2024-08-07	In Vivo DNA Assembly Using the PEDA Method 2024, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.) DOI:10.1007/978-1-0716-3658-9_24 PMID:38468102	研究论文	本文介绍了PEDA方法，一种在多种微生物中直接体内组装DNA片段的新技术	PEDA方法允许在体内组装具有短至5 bp同源序列的DNA片段，效率与体外DNA组装相当	NA	提供一种简单高效的DNA组装方法，促进合成生物学的发展	多种微生物如大肠杆菌、拉氏假单胞菌、假单胞菌、植物乳杆菌和亚罗利普酵母	合成生物学	NA	PEDA方法	NA	DNA片段	多种微生物
2575	2024-08-07	Bioconversion of C1 feedstocks for chemical production using Pichia pastoris 2023-08, Trends in biotechnology IF:14.3Q1 DOI:10.1016/j.tibtech.2023.03.006 PMID:36967258	综述	本文综述了利用毕赤酵母（Pichia pastoris）进行C1原料生物转化以生产化学品的潜力和策略	探讨了毕赤酵母通过代谢工程或与电催化结合利用CO的潜力，并提出了合成生物学和材料科学的新视角	NA	探讨利用毕赤酵母进行C1原料生物转化的挑战和可行策略	毕赤酵母在C1原料生物转化中的应用	NA	NA	代谢工程	NA	NA	NA
2576	2024-08-07	Modularized synthetic biology enabled intelligent biosensors 2023-08, Trends in biotechnology IF:14.3Q1 DOI:10.1016/j.tibtech.2023.03.005 PMID:36967259	综述	本文综述了智能合成生物学驱动的生物传感器（SBBs）的最新进展及其在即时检测（POCT）和可穿戴监测中的应用	介绍了智能SBBs在计算、存储和自校准方面的能力，以及其在实际应用中的适应性	NA	探讨智能合成生物学生物传感器的发展及其应用前景	智能合成生物学生物传感器及其在即时检测和可穿戴监测中的应用	合成生物学	NA	合成生物学模块化技术	NA	NA	NA
2577	2024-08-07	Harnessing synthetic biology to enhance ocean health 2023-07, Trends in biotechnology IF:14.3Q1 DOI:10.1016/j.tibtech.2022.12.015 PMID:36669947	研究论文	本文探讨了利用合成生物学方法增强海洋健康的框架	提出利用合成生物学工具创新性地增强海洋生物系统的自然适应能力，以应对人类活动引起的快速变化	NA	探索合成生物学在解决海洋塑料污染、珊瑚白化和有害藻华等问题中的应用	海洋健康、塑料污染、珊瑚白化、有害藻华	NA	NA	合成生物学	NA	NA	NA
2578	2024-08-07	Riboswitching with ciprofloxacin-development and characterization of a novel RNA regulator 2018-02-28, Nucleic acids research IF:16.6Q1 DOI:10.1093/nar/gkx1319 PMID:29346617	研究论文	本文描述了一种新型环丙沙星响应性核糖开关的体外筛选和下一代测序引导的细胞筛选的开发过程	该核糖开关能以低纳摩尔范围的KD识别小分子药物环丙沙星，并通过配体结合稳定假结折叠，有效干扰低等和高等真核生物中的基因表达	NA	开发一种新型的环丙沙星响应性核糖开关，并展示其在酵母细胞生存中的有效、可扩展和可编程控制	环丙沙星响应性核糖开关及其在细胞生存控制中的应用	合成生物学	NA	下一代测序	NA	RNA	NA
2579	2024-08-07	Bacterially driven cadmium sulfide precipitation on porous membranes: Toward platforms for photocatalytic applications 2018-02-09, Biointerphases IF:1.6Q4 DOI:10.1116/1.5008393 PMID:29426227	研究论文	本文利用大肠杆菌在多孔聚碳酸酯膜上促进硫化镉纳米颗粒的合成，并展示了其在光催化应用中的潜力	通过微生物生物合成方法，减少了合成硫化镉纳米颗粒的能耗和有毒前体的使用浓度	NA	开发一种利用微生物进行材料制造的可行技术，以制造功能性设备	硫化镉纳米颗粒及其在光催化应用中的性能	材料工程	NA	能量色散光谱、扫描电子显微镜和透射电子显微镜	NA	图像	NA
2580	2024-08-07	Recent Developments of the Synthetic Biology Toolkit for Clostridium 2018, Frontiers in microbiology IF:4.0Q2 DOI:10.3389/fmicb.2018.00154 PMID:29483900	综述	本文综述了合成生物学工具包在梭菌属中的最新进展，特别是CRISPR工具的发展和基于梭菌的启动子及报告基因的现状与开发。	介绍了CRISPR工具在多个梭菌物种和菌株中的应用，提高了编辑的精确性、速度和效率。	尽管有进展，但低转化效率和缺乏合成生物学工具及遗传部件仍使梭菌属的代谢工程面临挑战。	旨在加速梭菌属菌株工程的发展，以便在工业上利用梭菌进行多种应用，包括生物生产多种商品产品。	梭菌属的合成生物学工具和遗传工程方法。	合成生物学	NA	CRISPR	NA	NA	多个梭菌物种和菌株