合成生物学相关文章
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当前共找到 3041 篇文献，本页显示第 2581 - 2600 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2581 | 2024-08-07 |
Halogenases: a palette of emerging opportunities for synthetic biology-synthetic chemistry and C-H functionalisation
2021-Sep-07, Chemical Society reviews
IF:40.4Q1
DOI:10.1039/d0cs01551b
PMID:34368824
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综述 | 本文综述了卤化酶在合成生物学和C-H功能化中的应用 | 介绍了卤化酶在芳香和低活化脂肪族底物中安装卤素原子的选择性，这些选择性通常难以通过合成方法实现 | NA | 探讨卤化酶在生物转化、合成生物学和化学催化中的应用 | 卤化酶及其在C-H功能化和多样化中的机制 | 合成生物学 | NA | 卤化酶 | NA | NA | NA |
| 2582 | 2024-08-07 |
Enhancing l-Malic Acid Production in Aspergillus niger via Natural Activation of sthA Gene Expression
2024-Mar-06, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.3c09321
PMID:38407053
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研究论文 | 本研究通过激活sthA基因表达，提高了Aspergillus niger中l-苹果酸的生产效率 | 利用PmfsA启动子在发酵阶段特异表达sthA基因，显著提升了l-苹果酸的生产效率并减少了副产物 | 激活sthA基因表达导致孢子形成缺陷，限制了工业应用的可行性 | 提高l-苹果酸的合成效率并减少副产物积累 | Aspergillus niger中的l-苹果酸生产 | NA | NA | 生物发酵 | NA | NA | 5 L发酵罐中的表现 |
| 2583 | 2024-08-07 |
A synthetic biology approach to assemble and reboot clinically relevant Pseudomonas aeruginosa tailed phages
2024-Mar-05, Microbiology spectrum
IF:3.7Q2
DOI:10.1128/spectrum.02897-23
PMID:38294230
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研究论文 | 本研究采用合成生物学方法构建并重启针对临床相关假单胞菌的尾状噬菌体 | 开发了一种合成生物学方法，能够构建和重启自然界中无法感染特定菌株的噬菌体 | 噬菌体重启效率受噬菌体种类和细菌菌株中抗病毒防御系统的影响 | 构建临床相关的工程噬菌体，以解决抗生素耐药性问题 | 假单胞菌的尾状噬菌体 | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | 涉及两种噬菌体（JG024和DMS3）和两种不同的假单胞菌菌株 |
| 2584 | 2024-08-07 |
Bacterial host adaptation through sequence and structural variations of a single type III effector gene
2024-Mar-15, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.109224
PMID:38439954
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研究论文 | 本研究揭示了单一III型效应基因序列和结构变异在细菌宿主适应中的分子机制 | 发现了XopJ6效应蛋白的自然变异体，该变异体通过单个残基替换破坏了与WRKY蛋白的相互作用，从而逃避免疫感知并保留部分毒力功能 | NA | 探讨病原体致病性数量变异的分子机制 | XopJ6效应蛋白及其在宿主适应中的作用 | NA | NA | 合成生物学 | NA | 基因序列 | NA |
| 2585 | 2024-08-07 |
Coiled-Coil Interaction Toolbox for Engineering Mammalian Cells
2024, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-3718-0_3
PMID:38441756
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研究论文 | 本文介绍了用于哺乳动物细胞工程的卷曲螺旋（CC）肽设计工具箱及其在构建哺乳动物细胞中CC介导的逻辑电路的协议 | 卷曲螺旋肽作为调节蛋白质-蛋白质相互作用的独特有效工具，其结合特异性和亲和力可以被设计和控制 | NA | 开发用于合成生物学工具的卷曲螺旋肽，以调节蛋白质相互作用 | 哺乳动物细胞 | 合成生物学 | NA | 卷曲螺旋肽设计 | NA | NA | NA |
| 2586 | 2024-08-07 |
Mechanistic Model-Driven Biodesign in Mammalian Synthetic Biology
2024, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-3718-0_6
PMID:38441759
