合成生物学相关文章
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当前共找到 4980 篇文献，本页显示第 241 - 260 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 241 | 2026-05-07 |
Expanding salivary biomarker detection by creating a synthetic neuraminic acid sensor via chimeragenesis
2025-Jun-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.06.13.598939
PMID:38915506
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研究论文 | 通过嵌合转录因子构建检测口腔鳞状细胞癌唾液生物标志物Neu5Ac的全细胞生物传感器 | 通过嵌合体技术创建新型嵌合转录因子Sphnx，实现Neu5Ac的检测，为唾液生物标志物检测提供概念验证平台 | 仅作为概念验证，尚未应用于临床筛查，检测灵敏度和特异性有待进一步验证 | 开发基于合成生物学的全细胞生物传感器，用于早期非侵入性诊断口腔鳞状细胞癌 | 唾液中的N-乙酰-D-神经氨酸（Neu5Ac） | 合成生物学 | 口腔鳞状细胞癌 | 嵌合体技术 | NA | NA | NA | 嵌合体技术 | 工程细菌 | 全细胞生物传感器，嵌合转录因子 | 医学 |
| 242 | 2026-05-06 |
L-xylulose, a new versatile rare sugar: recent biosynthetic advances and challenges
2026-Jul-01, Food research international (Ottawa, Ont.)
DOI:10.1016/j.foodres.2026.119125
PMID:42083189
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综述 | 综述了稀有糖L-木酮糖的生物合成最新进展，分析六种酶促途径并识别两条竞争性路线，同时探讨底盘细胞构建和工业发酵的核心瓶颈 | 提出AI驱动高产菌株筛选、关键酶催化优化和靶产物高效胞外转运/分泌三大突破策略，并主张合成生物学与智能制造融合是未来发展关键方向 | 未详细对比化学合成与生物合成的成本效益，且对六种酶促途径的工业化适用性缺乏定量评估 | 系统梳理L-木酮糖生物合成进展，识别核心瓶颈并展望突破策略以推动其在食品和医药工业的应用 | L-木酮糖及其生物合成途径中的酶和底盘细胞 | 合成生物学 | NA | AI导向的高通量筛选技术、关键酶催化优化技术、胞外转运工程 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 食品工业、制药工业、化学工业 |
| 243 | 2026-05-06 |
Plant oil body engineering: A roadmap from multiscale structures to next-generation food systems
2026-Jun-01, Food chemistry
IF:8.5Q1
DOI:10.1016/j.foodchem.2026.149010
PMID:41905230
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综述 | 本文构建了植物油脂体的多尺度工程框架，从多尺度结构到下一代食品系统提供路线图 | 整合物理场、界面工程和合成生物学等多学科策略，建立了清晰的“分子结构-界面性质-宏观功能”关系，实现植物油脂体的可编程功能调控 | 技术转化面临规模化挑战以及技术经济和监管障碍 | 系统综述植物油脂体的多尺度工程方法，推动其从基础研究到工业应用 | 植物油脂体 | 合成生物学 | NA | 界面工程、合成生物学 | NA | NA | NA | 合成生物学 | 植物（种子） | NA | 食品 |
| 244 | 2026-05-06 |
Gibson Assembly of Highly Repetitive DNA
2026-May-05, Biochemistry
IF:2.9Q3
DOI:10.1021/acs.biochem.6c00002
PMID:42021475
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研究论文 | 报道了一种基于Gibson组装的模块化质粒框架，用于可扩展和序列定义地组装高度重复DNA，并以弹性蛋白样多肽为模型验证其有效性 | 提出了一种通过Gibson消化与组装工作流实现迭代重复扩增的模块化质粒框架，能够高效构建大片段重复DNA序列，并通过全质粒测序验证序列完整性 | 仅以特定重复序列（GVGVP）为模型，未测试其他类型重复序列的适用性；表征限于NEB 5-alpha细胞，未评估在更复杂宿主中的表达效果 | 开发一种通用策略用于合成高度重复DNA序列，并编码可编程蛋白质聚合物 | 编码五肽Gly-Val-Gly-Val-Pro重复序列的弹性蛋白样多肽（ELP）质粒 | 合成生物学 | NA | Gibson组装、DNA消化与组装、全质粒测序 | NA | DNA序列数据 | 构建了最大513个GVGVP重复的质粒，并表征了257个重复的功能 | Gibson Assembly | 大肠杆菌NEB 5-alpha细胞 | 迭代重复扩增的质粒架构（通过dIII和HI消化及Gibson组装实现） | 生物技术、材料科学 |
