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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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2641 | 2024-08-07 |
RNAs as Sensors of Oxidative Stress in Bacteria
2023-06-08, Annual review of chemical and biomolecular engineering
IF:7.6Q1
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综述 | 本文综述了氧化应激的本质,强调了已知的蛋白质传感器(转录因子)作为氧化应激中分子传感器标准的作用,并描述了探索RNA直接感受氧化应激潜力的分子研究 | RNA传感器有望成为理解和调控细菌氧化应激反应中动态生物途径的关键层,代表了合成生物学的重要前沿 | 关于RNA传感器的知识存在空白,特别是关于RNA核苷酸化学修饰的部分 | 探讨RNA作为细菌中氧化应激传感器的潜力 | RNA传感器在氧化应激反应中的作用 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
2642 | 2024-08-07 |
Engineering a dual vaccine against COVID-19 and tuberculosis
2023, Frontiers in cellular and infection microbiology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcimb.2023.1273019
PMID:37965265
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研究论文 | 研究通过合成生物技术构建了一种重组BCG菌株AspikeRBD,该菌株表达由Ag85A蛋白和SARS-CoV-2刺突蛋白的受体结合域(RBD)组成的融合蛋白,旨在开发一种针对COVID-19和结核病的双重疫苗 | 首次成功构建了一种能够同时表达Ag85A蛋白和SARS-CoV-2 RBD的重组BCG菌株,显示出对两种疾病的免疫反应增强 | 研究仅在老鼠模型中进行,尚未在人类中进行临床试验 | 开发一种新型双重疫苗,同时预防COVID-19和结核病 | 重组BCG菌株AspikeRBD的免疫效果及其作为双重疫苗的潜力 | NA | COVID-19和结核病 | 合成生物技术 | NA | NA | 老鼠模型 |
2643 | 2024-08-07 |
All-in-one IQ toggle switches with high versatilities for fine-tuning of transgene expression in mammalian cells and tissues
2024-Mar-14, Molecular therapy. Methods & clinical development
DOI:10.1016/j.omtm.2024.101202
PMID:38374964
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研究论文 | 本文介绍了一种新型转基因开关SIQ,该开关将所有基因切换元素集成到一个单一载体中,具有高效率和避免转基因泄漏的特点 | SIQ开关具有高效率和避免转基因泄漏的特点,并且可以通过单一构建体进行瞬时转染、建立稳定细胞系以及同时生产用于细胞和哺乳动物组织转导的腺病毒 | NA | 开发一种新型的转基因开关,用于基因和细胞基础的生物学研究和精准医学 | 转基因表达在哺乳动物细胞和组织中的精细调控 | 基因工程 | NA | 转基因技术 | NA | NA | NA |
2644 | 2024-08-07 |
Strategies on biosynthesis and production of bioactive compounds in medicinal plants
2024-Jan, Chinese herbal medicines
IF:4.7Q1
DOI:10.1016/j.chmed.2023.01.007
PMID:38375043
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综述 | 本文总结了药用植物中天然产物生物合成和生产的策略与方法 | 介绍了基于多种“OMICS”技术的遗传工程、植物细胞培养工程、代谢工程和合成生物学在药用植物天然产物生物合成中的应用 | NA | 促进药用植物的保护和可持续利用 | 药用植物中的天然产物 | NA | NA | 遗传工程、植物细胞培养工程、代谢工程、合成生物学 | NA | NA | NA |
2645 | 2024-08-07 |
Budding yeast as a factory to engineer partial and complete microbial genomes
2020-Dec, Current opinion in systems biology
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.coisb.2020.09.003
PMID:33015421
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研究论文 | 本文探讨了利用酵母细胞作为宿主来工程化微生物基因组的新进展 | 开发了新的合成生物学途径,使得能够高效地工程化微生物基因组并产生修改后的细菌/病毒 | 克隆大于两百万碱基对的DNA分子复杂,细菌基因组难以恢复,且这些技术的双重用途需要仔细考虑 | 研究利用酵母细胞作为工厂来工程化微生物基因组的方法 | 酵母细胞和微生物基因组 | 合成生物学 | NA | 基因组编辑 | NA | DNA | NA |
