合成生物学相关文章
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当前共找到 4965 篇文献，本页显示第 241 - 260 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 241 | 2026-04-30 |
AI-Driven De Novo Binder Design: From Structure Prediction to Closed-Loop Optimization
2026, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.34133/csbj.0070
PMID:42052042
|
综述 | 总结了人工智能驱动从头设计蛋白结合物的标准化技术栈，涵盖从结构预测到闭环优化的实用工作流程 | 系统整合了结构预测、蛋白质语言模型和扩散生成建模等前沿技术，提出了从计算设计到实验反馈的完整闭环优化框架 | 面临诱导契合、负设计和数据集偏差等关键挑战，端到端复合物生成尚未实现 | 综述人工智能驱动的从头蛋白结合物设计方法，建立标准化技术栈 | 蛋白结合物（包括抗体和非抗体支架，如单抗体和设计的锚蛋白重复蛋白） | 机器学习 | NA | 结构预测、蛋白质语言模型、扩散生成建模 | 扩散模型、蛋白质语言模型 | 蛋白质序列、蛋白质结构数据 | NA | NA | NA | NA | 医学、合成生物学 |
| 242 | 2026-04-30 |
Artificial intelligence and synthetic biology in traditional Chinese medicine: revolutionizing public health applications
2026, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2026.1789960
PMID:42052276
|
综述 | 探讨人工智能与合成生物学在中医药现代化中的应用，以推动公共卫生领域的革新 | 首次系统综述人工智能与合成生物学的协同作用，提出将中医药从经验实践转化为标准化、循证公共卫生干预的路径 | 综述性质缺乏实验验证，未来需增强AI可解释性、扩展生物数据库及优化跨学科协作 | 分析人工智能与合成生物学如何解决中医药面临的资源不可持续、多靶点机制模糊及标准化不足等挑战 | 中医药的活性化合物、临床诊疗体系及公共卫生应用 | 机器学习 | COVID-19 | NA | NA | 文本 | NA | NA | NA | NA | 医学, 制药 |
| 243 | 2026-04-30 |
Synthetic Immunotherapy: Programming Immune Cells with Novel and Sophisticated Logic Capabilities
2022-09, Transplantation and cellular therapy
IF:3.6Q1
DOI:10.1016/j.jtct.2022.06.001
PMID:35691572
|
综述 | 综述合成免疫学在编程免疫细胞以实现新型复杂逻辑功能方面的进展，特别是针对CAR T细胞疗法的局限性提出合成生物学解决方案 | 提出“合成免疫疗法”这一新子领域概念，强调通过合成生物学工具赋予T细胞更高级的布尔逻辑能力，如多抗原识别和增强持久性 | CAR T细胞疗法仍不成熟，存在对表达抗原的正常组织的毒性以及细胞因子毒性等严重局限性 | 探讨如何利用合成生物学解决CAR T细胞疗法的局限性，推动免疫疗法向合成免疫疗法方向发展 | 嵌合抗原受体（CAR）T细胞 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 244 | 2026-04-30 |
Budding yeast as a factory to engineer partial and complete microbial genomes
2020-Dec, Current opinion in systems biology
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.coisb.2020.09.003
PMID:33015421
|
综述 | 该论文综述了利用芽殖酵母作为工厂来工程化部分和完整微生物基因组的最新进展 | 总结了酵母在合成生物学中作为宿主进行高效基因组编辑的新方法，以及快速合成、组装和修改病毒与细菌基因组以应对新兴病原体的潜力 | 大型DNA分子（超过2百万碱基对）难以克隆、细菌基因组的拯救困难，以及技术的双重用途潜力需谨慎考虑 | 探讨酵母细胞在微生物基因组工程中的应用及其生物学意义 | 芽殖酵母及微生物基因组（包括病毒和细菌基因组） | 合成生物学 | NA | 基因组编辑 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 芽殖酵母 | 基因组合成与组装 | 医学、工业生物技术 |
