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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 241 | 2026-03-10 |
seq2ribo: Structure-aware integration of machine learning and simulation to predict ribosome location profiles from RNA sequences
2026-Feb-09, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.02.08.700508
PMID:41726975
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研究论文 | 本文介绍了一种名为seq2ribo的混合模拟与机器学习框架,用于仅基于mRNA序列预测核糖体A位点位置 | 结合了结构感知的TASEP模拟与机器学习抛光模型,无需表达数据或基因组背景,在多种细胞类型中实现高保真预测 | NA | 开发一种工具,用于从RNA序列预测核糖体位置分布,以支持合成生物学中的mRNA序列理性设计 | mRNA序列及其对应的核糖体位置分布 | 机器学习 | NA | 核糖体分析(Ribo-seq)、RNA-seq | 混合框架(结构感知TASEP与抛光模型) | 序列数据 | 多种细胞类型(iPSC、HEK293、LCL、RPE-1) | NA | NA | NA | 合成生物学 |
| 242 | 2026-03-10 |
Geneticability of Live-Cell Site-Specific Synthesis of Quantum Dots
2026-Feb-02, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202519974
PMID:41414644
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研究论文 | 本文提出了一种在活体哺乳动物细胞内实现功能无机纳米材料分子级空间精确合成的遗传可编程方法 | 通过基因编码富含半胱氨酸的蛋白质标签1DFS,并调控其细胞内固有代谢途径,实现了有机与无机分子在活细胞特定蛋白质位点的精确协同生长量子点,为蛋白质提供独特荧光功能 | NA | 开发一种遗传可编程平台,用于在活体细胞特定分子位点精确合成无机纳米材料,以增强生物体的精确操纵、监测和功能 | 活体哺乳动物细胞、病毒核蛋白(NP)、量子点(QD) | 合成生物学 | NA | 基因编码、代谢途径调控 | NA | NA | NA | 基因编码 | 哺乳动物细胞 | 通过1DFS蛋白质标签介导的有机-无机分子协同生长量子点的合成路径 | 医学、工业生物技术 |
| 243 | 2026-03-10 |
Harnessing synthetic biology for energy-efficient bioinspired electronics: applications for logarithmic data converters
2026-Feb-02, Communications engineering
DOI:10.1038/s44172-026-00589-5
PMID:41629453
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研究论文 | 本文提出了一种将合成基因回路映射到仿生电子架构的计算框架,并开发了一种基于对数编码的低功耗对数模数转换器 | 利用合成基因回路作为高效计算模型,为合成生物学与仿生电子设计的融合提供了一个平台,实现了对数编码在空间资源效率上的最大化 | NA | 探索合成生物学在能源高效仿生电子学中的应用,特别是针对对数数据转换器的设计 | 合成基因回路与仿生电子架构 | 合成生物学与电子工程交叉领域 | NA | 合成基因回路设计、对数编码技术 | 计算框架、对数模数转换器(ADC)模型 | 电流模式信号 | NA | 合成基因回路 | NA | 合成基因回路作为高效计算模型 | 能源、电子 |
| 244 | 2026-03-10 |
DAPE cloning with modified primers for producing designated lengths of 3' single-stranded ends in PCR products
2025, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0318015
PMID:39946422
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研究论文 | 本文介绍了一种名为DAPE的DNA组装方法,通过修饰引物在PCR产物中产生指定长度的3'单链末端,用于高效精确的DNA克隆 | DAPE方法克服了传统SLIC技术对小DNA片段(如gRNA和表位标签)组装效率低的问题,能在单次反应中精确组装不同大小的DNA片段 | NA | 开发一种改进的DNA组装技术,以促进合成生物学中多基因电路的构建 | DNA片段,特别是小片段如gRNA和表位标签 | 合成生物学 | NA | PCR,DNA组装,磷酸硫酯修饰,T5外切酶处理 | NA | NA | NA | DAPE(DNA Assembly with Phosphorothioate and T5 Exonuclease) | NA | 多基因电路 | 工业生物技术 |