2646 | 2024-08-07 |
Multiplexing cell-cell communication
2020-07, Molecular systems biology
IF:8.5Q1
DOI:10.15252/msb.20209618
PMID:32672881
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研究论文 | 本文开发了一种基于CRISPRi的遗传编码通道选择器设备,使单个通信系统能够传输两个独立的细胞间对话 | 设计了多路复用器和解多路复用器子电路,由12个基于CRISPRi的转录逻辑门、一个酰基高丝氨酸内酯基通信模块和三个可诱导启动子组成,实现了对细胞间通信的精细控制 | NA | 开发用于合成生物学的高级多细胞行为的细胞间通信系统 | 细胞间通信系统的遗传工程 | 合成生物学 | NA | CRISPRi | 转录逻辑门 | NA | NA |
2647 | 2024-08-07 |
Dynamic Cell Programming with Quorum Sensing-Controlled CRISPRi Circuit
2020-06-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.0c00148
PMID:32485106
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research paper | 本文构建了一系列基于群体感应控制的CRISPRi系统(Q-CRISPRi),用于动态编程细菌,无需引入细胞裂解 | Q-CRISPRi系统能够在不依赖基因编辑或细胞裂解的情况下动态编程细菌,具有广泛的应用潜力 | 现有的动态电路大多依赖基因编辑或细胞裂解,限制了其广泛和便捷的应用 | 开发一种新型的动态电路,用于调控细胞资源和微生物群落行为 | 细菌的基因表达、种群密度、表型、物理性质和群落组成 | synthetic biology | NA | CRISPRi | NA | NA | NA |
2648 | 2024-08-07 |
A transient reporter for editing enrichment (TREE) in human cells
2019-11-04, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkz713
PMID:31428784
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研究论文 | 本研究开发了一种名为TREE的临时报告系统,用于在人类细胞中高效筛选经过碱基编辑的细胞群体 | TREE系统通过使用蓝色荧光蛋白(BFP)在C到T替换后转化为绿色荧光蛋白(GFP),直接报告细胞内的碱基编辑活性,显著提高了编辑效率 | NA | 优化碱基编辑转染参数和递送策略,并开发一种高效的临时报告系统用于筛选碱基编辑细胞 | 人类细胞和人类多能干细胞(hPSCs) | 合成生物学 | NA | 碱基编辑技术 | NA | 荧光信号 | 多个独立位点 |
2649 | 2024-08-07 |
Polarized displacement by transcription activator-like effectors for regulatory circuits
2019-01, Nature chemical biology
IF:12.9Q1
DOI:10.1038/s41589-018-0163-8
PMID:30455466
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研究论文 | 本文展示了转录激活因子样效应物(TALE)能够以高度极化的方式从DNA上置换另一个TALE蛋白,仅置换3'端而非5'端重叠或相邻的TALE。 | 提出了基于TALE多部分DNA结合特性的极化置换机制,为基因表达的特异性调控、构建所有双输入布尔遗传逻辑电路、置换锌指转录因子及抑制Cas9-gRNA介导的基因组切割提供了新策略。 | NA | 探索DNA结合蛋白间相互作用在转录调控中的作用,提高设计调控电路的精确性和复杂性。 | 转录激活因子样效应物(TALE)及其在DNA上的极化置换行为。 | 合成生物学 | NA | 转录激活因子样效应物(TALE) | NA | DNA | NA |
2650 | 2024-08-07 |
Targeted m6A Reader Proteins To Study Epitranscriptomic Regulation of Single RNAs
2018-09-26, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.8b05012
PMID:30183280
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研究论文 | 本文报道了开发可编程的dPspCas13b-mA阅读器蛋白,用于研究活细胞中单个转录本的调控效应 | 开发了基于dPspCas13b的工具,用于研究内源性RNA的调控,并展示了这些工具在合成生物学中的应用潜力 | 目前对于mA的写入者、擦除者和阅读者之间的竞争性相互作用调控甲基化RNA转录本的研究尚不充分 | 研究RNA的转录后基因表达调控,特别是N-甲基腺苷(mA)修饰对RNA的影响 | 研究特定阅读器蛋白对单个转录本的调控效应 | 生物技术 | NA | RNA修饰分析 | dPspCas13b-mA阅读器蛋白 | RNA | 活细胞中的单个转录本 |
