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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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241 | 2025-03-29 |
Advancements in Escherichia coli secretion systems for enhanced recombinant protein production
2025-Mar-03, World journal of microbiology & biotechnology
IF:4.0Q2
DOI:10.1007/s11274-025-04302-0
PMID:40025370
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综述 | 本文综述了大肠杆菌分泌系统在增强重组蛋白生产方面的进展 | 探讨了天然和工程化的大肠杆菌分泌系统,以及通过基因工程、诱变和合成生物学方法提高蛋白产量、折叠和分泌效率的最新进展 | 大肠杆菌的细胞能力有限,蛋白聚集问题仍未完全解决 | 提高重组蛋白的产量和分泌效率 | 大肠杆菌及其分泌系统 | 微生物学 | NA | 基因工程、诱变、合成生物学 | NA | NA | NA |
242 | 2025-03-29 |
Triblock Proteins with Weakly Dimerizing Terminal Blocks and an Intrinsically Disordered Region for Rational Design of Condensate Properties
2024-03, Small (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/smll.202306817
PMID:37964343
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research paper | 该研究通过蛋白质工程构建了一种具有可变末端块和三段式结构的蛋白质,用于理性设计冷凝物的性质 | 利用弱二聚化末端块和内在无序区域的可调性,实现了冷凝物形成的可预测和理性设计 | 物理性质(如扩散速率)与二聚化强度无直接相关性,需进一步研究 | 研究冷凝物形成的理性设计及其在生物合成材料、合成生物学等领域的应用 | 具有可变末端块和三段式结构的蛋白质 | 合成生物学 | NA | 蛋白质工程 | NA | NA | 一组适合作为末端块的蛋白质 |
243 | 2025-03-28 |
Extracellular Bacterial Production of DNA Hydrogels-Toward Engineered Living Materials
2025-Mar-27, Small (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/smll.202502199
PMID:40143682
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研究论文 | 该研究首次利用外电细菌Shewanella oneidensis生产DNA水凝胶,为工程化活材料(ELMs)的开发奠定了基础 | 首次在活细菌环境中开发DNA水凝胶,并利用SpyCatcher/SpyTag技术实现外源聚合酶的细胞表面锚定 | 研究仅使用了Shewanella oneidensis一种细菌,未探索其他微生物系统的适用性 | 开发具有导电性和代谢活性的动态生物混合材料系统 | 外电细菌Shewanella oneidensis和DNA水凝胶 | 合成生物学 | NA | SpyCatcher/SpyTag技术 | NA | NA | NA |
244 | 2025-03-28 |
Orthogonal Host-Guest Interactions Enable Programming of Protocell Membranes for Cellular High-Order Assembly and Enhanced Immunogenicity
2025-Mar-26, ACS applied materials & interfaces
IF:8.3Q1
DOI:10.1021/acsami.4c20476
PMID:40067075
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研究论文 | 本文提出了一种通过正交主客体相互作用编程原生细胞膜的方法,用于细胞高阶组装和增强免疫原性 | 利用β-环糊精(β-CD)作为宿主实体,通过主客体相互作用在微囊膜上对接功能分子,实现了细胞样膜表面的可编程性 | 未提及该方法在大规模生产中的可行性和成本效益 | 开发一种可编程的治疗性原生细胞平台,模拟真实的细胞间相互作用 | 多糖基微囊(P-somes)和巨噬细胞 | 合成生物学与生物工程 | NA | 主客体相互作用 | NA | NA | NA |
245 | 2025-03-28 |
Metabolite-Responsive Control of Transcription by Phase Separation-Based Synthetic Organelles
2025-Mar-21, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00633
PMID:39954260