| 245 | 2026-03-09 |
Macrophages: Redefining extracellular matrix architecture through phenotypic switches as therapeutic targets
2026-Jul, Biomaterials
IF:12.8Q1
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综述 | 本文综述了巨噬细胞在组织稳态中的核心作用,重点探讨其表型转换对细胞外基质结构的重塑及其作为治疗靶点的潜力 | 整合多组学分析、合成生物学和AI辅助生物材料,开发能动态调控巨噬细胞功能的‘智能’疗法 | 在实现时空精准调控和平衡促修复与促纤维化结果方面仍面临挑战 | 深入理解巨噬细胞生物学,探索其在疾病治疗中的转化潜力 | 巨噬细胞的发育起源、表型异质性及其在细胞外基质重塑、免疫监视和器官稳态中的作用 | NA | NA | 多组学分析、合成生物学、AI辅助生物材料 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 246 | 2026-03-09 |
Biotechnological advances in key regulatory genes of phenylpropanoid and terpenoid biosynthesis pathways in Panax ginseng: Current insights and future prospects
2026 May-Jun, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.108840
PMID:41663015
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综述 | 本文综述了人参中苯丙烷类和萜类生物合成途径关键调控基因的生物技术研究进展,包括基因发现、功能表征及前沿技术应用 | 聚焦于利用基因组编辑、CRISPR调控、代谢工程和合成生物学等前沿技术,重新编程代谢通量以增强人参皂苷等代谢物生产,并整合组学策略与系统生物学模型 | NA | 阐明和操纵人参中苯丙烷类和萜类生物合成途径的关键基因,以开发具有改善生物活性化合物谱的优良人参品种 | 人参(Panax ginseng)及其次级代谢产物,特别是苯丙烷类途径的黄酮类和多酚,以及萜类途径的人参皂苷 | NA | NA | 基因组编辑、CRISPR调控、代谢工程、合成生物学、组学策略、系统生物学模型 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 人参(Panax ginseng) | 代谢途径工程,特别是苯丙烷类和萜类生物合成途径 | 医药 |
| 247 | 2026-03-09 |
Recent advances in computer-aided engineering of microbial synthesis and nutritional functions of fucosylated oligosaccharides
2026 May-Jun, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.108849
PMID:41740692
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综述 | 本文综述了岩藻糖基化寡糖的微生物合成进展,重点介绍了计算机辅助工程在提高产量和工业应用中的作用 | 结合生物信息学与合成生物学方法,实现岩藻糖基化寡糖的精确和可扩展生产 | NA | 探讨岩藻糖基化寡糖的微生物合成策略及其计算机辅助生产的潜力 | 岩藻糖基化寡糖 | 合成生物学 | NA | 合成生物学、代谢工程、生物信息学、虚拟筛选 | NA | NA | NA | 合成生物学方法 | 工程微生物菌株 | 代谢途径工程,包括提高岩藻糖基转移酶活性和供应GDP-岩藻糖前体 | 医药、食品 |
| 248 | 2026-03-09 |
Engineering microbial therapeutics for metabolic disorders: synthetic biology strategies and future direction
2026-Apr, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2026.103440
PMID:41592357
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综述 | 本文综述了合成生物学在工程化益生菌和微生物系统作为自调节活体疗法中的应用,以应对代谢性疾病 | 利用合成生物学策略开发工程化微生物作为可持续、自适应的活体疗法,整合精准治疗与生物基生产 | NA | 评估合成生物学如何使工程化益生菌和微生物系统成为代谢性疾病的自我调节活体疗法 | 代谢性疾病(如2型糖尿病、肥胖、代谢功能障碍相关脂肪性肝炎) | NA | 代谢性疾病 | 合成生物学 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | 益生菌, 微生物系统 | 生物传感器, 逻辑门, 代谢通路 | 医学 |