2651 | 2024-08-07 |
Transcriptional reprogramming in yeast using dCas9 and combinatorial gRNA strategies
2017-Mar-15, Microbial cell factories
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s12934-017-0664-2
PMID:28298224
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研究论文 | 本研究比较了两种基于dCas9的转录重编程系统,并将其应用于酵母中的两条生物合成途径,以生产异戊二烯和甘油三酯(TAG) | 本研究展示了常驻和诱导型dCas9方法的相似性能,并识别了能够显著扰动酵母中异戊二烯生产和TAG剖面的多重gRNA设计 | 研究指出,在14个酵母目标启动子中有大量gRNA位置不影响表达,表明需要进一步优化gRNA设计工具和dCas9工程 | 旨在开发合成生物学工具,实现对转录的正交控制,以便在不干扰原生基因表达机制的情况下灵活及时地控制基因表达 | 酵母中的异戊二烯和甘油三酯(TAG)生物合成途径 | 合成生物学 | NA | dCas9 | NA | 基因表达数据 | 101个gRNA结构,14个不同的酵母启动子 |
2652 | 2024-08-07 |
Targeted isolation and cloning of 100-kb microbial genomic sequences by Cas9-assisted targeting of chromosome segments
2016-May, Nature protocols
IF:13.1Q1
DOI:10.1038/nprot.2016.055
PMID:27101517
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research paper | 本文介绍了一种基于Cas9核酸酶的体外应用方法,用于从微生物中克隆长达100kb的基因组序列。 | 提出了一种名为Cas9辅助染色体片段靶向(CATCH)的新方法,通过体外切割目标DNA并使用Gibson组装法与克隆载体连接,简化了长基因组序列的克隆过程。 | NA | 开发一种新的技术方法,用于从微生物中高效克隆长基因组序列。 | 微生物的长基因组序列。 | genome engineering | NA | Cas9 nuclease, Gibson assembly | NA | DNA sequence | NA |
2653 | 2024-08-07 |
Multicolor optogenetics for regulating flux ratio of three glycolytic pathways using EL222 and CcaSR in Escherichia coli
2024-Mar, Biotechnology and bioengineering
IF:3.5Q2
DOI:10.1002/bit.28628
PMID:38116710
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研究论文 | 本文展示了通过使用蓝光响应的EL222和绿/红光响应的CcaSR在Escherichia coli中通过多色光照控制糖酵解途径的通量比 | 利用多色光调控技术,实现了对三种糖酵解途径(EMP、PP和ED)通量比的具体控制 | NA | 探索通过光遗传学技术控制代谢通量分布的方法 | Escherichia coli中的糖酵解途径 | 合成生物学 | NA | 光遗传学 | NA | NA | NA |
2654 | 2024-08-07 |
Precise integration of large DNA sequences in plant genomes using PrimeRoot editors
2024-Feb, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-023-01769-w
PMID:37095350
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研究论文 | 本文介绍了一种名为PrimeRoot的基因编辑方法,用于在植物基因组中精确插入大型DNA片段 | PrimeRoot编辑器采用了优化的引导RNA设计、增强的植物编辑器和先进的重组酶,能够实现高达11.1千碱基的精确DNA插入 | NA | 开发一种技术,用于在植物基因组中精确插入大型DNA片段,以促进农业特性和信号及代谢途径的引入 | 植物基因组和基因调控元件 | 基因编辑 | NA | PrimeRoot编辑器 | NA | DNA序列 | 在Kitaake水稻中进行了基因盒的整合,获得了含有预期插入的编辑植物,效率为6.3% |
2655 | 2024-08-07 |
The Future of Virology is Synthetic
2021-Aug-31, mSystems
IF:5.0Q1
DOI:10.1128/mSystems.00770-21
PMID:34463577
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评论 | 文章讨论了合成生物学在病毒学中的应用及其对未来人类健康和可持续农业的潜在贡献 | 提出合成病毒作为理解微生物生态系统中生命规则的工具,并可能提供针对多药耐药微生物的未来治疗策略 | NA | 探讨合成生物学在病毒学中的应用及其对生态系统稳定性和人类健康的潜在影响 | 全球病毒组及其在微生物生态系统中的作用 | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA |