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研究论文 | 该研究通过基于液-液相分离的合成细胞器,将代谢信号转化为基因转录调控 | 利用液-液相分离技术构建合成细胞器,实现代谢信号对基因转录的可逆调控 | 目前仅验证了丙酮酸代谢信号的特异性响应,未测试其他代谢物的广泛适用性 | 开发具有生命体感知和适应能力的合成生物材料 | 基于PdhR阻遏蛋白的合成细胞器系统 | 合成生物学 | NA | 液-液相分离技术 | NA | 生物分子相互作用数据 | NA |
246 | 2025-03-28 |
CnRed: Efficient, Marker-free Genome Engineering of Cupriavidus necator H16 by Adapted Lambda Red Recombineering
2025-Mar-21, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00757
PMID:39989320
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研究论文 | 本研究建立了一种适用于Cupriavidus necator H16的lambda Red重组系统,结合电穿孔技术,实现了高效快速的基因删除和稳定基因组整合 | 首次在线性PCR产物上应用lambda Red重组系统,并开发了高效的标记回收方法 | 研究仅验证了三个基因组位点的修改,未进行大规模应用测试 | 开发高效的基因组编辑方法以优化Cupriavidus necator H16的生产菌株 | Cupriavidus necator H16细菌 | 合成生物学 | NA | lambda Red重组系统、电穿孔技术、Cre/loxP系统 | NA | 基因组数据 | 三个不同的基因组位点 |
247 | 2025-03-28 |
Engineering a New Generation of Gene Editors: Integrating Synthetic Biology and AI Innovations
2025-Mar-21, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00686
PMID:39999982
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研究论文 | 本文探讨了如何通过合成生物学和人工智能创新来开发新一代基因编辑器 | 整合AI和机器学习技术优化基因编辑酶的发现与设计,提高活性、特异性和降低免疫原性 | 未提及具体实验验证数据或临床转化时间表 | 开发更安全高效的基因组编辑工具以促进临床转化 | CRISPR-Cas基因编辑系统及其衍生工具 | 合成生物学 | NA | AI/ML模型预测、定向进化 | 机器学习模型(未指定具体架构) | 生物分子数据 | NA |
248 | 2025-03-28 |
Potential and Optimization of Mammalian Splice Riboswitches for the Regulation of Exon Skipping-Dependent Gene Expression and Isoform Switching within the ALOX5 Gene
2025-Mar-21, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00731
PMID:40011207
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研究论文 | 本研究探讨了合成核糖开关在哺乳动物细胞中通过控制选择性剪接来调节基因表达的潜力,特别是在ALOX5基因中外显子跳跃和异构体转换的应用 | 提出了一种新型核糖开关控制剪接的概念,能够将5-LO野生型转换为缺乏外显子13的异构体(5-LOΔ13),并通过基因特异性内含子和外显子序列的上下文适应提高了调控的动态范围 | 合成核糖开关在真核系统中控制基因表达的功能通常限于特定基因或细胞类型,且非适应性构建体的引入可能导致基因开关功能的意外结果 | 探索合成核糖开关在哺乳动物细胞中通过选择性剪接调控基因表达的潜力及其优化策略 | ALOX5基因和HEK293细胞 | 合成生物学 | NA | 选择性剪接调控 | NA | 基因表达数据 | NA |
249 | 2025-03-28 |
Outlook on Synthetic Biology-Driven Hydrogen Production: Lessons from Algal Photosynthesis Applied to Cyanobacteria
2025-Mar-20, Energy & fuels : an American Chemical Society journal
IF:5.2Q1
DOI:10.1021/acs.energyfuels.4c04772
PMID:40134520
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综述 | 本文探讨了合成生物学驱动的氢生产前景,借鉴了藻类光合作用的经验应用于蓝藻 | 利用合成生物学技术精确调控PSII活性,避免传统营养剥夺方法的副作用,优化氢生产效率 | NA | 开发可持续的清洁能源生产方法,推动碳中和未来 | 蓝藻(特别是PCC 6803菌株) | 合成生物学 | NA | 基因工程、合成生物学 | NA | NA | NA |
250 | 2025-03-27 |
Introduction: Synthetic Biology
2025-Mar-26, Chemical reviews
IF:51.4Q1
DOI:10.1021/acs.chemrev.5c00158
PMID:40134283