| 245 | 2026-05-06 |
RATEX: A Scalable RNA-Based Platform for Logical and Multi-Layered Cellular Programming
2026-May-05, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202520600
PMID:42083989
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研究论文 | 介绍了一种名为RATEX的可扩展RNA平台，用于逻辑和多层细胞编程 | 整合了翻译到转录的转换器与合成RNA调节器，实现了紧凑且可扩展的RNA编程电路架构，并利用天然核糖体介导的多种环境输入感知 | 构建具有宽动态范围和多重调控级联的合成RNA电路仍是一个挑战 | 开发可扩展的遗传电路以实现细胞中的复杂功能 | RNA调节器和多输入逻辑门 | 合成生物学 | NA | RNA调控、基因电路设计 | 逻辑门（OR、AND） | RNA信号、代谢物信号 | NA | RATEX平台 | 活细胞（未具体说明） | 逻辑门（多输入OR和AND门）、信号放大和级联级联 | 合成生物学、生物技术 |
| 246 | 2026-05-06 |
A comprehensive ruminant microbial catalog (CRMC) reveals convergent selection for key vitamin-synthesizing pathways and genes across ruminants and human
2026-Jan-21, GigaScience
IF:11.8Q1
DOI:10.1093/gigascience/giag016
PMID:41738843
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研究论文 | 基于8种反刍动物的2325个宏基因组样本，重建了反刍动物胃肠道微生物组参考基因组目录（CRMC），并揭示了维生素合成微生物的分布模式和途径偏好 | 构建了目前最大的反刍动物胃肠道微生物基因组目录（CRMC），包含约39,696个MAGs，图谱拼接率高达83.45%，首次系统性地揭示了反刍动物与人类在维生素合成途径和基因节点选择上的趋同演化规律 | 可能受限于样本来源的多样性及宏基因组组装的完整性，未具体分析不同宿主间维生素合成微生物的功能差异或环境因素的影响 | 系统阐明反刍动物胃肠道维生素合成微生物的功能特征、生态角色及其在宿主间的分布模式 | 8种反刍动物（牛、羊等）的胃肠道宏基因组样本及维生素合成微生物 | 微生物组学 | NA | 宏基因组学、宏基因组组装基因组（MAG）重建、维生素合成通路分析 | NA | 宏基因组测序数据 | 2325个宏基因组样本，来源于8种反刍动物宿主 | NA | 反刍动物（牛、羊等） | NA | 农业、医学 |
| 247 | 2026-05-06 |
Microbial-Derived Anti-Cancer Compounds: Advances in Drug Discovery, Bioengineering, and Therapeutic Applications
2026, Anti-cancer agents in medicinal chemistry
IF:2.6Q3
|
综述 | 综述微生物来源抗癌化合物的发现、生物工程和治疗应用进展 | 整合人工智能、机器学习、分子对接与纳米技术来加速微生物代谢产物的发现和递送 | 缺乏体内验证和全面的药代动力学数据，临床转化面临挑战 | 探讨利用人工智能与合成生物学工程化微生物菌株以产生增强生物活性化合物，并利用纳米技术优化靶向递送机制 | 微生物代谢产物及其抗癌活性 | 机器学习 | 癌症 | 分子对接 | NA | 文本 | NA | 合成生物学 | 微生物 | NA | 医学 |
| 248 | 2026-05-06 |
Concentration-Dependent CsrA Regulation of the uxuB Transcript Leads to Development of a Post-Transcriptional Bandpass Filter
2025-04-18, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00668
PMID:40202123
|