| 245 | 2026-04-30 |
Synthetic Biology of Small RNAs and Riboswitches
2018-05, Microbiology spectrum
IF:3.7Q2
|
综述 | 综述小RNA和核糖开关在合成生物学中的应用 | 涵盖了从小RNA和核糖开关的基础研究到代谢工程、正交基因控制、生物传感器、逻辑门及RNA-RNA相互作用测定等最新应用 | 这些RNA调控机制的理解和表征尚不完整，基础研究带来挑战 | 总结小RNA和核糖开关的合成生物学应用及未来发展方向 | 小RNA和核糖开关 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 细菌和古菌 | 生物传感器、逻辑门、代谢通路 | 工业生物技术 |
| 246 | 2026-04-29 |
Microbial lipases: Catalyzing sustainable solutions for industrial innovations
2026-Jul, Enzyme and microbial technology
IF:3.4Q2
DOI:10.1016/j.enzmictec.2026.110869
PMID:41946009
|
综述 | 该综述文章全面回顾了微生物脂肪酶在工业创新中的应用，涵盖其来源、筛选、生产、纯化及表征等方面 | 强调了合成生物学、宏基因组学、CRISPR-Cas技术、酶工程及AI辅助建模在识别和定制具有所需特性的脂肪酶中的革命性作用 | 未明确说明，但作为综述可能缺乏对特定系统验证的深度讨论 | 探讨微生物脂肪酶在可持续工业创新和绿色化学中的关键作用 | 微生物脂肪酶，包括来自细菌、真菌和酵母的脂肪酶 | 机器学习 | NA | CRISPR-Cas, 宏基因组学, 酶工程 | NA | 文本 | NA | CRISPR-Cas9, 酶工程 | 芽孢杆菌属, 无色杆菌属, 产碱菌属, 节杆菌属, 假单胞菌属, 青霉属 | NA | 工业生物技术, 医药, 食品与饮料, 纺织, 皮革, 洗涤剂, 生物燃料 |
| 247 | 2026-04-29 |
WRKY Transcription Factors: Integral Regulators of Defence Responses to Biotic Stress in Crops
2026-May, Plant biotechnology journal
IF:10.1Q1
DOI:10.1111/pbi.70542
PMID:41524271
|
综述 | 综述WRKY转录因子在作物生物胁迫防御反应中的核心调控作用 | 系统总结了WRKY在多种生物胁迫（真菌、细菌、卵菌、病毒、害虫）中的调控机制，并探讨了利用多组学与精准基因编辑、合成生物学、基因驱动和人工智能整合提升作物抗性的新方向 | 未具体讨论WRKY在不同作物或不同胁迫条件下的功能特异性差异及潜在副作用 | 阐明WRKY转录因子在作物生物胁迫防御中的调控网络及其在抗性育种中的应用潜力 | WRKY转录因子家族及其在作物生物胁迫响应中的调控模块 | 机器学习 | NA | 多组学 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 作物 | NA | 农业 |
| 248 | 2026-04-29 |
Bibliometric-Based Analysis of Global Trends and Collaborative Networks in Plant Genetic Engineering (1994-2024)
2026-May, Plant biotechnology journal
IF:10.1Q1
DOI:10.1111/pbi.70550
PMID:41553078
|
综述 | 利用文献计量学方法分析1994-2024年间植物基因工程领域的全球趋势与合作网络 | 揭示了中美主导的双核心国际合作结构，以及‘一带一路’倡议对技术传播的影响，并识别出技术生命周期的三个不同阶段 | NA | 系统分析植物基因工程领域的全球研究趋势和国际合作格局 | 1994-2024年间全球植物基因工程相关文献 | 文献计量分析 | NA | 文献计量学 | NA | 文献数据 | 1994-2024年间的全球文献数据 | 农杆菌介导转化, RNA干扰, CRISPR-Cas9 | 烟草植物 | NA | 农业 |
| 249 | 2026-04-29 |
Reconstitution of Archaeal Membrane Lipid Biosynthesis in Bacterial and Eukaryotic Hosts
2026-Apr-28, Chembiochem : a European journal of chemical biology
IF:2.6Q3
DOI:10.1002/cbic.202500981
PMID:42046273
|