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
251 | 2025-03-27 |
Efficient De Novo Assembly of 100 kb-Scale Human Functional Immunoglobulin Heavy Variable (IGHV) Gene Fragments In Vitro
2025-Mar-26, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00011
PMID:40135783
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research paper | 该研究提出了一种高效的无疤痕体外组装方法,用于构建功能性人类免疫球蛋白重链可变区(IGHV)基因片段 | 开发了一种基于Gibson等温组装的迭代体外组装方法,能够无疤痕地组装复杂且高度重复的百kb级IGHV基因片段 | 未提及该方法在其他类型基因组片段组装中的适用性 | 开发大规模人类基因组片段的高效体外组装技术 | 人类免疫球蛋白重链可变区(IGHV)基因片段 | 合成生物学 | NA | Gibson等温组装 | NA | DNA序列 | 百kb级的IGHV基因片段 |
252 | 2025-03-27 |
Synthetic biology approaches for improving the specificity and efficacy of cancer immunotherapy
2024-May, Cellular & molecular immunology
IF:21.8Q1
DOI:10.1038/s41423-024-01153-x
PMID:38605087
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review | 综述探讨了合成生物学在提高癌症免疫疗法特异性和有效性方面的应用 | 强调合成生物学在工程化活细胞和基因电路方面的创新工具,以增强免疫疗法的特异性、可控性和疗效 | 未提及具体实验数据或临床结果,主要基于现有研究的综述和未来展望 | 探讨合成生物学如何解决癌症免疫疗法中的挑战,如脱靶毒性和疗效持续性 | 癌症免疫疗法,特别是工程化免疫细胞和基因电路 | 合成生物学 | 癌症 | NA | NA | NA | NA |
253 | 2025-03-27 |
Advancement of Engineered Bacteria for Orally Delivered Therapeutics
2023-11, Small (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/smll.202302702
PMID:37537714
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review | 本文综述了工程化细菌用于口服治疗的最新进展,包括细菌及其生物组分的类型、工程化策略及其在疾病治疗中的应用 | 结合合成生物学和纳米技术的最新发展,对细菌进行定向基因重编程,以提高其在胃肠道中的存活率和治疗效果 | 尽管工程化细菌在口服治疗中显示出潜力,但仍面临胃肠道恶劣环境的挑战,且治疗效果在体内显著降低 | 探讨工程化细菌作为口服治疗剂的当前进展、工程化策略及其在疾病治疗中的应用 | 工程化细菌及其生物组分 | 合成生物学 | NA | 合成生物学、纳米技术 | NA | NA | NA |
254 | 2025-03-26 |
Synthetic biology approaches to improve Rubisco carboxylation efficiency in C3 Plants: Direct and Indirect Strategies
2025-Apr, Journal of plant physiology
IF:4.0Q1
DOI:10.1016/j.jplph.2025.154470
PMID:40056853
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综述 | 本文综述了合成生物学方法在提高C3植物中Rubisco羧化效率方面的直接和间接策略 | 介绍了最新的合成生物学和基因转化技术,以及通过工程化Rubisco亚基、修饰Rubisco相互作用蛋白和调整Rubisco环境等方法来优化Rubisco羧化效率 | NA | 提高C3植物中Rubisco的羧化效率,以改善光合作用性能 | C3植物中的Rubisco酶 | 合成生物学 | NA | 基因转化技术 | NA | NA | NA |
255 | 2025-03-26 |
ProteoSeeker: A Feature-Rich Metagenomic Analysis Tool for Accessible and Comprehensive Metagenomic Exploration
2025-Mar-25, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202414877
PMID:40130725
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研究论文 | 介绍了一款名为ProteoSeeker的命令行工具,用于简化宏基因组蛋白质的识别和注释 | ProteoSeeker通过自动化关键步骤,降低了计算复杂性,使专业和非专业用户都能进行高效且全面的宏基因组分析 | 未提及具体的技术限制或性能瓶颈 | 加速生物技术、合成生物学和生物医学研究与创新 | 微生物群落中的蛋白质 | 生物信息学 | NA | 宏基因组学 | NA | 宏基因组数据 | NA |