| 249 | 2026-03-09 |
Biodesulfurization: Back on-stage through synthetic biology and metabolic engineering approaches
2026-Apr, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2026.103449
PMID:41687421
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综述 | 本文综述了利用合成生物学和代谢工程方法重新推动生物脱硫技术发展的最新进展,重点关注4S途径及其在红球菌和革兰氏阴性菌平台中的应用 | 整合了红球菌野生型性能、调控机制、系统生物学和基因工程的最新进展,以及革兰氏阴性菌平台中操纵子重构和底盘设计与工艺限制的融合 | NA | 探讨通过合成生物学和代谢工程方法克服传统加氢脱硫技术对持久性有机硫化合物处理不足的问题 | 中馏分燃料中的持久性有机硫化合物及其生物脱硫途径 | NA | NA | 合成生物学、代谢工程、系统生物学、基因工程 | NA | NA | NA | 操纵子重构、底盘设计、染色体整合 | 红球菌、假单胞菌 | 4S脱硫途径、调控逻辑(硫源抑制、遗传调控因子)、操纵子架构(基因顺序、翻译调控) | 能源、工业生物技术 |
| 250 | 2026-03-09 |
Metabolic engineering of microorganisms for the valorization of C2 feedstocks
2026-Apr, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2026.103457
PMID:41747573
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综述 | 本文综述了利用代谢工程改造微生物以将C2原料转化为高价值化学品和材料的最新进展 | 重点介绍了非天然和计算设计的途径、合成生物学与人工智能驱动的设计整合,以及构建下一代电气化和数字化引导的C2生物精炼厂 | NA | 总结并推动基于C2原料的生物制造技术,以支持低碳化学生产 | 微生物(如大肠杆菌、假单胞菌属、光合宿主)及其代谢途径 | NA | NA | 代谢工程、合成生物学、酶工程、基因组尺度代谢模型、人工智能驱动设计 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | 大肠杆菌, 假单胞菌属, 光合宿主 | 反向β-氧化、基于醛醇缩合的碳延伸、硫胺素焦磷酸依赖性模块、C1-to-C2平台策略 | 工业生物技术, 能源, 材料 |
| 251 | 2026-03-09 |
Sea buckthorn for future foods: bioactive mechanisms, synthetic biology, and precision delivery systems
2026-Apr-01, Food research international (Ottawa, Ont.)
DOI:10.1016/j.foodres.2026.118364
PMID:41763752
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综述 | 本文综述了沙棘生物活性成分的作用机制、合成生物学在提升其功能成分产量中的应用,以及基于纳米技术的精准递送系统,旨在推动沙棘在未来食品系统中的大规模应用 | 整合了合成生物学(如CRISPR/Cas9介导的代谢工程)与纳米技术递送系统,为提升沙棘生物活性成分的产量、功能性和生物利用度提供了创新框架 | NA | 探讨沙棘作为功能性食品的开发潜力,并推动其在未来食品系统中的大规模应用 | 沙棘(Hippophae rhamnoides)及其生物活性成分(类黄酮、类胡萝卜素、脂肪酸、维生素、多糖) | NA | NA | CRISPR/Cas9介导的代谢工程、精准发酵 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | NA | 代谢工程 | 食品, 工业生物技术 |
| 252 | 2026-03-09 |
From toxin to biofuel: engineering microbes for methanol biomanufacturing
2026-Apr, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2026.103442
PMID:41610456
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综述 | 本文综述了利用甲醇作为一碳原料生产生物燃料的工程微生物研究进展 | 系统总结了甲醇细胞毒性机制,并探讨了代谢通路重构、区室化和适应性进化等工程策略以提升甲醇利用和耐受性 | NA | 推动可持续甲醇生物制造的发展 | 天然和合成甲基营养菌 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 甲基营养菌 | 代谢通路重构 | 能源 |