2656 | 2024-08-07 |
Words Are Essential, but Underexamined, Research Tools for Microbes and Microbiomes
2021-Aug-31, mSystems
IF:5.0Q1
DOI:10.1128/mSystems.00769-21
PMID:34463574
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研究论文 | 本文探讨了语言工具(尤其是隐喻)在微生物和微生物组研究中的重要性和未被充分重视的问题 | 研究揭示了隐喻在微生物学研究中的潜在影响,并强调了对其进行审查的必要性 | 文章未明确指出具体的研究限制 | 旨在探讨和揭示隐喻在微生物学研究中的作用及其对研究方向的影响 | 研究对象包括酵母、细菌以及合成生物学和微生物组研究等领域 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
2657 | 2024-08-07 |
Retooling Microbiome Engineering for a Sustainable Future
2021-Aug-31, mSystems
IF:5.0Q1
DOI:10.1128/mSystems.00925-21
PMID:34463582
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评论 | 本文讨论了系统生物学方法在微生物组工程中的应用,以及如何通过整合合成生物学、自动化和机器学习来加速微生物组工程以应对未来的可持续性挑战 | 本文提出了通过系统生物学方法和整合合成生物学、自动化及机器学习来精确操纵和控制微生物组,以释放其全部潜力 | NA | 探讨如何利用系统生物学方法和新兴的遗传工程工具来优化微生物组工程,以应对未来的可持续性挑战 | 微生物组及其在生物技术应用中的功能 | NA | NA | 系统生物学、合成生物学、自动化、机器学习 | NA | NA | NA |
2658 | 2024-08-07 |
Third Generation Whole-Cell Sensing Systems: Synthetic Biology Inside, Nanomaterial Outside
2020-Oct-23, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2020.10.002
PMID:34756379
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研究论文 | 本文探讨了第三代全细胞传感系统,结合合成生物学和纳米材料以提高其特异性、稳定性和环境适应性 | 利用合成生物学进行智能设计和组装元素、模块及遗传电路,同时纳米材料提供稳定保护和远程控制能力 | NA | 推动全细胞传感系统的工业化应用 | 全细胞传感系统的改进和应用 | 合成生物学 | NA | 合成生物学,纳米材料 | NA | NA | NA |
2659 | 2024-08-07 |
A genetic toolbox to empower Paracoccus pantotrophus DSM 2944 as a metabolically versatile SynBio chassis
2024-Feb-15, Microbial cell factories
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s12934-024-02325-0
PMID:38360576
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研究论文 | 本研究旨在将Paracoccus pantotrophus DSM 2944转化为高效的合成生物学底盘,并开发了一套遗传工具箱以实现基因编辑和多种应用的可能性 | 成功开发了一套遗传工具箱,包括抗生素抗性分析、复制起点选择、基因转移方法评估、基因删除和整合技术,以及适应性实验室进化,以增强底盘的代谢多样性和应用潜力 | NA | 将Paracoccus pantotrophus DSM 2944发展为高效的合成生物学底盘 | Paracoccus pantotrophus DSM 2944的遗传改造和应用潜力 | 合成生物学 | NA | 基因编辑 | NA | 基因组数据 | 单个菌株Paracoccus pantotrophus DSM 2944 |
2660 | 2024-08-07 |
Cytokine signaling in chimeric antigen receptor T-cell therapy
2024-Feb-14, International immunology
IF:4.8Q2
DOI:10.1093/intimm/dxad033
PMID:37591521
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综述 | 本文综述了通过基因工程调节细胞因子信号以增强嵌合抗原受体T细胞(CAR-T细胞)治疗效果的合成生物学方法 | 提出了通过基因工程调节CAR-T细胞中的细胞因子信号,包括外源表达细胞因子和细胞因子受体,以及通过转录和表观遗传修饰增强自分泌IL-2信号 | 文章未明确提及具体限制 | 旨在探讨如何通过调节细胞因子信号来增强CAR-T细胞的治疗效果并减轻相关毒性 | CAR-T细胞及其在治疗中的应用 | 免疫疗法 | 血液恶性肿瘤 | 基因工程 | NA | NA | NA |