研究论文 | 利用CsrA蛋白与uxuB mRNA之间的浓度依赖性调控机制，设计了一种转录后带通滤波器 | 首次利用CsrA蛋白对uxuB mRNA的浓度依赖性双重调控（激活和抑制）特性，设计了一种基于RNA-蛋白质相互作用的转录后带通滤波器，减少了合成电路组件数量 | 未来需要对天然调控RNA-蛋白质系统进行进一步表征，以实现更复杂的RNP基电路 | 开发基于CsrA-uxuB相互作用的转录后带通滤波器，实现多信号控制 | uxuB mRNA的5'UTR和100个核苷酸编码序列与碳储存调控蛋白CsrA的相互作用 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 大肠杆菌 | 带通滤波器，基于CsrA浓度调控的ON/OFF状态转换电路 | 合成生物学 |
| 249 | 2026-05-06 |
Biophysical and structural studies on transketolases
2025, Methods in enzymology
DOI:10.1016/bs.mie.2025.07.011
PMID:41203347
|
研究论文 | 提供转酮醇酶活性、催化机制和结构分析的实验方案，涵盖稳态动力学、辅因子结合、催化中间体检测及快速动力学研究 | 整合多种生物物理和结构生物学方法，形成用于转酮醇酶基础与应用研究的综合工具集 | 未涉及具体疾病模型或临床验证，未讨论不同来源转酮醇酶间的差异 | 建立转酮醇酶功能与结构分析的标准实验方案，推动酶学、合成生物学及药物开发 | 转酮醇酶 | 结构生物学 | 癌症、代谢性疾病、神经退行性疾病 | 稳态动力学、光谱学、快速动力学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学、工业生物催化 |
| 250 | 2026-05-06 |
Special Issue "Synthetic Biology for Biosensing in Health and Environmental Applications"
2023-Oct-19, Biosensors
DOI:10.3390/bios13100937
PMID:37887130
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评论 | 本期特刊专注于合成生物学在健康与环境应用中的生物传感技术 | 通过合成生物学方法设计和构建高灵敏度、高特异性的生物传感器，以应对健康和环境监测中的挑战 | NA | 探讨合成生物学在生物传感领域的最新进展及其在健康与环境中的应用 | 生物传感器及其在健康和环境监测中的靶标分析物 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 生物传感器 | 医学, 环境 |
| 251 | 2026-05-06 |
Genetic context effects can override canonical cis regulatory elements in Escherichia coli
2022-10-14, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkac787
PMID:36134716
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研究论文 | 在大肠杆菌中，遗传背景效应可以超越经典的顺式调控元件对基因转录的影响 | 发现侧翼非编码合成序列的GC含量能独立于启动子等调控序列，显著影响报告基因的表达水平，揭示了转录倾向性的关键决定因素 | 未阐明低GC侧翼序列影响转录的分子机制，且研究仅在大肠杆菌中进行，尚未在其他宿主中验证 | 探究大肠杆菌中遗传背景对转录的影响机制及其与经典顺式调控元件的关系 | 大肠杆菌中不同GC含量侧翼序列对报告基因表达的影响 | 合成生物学 | NA | NA | NA | 表达量数据 | 涉及多种GC含量（低、中、高）的侧翼序列构建 | NA | 大肠杆菌 | 报告基因表达系统 | NA |
| 252 | 2026-05-05 |
Engineering the Liquid-to-Solid Transition of Biomolecular Condensates: Molecular Mechanisms, Control Strategies, and Applications
2026-May-03, Small (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/smll.73582
PMID:42070290
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综述 | 系统梳理了生物分子凝聚体从液态到固态转变的分子机制、控制策略及应用 | 整合生物物理学、合成生物学和材料科学，首次全面阐述液固转变的分子语法、时空控制工程策略及在生物系统设计中的新兴应用 | 当前对液固转变的精确时空控制仍面临挑战，未来需进一步探索其在系统化学和合成生物学中的设计原则 | 探讨生物分子凝聚体液固转变的工程化调控及其在疾病治疗和合成生物学中的应用 | 生物分子凝聚体及其液固转变过程 | 合成生物学 | NA | 液-液相分离观察技术、分子工程方法 | NA | NA | NA | NA | NA | 液固转变调控回路 | 医学、系统化学、合成生物学 |
| 253 | 2026-05-05 |