综述 | 介绍在细菌和真核宿主中重构古菌膜脂生物合成的研究进展 | 系统综述了通过合成生物学和代谢工程实现古菌脂质合成途径的跨域重构，并发现细菌和真核酶对古菌脂质前体具有显著的底物混杂性，从而无需古菌酶即可合成多种古菌脂质 | 未明确提及现有研究的局限性 | 研究古菌膜脂生物合成途径的重构、宿主系统及工程策略，探讨脂质分界的演化含义及生物技术应用 | 古菌膜脂生物合成途径及其在细菌和真核宿主中的重构 | 合成生物学 | NA | 合成生物学、代谢工程 | NA | NA | NA | NA | 大肠杆菌(Escherichia coli), 酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae) | 古菌脂质生物合成途径，包括核心古菌酶的表达和异戊二烯前体供应的增强 | 工业生物技术、医药 |
| 250 | 2026-04-29 |
GAN-GA: A Deep-Evolutionary Approach for Synthesizing Functionally Similar Heat Shock Proteins
2026-Apr-27, IEEE journal of biomedical and health informatics
IF:6.7Q1
DOI:10.1109/JBHI.2026.3688058
PMID:42043999
|
研究论文 | 提出GAN-GA混合框架，结合生成对抗网络与遗传算法以设计功能相似的热激蛋白 | 将Wasserstein GAN与多目标遗传算法NSGA-II结合，在蛋白质序列生成后加入理化性质优化阶段，克服传统生成方法缺乏功能验证的局限 | 未详细说明对生成蛋白质的湿实验验证结果，论文仅描述序列优化阶段未提及实际蛋白质表达与功能测试 | 开发一种无需天然模板的从头蛋白质设计方法，生成具有生物学相关性的功能蛋白序列 | 合成热激蛋白HSP70和HSP90的序列设计 | 机器学习 | NA | 蛋白质序列生成 | Wasserstein GAN, NSGA-II, ProtBert, ESM, 变分自编码器, 强化学习 | 蛋白质序列 | NA | NA | NA | NA | 医学, 工业生物技术 |
| 251 | 2026-04-29 |
Photoperiod-dependent regulation of secondary growth by auxin flux: how it occurs and how to benefit from it
2026-Apr-27, Biological reviews of the Cambridge Philosophical Society
DOI:10.1002/brv.70175
PMID:42046427
|
综述 | 综述光周期通过生长素流调控树木次生生长的机制及其潜在应用 | 提出生长素流作为光周期调控次生生长的关键机制，并探讨合成生物学方法调控光周期-生长素流关系以优化树木性能 | 现有证据尚不充分，部分分子机制（如FT/TFL1样和CCA1/LHY样因子）的作用未完全明确 | 阐述光周期通过生长素流调控次生生长的机制，并探索利用该机制增强树木生长和干旱抗性的策略 | 温带森林树木（尤其杨树）的次生生长过程 | 植物生物学、森林科学、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学方法 | 杨树（Populus） | 设计光周期不敏感的生长素生物合成回路 | 环境（碳封存）、农业（林木优化）、工业生物技术 |
| 252 | 2026-04-29 |
A biosynthetic survey of hypocrealean biocontrol fungi
2026-Apr-16, Nature chemical biology
IF:12.9Q1
DOI:10.1038/s41589-026-02201-5
PMID:41991721
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研究论文 | 利用系统发育组学、代谢组学和异源表达方法，调查了82种与植物和昆虫相关的肉座菌目真菌的生物合成基因簇及其天然产物 | 首次系统性地对肉座菌目生防真菌的生物合成能力进行大规模调查，揭示了约80%的基因簇编码未知产物，并表征了四种参与未知产物合成的非核糖体肽合成酶样合成酶 | 仅涉及82种真菌，样品量有限，且主要关注生物合成基因簇与分子的关联，未能覆盖所有潜在生物活性化合物 | 探索肉座菌目真菌作为生物防治剂的生物合成潜力，为可持续农业害虫防治奠定基础 | 82种与植物和昆虫相关的肉座菌目真菌及其生物合成基因簇 | 数字病理学 | NA | 系统发育组学, 代谢组学, 异源表达 | NA | 基因组数据, 代谢组数据 | 82种真菌物种 | 异源表达 | NA | 生物合成基因簇 | 农业 |
| 253 | 2026-04-29 |
Single Molecule Force Measurements Reveal Energy Stabilization of Theophylline Aptamer RNA Switch Required for Gene Control
