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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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2621 | 2024-08-07 |
Mesoplasma florum: a near-minimal model organism for systems and synthetic biology
2024, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2024.1346707
PMID:38404664
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研究论文 | 本文探讨了Mesoplasma florum作为一种近似最小模型生物在系统和合成生物学中的应用 | 首次发表Mesoplasma florum的基因组,并开发了多种分子工具和代谢模型,为未来的基因组工程和合成细胞设计提供了基础 | 由于技术限制和缺乏专用分子工具,该细菌的许多生物学特性长期未被研究 | 探索Mesoplasma florum在系统和合成生物学中的应用潜力 | Mesoplasma florum的基因组、调控元件、质粒开发、比较基因组学、转座子诱变等 | 系统和合成生物学 | NA | 基因组克隆、基因组移植、代谢模型开发 | NA | 基因组数据 | 单个细菌物种Mesoplasma florum |
2622 | 2024-08-07 |
Functionalized DNA-Origami-Protein Nanopores Generate Large Transmembrane Channels with Programmable Size-Selectivity
2023-01-18, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.2c11226
PMID:36577119
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研究论文 | 本文利用pneumolysin(PLY)和DNA折纸技术构建了具有可编程尺寸选择性的大型跨膜纳米孔 | 首次结合PLY毒素和DNA折纸技术构建了可功能化的大型纳米孔,具有均匀的孔径和可编程的尺寸选择性 | NA | 开发新型生物传感器和合成细胞构建技术 | 跨膜纳米孔的工程化 | 纳米技术 | NA | DNA折纸技术 | NA | 纳米孔 | 涉及脂质体和红细胞 |
2623 | 2024-08-07 |
CRISPR Screens in Plants: Approaches, Guidelines, and Future Prospects
2020-Aug-25, The Plant cell
DOI:10.1105/tpc.20.00463
PMID:32843437
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研究论文 | 本文讨论了在植物中建立CRISPR筛选的一般概念、工具和流程,并分析了近期使用该策略生成突变体敲除集合或多样化DNA序列的报告 | 本文探讨了CRISPR筛选在植物中的独特多重能力,以研究高度重复的植物基因组中的冗余基因功能,并讨论了如何设计CRISPR敲除筛选以应对当前的挑战和限制 | CRISPR筛选在植物中的应用仍处于初级阶段 | 探讨CRISPR筛选在植物中的应用,以分析植物基因组并推进植物功能和合成生物学 | 植物基因组和基因调控网络 | 基因工程 | NA | CRISPR-Cas系统 | NA | 基因组数据 | NA |
2624 | 2024-08-07 |
Artificial Light Regulation of an Allosteric Bienzyme Complex by a Photosensitive Ligand
2018-May-29, Chembiochem : a European journal of chemical biology
IF:2.6Q3
DOI:10.1002/cbic.201800219
PMID:29808949
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研究论文 | 本文利用光敏感的二芳基乙烯(DTE)作为竞争性抑制剂,通过光照调控异二聚酶复合物咪唑甘油磷酸合酶(ImGP-S)的催化活性和别构效应 | 首次展示了通过光敏感配体实现对多酶复合物催化活性和别构效应的光调控 | NA | 探索通过光敏感配体调控蛋白质活性的新方法 | 咪唑甘油磷酸合酶(ImGP-S)及其亚基HisF和HisH | 合成生物学 | NA | 光敏感配体结合UV光照 | NA | 酶活性数据 | NA |
2625 | 2024-08-07 |
Synthetic biology approach for plant protection using dsRNA
2018-Feb-26, Plant biotechnology journal
IF:10.1Q1
DOI:10.1111/pbi.12904
PMID:29479789