Deep learning architectures achieve state-of-the-art (SOTA) accuracy in protein secondary structure prediction
2026-May-03, Molecular diversity
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s11030-026-11570-x
PMID:42071121
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综述 | 本文综述了深度学习架构在蛋白质二级结构预测中达到最先进精度的最新进展 | 系统总结了混合模型设计、基准数据集和评估指标的最新进展，并讨论了未来方向如跨物种验证、不确定性感知建模和异构生物数据整合 | 当前方法存在数据依赖性和数据集偏差问题 | 综述深度学习在蛋白质二级结构预测领域的进展并指出未来方向 | 蛋白质二级结构预测方法 | 深度学习 | NA | NA | CNN, RNN, Transformer, AlphaFold2 | 蛋白质序列数据 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学, 药物开发, 疾病研究 |
| 254 | 2026-05-05 |
Breaking boundaries for PFAS surveillance in water reservoirs: CRISPR-electrochemical synergies from MXene to microfluidics- A review
2026-Apr-30, Biosensors & bioelectronics
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.bios.2026.118756
PMID:42070443
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综述文章 | 本文提出基于磺酸盐-MXene、CRISPR-Cas12a和微流体自动化协同融合的下一代PFAS监测框架 | 首次提出分子工程化磺酸盐-MXene、CRISPR-Cas12a与微流体自动化的协同融合，实现皮摩尔亲和力、阿托摩尔灵敏度和分钟级检测 | NA | 开发超越现有方法限制的超灵敏、特异、便携且低成本的PFAS监测技术 | 全氟和多氟烷基物质（PFAS） | 合成生物学，环境监测 | NA | CRISPR-Cas12a，微流体技术 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas12a | NA | 生物传感器，基于适体的CRISPR检测电路 | 环境监测，水安全 |
| 255 | 2026-05-05 |
Osmotic signaling governs sunscreen biosynthesis to safeguard desert cyanobacteria against desiccation
2026-Apr, mLife
IF:4.5Q1
DOI:10.1002/mlf2.70075
PMID:42079446
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研究论文 | 揭示了渗透信号通过调控防晒霜类菌胞素样氨基酸的生物合成来保护沙漠蓝细菌免受干燥胁迫 | 首次发现类菌胞素样氨基酸在干旱条件下作为渗透保护剂的双重功能，并鉴定出Dsp1-OrrA信号通路介导渗透诱导的MAA生物合成 | 未详细探讨MAA在其他胁迫条件下的具体功能，以及该信号通路在其他生物中的保守性 | 研究类菌胞素样氨基酸在沙漠蓝细菌应对干燥胁迫中的作用及其调控机制 | 沙漠蓝细菌（一种沙漠适应性的蓝细菌） | 合成生物学, 微生物学 | 不适用 | 基因破坏、生化分析、系统发育基因组分析 | 不适用 | 基因组数据、生化实验数据 | 不适用 | 不适用 | 沙漠蓝细菌 | 不适用 | 环境生物技术, 合成生物学 |
| 256 | 2026-05-05 |
Applications of Metabolomics in the Development of Biomedicine and Biotechnology
2026, Advances in experimental medicine and biology
DOI:10.1007/978-3-032-18966-0_21
PMID:42071157
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综述 | 探讨代谢组学从早期谱分析到与先进分析平台、计算生物学和精准医学整合的发展过程，并强调其在癌症、心血管疾病、糖尿病等疾病中的生物标志物发现、机制阐明和个性化治疗中的应用 | 系统阐述了代谢组学在生物医学和生物技术领域的整合应用，包括单细胞代谢组学和机器学习等新兴工具，及其在代谢流追踪和人工途径设计中的实践驱动作用 | 未明确提及具体局限性 | 概述代谢组学在生物医学和生物技术开发中的应用进展 | 代谢物和代谢途径，用于疾病机制和生物过程研究 | 生物信息学 | 癌症， 心血管疾病， 糖尿病 | 代谢组学， 单细胞代谢组学， 机器学习 | NA | 代谢物数据 | NA | NA | NA | 人工代谢途径 | 医学， 生物技术， 合成生物学 |