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综述 | 本文综述了数学模型在哺乳动物合成生物学中的应用，包括设计优化电路和工程生物过程，预测行为，以及指导实验设计 | 讨论了基因组规模模型、机器学习和网络遗传学在扩展模型驱动哺乳动物细胞生物设计能力中的机会 | NA | 探讨数学模型在哺乳动物合成生物学中的应用及其未来发展 | 哺乳动物合成生物学中的数学模型 | 合成生物学 | NA | NA | 数学模型 | NA | NA |
| 2587 | 2024-08-07 |
A Directed Evolution Protocol for Engineering Minimal Transcription Factors, Based on CIS Display
2024, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-3718-0_1
PMID:38441754
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研究论文 | 本文介绍了一种基于CIS展示的定向进化方法，用于从非结合蛋白池中高效筛选功能性DNA结合蛋白 | 首次使用CIS展示技术筛选DNA结合蛋白，该技术避免了传统的克隆步骤，允许更大的文库规模 | 目前仅在筛选最小转录因子Cro中进行了验证，尚未广泛应用于其他DNA结合蛋白或转录因子的工程化 | 开发一种新的定向进化方法，用于高效筛选和工程化DNA结合蛋白 | DNA结合蛋白和转录因子 | 生物技术 | NA | CIS展示技术 | NA | DNA | 从低起始频率（1 in 10）中筛选最小转录因子Cro |
| 2588 | 2024-08-07 |
A Computational Modeling Approach for the Design of Genetic Control Systems that Respond to Transcriptional Activity
2024, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-3718-0_8
PMID:38441761
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研究论文 | 本文介绍了一种基于预测数学模型的系统方法，用于指导基于基因活性的传感器的设计和构建 | 该方法通过敏感性分析和参数扫描的迭代，实现用户驱动的电路优化，提供了一种通用的工程化方法来制造感应和响应细胞 | NA | 设计并优化能够响应转录活性的遗传控制系统 | 遗传电路在哺乳动物细胞中的实现 | 合成生物学 | NA | 预测数学建模 | NA | NA | NA |
| 2589 | 2024-08-07 |
A Mammalian-Based Synthetic Biology Toolbox to Engineer Membrane-Membrane Interfaces
2024, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-3718-0_4
PMID:38441757
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研究论文 | 本文介绍了一种基于哺乳动物的合成生物学平台，用于在细胞间区域工程化功能性膜-膜界面 | 开发了一种新的合成生物学平台，利用一对二聚化蛋白在无细胞和细胞环境中工程化功能性膜-膜界面 | NA | 旨在为合成生物学家提供一个工具，用于工程化新的细胞间信号传导和通信系统 | 细胞间膜-膜界面及其在细胞过程中的功能 | 合成生物学 | NA | 合成生物学 | 二聚化蛋白 | NA | NA |
| 2590 | 2024-08-07 |
RNA Switches Using Cas Proteins
2024, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-3718-0_12
PMID:38441765
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研究论文 | 本文探讨了利用CRISPR-Cas系统中的Cas蛋白作为RNA结合蛋白（RBPs），通过在mRNA的5'UTR插入crRNA/sgRNA序列，实现基因翻译的可调控性 | 利用Cas蛋白的多样性作为触发蛋白，极大地扩展了合成生物学中的可用工具 | NA | 扩展哺乳动物细胞中可用的RNA结合蛋白数量，建立转录后调控电路 | CRISPR-Cas系统中的Cas蛋白及其在mRNA调控中的应用 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas系统 | NA | RNA | 使用HEK293FT细胞作为示例 |
| 2591 | 2024-08-07 |
Detection of MicroRNAs Using Synthetic Toehold Switch in Mammalian Cells
2024, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-3718-0_16
PMID:38441769
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研究论文 | 本文设计了一种新型合成脚趾开关，用于检测CHO、HeLa、HEK 293和MDA-MB-231乳腺癌细胞中表达的外源和内源miRNAs | 首次设计和利用miRNA基的脚趾开关，特别是在真核翻译控制方面 | NA | 开发基于RNA的开关平台，用于报告细胞发展和疾病中的动态细胞机制 | miR-155和miR-21的检测 | 合成生物学 | 乳腺癌 | 合成脚趾开关 | NA | RNA | CHO、HeLa、HEK 293和MDA-MB-231乳腺癌细胞 |
| 2592 | 2024-08-07 |
Two New Plasmid Post-segregational Killing Mechanisms for the Implementation of Synthetic Gene Networks in Escherichia coli