| 253 | 2026-03-09 |
Microbial spies and bloggers: programming cells to convert environmental information into discernible signals
2026-Apr, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2026.103436
PMID:41616686
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综述 | 本文综述了利用合成生物学和微生物工程将细胞编程为生物传感器,以在复杂环境中转换环境信息为可检测信号的最新进展 | 整合生物分子设计、微生物组工程和合成生物学的新兴技术,开发了基于电化学、气相色谱、高光谱成像和下一代测序等输出的生物传感器,并利用宏基因组数据挖掘和蛋白质开关设计加速传感组件多样化 | 现有生物传感器在土壤、沉积物和废水等难以成像环境中的应用仍存在严重限制,且需要负责任的发展和现代化监管框架 | 探索和开发微生物作为生物传感器,用于在复杂环境中监测和转换环境信息 | 微生物细胞和群落,特别是未驯化的微生物,作为生物传感器的底盘 | 合成生物学 | NA | 电化学、气相色谱、高光谱成像、下一代测序、宏基因组数据挖掘 | NA | 环境理化信息、生化信号 | NA | 生物分子设计、微生物组工程、合成生物学 | 微生物细胞和群落 | 生物传感器,包括转录调节器和变构蛋白质开关,用于直接调节报告输出 | 环境 |
| 254 | 2026-03-09 |
Cytochrome P450-mediated structural diversification of diketopiperazine alkaloids
2026-Mar-06, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2026.103476
PMID:41793977
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综述 | 本文综述了细胞色素P450酶在2,5-二酮哌嗪(DKP)结构多样化中的关键作用及其在药物发现中的应用 | 重点阐述了P450酶除羟基化外,在DKP二聚化、核碱基偶联和分子内环化等催化多样性方面的最新进展,并探讨了利用工程化P450变体进行可持续生物合成的新兴策略 | NA | 探讨P450酶如何扩展DKP的结构多样性并推动基于DKP的药物发现创新 | 2,5-二酮哌嗪(DKPs)及其P450介导的氧化修饰产物 | NA | NA | 细胞色素P450酶催化、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 药物发现、天然产物生物合成 |
| 255 | 2026-03-09 |
Green Biosynthesis of Terpenoid-Derived Flavor and Fragrance Compounds: Advances and Strategic Perspectives
2026-Mar-04, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.5c08719
PMID:41718042
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综述 | 本文系统综述了利用合成生物学策略绿色生物合成萜类香料化合物的最新进展、关键工程策略及未来展望 | 从低成本底物利用、宿主菌株适配性、酶修饰、动态途径调控、细胞区室化和毒性耐受性增强等综合视角,系统总结了萜类生物合成的关键工程策略,并探讨了多策略与先进技术整合的未来方向 | NA | 为萜类化合物的可持续生产提供关键见解和指导 | 萜类及其衍生物(香料化合物) | 合成生物学 | NA | 生物合成、酶工程、途径调控 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly | 微生物细胞工厂(如大肠杆菌、酿酒酵母等) | 代谢途径工程、动态调控回路、生物传感器 | 食品, 工业生物技术 |
| 256 | 2026-03-09 |
Synthetic Biology Approaches to Study Maize Signaling Pathways
2026-Mar-02, Cold Spring Harbor protocols
DOI:10.1101/pdb.top108450
PMID:40074299
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综述 | 本文综述了合成生物学方法在玉米信号通路研究中的应用,特别是通过异源表达系统(如酵母中的AuxInYeast系统)来解析玉米生长素信号通路 | 利用酵母作为异源底盘来重构玉米核生长素响应系统(AuxInYeast),提供了一种快速、高通量的假设生成平台,用于研究信号通路的进化、遗传和生化特性 | NA | 应用合成生物学原理和方法研究玉米信号通路,以推动基础生物学理解和育种工具开发 | 玉米信号通路,特别是生长素信号通路 | 合成生物学 | NA | 异源表达、荧光流式细胞术 | NA | NA | NA | NA | 酵母 | 玉米核生长素响应系统在酵母中的重构(AuxInYeast系统) | 农业 |