| 257 | 2026-05-05 |
Levels of autonomy in synthetic biology engineering
2020-12, Molecular systems biology
IF:8.5Q1
DOI:10.15252/msb.202010019
PMID:33331138
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综述 | 探讨合成生物学工程中的自主性层次，分析标准化与自动化在工程生物体中的应用现状与挑战 | 系统梳理其他工程领域标准化与自动化经验，对比分析合成生物学领域尚未实现全流程自动化的核心障碍 | 未提供具体实验数据或定量分析，属于概念性综述，缺乏对现有自主性层次划分的实证验证 | 评估合成生物学工程中自主性水平的现状与发展方向 | 合成生物学工程过程及自主化设计方法 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 工业生物技术 |
| 258 | 2026-05-04 |
Efficient cell factory design by combining meta-heuristic algorithm with enzyme-constrained metabolic models
2026-Aug, Bioresource technology
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.biortech.2026.134706
PMID:42034297
|
研究论文 | 提出MetaStrain框架，将酶约束代谢模型与元启发式算法结合，用于高效设计微生物细胞工厂 | 首次将元启发式算法与酶约束模型整合，通过降维预筛选和数值编码策略高效探索组合基因编辑空间，实现非直觉组合靶点的快速识别 | 未提供实验验证中脱靶效应的分析，且对大型代谢网络的计算复杂度评估不充分 | 开发一种计算框架以优化微生物细胞工厂中多基因靶点设计，提高目标产物产量 | 酿酒酵母和大肠杆菌的代谢网络模型 | NA | NA | 酶约束代谢模型 | 元启发式算法 | NA | 通过计算模拟涉及酿酒酵母的2-苯乙醇和亚精胺生物合成，实验验证使用大肠杆菌的五靶点组合菌株 | CRISPR-Cas9, 代谢工程 | 酿酒酵母, 大肠杆菌 | 组合基因编辑策略，包括敲除、过表达和酶修饰 | 工业生物技术 |
| 259 | 2026-05-04 |
The tryptophan prenyltransferase ComQ from Bacillus subtilis 168 can prenylate daptomycin at Trp1
2026-May-02, The FEBS journal
DOI:10.1111/febs.70578
PMID:42068243
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研究论文 | 本研究首次证明来自枯草芽孢杆菌168的色氨酸异戊二烯转移酶ComQ能够异戊二烯化环状抗菌肽达托霉素，显示出其作为合成生物学工具的潜力 | 首次发现ComQ不仅修饰线性肽，还能异戊二烯化环状肽，扩大了底物范围，为生物活性化合物的生物合成工程提供了新工具 | 未提及体内应用或工程化ComQ变体的具体效果 | 探究ComQ作为合成生物学工具异戊二烯化环状抗菌肽的可行性 | 枯草芽孢杆菌168的异戊二烯转移酶ComQ及其底物ComX和信息素和达托霉素 | 合成生物学 | NA | 克隆、蛋白纯化、AlphaFold建模 | AlphaFold | 蛋白质结构 | NA | NA | 大肠杆菌 | NA | 医学、工业生物技术 |
| 260 | 2026-05-04 |
Parabiotics as Next-Generation Microbiome Therapeutics: Insights into Mechanisms, Evidence, and Therapeutic Potential
2026-May-02, Current microbiology
IF:2.3Q3
DOI:10.1007/s00284-026-04942-x
PMID:42069941
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综述 | 综述了后生元作为下一代微生物组疗法的机制、证据和治疗潜力 | 首次系统总结后生元（非活性微生物或其组分）在安全性、稳定性和功能食品应用中的优势，并整合组学技术（如宏基因组学、CRISPR-Cas）对其研发的加速作用 | 标准化和监管协调仍面临挑战 | 探讨后生元在微生物组靶向干预中的应用及其转化潜力 | 后生元（非活性微生物细胞或其组分） | NA | 儿科腹泻、肌肉衰减、肠易激综合征、特应性皮炎、呼吸道感染、代谢性疾病 | 宏基因组学、下一代测序、蛋白质组学、代谢组学、CRISPR-Cas系统、合成生物学 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas系统 | NA | NA | 医学、食品 |