2019-Apr-26, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2019.03.019
PMID:30954530
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研究论文 | 本文展示了axe/txe毒素-抗毒素系统和微囊素-V细菌素系统在益生菌大肠杆菌Nissle 1917中的质粒稳定化能力，并证明它们可以超越常用的hok/sok系统 | 开发了两种新的质粒后分离杀伤机制，并应用贝叶斯统计方法量化了体外质粒稳定性 | NA | 探索和验证新的质粒稳定化机制，以应用于工业和合成生物学 | 大肠杆菌Nissle 1917中的质粒稳定性和其在体内外的表现 | 合成生物学 | NA | 自动化流式细胞分析，数学模型，贝叶斯统计 | NA | 细胞 | NA |
| 2593 | 2024-08-07 |
Natural Product Biosynthesis in Escherichia coli: Mentha Monoterpenoids
2016, Methods in enzymology
DOI:10.1016/bs.mie.2016.02.020
PMID:27417932
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研究论文 | 本文探讨了利用合成生物学方法在Escherichia coli中合成薄荷单萜类化合物的新途径 | 本文通过构建新的代谢途径，实现了在微生物中生产非天然单萜类化合物，并优化了基因选择、调控元件、宿主选择和优化以及宿主生物的代谢考虑 | NA | 探索合成生物学在微生物中单萜类化合物生产中的应用 | Escherichia coli中的薄荷单萜类化合物合成 | 合成生物学 | NA | 合成生物学技术 | NA | NA | NA |
| 2594 | 2024-08-07 |
Advances in the Application of Single-Cell Transcriptomics in Plant Systems and Synthetic Biology
2024, Biodesign research
DOI:10.34133/bdr.0029
PMID:38435807
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综述 | 本文综述了单细胞转录组测序（scRNA-seq）在植物系统和合成生物学中的应用进展 | scRNA-seq技术能够揭示植物细胞层面上的高分辨率基因表达模式和细胞类型异质性，为植物系统设计和合成生物学提供新知识 | 目前scRNA-seq技术在植物中的应用仅限于少数物种，未来技术进步将降低成本并加速其在植物中的应用 | 探讨scRNA-seq在植物系统生物学和植物合成生物学研究中的应用，并讨论其挑战和机遇 | 植物系统和合成生物学 | 合成生物学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 已应用于有限数量的植物物种，包括模型植物、农作物和生物能源作物 |
| 2595 | 2024-08-07 |
Synthetic Biology Pathway to Nucleoside Triphosphates for Expanded Genetic Alphabets
2023-06-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.3c00060
PMID:37227319
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研究论文 | 本文探讨了合成生物学中通过重排氢键供体和受体基团来形成12种独立复制核苷酸的方法，并介绍了利用“多磷酸激酶”制造AEGIS三磷酸的代谢途径。 | 首次报道了利用“多磷酸激酶”与天然二磷酸激酶和工程化核苷酸激酶合作，制造AEGIS三磷酸的途径，包括第三代三磷酸，其在活细菌细胞中的生存能力得到改善。 | NA | 探索合成生物学中扩展遗传字母表的途径，特别是制造AEGIS三磷酸的代谢途径。 | 12种独立复制的核苷酸及其三磷酸的合成途径。 | 合成生物学 | NA | 多磷酸激酶 | NA | NA | NA |
| 2596 | 2024-08-07 |
Microbial production of N-acetyl-D-glucosamine (GlcNAc) for versatile applications: Biotechnological strategies for green process development
2024-Feb, Carbohydrate research
IF:2.4Q2
DOI:10.1016/j.carres.2024.109039
PMID:38277719
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综述 | 本文综述了利用微生物生产N-乙酰-D-氨基葡萄糖（GlcNAc）的生物技术策略，以及其在制药、食品、化妆品和生物燃料行业的广泛应用 | 介绍了利用代谢工程和合成生物学的新技术，如底物共利用策略、启动子工程和CRISPR干扰系统，来提高GlcNAc的产量和降低生产成本 | 需要进一步的过程优化、代谢通量优化和从培养基中高效回收GlcNAc，以实现高产品产量的目标 | 探讨微生物工程在生产重要药物中的潜在应用，并推动未来研究方向的发展 | N-乙酰-D-氨基葡萄糖（GlcNAc）的生产和应用 | 生物技术 | NA | 代谢工程，合成生物学 | NA | NA | NA |
| 2597 | 2024-08-07 |
Highly-Adaptable Optothermal Nanotweezers for Trapping, Sorting, and Assembling across Diverse Nanoparticles
2024-Mar, Advanced materials (Deerfield Beach, Fla.)