256 | 2025-03-26 |
Reprogramming Komagataella phaffii for a Robust Chassis toward Efficient De Novo Biosynthesis of (-)-α-Bisabolol
2025-Mar-25, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.4c11904
PMID:40131269
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研究论文 | 本研究通过优化MVA途径和融合法尼基二磷酸合酶与比沙波醇合酶,成功在Komagataella phaffii中实现了高效生产(-)-α-比沙波醇 | 通过工程化辅因子NADPH、分子伴侣和转录因子,构建了强健的(-)-α-比沙波醇生产菌株KB-30,并在5 L补料分批发酵罐中实现了32.8 g/L的最高产量 | 未明确提及研究的局限性 | 开发一种高效、可持续的微生物细胞工厂生产(-)-α-比沙波醇 | Komagataella phaffii菌株 | 合成生物学 | NA | 微生物发酵、代谢工程 | NA | NA | 5 L补料分批发酵罐 |
257 | 2025-03-26 |
A novel MoClo-mediated intron insertion system facilitates enhanced transgene expression in Chlamydomonas reinhardtii
2025, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2025.1544873
PMID:40123955
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研究论文 | 本文介绍了一种新型的MoClo介导的内含子插入系统,用于增强莱茵衣藻中转基因的表达 | 开发了一种与当前MoClo标准兼容的新型内含子插入策略,显著提高了转基因在莱茵衣藻中的表达效率 | NA | 提高莱茵衣藻中转基因的表达效率,推动藻类生物技术的发展 | 莱茵衣藻 | 合成生物学 | NA | Modular Cloning (MoClo) | NA | NA | NA |
258 | 2025-03-26 |
Refining minimal engineered receptors for specific activation of on-target signaling molecules
2024-12-30, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-81259-4
PMID:39738202
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研究论文 | 本研究改进了最小工程受体(MERs)的设计,以减少STAT5的非靶向激活,同时保持对特定信号分子的靶向激活 | 通过酪氨酸突变和Box1区域的丙氨酸突变,发现了一种能最小化STAT5非靶向激活的MERs变体 | 虽然减少了STAT5的非靶向激活,但略微降低了靶向信号分子的激活效率 | 开发能够精确激活特定信号分子的合成受体,用于基因和细胞治疗 | 最小工程受体(MERs)及其对信号分子的激活特性 | 合成生物学 | NA | 酪氨酸突变、丙氨酸突变 | NA | NA | NA |
259 | 2025-03-26 |
All-in-One CO2 Capture and Transformation: Lessons from Formylmethanofuran Dehydrogenases
2024-12-17, Accounts of chemical research
IF:16.4Q1
DOI:10.1021/acs.accounts.4c00623
PMID:39584476
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研究论文 | 本文探讨了甲酰甲烷呋喃脱氢酶(FMD)在CO2捕获和转化中的潜力及其在可持续化学合成中的应用 | 揭示了FMD作为一种高效的生物CO转化系统,其独特的反应机制和能量节约模式为CO2的化学回收提供了新思路 | NA | 探索生物CO激活系统在可持续化学合成中的应用,特别是FMD在CO2捕获和转化中的潜力 | 甲酰甲烷呋喃脱氢酶(FMD)及其在CO2捕获和转化中的作用 | 合成生物学 | NA | 电还原CO | NA | NA | NA |
260 | 2025-03-26 |
Understanding the Role of Layered Minerals in the Emergence and Preservation of Proto-Proteins and Detection of Traces of Early Life
2024-09-03, Accounts of chemical research
IF:16.4Q1
DOI:10.1021/acs.accounts.4c00173
PMID:39141709
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research paper | 本文探讨了层状矿物在原始蛋白质出现和保存以及早期生命痕迹检测中的作用 | 提出了矿物可能作为环境循环现象信息转录者的新观点,并探讨了伪生物标志物的识别途径 | 实验室无法完全模拟早期行星的所有过程和样本 | 研究生命起源的基本原理及其在宇宙中的意义 | 层状矿物表面与原始生物分子的相互作用 | astrobiology | NA | 分子建模技术、空间任务、湿实验室实验、理论建模 | NA | NA | NA |