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研究论文 | 本文利用噬菌体phi6的组件,在Pseudomonas syringae细菌中设计了一种稳定且准确的体内dsRNA生产系统,用于植物保护 | 该研究基于RNA依赖的RNA聚合酶的dsRNA复制机制,生产高质量、长链dsRNA分子,与传统的体外或体内dsRNA生产系统不同 | NA | 开发一种高效、灵活、非转基因且环保的方法,用于保护作物免受病毒和其他病原体的侵害 | Pseudomonas syringae细菌中的dsRNA生产系统 | 合成生物学 | NA | RNA干扰 | NA | NA | NA |
2626 | 2024-08-07 |
Unravelling the Triterpenoid Saponin Biosynthesis of the African Shrub Maesa lanceolata
2014-Oct-08, Molecular plant
IF:17.1Q1
DOI:10.1093/mp/ssu110
PMID:25296856
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研究论文 | 本研究通过转录组分析和异源表达技术,揭示了非洲灌木Maesa lanceolata中三萜皂苷生物合成的关键基因及其功能 | 首次鉴定并验证了Maesa lanceolata中三萜皂苷生物合成的三个关键酶基因,并发现CYP87D16的C-16α氧化酶活性在不同植物谱系中独立进化 | NA | 揭示Maesa lanceolata中三萜皂苷的生物合成途径 | Maesa lanceolata中的三萜皂苷生物合成基因 | NA | NA | 转录组分析,异源表达 | NA | 转录组数据 | NA |
2627 | 2024-08-07 |
Advancements in heparosan production through metabolic engineering and improved fermentation
2024-May-01, Carbohydrate polymers
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.carbpol.2024.121881
PMID:38388039
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综述 | 本文综述了通过代谢工程和发酵优化提高肝素生产的研究进展 | 利用合成生物学技术,通过微生物工程生产肝素,提供了一种成本效益高且可扩展的替代传统从动物组织中提取的方法 | 讨论了未来的研究方向和领域内仍面临的挑战 | 分析微生物肝素生物合成中的关键模块和最新的代谢工程策略,以增强生产、调节分子量分布并优化肝素的发酵规模 | 肝素及其前体肝聚糖的生产 | NA | 炎症、癌症、微生物和病毒性疾病(包括COVID-19) | 代谢工程 | NA | NA | NA |
2628 | 2024-08-07 |
Application of extremophile cell factories in industrial biotechnology
2024-Apr, Enzyme and microbial technology
IF:3.4Q2
DOI:10.1016/j.enzmictec.2024.110407
PMID:38341913
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综述 | 本文综述了极端微生物的鉴定与筛选技术及其在工业生物技术中的应用 | 基于工程化极端微生物的下一代工业生物技术有望简化生物制造过程,建立开放、非灭菌的连续发酵生产系统,并利用低成本基质 | NA | 总结极端微生物的鉴定与筛选技术,并探讨其在工业生物技术中的应用前景 | 极端微生物及其在工业生物技术中的应用 | 工业生物技术 | NA | 分子生物学、合成生物学和发酵技术 | NA | NA | NA |
2629 | 2024-08-07 |
Enhancing the safety of CAR-T cell therapy: Synthetic genetic switch for spatiotemporal control
2024-Feb-23, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adj6251
PMID:38394207
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综述 | 本文综述了利用合成生物学方法增强CAR-T细胞疗法的安全性和可控性,特别是在时间和空间维度上的控制方法。 | 介绍了基于遗传工程技术的合成生物学方法,用于构建人工细胞或生物体,以实现CAR-T细胞疗法的可控性。 | NA | 探讨如何通过合成生物学方法提高CAR-T细胞疗法的安全性和可控性。 | CAR-T细胞疗法的安全性和可控性。 | 生物技术 | 癌症 | 遗传工程技术 | NA | NA | NA |
2630 | 2024-08-07 |
DNA-Diffusion: Leveraging Generative Models for Controlling Chromatin Accessibility and Gene Expression via Synthetic Regulatory Elements
2024-Feb-01, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.02.01.578352
PMID:38352499