DOI:10.1002/adma.202309143
PMID:37944998
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研究论文 | 本文介绍了一种高度适应性的光热纳米镊子（HAONTs），通过精确调节扩散泳和热渗透流在光热响应金膜边界层中的流动，能够操纵小至亚10纳米的单个纳米粒子，并引入了一种新颖的光热环形涡旋（DSV）捕获策略，实现了细胞与纳米粒子之间的新型物理相互作用。 | 本文设计了高度适应性的光热纳米镊子（HAONTs），并引入了新颖的光热环形涡旋（DSV）捕获策略，实现了对多种纳米粒子的通用和生物相容性操纵。 | NA | 开发一种通用且生物相容的工具，用于操纵不同大小、电荷和材料的纳米粒子。 | 纳米粒子的捕获、分类和组装。 | 纳米光子学 | NA | 光热响应金膜 | NA | NA | NA |
| 2598 | 2024-08-07 |
Structure-function analysis of the cyclic β-1,2-glucan synthase from Agrobacterium tumefaciens
2024-Feb-28, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-45415-8
PMID:38418509
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研究论文 | 研究了来自Agrobacterium tumefaciens的环状β-1,2-葡聚糖合酶（Cgs）的结构与功能 | 揭示了CβG合成的独特机制，使用酪氨酸连接的低聚糖中间体在葡聚糖链的聚合和加工循环中 | NA | 阐明CβG合成的机制并探索对抗依赖多糖毒力因子的病原体的可能性 | 环状β-1,2-葡聚糖合酶（Cgs）及其合成机制 | 微生物学 | NA | 冷冻电子显微镜（cryo-EM） | NA | 蛋白质结构 | NA |
| 2599 | 2024-08-07 |
Enzymatic Degradation of Deoxynivalenol with the Engineered Detoxification Enzyme Fhb7
2024-Feb-26, JACS Au
IF:8.5Q1
DOI:10.1021/jacsau.3c00696
PMID:38425922
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研究论文 | 本文报道了Fhb7酶的首次结构解析及其独特的催化机制，并通过工程化改造提高了其稳定性和DON降解性能。 | 首次解析了Fhb7酶的结构，并揭示了其在谷胱甘肽-S转移酶家族中的独特催化机制。通过工程化改造，显著提高了Fhb7酶的稳定性和DON降解性能。 | Fhb7酶的稳定性较差，且其催化机制的复杂性限制了其实际应用。 | 研究Fhb7酶的结构和催化机制，并通过工程化改造提高其在DON降解中的应用潜力。 | Fhb7酶及其在降解脱氧雪腐镰刀菌烯醇（DON）中的应用。 | 生物技术 | NA | 谷胱甘肽-S转移酶（GST） | NA | 结构数据 | NA |
| 2600 | 2024-08-07 |
Synthetic biology, genetic circuits and machine learning: a new age of cancer therapy
2023-Jun, Molecular oncology
IF:5.0Q1
DOI:10.1002/1878-0261.13420
PMID:37002698
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评论 | 本文探讨了合成生物学与机器学习在癌症治疗中的应用，特别是通过非自然信号传导途径和复杂的合成基因电路增强工程化T细胞的抗肿瘤特性 | 文章介绍了通过机器学习辅助筛选过程，成功预测CAR T细胞表型依赖于信号传导模体选择的新方法，以及合成锌指蛋白作为可控转录调节因子的应用 | NA | 探索合成生物学和机器学习如何通过新的技术手段增强工程化T细胞的抗肿瘤能力 | CAR T细胞的信号传导途径和合成基因电路的设计 | 合成生物学 | 癌症 | 合成生物学技术 | 机器学习 | 基因电路 | NA |