2026-Mar-25, ACS physical chemistry Au
IF:3.7Q2
DOI:10.1021/acsphyschemau.5c00109
PMID:41909145
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研究论文 | 利用单分子力谱测量茶碱适体RNA开关的能量稳定化机制及其在基因调控中的作用 | 首次通过光镊单分子力谱技术量化了茶碱结合对RNA适体折叠动力学的影响，发现茶碱通过稳定结构而非诱导构象重排来调控基因表达 | 未提及实验局限性或应用中的潜在挑战 | 揭示茶碱适体RNA开关的折叠动力学和能量稳定化机制，为合成生物学中适体工具的设计提供依据 | 茶碱适体RNA | 合成生物学 | NA | 光镊单分子力谱（optical tweezers single-molecule force spectroscopy） | NA | 单分子力曲线 | 单分子级别的RNA分子样本 | NA | NA | 茶碱适体RNA开关（theophylline aptamer RNA switch） | 合成生物学, 医学（治疗） |
| 254 | 2026-04-29 |
Synthetic multicolor antigen-stabilizable nanobody platform for intersectional labelling and functional imaging
2025-Oct-27, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.10.27.684934
PMID:41278670
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研究论文 | 开发了一种全可见光谱抗原稳定荧光纳米抗体平台，实现多色标记和功能成像 | 通过将二十多种荧光蛋白和生物传感器工程化到八个纳米抗体中，建立了通用型抗原稳定荧光纳米抗体设计，实现仅在与同源抗原结合时才发出明亮荧光 | NA | 开发一种合成生物学驱动的抗原稳定荧光纳米抗体工具包，用于高特异性和低背景的细胞内蛋白动态研究和功能成像 | 荧光蛋白、生物传感器、纳米抗体、小鼠脑、斑马鱼胚胎 | 合成生物学 | NA | 荧光纳米抗体工程化、荧光成像 | NA | 图像 | 二十多种荧光蛋白和生物传感器、八种纳米抗体 | NA | 小鼠、斑马鱼 | 抗原稳定荧光纳米抗体电路 | 医学、生物学 |
| 255 | 2026-04-29 |
Harnessing Transient Expression Systems with Plant Viral Vectors for the Production of Biopharmaceuticals in Nicotiana benthamiana
2025-Jun-09, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26125510
PMID:40564973
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综述 | 综述了利用植物病毒载体在本氏烟中瞬时表达系统生产生物制药的关键作用与最新进展 | 阐述了病毒载体修饰、水培法和受控环境农业等创新技术如何提升可扩展性和法规合规性，并通过糖基化工程拓宽可生产的生物制药范围 | 未明确讨论瞬时表达系统在工业生产中的长期稳定性或大规模生产成本控制的具体挑战 | 强调瞬时表达系统在生物制药生产、教育、合成生物学和基因编辑中的应用潜力，并推动植物分子农业成为现代生物技术的关键组成部分 | 本氏烟中的瞬时表达系统及植物病毒载体 | 合成生物学 | NA | 瞬时表达 | NA | NA | NA | 病毒载体 | 本氏烟 | 植物病毒载体驱动的瞬时表达系统 | 医药, 生物技术 |
| 256 | 2026-04-29 |
Activation of Innate Immune Responses by a CpG Oligonucleotide Sequence Composed Entirely of Threose Nucleic Acid
2019-02, Nucleic acid therapeutics
IF:4.0Q2
DOI:10.1089/nat.2018.0751
PMID:30526333
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研究论文 | 评估完全由苏糖核酸组成的CpG寡核苷酸序列激活先天免疫反应的能力 | 首次研究了异种核酸（XNA）诱导免疫反应的潜力，具体评估了苏糖核酸（TNA）在免疫激活中的作用 | 仅观察到mRNA信号的轻微诱导和B细胞系的强烈激活，对细胞增殖影响可忽略，可能免疫效果有限 | 探究TNA作为核酸治疗候选物的免疫原性 | B细胞系及其免疫反应 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 苏糖核酸（TNA）寡核苷酸序列，基于胞嘧啶-磷酸-鸟嘌呤（CpG）序列 | 医药 |