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研究论文 | 本文利用扩散模型设计特定上下文的DNA调控序列,以实现精确的基因表达控制 | 本文首次利用扩散模型设计特定细胞类型的合成200 bp调控元件,这些元件具有精确调节基因表达的潜力 | NA | 开发一种新的方法来系统地修改和优化调控元件,以实现精确的基因表达控制 | DNA调控序列及其在不同细胞类型中的基因表达调控能力 | 合成生物学 | NA | 扩散模型 | 扩散模型 | DNA序列 | 合成200 bp调控元件 |
2631 | 2024-08-07 |
Nannochloropsis as an Emerging Algal Chassis for Light-Driven Synthesis of Lipids and High-Value Products
2024-Jan-24, Marine drugs
IF:4.9Q1
DOI:10.3390/md22020054
PMID:38393025
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综述 | 本文综述了Nannochloropsis作为新兴微藻底盘在光驱动合成脂质和高价值产品方面的应用现状和潜力 | 介绍了基因工具和合成生物学领域的最新进展,将Nannochloropsis转化为强大的生物工厂 | NA | 探讨Nannochloropsis在生物燃料和高价值产品生产中的应用潜力 | Nannochloropsis的培养、利用及其代谢途径 | 生物技术 | NA | 基因操作技术 | NA | NA | NA |
2632 | 2024-08-07 |
Acoustically triggered mechanotherapy using genetically encoded gas vesicles
2021-12, Nature nanotechnology
IF:38.1Q1
DOI:10.1038/s41565-021-00971-8
PMID:34580468
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research paper | 本文展示了通过超声诱导的惯性空化,生物分子和细胞可以被工程化以在体内特定位置传递强大的机械效应 | 利用遗传编码的气泡体,通过低频超声将这些生物分子转化为微米尺度的空化气泡,释放强大的局部机械效应 | NA | 探索生物分子和细胞在体内特定位置传递机械效应的新方法 | 生物分子和细胞的工程化应用 | NA | NA | 超声诱导的惯性空化 | NA | NA | 包括体外、细胞内和体内实验,以及小鼠肿瘤归巢益生菌治疗模型 |
2633 | 2024-08-07 |
Constructing a Smartphone-Controlled Semiautomatic Theranostic System for Glucose Homeostasis in Diabetic Mice
2021, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-1441-9_9
PMID:34228289
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研究论文 | 研究者开发了一种智能手机控制的半自动治疗诊断系统,用于调节糖尿病小鼠的血糖稳态 | 该研究结合了多学科设计原则,包括电气工程、软件开发、合成生物学和光遗传学,创造了一种新型的智能手机控制的治疗诊断系统 | NA | 开发一种新型的智能手机控制的治疗诊断系统,用于远程调节糖尿病小鼠的血糖稳态 | 糖尿病小鼠的血糖稳态 | 生物医学工程 | 糖尿病 | 光遗传学 | NA | 生物信号 | 糖尿病小鼠 |
2634 | 2024-08-07 |
Expression and Purification of Cp3GT: Structural Analysis and Modeling of a Key Plant Flavonol-3-O Glucosyltransferase from Citrus paradisi
2024-Feb-07, Biotech (Basel (Switzerland))
DOI:10.3390/biotech13010004
PMID:38390907
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研究论文 | 本研究聚焦于植物黄酮醇特异性3-O葡萄糖基转移酶(Cp3GT)的规模化表达、纯化及其结构分析与建模 | 通过优化培养条件和纯化过程,成功解决了重组蛋白生产中的蛋白酶降解问题,并实现了Cp3GT的高纯度制备 | NA | 研究Cp3GT的结构和功能机制,为合成生物学和酶工程在制药应用中的发展提供支持 | 植物黄酮醇特异性3-O葡萄糖基转移酶(Cp3GT) | 生物技术 | NA | 亲和层析、阴离子交换层析和尺寸排阻层析 | AlphaFold2 | 蛋白质结构 | NA |
2635 | 2024-08-07 |
The dynamic-process characterization and prediction of synthetic gene circuits by dynamic delay model
2024-Mar-15, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.109142
PMID:38384832
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研究论文 | 本文提出了一种动态延迟模型(DDM),用于描述和预测合成基因电路的动态过程 | 首次提供了动态确定函数的详细公式,并提出了一种通过微流控系统测量合成元件参数的方法 | NA | 旨在通过动态延迟模型提高合成基因电路预测的准确性 | 合成基因电路的动态行为及其参数测量 | 合成生物学 | NA | 微流控系统 | 动态延迟模型 | NA | 包括8个激活子和5个抑制子 |