| 257 | 2026-03-09 |
BOTany methods: accessible automation for plant synthetic biology
2026-Mar-02, Plant physiology
IF:6.5Q1
DOI:10.1093/plphys/kiag066
PMID:41715940
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研究论文 | 本文开发了一套基于Opentrons OT-2机器人的模块化BOTany方法,旨在为植物合成生物学提供可访问的自动化实验方案 | 为缺乏液体处理机器人的研究人员提供了低成本、易修改的自动化解决方案,支持从简单重复任务到复杂分子克隆操作的全流程自动化 | 依赖特定机器人平台(Opentrons OT-2),且未在多种植物宿主系统中广泛验证 | 降低植物合成生物学实验自动化门槛,提高实验通量和可重复性 | 植物合成生物学实验流程 | 合成生物学 | NA | 植物模块化克隆(Plant MoClo)、细菌转化、质粒提取、PCR | NA | 实验操作流程 | NA | Opentrons OT-2 | 植物, 细菌 | 模块化克隆系统 | 农业, 工业生物技术 |
| 258 | 2026-03-09 |
Protein-glycan engineering in vaccine design: merging immune mechanisms with biotechnological innovation
2026-Mar, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2025.06.022
PMID:40713219
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综述 | 本文综述了蛋白质-糖基工程在疫苗设计中的应用,结合免疫机制与生物技术创新以提升疫苗效力 | 整合CRISPR糖基编辑、合成生物学和糖基修饰纳米颗粒等前沿技术,实现对糖基结构的精确控制,以增强抗原呈递和免疫激活 | NA | 探讨蛋白质-糖基工程如何通过控制糖基结构来优化疫苗设计,针对新兴病原体、肿瘤和自身免疫性疾病 | 糖基在免疫识别中的作用,包括感染、癌症和自身免疫中的糖基介导机制 | 生物技术 | 感染性疾病、癌症、自身免疫性疾病 | CRISPR糖基编辑、合成生物学、糖基修饰纳米颗粒 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | NA | NA | 医学 |
| 259 | 2026-03-09 |
The dual role of teichoic acids in gram-positive bacteria: Structural diversity dictates pathogenic and probiotic functions
2026-Mar, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2026.150925
PMID:41692204
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综述 | 本文综述了革兰氏阳性细菌中磷壁酸的结构多样性如何决定其致病性和益生功能的双重作用 | 系统比较了病原体和益生菌中壁磷壁酸和脂磷壁酸,并探讨了合成生物学方法重新设计磷壁酸合成的潜力 | NA | 阐明磷壁酸的结构多样性如何调控其与宿主的双重相互作用,并探索其在功能食品和精准营养策略中的应用 | 革兰氏阳性细菌中的磷壁酸 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医药, 食品 |
| 260 | 2026-03-09 |
Strategies for Metabolic Engineering of Escherichia coli for β-Carotene Biosynthesis
2026-Feb-10, Molecules (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/molecules31040611
PMID:41752388
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综述 | 本文总结了在大肠杆菌中通过代谢工程策略生产β-胡萝卜素的方法 | 系统综述了在大肠杆菌中生产β-胡萝卜素的多种代谢工程策略,包括内源MEP途径操作、杂合MVA途径引入、中心碳代谢调控、细胞膜修饰及发酵过程优化 | NA | 为设计高效的β-胡萝卜素生产菌株提供理论见解,并为有价值的类胡萝卜素和类胡萝卜素衍生物的可持续生产奠定基础 | 大肠杆菌(Escherichia coli) | 合成生物学 | NA | 代谢工程 | NA | NA | NA | NA | 大肠杆菌 | β-胡萝卜素生物合成途径,包括内源MEP途径和引入的杂合MVA途径 | 食品, 制药, 化妆品 |