| 257 | 2026-04-28 |
Mechanistic Insight into Conformational Control of Enzyme Activity by Genetically Encoded Metal-Responsive Switches
2026-Apr-28, Chembiochem : a European journal of chemical biology
IF:2.6Q3
DOI:10.1002/cbic.70349
PMID:42033023
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研究论文 | 探究基于遗传编码金属响应开关的酶活性构象控制机制 | 揭示双吡啶丙氨酸金属螯合残基通过局部构象变化调控酶活性的分子机制 | 仅针对两种酶中的一种进行机理验证，通用性需进一步验证 | 阐明金属响应系统中连接基团控制构象变化驱动酶活性调节的机理 | 激烈火球菌脯氨酸寡肽酶（Pfu POP） | 合成生物学 | NA | 荧光金属竞争实验、分子动力学模拟、F核磁共振波谱 | NA | 分子结构数据、荧光信号 | NA | NA | NA | 金属响应开关 | 合成生物学、生物传感、可编程催化 |
| 258 | 2026-04-28 |
Powering next-generation precision therapeutics through integrated synthetic transcriptional systems
2026-Apr-24, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2026.117308
PMID:42035420
|
综述 | 通过整合合成转录系统推动下一代精准治疗的发展 | 综述了合成启动子和合成转录因子的协调整合，结合人工智能从经验性发现转向理性预测设计，实现动态、时空精确调控，提升治疗精准度并减少脱靶效应 | 文中未明确讨论系统的潜在局限性 | 总结工程化和整合系统的进展，强调动态调控策略及其治疗应用 | 合成启动子与合成转录因子构成的整合系统 | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 哺乳动物细胞 | 逻辑门、反馈环路、可调系统 | 医学 |
| 259 | 2026-04-28 |
From Design to Practice: A Comprehensive Tutorial for the Rapid Multiplex Engineering of Escherichia coli Using Antibiotic Resistance Markers
2026-Apr-20, Bio-protocol
IF:1.0Q3
DOI:10.21769/BioProtoc.5665
PMID:42037765
|
研究论文 | 提供使用抗生素标记快速多重改造大肠杆菌的全面教程 | 整合15种抗生素抗性盒实现10-15个基因组修饰在3周内完成，并提供详细设计指南 | 不适用于需要无疤痕修饰的场景，且主要针对易操作微生物 | 建立一种快速、高效的多重基因组工程方法 | 大肠杆菌 | 合成生物学 | NA | 重组工程 | NA | 实验方法 | NA | 重组工程，抗生素标记 | 大肠杆菌 | 多重基因组修饰 | 工业生物技术 |
| 260 | 2026-04-28 |
Modular Deep Learning for Direct RNA Sequence Design via Self-Contained RNA Units
2026-Apr-18, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.16.719021
PMID:42039474
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研究论文 | 提出了一种基于自包含RNA单元（SCRU）的模块化深度学习框架，用于直接设计RNA序列 | 通过构建包含超过61,000个自包含RNA单元（SCRU）的SCRU-DB数据库，将RNA分解为结构自主的模块，突破了传统方法依赖高分辨率3D结构数据的瓶颈，并实现了直接O(1)预测和高效扩散采样 | 未提及具体局限性，但可能依赖于SCRU数据库的完整性和结构聚类准确性 | 开发可扩展且物理合理的RNA序列设计方法 | RNA序列及其自包含结构单元 | 合成生物学, 深度学习 | 不适用 | 深度学习, 3D结构聚类, GNN | 图神经网络（GNN）, 扩散模型 | 序列, 3D结构数据 | 超过61,000个自包含RNA单元（SCRU），涵盖8,200多个独特结构簇 | 不适用 | 不适用 | 不适用 | 合成生物学 |