2636 | 2024-08-07 |
A MoClo-Compatible Toolbox of ECF Sigma Factor-Based Regulatory Switches for Proteobacterial Chassis
2024, Biodesign research
DOI:10.34133/bdr.0025
PMID:38384496
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研究论文 | 本文展示了alpha变形菌作为植物相关合成生物学底盘的潜力,并识别了一组可在两种细菌宿主中使用的正交ECF基调控因子,用于创建2步延迟电路。 | 本文首次在alpha变形菌中应用ECF sigma因子作为正交调控元件,并提供了一个与Golden Gate (MoClo)克隆标准兼容的工具箱,以促进ECF基电路在不同物种中的构建。 | NA | 构建一个上下文无关且跨物种的ECF基工具箱,用于合成生物学应用。 | alpha变形菌和gamma变形菌中的ECF sigma因子调控元件。 | 合成生物学 | NA | Golden Gate (MoClo)克隆 | NA | 基因电路 | NA |
2637 | 2024-08-07 |
Advances in Metabolic Engineering of Plant Monoterpene Indole Alkaloids
2023-Jul-27, Biology
DOI:10.3390/biology12081056
PMID:37626942
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综述 | 本文综述了植物单萜吲哚生物碱(MIAs)代谢工程的最新进展和策略 | 探讨了通过合成生物学方法在异源宿主中增加MIAs产量和扩展其化学多样性的策略 | 讨论了当前制造MIAs的问题和未来发展 | 旨在通过代谢工程和合成生物学方法提高MIAs的产量和多样性 | 植物单萜吲哚生物碱(MIAs) | 代谢工程 | NA | 代谢工程 | NA | NA | NA |
2638 | 2024-08-07 |
Versatile Microfluidic Platform for Automated Live-Cell Hyperspectral Imaging Applied to Cold Climate Cyanobacterial Biofilms
2021-Jun-16, Analytical chemistry
IF:6.7Q1
DOI:10.1021/acs.analchem.0c05446
PMID:34133116
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研究论文 | 本文介绍了一种多功能微流控平台,用于冷气候条件下蓝藻生物膜的自动活细胞高光谱成像和物种检测 | 结合微流控技术、多模态成像和计算机视觉系统,提供了一个多功能平台,用于研究蓝藻生物膜的因果关系 | NA | 开发一种用于冷气候环境中蓝藻生物膜的活细胞成像和自动物种检测的微流控平台 | 冷气候环境中的蓝藻生物膜 | 计算机视觉 | NA | 高光谱成像 | 机器学习算法 | 图像 | 六个平行生长通道的生物膜样本 |
2639 | 2024-08-07 |
A non-equilibrium dissipation system with tunable molecular fuel flux
2024-Feb-22, Nanoscale
IF:5.8Q1
DOI:10.1039/d3nr06136a
PMID:38334944
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研究论文 | 本文报道了一种基于动态DNA纳米技术的仿生耗散系统,该系统具有可调节的分子燃料通量 | 通过调节链置换和酶反应速率,控制燃料通量并进一步调节非平衡瞬态状态的强度,实现了对金纳米粒子动态组装和解组的调控 | NA | 展示一种具有可调节分子燃料通量的耗散系统,并探讨其在生物仿生学、合成生物学、智能材料、生物传感及人工细胞等领域的应用潜力 | 仿生耗散系统及其在金纳米粒子组装和解组中的应用 | 合成生物学 | NA | 动态DNA纳米技术 | NA | NA | NA |
2640 | 2024-08-07 |
Efficient assembly of a synthetic attenuated SARS-CoV-2 genome in Saccharomyces cerevisiae using multi-copy yeast vectors
2024, Journal of genetics
IF:1.4Q4
PMID:38379228
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研究论文 | 本文研究了在多拷贝酵母载体中高效组装合成减毒SARS-CoV-2基因组的方法 | 首次尝试在多拷贝载体中进行大型多片段组装,并开发了一套工具包,使研究人员能够在单拷贝和多拷贝载体之间无缝过渡 | NA | 评估在单拷贝和多拷贝载体系统中组装28 kb减毒SARS-CoV-2基因组的效率 | SARS-CoV-2减毒基因组的组装 | 合成生物学 | NA | 同源重组 | NA | DNA | 10个片段 |